Genes de ARNr
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
ARN Ribosómico 16S
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
ADN Ribosómico
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Operón de ARNr
Loci genéticos que dirigen la transcripción del ARN ribosómico en los operones bacterianos. Se les designa como rrnB, rrnC, rrnD, etc. de acuerdo a la posición estructural de la unidad de transcripción en la secuencia de ADN.
ARN Bacteriano
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
ARN Ribosómico 23S
Constituyente de la subunidad 50S de los ribosomas procarióticos que contienen alrededor de 3200 nucleótidos. El rARN 23S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
ADN Bacteriano
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
ARN Ribosómico 5S
Secuencia de Bases
Técnicas de Tipificación Bacteriana
Procedimientos para identificar tipos y cepas de bacterias. Los sistemas de tipificación más frecuentemente empleados son los de TIPIFICACION DE BACTERIOFAGOS y la SEROTIPIFICACION, así como la tipificación de bacteriocina y la biotipificación.
ARN Ribosómico 28S
Constituyente de la subunidad 60S de los ribosomas eucarióticos. El rARN 28S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
Microbiología del Suelo
Conformación de Ácido Nucleico
Bacterias
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Hibridación de Ácido Nucleico
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Sedimentos Geológicos
Masa de material orgánico o inorgánico sólido fragmentado, o el propio fragmento sólido, que procede de la acción del intemperismo sobre las rocas y es transportada por, suspendida en o dejado caer por el aire, agua o hielo. Se refiere también a una masa que se acumula por cualquier otro agente natural y forma capas en la superficie terrestre, tales como arena, grava, limo, lodo, relleno o marga.
Ácidos Grasos
Acidos orgánicos, monobásicos, derivados de hidrocarburos por el equivalente de oxidación de un grupo metilo a un alcohol, a aldehído y luego a ácido. Los ácidos grasos son saturados y no saturados (ACIDOS GRASOS NO SATURADOS).
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Proteínas Ribosómicas
Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.
Procesamiento Postranscripcional del ARN
Modificación biológica postranscripcional de ARNs mensajeros, de transferencia o ribosómicos o sus precursores. Incluyen la ruptura, metilación, tiolación, isopentilación, formación de pseudoridina, alteraciones conformacionales y la asociación con proteínas ribosómicas.
Nucléolo Celular
Región diferente, no delimitada por una membrana, que se encuentra dentro del NÚCLEO CELULAR de la mayoría de las células eucariotas, en el mismo se sintetizan algunas especies de ARNr (ARN RIBOSÓMICO) y se ensamblan con unidades de ribonucleoproteínas del ribosoma. En el nucléolo el ARNr se transcribe a partir de un organizador nucleolar, es decir, un grupo de genes cromosomales en línea que codifican al ARNr y que son transcriptos por la ARN polimerasa I.
Microbiología del Agua
Actinomycetales
Orden de BACTERIAS grampositivas, principalmente aerobias, que tienden a formar filamentos ramificados.
Análisis por Conglomerados
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Alphaproteobacteria
Clase del filum PROTEOBACTERIA formado generalmente por dos fenotipos principales: bacterias púrpuras no sulfúricas y bacterias que contienen bacterioclorofilo aeróbico.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
ARN de Hongos
Ácido ribonucleico de hongos que tienen función reguladora y catalítica así como participan en la síntesis de proteínas.
Precursores del ARN
Transcripciones de ARN del ADN que se encuentran en alguna etapa inconclusa de procesamiento post-transcripcional ( PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN ) necesarios para la función. Precursores de ARN pueden someterse a varias etapas del EMPALME DEL ARN durante el cual los enlaces fosfodiesterasas en los límites exón-intrón se escinden y se extraen los intrones. En consecuencia se forma un nuevo enlace entre los extremos de los exones. Resultantes de ARN maduros se pueden utilizar, por ejemplo, ARNm maduro (ARN MENSAJERO) se usa como una plantilla para la producción de proteínas.
Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción
Variación en la presencia o longitud de un fragmento de ADN que tiene lugar dentro de una especie, generada por una endonucleasa específica en un sitio específico del genoma. Tales variaciones se generan por mutaciones que crean o eliminan sitios de reconocimiento de estas enzimas o cambian la longitud del fragmento.
