Qualquier miembro de la clase de enzimas que catalizan la segmentación de un enlace químico con la adición de agua, ejemplo, las ESTERASAS, glicosidasas (GLICÓSIDO HIDROLASAS), lipasas, NUCLEOTIDASAS, peptidasas (PÉPTIDO HIDROLASAS) y fosfatasas (HIDROLASAS MONOÉSTER FOSFÓRICAS). (Dorland, 28a ed). EC 3.
Glicósido hidrolasas (o glicosidasas) catalizan la hidrólisis del acoplamiento glicosídico para generar dos azúcares más pequeños. Ellas son enzimas sumamente comunes con papeles en la naturaleza incluyendo la degradación de biomasa como la celulosa y hemicellulose, en estrategias de defensa antibacterianas (ej. lisozimas), en mecanismos patogénicos (ej. neuraminidasas virales) y en la función normal celular (ej. ajustando manosidasas implicadas en la biosíntesis de glicoproteinas N-ligadas). Con las glicosiltransferasas, glicosidasas forman la principal maquinaria catalítica para la síntesis y la ruptura de enlaces glicosídicos.
Enzimas que catalizan reversiblemente la formación de un epóxido u óxido de areno a partir de un glicol o diol aromático, respectivamente.
Enzimas que catalizan la hidrólisis de ésteres de ácidos carboxílicos con la formación de un alcohol y un anión de ácido carboxílico.
Tipos de partículas citoplásmicas en los tejidos animales y de plantas heterogéneos morfológicamente y caracterizados por su contenido de enzimas hidrolíticas y su estructura, vinculada a la latencia de estas enzimas. Las funciones intracelulares de los lisosomas dependen de su potencial lítico. La membrana simple de la unidad lisosomal actúa como una barrera entre las enzimas encerradas en el lisosoma y el substrato externo. La actividad de las enzimas contenidas en los lisosomas está limitada o es nula a menos que se rompa la vesícula donde están encerradas. Se supone que tal ruptura esté bajo control metabólico (hormonal). (Rieger, et, al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed)
Enzima que cataliza la conversión de un monoéster ortofosfórico y agua en un alcohol y ortofosfato. EC 3.1.3.2.
Enzima que hidroliza el enlace glucosídico en el cual reside la función reductora del ácido glucurónico. Está presente en todos los tejidos animales, principalmente en el hígado y el bazo; interviene en la degradación del ácido hialurónico. La enzima glucuronidasa beta hidroliza selectivamente los enlaces beta-glucosidurónicos y los grupos arilo, acilo o alcohol. (Diccionario terminológico de ciencias médicas, Masson, 13a ed.)
Enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos de N-acilhexosamina en N-acilhexosamidas. Las hexosaminidasas también actúan sobre GLUCÓSIDOS, GALACTÓSIDOS y algunos OLIGOSACÁRIDOS.
Ésteres ácidos fosfóricos de manosa.
Enzima autolítica unida a la superficie de las paredes celulares bacterianas. Cataliza la hidrólisis del enlace entre residuos de N-acetilmuramoil y los residuos de L-aminoácido en ciertos glicopéptidos de la pared celular, particularmente el peptidoglucano. EC 3.5.1.28.
Hidrolasas que desdoblan especificamente las uniones peptídicas de las PROTEINAS y los PÉPTIDOS. Ejemplos de subclases de este grupo son las EXOPEPTIDASAS y ENDOPEPTIDASAS.
Grupo de enfermedades metabólicas hereditarias que se caracterizan por el acúmulo de cantidades excesivas de ácidos mucopolisacáridos, esfingolípidos, y/o glicolípidos en las células viscerales o mesenquimales. Cantidades anormales de esfingolípidos o glicolípidos están presentes en el tejido neural. DISCAPACIDAD INTELECTUAL y cambios esqueléticos, principalmente la disostosis múltiple, ocurren con frecuencia.(Traducción libre del original: Joynt, Clinical Neurology, 1992, Ch56, pp36-7)
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Las tioléster hidrolasas son enzimas que catalizan la hidrólisis de ésteres tiol, desempeñando un rol crucial en la regulación del metabolismo de lípidos y sulfolípidos.
Receptor específico para la IGF-II y la manosa-6-fosfato. El receptor es un polipéptido con una sola cadena con 250 kD que no se relaciona estructuralmente con el receptor IGF tipo1 (RECEPTOR IGF TIPO 1) y que no tiene un dominio tirosina quinasa.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Beta-N-acetilhexoasaminidasa que cataliza la hidrólisis de residuos 2-acetamido-2-desoxi-beta-glucosa terminales, no reductores en la quitobiosa y análogos mayores, así como en glicoproteínas. Se ha utilizado ampliamente en estudios estructurales delas paredes celulares bacterianas y en el estudio de enfermedades como la MUCOLIPIDOSIS y diversos trastornos inflamatorios del músculo y el tejido conjuntivo.
