Sulfolobus Solfataricus
Une espèce de thermoacidophilic Archaea dans la famille Sulfolobaceae volcanique, trouvé dans les zones où la température est à 26 degrés C et soufre.
Sulfolobus Acidocaldarius
Une espèce de l'aérobic. sa Chemolithotrophic Archaea constitué de soufre coccoid cellules qui utiliser comme source d'énergie. La température optimale pour la croissance est de 70 à 75 ° C. Il es isolée du champs acide.
Fuselloviridae
Une famille de virus à ADN lemon-shaped infectant Archaea et contenant un genre : Fusellovirus.
Archéobactéries
Un des trois domaines de vie (et les autres étant bactéries connues et Eukarya), anciennement appelé archaebacteria sous le taxon Bactérie. Mais à présent considéré séparés et distincts. Se caractérisent par : (1) la présence de caractéristiques tRNAs et RNAS ribosomales ; (2) l ’ absence de paroi cellulaire peptidoglycane ; (3) la présence de ether-linked lipides construit de branched-chain sous-unités ; et (4) leur survenue dans d'étranges habitats. Pendant que archaea ressemblent à des bactéries dans la morphologie et organisation génomique ressemblent-ils à eukarya dans leur mode de la réplication génétique. Le domaine contient au moins quatre royaumes : CRENARCHAEOTA ; EURYARCHAEOTA ; NANOARCHAEOTA ; et KORARCHAEOTA.
Rudiviridae
Famille de virus à ADN des bacilles infectant Archaea, manquent enveloppes virale ou des lipides.
Chromosome Archéen
Arn Archéal
Génome Archéal
Le complément génétique d'un organisme Archaeal (Archaea) représenté dans son ADN.
Bactéries
Données Séquence Moléculaire
Acide aminé, spécifique des descriptions de glucides, ou les séquences nucléotides apparues dans la littérature et / ou se déposent dans et maintenu par bases de données tels que la banque de gènes GenBank, européen (EMBL laboratoire de biologie moléculaire), la Fondation de Recherche Biomedical (NBRF) ou une autre séquence référentiels.
Hot Temperature
Présence de chaleur ou de la chaleur ou de la température notablement plus élevés qu'un habitué norme.
Stabilité Enzyme
Sulfolobaceae
Une famille de SULFOLOBALES composée de aérobie ou anaérobie ou Facultatively Chemolithotrophic Gram-positif, survenant généralement individuellement. Elles poussent mieux à un pH d'environ 2.
Séquence Des Acides Aminés
L'ordre des acides aminés comme ils ont lieu dans une chaine polypeptidique, appelle ça le principal structure des protéines. C'est un enjeu capital pour déterminer leur structure des protéines.
Sulfolobale
Un ordre de CRENARCHAEOTA composée de aérobic ou Facultatively aérobic. sa Chemolithotrophic Gram-positif qui sont extrêmes, manquent thermoacidophiles peptidoglycane dans leur paroi cellulaire.
Crenarchaeota
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats
Thermoplasma
Un genre de Facultatively heterotrophic anaérobie archaebactéries, dans l'ordre THERMOPLASMALES self-heating refuse de charbon, isolé de l'acide des piles et des sources chaudes. Ils sont thermophiles et peuvent faire pousser les deux avec et sans le soufre.
Spécificité Selon Substrat
Température
La propriété d'objets qui détermine la direction de chaleur coulent quand elles sont placées dans contact thermique direct. La température est de l'énergie de motions microscopiques et invariances transitionnelles) (vibration des particules d'atomes.
Dna Polymerase Beta
Séquence Nucléotidique
La séquence des purines et PYRIMIDINES dans les acides nucléiques et polynucleotides. On l'appelle aussi séquence nucléotidique.
