Enzimas non-heme contenedoras de hierro que incorporan dos átomos de OXIGENO dentro del substrato. Son importantes en la biosíntesis de FLAVONOIDES; GIBERELINAS y HIOSCIAMINA y por la degradación de HIDROCARBUROS AROMÁTICOS.

Oxidasas que introducen especificamente átomos de oxigeno derivado del DIOXIGENO dentro de distintas moléculas orgánicas.

Cataliza la oxidación del catecol a 2-hidroximuconato semialdehído en la degradación del carbazol y el BENZOATO en las vías de HIDROXILACIÓN. También cataliza la conversión de 3-metilcatecol a cis, cis-2-hidroxi-6-oxohepta-2,4-dienoato en la vía de degradación del TOLUENO y el XILENO. Esta enzima ha sido anteriormente caracterizada como EC 1.13.1.2.

Un grupo de 1,2-bencenodioles que contienen la fórmula general R-C6H5O2.

Enzima que cataliza la oxidación de protocatecoato a 3-carboxi-cis-cis-muconato en presencia de oxígeno molecular. Contiene ión férrico. EC 1.13.11.3.

Enzima que cataliza la oxidación del catecol a ácido mucónico, usando Fe3+ como cofactor. Esta enzima fue caracterizada previamente como EC 1.13.1.1 y EC 1.99.2.2.

Género bacteriano del orden ACTINOMYCETALES.

Género de bacteria gramnegativas, aerobias, en forma de bastoncillos que se caracterizan por tener una membrana externa que contiene esfingolípidos pero que no tiene lipopolisacáridos. Tienen la capacidad de degradar una amplia gama de compuestos aromáticos sustituidos.

Una familia de compuestos que contienen un grupo oxo con la estructura general del ácido 1,5-pentanodioico.

El único género en la familia RALSTONIACEAE, compuesta de varias especies. Están asociadas con una variedad de infecciones incluyendo MENINGITIS; PERITONITIS; e INFECCIONES URINARIAS.

Eliminación de CONTAMINANTES AMBIENTALES; PESTICIDAS y otros residuos usando organismos vivos, usualmente involucrando intervención de ingenieros ambientales o sanitarios.

Proteínas que usualmente actúan en las reacciones de oxidación-reducción, contienen hierro, pero no grupos porfirínicos.

Un poderoso herbicida utilizado como matador selectivo de malas hierbas.

Enzimas ampliamente distribuidas que llevan a cabo las reacciones de oxidación-reducción en las que un átomo de la molecula de oxigeno es incorporada al sustrato orgánico; el otro átomo de oxigeno es reducido y combinado con iones de hidrógeno para formar agua. También se conocen como monooxigenasas o hidroxilasas. Esas reacciones requieren dos sustratos como reductores de cada uno de los dos átomos de oxigeno. Hay distintas clases de monooxigenasas según el tipo de co-sustrato suministrador de hidrógeno (COENZIMAS)utilizado en la oxidación.

Compuestos orgánicos compuestos exclusivamente de carbono e hidrógeno formando un anillo cerrado que puede ser tanto acíclico como aromático.

Género de bacterias gramnegativas, aerobias en forma de bastoncillos que está ampliamente distribuido en la naturaleza. Algunas especies son patógenos para humanos, animales y plantas.

Especie de bacteria gramnegativao ampliamente distribuida por todos sitios y que previamente se llamó Comamonas acidivorans y Pseudomonas acidivorans. Es la especie tipo del género DELFTIA.

Género de bacterias gramnegativas, aerobias, en forma de bastoncillos. Los organismos de este género originalmente se clasificaron como miembros del género PSEUDOMONAS pero una inmensa cantidad de hallazgos bioquímicos y químicos indican la necesidad de separarlos de otras especies de Pseudomonas, y por ello, se creó este nuevo género.

Especie de bacteria gramnegativa aislada del suelo y el agua así como de muestras clínicas. Ocasionalmente es un patógeno oportunista.

Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.

El ácido homogentísico es un intermediario metabólico, resultante de la degradación del aminoácido aromático fenilalanina y tirrosina, que en presencia de oxígeno se polimeriza y forma pigmentos de color marrón rojizo en tejidos afectados por alcaptonuria.

Compuestos orgánicos o inorgánicos que contienen hierro divalente.

Género de plantas de la familia APIACEAE utilizadas como aromatizante de alimentos.

Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.

Género de bacterias esporogénicas aisladas del suelo que presentan un ciclo de crecimiento diferente de bacilo-coco.

Oxigenasa de función mixta que cataliza la hidroxilación de un prolil-glicilo que contiene péptido, por lo general en PROTOCOLÁGENO, a un hidroxiprolilglicilo que contiene péptido. La enzima utiliza OXÍGENO molecular con una descarboxilación oxidativa concomitante de 2-oxoglutarato a ÁCIDO SUCCÍNICO. La enzima se produce como un tetrámero de dos alfa y dos subunidades beta. La subunidad beta de la dioxigenasa procolágeno-prolina es idéntica a la enzima PROTEÍNA DISULFURO ISOMERASAS.

