Análisis de POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCION de genes rARN que es usada para diferenciación entre especies o cepas.
Procedimientos para identificar tipos y cepas de bacterias. Los sistemas de tipificación más frecuentemente empleados son los de TIPIFICACION DE BACTERIOFAGOS y la SEROTIPIFICACION, así como la tipificación de bacteriocina y la biotipificación.
Loci genéticos que dirigen la transcripción del ARN ribosómico en los operones bacterianos. Se les designa como rrnB, rrnC, rrnD, etc. de acuerdo a la posición estructural de la unidad de transcripción en la secuencia de ADN.
Electroforesis en gel en el que la dirección del campo eléctrico se cambia periódicamente. Esta técnica es similar a otros métodos electroforéticos utiliza normalmente para separar las moléculas de doble cadena de ADN que varían en tamaño de hasta decenas de miles de pares de bases. Sin embargo, alternando la dirección de un campo eléctrico es capaz de separar las moléculas de ADN de hasta varios millones de pares de bases de longitud.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
Una técnica para identificación de individuos de una especie basada en la singularidad de sus secuencias de ADN. La singularidad se determina identificándose cual combinación de variaciones alélicas ocurren en el individuo en un número estadísticamente relevante de sitios (o lugares) diferentes. En estudios forenses, POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCIÓN de LUGARES DE NVRT o lugares de REPETICIONES DE SATÉLITE múltiples y altamente polimórficos son analisados. El número de lugares usados para el perfil depende de la FRECUENCIA ALELICA en la población.
Habitante común de la flora del colon de los niños y algunas veces de los adultos. Produce una toxina que causa la ENTEROCOLITIS PSEUDOMEMBRANOSA en pacientes que reciben tratamiento con antibióticos.
Variación en la presencia o longitud de un fragmento de ADN que tiene lugar dentro de una especie, generada por una endonucleasa específica en un sitio específico del genoma. Tales variaciones se generan por mutaciones que crean o eliminan sitios de reconocimiento de estas enzimas o cambian la longitud del fragmento.
Técnica de ampliación que utiliza la amplificación de la reacción en cadena por polimerasa de baja viscosidad (PCR) con primers únicos de secuencia arbitraria para generar ordenamientos de cadena específica de fragmentos anónimos de ADN. La técnica RAPD puede usarse para determinar la identidad taxonómica, evaluar las relaciones de parentesco, analizar muestras de genomas mezclados, y crear sondas específicas.
Proceso de determinar y distinguir las especies de bacterias o virus basados en antígenos que comparten.
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Una de las desoxirribonucleasas del Tipo II sitio-específicas (EC 3.1.21.4). Reconoce y divide la secuencia G/AATTC. EcoRI proviene de E. coliRY13. Varios isosquizómeros han sido identificados. EC 3.1.21.-.
ARN preparado usualmente por transcripción a partir de ADN clonado, el cual es complementario de un ARNm específico o ADN y que se usa generalmente para estudiar genes de virus, distribución de ARN específico en tejidos y células, integración de ADN viral a los genomas, transcripción, etc. En tanto es preferible usar las SONDAS ADN a nivel macroscópico para detectar la presencia de ADN/ARN de especies o subespecies específicas, las sondas ARN se prefieren para estudios genéticos. El marcaje convencional para las sondas ARN incluyen los radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina. Las sondas ARN pueden dividirse por categorías en sondas ARN de sentido +, sondas ARN de sentido -, o sondas ARN antisentido.
Aumento repentino en la incidencia de una enfermedad. El concepto incluye BROTES DE ENFERMEDADES.
Sistemas enzimáticos que contienen una subunidad única y sólo requieren magnesio para la actividad endonucleolítica. Las metilasas de modificación correspondientes son enzimas separadas. Los sistemas reconocen pequeñas secuencias específicas de ADN y quiebran, ya sea dentro o a una determinada distancia pequeña de la secuencia de reconocimiento, produciendo fragmentos específicos de cadena doble con 5'-fostafos terminales. Las enzimas de microorganismos diferentes con la misma especificidad se denominan isosquizómeras EC 3.1.21.4.
