Ribotipificación
Técnicas de Tipificación Bacteriana
Operón de ARNr
Loci genéticos que dirigen la transcripción del ARN ribosómico en los operones bacterianos. Se les designa como rrnB, rrnC, rrnD, etc. de acuerdo a la posición estructural de la unidad de transcripción en la secuencia de ADN.
Electroforesis en Gel de Campo Pulsado
Electroforesis en gel en el que la dirección del campo eléctrico se cambia periódicamente. Esta técnica es similar a otros métodos electroforéticos utiliza normalmente para separar las moléculas de doble cadena de ADN que varían en tamaño de hasta decenas de miles de pares de bases. Sin embargo, alternando la dirección de un campo eléctrico es capaz de separar las moléculas de ADN de hasta varios millones de pares de bases de longitud.
ADN Ribosómico
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
Dermatoglifia del ADN
Una técnica para identificación de individuos de una especie basada en la singularidad de sus secuencias de ADN. La singularidad se determina identificándose cual combinación de variaciones alélicas ocurren en el individuo en un número estadísticamente relevante de sitios (o lugares) diferentes. En estudios forenses, POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCIÓN de LUGARES DE NVRT o lugares de REPETICIONES DE SATÉLITE múltiples y altamente polimórficos son analisados. El número de lugares usados para el perfil depende de la FRECUENCIA ALELICA en la población.
Clostridium difficile
Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción
Variación en la presencia o longitud de un fragmento de ADN que tiene lugar dentro de una especie, generada por una endonucleasa específica en un sitio específico del genoma. Tales variaciones se generan por mutaciones que crean o eliminan sitios de reconocimiento de estas enzimas o cambian la longitud del fragmento.
Técnica del ADN Polimorfo Amplificado Aleatorio
Técnica de ampliación que utiliza la amplificación de la reacción en cadena por polimerasa de baja viscosidad (PCR) con primers únicos de secuencia arbitraria para generar ordenamientos de cadena específica de fragmentos anónimos de ADN. La técnica RAPD puede usarse para determinar la identidad taxonómica, evaluar las relaciones de parentesco, analizar muestras de genomas mezclados, y crear sondas específicas.
Serotipificación
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Desoxirribonucleasa EcoRI
Sondas ARN
ARN preparado usualmente por transcripción a partir de ADN clonado, el cual es complementario de un ARNm específico o ADN y que se usa generalmente para estudiar genes de virus, distribución de ARN específico en tejidos y células, integración de ADN viral a los genomas, transcripción, etc. En tanto es preferible usar las SONDAS ADN a nivel macroscópico para detectar la presencia de ADN/ARN de especies o subespecies específicas, las sondas ARN se prefieren para estudios genéticos. El marcaje convencional para las sondas ARN incluyen los radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina. Las sondas ARN pueden dividirse por categorías en sondas ARN de sentido +, sondas ARN de sentido -, o sondas ARN antisentido.
Brotes de Enfermedades
Aumento repentino en la incidencia de una enfermedad. El concepto incluye BROTES DE ENFERMEDADES.
Desoxirribonucleasas de Localización Especificada Tipo II
Sistemas enzimáticos que contienen una subunidad única y sólo requieren magnesio para la actividad endonucleolítica. Las metilasas de modificación correspondientes son enzimas separadas. Los sistemas reconocen pequeñas secuencias específicas de ADN y quiebran, ya sea dentro o a una determinada distancia pequeña de la secuencia de reconocimiento, produciendo fragmentos específicos de cadena doble con 5'-fostafos terminales. Las enzimas de microorganismos diferentes con la misma especificidad se denominan isosquizómeras EC 3.1.21.4.
Epidemiología Molecular
Enterocolitis Seudomembranosa
Inflamación aguda de la MUCOSA INTESTINAL caracterizada por la presencia de seudomembranas o placas en el INTESTINO DELGADO (enteritis seudomembranosa) y en el INTESTINO GRUESO (colitis seudomembranosa). Se asocian comúnmente con el tratamiento con antibióticos y colonización por CLOSTRIDIUM DIFFICILE.
