Pyrococcus furiosus
Especie de archaea estrictamente anaerobia, hipertermofílica que vive en sedimentos marinos geotérmicamente calientes. Muestra crecimiento heterotrófico por fermentación o por respiración sulfurosa.
Pyrococcus
Género de archaea estrictamente anaerobios ultratermofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que ocurren en aguas de mares calientes. Muestran crecimiento heterotrófico con una temperatura óptima de 100 grados C.
Pyrococcus horikoshii
Una especie de ARCHAEA anaeróbico hipertermofílico, aislado de muestras de fluído hidrotermal. Es obligatoriamente heterotrófico con células cocoides que requieren TRIPTOFANO para crecer.
Pyrococcus abyssi
Una especie de ARCHAEA gramnegativa hipertermofílica, encontrada en salidas hidrotermales de océano profundo. Es un anaerobio obligatorio y obligatoriamente quimiorganotrófico.
Archaea
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
ADN de Archaea
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
Genes Arqueales
Unidades genéticas funcionales de la ARCHAEA.
ARN de Archaea
Ácido ribonucleico de la archaea que cumple funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Regulación de la Expresión Génica Arqueal
Thermococcus
Género de archaea heterotrófica extremadamente termofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que existen en corrientes marinas calientes. Son sulfidógenos quimiorganotróficos anaerobios.
Estabilidad de Enzimas
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Genoma Arqueal
Complemento genético de un organismo arqueal (ARCHAEA) como está representado en su ADN.
Rubredoxinas
Una clase de proteínas de hierro-azufre que contienen un hierro coordinado al átomo de azufre de cuatro residuos de cisteína.
Cromosomas de Archaea
Estructuras que se encuentran dentro del núcleo de las células de Archaea que están constituidas por ADN o que contienen ADN, que contienen información genética esencial para la célula.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Tungsteno
Tungsteno. Un elemento metálico que tiene por símbolo atómico W, número atómico 74 y peso atómico 183.85. Es utilizado en muchas aplicaciones industriales, incluyendo incremento de la solidez, dureza y fuerza a la tracción del acero; manufactura de filamentos para bombillos de luz incandescente y en puntos de contacto para aparatos eléctricos y automotores.
Calor
Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.
Secuencia de Aminoácidos
Thermococcales
Orden de archaea estrictamente anaerobios, termofílicos en el reino EURYARCHAEOTA. Los miembros muestran crecimiento heterotrófico por respiración sulfurosa. Hay una sola familia THERMOCOCCACEAE.
Cristalografía por Rayos X
Homología de Secuencia de Aminoácido
Empalme de Proteína
Extirpación de secuencias protéicas internas (INTEINAS) de una proteína precursora, acopladas con la conexión de secuencias laterales (EXTEINAS). El empalme de proteína es una reacción autocatalítica y da lugar a la producción de dos proteínas a partir de un solo producto de translación primario: la inteína y la proteína madura.
Piruvato-Sintasa
Azufre
Especificidad por Sustrato
Cristalización
Modelos Moleculares
Carbamoil Fosfato
Clonación Molecular
ARN de Transferencia de Aspártico
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Temperatura Ambiental
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Exteínas
Hidrogenasas
Enzima que se halla en bacterias. Cataliza la reducción de FERREDOXINA y otras sustancias en presencia de hidrógeno molecular e interviene en el transporte de electrones de la fotosíntesis bacteriana.
Inteínas
Los fragmentos internos de proteínas precursoras (ProTEINAS INternas) que son autocatalíticamente removidas por el EMPALME DE PROTEINAS. Los freagmentos flanqueantes (EXTEINAS) se unen formando proteínas maduras. Los códigos de secuencias de ácido nucléico son considerados ELEMENTOS GENETICOS MOVILES. Las inteinas se componen de dominios de auto-empalme y un dominio de endonucleasa el cual juega un rol en la diseminación de la secuencia genómica de las inteinas. Las mini-inteinas se componen solamente de dominios de auto-empalme.
