Catalizan la hidrólisis de nucleósidos con la eliminación de amoniaco.
Bases de purina o pirimidina unidas a una ribosa o desoxirribosa.
Enzima que cataliza la desaminación de la citidina, formando uridina. EC3.4.4.5.
Enzima que cataliza la hidrólisis de la ADENOSINA a INOSINA con la eliminación de AMONÍACO.
Proceso que cambia la secuencia de nucleótidos del ARNm a partir de aquella del molde de ADN que lo codifica. Algunas de las clases principales de edición de ARN son las siguientes: 1) conversión de la citosina a uracil en el ARNm, 2) adición de un número variable de guaninas en sitios predeterminados y 3) la adición y deleción de uracilos, modelados por ARNs guías (ARN GUIA).
Cataliza la hidrólisis de nucleótidos con la eliminación de amonio.
Una enzima que cataliza la desaminación de CITOSINA resultando en la formación de URACILO. También puede actuar en 5-metilcitosina para formar TIMIDINA.
Purinas unidas a una RIBOSA que, mediante fosforilación, se convierten en NUCLEÓTIDOS DE PURINA.
Eliminación de un grupo amino (NH2) de un compuesto químico.
Pirimidinas con una RIBOSA que, tras fosforilarse, se convierten en NUCLEÓTIDOS DE PIRIMIDINA.
Proteínas implicadas en el transporte de NUCLEÓSIDOS a través de las membranas celulares.
Nucleosido de purina, hipoxantina unida por su nitrógeno N9 al carbono C1 de la ribosa. Es un intermediario en la degradación de las purinas y los nucleósidos de purina a ácido úrico, y en las vías de rescate de las prurinas. También está presente en el anticodón de ciertas moléculas de ARN de transferencia. (Dorland, 28a ed)
Enzimas que catalizan la rotura de enlaces peptídicos y otros enlaces similares a éteres, liberando un grupo amino y su correspondiente ácido carboxílico, típicamente involucradas en el metabolismo de aminoácidos y otras biomoléculas.
Subtipo de proteínas transportadoras de nucleósidos equilibradoras sensibles a la inhibicion por 4-nitrobenziltioinoisina.
Proteínas codificadas por los GENES VIF del VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA.
Nucleósido de pirimidina que está compuesto por la base CITOSINA unida a la RIBOSA, que es un azúcar de cinco átomos de carbono.
Análogo sulfhidrilo de la INOSINA que inhibe el transporte de nucleósidos a través de las membranas plasmáticas de los eritrocitos, y que tiene propiedades inmunosupresoras. Se ha utilizado de forma similar a la MERCAPTOPURINA en el tratamiento de la leucemia.
Enzima que cataliza la reacción entre un nucleósido de purina y ortofosfato para formar purina libre más ribosa-5-fosfato. EC 2.4.2.1.
Un nucleósido que está compuesto de ADENINA y RIBOSA. Derivados de adenosina o la adenosina juegan un papel biológico muy importante además de ser componentes de ADN y ARN. La misma adenosina es un neurotransmisor.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Fármacos que inhiben la actividad de la ADENOSINA DEAMINASA.
Enzima que cataliza la desaminación de la guanina para formar xantina. EC3.5.4.3.
Proteínas accesorias codificadas por retrovirus que desempeñan una función esencial en la REPLICACIÓN VÍRICA. Se encuentran en el citoplasma de las células huésped y se asocian a diversas proteínas de las células huésped. Vif es la abreviatura de "virion infectivity factor", factor de infectividad del virión.
Nucleósido de purina, guanina unida por su nitrógeno N9 al carbono C1 de la ribosa. Es un componente del ácido ribonucleico y sus nucleótidos desempeñan funciones importantes en el metabolismo. Símbolo, G. (Dorland, 28a ed)
Enzima que se encuentra en la mitocondria y en el citoplasma soluble de las células. Cataliza las reacciones reversibles de un nucleósido trifosfato, por ejemplo, ATP, con un nucleósido difosfato, por ejemplo, UDP, para formar ADP y UTP. Muchos nucleósidos difosfatos pueden actuar como aceptores, mientras que muchos ribo- y desoxirribonucleósidos trifosfatos pueden actuar como donadores. EC 2.7.4.6.
Uridina es una nucleósido pirimidina, un componente fundamental de ARN y fuente de energía y estructura para células vivas.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Especie típica de LENTIVIRUS y agente etiológico del SIDA. Se caracteriza por su efecto citopático y afinidad por el linfocito T4.
