ARN de Archaea
Ácido ribonucleico de la archaea que cumple funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
ADN de Archaea
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
Genes Arqueales
Unidades genéticas funcionales de la ARCHAEA.
Genoma Arqueal
Archaea
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Virus de Archaea
Virus cuyos huéspedes pertenecen al dominio de ARCHAEA.
Regulación de la Expresión Génica Arqueal
Sulfolobus
Género de cocos ARCHAEA aeróbicos, quemolitotróficos cuyos organismos son termoacidofílicos. Sus células tienen forma muy irregular, a menudo lobuladas, pero ocasionalmente esféricas. Tienen una distribución mundial con organismos aislados de suelos calientes acídicos y del agua. El azufre se utiliza como fuente de energía.
Methanobacteriaceae
Familia de METHANOBACTERIALES anaerobios, de forma variada desde cocos a bastoncillos. Las membranas celulares están compuestas principalmente por hidrocarburos poliisoprenoides que unen el eter al glicerol. Sus organismos se encuentran en hábitats anaerobios en la naturaleza.
Methanococcales
Orden de metágenos anaerobios en el reino EURYARCHAEOTA. Tienen forma de pseudosarcina, cocoide o bastoncillos envueltos en vainas y catabolizan a grupos metilo. Las paredes celulares están compuestas de proteínas. El orden incluye una familia, METHANOCOCCACEAE.
Crenarchaeota
Reino del dominio ARCHAEA que comprende organismos termoacidofílicos dependientes del azufre. Los dos órdenes son SULFOLOBALES y THERMOPROTEALES.
Cromosomas de Archaea
Methanococcus
Género de METHANOCOCCACEAE cocoides cuyos organismos se mueven por medio de un penacho de flagelos polares. Estos metágenos se encuentran en pantanos salinos, sedimentos marinos y estuarios, y en el tracto gastrointestinal de animales.
Sulfolobus solfataricus
especie de ARCHAEA termoácidofilica de la familia Sulfolobaceae, encontrada en áreas volcánicas donde la temperatura llega casi a los 80 grados C y hay presencia de SULFURO.
Haloferax volcanii
Especie de archaea halofílica que se encuentra en el Mar Muerto.
Pyrococcus furiosus
Especie de archaea estrictamente anaerobia, hipertermofílica que vive en sedimentos marinos geotérmicamente calientes. Muestra crecimiento heterotrófico por fermentación o por respiración sulfurosa.
Subunidades Ribosómicas Grandes de Archaea
Subunidad mayor del ribosoma 70S de archaea. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 40 diferentes PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.
Pyrococcus abyssi
Una especie de ARCHAEA gramnegativa hipertermofílica, encontrada en salidas hidrotermales de océano profundo. Es un anaerobio obligatorio y obligatoriamente quimiorganotrófico.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Archaeoglobus fulgidus
Methanosarcina
Género de METHANOSARCINALES anaerobios, de forma esférica irregular, cuyos organismos son inmóviles. No se forman endosporas. Estos archaea derivan su energía de la formación de metano a partir de acetato, metanol, mono-, di-, y trimetilamina, y posiblemente, monóxido de carbono. Los organismos son aislados a partir de agua dulce y de ambientes marinos.
Sulfolobus acidocaldarius
Especie de ARCHEA quimiolitotrófica y aerobia constituida por células cocoides que utilizan al azufre como fuente de energía. La temperatura óptima para su crecimiento es de 70-75 grados C. Se aislan de campos acídicos.
Pyrococcus horikoshii
Una especie de ARCHAEA anaeróbico hipertermofílico, aislado de muestras de fluído hidrotermal. Es obligatoriamente heterotrófico con células cocoides que requieren TRIPTOFANO para crecer.
Acidianus
Un género facultativamente anaerobio de cocoides ARCHAEA, en la familia SULFOLOBACEAE. Las células son altamente irregulares de forma y termoacidofílicas. El crecimiento litotrófico ocurre aeróbicamente por oxidación de azufre en algunas especies. La distribución incluye manantiales solfatáricos y campos, lodazales, y ambientes marinos ácidos geotérmicamente calientes.
