Enzima que cataliza la ruptura independiente de ATP de un ADN de cadena simple, seguida por el paso y reagrupamiento de otra hebra simple del ADN. Esta clase de enzima realiza la conversión de un topoisómero de ADN en otro, por ejemplo, el relajamiento de las vueltas superhelicoidales en el ADN, la interconversión de anillos simples y nodulares del ADN de cadena simple y el entrelazamiento de anillos de cadena simple de secuencias complementarias. EC 5.99.1.2.
Enzima que requiere ATP y que, en presencia de iones magnesio, introduce superenrollamientos negativos en ADN de cadena doble cerrados y posiblemente lineales. La enzima interviene en la replicación y en la transcripción del ADN. Provoca el almacenamiento de energía de presión mecánica en las vueltas superhelicoidales del ADN, a expensas de la hidrólisis del ATP. EC 5.99.1.3.
Enzimas que regulan la topología del ADN mediante acciones como la rotura, relajación, paso y reunión de las cadenas de ADN en las células. Estas enzimas son componentes importantes del sistema de replicación del ADN. Se clasifican por las especificidades del sustrato. Las enzimas TOPOISOMERASAS DE ADN TIPO I actuan sobre una cadena única del ADN. Las enzimas TOPOISOMERASAS DE ADN TIPO II actuan sobre cadenas dobles de ADN.
Compuestos que inhiben la actividad de las TOPOISOMERASAS DE ADN TIPO II. Incluidos en esta categoría hay una variedad de ANTINEOPLÁSICOS que se dirigen a la forma eucariota de la topoisomerasa II y ANTIBACTERIANOS que se dirigen a la forma procariota de la topoisomerasa II.
Compuestos que inhiben la actividad de las TOPOISOMERASAS del ADN.
Compuestos que inhiben la actividad de la TOPOISIMERASA I del ADN.
ADN duplex circular aislado a partir de los virus, bacterias y mitocondrias en forma superenrrollada o superdoblado. Este ADN superhelicoidal es rico en energía libre. Durante la transcripción, la magnitud de la iniciación es proporcional a la superhelicoidalidad del ADN.
Glicósido cardiotónico aislado de Scilla maritima var. alba (Squill).
Derivado de la aminoacridina que intercala hacia el ADN y usado como agente antineoplásico.
ADN CIRCULAR que está entrelazado como uniones de una cadena. Es usado como un ensayo para la actividad de las TOPOISOMERASAS DE ADN. El ADN encadenado se diferencia del ADN CONCATENADO en que aquel la unión es eslabón a eslabón y en éste la unión es final con final.
Compuestos complejos en los que dos moléculas cíclicas están entrelazadas como uniones en una cadena. Estos tienen un uso potencial en NANOTECNOLOGIA.
ADN topoisomerasa II bacteriano que cataliza la rotura dependiente de ATP de ambos filamentos de ADN, el paso de las hebras continuas a través de las rupturas, y re-uniones de los filamentos rotos. Las uniones de Girasa al ADN como un heterotetrámero consisten en dos subunidades A y dos B. En presencia del ATP, la girasa es capaz de convertir el ADN dúplex circular relajado en una superhélice. En la ausencia del ATP, ADN superenrollado se relajó por la ADN girasa.
Topoisomerasa bacteriana de ADN II que cataliza la rotura dependiente de ATP de ambas hebras de ADN, el paso de hebras sin romper a través de las roturas y la unión, de nuevo, de las hebras rotas. La topoisomerasa IV se une al ADN como heterodímero que consta de dos subunidades parC y 2 subunidades parE. La topoisomerasa IV es una enzima separadora de los cromosmas hijos entrelazados tras la replicación del ADN.
