Inhibidores de Histona Desacetilasas
Compuestos que inhiben la HISTONA DESACETILASAS. Esta clase de fármacos puede influir en la expresión génica al aumentar el nivel de histonas acetiladas en dominios específicos de la CROMATINA.
Histona Desacetilasas
Deacetilasas que separan grupos N-acetil de las cadenas aminósidas de los aminoácidos de HISTONAS. La familia de enzimas pueden dividirse en al menos tres subclases estructuralmente definidas. La clase I y la clase II de desacetilasas utilizan un mecanismo dependiente de zinc. Las sirtuinas son histona deacetilasas que pertenecen a la clase III y son enzimas dependientes de NAD.
Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Histona Desacetilasa 1
Un subtipo de histona desacetilasa que está a lo largo de la HISTONA DESACETILASA 2; PROTEÍNA 4 DE UNIÓN A RETINOBLASTOMA; y PROTEÍNA 7 DE UNIÓN A RETINOBLASTOMA como componentes centrales de los complejos de histona desacetilasa.
Depsipéptidos
Histona Desacetilasa 2
Un subtipo de la histona desacetilasa que se encuentra junto con las HISTONAS DESACETILASAS 1; RETINOBLASTOMA PORTADOR DE PROTEÍNA 4 ; y RETINOBLASTOMA PORTADOR DE PROTEÍNA 7 como componentes núcleos de los complejos histona desacetilasa.
Ácido Valproico
Un ácido graso con propiedadesa anticonvulsivantes utilizado en el tratamiento de la epilepsia. Los mecanismos de sus acciones terapéuticas no están bien comprendidos. Pudieran actuar incrementando los niveles de GABA en el cerebro o alterando las propiedades de los canales de sodio dependientes del voltage.
Butiratos
Derivados del ÁCIDO BUTÍRICO. Se incluyen bajo este descriptor una amplia variedad de formas de ácidos, sales, ésteres y amidas que contienen la estructura carboxipropano.
Inhibidores Enzimáticos
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Fenilbutiratos
Histona Acetiltransferasas
Enzimas que catalizan la transferencia del grupo acilo desde el ACETIL-CoA a las HISTONAS formando CoA y acetil-histonas.
Epigénesis Genética
El proceso genético por el cual el organismo adulto es formado por incrementos graduales en complejidad de estructuras como opuesto a un simple incremento en el tamaño de estructuras preexistentes. Incluye esos mecanismos que causan represión o de-represión selectiva del gen que restringen los posibles destinos de las células y eventualmente llevan a su estado de diferenciación.
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Apoptosis
Uno de los mecanismos mediante los que tiene lugar la MUERTE CELULAR (distinguir de NECROSIS y AUTOFAGOCITOSIS). La apoptosis es el mecanismo responsable de la eliminación fisiológica de las células y parece estar intrínsicamente programada. Se caracteriza por cambios morfológicos evidentes en el núcleo y el citoplasma, fraccionamiento de la cromatina en sitios regularmente espaciados y fraccionamiento endonucleolítico del ADN genómico (FRAGMENTACION DE ADN) en sitios entre los nucleosomas. Esta forma de muerte celular sirve como equilibrio de la mitosis para regular el tamaño de los tejidos animales y mediar en los procesos patológicos asociados al crecimiento tumoral.
Isobutiratos
Antineoplásicos
Sustancias que iniben o previenen la proliferación de NEOPLASIAS.
Azacitidina
Un análogo de la pirimidina que inhibe la ADN metiltransferasa, afectando la metilación del ADN. Es también un antimetabolito de la citidina, incorporada principalmente en el ARN. La azacitidina ha sido utilizada como antineoplásico.
Sinergismo Farmacológico
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Complejo Correpresor Histona Desacetilasa y Sin3
Un complejo enzimático de múltiples subunidades que regula la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA por la desacetilación de los residuos de HISTONA de los NUCLEOSOMAS.
Transcripción Genética
Ácido Butírico
Regiones Promotoras Genéticas
Inhibidor p21 de las Quinasas Dependientes de la Ciclina
Inhibidor de cinasas dependientes de la ciclina que media en la detención del CICLO CELULAR dependiente de la PROTEÍNA P53 SUPRESORA DE TUMORES. p21 interactúa con una amplia variedad de CINASAS DEPENDIENTES DE LA CICLINA y se asocia al ANTÍGENO NUCLEAR DE LAS CÉLULAS PROLIFERANTES y con la CASPASA 3.