Enzima que cataliza la hidrólisis de un alfa L-fucósido para dar lugar a un alcohol y L-fucosa. La deficiencia de esta enzima puede causar FUCOSIDOSIS. EC 3.2.1.51.
Proceso de disociación de un compuesto químico por la adición de una molécula de agua.
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces alfa o beta-xilosídicos. EC 3.2.1.8 cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,4-beta-D-xilosídicos; EC 3.2.1.32 cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,3-beta-D-xilosídicos; EC 3.2.1.37 cataliza la exohidrólisis de enlaces 1,4-beta-D de los terminales no reductores de los xilanos; y la EC 3.2.1.72 cataliza la exohidrólisis de enlaces 1,3-beta-D de los terminales no reductores de los xilanos. Han sido identificadas otras xilosidasas que catalizan la hidrólisis de enlaces alfa-xilosídicos.
Una endocelulasa con especificidad para la hidrólisis de enlaces 1.4-beta-glicosídicos en la CELULOSA, liquenina y beta-glucanos de cereales.
Género de bacterias aerobias, gramnegativas, móviles, ligeramente curvas y que tienen forma de bastoncillos.
Exocelulasa con especificidad por distintos sustratos beta-D-glucósidos. Cataliza la hidrólisis de residuos terminales no reductores en los beta-D-glucósidos con liberación de GLUCOSA.
Familia de galactósido hidrolasas que hidrolizan compuestos con un enlace O-galactosil.EC 3.2.1.-.
Una enzima que cataliza la hidrólisis de residuos no-reducibles beta-D-manosa terminales en beta-D-manosidas. La enzima desempeña un rol en la degradación lisosomal de los N-glicosilproteína glicanos. Los defectos en la forma lisomal de la enzima en humanos resulta en la reconstrucción de metabolitos de manosida intermediarios y la enfermedad BETA-MANOSIDOSIS.
Una enzima que cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,4-beta-D-xilosídico en XILANOS.
Polisacáridos constituídos por unidades de xilosa.
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces difosfato en compuestos tales como nucleósido di- y tri-fosfatos y anhídridos que contienen sulfonil, tales como el adenililsulfato. EC 3.6.
Enzimas que catalizan la hidrólisis de un fenol sulfato para dar lugar a un fenol y sulfato. Han sido separadas arilsulfatasas A, B y C. La deficiencia de arilsulfatasas es una de las causas de la leucodistrofia metacromática (LEUCODISTROFIA METACROMATICA). EC 3.1.6.1.
Hexosaminidasa específica de los residuos no reductores de N-acetil-D-hexosamina en N-acetil-beta-D-hexosamínidas. Actúa sobre GLUCÓSIDOS, GALACTÓSIDOS y algunos OLIGOSACÁRIDOS. Dos isoenzimas específicas de mamíferos de la beta-N-acetilhexoaminidasa se denominan HEXOSAMINIDASA A y HEXOSAMINIDASA B. La deficiencia de lla isoenzima A causa la ENFERMEDAD DE TAY-SACH, mientras que la deficiencia de las isoenzimas A y B causa la ENFERMEDAD DE SANDHOFF. La enzima también se ha utilizado como marcador tumoral para distinguir las neoplasias malignas y benignas.
Enzimas digestivas que catalizan la hidrólisis de disacáridos en monosacáridos, como la sacarosa, maltosa y lactasa.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Grupo de enzimas dentro de la clase EC 3.6.1.- que catalizan la hidrólisis de enlaces difosfato, principalmente en los nucleósidos di y trifosfatos. Pueden liberar mono- o difosfato. EC 3.6.1.-.
Grupo de proteinasas o endopeptidasas lisosomales presentes en los extractos acuosos de una variedad de tejidos animales. Funcionan óptimamente dentro de un rango de pH ácido. Las catepsinas existen como varios subtipos de enzimas incluyendo PROTEASAS DE SERINA, PROTEINASAS ASPÁRTICAS y PROTEASAS DE CISTEÍNA.
Las amidohidrolasas son enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces amida, desempeñando un rol crucial en diversos procesos metabólicos, como el catabolismo de aminoácidos y nucleótidos.
Enzimas que hidrolizan compuestos O-glucosilados. EC 3.2.1.-.
Glucósido hidrolasas que catalizan la hidrolisis de alfa o beta MANOSA.
Clase de enzimas implicadas en la hidrólisis de los enlaces N-glicosídicos de los azúcares unidos al nitrógeno.
Proteinasa intracelular presente en una variedad de tejidos. Tiene especificidad similar a la de la pepsina A, pero más estrecha. La enzima interviene en el catabolismo del cartílago y del tejido conjuntivo. EC 3.4.23.5. (Anteriormente EC 3.4.4.23).
