Liasas
Condroitin Liasas
Enzimas que catalizan la eliminación de residuos de delta-4,5-D-glucuronato de polisacáridos que contienen enlaces 1,4-beta-hexosaminil y 1,3-beta-D-glucuronosil o 1,3-alfa-L-iduronosil, realizando así la despolimerización. EC 4.2.2.4 actúa sobre el condroitín sulfato A y C, así como sobre dermatán sulfato y lentamente, sobre el hialuronato. EC 4.2.2.5. actúa sobre condroitín sulfato A y C.age sobre condroitín sulfato A e C.
Pectobacterium chrysanthemi
Condroitinasas y Condroitin Liasas
Pectinas
Polisacáridos de alto peso molecular presentes en la pared celular de todas las plantas. Las pectinas pegan las paredes celulares entre sí. Se utilizan como emulsionantes y estabilizantes en la industria alimentaria. Han sido probadas en una gran variedad de usos terapéuticos, incluso como agente antidiarreico, para lo que en la actualidad no se les considera efectivas y en el tratamiento de la hipercolesterolemia.
Achicoria
Aldehído-Liasas
Liasas de Carbono-Oxígeno
Erwinia
Género de bacterias gramnegativas, facultativamente anaerobias, en forma de bastoncillos cuyos organismos se asocian a plantas como patógenos, saprofitos, o como constituyente de la flora epifítica.
Liasa de Heparina
Enzima de la clase de las isomerasas que cataliza la ruptura eliminativa de polisacáridos que contienen residuos de D-glucuronato o L-iduronato enlazados en 1,4 y residuos de 2-sulfoamino-2-desoxi-6-sulfo-D-glucosa en enlaces 1,4-alfa, para formar oligosacáridos con grupos terminales de 4-desoxi-alfa-D-gluc-4-enuronosil, en sus terminales no reductores. EC 4.2.2.7.
Oxo-Ácido-Liasas
Poligalacturonasa
Enzima degradadora de la pared celular presente en microorganismos y vegetales superiores. Cataliza la hidrólisis aleatoria de enlaces 1,4-alfa-D-galactosidurónicos en el pectato y otros galacturonanos. EC 3.2.1.15.
Alginatos
Ácidos Hexurónicos
Término utilizado para designar a los ácidos tetrahidroxi aldehídicos obtenidos por la oxidación de azúcares hexosa, es decir, ácido glucurónico, ácido galacturónico, etc. Históricamente el nombre de ácido hexurónico le fue otorgado al ácido ascórbico.
Isocitratoliasa
Rhodophyta
Plantas de la división Rhodophyta comúnmente conocidas como algas rojas, en la cual predomina el pigmento rojo (FICOERITRINA). Sin embargo, si este pigmento es destruido, esta alga puede ser morada, marrón, verde o amarilla. Dos sustancias importantes encontradas en las paredes celulares del alga roja son el AGAR y la CARRAGENINA. Algunas rodofitas son notables ALGAS MARINAS (macroalgas).
Especificidad por Sustrato
Ficobilinas
Tetrapirroles de cadena abierta que actúan como cromóforos que absorben la luz en las FICOBILIPROTEÍNAS.
Liasa de Condroitin ABC
Enzima que cataliza la degradación eliminativa de polisacáridos que contienen enlaces 1,4-beta-D-hexosaminil y 1,3-beta-D-glucuronosil o 1,3-alfa-L-iduronosil en disacáridos que contienen grupos de 4-desoxi-beta-D-gluc-4-enuronosil. (Enzyme Nomenclature, 1992)
Sphingomonas
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Secuencia de Aminoácidos
Citocromos c1
Bacteroides
Flavobacterium
Género de bacterias aerobias, gramnegativas en forma de bastones que están ampliamente distribuidas en el SUELO y el AGUA. Sus organismos se encuentran también en carnes crudas, LECHE y otros ALIMENTOS, en los ambientes hospitalarios y en las muestras clínicas de humanos. Algunas especies son patógenas en humanos.
Adenilosuccinato Liasa
Streptococcus anginosus
Ácido Glucurónico
Ácido de azúcar formado por la oxidación del carbono C-6 de la GLUCOSA. Además de ser un metabolito intermediario clave de la vía del ácido urónico, el ácido glucurónico también juega un rol en la desintoxicación de ciertas drogas y toxinas mediante la conjugación con ellas para formar GLUCURÓNIDOS.
Hevea
Clonación Molecular
Glucosaminoglicanos
Proteus vulgaris
Homología de Secuencia de Aminoácido
Ácidos Urónicos
Sulfatos de Condroitina
Derivados del condroitín que tienen la parte del sulfato esterificado a la parte de galactosamina del condoitrín. El sulfato de condroitina A, o el 4-sulfato de condroitina y el sulfato de condroitina C, o 6-sulfato de condroitina, tienen el sulfato esterificado en las posiciones 4- y 6-, respectivamente. El sulfato de condroitina B (beta heparina; DERMATÁN SULFATO) es un nombre incorrecto y este compuesto no es un sulfato de condroitina auténtico.