Catálisis
ARNt Metiltransferasas
Fosfotransferasas (Aceptor de Grupo Carboxilo)
Respiraderos Hidrotermales
beta-Glucosidasa
Ferredoxinas
Secuencia de Bases
Hidrógeno
Hidrógeno. El primer elemento químico de la tabla periódica. Tiene por símbolo atómico H, número atómico 1 y peso atómico [1.00784; 1.00811]. Existe, en condiciones normales, como un gas diatómico incoloro, inodoro e insípido. Los iones del hidrógeno son PROTONES. Además del isótopo común H1 el hidrógeno existe como el isótopo estable DEUTERIO y el isótopo radioactivo inestable TRITIO.
Difracción de Rayos X
Esparcimiento de rayos X por la materia, especialmente cristales, con la consiguiente variación en intensidad debida a los efectos de interferencia. El análisis de la estructura de los cristales de los materiales se hace pasando rayos x a través de ellos y registrando la imagen de difracción de los rayos (CRISTALOGRAFIA POR RAYOS X).
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Ornitina Carbamoiltransferasa
Virus de Archaea
Virus cuyos huéspedes pertenecen al dominio de ARCHAEA.
Resolvasas de Unión Holliday
Sitios de Unión
Glutamato Deshidrogenasa
Quitinasa
Enzimas que degradan la quitina, hidrolizando los enlaces beta(1,4). Se encuentran en muchos organismos, desde bacterias, virus y hongos, hasta plantas y animales, con actividades específicas dependiendo de los organismos: en los hongos tienen funciones autolíticas, nutricionales y morfogénicas; en las bacterias digieren la quitina para obtener energía; en las plantas intervienen en la defensa y el desarrollo; y en crustáceos e insectos participan en los procesos de muda. (http://recursostic.javeriana.edu.co/wiki/index.php/Bioinformática_de_Quitinasas, 01-03-2009)
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Dominio Catalítico
Glucano Endo-1,3-beta-D-Glucosidasa
Concentración de Iones de Hidrógeno
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Estructura Cuaternaria de Proteína
Celulasas
Familia de glicosidasas que hidrolizan la CELULOSA cristalina en moléculas de azúcar soluble. En esta familia hay distintos subtipos de enzimas con especificidades de sustratos diferenciados que deben actuar juntas para efectuar la hidrólisis completa de la celulosa. Se encuentran en estructuras llamadas CELULOSOMAS.
Celulasa
Sistema de la Enzima Desramificadora del Glucógeno
1,4-alfa-D-glucan-1,4-alfa-D-glucan 4-alfa-D-glucosiltransferasa/dextrina 6 alfa-D-glucanohidrolasa. Sistema enzimático que tiene actividades tanto de 4-alfa-glucanotransferasa (EC 2.4.1.25) como de amilo-1,6-glucosidasa (EC 3.2.1.33). Como transferasa, transfiere un segmento de un 1,4-alfa-D-glucano hacia una nueva posición 4 en un aceptor, que puede ser glucosa u otro 1,4-alfa-D-glucano. Como glucosidasa, cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,6-alfa-D-glucosídicos en puntos de ramificación de las cadenas de residuos de alfa-D-glucosa enlazados en 1,4. La actividad de la amilo-1,6-glucosidasa es deficiente en la enfermedad por almacenamiento de glucógeno tipo III.
Estructura Secundaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Aspartato-ARNt Ligasa
alfa-Amilasas
Gliceraldehído 3-Fosfato
Methanococcales
ARN Guia
Pequeño ARN mitocondrial cinetoplástido que desempeña un importante rol en la EDICIÓN DEL ARN. Estas moléculas forman híbridos perfectos con las secuencias editadas de ARNm y poseen secuencias de nucleótidos en sus extremos 5' que son complementarias con las secuencias del ARNm que están inmediatamente corriente abajo de las regiones preeditadas.