La capa mas externa de una célula en la matoría de las PLANTAS, BACTERIAS, HONGOS y ALGAS. La pared celular generalmente es una estructura rigida externa a la MEMBRANA CELULAR y proporciona una barrera protectora contra agentes físicos y químicos.
Un insecticida organofosforado que inhibe la monoaminooxidasa y la acetilcolinesterasa. Ha sido demostrado que es genotóxico.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Clase de enzimas que transfieren grupos fosfatos sustituídos. EC 2.7.8.
Familia de glicosidasas que hidrolizan la CELULOSA cristalina en moléculas de azúcar soluble. En esta familia hay distintos subtipos de enzimas con especificidades de sustratos diferenciados que deben actuar juntas para efectuar la hidrólisis completa de la celulosa. Se encuentran en estructuras llamadas CELULOSOMAS.
La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.
En biología molecular, 'esterasas' son enzimas que catalizan la hidrólisis de ésteres, produciendo alcoholes y ácidos carboxílicos.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Cualquier espacio o cavidad dentro de una célula. Pueden participar en las funciones de digestión, almacenamiento, secreción o excreción.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.
Polisacárido con unidades de glucosa enlazadas igual que en la CELOBIOSA. Es el constituyente principal de las fibras vegetales, siendo el algodón la forma natural más pura de esta sustancia. Como materia prima, constituye la base de muchos derivados empleados en cromatografía, materiales de intercambio iónico, fabricación de explosivos y preparados farmacéuticos.
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Un grupo de cuatro proteínas activadoras de esfingolípidos homólogas formadas de segmentación proteolítica de una molécula común precursora de proteína referida como prosaposina.
Enzima que cataliza la conversión de los ésteres de acetato y agua en alcoholes y acetato. EC3.1.1.6.
Una exocelulasa con especificidad para la hidrólisis de enlaces 1,4-beta-D-glucosídico en CELULOSA y celotetraosa. Cataliza la hidrólisis de Ios terminales no-reducibles finales de beta-D-glucósidos con liberación de CELOBIOSA.
Enzimas que catalizan la remoción de grupos sulfato de diversos sustratos orgánicos, desempeñando funciones importantes en procesos biológicos como el metabolismo y homeostasis.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Enzima que hidroliza la sacarosa por escisión en sus constituyentes glucosa y fructosa. Se encuentra en las células de la levadura de cerveza y en las microvellosidades intestinales, donde hidroliza la sacarosa de la dieta. (Diccionario terminológico de ciencias médicas, Masson, 13a ed.)
Enzima que cataliza la hidrólisis de ÉSTERES DE COLESTEROL y algunos otros ésteres de esterol, para liberar al colesterol más un anión de ácido graso.
Grupo de hidrolasas que catalizan la hidrólisis de ésteres monofofóricos con la producción de un mol de ortofosfato. EC 3.1.3.
Polisacáridos compuestos de unidades de glucosa repitentes. Pueden estar constituídos por cadenas ramificadas o no ramificadas en cualquier enlace.
Una enzima que cataliza la HIDROLISIS de residuos terminales, no reducibles alfa-D-manosa en alfa-D-manosidas. La enzima desempeña un rol en el proceso de formación de nuevos N-glicanos y en la degradación de GLICOPROTEINAS maduras. Hay múltiples isoformas de alfa-manosidasa, cada una tiene su propia ubicación celular específica y pH óptimo. Los defectos en la forma lisosomal de la enzima resulta en una reconstrucción de metabolitos de manosida intermediarios y la enfermedad ALFA-MANOSIDOSIS.
Enzimas que catalizan la exohidrólisis de enlaces 1,4-alfa-glucosídicos con liberación de alfa-glucosa. La deficiencia de alfa-1,4-glucosidasa puede causar la ENFERMEDAD POR ALMACENAMIENTO DE GLUCOGENO TIPO II. EC 3.2.1.20.
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Una carboxipeptidase que cataliza la liberación de un aminoácido C-terminal con una amplia especificidad. También desempeña una función en los LISOSOMAS, protegiendo de la degradación a la BETA-GALACTOSIDASA y a la NEURAMINIDASA. Fue clasificada antiguamente como EC 3.4.12.1 y EC 3.4.21.13.
Carbohidratos formados por dos a diez MONOSACARIDOS conectados por un enlace alfa- o beta-glicosídico. Son encontrados por toda la naturaleza tanto en la forma livre como vinculada.
El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.