Nucleósido modificado que está presente en la primera posición del anticodón de la ARNt-tirosina, ARNt-histidina, ARNt-asparagina y ARNt-ácido aspártico de muchos organismos. Se cree que desempeña un papel en la función reguladora del ARNt. El nucleósido Q puede ser modificado después a nucleósido Q*, que tiene una molécula de manosa o de galactosa unida a la posición 4 de su anillo ciclopentenediol.
ARN constituido por dos cadenas, en oposición al ARN de una sóla cadena que tiene mayor prevalencia. La mayoría de los segmentos bicatenarios se forman por la transcripción del ADN, por pareamiento intramolecular de las bases se secuencias complementarias invertidas por un asa de una sola cadena. Algunos segmentos bicatenarios de ARN son normales en todos los organismos.
PIRIDOXAL-fosfato que contiene una enzima que cataliza la deshidratación y desaminación de la L-Serina para formar piruvato. Esa enzima fue listada anteriormente en EC 4.2.1.13.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Subtipo de proteínas transportadoras de nucleósidos equilibradoras insensibles a la inhibición por 4-nitrobenziltioinosina.
Enzima que cataliza la hidrólisis de nucleósidos trifosfato a nucleósidos difosfato. También puede catalizar la hidrólisis de nucleótidos trifosfato, difosfato, difosfatos de tiamina y FAD. Las fosfohidrolasas de nucleósidos trifosfato I y II son subtipos de la enzima que se encuentra principalmente en los virus.
Nucléosido en el que la base púrica o pirimídica se ha combinado con ribosa. (Dorland, 28a ed)
Unidades monoméricas a partir de las cuales son construídos los polímeros de ADN o ARN. Están constituídas por una base de purina o pirimida, un azúcar pentosa y un grupo fosfato.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Enzima que cataliza la desaminación de AMP a IMP. EC3.5.4.6.
Ribonucleósidos pirazolopirimidínicos aislados de la Nocardia interforma. Son antibióticos antineoplásicos con propiedades citostáticas.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Enzimas de la clase transferasas que catalizan la transferencia de un grupo pentosas de un compuesto a otro.
Familia de nucleótido difosfato quinasas que intervienen en diversos procesos de señalización celular durante la DIFERENCIACIÓN CELULAR, la PROLIFERACIÓN CELULAR, y la APOPTOSIS. Son consideradas proteinas multifuncionales que interactúan con una variedad de proteinas celulares y tienen funciones no relacionadas a su actividad enzimática.
Inhibidores de la transcriptasa inversa (ADN POLIMERASA DIRIGIDA POR ARN), una enzima que sintetiza ADN sobre una plantilla de ARN.
Clase de transportadores de nucleósidos independientes del sodio que median en el transporte facilitativo de los NUCLEÓSIDOS.
Cultivos celulares establecidos que tienen el potencial de multiplicarse indefinidamente.
La familia de la secuencia Alu (nombrada por la enzima endonucleasa de restricción Alu I) es el elemento repetido diseminado más altamente repetido en el ser humano (más de un millón de copias). Se deriva del componente 7SL del ARN de la PARTICULA DE RECONOCIMIENTO DE SEÑAL y contiene un promotor de la ARN polimerasa III. La transposición de este elemento a las señales de las regiones génicas codificadoras o reguladoras es responsable de muchas enfemedades hereditarias.
Base purínica o pirimidínica unida a la DESOXIRRIBOSA.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Proceso de multiplicación viral intracelular, que consiste en la síntesis de PROTEÍNAS, ÁCIDOS NUCLEICOS, y a veces LÍPIDOS y su ensamblaje para formar una nueva partícula infecciosa.
Molécula de adenosina que puede sustituirse en cualquier posición, pero que no posee un grupo hidroxilo en la parte de ribosa de la molécula.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Una base púrica y unidad fundamental de los NUCLEÓTIDOS DE ADENINA.
Vasodilatador coronario con alguna actividad antiarrítmica.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Nucleósidos que no tienen dos grupos hidroxilos en la molécula de azúcar. La mayoría de estos compuestos tienen un amplio espectro en la actividad antirretroviral debido a su acción como antimetabolito. Los nucleósidos se fosforilan intracelularmente a sus 5'-trifosfatos y actúan como inhibidores de la terminación de la cadena en la transcripción inversa viral.
Antibiótico ribonucleósido purínico que se sustituye fácilmente por adenosina en el sistema biológico, pero su incorporación en el ADN y el ARN tiene efecto inhibitorio sobre el metabolismo de estos ácidos nucleicos.