Silenciador del Gen
Metilación de ADN
Proliferación de la Célula
Todos los procesos involucrados en el aumento del RECUENTO DE CELULAS. Estos procesos incluyen más que DIVISION CELULAR la cual es parte del CICLO CELULAR.
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Ciclo Celular
Compleja serie de fenómenos que se producen entre el final de una DIVISIÓN CELULAR y el final de la siguiente y por la que el material celular se duplica y se divide en dos células hijas. El ciclo celular consta de la INTERFASE, que incluye la FASE G0, FASE G1, FASE S, FASE G2 y la fase de DIVISIÓN CELULAR.
Regulación Neoplásica de la Expresión Génica
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Factores de Transcripción p300-CBP
Familia de histona-acetiltransferasas que se relaciona estructuralmente con la PROTEÍNA DE UNIÓN A CREB y con la PROTEÍNA P300 ASOCIADA A E1A. Funcionan como coactivadores transcripcionales formando puentes entre los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN de unión al ADN y la maquinaria de transcripción basal. Modifican también los factores de transcripción y la CROMATINA a través de la ACETILACIÓN.
Antibióticos Antineoplásicos
Sustancias químicas, producidas por microorganismos, que inhiben o impiden el desarrollo de neoplasias.
Western Blotting
Regulación de la Expresión Génica
Ensamble y Desensamble de Cromatina
Células Tumorales Cultivadas
Sirtuinas
Familia homóloga de enzimas reguladoras que están estructuralmente relacionados con la proteína de tipo apareamiento en silencio reguladora de la información 2 (Sir2) encontrado en Saccharomyces cerevisiae. Las sirtuinas contienen una región núcleo catalítico central que une NAD. Varias de las sirtuinas utilizan NAD para desacetilar proteínas como las HISTONAS y se clasifican como HISTONA DESACETILASAS DEL GRUPO III. Varios de los otros miembros de las sirtuinas utilizan NAD para transferir ADP-RIBOSA a proteínas y se categorizan MONO ADP-RIBOSAS TRANSFERASAS, mientras que un tercer grupo de las sirtuinas parece tener actividades tanto desacetilasa y ADP ribosa transferasa.
Complejo Desacetilasa y Remodelación del Nucleosoma Mi-2
Complejo de enzima implicada en la remodelación de los NUCLEOSOMAS. El complejo está compuesto de al menos siete subunidades e incluye tanto la histona desacetilasa y actividades de ATPasa.
Piridinas
Indoles
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Regulación hacia Abajo
Proceso que disminuye las interacciones ligando/receptor debido a una reducción en el número de receptores disponibles. Esto puede ser resultado de la introversión del complejo ligando/receptor o de una expresión reducida del receptor. Clásicamente el concepto se refiere a los receptores de hormonas, pero el uso contemporáneo incluye otros receptores de la superficie celular.
Proteínas de Unión al ADN
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Sirtuina 1
Un miembro de la familia sirtuina que se encuentra principalmente en el NÚCLEO CELULAR. Se trata de un deacetilasa dependiente de NAD con especificidad hacia las HISTONAS y una variedad de proteínas implicadas en la regulación génica.
Metilación
Adición de grupos metilo. En histoquímica, la metilación se usa para esterificar grupos sulfato tratando cortes de tejido con metanol caliente en presencia de ácido clorhídrico. (Stedman, 25a ed)
Línea Celular
Células HeLa
Péptidos Cíclicos
Factor de Transcripción Sp1
Ensayos Antitumor por Modelo de Xenoinjerto
Métodos in vivo de selección investigadora de fármacos anticancerígenos, modificadores de la respuesta biológica o radioterapias. Tejido o células de tumor humano son trasplantados a ratones o ratas, seguido de regímenes de tratamiento de tumor. Una cantidad de resultados son monitorizados para evaluar la eficacia antitumoral.
N-Metiltransferasa de Histona-Lisina
Enzima que cataliza la metilación del epsilon-aminogrupo de los residuos de lisina en las proteínas, formando epsilon mono-, di- y tri-metil-lisina. EC 2.1.1.43.