Compuestos de Sulfonio
Glicósido Hidrolasas
Glicósido hidrolasas (o glicosidasas) catalizan la hidrólisis del acoplamiento glicosídico para generar dos azúcares más pequeños. Ellas son enzimas sumamente comunes con papeles en la naturaleza incluyendo la degradación de biomasa como la celulosa y hemicellulose, en estrategias de defensa antibacterianas (ej. lisozimas), en mecanismos patogénicos (ej. neuraminidasas virales) y en la función normal celular (ej. ajustando manosidasas implicadas en la biosíntesis de glicoproteinas N-ligadas). Con las glicosiltransferasas, glicosidasas forman la principal maquinaria catalítica para la síntesis y la ruptura de enlaces glicosídicos.
Dermatán Sulfato
Un glucosaminoglicano que se encuentra en estado natural y que se halla principalmente en la piel y en el tejido conjuntivo. Se diferencia del SULFATO DE CONDROITINA A (ver SULFATOS DE CONDROITINA) en que contiene ÁCIDO IDURÓNICO en lugar de ácido glucurónico, su epímero, en el átomo de carbono 5.
Secuencia de Carbohidratos
Liasas de Carbono-Nitrógeno
Liasas de Carbono-Carbono
ADN-(Sitio Apurínico o Apirimidínico) Liasa
Enzima de reparación del ADN que cataliza la escisión de los residuos de ribosa en los sitios de ADN apurínicos y apirimidínicos que pueden resultar de la acción de los ADN GLICOSILASAS. La enzima cataliza una reacción de beta-eliminación en el cual el enlace COP 3 'al sitio apurínico o apirimidínico en el ADN se rompe, dejando un azúcar insaturado 3'-terminal y un producto con un terminal 5'-fosfato. Esta enzima fue listada anteriormente bajo EC 3.1.25.2.
Pseudomonas
Género de bacterias gramnegativas, aerobias en forma de bastoncillos que está ampliamente distribuido en la naturaleza. Algunas especies son patógenos para humanos, animales y plantas.
N-Glicosil Hidrolasas
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Concentración de Iones de Hidrógeno
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Hongos
Reino de organismos eucariónticos, heterotróficos que viven parasitamente como sáprobos, incluyendo las setas (AGARICALES), LEVADURAS, moho, etc. Se reproducen sexual o asexualmente, y tienen ciclos de vida que van desde los simples a los complejos. Los hongos filamentosos, habitualmente llamados mohos, se refieren a los que crecen como colonias multicelulares.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Cristalografía por Rayos X
ADN Glicosilasas
Una familia de enzimas reparadoras de ADN que reconocen las bases de nucleótidos dañados y los remueven por hidrolización del vínculo N-glicosídico que los adhiere a la médula del azúcar de la molécula de ADN. El proceso llamado REPARACION DE EXCISION BASE puede ser completada por ADN-(SITIO APURINICO O APIRIMIDINICO) LIASA el cual extirpa el azúcar RIBOSA sobrante del ADN.
Bacillus
Liasas Intramoleculares
Heparitina Sulfato
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
Biocatálisis
Dominio Catalítico
Cromatografía en Gel
Isoenzimas
Secuencia de Bases
Oligosacáridos
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Cromatografía
Técnicas usadas para separar mezclas de sustancias basadas en diferencias en las afinidades relativas de las sustancias para fases móviles y estacionarias. Una fase móvil (líquido o gas) pasa a través de una columna que contiene una fase estacionaria de líquido sólido poroso líquido revestido en un soporte sólido. El uso es tanto analítico para pequeñas cantidades y preparativo para cantidades a granel.
Catálisis
Estabilidad de Enzimas
Modelos Moleculares
Pared Celular
La capa mas externa de una célula en la matoría de las PLANTAS, BACTERIAS, HONGOS y ALGAS. La pared celular generalmente es una estructura rigida externa a la MEMBRANA CELULAR y proporciona una barrera protectora contra agentes físicos y químicos.
Liasas de Fósforo-Oxígeno
Plantas
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Sitios de Unión
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Cromatografía por Intercambio Iónico
Enfermedades de las Plantas
Enfermedades de las plantas.
Cristalización
Cromatografía Líquida de Alta Presión
Temperatura Ambiental
Mutación
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Liasas de Carbono-Azufre
Unión Proteica
Mutagénesis Sitio-Dirigida
Estructura Secundaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Reparación del ADN
La reconstrucción de una molécula de ADN de doble cadena continua sin defectos a partir de una molécula contenida en regiones dañadas. Los principales mecanismos de reparación son la reparación por extirpación, en la que las regiones defectuosas en una cadena son extirpadas y resintetizadas usando la información complementaria de pareamento de las bases que está en la cadena intacta.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.