Bactéries
Un des trois domaines de vie (et les autres étant Eukarya et Archaea), également appelé facteur D'unicellulaires Eubacteria. Ils sont généralement posséder micro-organismes présents dans la paroi des cellules rigide, multiplier par la division cellulaire, et présentent trois grandes formes : Ronde ou coccal, rodlike ou Bacillary, et - Torsadée ou spirochetal. Les bactéries peuvent être classés en fonction de leur réponse à oxygène : Aérobique, anaérobique, ou anaérobie Facultatively. À la mode par lesquels elles obtenir leur énergie : Chemotrophy (via réaction chimique) ou PHOTOTROPHY (via lumière réaction) ; pour chemotrophs par leur source d'énergie chimique : CHEMOLITHOTROPHY (de la matière minérale) ou chemoorganotrophy (de composés organiques), et par leur source pour CARBON ; azote ; etc. ; HETEROTROPHY (provenant de sources) organique ou AUTOTROPHY (de CARBON de titane). Ils peuvent aussi être classée par si oui ou non ils tachent (basée sur la structure de leur cellule murs) avec cristal VIOLET teinture : Gram ou les.
Alignement Séquences
L'arrangement de deux ou plusieurs séquences venant de base acide aminé ou un organisme ou organismes de manière à aligner zones séquences partager propriétés communes. Le degré de parenté entre les séquences ou homologie est prédite statistiquement impossible par ou sur la base de pondérations attribuées aux éléments alignés entre les séquences. Cette évolution peut constituer un indicateur potentiel de la parenté génétique entre les organismes.
Homologie Séquentielle Acides Aminés
Cristallographie Rayons X
Modèle Moléculaire
Phosphoric Triester Hydrolases
La classe des enzymes qui catalysent l ’ hydrolyse d ’ une des trois ester phosphotriester-containing obligations d'une enceinte.
Escherichia Coli
Une espèce de bêta-lactamases, Facultatively bactéries anaérobies, des bacilles (anaérobies à Gram-négatif) Facultatively tiges généralement trouvé dans la partie basse de l'intestin de les animaux à sang chaud. C'est habituellement nonpathogenic, mais certaines souches sont connues pour entraîner des infections pyogène. Pathogène DIARRHEA et souches (virotypes) sont classés par des mécanismes pathogène telles que Escherichia coli entérotoxinogène (toxines), etc.
Glucose 1-Dehydrogenase
Le glucose déshydrogénase qui catalyse l ’ oxydation du beta-D-glucose pour former D-glucono-1,5-lactone, en utilisant NAD ainsi que NADP comme un coenzyme.
Clonage Moléculaire
L'insertion de l ’ ADN recombinant les molécules de facteur D'et / ou eucaryotes sources dans un véhicule, tels qu ’ une réplication génétique ou virus vecteur, et l 'introduction de l ’ hybride molécules dans receveur cellules sans altérer la viabilité de ces cellules.
Lipothrixviridae
Famille de enveloppé, lipid-containing 2 ADN, un virus qui infecte Archaea.
Ph
La normalité de la solution par rapport à l'eau ; les ions H +. C'est lié à acidité mesures dans la plupart des cas par pH = log [1 / 1 / 2 (H +)], où (H +) est la concentration d'ions d'hydrogène équivalents en gramme par litre de solution. (Dictionnaire de McGraw-Hill Terms scientifique et technique, 6e éditeur)
Conformation Protéine
La caractéristique en 3 dimensions forme d'une protéine, dont les critères secondaires, tertiaires supersecondary (motifs), (domaine) et la chaîne peptidique quaternaire structure de la structure des protéines, quaternaire décrit la configuration assumée par multimeric protéines (agrégats de plus d'une chaîne de polypeptide).
CRISPR-Associated Proteins
Des composants protéinés CRISPR-CAS NATIONAUX pour de la défense antiviral dans Archaea et bactéries connues. Voici des protéines qui remplissent diverses fonctions pendant la création et l'expansion du CRISPR transducteurs, la capture de nouveau CRISPR spacers, Biogenèse de LES PETITS INTERFERING (ARN CRISPR ou crRNAs) et le ciblage et faire taire d'envahir des virus et à des plasmides. Ils incluent Hélicase ; RNA-BINDING PROTEINS ; Endonucleases ; et l'ARN et ADN polymérases.
Ferredoxine
Haloferax
Nucléotide Désoxycytidylique
Cristallisation
Cytochromes De Type A
Protéines Recombinaison
Protéines préparé par la technique de l ’ ADN recombinant.