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
ARN Bacteriano
Tipificación de Bacteriófagos
Estudios de Evaluación como Asunto
Estudios que determinan la efectividad o valor de los procesos, personal y equipamiento, o del material necesario para conducir dichos estudios. En los casos de medicamentos y dispositivos, existen los ENSAYOS CLINICOS COMO ASUNTO, EVALUACION DE MEDICAMENTOS, y la EVALUACION PRECLINICA DE MEDICAMENTOS.
ARN Ribosómico 16S
Automatización
Desoxirribonucleasa HindIII
Burkholderia cepacia
Anguilas
Vibriosis
Infecciones producidas por bacterias del género VIBRIO.
ARN Ribosómico 23S
Cólera
Enfermedad diarreica aguda, endémica en la India y en el Sudeste Asiático, cuyo agente causal es el VIBRIO CHOLERAE. Esta afección puede llevar a deshidratación severa en cuestión de horas a menos que sea tratada rápidamente.
Corynebacterium diphtheriae
Especie de bacteria grampositiva, esporogénica en la que se reconocen tres tipos culturales. Estos tipos (gravis, intermedius, y mitis) fueron originalmente clasificados de acuerdo con la severidad clínica de los casos de la cual se aisla más frecuentemente las diferentes cepas. Esta especie es el agente causal de la DIFTERIA.
Microbiología Ambiental
Acinetobacter
Mapeo Restrictivo
Acinetobacter calcoaceticus
Vibrio cholerae
Agente etiológico del CÓLERA.
Salmonella enteritidis
Vibrio
Un género de VIBRIONACEAE, constituido por bacilos ligermente curvos, cortos, móviles y gram negativos. Diversas especies producen cólera y otras enfermedades gastrointestinales así como abortos en ganado vacuno y caprino.
Enzimas de Restricción del ADN
Enzimas que forman parte de los sistemas de restricción-modificación. Catalizan la segmentación endonucleolítica de secuencias de ADN que no poseen el patrón de metilación de la especie en el ADN de la célula hospedera. La segmentación produce fragmentos aleatorios, o específicos de doble cadena, con 5'-fosfatos terminales. La función de las enzimas de restricción es destruir cualquier ADN extraño que invada la célula hospedera. La mayoría ha sido estudiada en sistemas bacterianos, pero algunas han sido encontradas en organismos eucarióticos.También se han usado como herramientas en la disección sistemática y en el mapeo de los cromosomas, en la determinación de la secuencia de bases de ADNs y han hecho posible cortar y recombinar genes de un organismo al genoma de otro. EC 3.21.1.
Difteria
Infección localizada de las membranas mucosas o de la piel producida por cepas toxigénicas del CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE. Se caracteriza por la presencia de una pseudomembrana en el sitio de la infección. La TOXINA DE LA DIFTERIA, producida por el C. diphtheriae, puede producir miocarditis, polineuritis, y otros efectos tóxicos sistémicos.
Sondas de ADN
ADN específico de especies o subespecies (incluyendo ADN COMPLEMENTARIO; genes conservados, cromosomas enteros, o genomas enteros) utilizado en estudios de hibridación con el fin de identificar los microorganismos, para medir homologías ADN-ADN, agrupar subespecies, etc. La sonda de ADN se hibrida con un ARNm específico, si está presente. Entre las técnicas convencionales que se utilizan para determinar el producto de hibridación se encuentran ensayos de "dot blot" (o inmunotransferencia por puntos), ensayos de "Southern blot" (o inmunotransferencia de Southern), y pruebas de anticuerpos específicos de híbridos ADN:ARN. Entre los marcadores convencionales de las sondas de ADN se encuentran los marcadores radioactivos 32P y 125I y el marcador químico biotina. El empleo de sondas de ADN proporciona un sustituto específico, sensible, rápido, y barato de técnicas de cultivo celular para el diagnóstico de las infecciones.
Listeria monocytogenes
Especie de bacterias grampositivas en forma de bastoncillos ampliamente distribuidas en la naturaleza. Se han aislado de las aguas de albañales, suelos, ensilajes, y de las heces de animales saludables y del hombre. La infección con esta bacteria produce encefalitis, meningitis, endocarditis, y abortos.
