Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Histona Acetiltransferasas
Enzimas que catalizan la transferencia del grupo acilo desde el ACETIL-CoA a las HISTONAS formando CoA y acetil-histonas.
Factores de Transcripción p300-CBP
Familia de histona-acetiltransferasas que se relaciona estructuralmente con la PROTEÍNA DE UNIÓN A CREB y con la PROTEÍNA P300 ASOCIADA A E1A. Funcionan como coactivadores transcripcionales formando puentes entre los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN de unión al ADN y la maquinaria de transcripción basal. Modifican también los factores de transcripción y la CROMATINA a través de la ACETILACIÓN.
Acetiltransferasas
Histona Desacetilasas
Deacetilasas que separan grupos N-acetil de las cadenas aminósidas de los aminoácidos de HISTONAS. La familia de enzimas pueden dividirse en al menos tres subclases estructuralmente definidas. La clase I y la clase II de desacetilasas utilizan un mecanismo dependiente de zinc. Las sirtuinas son histona deacetilasas que pertenecen a la clase III y son enzimas dependientes de NAD.
Inhibidores de Histona Desacetilasas
Compuestos que inhiben la HISTONA DESACETILASAS. Esta clase de fármacos puede influir en la expresión génica al aumentar el nivel de histonas acetiladas en dominios específicos de la CROMATINA.
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Procesamiento Proteico-Postraduccional
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Proteína de Unión a CREB
Miembro de la familia de los factores de transcripción p300-C8P que fue identificado inicialmente como molécula de unión de la PROTEÍNA DE UNIÓN A LOS ELEMENTOS DE RESPUESTA AL AMPc. Las mutaciones en la proteína de unión a CREB se asocian al SÍNDROME DE RUBINSTEIN-TAYBI.
Proteína p300 Asociada a E1A
Miembro de los factores de transcripción p300-CBP que fue identificado originalmente como molécula de unión de las PROTEÍNAS E1A DE ADENOVIRUS.
Nucleosomas
Regiones Promotoras Genéticas
Histona Desacetilasa 1
Un subtipo de histona desacetilasa que está a lo largo de la HISTONA DESACETILASA 2; PROTEÍNA 4 DE UNIÓN A RETINOBLASTOMA; y PROTEÍNA 7 DE UNIÓN A RETINOBLASTOMA como componentes centrales de los complejos de histona desacetilasa.
Sirtuina 1
Un miembro de la familia sirtuina que se encuentra principalmente en el NÚCLEO CELULAR. Se trata de un deacetilasa dependiente de NAD con especificidad hacia las HISTONAS y una variedad de proteínas implicadas en la regulación génica.
Histona Desacetilasa 2
Un subtipo de la histona desacetilasa que se encuentra junto con las HISTONAS DESACETILASAS 1; RETINOBLASTOMA PORTADOR DE PROTEÍNA 4 ; y RETINOBLASTOMA PORTADOR DE PROTEÍNA 7 como componentes núcleos de los complejos histona desacetilasa.
Epigénesis Genética
El proceso genético por el cual el organismo adulto es formado por incrementos graduales en complejidad de estructuras como opuesto a un simple incremento en el tamaño de estructuras preexistentes. Incluye esos mecanismos que causan represión o de-represión selectiva del gen que restringen los posibles destinos de las células y eventualmente llevan a su estado de diferenciación.
Transcripción Genética
Butiratos
Derivados del ÁCIDO BUTÍRICO. Se incluyen bajo este descriptor una amplia variedad de formas de ácidos, sales, ésteres y amidas que contienen la estructura carboxipropano.
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Acetilcoenzima A
Metilación
Adición de grupos metilo. En histoquímica, la metilación se usa para esterificar grupos sulfato tratando cortes de tejido con metanol caliente en presencia de ácido clorhídrico. (Stedman, 25a ed)
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Ensamble y Desensamble de Cromatina
Sirtuina 3
Un miembro de la familia sirtuina que se encuentra principalmente en la MITOCONDRIA. Es una enzima multifuncional que contiene una actividad deacetilasa dependiente de NAD que es específica para las HISTONAS y una actividad mono-ADP-ribosiltransferasa.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Sirtuinas
Familia homóloga de enzimas reguladoras que están estructuralmente relacionados con la proteína de tipo apareamiento en silencio reguladora de la información 2 (Sir2) encontrado en Saccharomyces cerevisiae. Las sirtuinas contienen una región núcleo catalítico central que une NAD. Varias de las sirtuinas utilizan NAD para desacetilar proteínas como las HISTONAS y se clasifican como HISTONA DESACETILASAS DEL GRUPO III. Varios de los otros miembros de las sirtuinas utilizan NAD para transferir ADP-RIBOSA a proteínas y se categorizan MONO ADP-RIBOSAS TRANSFERASAS, mientras que un tercer grupo de las sirtuinas parece tener actividades tanto desacetilasa y ADP ribosa transferasa.
