Un actinomiceto que vive en el suelo con un ciclo de vida complejo que implica elrecimiento micelial ylaa formación de esporas. Participa en la producción de numerosos ANTIBIÓTICOS médicamente importantes.
Género de bacterias que forman micelas aéreas no fragmentadas. Se han identificado muchas especies de las que algunas son patógenas. Este género es responsable de la producción de la mayoría de los AGENTES ANTIBACTERIANOS de uso práctico.
Compuestos basados en ANTRACENOS que contienen dos CETONAS en cualquier posición. Las sustituciones pueden estar en cualquier posición excepto en los grupos cetónicos.
4-Metoxi-5-((5-metil-4-pentil-2H-pirrol-2-ilideno)metil)- 2,2'-bi-1H-pirrol. Pigmente tripirrólico tóxico, de color rojo brillante, de la Serratia marcescens y otros. Tiene actividades antibacteriana, anticoccídica, antimalárica y antifúngica, pero es utlizado principlamente como una herramienta bioquímica.
Actinomiceto del que se obtienen los antibióticos ESTREPTOMICINA, griseina, y CANDICIDINA.
Un actinomiceto usado en la producción de ANTIBIÓTICOS comerciales y como anfitrión para la clonación de genes.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.
Actinomiceto del que se obtiene el antibiótico OLEANDOMICINA.
Cuerpos metabólicamente inactivos, resistentes al calor y a las coloraciones, formados dentro de las células vegetativas de las bacterias del género Bacillus y Clostridium.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Sustancias que reducen el crecimiento o la reprodución de las BACTERIAS.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Actinomiceto del que se obtiene el antibiótico CLORTETRACICLINA.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Uno de los FURANOS con un carbonilo que forma una lactona cíclica. Es un compuesto endógeno hecho a partir del gamma-aminobutirato y es el precursor del gamma-hidroxibutirato. Es también utilizado como un agente farmacológico y como solvente.
Una prueba que se usa para determinar si tendrá lugar o no la complementación (compensación en forma de dominancia) en una célula con un fenotipo mutante dado cuando otro genoma mutante, que codifica el mismo fenotipo mutante, se introduce en dicha célula.
Cuerpo de un hongo, constituido por filamentos que se denominan HYPHAE.
ARN de transferencia que es específico para transportar leucina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Un anillo de naftaleno que contiene dos partes de cetona en cualquier posición. Pueden ser sustituídos en cualquier posición excepto en los grupos cetona.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Estructuras dentro del núcleo de las células de bacterias que consisten en o contienen ADN el cual porta la información genética esencial de la célula.
Clase de BACTERIAS con diversas propiedades morfológicas. Algunas Actinobacterias muestran entre si una semejanza de la secuencia 16S rADN/rARN mayor al 80 por ciento asi como la presencia de distintivos de nucleótidos. (Adaptación del original: Stackebrandt E. et al, Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491).
Cataliza la oxidación del catecol a 2-hidroximuconato semialdehído en la degradación del carbazol y el BENZOATO en las vías de HIDROXILACIÓN. También cataliza la conversión de 3-metilcatecol a cis, cis-2-hidroxi-6-oxohepta-2,4-dienoato en la vía de degradación del TOLUENO y el XILENO. Esta enzima ha sido anteriormente caracterizada como EC 1.13.1.2.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Proteína que es una subunidad de la ARN polimerasa. Efectúa la iniciación de cadenas específicas de ARN a partir del ADN.
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Biosíntesis del ARN dirigida por un patrón de ADN. La biosíntesis del ADN a partir del modelo de ARN se llama TRANSCRIPCIÓN REVERSA.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Degradación anaerobia de la GLUCOSA u otros nutrientes orgánicos para proporcionar energia en forma de ATP. Los productos finales varían según los organismos, sustratos y vías enzimáticas. Entre los productos comúnes de fermentación están el ETANOL y el ÁCIDO LÁCTICO.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Plásmidos que contienen al menos un cos (sitio de extremo cohesivo) del BACTERIÓFAGO LAMBDA. Se utilizan como vehículos de clonación.
Secuencias de ADN que son reconocidas (directa o indirectamente) y enlazadas por una ARN polimerasa dependiente de ADN durante la iniciación de la transcripción. Entre las secuencias altamente conservadas dentro del promotor están la caja de Pribnow en las bacterias y la TATA BOX en los eucariotes.
Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.
Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.
Cualquier materia colorante normal o anormal en PLANTAS, ANIMALES o microorganismos.
Grandes complejos enzimáticos formados de numerosos componentes de enzimas que se encuentran en STREPTOMYCES los cuales biosintetizan MACROLIDOS y otro STREPTOMYCE.
Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
Cualquier preparación líquida o sólida hecha específicamente para cultivo, almacenamiento o transporte de microorganismos u otros tipos de células. La variedad de los medios que existen permiten el cultivo de microorganismos y tipos de células específicos, como medios diferenciales, medios selectivos, medios de test y medios definidos. Los medios sólidos están constituidos por medios líquidos que han sido solidificados con un agente como el AGAR o la GELATINA.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Conjuntos de reacciones enzimáticas que tienen lugar en los organismos y forman compuestos bioquímicos estableciendo nuevos enlaces covalentes.
Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.
Filamentos microscópicos de los HONGOS, ocupados por una capa de protoplasma. Colectivamente las hifas constituyen el MICELIO.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Una enzima de la clase de las transferasas que cataliza la reacción ARN(n+1) y ortofosfato para producir ARN(n) y un nucleosido difosfato, o la reacción reversa. ADF, IDF, GDF, UDF y CDF pueden actuar como donadores en el último caso. EC 2.7.7.8.
Enzimas que degradan la quitina, hidrolizando los enlaces beta(1,4). Se encuentran en muchos organismos, desde bacterias, virus y hongos, hasta plantas y animales, con actividades específicas dependiendo de los organismos: en los hongos tienen funciones autolíticas, nutricionales y morfogénicas; en las bacterias digieren la quitina para obtener energía; en las plantas intervienen en la defensa y el desarrollo; y en crustáceos e insectos participan en los procesos de muda. (http://recursostic.javeriana.edu.co/wiki/index.php/Bioinformática_de_Quitinasas, 01-03-2009)
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Modificación hereditaria de las propiedades de una bacteria competente por ADN desnudo procedente de otra fuente. La incorporación de ADN desnudo es un fenómeno que ocurre naturalmente en algunas bacterias. esto es usado frecuentemente en TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Derivados del naftaleno que portan uno o más grupos hidroxilo (-OH) en cualquier posición del anillo. Se usan frecuentemente en colorantes y pigmentos, como antioxidantes para la goma, grasas y aceites, como insecticidas, en compuestos farmacéuticos y en muchas otras aplicaciones.
Grupo de compuestos macrocíclicos glicolisados formados por una extensión de cadena de múltiples PROPIONATOS y ciclizados a una lactona con muchos miembros (habitualmente 12, 14, 16). Los macrólidos pertenecen a la clase POLICÉTIDOS de productos naturales, y muchos miembros demuestran propiedades antibióticas.
Orden de BACTERIAS grampositivas, principalmente aerobias, que tienden a formar filamentos ramificados.
Virus cuyos huéspedes son células bacterianas.
Cualquier método empleado para determinar la localización y distancias relativas entre los genes en un cromosoma.
Métodos para el cultivo de células, usualmente a gran escala, en un sistema cerrado con el objetivo de producir células o productos celulares a cosechar.
Carboxiliasa que cataliza la descarboxilación de (S)-2-Metil-3-oxopropanoil-CoA a propanoil-CoA reductasa. En los microorganismos, la reacción puede ser acoplada al transporte vectorial de iones de SODIO a través de la membrana citoplasmática.
Enzima que cataliza la hidrólisis de difosfato (DIFOSFATOS) en fosfato inorgánico. La hidrólisis de pirofosfato está acoplado al transporte de PROTONES a través de una membrana.
Primer motivo proteico reconocido que se une al ADN. Los motivos de hélice-giro-hélice fueron identificados originalmente en las proteínas bacterianas, pero desde entonces se han hallado en cientos de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN tanto de eucariotas como de procariotas. Estan formados por dos alfa hélices conectadas por una corta cadena extendida de aminoácidos que constituye el "giro". Las dos hélices se mantienen en un ángulo fijo, ante todo mediante interacciones entre las dos hélices.
Familia de bacterias del suelo. También incluyen algunas formas parásitas.
Proceso parasexual en las BACTERIAS, ALGAS, HONGOS y EUCARIOTAS ciliados para lograr el intercambio de material cromosómico durante la fusión de dos células. En las bacterias, es una transferencia unidireccional del material genético; en los protozoos es un intercambio bidireccional. En las algas y hongos, es una forma de reproducción sexual, con la unión de gametos masculinos y femeninos.