Unión Proteica
Ensayos de Selección de Medicamentos Antitumorales
Métodos de investigación de efectividad de medicamentos citotóxicos anticáncer e inhibidores biológicos. Estos incluyen modelos de muerte celular in vitro y pruebas de exclusión de colorantes citostáticos, así como medición in vivo de los parámetros de crecimiento tumoral en animales de laboratorio.
Acetiltransferasas
Proteínas Nucleares
Activación Transcripcional
Procesos que estimulan la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de un gen o conjunto de genes.
Células K562
Línea celular de ERITROLEUCEMIA derivada de un paciente con LEUCEMIA MIELOIDE CRÓNICA en una CRISIS BLASTICA.
Metilasas de Modificación del ADN
Enzimas que forman parte de los sistemas de restricción-modificación. Son responsables de producir un patrón de metilación característico de la especie, ya sea en el residuo de adenina o en el de citosina, en una secuencia de bases corta y específica en el propio ADN de la célula hospedera. Esta secuencia metilada se presentará muchas veces en el ADN de la célula hospedera y permanece intacta durante toda la vida de la célula. Cualquier ADN de otra especie, que tenga acceso a una célula viva y no tenga el patrón característico de metilación, será reconocido por las endonucleasas de restricción de especificidad similar, y será destruido por segmentación. La mayoría ha sido estudiada en sistemas bacterianos, pero se han encontrado algunas en organismos eucarióticos.
ARN Interferente Pequeño
Pequeños ARN bicatenarios no codificadores de proteínas, de 21 A 31 nucleótidos, implicados en mecanismos de SILENCIAMIENTO GÉNICO, especialmente en la INTERFERENCIA POR ARN o RIBOINTERFERENCIA (RNAi). Los RNA interferentes pequeños (siRNA) se forman endógenamente a partir de dsRNA (ARN BICATENARIOS) por acción de una misma ribonucleasa, Dícer, que genera miRNA (MICROARN). El apareamiento perfecto de la hebra antiparalela de siRNA con ARN complementarios es un paso intermedio en la RNAi, que permite la escisión de los RNA guiada por el siRNA. Los siRNA se clasifican en: siRNA que actúan en trans (tasiRNA), RNA asociados a repeticiones (rasiRNA), RNA small-scan (scnRNA) y RNA de interacción con proteínas Piwi (RNApi), y desempeñan diversas funciones específicas de silenciamiento génico.
Neoplasias
Crecimiento anormal y nuevo de tejido. Las neoplasias malignas muestran un mayor grado de anaplasia y tienen la propiedad de invasión y metástasis, comparados con las neoplasias benignas.
Nucleosomas
Resistencia a Antineoplásicos
Cinamatos
Ratones Desnudos
Células Cultivadas
Relación Dosis-Respuesta a Droga
Sirtuina 2
Un miembro de la familia sirtuina que se encuentra principalmente en el CITOPLASMA. Es una enzima multifuncional que contiene una actividad deacetilasa dependiente de NAD que es específica para las HISTONAS y una actividad mono-ADP-ribosiltransferasa.
Células HL-60
Línea celular promielocítica derivada de un paciente con LEUCEMIA PROMIELOCITICA AGUDA. Las células HL-60 carecen de marcadores específicos para las LINFOCITOS pero expresan receptores de superficie para los FRAGMENTOS FC DE INMUNOGLOBULINAS y PROTEÍNAS DEL SISTEMA COMPLEMENTO. También muestran actividad fagocítica y responden a los estímulos quimiotácticos (Adaptación del original: Hay et al., American Type Culture Collection, 7th ed, pp127-8).