Unión Proteica
Proteínas Nucleares
Activación Transcripcional
Procesos que estimulan la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de un gen o conjunto de genes.
Arilamina N-Acetiltransferasa
Enzima que cataliza la transferencia de grupos acetil desde el ACETIL COENZIMA A a las arilaminas. También puede catalizar la transferencia de acetil entre arilaminas sin COENZIMA A y tiene una gran especificidad por las aminas aromáticas, incluida la SEROTONINA. Sin embargo, la arilamina N-acetiltransferasa no debería confundirse con la enzima N-ACETILTRANSFERASA DE ARILALQUILAMINA, también conocida como SEROTONINA ACETILTRANSFERASA.
Sirtuina 2
Un miembro de la familia sirtuina que se encuentra principalmente en el CITOPLASMA. Es una enzima multifuncional que contiene una actividad deacetilasa dependiente de NAD que es específica para las HISTONAS y una actividad mono-ADP-ribosiltransferasa.
Anhídridos Acéticos
Línea Celular
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Transactivadores
Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.
Regulación de la Expresión Génica
Acetiltransferasa A N-Terminal
Subtipo de acetiltransferasa N-terminal que consiste en la subunidad catalítica Naa10p y en la subunidad auxiliar Naa15p. La estructura de esta enzima es conservada entre eucariotas inferiores y superiores. Tiene especificidad por la SERINA N-terminal; ALANINA; TREONINA; GLICINA; VALINA y residuos de CISTINA y actúa sobre las cadenas de péptido nacientes después de la eliminación de la METIONINA iniciadora mediante las METIONIL AMINOPEPTIDASAS.
Ácido Butírico
Sulfametazina
Secuencia de Aminoácidos
Células HeLa
Proteínas de Ciclo Celular
Proteínas que controlan el CICLO DE DIVISIÓN CELULAR. Esta familia de proteínas incluye una gran variedad de clases, entre las que se encuentran las CINASAS DEPENDIENTES DE LA CICLINA, cinasas activadas por mitógenos, CICLINAS y FOSFOPROTEÍNA FOSFATASAS, así como sus presuntos sustratos, como las proteínas asociadas a la cromatina, las PROTEÍNAS DEL CITOESQUELETO y los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN.
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Acetiltransferasa E N-Terminal
Saccharomyces cerevisiae
Proteínas de Unión al ADN
Ácidos Anacárdicos
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Mutación
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Tubulina (Proteína)
Subunidad proteica de microtúbulo que se encuentra en grandes cantidades en el cerebro de mamíferos. Se ha aislado también del FLAGELO DEL ESPERMATOZOIDE, CILIOS y de otras fuentes. Estructuralmente, la proteína es un dímero con un PM aproximado de 120,000 KDa y un coeficiente de sedimentación de 5.8S. Se une a la COLCHICINA, VINCRISTINA y VINBLASTINA.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Proteína p53 Supresora de Tumor
Inhibidores Enzimáticos
Ácido Valproico
Un ácido graso con propiedadesa anticonvulsivantes utilizado en el tratamiento de la epilepsia. Los mecanismos de sus acciones terapéuticas no están bien comprendidos. Pudieran actuar incrementando los niveles de GABA en el cerebro o alterando las propiedades de los canales de sodio dependientes del voltage.
Metilación de ADN
Sitios de Unión
Silenciador del Gen
Acetiltransferasas N-Terminal
Enzimas que catalizan la transferencia de un grupo de acetilo, por lo general de la ACETILCOENZIMA A, a la N-terminal de una cadena de péptidos.
Acetilesterasa
Acetato CoA Ligasa
Acetatos
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Células Cultivadas
Inmunoprecipitación
Células HEK293
Proteínas Cromosómicas no Histona
Nucleoproteínas, que en contraste con las HISTONAS, son insolubles en ácido. Participan en las funciones cromosómicas; por ejemplo, se unen selectivamente al ADN, estimulan la transcripción que produce la síntesis de ARN específico de los tejidos y sufre cambios específicos en respuesta a distintas hormonas o fitomitógenos.
Fosforilación
Espectrometría de Masas
Western Blotting
N-Metiltransferasa de Histona-Lisina
Enzima que cataliza la metilación del epsilon-aminogrupo de los residuos de lisina en las proteínas, formando epsilon mono-, di- y tri-metil-lisina. EC 2.1.1.43.