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Compuesto didesoxinucleósido en el cual el grupo 3'-hidroxilo de la molécula de azúcar se ha reemplazado por un grupo azida. Esta modificación impide la formación de los enlaces fosfodiéster necesarios para completar las cadenas de ácidos nucleicos. El compuesto es un inhibidor potente de la replicación del VIH, y actúa como terminador de la cadena del ADN viral durante la transcripción inversa. Mejora la función inmunológica, revierte parcialmente la disfunción neurológica inducida por el VIH, y mejora otras anomalías clínicas asociadas con el SIDA. Su principal efecto tóxico es la supresión de la médula ósea, dependiente de la dosis,, que produce anemia y leucopenia.
La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.
Nucleósidos que contienen arabinosa como su molécula de azúcar.
Sustancias que se utilizan en la profilaxis o en el tratamiento de las ENFERMEDADES POR VIRUS. Pueden actuar de diversos modos: impidiendo la replicación viral mediante la inhibición de la ADN-polimerasa viral; uniéndose a receptores específicos de la superficie celular e inhibiendo la penetración viral o provocando la pérdida de la cápsula viral; inhibiendo la síntesis de proteínas virales; o bloqueando las las fases finales del ensamblaje viral.
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Una serie de compuestos heterocíclicos sustituídos de varias maneras en la naturaleza y que se conocen como bases púricas. Ellas incluyen la ADENINA y la GUANINA, constituyentes de los ácidos nucleicos, así como muchos alcaloides tales como CAFEINA y TEOFILINA. El ácido úrico es el rpoducto final del metabolismo de las purinas.
Metal de número atómico 30 y peso atómico 65.37. Es un oligoelemento necesario en la dieta, siendo una parte esencial de muchas enzimas, y desempeña una función importante en la síntesis de proteínas y en la división celular. La deficiencia de zinc se asocia con ANEMIA, baja estatura, HIPOGONADISMO, alteración de la CICATRIZACIÓN DE HERIDA y geofagia. Se conoce con el símbolo Zn.
Enzima que cataliza reversiblemente la fosforilación de desoxicitidina con la formación de nucleósido difosfato y desoxicitidina monofosfato. La citosina arabinósida también puede actuar como aceptor. Todos los nucleósidos trifosfatos naturales, excepto la desoxicitidina trifosfato pueden actuar como donadores. La enzima es inducida por algunos virus, particularmente el virus del herpes simplex (HERPESVIRUS HOMINI). EC 2.7.1.74.
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
La primera LINEA CELULAR humana, maligna, cultivada de forma continua, proveniente del carcinoma cervical Henrietta Lacks. Estas células son utilizadas para el CULTIVO DE VIRUS y para el estudio de drogas antitumorales.
Compuestos de ácido fosfónico que contienen carbono. Incluidos bajo este descriptor están los compuestos que tienen carbono unido a cualquier átomo de OXÍGENO o átomo de FÓSFORO de la estructura (P=O)O2.
Ordenamiento espacial de los átomos de un ácido nucleico o polinicleótido que produce su forma tridimensional característica.
Pentosiltransferasas que catalizan la reacción entre un nucleósido de pirimidina y ortofosfato para formar una pirimidina libre y ribosa 5-fosfato.
Timidina es un nucleósido natural formado por la unión de desoxirribosa y timina, componentes importantes del ADN.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de los virus.
Incluye el espectro de infecciones por el virus de la inmunodeficiencia humana que van desde los seropositivos asintomáticos, pasa por el complejo relacionado con el SIDA (ARC), hasta el síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA).
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
Nucleósidos en los que la base se sustituye por uno o más átomos de azufre.
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Nucleótido en el que las bases púrica o pirimídica están combinadas con ribosa. (Dorland, 28a ed)
2'-Desoxiuridina. Antimetabolito que se convierte en desoxiuridina trifosfato durante la síntesis de ADN. La supresión en el laboratorio de la desoxiuridina se utiliza para diagnosticar las anemias megaloblásticas debido a deficiencias de vitamina B12 y folatos.
Compuesto dideoxinucleosídico en el cual el grupo hidroxilo 3' de la molécula de azúcar ha sido reemplazado por un hidrógeno. Esta modificación impide la formación de enlaces fosfodiéster necesarios para terminar las cadenas de ácido nucleico. El compuesto es un potente inhibidor de la replicación del VIH a bajas concentraciones, actuando como terminador de la cadena del ADN viral al unirse a la transcriptasa inversa. Su principal efecto secundario tóxico es la degeneración axonal que se produce en la neuropatía periférica.
Enzima que cataliza la transferencia de la ribosa de la uridina hacia el ortofosfato, formando uracilo y ribosa 1-fosfato.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Ácido ribonucleico que constituye el material genético de los virus.
Fármacos utilizados para tratar el SIDA y/o la diseminación de la infección por VIH. Estos no incluyen os fármacos utilizados para tratar los síntomas o las infecciones oportunistas asociadas con el SIDA.