Catalyse
Glyceryl Ethers
Acidianus
Un genre de Facultatively coccoid anaérobie Archaea, dans la famille SULFOLOBACEAE. Cellules sont hautement de forme irrégulière et thermoacidophilic. Lithotrophic croissance repartira aérobiquement via soufre oxydation chez certaines espèces. Distribution inclut solfataric ressorts et les champs, trou, et les acides geothermically chauffée.
Ferrosulfoprotéines
Glycogen Debranching Enzyme System
1,4-alpha-D-Glucan-1,4-alpha-D-glucan 4-alpha-D-glucosyltransferase / dextrine 6 alpha-D-glucanohydrolase avoir tous les deux. Un système enzymatique 4-alpha-glucanotransferase 2.4.1.25 (CE) et (CE) activités amylo-1,6-glucosidase 3.2.1.33. Comme un transférase elle transfère un segment de un à un nouveau 1,4-alpha-D-glucan 4-position dans une acceptor, qui peut être du glucose ou un autre 1,4-alpha-D-glucan. En tant qu'il y a catalyse l ’ alpha-glucosidase 1,6-alpha-D-glucoside le endohydrolysis de liens aux points de diversification 1,4-linked alpha-D-glucose les chaînes de résidus. Amylo-1,6-glucosidase activité est déficient en glycogen storage disease type III.
Gènes Bactériens
The functional héréditaire unités de bactéries connues.
Cadre Lecture Ouvert
Une séquence de nucléotide successives triplets qui sont lues comme codons précisant AMINO ACIDS et commencer un déclencheur codon et fin avec un arrêt codon (codon, TERMINATOR).
Ribosome Subunits, Large, Archaeal
Dna-Directed Dna Polymérase
L'ADN polymérases trouvé entre les bactéries, cellules animales et végétales. Pendant la réplication processus, ces enzymes catalyser l'ajout de résidus désoxyribonucléotidique jusqu'au bout d'un brin d'ADN en présence d'ADN que template-primer. Ils ont aussi exonuclease activité et par conséquent fonctionner en réparation d'ADN.
Aldéhyde-Lyases
Structure Quaternaire Protéine
Soufre
Liaison
Ribosome Subunits, Small, Archaeal
Acide Tétrathionique
CRISPR-Cas Systems
Mécanismes de défense antiviral adaptative dans archaea et les bactéries, basé sur l'ADN viral répéter appelé agglutinés REGULARLY Interspaced BREF palindromic répète (CRISPR éléments) cette fonction conjointement avec CRISPR-ASSOCIATED PROTEINS (Cas protéines). Plusieurs types ont été distingués, y compris de type I, II et Type Type III, sur la base des motifs de signature CRISPR-ASSOCIATED PROTEINS.
Résonance Paramagnétique
Une technique applicable à la grande variété de substances lesquelles présentent paramagnetism magnétique à cause des moments d'électrons qui ne sont pas en couple. Le spectre sont utiles pour la détection et identification, pour déterminer la électron structure, de l'étude d'interactions entre les molécules, et pour le dosage de nucléaire tourne et quelques instants de McGraw-Hill. (Encyclopedia de Science et Technologie, 7 e édition) Electron double résonance nucléaire (ENDOR) la spectroscopie est une variante de la technique qui peut offrir une résolution. Analyse par résonance spin de l'électron peut être utiliser in vivo, y compris des applications imagerie tels que MAGNETIC RESONANCE IMAGING.
Electrophoresis, Polyacrylamide Gel
Protéine Régulatrice
Un leucine et DNA-Binding protéine qui est retrouvé principalement dans bactéries connues et Archaea. Il régule GENETIC transcription impliqué dans le métabolisme de AMINO ACIDS en réponse à l'augmentation du taux de la leucine.
Alpha-Glucosidase
Site Fixation
Conformation Acide Nucléique
Facteurs D'Initiation Procaryote
Holliday Junction Resolvases
Spermidine Synthase
Une enzyme qui catalyse le transfert de la fraction propylamine de 5 '-deoxy-5' -S- (3-methylthiopropylamine) sulfonium adénosine à putrescine spermidine. Dans la biosynthèse de l ’ enzyme a un poids moléculaire d ’ environ 73 000 kDa et se compose de deux sous-unités de taille similaire.