Metano
Bacterias
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Nanoarchaeota
Reino de la ARCHAEA hipertermofílica que se encuentra en diversos ambientes.
Euryarchaeota
Un filo de ARCHAEA que comprende por lo menos siete clases: Methanobacteria, Methanococci, Halobacteria (halófilos extremos), Archaeoglobi (especies reductoras de sulfato), Methanopyri, y las termofilas: Thermoplasmata e Thermococci.
Pyrococcus
Género de archaea estrictamente anaerobios ultratermofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que ocurren en aguas de mares calientes. Muestran crecimiento heterotrófico con una temperatura óptima de 100 grados C.
ARN Ribosómico 16S
Secuencia de Aminoácidos
Thermoplasma
Éteres de Glicerilo
Thermoproteaceae
Familia de THERMOPROTEALES constituida por bacilos rígidos de longitud variable y sin septum. Crecen quemolitoautotróficamente o por respiración sulfurosa. Los cuatro géneros son: PYROBACULUM, THERMOPROTEUS, Caldivirga y Thermocladium (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).
Sedimentos Geológicos
Masa de material orgánico o inorgánico sólido fragmentado, o el propio fragmento sólido, que procede de la acción del intemperismo sobre las rocas y es transportada por, suspendida en o dejado caer por el aire, agua o hielo. Se refiere también a una masa que se acumula por cualquier otro agente natural y forma capas en la superficie terrestre, tales como arena, grava, limo, lodo, relleno o marga.
Methanobacterium
Methanosarcinales
Orden de metanógenos anaerobios del reino EURYARCHAEOTA. Hay dos familias: METHANOSARCINACEAE y Methanosaetaceae.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Methanobacteriales
Orden de metágenos anaerobios con formas variadas desde cocoide a bastoncillo, del reino EURYARCHAEOTA. Son inmóviles, no catabolizan los carbohidratos, material proteináceo o compuestos orgánicos que no sean formiato o monóxido de carbono, y están ampliamente distribuidos en la naturaleza.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas de Archaea
Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS arqueales. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 16S y de cerca de 28 diversas PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.
Evolución Molecular
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Modelos Moleculares
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Desulfurococcaceae
Familia de archaea, del orden DESULFUROCOCCALES, constituida por cocos anaerobios que utilizan facultativamente péptidos, proteínas o carbohidratos por respiración sulfurosa o fermentación. Hay ocho géneros: AEROPYRUM, Desulfurococcus, Ignicoccus, Staphylothermus, Stetteria, Sulfophoboccus, Thermodiscus y Thermosphaera (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).
Homología de Secuencia de Aminoácido
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Nitrificación
Un proceso facilitado por bacterias especializadas que implican la oxidación de amonio a nitrito y nitrato.
ADN Ribosómico
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
Células Eucariotas
Secuencia de Bases
Methanococcaceae
Familia de METHANOCOCCALES anaerobios cuyos organismos se mueven por medio de un flagelo. Estos metágenos usan dióxido de carbono como aceptor de electrones.
Sulfolobales
Orden de CRENARCHAEOTA que está constituido por cocos aeróbicos o facultativamente aeróbicos, quimolitotróficos que son termoacidófilos extremos. Carecen de peptidoglicanos en sus paredes celulares.
Cristalografía por Rayos X
Korarchaeota
Reino del dominio ARCHAEA, que comprende organismos termofílicos de fuentes de agua caliente que está entre las formas más primitivas de todas las formas vivas. Comparativamente han sufrido pocos cambios evolutivos desde el último ancestro común de toda la vida existente.
