LIM Domain Proteins
Una larga classe di proteine structurally-related che contengono uno o più LIM zinco dito. Molte delle proteine contenute in questa classe sono coinvolti in processi il segnale intracellulare e mediare i loro effetti attraverso LIM dominio LIM protein-protein interazioni. Il nome deriva dal primo tre proteine nel quale il simbolo è stato trovato: LIN-11, Isl1 e Mec-3.
LIM-Homeodomain Proteins
Zyxin
Una proteina fosforilata che si concentra a focali zinc-binding aderenze e lungo la actina citoscheletro. Zyxin ha un N-Terminal Proline-Rich dominio e tre settori nei suoi LIM C-terminale meta '.
Proteine Muscolari
Proteine Degli Omeodomini
Proteine Homeobox (GENI codificata da geni Homeobox) che mostra similarità strutturale ad alcuni DNA-Binding eucariotiche procariote e proteine. Homeodomain proteine sono coinvolte nel controllo dell ’ espressione genica durante la morfogenesi e lo sviluppo (Ehi REGOLAMENTO siano espressione... dello sviluppo).
Lim Kinases
Metalloproteine
Fattori Di Trascrizione
Proteine Adattatrici Trasducenti Il Segnale
Una delle categorie generali di proteine di trasporto che giocano un ruolo nella trasduzione del segnale. Di solito contiene diversi dominii modulari, ciascuno dei quali ha un proprio legame dell 'attività e agire formando un complesso scarsamente assorbibile con altre proteine Signal-transducing adattatore intracellular-signaling molecole. Perdita dell ’ attività enzimatica, tuttavia la loro attività può essere modulata da altri enzimi signal-transducing
Paxillina
E 'un segnale Paxillina transducing adattatore proteina che localizes di aderenze in attraverso quattro LIM. Viene fosforilazione in risposta a integrin-mediated CELLULARE aderenza, e interagisce con una varietà di proteine incluso VINCULIN; in adesione; proto-oncogene PROTEIN pp60 chinasi (C-Src); e proto-oncogene PROTEIN c-crk.
Proteine Del Citoscheletro
Struttura Terziaria Della Proteina
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.
Tecniche Del Sistema Del Doppio Ibrido
Proiezione tecniche sviluppate prima nei lieviti per identificare geni che codificano interagire proteine. Variazioni sono utilizzati per valutare interazione tra proteine e altre molecole. Two-hybrid tecniche di analisi per protein-protein interazioni, one-hybrid per DNA-protein interazioni, three-hybrid interazioni per RNA-protein interazioni o interazioni n-hybrid ligand-based. Tecniche di analisi per mutazioni o di altre piccole molecole che dissociarsi interazioni note.
Legame Di Proteine
Dati Di Sequenza Molecolare
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Sequenza Aminoacidica
Proteine E Peptidi Del Segnale Intracellulare
Proteine e peptidi che sono coinvolte nella trasduzione del segnale all'interno della cellula. Incluso qui sono peptidi e le proteine che regolano l ’ attività di Transcription FACTORS processi e cellulari in risposta ai segnali dalla superficie cellulare. Il segnale intracellulare peptide e le proteine può essere parte di un segnale enzimatica cascata o agire attraverso il legame e la modifica dell 'azione di altri fattori di segnalazione.
Proteine Leganti Dna
Proteine Di Trasporto
Omologia Di Sequenza Di Amino Acido
Proteine Di Fusione Ricombinanti
Siti Di Legame
Fas-Associated Death Domain Protein
Un adattatore signal-transducing proteina che frequenta dei recettori del TNF complessi. Contiene una morte effettrici dominio che possono interagire con la morte effettrici dominio trovato sul detonatore CASPASES come CASPASE CASPASE 8 e 10. L 'attivazione di CASPASES attraverso l' interazione con questa proteina riveste un ruolo nella cascata del segnale che porta a apoptosi.
Allineamento Di Sequenze
L'accordo di due o più sequenze di base aminoacido o un organismo o organismi in modo tale da allineare le aree di condividere le sequenze proprietà comuni. Il grado di relazione o omologia tra le sequenze prevista computationally o statisticamente basato su pesi attribuiti agli elementi allineati tra le sequenze. A sua volta questo puo 'servire da indicatore genetica potenziale relazione tra gli organismi.
Dita Di Zinco
I soggetti nei quali DNA- RNA-binding proteine e aminoacidi strutturali sono piegate in un unico gruppo intorno a un zinco atomo. Nel classico dito di zinco, zinco Atom è legato a due histidines cysteines e due, tra le cysteines e histidines sono 12 residui che si legano al DNA forma un dito. Da variazioni nella composizione delle sequenze in i polpastrelli e il numero e spazi tra ripetizioni di lato, zinco dita possono formare un numero ampio di sequenza diversi siti di legame specifico.
Sequenza Base
Clonaggio Molecolare
Protein Interaction Domains and Motifs
Proteina moduli con conservato ligand-binding superfici che mediare l ’ interazione specifica funzioni nella trasduzione del segnale le vie e vincolante specifica il luogo della loro adattarsi proteine che legano le sulfaniluree.
Dominio Di Omologia Con Il Gene Src
Regioni di amino acido nella sequenza somiglianza SRC-FAMILY delle protein-tirosin chinasi che si piegano in specifiche funzionali. La struttura terziaria SH1 dominio è un catalizzatore DOMINIO. SH2 e SH3 dominio sono piene di proteine interazione SH2 PHOSPHOTYROSINE-containing. Di solito si lega alle proteine plasmatiche e CYTOSKELETAL SH3 interagisce con le proteine.