Acide Orotique
L'acide orotique est un composé intermédiaire dans la biosynthèse des pyrimidines, qui peut s'accumuler en excès dans l'organisme en raison de troubles génétiques ou d'une carence en certaines enzymes, entraînant une acidurie orotique, une condition pouvant provoquer des anomalies congénitales et des problèmes rénaux.
Dextrine
Motifs Hélice Tour Hélice
La première DNA-Binding protéine motif d'être reconnu. Helix-turn-helix motifs ont été identifiés dans les protéines mais bactérienne ont depuis été trouvé dans des centaines de DNA-Binding PROTEINS des deux eukaryotes et ils sont construits à partir des procaryotes. Deux hélices alpha alpha reliées par une courte chaîne prolongée des acides aminés qui constituent le "tour." Les deux hélices soient détenus à un angle, principalement par les interactions entre les deux hélice. (De Alberts et al., biologie moléculaire de la 3D Cell, Ed, p408-9)
Dimérisation
Arn Ribosomique 23S
Methanococcales
Un ordre de methanogens anaérobies dans le royaume EURYARCHAEOTA. Ils sont pseudosarcina, coccoid ou rengainées joue un bâtonnet et parahydroxybenzoate de groupes. La paroi cellulaire se compose de protéine. L'ordre inclut une famille, METHANOCOCCACEAE. (De manuel d'Bergey of Systemic la Bactériologie, 1989)
Tétraméthyl Phénylènediamine
Structure Tertiaire Protéine
Le niveau de structure protéique dans lesquels les associations de structures (protéine secondaire hélice alpha, bêta draps, boucle régions, et motifs) ensemble pour former plié formes appelé domaines : Disulfures des ponts entre cysteines dans deux différentes parties de la chaine polypeptidique avec autres interactions entre les chaînes jouer un rôle dans la formation et stabilisation des protéines habituellement tertiaire. Petite structure consistent en un seul domaine, mais plus grande protéines peut contenir un certain nombre de domaines liés par les segments de chaine polypeptidique peu structure secondaire habituel.
Détermination Séquence Adn
Protéines Fixant Adn
Plasmides
Extrachromosomal, généralement CIRCULAR des molécules d'ADN qui sont transférables autoréplication et d'un organisme à un autre. Ils sont présentés dans diverses Archéal bactériennes, fongiques, et des algues, espèces de plantes. Elles sont utilisées en ingénierie CLONING GENETIC comme des vecteurs.
Malate Synthase
Un important acide glyoxylic enzyme du cycle qui catalyse la synthèse de façon réversible L-malate de acetyl-CoA et glyoxylate. Cette enzyme était anciennement listé comme CE 4.1.3.2.
Diffraction Des Rayons X
La suite d'radios par problème, plus particulièrement cristaux, associée à une variation de l'intensité due à une interférence secondaires. Analyse de la structure en cristal de matériaux est réalisée par le passage à travers eux et radios enregistrer l'image de la diffraction des rayons (cristallographie RAYONS X). (De McGraw-Hill Dictionary of Terms scientifique et technique, 4e éditeur)
Protéines Bactériennes
Protéines trouvé dans aucune des espèces de bactéries.
Acid Anhydride Hydrolases
Un groupe d'enzymes qui catalysent l ’ hydrolyse de diphosphate bonds in composés tels que inhibiteurs nucléosidiques di- et tri-phosphates et sulfonyl-containing anhydre comme adenylylsulfate. (Enzyme nomenclature, 1992) CE 3,6.
Glucose Dehydrogenases
D-glucose : 1-oxidoreductases. Catalyse l ’ oxydation du D-glucose à D-glucono-gamma-lactone et réduite acceptor. Aucun acceptor sauf la molécule d ’ oxygène est permis. Inclut CE 1.1.1.47 ; CE 1.1.1.118 ; CE 1.1.1.119 et CE 1.1.99.10.
Facteurs De Transcription De La Famille Winged-Helix
Adenosine Triphosphatases
Un groupe d'enzymes hydrolyse catalyser la réaction d'ATP. L'hydrolyse est habituellement de pair avec une autre fonction comme transporter Ca (2 +) sur une membrane. Ces enzymes peut dépendre de Ca (2 +) Mg (2 +), les anions, H +, ou l'ADN.