ARN de Archaea
Bacteroidetes
ARN Polimerasa I
Fenotipo
Subunidades Ribosómicas Pequeñas
Componente pequeño de ribonucleoproteínas de los RIBOSOMAS. Contiene el sitio de unión del ARN MENSAJERO y dos sitios de unión para el ARN DE TRANSFERENCIA - uno para el AMINOACIL ARNt (sitio A) y el otro (sitio P) para el peptidil ARNt que porta la cadena peptídica de elongación.
Biodiversidad
La variedad de todos los organismos vivientes nativos y sus variadas formas de interrelación. (MeSH, 2010) Contenido vivo de la Tierra en su conjunto, todo cuanto vive en los océanos, las montañas y los bosques. La encontramos en todos los niveles, desde la molécula de ADN hasta los ecosistemas y la biosfera. Todos los sistemas y entidades biológicos están interconectados y son interdependientes. La importancia de la biodiversidad estriba en que nos facilita servicios esenciales: protege y mantiene los suelos, regula el clima y hace posible la biosíntesis, proporcionándonos así el oxígeno que respiramos y la materia básica para nuestros alimentos, vestidos, medicamentos y viviendas (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Actinobacteria
Clase de BACTERIAS con diversas propiedades morfológicas. Algunas Actinobacterias muestran entre si una semejanza de la secuencia 16S rADN/rARN mayor al 80 por ciento asi como la presencia de distintivos de nucleótidos. (Adaptación del original: Stackebrandt E. et al, Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491).
Gammaproteobacteria
Grupo de protobacterias comprendidas por bacterias gramnegativas fermentadoras y facultativamente anaerobias.
Transcripción Genética
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Corea (Geográfico)
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Quinonas
ARN Protozoario
Metiltransferasas
Vitamina K 2
Grupo de sustancias similares a la VITAMINA K 1 que contiene un anillo de 2-metil-1,4-naftoquinona y una cadena lateral isoprenoide de un número variable de unidades de isopreno. En la vitamina K 2, cada unidad de isopreno contiene un doble enlace. Se producen por bacterias de la flora intestinal normal.
Betaproteobacteria
Clase del filum PROTEOBACTERIA, compuesta por quimioheterótrofos y quimioautótrofos, que toman sus nutrientes de la descomposición de materia orgánica.
Cloruro de Sodio
Proteobacteria
Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas Bacterianas
Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS de las eubacterias. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 16S y alrededor de 23 PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS distintas.
Endorribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación endonucléolítica del ARN. Incluye EC 3.1.26.-, EC 3.1.27.-, EC 3.1.30.- y EC 3.1.31.-.
Ecosistema
Sondas de Oligonucleótidos
Oligonucleótidos sintéticos o naturales utilizados en estudios de hibridización con el propósito de identificar y estudiar fragmentos específicos de ácidos nucleicos, ejemplo, segmentos de ADN cercanos o que están dentro de locus específicos del gen o de genes. La sonda hibridiza con un ARNm específico, si está presente. Las técnicas convencionales utilizadas para evaluar el producto de hibridización incluyen el ensayo de dot blot, ensayo de Southern blot, y las pruebas de anticuerpos específicos de híbridos de ADN:ARN. Las marcas convencionales para la sonda incluyen el marcaje con radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina.
Deltaproteobacteria
Grupo de PROTEOBACTERIA representadas por sulfidógenos anaerobios, morfológicamente variados. Algunos miembros de este grupo se consideran depredadores bacterianos, con propiedades bacteriolíticas.
Microbiología Ambiental
El estudio de microorganismos vivos en diversos tipos de medio ambiente (aire, suelo, agua etc) y su relación patogénica con otros organismos inclusive el hombre.
Manantiales de Aguas Termales
Pigmentos Biológicos
Cualquier materia colorante normal o anormal en PLANTAS, ANIMALES o microorganismos.
Operón
ARN Nucleolar Pequeño
ARNs nucleares pequeños que participan en el procesamiento del ARN pre-ribosómico en el nucleolo. La caja C/D contiene ARNnop's (U14, U15, U16, U20, U21 y U24-U63) dirige la metilación específica del sitio de diversas porciones de ribosa. La caja H/ACA que contiene ARNnop's (E2, E3, U19, U23, y U64-U72) dirige la conversión de uridinas específicas a pseudouridina. La escisión en sitios específicos que se produce en los ARNs ribosómicoa maduros es dirigida por ARNnop's U3, U8, U14, U22 y los componentes ARNnop's de la ARNasa MRP y ARNasa P.