Un inhibidor de la fosfodiesterasa que bloquea la captación y el metabolismo de la adenosina por los eritrocitos y las células endoteliales vasculares. El dipiridamol también potencia la acción antiagregante de la prostaciclina.
Transcriptasa inversa codificada por el GEN POL del VIH. Consiste en un heterodímero formado por una subunidad de 66kDa y otra de 51 kDa que son derivadas de una proteína precursora común. El heterodímero también incluye una actividad de ARNsa H (RIBONUCLEASA H DEL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA) que juega un rol esencial en el proceso de replicación viral.
Transcripciones de ARN del ADN que se encuentran en alguna etapa inconclusa de procesamiento post-transcripcional ( PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN ) necesarios para la función. Precursores de ARN pueden someterse a varias etapas del EMPALME DEL ARN durante el cual los enlaces fosfodiesterasas en los límites exón-intrón se escinden y se extraen los intrones. En consecuencia se forma un nuevo enlace entre los extremos de los exones. Resultantes de ARN maduros se pueden utilizar, por ejemplo, ARNm maduro (ARN MENSAJERO) se usa como una plantilla para la producción de proteínas.
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
Ester fosfato de TIMIDINA mediante un enlace N-glucosídico a ribosa o desoxirribosa, como ocurre en los ácidos nucleicos. (Dorland, 28a ed, p1340)
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces difosfato en compuestos tales como nucleósido di- y tri-fosfatos y anhídridos que contienen sulfonil, tales como el adenililsulfato. EC 3.6.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Adenosina 5'-(tetrahidrógeno trifosfato). Nucleótido de adenina que contiene tres grupos fosfato esterificados a la molécula de azúcar. Además de su crucial rol en el metabolismo del trifosfato de adenosina es un neurotransmisor.
Ésteres fosfato de DIDESOXINUCLEÓSIDOS.
Una purina e intermediario del metabolismo de la adenosina y en la formación de ácidos nucleicos mediante la vía de salvamento.
POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.
Análogo del didesoxinucleósido que inhibe a la transcriptasa inversa y que tiene actividad in vitro contra el VIH.
La guanina es una base nitrogenada presente en los nucleótidos de ARN y ADN, que forma un par de bases con la citosina mediante tres enlaces de hidrógeno.
Sistema que produce la infección de un virus, compuesto del genoma viral, un núcleo proteico, y una cubierta proteica llamada cápside, la cual puede estar desnuda o encerrada en una cubierta lipoproteica llamada peplos.
Movimiento de materiales (incluyendo sustancias bioquímicas y drogas) a través de membranas celulares y capas epiteliales, generalmente por DIFUSIÓN pasiva.
Nucleósido constituido por una base de guanina y el azúcar desoxirribosa.
Análogo fotoactivable de la URIDINA que se utiliza como marcador de afinidad.
Purinas unidas a RIBOSA y a fosfato que, mediante polimerización, dan ADN y ARN.
Proteinas de membrana cuya función primaria es facilitar el transporte de moléculas a través de una membrana biológica. En esta amplia categoria se incluyen las proteinas implicadas en el transporte activo (TRANSPORTE BIOLÓGICO ACTIVO), transporte ayudado y CANALES IÓNICOS.
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Citidina 5'-(tetrahidrógeno trifosfato). Nucleótido de citosina que contiene tres grupos fosfato esterificados a la molécula de azúcar.
Capacidad de los virus de resistir o hacerse tolerantes a fármacos quimioterapéuticos o antivirales. Esta resistencia se adquire por mutación génica.
Grupo bastante grande de enzimas, que incluye no sólo aquellas que transfieren fosfato, sino también difosfato, residuos de nucleótidos y otros. También han sido subdivididas de acuerdo con el grupo aceptor. EC 2.7.
Compuesto didesoxinucleósido en el cual el grupo 3'-hidroxilo de la molécula de azúcar ha sido reemplazado por un hidrógeno. Esta modificación impide la formación de los enlaces fosfodiéster necesarios para formar las cadenas de ácido nucleico. La dinadosina es un potente inhibitor de la replicación del VIH, y actúa como terminador de la cadena del ADN viral al unirse a la transcriptasa inversa; eñ ddi es entonces metabolizado a didesoxiadenosine trifosfato, que es su metabolito putativo activo.
Las bases púricas relacionadas a la hipoxantina, un producto intermediario de la síntesis del ácido úrico y un producto de la degradación del catabolismo de la adenina.
Un nucleótido de adenina es un biomolécula compuesta por un azúcar pentosa (ribosa o desoxirribosa), un grupo fosfato y la base nitrogenada adenina, que desempeña un papel fundamental en la transferencia de energía, almacenamiento y codificación de información genética en organismos vivos.