Biodiversidad
La variedad de todos los organismos vivientes nativos y sus variadas formas de interrelación. (MeSH, 2010) Contenido vivo de la Tierra en su conjunto, todo cuanto vive en los océanos, las montañas y los bosques. La encontramos en todos los niveles, desde la molécula de ADN hasta los ecosistemas y la biosfera. Todos los sistemas y entidades biológicos están interconectados y son interdependientes. La importancia de la biodiversidad estriba en que nos facilita servicios esenciales: protege y mantiene los suelos, regula el clima y hace posible la biosíntesis, proporcionándonos así el oxígeno que respiramos y la materia básica para nuestros alimentos, vestidos, medicamentos y viviendas (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Halobacterium salinarum
Haloarcula
Género de HALOBACTERIACEAE que se distingue de otros géneros de la familia por la presencia de derivados específicos de lípidos polares TGD-2. La Haloarcula se encuentra en ambientes salinos neutros como en los lagos salados, salinas marinas y suelos salinos.
Methanosarcinaceae
Familia de METHANOSARCINALES anaerobios cuyas células son mesofílicas o termofílicas y se observan como cuerpos esféricos irregulares o bacilos encubiertos. Estos metágenos se encuentran en cualquier medio ambiente anaerobio incluidos los sedimentos acuáticos, digestores anaerobios de aguas de albañales y tracto gastrointestinal. Hay cuatro géneros: METHANOSARCINA, Methanolobus, Methanothrix, y Methanococcoides.
Microbiología del Suelo
La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.
Halorubrum
Un género de HALOBACTERIACEAE que son quimioorganotróficos y estrictamente aeróbicos.Han sido aislados a partir de múltiples ambientes hipersalinos que varían ampliamente en propiedades químicas y físicas.
Manantiales de Aguas Termales
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Termosomas
Grupo II de chaperoninas que se encuentran en las especies ARCHEA.
Consorcios Microbianos
Genes de ARNr
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Eucariotas
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIAS y ARCHAEA), también llamado de Eukarya. Son organismos cuyas células están envueltas en membranas y poseen un núcleo. Comprenden casi todos los organismos unicelulares y muchos organismos pluricelulares. Tradicionalmente se dividen en grupos (a veces llamados reinos), incluyendo ANIMALES, PLANTAS, HONGOS, diferentes algas, y otros taxones que anteriormente formaban parte del antiguo reino Protista.
Methanomicrobiales
Orden de metanógenos anaerobios, altamente especializados, del reino de los EURYARCHAEOTA. Sus organismos son inmóviles o móviles, con células que son como cuerpos cocoides, pseudosarcina o bastoncillos. Las familias incluyen los METHANOMICROBIACEAE, Methanocorpusculaceae y Methanospirillaceae.
Subunidades de Proteína
Halobacteriaceae
Familia de archaea extremadamente halofílica que se encuentra en ambientes con altas concentraciones de sal, como los lagos salados, salinas evaporadas o pescado salado. Las Halobacteriaceae son aerobios obligados o anaerobios facultativos y se dividen en al menos veintiséis géneros: HALOARCULA, HALOBACTERIUM, HALOCOCCUS, HALOFERAX, HALORUBRUM, NATRONOBACTERIUM y NATRONOCOCCUS.
Genoma Bacteriano
Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.
Ribonucleasa P
Una enzima que contiene ARN que desempeña un rol esencial en el procesamiento ARNt catalizando el clivaje endonucleolítico de precursores de ARN DE TRANSFERENCIA. Remueve los extra 5'-nucleótidos desde los precursores de ARNt para generar moléculas de ARNt maduras.
Transferencia de Gen Horizontal
Transmisión de información genética entre organismos, emparentados o sin parentesco, burlando la transmisión de padres a hijos, que se da de forma natural. Puede darse mediante procesos naturales como la CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA y la TRANSFECCIÓN. Puede dar lugar a un cambio de la composición genética del organismo recipiente (TRANSFORMACIÓN GENÉTICA).