Famille Multigénique
Un ensemble de gènes descendu reprographie et de variation du gène ancestrale. Si les gènes peuvent être concentrés ensemble sur le même chromosome ou dispersés sur vos chromosomes. Exemples de multigene familles comprennent ceux qui utilisent hémoglobine, les immunoglobulines, histocompatibility Antigens, actins, tubulins, keratins, collagène, chaleur choc protéines, hypersécrétion colle protéines, des protéines chorion protéines cuticule phaseolins protéines, des œufs, et, ainsi que histones, l ’ ARN ribosomal et transfert ARN gènes. Cette dernière a réaffirmé trois sont des exemples de gènes, où des centaines de mêmes gênes sont présents dans un tandem. (King & Stanfield, Un Dictionary of Genetics, 4ème éditeur)
Homologie Séquentielle Acide Nucléique
La correspondance successives de nucléoides acides nucléiques dans une molécule avec ceux d'une autre molécule. Homologie de séquence d ’ acide nucléique est une indication de la parenté génétique d'organismes différents et Gene.
Coenzymes
De petites molécules qui sont requis pour le catalyseur de la fonction des enzymes. Plusieurs VITAMINS sont des coenzymes.
Acides
Composés chimiques qui cède ions d'hydrogène ou protons quand dissous dans l'eau, dont l'hydrogène peut être remplacé par les métaux et radicaux de base, ou qui réagissent avec bases pour former le sel et d ’ eau (neutralisation). Une extension de visant substances dissoutes dans les médias autre que l'eau. (Grant & Hackh est Chemical Dictionary, 5ème e)
Toxines Biologiques
Dichroisme Circulaire
Thermodynamique
Une analyse mathématique rigoureusement d'énergie relations (chaleur, travail, de la température et équilibre). Il décrit systèmes dont les états sont déterminées par les paramètres thermique, tels que la température corporelle, en plus de mécanique et les paramètres électromagnétique. (De Hawley est tronquée Chemical Dictionary, 12e éditeur)
Adn Bactérien
L'acide désoxyribonucléique qui fait le matériel génétique des bactéries.
Oxydoréduction
Une réaction chimique dans lequel une électron est transféré d'une molécule à l'autre. La molécule est le electron-donating réduisant agent ou electron-accepting reductant ; la molécule est l'agent oxydant ou oxydant. La réduction et le fonctionnement des agents oxydant reductant-oxidant conjugué paires ou redox paires (Lehninger, Principes de biochimie, 1982, p471).
Motifs Acides Aminés
Le niveau de structure protéique au cours de laquelle contiguë hydrogen-bond interactions dans les périodes de chaine polypeptidique susciter des brins d'hélices alpha alpha, bêta (qui s'alignent pour former beta draps) ou d ’ autres types de bobines. C'est la première plier niveau de protéine une telle conformation.
Bêta-Glucosidase
Adn
Un polymère qui est le principal désoxyribonucléotidique matériel génétique des cellules eucaryotes. Et facteur D'organismes contiennent l'ADN bicaténaire normalement dans un état, mais plusieurs grandes régions monobrin implique des procédés biologiques initialement réparti. ADN, qui consiste en un pilier polysugar-phosphate possédant des projections des purines (adénine et thymine pyrimidines (guanine) et et cytosine), formes une double hélice qui doit être maintenue par liaisons hydrogène entre ces purines et en thymine et adénine pyrimidines (guanine à cytosine).
Empreinte Adn
Une méthode pour déterminer la séquence spécificité de protéines DNA-Binding. ADN footprinting utilise une ADN néfaste (soit un agent réactif chimique ou une nucléase) qui pourfend l'ADN sur chaque paire de base. ADN décolleté est inhibé où le ligand se lie à l'ADN. (De Rieger et al., Glossaire de Genetics : Classique et Molecular, 5ème e)
Transcription Génétique
Dénaturation Protéine
Purine Nucléoside Phosphorylase
Une enzyme qui catalyse la réaction entre... et un antimétabolite nucléoside purique Orthophosphate pour former une libre plus ribose-5-phosphate. CE 2.4.2.1.