La aplicación de la biología molecular para responder a cuestiones epidemiológicas. Ejemplos comunes son el examen de patrones de alteraciones en el ADN para implicar carcinógenos individuales y el uso de marcadores moleculares para predecir cuáles individuos tienen un mayor riesgo de enfermedades.
Inflamación aguda de la MUCOSA INTESTINAL caracterizada por la presencia de seudomembranas o placas en el INTESTINO DELGADO (enteritis seudomembranosa) y en el INTESTINO GRUESO (colitis seudomembranosa). Se asocian comúnmente con el tratamiento con antibióticos y colonización por CLOSTRIDIUM DIFFICILE.
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Infecciones producidas por bacterias del género CLOSTRIDIUM.
Técnica para tipificación bacteriana capaz de diferenciar las bacterias o las cepas de bacterias por su susceptibilidad a uno o más bacteriófagos.
Estudios que determinan la efectividad o valor de los procesos, personal y equipamiento, o del material necesario para conducir dichos estudios. En los casos de medicamentos y dispositivos, existen los ENSAYOS CLINICOS COMO ASUNTO, EVALUACION DE MEDICAMENTOS, y la EVALUACION PRECLINICA DE MEDICAMENTOS.
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Operación controlada de un aparato, proceso, o sistema por dispositivos mecánicos o electrónicos que ocupan el lugar de los órganos humanos de observación, esfuerzo y decisión.
Una de las desoxirribonucleasas del TIpo II sitio-específicas. Reconoce y divide la secuencia A/AGCTT. HindIII proviene del Haemophillus influenzae R(d). Numerosos isosquizómeros han sido identificados. EC 3.1.21.-.
Familia de bacterias gram negativas aerobias que no forman endosporas o microquistes.
Cualquier infección que un paciente contrae en una institución de salud.
Especie de BURKHOLDERIA considerada como patógeno oportunista en humanos. Se ha asociado con varios tipos de infecciones de origen nosocomial.
Nombre común de un orden (Anguilliformes) de peces teleósteos, voraces, elongados, con aspecto de serpiente.
Infecciones producidas por bacterias del género VIBRIO.
Constituyente de la subunidad 50S de los ribosomas procarióticos que contienen alrededor de 3200 nucleótidos. El rARN 23S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Enfermedad diarreica aguda, endémica en la India y en el Sudeste Asiático, cuyo agente causal es el VIBRIO CHOLERAE. Esta afección puede llevar a deshidratación severa en cuestión de horas a menos que sea tratada rápidamente.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Especie de bacteria grampositiva, esporogénica en la que se reconocen tres tipos culturales. Estos tipos (gravis, intermedius, y mitis) fueron originalmente clasificados de acuerdo con la severidad clínica de los casos de la cual se aisla más frecuentemente las diferentes cepas. Esta especie es el agente causal de la DIFTERIA.
El estudio de microorganismos vivos en diversos tipos de medio ambiente (aire, suelo, agua etc) y su relación patogénica con otros organismos inclusive el hombre.
Género de bacterias gram negativas de la familia MORAXELLACEAE, que se encuentran en el suelo y el agua y de patogenicidad incierta.
Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.
Especie de bacteria gramnegativa aerobia que se encuentra en los suelos y el agua. Aunque se considera que normalmente no es patógena, esta bacteria es el agente causal de infecciones nosocomiales, particularmente en personas débiles.
Agente etiológico del CÓLERA.
Serotipo de Salmonella entérica que es agente etiológico de la gastroenteritis en el hombre y en otros animales.
Infecciones producidas por bacterias del género PASTEURELLA.
Infección producida por bacterias del género SERRATIA.
Un género de VIBRIONACEAE, constituido por bacilos ligermente curvos, cortos, móviles y gram negativos. Diversas especies producen cólera y otras enfermedades gastrointestinales así como abortos en ganado vacuno y caprino.