Clorobencenos son compuestos aromáticos organoclorados formados por uno o más átomos de cloro unidos al benceno, con diversas aplicaciones industriales pero también preocupantes efectos ambientales y toxicológicos.

Enzima que cataliza la conversión de L-CISTEÍNA a 3-sulfinoalanina (3-sulfino-L-alanina) en el metabolismo de la CISTEÍNA y en las vías metabólicas de la TAURINA e hipotaurina.

El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.

Los compuestos de bifenilo se definen médicamente como moléculas orgánicas formadas por dos anillos de benceno unidos a través de dos átomos de carbono adyacentes.

Elemento metálico con el símbolo atómico Fe, número atómico 26 y peso atómico 55.85. Es un constituyente esencial de las HEMOGLOBINAS.

Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.

Sales y ésteres del ácido gentísico.

Derivados de benzoato sustituidos por uno o más grupos de hidroxi en cualquier posición en el anillo de benceno.

Productos industriales que consisten en una mezcla de isómeros y congéneres bifenilo clorinados. Estos compuestos son altamente lipofílicos y se tienden a acumular en los almacenes de grasa de los animales. Mucho de estos compuestos se consideran tóxicos y contaminantes ambientales potenciales.

Dioxigenasa con especificidad para la oxidación del anillo de indolamina del TRIPTÓFANO. Es una enzima específica del HIGADO que es la primera y principal enzima limitante en la vía de la quinurenina del catabolismo del TRIPTÓFANO.

Un compuesto cristalino incoloro o ligeramente amarillo obtenido de la agalla. Es utilizado en fotografía, fármacos y como reactivo analítico.

Ácido indol sulfónico utilizado como colorante en pruebas de función renal para la detección de nitratos o cloratos, y en el análisis de la leche.

Colocación de un grupo hidroxilo en un compuesto en una posición donde no existía antes. (Stedman, 25a ed)

Acido benzoico o ésteres del ácido benzoico sustituídos con uno o más átomos de cloro.

Género de bacterias gram negativas de la familia MORAXELLACEAE, que se encuentran en el suelo y el agua y de patogenicidad incierta.

Bacterias que requieren oxígeno molecular para su metabolismo y crecimiento, encontradas generalmente en la atmósfera o en entornos bien oxigenados.

Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.

Ésteres metílicos, propílicos, butílicos y etílicos del ácido p-hidroxibenzoico. Han sido aprobados por la FDA (ver UNITED STATES FOOD AND DRUG ADMINISTRATION) como agentes antimicrobiandos para alimentos y fármacos. (Traducción libre del original: Hawley's Condensed Chemical Dictionary, 11th ed, p872)

Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.

Hidroquinonas son compuestos aromáticos fenólicos que actúan como agentes reductorres y antioxidantes, pero también pueden tener propiedades fototóxicas y bleachantes de la piel.

Productos de degradación de buteno ciclohexeno de trece carbonos formados por el clivaje de CAROTENOIDES. Ellos contribuyen al sabor en algunas FRUTAS.

Solvente industrial ampliamente utilizado.

Reactivo utilizado para la determinación del hierro.

Enzima que cataliza la conversión de 4-hidroxifenilpiruvato más oxígeno en ácido homogentísico y dióxido de carbono. EC 1.13.11.27.

Enzima que cataliza la conversión de 3-hidroxiantranilato al 2-amino-3-carboximuconato semialdehído. Previamente caracterizada como EC 1.13.1.6.

Derivados del ÁCIDO BENZOICO. Se incluyen bajo este descriptor una amplia variedad de formas de ácidos, sales, ésteres y amidas que contienen la estructura carboxibenceno.

Un elemento con símbolo atómico O, número atómico 8 y peso atómico [15.99903; 15.99977]. Es el elemento más abundante de la tierra y es esencial para la respiración.

Un herbicida con efectos irritantes sobre los ojos y el sistema gastrointestinal.

Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.

Sustancias que contaminan el suelo. Se emplea para contaminantes del suelo en general o para aquellos que no tienen un título específico.

Grupo importante de hidrocarburos cíclicos insaturados que contienen dos o más anillos. El amplio número de compuestos de este importante grupo, derivados principalmente del petróleo y del alquitrán de la hulla, son altamente reactivos y químicamente versátiles. El nombre se debe al olor fuerte y no desagradable, característico de la mayoría de las sustancias de esta naturaleza. (Traducción libre del original: Hawley's Condensed Chemical Dictionary, 12th ed, p96)

Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).

Fenantrenos son hidrocarburos aromáticos policíclicos complejos, derivados del sistema básico de fenantreno, que se encuentran naturalmente en el alquitrán de hulla, el alquitrán de cigarrillo y algunos aceites vegetales, y pueden ser producidos también por procesos industriales.

Organismo grampositivo que se encuentra en los productos lácteos, agua dulce y salada, organismos marinos, insectos y materia orgánica en descomposición.