Supervivencia Celular
Procesamiento Proteico-Postraduccional
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Evaluación Preclínica de Medicamentos
Diferenciación Celular
Células U937
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Histona Demetilasas
Código de Histonas
Los parámetros específicos de los cambios realizados a las HISTONAS, que participan en el montaje, mantenimiento y alteración de los estados estructurales de la cromatina (como la EUCROMATINA y la HETEROCROMATINA). Los cambios se realizan mediante varios PROCESOS DE MODIFICACIÓN DE HISTONAS que incluyen ACETILACIÓN, METILACIÓN, FOSFORILACIÓN y UBIQUITINACIÓN.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Leucemia
Enfermedad maligna progresiva de los órganos hematopoyéticos caracterizada por una proliferación y desarrollo distorsionados de los leucocitos y de sus precursores en la sangre y medula ósea. Las leucemias fueron denominadas originalmente como agudas o crónicas atendiendo a la esperanza de vida, pero en la actualidad se clasifican de acuerdo a la madurez celular. Las leucemias agudas constan predominantemente de células inmaduras; las leucemias crónicas están compuestas de células maduras. (The Merck Manual, 2006)
Heterocromatina
Aquel estado de la cromatina en el cual ésta se tiñe de oscuro y se enrrolla fuertemente formando masas compactas irregulares (cariosomas) o cuerpos de Barr, en el núcleo de células que están en interfase, o que se tiñe intensamente en ciertas áreas de los cromosomas mitóticos. (Dorland, 27thed).
ADN (Citosina-5-) Metiltransferasa
Enzima que cataliza la transferencia de un grupo metilo de la S-ADENOSILMETIONINA hacia la posición 5 de los residuos de CITOSINA en el ADN.
Pirazinas
Las pirazinas son compuestos heterocíclicos aromáticos formados por un anillo de nitrógeno y carbono con dos átomos de nitrógeno adyacentes, encontradas en algunos fármacos, productos naturales y como contaminantes ambientales.
Proteínas de Ciclo Celular
Proteínas que controlan el CICLO DE DIVISIÓN CELULAR. Esta familia de proteínas incluye una gran variedad de clases, entre las que se encuentran las CINASAS DEPENDIENTES DE LA CICLINA, cinasas activadas por mitógenos, CICLINAS y FOSFOPROTEÍNA FOSFATASAS, así como sus presuntos sustratos, como las proteínas asociadas a la cromatina, las PROTEÍNAS DEL CITOESQUELETO y los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN.
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Regulación hacia Arriba
Efecto regulatorio positivo sobre procesos fisiológicos a nivel molecular, celular o sistémico. A nivel molecular, los lugares de regulación principales incluyen los receptores de membrana, genes (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA)ARNm (ARN MENSAJERO)y proteinas.
Proteínas de Neoplasias
Proteínas que en las expresiones anormales (ganancia o pérdida)se asocian al desarrollo, crecimiento o progresión de las NEOPLASIAS. Algunas proteínas de neoplasias son ANTÍGENOS DE NEOPLASIAS, es decir, inducen una reacción inmune en su tumor. Muchas proteínas de neoplasias han sido caracterizadas y se utilizan como marcadores tumorales (MARCADORES BIOLÓGICOS DE TUMOR), cuando son detectables en células y líquidos corporales en el control de la presencia o crecimiento de tumores. La expresión anormal de PROTEÍNAS ONCOGÉNICAS está implicada en la transformación neoplásica, mientras que la pérdida de la expresión de las PROTEÍNAS SUPRESORAS DE TUMOR están relacionadas con la pérdida del control y progresión del crecimiento de la neoplasia.
Fosforilación
Genes Reporteros
Genes cuya expresión es fácilmente detectable y portanto se emplean para estudiar la actividad promotora en muhcas posiciones en un genoma diana. En la tecnología del ADN recombinante, estos genes pueden unirse a una región promotora de interés.
Linfoma Cutáneo de Células T
Grupo de linfomas que muestran expansión clonal de los linfocitos T malignos interrumpidos en diferentes etapas de la diferenciación así como maligna infiltración de la piel. MICOSIS FUNGOIDE, SÍNDROME DE SÉZARY, PAPULOSIS LINFOMATOIDE y LINFOMA CUTÁNEO PRIMARIO DE CÉLULAS GRANDES ANAPLÁSICAS son las más caracterízticas de estos trastornos.
Inmunoprecipitación
Proteína de Unión a CREB
Miembro de la familia de los factores de transcripción p300-C8P que fue identificado inicialmente como molécula de unión de la PROTEÍNA DE UNIÓN A LOS ELEMENTOS DE RESPUESTA AL AMPc. Las mutaciones en la proteína de unión a CREB se asocian al SÍNDROME DE RUBINSTEIN-TAYBI.
