Ubiquitin-Protein Ligases
Une classe d'enzymes, qui interagissent avec les substrats des enzymes et protéine UBIQUITIN-CONJUGATING ubiquitination-specific. Chaque membre de cette enzyme a sa propre groupe spécificité pour un substrat et ubiquitin-conjugating enzyme. Ubiquitin-protein Ligases existent comme tous les deux protéines protéines Monomériques multiprotein complexes.
Ligases
La classe des enzymes qui catalyser la formation d'un lien entre deux substrat molécules, conjugué à l ’ hydrolyse d ’ un lien dans Pyrophosphate ATP ou un donneur d'énergie similaire, 28e Dorland. (Éditeur) CE 6.
Endosomal Sorting Complexes Required for Transport
Un ensemble de protéine subcomplexes impliqué dans des protéines SORTING de Ubiquitinated PROTEINS dans intraluminal MULTIVESICULAR vésicules de corps et dans des membranes noyau benzisoxazole pendant la formation de vésicules intraluminal, pendant l'étape finale de CYTOKINESIS, et pendant les bourgeons des virus enveloppés ESCRT. Les machines se compose de la protéine produits de classe E protéine vacuolar tri gènes.
Ubiquitin-Conjugating Enzymes
La classe des enzymes qui forment un lien avec thioester UBIQUITIN avec l'aide de UBIQUITIN-ACTIVATING d'enzymes... ils transfèrent ubiquitin de la lysine d'un substrat de protéine avec l'aide de UBIQUITIN-PROTEIN Ligases.
Ubiquitin-Protein Ligase Complexes
Des complexes d'enzymes qui enclencher le attachment of covalente UBIQUITIN aux autres protéines en formant une liaison peptidique entre les propeptide C-terminal glycine de alpha-amino UBIQUITIN et les groupes de lysine les résidus dans la protéine. Les complexes jouent un rôle important dans son selective-degradation de courte durée et des protéines anormales. Le complexe enzymatique peut être divisé en trois composantes qui impliquent d'activation de UBIQUITIN-ACTIVATING), des enzymes ubiquitin (conjugaison de ubiquitin au ligase complexes d'enzymes... (UBIQUITIN-CONJUGATING) et de ligature ubiquitin au substrat protéine (UBIQUITIN-PROTEIN Ligases).
Ubiquitines
Une famille de protéines structurally-related à ubiquitine. Ubiquitines et protéines ubiquitin-like participer à diverses fonctions cellulaires, tels que la dégradation de protéine et Heat-Shock RÉPONSE, conjuguée aux autres protéines.
Ubiquitine
Un acide 76-amino hautement conservée peptide universellement trouvé dans les cellules eucaryotes qui fonctionne comme un marqueur pour protéines intracellulaires TRANSPORTER and degradation. Ubiquitine est activé par une série de compliqué étapes et forme une caution pour isopeptide lysine résidu de protéines spécifiques dans la cellule, ces "Ubiquitinated" protéines peuvent être reconnu et dégradé par proteosomes ou être transportée à certains compartiments au sein de la cellule.
Séquence Des Acides Aminés
Données Séquence Moléculaire
Acide aminé, spécifique des descriptions de glucides, ou les séquences nucléotides apparues dans la littérature et / ou se déposent dans et maintenu par bases de données tels que la banque de gènes GenBank, européen (EMBL laboratoire de biologie moléculaire), la Fondation de Recherche Biomedical (NBRF) ou une autre séquence référentiels.
Homologie Séquentielle Acides Aminés
Le degré de similitude entre séquences d'acides aminés. Cette information est utile pour l'analyse de protéines parenté génétique et l'espèce.
Dna Ligases
Poly (désoxyribonucléotidique) : Copolymère de poly (désoxyribonucléotidique) Ligases. Enzymes qui catalyser la fusion de preformed phosphodiester en désoxyribonucléotides lien du processus génétique pendant pendant réparation d'un monobrin entrer duplex ADN. La classe inclut les CE 6.5.1.1 (Atp) et CE 6.5.1.2 (NAD).