Enzima que cataliza reversiblemente la hidrólisis del palmitoil-CoA u otros compuestos de coenzima A con acilos de cadena larga para dar lugar a CoA y palmitato u otros acil ésteres. La enzima interviene en la esterificación de ácidos grasos para formar triglicéridos. EC 3.1.2.2.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Orden de hongos del filum NEOCALLIMASTIGOMYCOTA que comprende chitridos anaerobios que están en el RUMEN y el CIEGO de animales hervíboros. Los géneros (todos los de la única familia Neocallimasticaceae) incluyen NEOCALLIMASTIX, Orpinomyces, PIROMYCES, Anaeromyces, Cyllamyces, y Caecomyces.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Género de bacilos gramnegativos, que son rectos o curvos y que se mueven por medio de un flagelo único polar. Los miembros de este género se encuentran en las aguas costeras y en el océano abierto.
Enzima que cataliza la conversión de N(4)-(beta-N-acetil-D-glucosaminil)-L-aspargina y agua a N-acetil-beta-D-glucosaminilamina y L-aspartato. Actúa sólo sobre oligosacáridos con ASPARAGINA que contienen un aminoácido, es decir, la aspargina tiene grupos alfa-amino y alfa-carboxílico libres.
Un género de bacterias gramnegativas, anaerobias en la familia Fibrobacteraceae, aislada del TRACTO GASTROINTESTINAL humano.
Endocelulasa con especificidad por la hidrolisis de enlaces 1,3-beta-D-glucosídicos en los 1,3-beta-D-glucanos, incluyendo laminarin, paramilon y paquiman.
Clase de enzimas que catalizan la hidrólisis de uno de los dos enlaces éster en un compuesto fosfodiéster. EC 3.1.4.
Compuestos orgánicos que incluyen un éter cíclico con tres anillos de átomos en su estructura. Se utilizan comúnmente como precursores para POLÍMEROS tales como las RESINAS EPOXI.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Ruptura de las células bacterianas debido a una fuerza mecánica, acción química o el crecimiento lítico de BACTERIÓFAGOS.
Carboxilesterasa es una esterasa serina-dependiente con amplia especificidad de sustrato. La enzima está involucrada en la detoxificación de XENOBIOTICOS y la activación de éster y de amida PRODROGAS.
Peptidoglicano es un polímero complejo formado por cadenas alternas de azúcares y péptidos, constituuyendo la capa fundamental de la pared celular en bacterias gram positivas y parcialmente en gram negativas.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Una exocelulasa con especificidad para enlaces 1,4-beta-glucosídicos de 1,4-beta-D-glucanos resultando en remoción sucesiva de unidades de GLUCOSA.
Género de hongos en la familia Neocallimasticaceae, orden NEOCALLIMASTICALES, que contienen zoosporas uniflageladas.
Polisacáridos son largas cadenas de azúcares simples unidos por enlaces glucosídicos, desempeñando funciones estructurales y de almacenamiento de energía en organismos vivos.
Enzimas que degradan la quitina, hidrolizando los enlaces beta(1,4). Se encuentran en muchos organismos, desde bacterias, virus y hongos, hasta plantas y animales, con actividades específicas dependiendo de los organismos: en los hongos tienen funciones autolíticas, nutricionales y morfogénicas; en las bacterias digieren la quitina para obtener energía; en las plantas intervienen en la defensa y el desarrollo; y en crustáceos e insectos participan en los procesos de muda. (http://recursostic.javeriana.edu.co/wiki/index.php/Bioinformática_de_Quitinasas, 01-03-2009)
Hongo imperfecto causante de manchas o moho negro en varias frutas, vegetales, etc.
Enzimas que catalizan la transferencia de grupos glicosil a un aceptor. Más frecuentemente, la molécula de carbohidrato actúa como aceptor, pero el fosfato inorgánico también puede actuar como aceptor, como en el caso de las fosforilasas. Algunas enzimas de este grupo catalizan también la hidrólisis, que puede ser considerada como transferencia de un grupo glicosil de un donador para el agua. Las subclases comprenden las HEXOSILTRANSFERASAS, PENTOSILTRANSFERASAS, SIALILTRANSFERASAS, y aquellas que transfieren otros grupos glicosil. EC 2.4.
Enzimas que actúan en la extremidad C-terminal libre de un polipéptido para liberar un solo residuo de aminoácido.
Una tioéster hidrolasa que actúa sobre ésteres formados entre tioles como DITIOTREITOL o GLUTATION y el residuo de la glicina C-terminal de UBIQUITINA.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Enzima de la clase de las hidrolasas que contiene zinc, que cataliza la remoción del aminoácido N-terminal de la mayoría de los L-péptidos, particularmente aquellos con residuos de leucina N-terminal, pero no aquellos con residuos N-terminales de lisina o arginina. Esto tiene lugar en el citosol celular de los tejidos, con actividad elevada en el duodeno, hígado y riñón La actividad de esta enzima es comúnmente analizada utilizando una leucina arilamida de sustrato cromogénico como el leucil beta-naftilamida.
Subclase de PÉPTIDO HIDROLASAS que catalizan la división interna de PÉPTIDOS y PROTEINAS.