Enzimas que forman parte de los sistemas de restricción-modificación. Catalizan la segmentación endonucleolítica de secuencias de ADN que no poseen el patrón de metilación de la especie en el ADN de la célula hospedera. La segmentación produce fragmentos aleatorios, o específicos de doble cadena, con 5'-fosfatos terminales. La función de las enzimas de restricción es destruir cualquier ADN extraño que invada la célula hospedera. La mayoría ha sido estudiada en sistemas bacterianos, pero algunas han sido encontradas en organismos eucarióticos.También se han usado como herramientas en la disección sistemática y en el mapeo de los cromosomas, en la determinación de la secuencia de bases de ADNs y han hecho posible cortar y recombinar genes de un organismo al genoma de otro. EC 3.21.1.
Infección localizada de las membranas mucosas o de la piel producida por cepas toxigénicas del CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE. Se caracteriza por la presencia de una pseudomembrana en el sitio de la infección. La TOXINA DE LA DIFTERIA, producida por el C. diphtheriae, puede producir miocarditis, polineuritis, y otros efectos tóxicos sistémicos.
ADN específico de especies o subespecies (incluyendo ADN COMPLEMENTARIO; genes conservados, cromosomas enteros, o genomas enteros) utilizado en estudios de hibridación con el fin de identificar los microorganismos, para medir homologías ADN-ADN, agrupar subespecies, etc. La sonda de ADN se hibrida con un ARNm específico, si está presente. Entre las técnicas convencionales que se utilizan para determinar el producto de hibridación se encuentran ensayos de "dot blot" (o inmunotransferencia por puntos), ensayos de "Southern blot" (o inmunotransferencia de Southern), y pruebas de anticuerpos específicos de híbridos ADN:ARN. Entre los marcadores convencionales de las sondas de ADN se encuentran los marcadores radioactivos 32P y 125I y el marcador químico biotina. El empleo de sondas de ADN proporciona un sustituto específico, sensible, rápido, y barato de técnicas de cultivo celular para el diagnóstico de las infecciones.
Especie de bacterias grampositivas en forma de bastoncillos ampliamente distribuidas en la naturaleza. Se han aislado de las aguas de albañales, suelos, ensilajes, y de las heces de animales saludables y del hombre. La infección con esta bacteria produce encefalitis, meningitis, endocarditis, y abortos.
Infecciones con bacterias del género BURKHOLDERIA.
Subgénero de Salmonella que contiene varios serotipos de importancia médica. El hábitat para la mayoría de las cepas son los animales de sangre caliente.
Una de las desoxirribonucleasas del Tipo II sitio-específicas (EC 3.1.21.4). Reconoce y divide la secuencia G/GATCC. BamHI proviede del Bacillus amyloliquefaciens N. Numerosos isosquizómeros han sido identificados. EC 3.1.21.-.
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
Colecciones solitarias o múltiples de PUS dentro del hígado como resultado de infección por bacterias, protozoos u otros agentes.
Residuo o excremento del tracto digestivo formado en el intestino y expulsado por recto. Las heces están compuestas por agua, residuos alimenticios, bacterias y secreciones del intestino y del hígado. (Diccionario Mosby. 5a ed. Madrid: Harcourt España, 2000, p.615).
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Constitución genética del individuo, que comprende los ALELOS presentes en cada locus génico (SITIOS GENÉTICOS).
Bacteria que fermenta la lactosa y que produce disentería.
Presencia de bacterias, virus y hongos en alimentos y productos alimentarios. Este término no está restringido a organismos patógenos: la presencia de varias bacterias y hongos no patógenos en quesos y vinos, por ejemplo, se incluye en este concepto.
Plásmidos que controlan la síntesis de hemolisina por las bacterias.
Infecciones producidas por bacterias del género ACINETOBACTER.
Infecciones producidas por bacterias del género SALMONELLA.