Skp Cullin F-Box Protein Ligases
Un sous-ensemble de ubiquitin protéine Ligases formées par l'association d'un domaine Skp Cullin un domaine des protéines, des protéines et une des protéines F-Box domaine.
Protéines Cullin
Une famille de structurellement apparenté des protéines qui avaient été initialement découvert pour leur rôle dans la régulation du cycle cellulaire dans CAENORHABDITIS Elegans. Ils jouent également un rôle important dans la régulation de la cellule synchronise et dans les thérapies UBIQUITIN-PROTEIN Ligases.
Ubiquitin-Activating Enzymes
La classe des enzymes qui catalyse la formation d'une Atp-Dependent thioester lien entre elle-même et UBIQUITIN on transfère l'activé ubiquitin à un des UBIQUITIN-PROTEIN Ligases.
Ubiquitination
L'acte de ligature UBIQUITINS à PROTEINS ubiquitin-protein ligase pour former des complexes d'étiqueter protéines pour le transport au Proteasome Endopeptidase complexe où la protéolyse survient.
Proteasome Endopeptidase Complex
Un grand multisubunit complexe qui joue un rôle important dans la dégradation de la plupart des protéines et cytosolique nucléaire dans les cellules eucaryotes. Il contient un 700-kDa sub-complex catalytique et deux 700-kDa sub-complexes réglementaires. Le complexe digère Ubiquitinated protéines et protéine activation antizyme ornithine décarboxylase.
Protéines Du Proto-Oncogène C-Cbl
Polyubiquitine
Un oligomer formées par les liens entre ces répétitif propeptide C-terminal glycine d'une molécule UBIQUITIN isopeptide via une attachée à un lysine résidu sur une seconde ubiquitin molécule. C'est structurellement différent de UBIQUITIN C, qui est une protéine unique contenant une tandemly liguées ubiquitin peptide séquence.
Liaison
Protéines Saccharomyces Cerevisiae
Espèce de protéines Saccharomyces cerevisiae. La fonction de protéines spécifiques de cet organisme font l 'objet d' un intérêt scientifique et ont été utilisés pour obtenir compréhension basique du fonctionnement protéines semblables à fortes eukaryotes.
Structure Tertiaire Protéine
Le niveau de structure protéique dans lesquels les associations de structures (protéine secondaire hélice alpha, bêta draps, boucle régions, et motifs) ensemble pour former plié formes appelé domaines : Disulfures des ponts entre cysteines dans deux différentes parties de la chaine polypeptidique avec autres interactions entre les chaînes jouer un rôle dans la formation et stabilisation des protéines habituellement tertiaire. Petite structure consistent en un seul domaine, mais plus grande protéines peut contenir un certain nombre de domaines liés par les segments de chaine polypeptidique peu structure secondaire habituel.
Cysteine Endopeptidases
Cysteine Endopeptidases qui ont une impliquées dans le processus catalytique. Ce groupe d ’ enzymes est DE LA SEROTONINE cystéine protéase tels que Cystatines et SULFHYDRYL réactifs.
Syndrome D'Angelman
Un syndrome caractérisé par de multiples anormalités, et un retard mental, troubles du mouvement. Cadeau crâne et sont généralement d ’ autres anomalies, des spasmes infantiles (spasmes, INFANTILE) ; facilement provoquable et de rires paroxysmes prolongé (par conséquent, "Happy") ; séché puppetlike mouvements (par conséquent, "chou") ; continue retards langue protrusion ; moteur ; ataxie, hypotonie ; et un drôle de faciès. Elle est associée à la mère de son chromosome suppressions 15q11-13 et autres anomalies génétiques. (De Am J Med Genet déc. 1998 4 ; 80 (4) : 385-90 ; Hum Mol Genet 1999 Jan ; 8, paragraphe 1 : 129-35)
Polynucleotide Ligases
Réticulocytes
Les érythrocytes. Immatures chez l'homme, ce sont des cellules de la lignée érythrocytaire extrudé qui ont subi de leur cellule noyau. Ils contiennent encore des organites progressivement que diminution du nombre de cellules matures. Ribosomes de disparaître. Certaines composantes techniques de coloration cause dans les ribosomes aggraver caractéristique "endoplasmique" (pas la même chose que les Endoplasmic Reticulum), d'où le nom réticulocytes.