Cisteína proteinasa lisosomal que hidroliza proteínas, con especificidad similar a la de la PAPAÍNA. La enzima está presente en una variedad de tejidos y es importante en muchos procesos fisiológicos y patológicos. En patología se ha comprobado que la catepsina B interviene en la DESMIELINIZACIÓN, ENFISEMA, ARTRITIS REUMATOIDE e INVASIVIDAD NEOPLÁSICA.
Género de hongo mitospórico que se encuentra con frecuencia en los suelos y en la madera. Algunas veces se utiliza para controlar los hongos patógenos. Su teleomorfo es la HYPOCREA.
Una familia de cofactores de glicoproteína necesarios para la eficiente catabolización de los ESFINGOLIPIDOS mediante hidrolasas ácidas específicas tales como la GLUCOSILCERAMIDASA; GALACTOCEREBROSIDASA; BETA-N-ACETILHEXOSAMINIDASA y CEREBROSIDO-SULFATASA.
Hexosafosfatos son moléculas de azúcar complejas (polisacáridos), específicamente glucógeno en animales y almidón en plantas, que desempeñan un papel vital en el almacenamiento y suministro de energía celular.
Procesos celulares de la biosíntesis (anabolismo) y degradación (catabolismo) de los CARBOHIDRATOS.
Una suspensión de partículas de oro radioactivo que emiten partículas beta negativas e irradiación gamma. Fue utilizada anteriormente para escanografía del hígado y tratamiento por irradiación de algunas enfermedades malignas metastásicas.
Un género facultativamente anaerobio de cocoides ARCHAEA, en la familia SULFOLOBACEAE. Las células son altamente irregulares de forma y termoacidofílicas. El crecimiento litotrófico ocurre aeróbicamente por oxidación de azufre en algunas especies. La distribución incluye manantiales solfatáricos y campos, lodazales, y ambientes marinos ácidos geotérmicamente calientes.
Una hexosa o monosacárido fermentable e isómero de la glucosa del maná, el Fraxinus ornus y otras plantas relacionadas.
Una familia de bacterias gramnegativas aerobias en la clase BETA PROTEOBACTERIAS, circundando el complejo acidovorans rARN. Algunas especies son patogénicas para las PLANTAS.
Subclase de exopeptidasas que incluye enzimas que rompen dos o tres AMINOÁCIDOS desde el final de una cadena de péptidos.
Pequeñas proyecciones de las membranas celulares que aumentan enormemente el área superficial de la célula.
Componentes de una célula que se obtienen por medio de diversas técnicas de separación las cuales, aunque rompen la delicada anatomía de una célula, preservan la estructura y fisiología de sus componentes funcionales y permiten realizar análisis bioquímicos y ultraestructurales.(Alberts, et al., Molecular Biology of the Cell, 2d ed, p163)
Subclase de las EXOPEPTIDASAS que actúan en la extremidad N-terminal libre de un polipéptido, liberando un solo residuo de aminoácido. EC 3.4.11.
Género EUCARIOTAS flagelados que poseen tres largos flagelos anteriores.
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Género de bacterias gram negativas deslizantes que se encuentran en el SUELO, el HUMUS, el AGUA DULCE y los hábitats marinos.
Cualquier enzima que escinde hidrolíticamente un anión de ácido graso a partir de un triglicérido o un fosfolípido. Triacilglicerol-lipasa: enzima de la clase hidrolasa que cataliza la escisión de los grupos acil grasos externos de los triglicéridos en la digestión de las grasas dietéticas. (Dorland, 28a ed).
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Un género de bacterias grampositivas, en la familia Lachnospiraceae que habita el RUMEN, INTESTINO GRUESO y CIEGO de MAMIFEROS.
Estructuras extracelulares encontradas en una variedad de microorganismos. Contienen CELULASAS y desempeñan un importante rol en la digestión de la CELULOSA.
Complejo enzimático que se halla en las membranas de las márgenes de las vellosidades del intestino delgado. Se considera un complejo enzimático con sitios catalíticos diferentes. Su ausencia se manifiesta en una enfermedad hereditaria llamada deficiencia de sacarasa-isomaltasa.
Bacterias estrictamente autotróficas que oxidan azufre y tiosulfato en ácido sulfúrico. Anteriormente se llamaba Thiobacillus thiooxidans.
Proteínas que se encuentran en cualquier especie de hongo.
Polisacáridos de alto peso molecular presentes en la pared celular de todas las plantas. Las pectinas pegan las paredes celulares entre sí. Se utilizan como emulsionantes y estabilizantes en la industria alimentaria. Han sido probadas en una gran variedad de usos terapéuticos, incluso como agente antidiarreico, para lo que en la actualidad no se les considera efectivas y en el tratamiento de la hipercolesterolemia.