Caspasas
Familia de CISTEÍNA ENDOPEPTIDASAS intracelulares que intervienen en la regulación de la INFLAMACIÓN y la APOPTOSIS. Específicamente escinden péptidos en un aminoácido CISTEÍNA que sigue a un residuo de ÁCIDO ASPÁRTICO. Las caspasas son activadas por escisión proteolítica de una forma precursora, dando lugar a las subunidades grande y pequeña que forman la enzima. Dado que el sitio de escisión de los precursores se corresponde con la especificidad de las caspasas, puede producirse la activación secuencial de los precursores por caspasas activadas.
Regulación Enzimológica de la Expresión Génica
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-bcl-2
Proteínas de membrana codificadas por los GENES BCL-2 y que sirven como inhibidores potentes de la muerte celular por APOPTOSIS. Las proteínas se encuentran en sitios de las membranas mitocondriales, microsomales y de la MEMBRANA NUCLEAR dentro de muchos tipos de células. La sobrexpresión de las proteínas bcl-2, debido a la translocación del gen, se asocia con el linfoma folicular.
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Mutación
Immunoblotting
Interferencia de ARN
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
Secuencia de Bases
Ciclinas
Una gran familia de proteínas reguladoras que funcionan como subunidades accesorias para una gran variedad de QUINASAS DEPENDIENTES DE LA CICLINA. Por lo general, funcionan como ACTIVADORES DE ENZIMA que conduce el CICLO CELULAR a través de transiciones entre las fases. Un subconjunto de ciclinas también pueden actuar como reguladores de la transcripción.
Chaperonas de Histonas
Protocolos de Quimioterapia Combinada Antineoplásica
Uso simultáneo o secuencial de dos o más productos en el tratamiento con drogas de las neoplasias. No es necesario que la vía de administración sea la misma.
Caspasa 3
Caspasa de prodominio corto con papel efector en la APOPTOSIS. Es activada por CASPASAS INICIADORAS como la CASPASA 9. Debido a corte y emplame álternativo múltiple de su ARN MENSAJERO existen diversas isoformas de esta proteína.
Tubulina (Proteína)
Subunidad proteica de microtúbulo que se encuentra en grandes cantidades en el cerebro de mamíferos. Se ha aislado también del FLAGELO DEL ESPERMATOZOIDE, CILIOS y de otras fuentes. Estructuralmente, la proteína es un dímero con un PM aproximado de 120,000 KDa y un coeficiente de sedimentación de 5.8S. Se une a la COLCHICINA, VINCRISTINA y VINBLASTINA.
Ratones Consanguíneos C57BL
Proteínas HSP90 de Choque Térmico
Clase de CHAPERONES MOLECULARES cuyos miembros actúan en el mecanismo de la TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL por RECEPTORES DE ESTEROIDES.
Proteína 4 de Unión a Retinoblastoma
Una proteína de retinoblastoma vinculante que está involucrada en la REMODELACIÓN DE LA CROMATINA, la desacetilación de histonas, y la represión de la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA. Aunque inicialmente descubierto como una proteína de unión al retinoblastoma, tiene afinidad por HISTONAS del núcleo y es una subunidad del factor-1 de ensamblaje de la cromatina y complejo polycomb represivo 2.
Proteínas Reguladoras de la Apoptosis
Transactivadores
Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.
Co-Represor 1 de Receptor Nuclear
Una proteína nuclear que regula la expresión de genes implicados en una amplia gama de procesos relacionados con el metabolismo y la reproducción. La proteína contiene tres dominios de la interacción de receptores nucleares y tres dominios represores y está estrechamente relacionada con la estructura del CO-REPRESOR 2 DEL RECEPTOR NUCLEAR.
Clonación de Organismos
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Fármacos Sensibilizantes a Radiaciones
Epigenómica
El estudio sistemático de la expresión génica global de los cambios debidos a la EPIGÉNESIS GENÉTICA y no debido a cambios de la secuencia de bases del ADN.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Tretinoina
Importante regulador de la EXPRESIÓN GÉNICA durante el crecimiento y desarrollo y en TUMORES. La tretinoina, también conocida como ácido retinoico y derivado de la VITAMINA A materna, es esencial para el CRECIMIENTO normal y el DESARROLLO EMBRIONARIO. Un exceso de tretinoina puede ser teratogénico. Tambíén se utiliza en el tratamiento de la PSORIASIS, ACNÉ VULGAR y otras ENFERMEDADES DE LA PIEL. También se ha probado en la LEUCEMIA PROMIELOCÍTICA AGUDA.
