Sulfolobus solfataricus
especie de ARCHAEA termoácidofilica de la familia Sulfolobaceae, encontrada en áreas volcánicas donde la temperatura llega casi a los 80 grados C y hay presencia de SULFURO.
Sulfolobus
Género de cocos ARCHAEA aeróbicos, quemolitotróficos cuyos organismos son termoacidofílicos. Sus células tienen forma muy irregular, a menudo lobuladas, pero ocasionalmente esféricas. Tienen una distribución mundial con organismos aislados de suelos calientes acídicos y del agua. El azufre se utiliza como fuente de energía.
Sulfolobus acidocaldarius
Regulación de la Expresión Génica Arqueal
ADN de Archaea
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
ARN de Archaea
Ácido ribonucleico de la archaea que cumple funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Archaea
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Cromosomas de Archaea
Estructuras que se encuentran dentro del núcleo de las células de Archaea que están constituidas por ADN o que contienen ADN, que contienen información genética esencial para la célula.
Genes Arqueales
Unidades genéticas funcionales de la ARCHAEA.
Estabilidad de Enzimas
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Genoma Arqueal
Complemento genético de un organismo arqueal (ARCHAEA) como está representado en su ADN.
ADN Polimerasa beta
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Calor
Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.
Virus de Archaea
Virus cuyos huéspedes pertenecen al dominio de ARCHAEA.
Secuencia de Aminoácidos
Glucosa 1-Deshidrogenasa
Rudiviridae
Familia de virus ADN con forma bacilar que infectan a ARCHAEA. Carecen de cubiertas o lípidos víricos.
Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Espaciadas
Las secuencias repetitivas de ácido nucleico que son los componentes principales de los SISTEMAS CRISPR-CAS arqueas y bacterias, que funcionan como sistemas adaptativos de defensa frente a los virus.
Especificidad por Sustrato
Temperatura Ambiental
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Nucleótidos de Desoxicitosina
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Hidrolasas de Triéster Fosfórico
Una clase de enzimas que catalizan la hidrólisis de una de los tres enlaces éster en un compuesto conteniendo fosfotriéster.
Modelos Moleculares
Cristalografía por Rayos X
Sulfolobaceae
Familia de SULFOLOBALES constituida por cocos aeróbicos o facultativamente anaeróbicos quemolitotróficos, que ocurren usualmente en solitario. Ellos crecen mejor a un pH de alrededor de 2.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Subunidades Ribosómicas Grandes de Archaea
Subunidad mayor del ribosoma 70S de archaea. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 40 diferentes PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.
Secuencia de Bases
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas de Archaea
Clonación Molecular
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Catálisis
Factores Procarióticos de Iniciación
Espermidina Sintasa
Enzima que cataliza la transferencia de la parte de propilamina de la 5'-desoxi-5'-S-(3-metiltiopropilamina)sulfonio adenosina a la putrescina, en la biosíntesis de espermidina. La enzima tiene un peso molecular de aproximadamente 73.000 kD y está compuesta de dos subunidades de igual tamaño.
ADN Polimerasa Dirigida por ADN
ADN polimerasas dependientes de ADN, que se encuentran en bacterias, animales y vegetales. Durante el proceso de replicación, estas enzimas catalizan la adición de residuos de desoxirribonucleótidos al extremo de una cadena de ADN en presencia de ADN como modelo-iniciador. También poseen actividad exonucleasa y por lo tanto funcionan en la reparación del ADN.
Antranilato Fosforribosiltransferasa
Enzima que cataliza la formación de ácido N-5'-fosforribosilantranílico a partir de antranilato y fosforribosilpirofosfato, la primera etapa en la síntesis de triptofano en E. coli. En bacterias, existe en un complejo con la ANTRANILATO SINTASA . EC 2.4.2.18.
Aldehído-Liasas
Glucosa Deshidrogenasas
Ácido Anhídrido Hidrolasas
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces difosfato en compuestos tales como nucleósido di- y tri-fosfatos y anhídridos que contienen sulfonil, tales como el adenililsulfato. EC 3.6.
Bacterias
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Concentración de Iones de Hidrógeno
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Proteínas Asociadas a CRISPR
Componentes proteicos de los SISTEMAS CRISPR-CAS para la defensa antiviral en BACTERIA y ARCHAEA. Estas son proteínas que llevan a cabo una variedad de funciones durante la creación y expansión de las SECUENCIAS CRISPR, la captura de nuevos ESPACIADORES CRISPR, biogénesis de PEQUEÑOS ARN DE INTERFERENCIA (CRISPR o crARNs), y la orientación y el silenciamiento de los virus y plásmidos invasores. Incluyen ADN HELICASAS; PROTEÍNAS PORTADORAS DE ARN, ENDONUCLEASAS, y ARN y ADN POLIMERASAS.
alfa-Glucosidasas
Sitios de Unión
Unión Proteica
Estructura Cuaternaria de Proteína
Purina-Nucleósido Fosforilasa
Proteína 1 de Mantenimiento de Minicromosoma
Proteína de unión a ADN específica de secuencia que juega un papel esencial como un regulador global de control del ciclo celular de la levadura. Contiene un dominio MADS-box de 56 aminoácidos en la proteína N-terminal y es una de las cuatro proteínas fundadores que definen estructuralmente la superfamilia de las PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. .
Cristalización
Factores de Elongación Enlazados a GTP Fosfohidrolasas
Factores que utilizan energía de la hidrólisis del GTP a GDP para la elongación de la cadena peptídica. EC 3.6.1.-.
Factor 1 de Elongación Peptídica
El factor 1 de elongación peptídica es una proteína con muchas subunidades, responsable del enlace dependiente de GTP, de los aminoacil-ARNt's a los ribosomas eucarióticos. La subunidad alfa (EF-1alfa) se une al aminoacil-ARNt y los transfiere al ribosoma, en un proceso vinculado a la hidrólisis del GTP. Las subunidades beta y delta (EF-1beta, EF-1delta) participan en la conversión de GDP a GTP. La subunidad gamma (EF-1gamma) es un componente estructural.
Desnaturalización Proteica
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Nucleótidos
Aductos de ADN
alfa-Amilasas
Replicación del ADN
Conformación de Ácido Nucleico
beta-Glucosidasa
Exocelulasa con especificidad por distintos sustratos beta-D-glucósidos. Cataliza la hidrólisis de residuos terminales no reductores en los beta-D-glucósidos con liberación de GLUCOSA.
Dimerización
Sulfolobales
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
Adenosina Trifosfatasas
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.
Termodinámica
Análisis rigurosamente matemático de las relaciones energéticas (calor, trabajo, temperatura y equilibrio). Describe sistemas cuyos estados están determinados por parámetros térmicos, como la temperatura, además de parámetros mecánicos y electromagnéticos.
Nucleótidos de Desoxiadenina
Alcohol Deshidrogenasa
Enzima que cataliza reversiblemente la etapa final de la fermentación alcohólica, reduciendo un aldehído a un alcohol. En el caso del etanol, el acetaldehído es reducido a etanol en presencia de NADH e hidrógeno. La enzima es una proteína con zinc que actúa en alcoholes primarios y secundarios o hemiacetales. EC 1.1.1.1.
Dominio Catalítico
Genes Bacterianos
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.