Conformación de Ácido Nucleico
Microbiología del Agua
Presencia de bacterias, virus y hongos en el agua. Este término no está restringido a los organismos patógenos.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Pyrobaculum
Un género de ARCHAEA con forma de bacilos, casi rectangulares, en la familia THERMOPROTEACEAE. Los organismos son facultativamente aerobios o estrictamente anaerobios, crecen en varios sustratos orgánicos, y se encuentran en solfataras continentales.
Archaeoglobales
Orden de archaea extremadamente termofílico, reductor de sulfato del reino EURYARCHAEOTA. La única familia Archaeoglobaceae contiene un género ARCHAEOGLOBUS.
Ecosistema
Amoníaco
Thermoproteus
Un género de ARCHAEA obligatoriamente anaerobios, en la familia THERMOPROTEACEAE. Se encuentran en manantiales calientes ácidos y en hoyos de agua.
Archaeoglobus
Género de archaea extremadamente termofílico, reductor de sulfato de la familia Archaeoglobaceae.
Thermoproteales
Orden de CRENARCHAEOTA comprendido por termófilos extremos que son anaerobios, no septados en forma de bastones, discos o esferas y que se encuentran en aguas calientes sulfurosas, hoyos de fango y ambientes submarinos supercalientes.
Especificidad por Sustrato
Biota
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Temperatura Ambiental
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Factores Procarióticos de Iniciación
Factores de iniciación de péptido a partir de organismos procariotas. Sólo se necesitan tres factores para iniciación de la traducción en los organismos procariotas, que se produce por un proceso mucho más simple que en la INICIACIÓN DE LA CADENA PEPTÍDICA TRADUCCIONAL de los organismos eucariotas.
Halobacteriales
Orden de archae extremadamente halofílica, en el reino EURYARCHAEOTA. Ocurren frecuentemente en la naturaleza donde la concentración de sal es alta, y son quimorganotróficos, utilizan aminoácidos o carbohidratos como fuentes de carbono.
Chaperoninas
Familia de multisubunidades de complejos de proteínas que se forman en grandes estructuras cilíndricas que se unen a y encapsulan proteínas no nativas. Las chaperoninas utilizan la energía de la hidrólisis de ATP para aumentar la eficiencia de reacción del PLIEGUE DE PROTEÍNAS y de ese modo ayudar a las proteínas a alcanzar su conformación funcional. La familia de chaperoninas se divide en el GRUPO I DE CHAPERONINAS, y el GRUPO II DE CHAPERONINAS, donde cada grupo poseé su propio repertorio de subunidades de proteína y preferencias de subcelulares.
ARN Guia
Pequeño ARN mitocondrial cinetoplástido que desempeña un importante rol en la EDICIÓN DEL ARN. Estas moléculas forman híbridos perfectos con las secuencias editadas de ARNm y poseen secuencias de nucleótidos en sus extremos 5' que son complementarias con las secuencias del ARNm que están inmediatamente corriente abajo de las regiones preeditadas.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Seudouridina
La seudouridina es un nucleósido presente en moléculas de ARN, donde reemplaza a la uridina en algunos residuos y puede contribuir a la estabilidad estructural y función del ARN modificado.
Sitios de Unión
Wyoming
Haloarcula marismortui
Especie de archaea halofílica que se distingue por su producción de ácido a partir del azúcar. Esta especie se llamó previamente Halobacterium marismortui.
Unión Proteica
Oxidorreductasas
Clase de todas las enzimas que catalizan reacciones de oxidación-reducción. El sustrato que es oxidado es considerado donador de hidrógeno. El nombre sistemático está basado en la oxidorreductasa donadora:aceptora. El nombre recomendado es deshidrogenasa, siempre que sea posible. Como alternativa puede usarse reductasa. Oxidasa sólo se usa en los casos en que el O2 es el aceptor.
Factor de Transcripción TFIIB
Resolvasas de Unión Holliday
Estabilidad de Enzimas
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Estructura Secundaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Homología Estructural de Proteína
El grado de similitud entre la forma tridimensional de las proteínas. Puede ser una indicación de poca HOMOLOGÍA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y utilizada para el DISEÑO DE DROGAS racional.