Saccharomyces cerevisiae
Temperatura Ambiental
Mutación
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Bacillaceae
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Nocardia
Género de bacterias grampositivas aerobias cuyas especies están ampliamente distribuidas y son abundantes en los suelos. Algunas cepas son patógenos oportunistas para hombres y animales.
Proteínas del Complejo de Iniciación de Transcripción Pol1
Factores que forman un complejo pre-iniciador en los promotores, especificamente transcritos por la ARN POLIMERASA I.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Dermatoglifia del ADN
Una técnica para identificación de individuos de una especie basada en la singularidad de sus secuencias de ADN. La singularidad se determina identificándose cual combinación de variaciones alélicas ocurren en el individuo en un número estadísticamente relevante de sitios (o lugares) diferentes. En estudios forenses, POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCIÓN de LUGARES DE NVRT o lugares de REPETICIONES DE SATÉLITE múltiples y altamente polimórficos son analisados. El número de lugares usados para el perfil depende de la FRECUENCIA ALELICA en la población.
Seudouridina
La seudouridina es un nucleósido presente en moléculas de ARN, donde reemplaza a la uridina en algunos residuos y puede contribuir a la estabilidad estructural y función del ARN modificado.
Metano
Anaerobiosis
Precursores de Ácido Nucleico
Flavobacteriaceae
Una familia de bacterias en el orden Sphingobacteriales, clase Sphingobacteria. Son bacilos gramnegativos, principalmente saprofíticos en hábitats terrestres y acuáticos.
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Electroforesis en Gel de Gradiente Desnaturalizante
Electroforesis en el que varios gradientes desnaturalizantes se utilizan para inducir los ácidos nucleicos a derretirse en las varias etapas que resultando en separación de moléculas basadas en es pequeñas diferencias en las secuencias incluyendo SNPs. Los desnaturalizantes utilizados contienen calor, formamida y urea.
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Ácido Diaminopimélico
El ácido diaminopimélico es un aminoácido intermediario en la biosíntesis de peptidoglicano, un componente crucial de las paredes celulares bacterianas.
Plancton
Conjunto de organismos acuáticos diminutos PLANTAS y ANIMALES y BACTERIAS fotosintéticas, que flotan libremente o están suspendidos en el agua, con poco o ningún poder de locomoción. Están divididos en FITOPLANCTON y ZOOPLANCTON.
Plásmidos
Antibacterianos
Sustancias que reducen el crecimiento o la reprodución de las BACTERIAS.
Chloroflexi
Filo de bacterias verdes no sulfúricas incluyendo la familia Chloroflexaceae, entre otras.
Eucariotas
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIAS y ARCHAEA), también llamado de Eukarya. Son organismos cuyas células están envueltas en membranas y poseen un núcleo. Comprenden casi todos los organismos unicelulares y muchos organismos pluricelulares. Tradicionalmente se dividen en grupos (a veces llamados reinos), incluyendo ANIMALES, PLANTAS, HONGOS, diferentes algas, y otros taxones que anteriormente formaban parte del antiguo reino Protista.
Rhodobacteraceae
Familia en el orden Rhodobacterales, clase ALPHAPROTEOBACTERIA.
Mycoplasma
Género de bacterias gram negativas, la mayoría facultativamente anaerobias de la familia MYCOPLASMATACEAE. Las células están revestidas por la MEMBRANA PLASMÁTICA y carecen de una verdadera PARED CELULAR. Estos organismos patógenos se encuentran en las MEMBRANA MUCOSA de humanos, ANIMALES y PÁJAROS.
ADN Mitocondrial
ADN de doble cadena de la MITOCONDRIA. En los eucariotas, el GENOMA mitocondrial es circular y codifica los ARN ribosómicos, ARN de transferencia y alrededor de 10 proteínas.