Glicósido hidrolasas (o glicosidasas) catalizan la hidrólisis del acoplamiento glicosídico para generar dos azúcares más pequeños. Ellas son enzimas sumamente comunes con papeles en la naturaleza incluyendo la degradación de biomasa como la celulosa y hemicellulose, en estrategias de defensa antibacterianas (ej. lisozimas), en mecanismos patogénicos (ej. neuraminidasas virales) y en la función normal celular (ej. ajustando manosidasas implicadas en la biosíntesis de glicoproteinas N-ligadas). Con las glicosiltransferasas, glicosidasas forman la principal maquinaria catalítica para la síntesis y la ruptura de enlaces glicosídicos.
Poliacenos con anillos de benceno con cuatro uniones orto en una ordenación lineal. La subclase de este grupo llamada TETRACICLINAS es mejor conocida.
Enzima que utiliza NADH o NADPH para reducir FLAVINAS. Está implicada en un número de procesos biológicos que requieren flavina reducida para sus funciones tales como bioluminiscencia bacteriana. Antes enumerada como EC 1.6.8.1 y EC 1.5.1.29.
Está constituída por una cadena polipéptida y 4'-fosfopanteteína unida a un residuo de serina por un enlace fosfodiéster. Los grupos acilos están enlazados como ésteres de tiol al grupo de pantotenilo. El transportador de acil interviene en todos los casos de la síntesis de ácido graso, a través del sistema citoplasmático.
Enzima que interviene en las vías del catabolismo de la VALINA, LEUCINA e ISOLEUCINA, catalizando la oxidación del 2-metil-3-oxopropanato a propanoil-CoA usando NAD+ como coenzima. La deficiencia de metilmalonato-semialdehído deshidrogenasa se caracteriza por elevación de la BETA-ALANINA y del ácido 3-hidroxipropiónico.
Fusión in vitro de GENES con técnicas de ADN RECOMBINANTE para analizar el comportamiento de las proteínas o la REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA o para combinar funciones proteicas para usos específicos médicos o industriales.
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Enzima que cataliza la conversión de ATP, L-glutamato y NH3 en ADP, ortofosfato y L-glutamina. También actúa más lentamente sobre 4-metileno-L-glutamato. EC 6.3.1.2.
Guanosina 5'-difosfato 2'(3')-difosfato. Nucleótido de guanina que contiene cuatro grupos fosfato. Dos que están esterificados a la molécula de azúcar en la posición 5' y los otros dos en las posiciones 2' o 3'. Este nucleótido sirve como mensajero para detener la síntesis de ARN ribosómico cuando no se dispone de aminoácidos para la síntesis de proteínas. Sinónimo: mancha mágica I.
Sistemas de enzimas que funcionan secuencialmente, catalizando reacciones consecutivas conectadas por intermediarios metabólicos comunes. Pueden implicar simplemente una transferencia moléculas de agua o de átomos de hidrógeno o estar asociadas a grandes estructuras supramoleculares, como la MITOCONDRIA o los RIBOSOMAS.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Enzimas que catalizan la unión de dos moléculas a través de la formación de un enlace carbono-carbono. Son enzimas carboxilantes y en su mayoría, biotinil-proteínas. EC 6.4.
Enzima que cataliza reversiblemente la transferencia del grupo pirofosfato del ATP hacia el grupo 3'-OH del GDP o GTP, con formación de guanosina 3'-difosfato 5'-difosfato o guanosina 3'-difosfato 5'-trifosfato y AMP. La enzima, también llamada factor estricto, está localizada en el gen reIA en las cepas estrictas de las bacterias. La síntesis anterior es inducida por el ARNm y por el tARN descargado, que está enlazado al sitio de enlace ribosómico del aminoacil-ARNt por una asociación específica para codón. EC 2.7.6.5.
Grupo de enzimas que cataliza la transferencia de un grupo fosfato hacia un aceptor de grupo nitrogenado. EC 2.7.3.
Alcohol de azúcar de cinco carbonos derivado de la XILOSA mediante reducción del grupo carbonilo. Es tan dulce como la sucrosa y se emplea como edulcorante no cariogénico.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Enzimas que catalizan la segmentación endonucleolítica de las regiones monocatenarias de las moléculas de ADN o ARN, dejando las regiones bicatenarias intactas. Son particularmente útiles en el laboratorio para producir moléculas de ADN de "extremos romos"; con terminaciones monocatenarias sensibles para TÉCNICAS GENÉTICAS, tales como ENSAYOS DE PROTECCIÓN DE NUCLEASAS que involucran la detección de ADN y ARN monocatenarios.
Método espectroscópico de medición del momento magnético de las partículas elementales tales como núcleos atómicos, protones o electrones. Se emplea en aplicaciones clínicas tales como IMAGEN POR RESONANCIA MAGNÉTICA (IMAGEN POR RESONANCIA MAGNÉTICA)