ARN Bacteriano
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Pyrodictiaceae
Una familia de archaea, en el orden DESULFUROCOCCALES consisten en células cocoides anaerobias a discoides. Crecen lo mismo quimiolitoautotróficamente o por FERMENTACION. Se reconocen tres géneros: Pyrodictium, Hyperthermus, y Pyrolobus.
Respiraderos Hidrotermales
Electroforesis en Gel de Gradiente Desnaturalizante
Electroforesis en el que varios gradientes desnaturalizantes se utilizan para inducir los ácidos nucleicos a derretirse en las varias etapas que resultando en separación de moléculas basadas en es pequeñas diferencias en las secuencias incluyendo SNPs. Los desnaturalizantes utilizados contienen calor, formamida y urea.
Salinidad
Suelo
Dominio Catalítico
ADN Bacteriano
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Estructura Cuaternaria de Proteína
Dimerización
ARNt Metiltransferasas
Enzimas que catalizan la metilación dependiente de S-adenosil-L-metionina de las bases ribonucleótidas en el interior de una molécula de ARN de transferencia. EC 2.1.1.
Adenosina Trifosfatasas
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.
Haloferax
Género de HALOBACTERIACEAE extremadamente halofílico, quimioheterotróficas y estrictamente aerobias. Se encuentran en ambientes salinos neutros como los lagos salados (especialmente el Mar Muerto) y salinas marinas.
ARN de Transferencia de Triptófano
Leucina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la leucina con su ARN de transferencia específico. EC 6.2.2.4.
Genes Bacterianos
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Calor
Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.
ARN Nucleolar Pequeño
ARNs nucleares pequeños que participan en el procesamiento del ARN pre-ribosómico en el nucleolo. La caja C/D contiene ARNnop's (U14, U15, U16, U20, U21 y U24-U63) dirige la metilación específica del sitio de diversas porciones de ribosa. La caja H/ACA que contiene ARNnop's (E2, E3, U19, U23, y U64-U72) dirige la conversión de uridinas específicas a pseudouridina. La escisión en sitios específicos que se produce en los ARNs ribosómicoa maduros es dirigida por ARNnop's U3, U8, U14, U22 y los componentes ARNnop's de la ARNasa MRP y ARNasa P.
Procesos Autotróficos
Procesos por los cuales los organismos usan sustancias inorgánicas simples, tales como dióxido de carbono gaseoso o disuelto y nitrógeno inorgánico como fuente de nutrientes. Contrasta con procesos heterotróficos que hacen uso de materiales orgánicos como la fuente de suministro de nutrientes. Los autótrofos pueden ser tanto quimioautótrofos (o quimiolitótrofos), principalmente ARCHAEA y BACTERIAS, que también consumen sustancias inorgánicas simples para sus requisitos de energía metabólica, o fotoautótrofos (o fotolitótrofos), tales como PLANTAS y CIANOBACTERIAS, que derivan su energía de la luz. Dependiendo de las condiciones ambientales, algunos organismos pueden cambiar entre los diferentes modos de nutrición (PROCESOS AUTOTRÓFICOS; PROCESOS HETEROTRÓFICOS; procesos quimiotróficos; o PROCESOS FOTOTRÓFICOS) para utilizar diferentes fuentes para satisfacer sus necesidades de nutrientes y energía.
Yacimiento de Petróleo y Gas
Agua Dulce
Agua que contiene cantidades no significativas de sales, como el agua de RÍOS y LAGOS.
Aminoacil-ARNt Sintetasas
Subclase de enzimas que aminoacilan el ARN DE TRANSFERENCIA AMINOÁCIDO-ESPECÍFICO con los correspondientes AMINOÁCIDOS.
Océano Pacífico
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Aminoacilación de ARN de Transferencia
Methanomicrobiaceae
Familia de METHANOMICROBIALES anaerobios cuyas células tienen forma de cocos, bastoncillos rectos o ligeramente curvos. Hay seis géneros.