Homologie Séquentielle
Domaine Catalytique
Mutation
Maltose
Facteurs
Les facteurs à utiliser l'énergie de l ’ hydrolyse de Gtp au PIB pour l ’ élongation de la chaîne peptidique. CE 3.6.1.-.
Dna Topoisomérases Type I
DNA Topoisomérases ATP-independent qui catalysent cassure de l'un des deux brins d'ADN, passage de l'incassable cheveu dans la pause, de la fracture ou réintégré brin. DNA Topoisomérases Type I moulent enzymes réduire le stress dans la structure d'ADN en relâchant les anneaux Superhelical tourne et noué dans l'ADN hélice.
Minichromosome Maintenance 1 Protein
Un sequence-specific DNA-Binding protéine qui joue un rôle essentiel comme le régulateur de levure contrôle du cycle cellulaire. Il contient un acide aminé 56 MADS-box domaine... sous le N-terminal de la protéine et est un des quatre fondateur des protéines qui structurellement définir la superfamille de domaine PROTEINS un Mads.
Facteur 1
Peptide élongation multisubunit facteur 1 est une protéine qui est responsable de la liaison de aminoacyl-tRNAs GTP-dependent ribosomes. Eucaryotes de la sous-unité alpha se lie l ’ aminoacil-tARN (EF-1alpha) et la transfert vers les ribosome dans un processus lié à Gtp une hydrolyse. Les Beta et Delta sous-unités (EF-1beta, EF-1delta) sont impliqués dans l 'échange PIB pour Gtp. La sous-unité gamma (EF-1gamma) est un composant structurel.
Alcohol Dehydrogenase
Un enzyme oxyder zinc-containing primaires et secondaires hemiacetals alcools ou en présence de NAD. En alcoolique fermentation, il y a catalyse la dernière étape de réduire un aldéhyde en un dérivé alcool en présence de Nadh et hydrogène.
Origine Réplication
Une séquence ADN d'un unique replicon auquel ADN REPLICATION est initié et recettes bidirectionally ou unidirectionally. Il contient les sites où la première séparation des brins complémentaires survient, un apprêt ARN est fabriqué, et le switch d ’ ARN-VHC à la synthèse ADN apprêt a lieu. (Rieger et al., Glossaire de Genetics : Classique et Molecular, 5ème e)
Adénosine Triphosphate
Un adénine nucléotidiques contenant trois groupes de phosphate dans le sucre Esterified azotée. Outre son rôle crucial dans le métabolisme adénosine triphosphate est un neurotransmetteur.
Nucléotide
Pyrococcus Furiosus
Microanalyse Par Sonde
Les radios ont par spectrométrie de masse de fluorescente, c 'est-à-dire radios émise après bombarder problème des particules de haute énergie tels que les protons ; électrons passent ; ou plus d'énergie des radios. Identification de JURIDIQUES par cette technique est basée sur le type précis de radios qui sont émis qui sont caractéristiques des éléments spécifiques dans le matériau analysés. La caractéristique radios sont distingués et / ou quantifiées par longueur d'onde dispersive ou énergie dispersive méthodes.
Chromatographie Gel
Complexe Iii De La Chaîne Respiratoire Mitochondriale
Multisubunit qui contient un complexe enzymatique du cytochrome B groupe ; cytochrome C1 ; et centres iron-sulfur. Il y a catalyse l ’ oxydation du ubiquinol à ubiquinone ", et au transfert des électrons à cytochrome C. Dans mitochondries la réaction redox est accroché au transport de protons à travers la membrane mitochondriale intérieure.
Sous-Unités Protéine
Célibataire chaînes d'acides aminés dont sont les unités de multimeric PROTEINS. Multimeric protéines peuvent être composé de sous-unités identiques ou non-jumelle. Un ou plusieurs protéines Monomériques sous-unités peut composer une sous-unité protomer qui est une structure d'une plus grande assemblée.
Methanococcus
Opéron
Succinate Dehydrogenase
Un contenant oxidoreductase flavoprotein qui catalyse le déshydrogénation de disodium à disoproxil. Dans la plupart des organismes eucaryotes cette enzyme est un composant de transport d'électrons des mitochondries complexe II.