Un derivado semi-sintético de la PODOFILOTOXINA que exhibe actividad antitumoral. Tenipósido inhibe la síntesis de ADN mediante la formación de un complejo con la topoisomerasa II y el ADN. Este complejo induce rupturas en el ADN de cadena doble e impide su reparación mediante el enlace con la topoisomerasa II. Los pedazos acumulados de ADN impiden que las células entren en la fase mitótica del ciclo celular, provocando la muerte de la célula. El tenipósido actúa primariamente en las fases G2 y S del ciclo celular.
Compuesto antibiótico derivado del Streptomyces niveus. Tiene una estructura química similar a la cumarina. La novobiocina se une a la ADN girasa, y bloquea la actividad de la adenosina trifosfatasa (ATPasa). (Traducción libre del original: Reynolds, Martindale The Extra Pharmacopoeia, 30th ed, p189)
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Ordenamiento espacial de los átomos de un ácido nucleico o polinicleótido que produce su forma tridimensional característica.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Un alcaloide aislado de la madera del tallo del árbol chino, Camptotheca acuminata. Este compuesto inhibe selectivamente la enzima nuclear ADN TOPOISOMERASA. Varios análogos semisintéticos de la camptotecina han demostrado tener actividad antitumoral.
Células de los organismos superiores que contienen un núcleo verdadero limitado por una membrana nuclear.
Cualquiera de las moléculas de ADN covalentemente cerradas que se encuentran en bacterias, muchos virus, mitocondrias, plástidos, y plásmidos. También se han observado ADNs pequeños, circulares y polidispersos en un número de organismos eucarióticos y se ha sugerido que tienen homología con el ADN cromosómico y en la capacidad de insertarse en él, y escindirse del ADN cromosómico. Es un fragmento de ADN formado por un proceso de formación y de deleción de un asa , que contiene una región constante de la cadena pesada mu y la parte 3 de la región de cambio mu. El ADN circular es un producto normal de la reordenación entre los segmentos del gen que codifica las regiones variables de las cadenas ligeras y pesadas de las inmunoglobulinas, así como de los receptores de las células T.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.
La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Lesiones en el ADN que introducen distorsiones de su estructura normal intacta y que puede, si no se restaura, dar lugar a una MUTACIÓN o a un bloqueo de la REPLICACIÓN DEL ADN. Estas distorsiones pueden estar causadas por agentes físicos y químicos y se producen por circunstancias introducidas, naturales o no. Estas incluyen la introducción de bases ilegítimas durante la replicación o por desaminación u otra modificación de las bases; la pérdida de una base del ADN deja un lugar abásico; roturas de filamentos únicos; roturas de filamentos dobles; intrafilamentoso (DÍMEROS DE PIRIMIDINA) o uniones cruzadas interfilamentosas. El daño con frecuencia puede ser reparado (REPARACIÓN DEL ADN). Si el daño es grande, puede inducir APOPTOSIS.
Compuestos o agentes que se combinan con una enzima de manera tal que evita la combinación sustrato-enzima normal y la reacción catalítica.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Proteínas que se unen al ADN. La familia incluye proteínas que se unen tanto al ADN de una o de dos cadenas y que incluyen también a proteínas que se unen específicamente al ADN en el suero las que pueden utilizarse como marcadores de enfermedades malignas.
Especie del género SACCHAROMYCES, familia Saccharomycetaceae, orden Saccharomycetales, conocido como levadura del 'panadero' o del 'cervecero'. La forma seca se usa como suplemento dietético.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Sustancias que iniben o previenen la proliferación de NEOPLASIAS.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Adenosina 5'-(tetrahidrógeno trifosfato). Nucleótido de adenina que contiene tres grupos fosfato esterificados a la molécula de azúcar. Además de su crucial rol en el metabolismo del trifosfato de adenosina es un neurotransmisor.
Reacción que rompe una de las uniones covalentes de azucar-fosfato entre NUCLEÓTIDOS constituyentes de la columna azucar-fosfato del ADN. Esta reacción está catalizada por enzimas, por compuestos químicos o por radiación. La división puede ser exonucleótica, con eliminación del nucleótido del final, o endonucleótica, dividiendo la cadena en dos.