Polisacárido lineal de unidades de ACETILGLUCOSAMINA unidas entre sí por enlaces beta-1,4. Es el segundo biopolímero más abundante en la tierra y se encuentra sobre todo en INSECTOS y HONGOS. Al desacetilarse se le denomina QUITOSANA.
Técnicas para dividir varios componentes de la célula en FRACCIONES SUBCELULARES.
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Enzimas que catalizan la endohidrólisis de los enlaces 1,4-alfa-glicosídicos en el ALMIDÓN, GLUCÓGENO, y POLISACÁRIDOS y OLIGOSACÁRIDOS relacionados que contienen 3 o más unidades de D-glucosa enlazadas en 1,4-alfa.
Familia de hongos, del orden de los POLYPORALES, que se encuentran en maderas en descomposición.
Enzima que cataliza la hidrólisis de monoésteres de glicerol de ácidos grasos de cadena larga. EC 3.1.1.23.
Englobamiento de líquidos por las células en un proceso de invaginación y cierre de la membrana celular en el cual se forman vacuolas llenas de líquido.
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de los procesos o fenómenos químicos; comprende el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Grupo de bacterias anaerobias en forma de bastoncillos que muestran color rosado (negativos) cuando se tratan con el método de coloración de Gram.
Derivados del naftaleno que contienen el radical -CH2CCO2H en la posición 1, en la posición 2, o en ambas. Estos compuestos se usan como reguladores del crecimiento vegetal para retardar la germinación, controlar las malas hierbas, diminuir el fruto, etc.
Moléculas biológicas que poseen actividad catalítica. Pueden darse naturalmente o ser creadas sintéticamente. Las enzimas son usualmente proteínas, aunque también se han identificado moléculas de ARN CATALITICO y ADN CATALITICO.
Un inhibidor organofosforado de la colinesterasa que es utilizado como pesticida.
Captación por la célula de materiales extracelulares en vacuolas o microvesículas delimitadas por membranas. Los ENDOSOMAS desempeñan un papel central en la endocitosis.
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.
Espacios delimitados dentro de las células debidos a membranas selectivamente permeables que encierran cada una de las partes separadas, por ej. mitocondrias, lisosomas, etc.
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Amplia categoría de proteínas implicadas en la formación, transporte y disolución de VESÍCULAS TRANSPORTADORAS. Ellas tienen un papel en el transporte intracelular de las moléculas contenidas en vesículas de membrana. Las proteínas de transporte vesicular se distinguen de las PROTEÍNAS DE TRANSPORTE DE MEMBRANA, que mueven las moléculas a través de las membranas, modo por el que se transportan las moléculas.
Hongo imperfecto presente en la mayoría de las semillas agrícolas y que es a menudo responsable del deterioro de toda la cosecha almacenada. Se utiliza también en la producción de alimentos o bebidas fermentadas, especialmente en Japón.
La arabinosa es un azúcar monosacárido (pentosa) hexonato de ácido L-arábino, que se encuentra como componente estructural en varios polisacáridos y glicoconjugados en plantas, microorganismos y algunos invertebrados.
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Grupo de enfermedades hereditarias, a menudo fatales, que se caracterizan por la acumulación de GANGLIÓSIDOS en los LISOSOMAS, secundaria a estados de deficiencia enzimática. Las gangliosidosis incluyen la ENFERMEDAD DE TAY-SACHS, la GANGLIOSIDOSIS GM1, la GANGLIOSIDOSiS GM2 y la ENFERMEDAD DE SANDHOFF, que comparte el comienzo neonatal o infantil del deterioro del SISTEMA NERVIOSO CENTRAL. (Adaptación del original: Menkes, Textbook of Child Neurology, 5th ed, pp89-97).
Xilosidasa que cataliza la hidrólisis aleatoria de enlaces 1,3-beta-D-xilosídicos en 1,3-beta-D-xilanos.
Enzima que cataliza la hidrólisis de residuos terminales no reductores de alfa-D-galactosa en los alfa-galactósidos, incluyendo oligosacáridos de galactosa, galactomananos y galactolípidos. EC 3.2.1.22.
Gran cantidad de vesículas aplanadas cuya función es el procesamiento postraduccional y la clasificación de proteínas que reciben desde el RETICULO ENDOPLASMICO rugoso y dirigen hacia las vesículas de secreción, los LISOSOMAS o la MEMBRANA CELULAR. El movimiento de las proteínas tiene lugar mediante la transferencia de las vesículas que brotan del retículo endoplásmico rugoso o el aparato de Golgi y se fusionan con el de Golgi, los lisosomas o las membranas celulares.(Glick, Glossary of Biochemistry and Molecular Biology, 1990)
Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.
Enzima que cataliza la conversión de un monoéster ortofosfórico y agua en un alcohol y ortofosfato. EC 3.1.3.1.
Vesículas citoplasmáticas que se forman cuando las VESICULAS CUBIERTAS pierden su revestimiento de CLATRINA. Los endosomas internalizan las macromoléculas fijadas por los receptores sobre la superficie de la célula.