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Especie de bacterias gram negativas, facultativamente anaerobias, en forma de bastoncillos que se encuentran normalmente en la flora de la boca y del tracto respiratorio de animales y aves. Produce fiebre de embarque (ver PASTEURELLOSIS, NEUMONICA), BACTERIEMIA HEMORRÁGICA, y enfermedades intestinales en animales. En humanos, la enfermedad surge usualmente luego de una picada o arañazo producido por animales domésticos.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Infecciones producidas por bacterias del género LISTERIA.
Presencia de bacterias, virus y hongos en el agua. Este término no está restringido a los organismos patógenos.
Cualquier prueba que demuestre la eficacia relativa de los diferentes agentes quimioterapéuticos contra microorganismos específicos (es decir, bacterias, hongos, virus).
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
DISENTERIA causada por bacterias gram negativas entéricas en forma de bastoncitos (ENTEROBACTERIACEAE), generalmente por el género SHIGELLA. La disenteria por shigella o shigelosis se clasifica en subgrupos según la gravedad del síndrome y las especies infecciosas. Grupo A: SHIGELLA DYSENTERIAE (la más grave); Grupo B: SHIGELLA FLEXNERI; Grupo C: SHIGELLA SONNEI (la más benigna).
1) Enfermedades agudas que generalmente afectan el tracto gastrointestinal, causada por el consumo de alimentos o bebidas contaminadas. La mayoría de estas enfermedades son infecciosas, causadas por una variedad de bacterias, virus o parásitos que pueden ser transmitidas por los alimentos. A veces las enfermedades son causadas por las toxinas nocivas de los microbios u otras sustancias químicas presentes en el alimento. Especialmente en este último caso, la condición a menudo se llama intoxicación alimentaria.(MeSH) 2) Efectos nocivos que siguen a la ingestión de alimentos debido a I) la contaminación con bacterias patógenas, II) la presencia de productos tóxicos procedentes de hongos y bacterias, III) la reacción alérgica a ciertas proteínas u otros componentes de los alimentos, o IV) la contaminación con sustancias químicas.
País en Europa occidental limitada por el Océano Atlántico, el Canal Inglés, el Mar Mediterráneo, y los países de Bélgica, Alemania, Italia, España, Suiza, el principado de Andorra y Mónaco, y en el ducado de Luxemburgo. Su capital es París.
Capacidad de los microorganismos, en especial las bacterias, de resistir o hacerse tolerantes a fármacos quimioterapéuticos, antimicrobianos o antibióticos. Esta resistencia puede ser adquirida a través de mutación génica o ADN extraño en plásmidos transmisibles (FACTORES R).
Usando técnicas de BIOLOGÍA MOLECULAR, tales como SECUENCIA DE ANÁLISIS DE ADN; ELECTROFORESIS EN GEL DE CAMPO PULSADO y DERMATOFIGLIA DEL ADN, para identificar, clasificar y comparar organismos y sus subtipos.
Diferencias genotípicas observadas entre los individuos de una población.
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Sustancias que son tóxicas para el tracto gastrointestinal y que producen vómitos, diarreas, etc. La mayoría de las enterotoxinas comunes son producidas por bacterias.
Infecciones con bacterias de la familia ENTEROBACTERIACEAE.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Sustancias tóxicas formadas o elaboradas por las bacterias; usualmente son proteínas con elevado peso molecular y antigenicidad, algunas se utilizan como antibióticos y algunas en las pruebas cutáneas para demostrar la presencia o la susceptibilidad a ciertas enfermedades.
Género de enterobacterias gramnegativas que pueden utilizar el citrato como única fuente de carbono.
La reproductibilidad estadística de dimensiones (frecuentemente en el contexto clínico) incluyendo la testaje de instrumentación o técnicas para obtener resultados reproducibles; reproductibilidad de mediciones fisiológicas que deben de ser usadas para desarrollar normas para estimar probabilidad, prognóstico o respuesta a un estímulo; reproductibilidad de ocurrencia de una condición y reproductibilidad de resultados experimentales.