Motifs Acides Aminés
Fréquemment observés composantes structurelles de protéines formé par simple associations des structures secondaire fréquemment observés. Un composé d 'une structure peut être conservé séquence qui peut être représenté par un CONSENSUS séquence.
Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome
Un E3 ubiquitin ligase principalement impliqué dans la régulation de la transition metaphase-to-anaphase pendant la mitose par Ubiquitination PROTEINS. Cellule spécifique de l ’ activité enzymatique LES est étroitement régulée par sous-unités et co- facteurs qui modulent activation, l ’ inhibition, et un substrat spécificité. Le Anaphase-Promoting complexe, ou APC-C, est également impliquée dans la différenciation des tissus dans le placenta, LENS cristalline, et squeletique muscle, et dans la régulation de la plasticité neuronale postmitotic et être émotive.
Mutation
Complexes Multienzyme
Systèmes de la fonction enzymes catalysant séquentiellement par des réactions consécutives métaboliques liées par des intermédiaires. Elles peuvent entraîner simplement un transfert de molécules d'eau ou les atomes d'hydrogène et peut être associée à de grandes structures supramolecular tels que mitochondries ou les ribosomes.
Saccharomyces Cerevisiae
Ubiquitin Thiolesterase
RING Finger Domains
Un domaine zinc-binding définies par la séquence Cysteine-X2-Cysteine-X (9-39) -Cysteine-X (L-3) -His-X (2-3) (x) -Cysteine-X2-Cysteine -Cysteine-X2-Cysteine 4-48 où X est un acide aminé. La bague doigt motif lie deux atomes de zinc, avec chaque atome zinc ligaturé tetrahedrally par chacune des trois ou quatre cysteines cysteines et un histidine. Le motif aussi devient une structure unitaire ´ cross-brace région et est présent dans plusieurs protéines qui sont impliqués dans protein-protein interactions. L'acronyme bague représente très intéressant New Gene.
Spécificité Selon Substrat
Apc3 Subunit, Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome
Une évolution de la sous-unité conservée hautement complexe (Anaphase-Promoting APC-C) contenant plusieurs 34-amino-acid tetratricopeptide se répète. Ces domaines, également trouvés dans la PCA sous-unités 6, 7 et 8 a été démontré que les interactions protein-protein médiation, suggérant que Apc3 peuvent aider à coordonner la juxtaposition de la reconnaissance et substrat catalytique module sous-unités co-activators et APC-C par rapport à l ’ angiotensine.
Apc10 Subunit, Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome
Epithelial Sodium Channels
Techniques Double Hybride
Techniques de détection développée sur levure pour identifier les gènes codant pour interagir protéines. Variations sont utilisés pour évaluer l'interaction entre les protéines et d'autres molécules. Two-hybrid techniques se réfèrent à une analyse pour protein-protein interactions, one-hybrid pour DNA-protein interactions, three-hybrid interactions pour RNA-protein interaction ou ligand-based interactions. Inverser n-hybrid techniques se réfèrent à une analyse concernant les mutations ou d'autres petites molécules dissociant d ’ interactions connues.
Protéines De Transport
Les protéines de transport qui transportent spécifiquement des substances dans le sang ou à travers la membrane cellulaire.
Protéines De Transport De Nucléotides
Lysine
Rna Ligase (Atp)
Protéines De Liaison Du Calcium
Protéines auquel des ions calcium sont liés. Ils peuvent agir comme des protéines de transport, régulateur des protéines activateur. Ils contiennent typiquement EF main MOTIFS.
