Especie de archaea estrictamente anaerobia, hipertermofílica que vive en sedimentos marinos geotérmicamente calientes. Muestra crecimiento heterotrófico por fermentación o por respiración sulfurosa.
Género de archaea estrictamente anaerobios ultratermofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que ocurren en aguas de mares calientes. Muestran crecimiento heterotrófico con una temperatura óptima de 100 grados C.
Una especie de ARCHAEA anaeróbico hipertermofílico, aislado de muestras de fluído hidrotermal. Es obligatoriamente heterotrófico con células cocoides que requieren TRIPTOFANO para crecer.
Una especie de ARCHAEA gramnegativa hipertermofílica, encontrada en salidas hidrotermales de océano profundo. Es un anaerobio obligatorio y obligatoriamente quimiorganotrófico.
Proteínas que se hallan en cualquier especie arqueológica.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
Unidades genéticas funcionales de la ARCHAEA.
Ácido ribonucleico de la archaea que cumple funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción génica en el arquea.
Género de archaea heterotrófica extremadamente termofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que existen en corrientes marinas calientes. Son sulfidógenos quimiorganotróficos anaerobios.
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Complemento genético de un organismo arqueal (ARCHAEA) como está representado en su ADN.
Una clase de proteínas de hierro-azufre que contienen un hierro coordinado al átomo de azufre de cuatro residuos de cisteína.
Estructuras que se encuentran dentro del núcleo de las células de Archaea que están constituidas por ADN o que contienen ADN, que contienen información genética esencial para la célula.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Tungsteno. Un elemento metálico que tiene por símbolo atómico W, número atómico 74 y peso atómico 183.85. Es utilizado en muchas aplicaciones industriales, incluyendo incremento de la solidez, dureza y fuerza a la tracción del acero; manufactura de filamentos para bombillos de luz incandescente y en puntos de contacto para aparatos eléctricos y automotores.
Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Orden de archaea estrictamente anaerobios, termofílicos en el reino EURYARCHAEOTA. Los miembros muestran crecimiento heterotrófico por respiración sulfurosa. Hay una sola familia THERMOCOCCACEAE.
El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Extirpación de secuencias protéicas internas (INTEINAS) de una proteína precursora, acopladas con la conexión de secuencias laterales (EXTEINAS). El empalme de proteína es una reacción autocatalítica y da lugar a la producción de dos proteínas a partir de un solo producto de translación primario: la inteína y la proteína madura.
Enzima que contiene ferredoxina y cataliza la descarboxilación oxidativa dependiente de la COENZIMA-A del PIRUVATO a acetil-COENZIMA A y DIÓXIDO DE CARBONO.
Un elemento miembro de la familia de los calcógenos. Tiene por símbolo atómico S, número atómico 16 y peso atómico [32.059; 32.076]. Se encuentra en los aminoácidos cisteína y metionina.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Formación de sustancias cristalinas a partir de soluciones o fusiones. (traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Monoanhídrido de ácido carbámico con ÁCIDO FOSFÓRICO. Es un importante metabolito intermediario y es enzimáticamente sintetizado por CARBAMIL-FOSFATO SINTASA (AMONÍACO) y CARBAMOIL-FOSFATO SINTASA (GLUTAMINA HIDROLIZANTE).
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
ARN de transferencia que es específico para transportar ácido aspártico hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Secuencias (proTEÍNAS EXternas) de acompañamiento de INTEÍNAS, que son fragmentos internos de proteínas precursoras removidas por EMPALME DE PROTEÍNAS. Al mismo tiempo, como las inteínas se escinden, las exteínas se ligan para formar proteínas maduras.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Enzima que se halla en bacterias. Cataliza la reducción de FERREDOXINA y otras sustancias en presencia de hidrógeno molecular e interviene en el transporte de electrones de la fotosíntesis bacteriana.
Los fragmentos internos de proteínas precursoras (ProTEINAS INternas) que son autocatalíticamente removidas por el EMPALME DE PROTEINAS. Los freagmentos flanqueantes (EXTEINAS) se unen formando proteínas maduras. Los códigos de secuencias de ácido nucléico son considerados ELEMENTOS GENETICOS MOVILES. Las inteinas se componen de dominios de auto-empalme y un dominio de endonucleasa el cual juega un rol en la diseminación de la secuencia genómica de las inteinas. Las mini-inteinas se componen solamente de dominios de auto-empalme.
La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.
Enzimas que catalizan la metilación dependiente de S-adenosil-L-metionina de las bases ribonucleótidas en el interior de una molécula de ARN de transferencia. EC 2.1.1.
Clase de enzimas que transfieren grupos fosfato y tiene un grupo carboxilo como aceptor. EC 2.7.2.
Aguas termales en el fondo del océano. Generalmente, se encuentran cerca de lugares de actividad volcánica tales como arrecifes oceánicos.
Auxiliar de diagnóstico para la determinación de la función del páncreas.
Exocelulasa con especificidad por distintos sustratos beta-D-glucósidos. Cataliza la hidrólisis de residuos terminales no reductores en los beta-D-glucósidos con liberación de GLUCOSA.
Proteínas que contienen hierro que transfieren electrones a las flavoproteínas, generalmente en un bajo potencial; el hierro no está presente como en el hemo.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Hidrógeno. El primer elemento químico de la tabla periódica. Tiene por símbolo atómico H, número atómico 1 y peso atómico [1.00784; 1.00811]. Existe, en condiciones normales, como un gas diatómico incoloro, inodoro e insípido. Los iones del hidrógeno son PROTONES. Además del isótopo común H1 el hidrógeno existe como el isótopo estable DEUTERIO y el isótopo radioactivo inestable TRITIO.