Células Jurkat
LINEA CELULAR derivada de la LEUCEMIA DE CÉLULA T humana y utilizada para determinar el mecanismo de susceptibilidad diferencial a medicamentos anticancerosos y a la irradiación.
Secuencia de Aminoácidos
Islas de CpG
Areas de densidad incrementada de la secuencia de dinucleótidos citosina-fosfato diéster-guanina. Forman superficies de ADN de varios cientos a varios miles de pares de bases de longitud. En los humanos hay cerca de 45,000 islas CpG, encontrándose la mayoría en los extremos 5' de los genes. Son desmetilados excepto los del cromosoma X inactivo y algunos asociados con genes impresos.
Quinolinas
Daño del ADN
Lesiones en el ADN que introducen distorsiones de su estructura normal intacta y que puede, si no se restaura, dar lugar a una MUTACIÓN o a un bloqueo de la REPLICACIÓN DEL ADN. Estas distorsiones pueden estar causadas por agentes físicos y químicos y se producen por circunstancias introducidas, naturales o no. Estas incluyen la introducción de bases ilegítimas durante la replicación o por desaminación u otra modificación de las bases; la pérdida de una base del ADN deja un lugar abásico; roturas de filamentos únicos; roturas de filamentos dobles; intrafilamentoso (DÍMEROS DE PIRIMIDINA) o uniones cruzadas interfilamentosas. El daño con frecuencia puede ser reparado (REPARACIÓN DEL ADN). Si el daño es grande, puede inducir APOPTOSIS.
Proteína p53 Supresora de Tumor
Modelos Animales de Enfermedad
Activación Viral
Mecanismo por el que los virus latentes, como los virus tumorales transmitidos genéticamente (PROVIRUS) o los PROFAGOS de las bacterias lisogénicas, son inducidos a su replicación y liberados como virus infecciosos. Puede ser consecuencia de varios estímulos endógenos y exógenos, incluyendo LIPOPOLISACÁRIDOS de células B, hormonas glucocorticoides, pirimidinas halogenadas, RADIACIÓN IONIZANTE, luz ultravioleta y virus superinfectantes.
Técnicas de Silenciamiento del Gen
La inducción artificial del SILENCIADOR DEL GEN por el uso de la INTERFERENCIA DE ARN para reducir la expresión de un gen específico. Se incluye el uso de ARN BICATENARIO, tales como los ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS y ARN que contenga SECUENCIA DE LA HORQUILLA EN BUCLE, y OLIGONUCLEÓTIDOS ANTISENTIDO.
Fibroblastos
Técnicas de Transferencia Nuclear
Métodos de implantación de un NÚCLEO CELULAR de una célula donante en una célula receptora enucleada.
Proteínas Supresoras de Tumor
Oxibato de Sodio
Sitios de Unión
Racionalización
Citometría de Flujo
Técnica que emplea un sistema instrumental para realizar, procesar y exhibir una o más mediciones de células individuales obtenidas de una suspensión celular. Las células generalmente son coloreadas con uno o más tintes fluorescentes específicos para los componentes celulares de interés, por ejemplo, el ADN, y la fluorescencia de cada célula se mide cuando atraviesa rápidamente el haz de excitación (láser o lámpara de arco de mercurio). La fluorescencia brinda una medición cuantitativa de varias propiedades bioquímicas y biofísicas de la célula como base para diferenciación celular. Otros parámetros ópticos mensurables incluyen la obsorción y la difusión de la luz, aplicándose esta última a la medición del tamaño, forma, densidad, granularidad de la célula y su absorción del colorante.
Proteínas Cromosómicas no Histona
Nucleoproteínas, que en contraste con las HISTONAS, son insolubles en ácido. Participan en las funciones cromosómicas; por ejemplo, se unen selectivamente al ADN, estimulan la transcripción que produce la síntesis de ARN específico de los tejidos y sufre cambios específicos en respuesta a distintas hormonas o fitomitógenos.