Base de nucleótido metilado encontrado en ADN eucariótico. En ANIMALES, la METILACIÓN DE ADN de CITOSINA para formar 5-metilcitosina se encuentra primariamente en la secuencia palindrómica CpG. En PLANTAS, la secuencia metilada es CpNpGp, en donde N puede ser cualquier base.

La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.

Pesticidas que se usan para destruir la vegetación no deseada, especialmente diversos tipos de malas hierbas, gramíneas herbáceas (POACEAE) y plantas leñosas. Algunas plantas desarrollan RESISTENCIA AL HERBICIDA.

Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.

Atomos estables de oxígeno que tienen el mismo número atómico que el elemento oxígeno pero que difieren en peso atómico. O-17 y 18 son isótopos estables de oxígeno.

Amplio grupo de bacterias aerobias que toman color rosado (negativas) cuando se tratan con el método de coloración de gram. Esto es debido a que las paredes celulares de las bacterias gram negativas tienen poca cantidad de peptidoglicano y por ello tienen baja afinidad a la coloración violeta y alta afinidad por el tinte rosa de safranina.

Género de bacterias gramnegativas, aerobias, y con motilidad que se encuentran en el agua y los suelos. Algunas son habitantes comunes del tracto intestinal de vertebrados. Estas bacterias producen ocasionalmente infecciones oportunistas en humanos.

La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.

Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.

Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.

Compuestos que tienen el grupo nitro, -NO2, unido a carbono. Cuando se une al nitrógeno son nitraminas y cuando se unen al oxígeno son NITRATOS.

Proteínas que contienen hierro que transfieren electrones a las flavoproteínas, generalmente en un bajo potencial; el hierro no está presente como en el hemo.

La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.

Una base pirimidínica que es una unidad fundamental de los ácidos nucleicos.

Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.

Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de los procesos o fenómenos químicos; comprende el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.

Compuestos orgánicos o inorgánicos que contienen hierro trivalente.

Dioxigenasa con especificidad para la oxidación del anillo indolamina del TRIPTÓFANO. Es una enzima extrahepática que interviene en el metabolismo como enzima primera y limitante de la velocidad en la vía de la quinurenina del catabolismo del TRIPTÓFANO.

Técnica aplicable a la gran variedad de sustancias que exhiben paramagnetismo debido a los momentos magnéticos de los electrones no pareados. Los espectros son útiles para la detección e identificación, para la determinación de la estructura del electrón, para el estudio de las interacciones entre moléculas, y para la medición de los "spins" y momentos nucleares. La espectroscopía nuclear electrónica de doble resonancia (ENDOR), es una variante de la técnica que puede dar una mejor resolución. El análisis de la resonancia del spin electrónico puede hacerse ahora in vivo, incluyendo aplicaciones imagenológicas como la RESONANCIA MAGNÉTICA.

Fenómeno por el cual compuestos cuyas moléculas tienen el mismo número y tipo de átomos y el mismo ordenamiento atómico, difieren en sus relaciones espaciales.

La facilitación de reacciones bioquímicas con la ayuda de catalizadores de origen natural tales como las ENZIMAS.

Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.

Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.

Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.

El nombre genérico para un grupo de pigmentos liposolubles encontrados en vegetales verdes, amarillos y de hojas, y en frutas amarillas. Son carbohidratos alifáticos formados por un eje de poliisopreno.

Los compuestos que contienen un anillo de BENCENO fusionado con un anillo furano.

Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.

El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.

Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.

Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.

Factor de transcripción hélice-asa-hélice de carácter básico que desempeña un papel en la APOPTOSIS. Está compuesto por dos subunidades: el TRANSLOCADOR NUCLEAR DEL RECEPTOR DE ARIL HIDROCARBONO y la SUBUNIDAD ALFA DEL FACTOR 1 INDUCIBLE POR HIPOXIA.

Hidrocarburos cristalinos de dos anillos, aislados del alquitrán de la hulla. Se usan como intermediarios en la síntesis química, como repelentes de insectos, fungicidas, lubricantes, preservativos e, antiguamente, como antisépticos tópicos.

Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.

La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.

Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.

Un grupo de proteínas que poseen sólo el complejo hierro-azufre como grupo prostético. Estas proteínas participan en todas las principales vías de transportación de electrones: fotosíntesis, respiración, hidroxilación y fijación bacteriana de hidrógeno y nitrógeno.

Análisis de la masa de un objeto mediante la determinación de las longitudes de ondas en las que la energía electromagnética es absorbida por dicho objeto.

Elementos químicos electropositivos caracterizados por su ductibilidad, maleabilidad, brillo, y conductibilidad al calor y la electricidad. Pueden reemplazar al hidrógeno de un ácido y formas bases con radicales hidroxilo.

La subunidad alfa del factor 1 inducible por hipoxia es un factor de transcripción hélice-giro-hélice alcalino que está regulado por la disponibilidad de OXÍGENO y que es objetivo de la degradación por parte de la PROTEÍNA SUPRESORA DE TUMORES DEL SÍNDROME DE VON HIPPEL-LINDAU.