Factor de Transcripción TFIIIA
Biodegradación Ambiental
Sondas de ADN
ADN específico de especies o subespecies (incluyendo ADN COMPLEMENTARIO; genes conservados, cromosomas enteros, o genomas enteros) utilizado en estudios de hibridación con el fin de identificar los microorganismos, para medir homologías ADN-ADN, agrupar subespecies, etc. La sonda de ADN se hibrida con un ARNm específico, si está presente. Entre las técnicas convencionales que se utilizan para determinar el producto de hibridación se encuentran ensayos de "dot blot" (o inmunotransferencia por puntos), ensayos de "Southern blot" (o inmunotransferencia de Southern), y pruebas de anticuerpos específicos de híbridos ADN:ARN. Entre los marcadores convencionales de las sondas de ADN se encuentran los marcadores radioactivos 32P y 125I y el marcador químico biotina. El empleo de sondas de ADN proporciona un sustituto específico, sensible, rápido, y barato de técnicas de cultivo celular para el diagnóstico de las infecciones.
Cytophaga
Género de bacterias gram negativas deslizantes que se encuentran en el SUELO, el HUMUS, el AGUA DULCE y los hábitats marinos.
Violeta de Genciana
Consorcios Microbianos
Hibridación Fluorescente In Situ
Tipo de HIBRIDACION IN SITU en que las secuencias dianas se tiñen con colorante fluorescente de manera que se pueda determinar su localización y tamaño mediante el empleo de microscopía fluorescente. Esta coloración es lo suficientemente distintiva como para que la señal de hibridización pueda ser vista tanto en las difusiones de la metafase como en los núcleos de la interfase.
Eliminación de Residuos Líquidos
Mycobacterium
Halobacteriaceae
Familia de archaea extremadamente halofílica que se encuentra en ambientes con altas concentraciones de sal, como los lagos salados, salinas evaporadas o pescado salado. Las Halobacteriaceae son aerobios obligados o anaerobios facultativos y se dividen en al menos veintiséis géneros: HALOARCULA, HALOBACTERIUM, HALOCOCCUS, HALOFERAX, HALORUBRUM, NATRONOBACTERIUM y NATRONOCOCCUS.
Comamonadaceae
Una familia de bacterias gramnegativas aerobias en la clase BETA PROTEOBACTERIAS, circundando el complejo acidovorans rARN. Algunas especies son patogénicas para las PLANTAS.
Bacterias Anaerobias
Simbiosis
Subunidades Ribosómicas Grandes Bacterianas
Subunidad mayor del ribosoma 70S de eubacterias. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 37 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Sondas ARN
ARN preparado usualmente por transcripción a partir de ADN clonado, el cual es complementario de un ARNm específico o ADN y que se usa generalmente para estudiar genes de virus, distribución de ARN específico en tejidos y células, integración de ADN viral a los genomas, transcripción, etc. En tanto es preferible usar las SONDAS ADN a nivel macroscópico para detectar la presencia de ADN/ARN de especies o subespecies específicas, las sondas ARN se prefieren para estudios genéticos. El marcaje convencional para las sondas ARN incluyen los radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina. Las sondas ARN pueden dividirse por categorías en sondas ARN de sentido +, sondas ARN de sentido -, o sondas ARN antisentido.
Enzimas de Restricción del ADN
Enzimas que forman parte de los sistemas de restricción-modificación. Catalizan la segmentación endonucleolítica de secuencias de ADN que no poseen el patrón de metilación de la especie en el ADN de la célula hospedera. La segmentación produce fragmentos aleatorios, o específicos de doble cadena, con 5'-fosfatos terminales. La función de las enzimas de restricción es destruir cualquier ADN extraño que invada la célula hospedera. La mayoría ha sido estudiada en sistemas bacterianos, pero algunas han sido encontradas en organismos eucarióticos.También se han usado como herramientas en la disección sistemática y en el mapeo de los cromosomas, en la determinación de la secuencia de bases de ADNs y han hecho posible cortar y recombinar genes de un organismo al genoma de otro. EC 3.21.1.
Aminoglicósidos
Compuestos glicosilados en los que hay una amina que sustituye a un glicósido. Algunos son ANTIBACTERIANOS clinicamente importantes.
Mapeo Restrictivo
Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.