Factor de Transcripción Sp3
Muerte Celular
Proteína de la Membrana Similar al Receptor de Coxsackie y Adenovirus
Proteína transmembrana de la superfamilia Ig que se localiza en los complejos de unión que existen entre las CÉLULAS ENDOTELIALES y las CÉLULAS EPITELIALES. La proteína puede desempeñar un papel en la adhesión célula-célula y es el sitio principal para la unión de los ADENOVIRUS durante la infección.
Factores de Tiempo
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Fenilendiaminas
Puntos de Control del Ciclo Celular
Sistemas de regulación de señalización que controlan la progresión del CICLO CELULAR. Aseguran de que la célula ha terminado, en el orden correcto y sin errores, todos los procesos necesarios para replicar el GENOMA y el CITOPLASMA, y se dividen por igual entre las dos células hijas. Si el entorno de las células no han completado estos procesos o que el entorno no tiene los nutrientes y hormonas de crecimiento en lugar de proceder, a continuación, las células se ven limitadas (o "detenidas") hasta que los procesos se ha completado y las condiciones de crecimiento son adecuadas.
Ataxia de Friedreich
Enfermedad autosómica recesiva, que se desarrolla usualmente en la infancia, y se caracteriza por degeneración de los tractos espinocerebelares, las columnas posteriores, y en menor grado de los tractos corticoespinales. Las manifestaciones clínicas incluyen ATAXIA DE LA MARCHA, pie cavo, trastornos del habla, curvatura lateral de la columna, temblor rítmico de la cabeza, cifoescoliosis, insuficiencia cardíaca congestiva (secundaria a cardiomiopatía), y debilidad de las extremidades inferiores. Esta afección se asocia con una mutación del gen en el cromosoma 9 en la banda q13 que codifica una proteína mitocondrial, la frataxina. (Traducción libre del original de: Adams et al., Principles of Neurology, 6th ed, p1081; N Engl J Med 1996 Oct 17;335(16):1169-75). La severidad de la ataxia de Friedreich asociada con la expansión de las repeticiones GAA en el primer intrón del gen de la frataxina se correlaciona con el número de repeticiones de trinucleótidos. (Traducción libre del original de: Durr et al, N Engl J Med 1996 Oct 17;335(16):1169-75)
Elementos de Respuesta
Secuencias de nucleótidos, generalmente al inicio de la cadena, que son reconocidas por factores de transcripción reguladores específicos, provocando la respuesta del gen a los distintos agentes reguladores. Estos elementos pueden encontrarse tanto en regiones promotoras como intensificadoras.
Proteína X Asociada a bcl-2
Miembro de la familia de proteínas Bcl-2 y homólogo de la PROTEÍNA PROTOONCOGÉNICA C-BCL-2. Regula la liberación de CITOCROMO C y del FACTOR INDUCTOR DE LA APOPTOSIS a partir de las mitocondrias. Se dan varias isoformas de la proteína X asociada a BCL-2 debido al EMPALME ALTERNATIVO del ARNm para esta proteína.
Regulación Leucémica de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos mediante los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en la leucemia.
División Celular
Fisión de las CÉLULAS. Incluye la CITOCINESIS, cuando se divide el CITOPLASMA de una célula y la DIVISIÓN CELULAR DEL NÚCLEO.
Fase G2
Periodo del CICLO CELULAR que sigue a la síntesis de ADN (FASE S) y precede a la FASE M (fase de división celular). Los CROMOSOMAS son tetraploides en este punto.