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Actividad de enzima hidrolítica que se usa como test histoquímico para la presencia de esterasas en el tejido. El sustrato que se usa es el cloroacetato de 3-hidroxi-4'-nitro-2-naftanilida (naftol AS-D).
La facilitación de reacciones bioquímicas con la ayuda de catalizadores de origen natural tales como las ENZIMAS.
Una enzima que cataliza el catabolismo de S-ADENOSILHOMOCISTEINA a ADENOSINA y HOMOCISTEINA. Puede jugar un rol en la regulación de la concentración de adenosilhomocisteína intracelular.
Un gran órgano glandular lobulada en el abdomen de los vertebrados que es responsable de la desintoxicación, el metabolismo, la síntesis y el almacenamiento de varias sustancias.
Las ureohidrolasas son enzimas que catalizan la hidrólisis reversible de urea en carbamato y amoníaco, desempeñando un papel importante en el ciclo del nitrógeno microbiano.
Una especie de bacterias gram-positiva, termofílicas, celulolíticas de la familia Clostridaceae. Degrada y fermenta CELOBIOSA y CELULOSA a ETANOL en el CELULOSOMA.
Género de hongos en la familia Neocallimasticaceae, orden NEOCALLIMASTIGALES. Ellos contienen zoosporas poliflageladas y crecen con un rango de carbohidratos de simples a complejos en el rumen de carneros y de ganado bovino.
Los azúcares de Uridina Difosfato (UDP-sacáridos) se refieren a formas activadas de azúcares que desempeñan un rol fundamental en la síntesis y modificación de glucanos, proteoglicanos y oligosacáridos en células vivas.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Una exocelulasa con especificidad para los enlaces 1,3-beta-D-glucasídica. Cataliza la hidrólisis de unidades beta-D-glucosa desde terminales no reducibles de 1,3-beta-D-glucanos, liberadores de GLUCOSA.
EXOPEPTIDASAS que actúan específicamente sobre dipéptidos. EC 3.4.13.
Una proteasa de cisteína expresada ubicuamente que desempeña un papel enzimático en el PROCESAMIENTO PROTEICO POSTRADUCCIONAL de las proteínas dentro de las VESÍCULAS SECRETORAS.
Células mononucleadas con pronunciada capacidad fagogítica que se encuentran ampliamente distribuidas en los tejidos linfoides y otros órganos. Comprende los MACRÓFAGOS y sus precursores; FAGOCITOS; CÉLULAS DE KUPFFER; HISTIOCITOS; CÉLULAS DENDRÍTICAS, CÉLULAS DE LANGERHANS y MICROGLÍA. El término sistema mononuclear fagocítico ha sido sustituído por sistema reticuloendotelial, que también incluye células con menor actividad fagocítica como los fibroblastos y las células endoteliales. (Desde Illustrated Dictionary of Immunology, 2d ed.)
La suma del peso de todos los átomos en una molécula.
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
La clase más grande de compuestos orgánicos, incluídos el ALMIDÓN, GLICÓGENO, CELULOSA, POLISACÁRIDOS y MONOSACÁRIDOS simples. Los carbohidratos están compuestos de carbono, hidrógeno y oxígeno en una relación Cn(H20)n.
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
Esteres orgánicos del ácido tioglicólico (HS-CH2COOH).
Enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces éster dentro del ARN. EC 3.1.-.
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
La capacidad de una sustancia de se disuelver, es decir, de formar una solución con otra sustancia. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 6th ed)
Relación entre la estructura química de un compuesto y su actividad biológica o farmacológica. Los compuestos frecuentemente se clasifican juntos porque tienen características estructurales comunes, incluyendo forma, tamaño, arreglo estereoquímico y distribución de los grupos funcionales.
Polisacáridos constituídos por unidades de manosa.
Técnica de separación en la que la fase estacionaria está constituída por resinas de intercambio iónico. Las resinas contienen pequeños iones libres que intercambian fácilmente de lugar con otros pequeños iones de carga similar presentes en las soluciones que las resinas.
Centrifugación que emplea una cámara giratoria de gran capacidad en la cual se separan orgánulos celulares mediante la centrifugación por gradiente de densidad.
Grupo de compuestos que están constituidos por moléculas de nucleótidos a las que se une un nucleósido adicional a través de las molécula(s) de fosfato. El nucleótido puede contener cualquier número de fosfatos.
Especie del género SACCHAROMYCES, familia Saccharomycetaceae, orden Saccharomycetales, conocido como levadura del 'panadero' o del 'cervecero'. La forma seca se usa como suplemento dietético.