Heces
Subunidades Ribosómicas Pequeñas de Eucariotas
Subunidad menor de los ribosomas 80s de eucariotas. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 18S y alrededor de 32 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Evolución Molecular
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Helicobacter
Género de bacterias patógenas gram negativas, en forma de espiral que se han aislado del tracto intestinal de mamíferos, incluido el hombre.
Sensibilidad y Especificidad
Medidas binarias de clasificación para evaluar los resultados de la prueba.Sensibilidad o su índice de repeteción es la proporción de verdaderos positivos. Especificidad es la probabilidad de determinar correctamente la ausencia de una condición. (Del último, Diccionario de Epidemiología, 2d ed)
Metilación
Adición de grupos metilo. En histoquímica, la metilación se usa para esterificar grupos sulfato tratando cortes de tejido con metanol caliente en presencia de ácido clorhídrico. (Stedman, 25a ed)
Fenazinas
Genes
Flavobacterium
Género de bacterias aerobias, gramnegativas en forma de bastones que están ampliamente distribuidas en el SUELO y el AGUA. Sus organismos se encuentran también en carnes crudas, LECHE y otros ALIMENTOS, en los ambientes hospitalarios y en las muestras clínicas de humanos. Algunas especies son patógenas en humanos.
Ribonucleoproteínas Nucleolares Pequeñas
Complejos nucleolares de ARN-proteína que funcionan en el procesamiento del ARN pre-ribosómico.
Microbiota
Cytophagaceae
Familia de bacterias gramnegativas en el orden Cytophagales, clase Cytophagia. Se encuentra en el SUELO y AGUA DEL MAR.
Bacilos Grampositivos Formadores de Endosporas
Bacterias en forma de bastones que forman endosporas y que son grampositivas. Entre los géneros representativos se incluyen los BACILLUS y CLOSTRIDIUM.
Análisis de Secuencia de ARN
Subunidades Ribosómicas
Los dos complejos de ribonucleoproteína, de diferente tamaño, que constituyen un RIBOSOMA - la subunidad ribosómica mayor y la subunudad ribosómica menor. El ribosoma eucariótico de 80S está constituido por una subunidad mayor, de 60S, y una subunidad menor, de 40S. El ribosoma bacteriano de 70S está formado por una subunidad mayor, de 50S, y una subunidad menor, de 30S.
Sphingomonadaceae
Una familia de bacilos gramnegativos, asporogenosos o células ovoides, aerobios o facultativamente anaerobios quimioorganotróficos. Se aislan comunmente del SUELO, lodo activado o ambientes marinos.
Medios de Cultivo
Cualquier preparación líquida o sólida hecha específicamente para cultivo, almacenamiento o transporte de microorganismos u otros tipos de células. La variedad de los medios que existen permiten el cultivo de microorganismos y tipos de células específicos, como medios diferenciales, medios selectivos, medios de test y medios definidos. Los medios sólidos están constituidos por medios líquidos que han sido solidificados con un agente como el AGAR o la GELATINA.
Farmacorresistencia Bacteriana
Sitios de Unión
Ribonucleasa T1
Enzima que cataliza la segmentación endonucleolítica del ARN en la posición 3' de un residuo de guanilato. EC 3.1.27.3.
Bacterias Grampositivas Formadoras de Endosporas
Bacterias que forman endosporas y que son gram positivas. Entre los géneros representativos se incluyen los BACILLUS, CLOSTRIDIUM, MICROMONOSPORA, SACCHAROPOLYSPORA, y STREPTOMYCES.
Proteínas Inactivadoras de Ribosomas
N-Glicosidasas que remueven las adeninas del ARN RIBOSÓMICO, depurando el asa de la alfa-sarcina conservada del ARN RIBOSÓMICO 28S. Con frecuencia constan de una subunidad tóxica A y una atadura a la subunidad B de lectinas. Pueden ser consideradas como INHIBIDORES DE LA SÍNTESIS DE LA PROTEÍNA. Se encuentran en muchas PLANTAS y tienen actividad citotóxica y antiviral.
ARN Polimerasas Dirigidas por ADN
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Haloarcula marismortui
Reactores Biológicos
Herramientas o aparatos para generar productos empleando la capacidad de conversión sintética o química de un sistema biológico. Pueden ser fermentadores clásicos, sistemas de perfusión de cultivo de células, o biorreactores de enzimas. Para la producción de proteínas o enzimas, se seleccionan microorganismos recombinantes como las bacterias, células de mamífero, o células de insectos o de vegetales.