Pirido-CARBAZOLES descubiertos originariamente en la corteza de la OCHROSIA. Inhiben la síntesis del ADN y el ARN y tienen propiedades inmunosupresoras.
Acridinas sustituídas en cualquier posición por uno o más grupos amino o grupos amino sustituídos.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Quinolinas que son sustituídas en cualquier posición por uno o más grupos oxo. Estos compuestos pueden tener cualquier grado de hidrogenación, cualquier sustituyente y sistemas de anillo fusionados.
Género de protozoos parásitos encontrados en el tracto digestivo de invertebrados, especialmente de insectos. Los organismos de este género tienen una etapa de amastigote y coanomastigote en su ciclo de vida.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Grupo de QUINOLONAS que poseen, al menos, un átomo de cloro y un grupo piperacinilo.
ADN de cinetoplastos que son MITOCONDRIAS especializadas de los tripanosomas y de protozoos parasitarios relacionados dentro del orden CINETOPLASTIDA. El ADN de Cinetoplastos está constituido por una red compleja de numerosos anillos concatenados de dos clases; el primero es un gran número de pequeños anillos de ADN duplex, llamados minicírculos, con aproximadamente 2000 pares de base en longitud, y la segunda son varias docenas de anillos mucho más largos, llamados maxicírculos, de aproximadamente 37 kb en longitud.
CUMARINAS con un grupo amino, ejemplificadas por la NOVOBIOCINA.
Sustancias que son capaces de insertarse entre bases sucesivas de ADN, y de este modo lo retuercen, desenrrollan o deforman y, por tanto, impiden que funcione adecuadamente. Se utilizan en el estudio del ADN.
Derivado semi-sintético de la PODOFILOTOXINA que muestra actividad antitumoral. El etopósido inhibe la síntesis de ADN formando un complejo con la topoisomerasa II y el ADN. Ese complejo induce rupturas en el ADN de doble cuerda e impide la reparación mediante el enlace de la toposimerasa II. Rupturas acumuladas en el ADN impiden la entrada en la fase mitótica de la división celular y conduce a la muerte celular. El etopósido actúa primariamente en las fases G2 y S del ciclo celular.
Sustancias que impeden que microorganismos o agentes infecciosos se diseminen o que los destruyen con el fín de prevenir la extensión de la infección.
Naftiridinas son compuestos químicos heterocíclicos con propiedades vasodilatadoras y neuroprotectoras, utilizados en el tratamiento de la insuficiencia cardíaca congestiva.
Componentes de proteínas, glicoproteínas, o lipoproteínas que se encuentran en la superficie de las células tumorales que son usualmente identificados por anticuerpos monoclonales. Muchos de ellos son de origen embrionario o viral.
Familia de hidrocarburos de anillos fundidos, aislados del alquitrán de la hulla, que actúan como intermediarios en varias reacciones químicas y se usan en la producción de resinas de cumarina-indeno.
Una amplia categoría de enzimas que están involucradas en el proceso de RECOMBINACION GENETICA.
QUINOLONAS con un grupo 4-oxo (carbonilo en posición para unido al nitrógeno). Estos compuestos inhiben la subunidad A de la GIRASA DE ADN y se utilizan como antimicrobianos. La segunda generación de 4-quinolonas también están sustituidas con un grupo 1-piperacinilo en posición 7 y un átomo de flúor en posición 6.
Triterpenos son compuestos orgánicos lipofílicos, formados por seis unidades isoprenoides, que naturalmente ocurren en plantas, animales y hongos, desempeñando diversas funciones biológicas, como la defensa contra patógenos y la estructura celular.
Género de cocos ARCHAEA aeróbicos, quemolitotróficos cuyos organismos son termoacidofílicos. Sus células tienen forma muy irregular, a menudo lobuladas, pero ocasionalmente esféricas. Tienen una distribución mundial con organismos aislados de suelos calientes acídicos y del agua. El azufre se utiliza como fuente de energía.