Reino de organismos eucariónticos, heterotróficos que viven parasitamente como sáprobos, incluyendo las setas (AGARICALES), LEVADURAS, moho, etc. Se reproducen sexual o asexualmente, y tienen ciclos de vida que van desde los simples a los complejos. Los hongos filamentosos, habitualmente llamados mohos, se refieren a los que crecen como colonias multicelulares.
Grado de semejanza entre secuencias. Los estudios de HOMOLOGIA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y HOMOLOGIA DE SECUENCIA DE ÁCIDO NUCLEICO proporcionan información útil sobre la interrelación genética de genes, productos génicos y especies.
Género de BACILLACEAE que son células formadoras de esporas, tienen forma de bastones. La mayoría de las especies son saprofitas del suelo con sólo unas pocas especies que son patógenas.
Secuencia de carbohidratos en los POLISACÁRIDOS, GLICOPROTEINAS y GLUCOLÍPIDOS.
POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.
Enzima básica que está presente en la saliva, lágrimas, clara de huevo y muchos fluidos animales. Funciona como agente antibacteriano, La enzima cataliza la hidrólisis de enlaces 1,4-beta entre los residuos de ácido N-acetilmurámico y la N-acetil-D-glucosamina en el peptidoglicano y entre residuos de N-acetil-D-glucosamina en la quitodextrina. EC 3.2.1.17.
Fenómeno por el cual compuestos cuyas moléculas tienen el mismo número y tipo de átomos y el mismo ordenamiento atómico, difieren en sus relaciones espaciales.
Éster acetílico de ADENOSINDIFOSFATO RIBOSA que se forma durante la desacetilación NAD dependiente de proteínas mediante SIRTUINAS. El grupo acetato reside en el anillo de ribosa donde se formó nicotinamida durante la reacción. Durante dicha reacción se liberan algunos isómeros de O-acetil-ADP-ribosa.
Separación de partículas según la densidad, mediante el empleo de un gradiente de diversas densidades. En equilibrio cada partícula se sitúa en el gradiente equivalente a su densidad.
Compuestos orgánicos que contienen fósforo como parte integral de la molécula. Incluido en este descriptor esta una amplia gama de compuestos sintéticos que se utilizan como PLAGUICIDAS y MEDICAMENTOS.
Género de bacterias gram positivas móviles e inmóviles de la familia Clostridiaceae. Se han identificado muchas especies, siendo algunas patógenas. Se encuentran en el agua, suelo y en el tracto intestinal de humanos y animales inferiores.
Movimiento de materiales (incluyendo sustancias bioquímicas y drogas) a través de membranas celulares y capas epiteliales, generalmente por DIFUSIÓN pasiva.
Enzima que cataliza la hidrólisis de la penicilina dando lugar a penicina y un anión de ácido carboxílico. EC 3.5.1.11.
Errores congénitos del metabolismo que se caracterizan por defectos en hidrolasas lisosomales específicas y que producen acumulación intracelular de sustratos no metabolizados.
Género de plantas de la familia BRASSICACEAE que contienen PROTEÍNAS DE ARABIDOPSIS y PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. La especie A. thaliana se utiliza para experimentos de genética clásica en plantas así como en estudios de genética molecular en fisiología, bioquímica y desarrollo de las plantas.
Partículas específicas de sustancias vivas organizadas rodeadas por una membrana, presentes prácticamente en todas las células eucariotas. Son orgánulos la MITOCONDRIA, el APARATO DE GOLGI, RETÍCULO ENDOPLÁSMICO, LISOSOMAS, PLASTIDIOS y VACUOLAS.
Pigmento lipídico natural con características histoquímicas similares a la lipofuscina. Se acumula en varios tejidos en ciertas condiciones experimentales y afecciones.
Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).
Disacárido no reductor compuesto de GLUCOSA y FRUCTOSA, unidas a través de sus carbonos anoméricos. Se obtiene comercialmente de la CAÑA DE AZÚCAR, remolacha de azúcar (BETA VULGARIS) y otras plantas y se usa ampliamente como alimento y edulcorante.
Gran colección de fragmentos de ADN clonados (CLONACIÓN MOLECULAR)de un determinado organismo, tejido, órgano o tipo celular. Puede contener secuencias genómicas completas (BIBLIOTECA GENÓMICA) o secuencias complementarias de ADN, éstas formadas a partir de ARN mensajero y sin secuencias intrónicas.
Género de bacteria gramnegativas, aerobias, en forma de bastoncillos que se caracterizan por tener una membrana externa que contiene esfingolípidos pero que no tiene lipopolisacáridos. Tienen la capacidad de degradar una amplia gama de compuestos aromáticos sustituidos.
Género fúngico de Trichocomaceae mitospórico que desarrolla órganos de fructificación que recuerdan una escoba. Cuando se identifican, los teleomorfos incluyen EUPENICILLIUM y TALAROMYCES. Varias especies (pero especialmente el PENICILLIUM CHRYSOGENUM) son fuente del antibiótico penicilina.