Chaperoninas del Grupo II
Subcategoría de chaperoninas que se encuentran en la ARCHAEA y el CITOSOL de las células eucariotas. El grupo II de chaperoninas forman una estructura molecular en forma de barril que se distingue de las CHAPERONINAS DEL GRUPO I en que no utiliza una estructura separada de unión para incluir las proteínas similares lid.
Sistemas de Lectura Abierta
Análisis por Conglomerados
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Lagos
Cuerpos tierra adentro apaciguados o movimientos lentos de AGUA DULCE o agua salada, más grande que un estanque, y suministrados por RÍOS y arroyos.
Combretaceae
Plancton
Conjunto de organismos acuáticos diminutos PLANTAS y ANIMALES y BACTERIAS fotosintéticas, que flotan libremente o están suspendidos en el agua, con poco o ningún poder de locomoción. Están divididos en FITOPLANCTON y ZOOPLANCTON.
Transcripción Genética
Microscopía por Crioelectrón
Proteína de Unión a TATA-Box
Factor de transcripción general que desempeña un papele principal en la activación de los genes aucarióticos, transcritos por ARN POLIMERASAS. Se une específicamente al elemento promotor de TATA BOX, situado muy próximo a la posición de la iniciación de la transcripción en el ARN transcrito por la ARN POLIMERASA II. Aunque considerado como componente principal del FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TFIID, participa también en los complejos generales de factores de transcripción implicados en la transcripción de ARN POLIMERASA I y ARN POLIMERASA II.
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Proteínas Asociadas a CRISPR
Componentes proteicos de los SISTEMAS CRISPR-CAS para la defensa antiviral en BACTERIA y ARCHAEA. Estas son proteínas que llevan a cabo una variedad de funciones durante la creación y expansión de las SECUENCIAS CRISPR, la captura de nuevos ESPACIADORES CRISPR, biogénesis de PEQUEÑOS ARN DE INTERFERENCIA (CRISPR o crARNs), y la orientación y el silenciamiento de los virus y plásmidos invasores. Incluyen ADN HELICASAS; PROTEÍNAS PORTADORAS DE ARN, ENDONUCLEASAS, y ARN y ADN POLIMERASAS.
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Oxidación-Reducción
Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.
Bacteriófago PRD1
Bacteriófago y especie tipo del género Tectivirus, familia TECTIVIRIDAE. Son específicos de bacterias gramnegativas.
ARN Polimerasas Dirigidas por ADN
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Hidrogenosulfito Reductasa
Genómica
El estudio sistemático de las secuencias completas del ADN (GENOMA) de los organismos.
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Metagenoma
Methanosarcina barkeri
Especie de archaea halofílica cuyos organismos son inmóviles. Los hábitats incluyen agua dulce y lodo marino, lagunas de desechos animales, y el rumen de ungulados.
Anaerobiosis
Secuencias de Aminoácidos
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
ADN Polimerasa Dirigida por ADN
ADN polimerasas dependientes de ADN, que se encuentran en bacterias, animales y vegetales. Durante el proceso de replicación, estas enzimas catalizan la adición de residuos de desoxirribonucleótidos al extremo de una cadena de ADN en presencia de ADN como modelo-iniciador. También poseen actividad exonucleasa y por lo tanto funcionan en la reparación del ADN.
Proteínas de Unión al ADN
Halobacterium
Género de HALOBACTERIACEAE cuyo crecimiento requiere de una elevada concentración de sal. La fisión binaria es por constricción.
Endorribonucleasas
Serina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la serina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.11.
Regiones Antárticas
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Proteínas Ribosómicas
Deltaproteobacteria
Grupo de PROTEOBACTERIA representadas por sulfidógenos anaerobios, morfológicamente variados. Algunos miembros de este grupo se consideran depredadores bacterianos, con propiedades bacteriolíticas.