Ribotipificación
Análisis de POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCION de genes rARN que es usada para diferenciación entre especies o cepas.
Modelos Moleculares
Contaminantes del Suelo
Sustancias que contaminan el suelo. Se emplea para contaminantes del suelo en general o para aquellos que no tienen un título específico.
Secuencia de Aminoácidos
Suelo
El mineral no consolidada o materia orgánica en la superficie de la tierra que sirve como un medio natural para el crecimiento de las plantas terrestres.
Oligorribonucleótidos
Bacillus
Género de BACILLACEAE que son células formadoras de esporas, tienen forma de bastones. La mayoría de las especies son saprofitas del suelo con sólo unas pocas especies que son patógenas.
Prevotella
Género de bacilos gramnegativos, anaerobios, que no forman esporas, inmóviles. Los organismos de este género originalmente se clasificaron como miembros del género BACTEROIDES pero hallazgos bioquímicos y químicos en 1990 indicaron la necesidad de separarlos de otras especies de Bacteroides, y por ello se estableció este nuevo género.
Subunidades Ribosómicas Grandes
Técnicas Bacteriológicas
Técnicas utilizadas en el estudio de bacterias.
Tracto Gastrointestinal
Exorribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación exonucleolítica del ARN. Incluye EC 3.1.13.-, EC 3.1.14.-, EC 3.1.15.-, y EC 3.1.16.-. EC 3.1.-
Genotipo
Peptidil Transferasas
Aciltransferasas que usan AMINOACIL ARNT como aminoácido donante en la formación de una unión peptídica. existen peptidil transferasas ribosómicas y no ribosómicas.
ADN Intergénico
Cualquiera de los ADN entre los ADN que codifican genes, incluyendo a regiones no traducidas, regiones flanqueadoras 5' y 3', INTRONAS, pseudogenes no funcionales, y secuencias repetitivas no funcionales. Este ADN puede o no codificar funciones reguladoras.
Biología Marina
Ribonucleasas
Enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces éster dentro del ARN. EC 3.1.-.
Cilióforos
Filo de EUCARIOTAS caracterizadas por la presencia de cilios en algún momento de su ciclo de vida. Constituido por tres clases: CINETOFRAGMINÓFOROS, OLIGOHIMENÓFOROS, y POLIMENÓFOROS.
Cocos Grampositivos
Lactobacillus
Género de bacterias grampositivas, microaerofílicas, en forma de bastoncillos que están ampliamente distribuidas en la naturaleza. Sus especies son parte también de la flora normal de la boca, del tracto intestinal y de la vagina de muchos mamíferos incluidos del hombre. La patogenicidad de este género es rara.
Locomoción
Genes Fúngicos
Unidades hereditarias funcionales de los HONGOS.
Poríferos
Filum de esponjas, que son animales multicelulares sésiles, con alimentación en suspensión, que utilizan células flageladas llamadas coanocitos para propalar agua. La mayoria son hermafroditas. Probablemente existió una rama evolutiva que no dió lugar a ningún otro tipo de animal. Excepto para las aproximadamente 150 especies de agua dulce, las esponjas son animales marinos. Son una fuente de ALCALOIDES, ESTEROLES y otras moléculas complejas útiles en medicina e investigación biológica.
Regiones Árticas
Emparejamiento Base
Apareamiento de las bases de purinas y pirimidinas por ENLACES DE HIDRÓGENO en la molécula de doble cadena de ADN o ARN.
Regiones Antárticas
Chryseobacterium
Un género de bacterias aeróbicas gramnegativas en la familia FLAVOBACTERIACEAE. Muchas de estas especies fueron antiguamente del género FLAVOBACTERIUM.
Clasificación
Plantas
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
Crenarchaeota
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Hongos
Reino de organismos eucariónticos, heterotróficos que viven parasitamente como sáprobos, incluyendo las setas (AGARICALES), LEVADURAS, moho, etc. Se reproducen sexual o asexualmente, y tienen ciclos de vida que van desde los simples a los complejos. Los hongos filamentosos, habitualmente llamados mohos, se refieren a los que crecen como colonias multicelulares.