Proteine Contenenti Domini Mads
Un superfamily di proteine che condividono un dominio conservato MADS sequenza MADS. Il termine si riferiscono alla prima quattro membri che erano MCM1 PROTEIN; AGAMOUS 1 PROTEIN; DEFICIENS PROTEIN; e siero risposta elemento. Molti MADS dominio proteine sono state trovate in specie di tutti i regni eucariotiche. Giocano un ruolo importante nello sviluppo, specialmente nelle piante dove hanno un ruolo importante in fiore.
Motivi Strutturali Degli Aminoacidi
Dna Complementare
Proteine Della Membrana
Proteine che si trovano nelle membrane cellulari compresi e le membrane intracellulari. Consistono di due tipi, proteine periferico e centrale e includono più Membrane-Associated enzimi, antigenico proteine, proteine di trasporto, e la droga, gli ormoni e Lectin recettori.
Mutazione
PDZ Domains
Proteina interazione dominio dei 70-90 per residui di aminoacidi, il nome di una struttura comune in PSD-95, Discs Large, e Zona Occludens 1 proteine. PDZ dominio sono coinvolti nel reclutamento e l 'interazione di proteine, e porteranno la formazione di proteine impalcature e reti del segnale. Un legame tra sequence-specific PDZ dominio in una proteina e un tema PDZ in un ’ altra proteina.
Trasduzione Del Segnale
Il trasferimento delle informazioni biologiche intracellulare (attivazione / inibizione) attraverso un segnale di trasduzione del segnale. In ogni sistema un'attivazione / inibizione segnale di una molecola ormone di differenziazione, biologicamente attivo (neurotrasmettitore) è mediato l'accoppiamento di un recettore / enzima per un secondo messaggero sistema o di trasduzione del segnale canale ionico. Gioca un ruolo importante nel attivando funzioni cellulari, cella differenziazione e la proliferazione cellulare. Esempi di trasduzione del segnale sistemi sono il canale ionico gamma-aminobutyric ACID-postsynaptic receptor-calcium mediato dal sistema, la via metabolica, l 'attivazione dei linfociti T e l'attivazione mediata dai recettori di membrana collegato a fosfolipasi. Quei depolarizzazione o rilascio intracellulare di calcio includono l' attivazione mediato citotossica sinaptici granulociti ed è un potenziamento dell ’ attivazione della protein-chinasi. Vie di trasduzione del segnale può essere una parte dei suoi vie di trasduzione del segnale; ad esempio, protein chinasi attivazione è parte del segnale di attivazione delle piastrine.
Conformazione Della Proteina
La caratteristica forma tridimensionale di una proteina, incluso il secondario, supersecondary (motivi), la terza quaternaria (dominio) e struttura della catena peptidica. Proteine quaternaria descrive la struttura, conferma assumed by multimeric proteine (aggregati di più di una catena polipeptidica).
Proteine Nucleari
Proteine Dei Microfilamenti
Proteine Monomeriche subunità di globulari principalmente actina e trovato nella matrice citoplasmatica di quasi tutte le cellule, sono spesso associati a microtubuli e possono svolgere un ruolo nella funzione cytoskeletal e / o mediare movimento del cellulare o il organelli all'interno della cellula.
Proteine Della Drosophila
Regolazione Dell'Espressione Genica Nello Sviluppo
Proteine Del Tessuto Nervoso
Le proteine del tessuto nervoso sono specifiche proteine presenti nel sistema nervoso centrale e periferico che svolgono ruoli strutturali, enzimatici, regolatori e di trasporto essenziali per la normale funzione nervosa.
Trasfezione
Mutagenesi Sito Diretta
Geni Homeobox
Geni che codificano altamente conservato Transcription FACTORS quel controllo identità posizionale delle cellule (corpo anomalo) e la morfogenesi. Le loro sequenze durante lo sviluppo di una sequenza di nucleotidi 180 designato il Homeobox, così chiamata perchè mutazioni di questi geni spesso porta al gene omeotico trasformazioni, in quale struttura corporea sostituisce un altro. Le proteine sono codificata da geni Homeobox Homeodomain proteine.
Repressori
Proteine che mantenere la transcriptional di specifici o uno stato di quiescenza GENI OPERONS repressiva classica DNA-Binding proteine sono proteine che vengono normalmente legato alla Signorina Laghi Operone, o di un antidepressivo SEQUENCES di gene si verifica fino a un segnale che provoca il rilascio.
Modelli Molecolari
Dimerizzazione
Sequenza Consenso
Un teorico della sequenza aminoacidica rappresentante nucleotide o in cui ciascuna nucleotide o dell 'aminoacido è quella che si manifestano più frequentemente in quel posto nelle diverse sequenze che si verificano in natura. La frase fa riferimento ad una vera sequenza, che equivale approssimativamente il consenso. Un noto CONSERVED sequenza set è rappresentata da un consenso sequenza. Comunemente osservate le strutture proteiche supersecondary (amino acido motivi) spesso si formano da conservato sequenze.
Struttura Secondaria Della Proteina
Actinina
Nucleo Cellulare
Entro una cellula eucariota, un corpo che contiene membrane-limited cromosomi ed uno o più nucleoli... Nucleolus). La membrana nucleare è costituito da un doppio unit-type membrana che e 'perforato da una serie di pori; turismo, continua con la membrana ENDOPLASMIC Reticulum, una cellula può contenere più di un nucleo. (Dal Singleton & Sainsbury, microbiologia Dictionary of e biologia, secondo Ed)
Sequenza Conservata
Fosfoproteine
Le fosfoproteine sono proteine che contengono gruppi fosfato covalentemente legati, svolgendo un ruolo cruciale nella regolazione di varie funzioni cellulari come il metabolismo energetico e la trasduzione del segnale.