Protéines De Fusion Recombinantes
Recombinant GENETIC Ia traduction des protéines produites par les gènes de fusion sont formés par l'association de l'acide nucléique RÉGLEMENTATION un ou plusieurs des séquences de gènes avec la protéine séquences ADN de un ou plusieurs gènes.
Cellules Hela
Protéines Cycle Cellulaire
Protéines qui contrôlent la cellule Division synchronise. Cette famille de protéines inclut un large choix de classes, y compris CYCLIN-DEPENDENT kinases activées par des kinases cyclines et Phosphoprotein Phosphatases ainsi que leurs substrats putatif tels que des protéines chromatin-associated CYTOSKELETAL PROTEINS, et la transcription FACTEURS.
Protéines Nucléaires
Protéines dans le noyau d'une cellule. Ne pas confondre avec NUCLEOPROTEINS qui sont des protéines conjugué avec les acides nucléiques, qui ne sont pas nécessairement présent dans le noyau.
Protéine Xiap
Peptide Hydrolases
Peptide Hydrolases que spécifiquement trouvé dans les obligations et peptides PROTEINS. Exemples de sub-subclasses pour ce groupe inclure EXOPEPTIDASES et Endopeptidases.
Site Fixation
Protéines F-Box
Une famille de protéines F-Box qui empruntent la MOTIF and are involved in protein-protein interactions. Ils jouent un rôle important en cours de protéine ubiquition en voyant un grand nombre de substrats et associez dans SCF UBIQUITIN Ligase complexes. Ils sont détenus dans le complexe ubiquitin-ligase via la liaison de Skp domaine PROTEINS.
Modification Post-Traductionnelle Protéine
Aucun de diverses méthodes de dosage enzymatiques catalysé modifications post-translationnelles de peptides ou PROTEINS dans la cellule d'origine. Ces modifications concernent carboxylation ; hydroxylation ; acétylation ; phosphorylation ; méthylation ; glycosylation ; Ubiquitination, oxydation ; protéolyse ; et crosslinking et entraîner des modifications de poids moléculaire et analyse électrophorétique mobilité.
Protéines
Polypeptides linéaire qui se produisent par synthèse sur ribosomes et peuvent également être modifié, crosslinked, fendu ou assemblées de protéines complexe avec plusieurs sous-unités. La certaine séquence d'AMINO ACIDS détermine la forme prendra ce polypeptide, COMME pendant des protéines, et la fonction de la protéine.
Transfection
Glutathione Transférase
Endopeptidases
Une sous-catégorie de peptide Hydrolases le clivage des internes qui catalysent les peptides ou PROTEINS.
Alignement Séquences
L'arrangement de deux ou plusieurs séquences venant de base acide aminé ou un organisme ou organismes de manière à aligner zones séquences partager propriétés communes. Le degré de parenté entre les séquences ou homologie est prédite statistiquement impossible par ou sur la base de pondérations attribuées aux éléments alignés entre les séquences. Cette évolution peut constituer un indicateur potentiel de la parenté génétique entre les organismes.
Clonage Moléculaire
Canaux Sodiques
Les canaux ioniques qui permettent le passage d'ions. C'est une variété de formes polyarticulaires canaux sodiques spécifiques sont impliqués dans servir spécialisé comme clignotant neuronal CARDIAC contraction et calculs de la fonction.
Oryctolagus Cuniculus
L'espèce Oryctolagus cuniculus, dans la famille Leporidae, ordre LAGOMORPHA. Les lapins sont nés en Burrows, furless, et avec les yeux et oreilles fermé. En contraste avec des lièvres, les lapins ont chromosome 22 paires.
Plasmides
Extrachromosomal, généralement CIRCULAR des molécules d'ADN qui sont transférables autoréplication et d'un organisme à un autre. Ils sont présentés dans diverses Archéal bactériennes, fongiques, et des algues, espèces de plantes. Elles sont utilisées en ingénierie CLONING GENETIC comme des vecteurs.