Residuos Industriales
Tetrahymena
Bacterias Gramnegativas
Alteromonadaceae
Mar Mediterráneo
No puedo proporcionar una definición médica de 'Mar Mediterráneo' ya que no es un término relacionado con la medicina, la salud o las ciencias de la vida. El Mar Mediterráneo es un mar interior en el sistema de mares interconectados de la Tierra, geográficamente localizado entre Europa, Asia y África.
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
ARNt Metiltransferasas
Enzimas que catalizan la metilación dependiente de S-adenosil-L-metionina de las bases ribonucleótidas en el interior de una molécula de ARN de transferencia. EC 2.1.1.
Corynebacterium
Género de bacterias esporogénicas que están ampliamente distribuidas en la naturaleza. Sus organismos aparecen como bacilos rectos o ligeramente curvos y se conoce que son parásitos humanos y de animales y patógenos.
Ricina
Procesos Heterotróficos
Procesos en los que los organismos utilizan sustancias orgánicas como fuente de nutrientes. Se diferencian de los PROCESOS AUTÓTROFOS, que recurren a sustancias inorgánicas simples como fuente de aporte de nutrientes. Los heterótrofos pueden ser quimioheterótrofos (o quimioorganótrofos), que también necesitan compuestos orgánicos como la glucosa para satisfacer sus necesidades energéticas metabólicas principales, o fotoheterótrofos (o fotoorganótrofos), que satisfacen sus necesidades energéticas principales gracias a la luz. Dependiendo de las condiciones ambientales, algunos organismos pueden pasar de un modo nutricional a otro diferente (AUTOTROFIA, heterotrofia, quimiotrofia o FOTOTROFIA) para utilizar distintas fuentes con el fin de satisfacer sus necesidades de nutrientes y energía.
Bacterioclorofila A
Recuento de Colonia Microbiana
Enumeración por conteo directo de viables, aisladas células bacterianas, arquea, o por hongos o esporas capaz de un crecimiento sólido en medios de cultivo. El método se utiliza habitualmente por los microbiólogos ambientales para la cuantificación de microorganismos en el AIRE, ALIMENTOS y AGUA, por los médicos para medir la carga microbiana de los pacientes microbiana, y en las pruebas de drogas antimicrobianas.
Streptococcaceae
Familia de bacterias grampositivas que no forman esporas entre las que se incluyen diversas formas parásitas, patógenas y saprofitas.
Bradyrhizobium
ARN Nuclear Pequeño
Cadenas cortas de ARN (100-300 nucleótidos de largo) abundantes en el núcleo y que usualmente forman complejos con las proteínas en las ARNnps (RIBONUCLEOPROTEÍNAS, NUCLEARES PEQUEÑAS). Muchas funcionan en el procesamiento de los precursores del ARN mensajero. Otros, los ARNnops (ARN, NUCLEOLAR PEQUEÑO), participan en el procesamiento de los precursores del ARN ribosómico.
Rhizobiaceae
Uridina
Uridina es una nucleósido pirimidina, un componente fundamental de ARN y fuente de energía y estructura para células vivas.
Southern Blotting
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Humedales
Los ambientes o los hábitat en la interfaz entre los ecosistemas verdaderamente terrestres y los sistemas verdaderamente acuáticos que los hace diferentes de cada uno no obstante, con alto nivel de dependencia por los dos. Las adaptaciones al bajo oxígeno de suelo caracterizan muchas especies de la zona pantanosa.
Methylobacterium
Género de bacilos gramnegativos, aerobios, facultativamente metilotrópicos que se encuentran aislados u ocasionalmente en rosetas. Los miembros de este género usualmente son móviles y se aislan de los suelos, el polvo, el agua dulce, el sedimento de lagos, la superficie de las hojas, el arroz, el aire y los ambientes hospitalarios.
Concentración de Iones de Hidrógeno
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Macrólidos
Grupo de compuestos macrocíclicos glicolisados formados por una extensión de cadena de múltiples PROPIONATOS y ciclizados a una lactona con muchos miembros (habitualmente 12, 14, 16). Los macrólidos pertenecen a la clase POLICÉTIDOS de productos naturales, y muchos miembros demuestran propiedades antibióticas.