Esparcimiento de rayos X por la materia, especialmente cristales, con la consiguiente variación en intensidad debida a los efectos de interferencia. El análisis de la estructura de los cristales de los materiales se hace pasando rayos x a través de ellos y registrando la imagen de difracción de los rayos (CRISTALOGRAFIA POR RAYOS X).
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Enzima del ciclo de la urea que cataliza la formación de ortofosfato y L-citrulina (CITRULINA) a partir de FOSFATO DE CARBAMILO y L-ornitina (ORNITINA). La deficiencia de esta enzima puede ser transmitida como un rasgo ligado al X. EC 2.1.3.3.
Virus cuyos huéspedes pertenecen al dominio de ARCHAEA.
Enzimas que reconocen estructuras de ADN CRUCIFORME e introduce incisiones pares que ayudan a resolver la estructura dentro de dos hélices de ADN.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Enzima que cataliza la conversión de L-glutamato y agua en 2-oxoglutarato y NH3 en presencia de NAD+. EC 1.4.1.2.
Enzimas que degradan la quitina, hidrolizando los enlaces beta(1,4). Se encuentran en muchos organismos, desde bacterias, virus y hongos, hasta plantas y animales, con actividades específicas dependiendo de los organismos: en los hongos tienen funciones autolíticas, nutricionales y morfogénicas; en las bacterias digieren la quitina para obtener energía; en las plantas intervienen en la defensa y el desarrollo; y en crustáceos e insectos participan en los procesos de muda. (http://recursostic.javeriana.edu.co/wiki/index.php/Bioinformática_de_Quitinasas, 01-03-2009)
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.
Endocelulasa con especificidad por la hidrolisis de enlaces 1,3-beta-D-glucosídicos en los 1,3-beta-D-glucanos, incluyendo laminarin, paramilon y paquiman.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Forma tridimensional y ordenamiento característico de las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Familia de glicosidasas que hidrolizan la CELULOSA cristalina en moléculas de azúcar soluble. En esta familia hay distintos subtipos de enzimas con especificidades de sustratos diferenciados que deben actuar juntas para efectuar la hidrólisis completa de la celulosa. Se encuentran en estructuras llamadas CELULOSOMAS.
Una endocelulasa con especificidad para la hidrólisis de enlaces 1.4-beta-glicosídicos en la CELULOSA, liquenina y beta-glucanos de cereales.
1,4-alfa-D-glucan-1,4-alfa-D-glucan 4-alfa-D-glucosiltransferasa/dextrina 6 alfa-D-glucanohidrolasa. Sistema enzimático que tiene actividades tanto de 4-alfa-glucanotransferasa (EC 2.4.1.25) como de amilo-1,6-glucosidasa (EC 3.2.1.33). Como transferasa, transfiere un segmento de un 1,4-alfa-D-glucano hacia una nueva posición 4 en un aceptor, que puede ser glucosa u otro 1,4-alfa-D-glucano. Como glucosidasa, cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,6-alfa-D-glucosídicos en puntos de ramificación de las cadenas de residuos de alfa-D-glucosa enlazados en 1,4. La actividad de la amilo-1,6-glucosidasa es deficiente en la enfermedad por almacenamiento de glucógeno tipo III.
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Enzima que activa el ácido aspártico con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.12.
Enzimas que catalizan la endohidrólisis de los enlaces 1,4-alfa-glicosídicos en el ALMIDÓN, GLUCÓGENO, y POLISACÁRIDOS y OLIGOSACÁRIDOS relacionados que contienen 3 o más unidades de D-glucosa enlazadas en 1,4-alfa.
Una aldotriosa que es un intermediario importante en la glicolisis y en la síntesis de triptofano.
Orden de metágenos anaerobios en el reino EURYARCHAEOTA. Tienen forma de pseudosarcina, cocoide o bastoncillos envueltos en vainas y catabolizan a grupos metilo. Las paredes celulares están compuestas de proteínas. El orden incluye una familia, METHANOCOCCACEAE.
Pequeño ARN mitocondrial cinetoplástido que desempeña un importante rol en la EDICIÓN DEL ARN. Estas moléculas forman híbridos perfectos con las secuencias editadas de ARNm y poseen secuencias de nucleótidos en sus extremos 5' que son complementarias con las secuencias del ARNm que están inmediatamente corriente abajo de las regiones preeditadas.
Una enzima que contiene ARN que desempeña un rol esencial en el procesamiento ARNt catalizando el clivaje endonucleolítico de precursores de ARN DE TRANSFERENCIA. Remueve los extra 5'-nucleótidos desde los precursores de ARNt para generar moléculas de ARNt maduras.
Género de METHANOCOCCACEAE cocoides cuyos organismos se mueven por medio de un penacho de flagelos polares. Estos metágenos se encuentran en pantanos salinos, sedimentos marinos y estuarios, y en el tracto gastrointestinal de animales.
Disacárido que consta de dos unidades de glucosa en el enlace glicosídico beta (1-4). Se obtiene de la hidrólisis parcial de la celulosa.
Grupo de enzimas que catalizan la segmentación endonucleolítica del ADN. Incluyen miembros de EC 3.1.21.-, EC 3.1.22.-, EC 3.1.23.- (ENZIMAS DE RESTRICCION DEL ADN), EC 3.1.24. (ENZIMAS DE RESTRICCION DEL ADN). y EC 3.1.25.-.
Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.
Oxidorreductasas especificas para los ALDEHIDOS.
Proceso mediante el cual dos moléculas con la misma composición química forman un producto de condensación o polímero.