Salmonella enterica
Desoxirribonucleasa BamHI
Genes de ARNr
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
Absceso Hepático
Heces
Residuo o excremento del tracto digestivo formado en el intestino y expulsado por recto. Las heces están compuestas por agua, residuos alimenticios, bacterias y secreciones del intestino y del hígado. (Diccionario Mosby. 5a ed. Madrid: Harcourt España, 2000, p.615).
Hibridación de Ácido Nucleico
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Genotipo
Microbiología de Alimentos
Infecciones por Acinetobacter
Infecciones producidas por bacterias del género ACINETOBACTER.
Análisis por Conglomerados
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Pasteurella multocida
Especie de bacterias gram negativas, facultativamente anaerobias, en forma de bastoncillos que se encuentran normalmente en la flora de la boca y del tracto respiratorio de animales y aves. Produce fiebre de embarque (ver PASTEURELLOSIS, NEUMONICA), BACTERIEMIA HEMORRÁGICA, y enfermedades intestinales en animales. En humanos, la enfermedad surge usualmente luego de una picada o arañazo producido por animales domésticos.
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Microbiología del Agua
Pruebas de Sensibilidad Microbiana
Disentería Bacilar
DISENTERIA causada por bacterias gram negativas entéricas en forma de bastoncitos (ENTEROBACTERIACEAE), generalmente por el género SHIGELLA. La disenteria por shigella o shigelosis se clasifica en subgrupos según la gravedad del síndrome y las especies infecciosas. Grupo A: SHIGELLA DYSENTERIAE (la más grave); Grupo B: SHIGELLA FLEXNERI; Grupo C: SHIGELLA SONNEI (la más benigna).
Enfermedades Transmitidas por los Alimentos
1) Enfermedades agudas que generalmente afectan el tracto gastrointestinal, causada por el consumo de alimentos o bebidas contaminadas. La mayoría de estas enfermedades son infecciosas, causadas por una variedad de bacterias, virus o parásitos que pueden ser transmitidas por los alimentos. A veces las enfermedades son causadas por las toxinas nocivas de los microbios u otras sustancias químicas presentes en el alimento. Especialmente en este último caso, la condición a menudo se llama intoxicación alimentaria.(MeSH) 2) Efectos nocivos que siguen a la ingestión de alimentos debido a I) la contaminación con bacterias patógenas, II) la presencia de productos tóxicos procedentes de hongos y bacterias, III) la reacción alérgica a ciertas proteínas u otros componentes de los alimentos, o IV) la contaminación con sustancias químicas.
Francia
Farmacorresistencia Microbiana
Capacidad de los microorganismos, en especial las bacterias, de resistir o hacerse tolerantes a fármacos quimioterapéuticos, antimicrobianos o antibióticos. Esta resistencia puede ser adquirida a través de mutación génica o ADN extraño en plásmidos transmisibles (FACTORES R).
Tipificación Molecular
Usando técnicas de BIOLOGÍA MOLECULAR, tales como SECUENCIA DE ANÁLISIS DE ADN; ELECTROFORESIS EN GEL DE CAMPO PULSADO y DERMATOFIGLIA DEL ADN, para identificar, clasificar y comparar organismos y sus subtipos.
Plásmidos
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Fenotipo
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Enterotoxinas
Sustancias que son tóxicas para el tracto gastrointestinal y que producen vómitos, diarreas, etc. La mayoría de las enterotoxinas comunes son producidas por bacterias.
Secuencia de Bases
Toxinas Bacterianas
Citrobacter
Reproducibilidad de Resultados
La reproductibilidad estadística de dimensiones (frecuentemente en el contexto clínico) incluyendo la testaje de instrumentación o técnicas para obtener resultados reproducibles; reproductibilidad de mediciones fisiológicas que deben de ser usadas para desarrollar normas para estimar probabilidad, prognóstico o respuesta a un estímulo; reproductibilidad de ocurrencia de una condición y reproductibilidad de resultados experimentales.