ARN de Transferencia de Glutamina
Homología de Secuencia
Catálisis
Multimerización de Proteína
El montaje de la ESTRUCTURA CUATERNARIA DE PROTEÍNA de las proteínas multiméricas (COMPLEJOS MULTIPROTEÍNAS) desde sus compuestos de las SUBUNIDADES DE PROTEÍNA.
Azufre
Rodopsinas Sensoriales
Rodopsinas fotosensoriales existentes en microorganismos tales como EURYARCHAEOTA. Estos compuestos convierten las señales luminosas en información bioquímica que regula determinadas funciones celulares, como la actividad motora de los flagelos.
ARN de Transferencia de Tirosina
Replicación del ADN
Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.
Transferasas Intramoleculares
ARN de Transferencia de Asparagina
Crecimiento Quimioautotrófico
Crecimiento de microorganismos que utilizan PROCESOS AUTÓTROFOS para obtener nutrientes y procesos quimiótrofos para obtener su aporte principal de energía. Los procesos quimiótrofos intervienen en la obtención del aporte principal de energía de fuentes químicas exógenas. Los autótrofos quimiótrofos (quimioautótrofos) generalmente usan compuestos inorgánicos como fuentes de energía y, por tanto, se denominan quimiolitoautótrofos. La mayoría de los quimioautótrofos viven en medios hostiles, como las fumarolas marinas profundas. Son sobre todo BACTERIAS y ARCHAEA, y son los principales productores de estos ecosistemas.
Ferredoxinas
Ribonucleoproteínas Nucleolares Pequeñas
Thermotoga maritima
Bacteria en forma de bastoncillo rodeada de una estructura en forma de vaina que tiene salientes en forma de balón fuera de los extremos de la célula. Es termofílica, el crecimiento ocurre con temperaturas tan altas como 90 grados C. Se aisla de sedimentos marinos geotérmicamente calientes o de aguas termales.
Concentración de Iones de Hidrógeno
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Lisina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la lisina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.6.
Mutación
Proteobacteria
Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.
Rizosfera
Tirosina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la tirosina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.1.
ADN Helicasas
Proteínas que catalizan la reversión del dúplex de ADN durante la replicación mediante la unión cooperativa para las regiones de cadena simple de ADN o para las regiones cortas de ADN dúplex que están experimentando apertura transitoria. Además las helicasas ADN son ATPasas dependientes de ADN que aprovechan la energía libre de la hidrólisis de ATP para trasladar los filamentos de ADN.
Factor 1 de Elongación Peptídica
El factor 1 de elongación peptídica es una proteína con muchas subunidades, responsable del enlace dependiente de GTP, de los aminoacil-ARNt's a los ribosomas eucarióticos. La subunidad alfa (EF-1alfa) se une al aminoacil-ARNt y los transfiere al ribosoma, en un proceso vinculado a la hidrólisis del GTP. Las subunidades beta y delta (EF-1beta, EF-1delta) participan en la conversión de GDP a GTP. La subunidad gamma (EF-1gamma) es un componente estructural.
Biocatálisis
Origen de Réplica
Secuencia única de ADN de un replicón en la que se inicia la REPLICACIÓN DEL ADN y prosigue bidireccional o unidireccionalmente. Contiene los sitios en que ocurre la primera separación de las cadenas complementarias, se sintetiza un primer ARN, y tiene lugar el cambio del primer ARN a la síntesis de ADN. (Adaptación del original: Rieger et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
Natronobacterium
Género de HALOBACTERIACEAE en forma de bastoncillos y extremadamente halofílica que crece en condiciones alcalinas. Son estrictamente aerobias y algunas cepas son móviles. La Natronobacterium se encuentra en lagos sódicos, salinas alcalinas y suelos sódicos.
Reactores Biológicos
Herramientas o aparatos para generar productos empleando la capacidad de conversión sintética o química de un sistema biológico. Pueden ser fermentadores clásicos, sistemas de perfusión de cultivo de células, o biorreactores de enzimas. Para la producción de proteínas o enzimas, se seleccionan microorganismos recombinantes como las bacterias, células de mamífero, o células de insectos o de vegetales.