Activación Enzimática
Pruebas de Precipitina
ARN Polimerasa II
Mitocondrias
Organelas semiautónomas que se reproducen por sí mismas y se presentan en el citoplasma de la mayoría de las células eucariotas, pero no en todas. Cada una está rodeada por una doble membrana limítrofe. La membrana interna presenta múltiples invaginaciones y sus proyecciones se denominan crestas. La mitocondria es el lugar de las reacciones de fosforilación oxidativa que dan lugar a la formación de ATP. Contienen RIBOSOMAS, varios ARN DE TRANSFERENCIA, SINTETASAS AMINOACIL-ARN T y factores de elongación y terminación. Las mitocondrias dependen de los genes del núcleo, de las células en que residen, para muchos ARN MENSAJEROS. Se cree que las mitocondrias se han originado a partir de bacterias aerobiass que establecieron una relación simbiótica con los protoeucariotas primitivos. (King & Stansfield, A Dictionary of Genetics, 4th ed)
Neuroblastoma
Neoplasia común en el inicio de la infancia que surge de las células de la cresta neural en el sistema nervioso simpático y que se caracteriza por tener un comportamiento clínico diverso, que va desde la remisión espontánea a la rápida progresión metastásica y la muerte. Este es el tumor maligno intrabdominal más común de la infancia, pero también puede surgir en el tórax, cuello o raramente en el sistema nervioso central. Las características histológicas incluyen células redondas uniformes con núcleos hipercromáticos agrupados en nidos y separados por septos fibrovasculares. Los neuroblastomas pueden estar asociados con el síndrome del opsoclono-mioclono (Adaptación del original: DeVita et al., Cancer: Principles and Practice of Oncology, 5th ed, pp2099-2101; Curr Opin Oncol 1998 Jan;10(1):43-51).
Anilidas
Concentración 50 Inhibidora
Concentración de un compuesto necesaria para reducir in vitro el crecimiento poblacional de organismos, incluidas las células eucariotas, en un 50 por ciento. Aunque a menudo se expresa para denotar la actividad antibacteriana in vitro, se utiliza también como un patrón de citotoxicidad a las células eucariotas en cultivo.
Proteína Inhibidora de la Apoptosis Ligada a X
Caspasa 7
Caspasa de prodominio corto con papel efector en la APOPTOSIS. Es activada por CASPASAS INICIADORAS como la CASPASA 3 y la CASPASA 10. Debido a corte y empalme álternativo múltiple de su ARN MENSAJERO existen diversas isoformas de esta proteína.
Inhibidores de la Síntesis de la Proteína
Compuestos que inhiben la síntesis de proteínas. Generalmente son AGENTES ANTIBACTERIANOS o toxinas. El mecanismo de acción de la inhibición incluye la interrupción de la prolongación de la cadena peptídica, el bloqueo del sitio A de los ribosomas, la lectura errónea del código genético o el impedimiento de la unión de las cadenas laterales de los oligosacáridos con las glicoproteínas.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Latencia del Virus
Capacidad de un virus patógeno para mantenerse latente dentro de una célula (infección latente). En los eucariotas, la subsecuente activación y replicación viral se estima que sea causada por la simulación extracelular de los factores de transcripción celulares. La latencia del bacteriófago se mantiene por la expresión de represores codificados por el virus.
Fase G1
Período del CICLO CELULAR que precede la REPLICACIÓN DEL ADN en FASE S. Las Subfases de G1 incluyen "competencia" (para responder a los factores de crecimiento), G1a (entrada en G1), G1b (progresión) y G1c (asamblea). La progresión a través de las subfases G1 se efectúa mediante la limitación de los factores de crecimiento, nutrientes, o inhibidores.
Complejo de la Endopetidasa Proteasomal
Un gran complejo multisubunidades que juega un importante rol en la degradación de la mayoría de las proteínas citosólicas y nucleares en células eucariotas. Contiene un sub-complejo catalítico 700-kDa y dos sub-complejos regulatorios 700-kDa. El complejo condensa proteínas ubiquitarias y proteínas activadas vía entienzima ornitina decarboxilasa.
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
Proteínas Proto-Oncogénicas
Especies de Oxígeno Reactivo
Moléculas o iones formados por la reducción incompleta de un electrón del oxígeno. El oxígeno reactivo intermediario incluye OXÍGENO SINGLETE, SUPERÓXIDOS, PERÓXIDOS, RADICAL HIDROXILO y ÁCIDO HIPOCLOROSO. Contribuyen a la actividad microbicida de los FAGOCITOS, regulación de la señal de transducción y la expresión genética y el daño oxidativo de los ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEINAS y LÍPIDOS.
Ratones Consanguíneos BALB C
Mitosis
Tipo de divisaión del NÚCLEO CELULAR, mediante el que los dos núcleos hijos normalmente reciben dotaciones idénticas del número de CROMOSOMAS de las células somáticas de la especie.
Metiltransferasas de Proteína
Enzimas que catalizan la metilación de aminoácidos después de su incorporación a una cadena polipéptida. La S-Adenosil-L-metionina actúa como agente metilante. EC 2.1.1.