Aminoacyl-tRNA-syntetaser
Peptidsyntaser
En peptidsyntase är ett enzym som katalyserar reaktioner involverade i skapandet av peptidbindningar mellan aminosyror för att bilda peptider eller proteiner.
Aminosyror
tRNA-aminoacylering
tRNA-aminoacyling, eller tRNA-syrebaseret aminosyreesterifikation, er en biokemisk reaktion, hvor en specifik aminosyre kovalent forbindes med sit tilhørende transfer RNA (tRNA) molekyle. Denne proces katalyseres af enzymer kaldet aminoacyl-tRNAsynthetaser og spiller en essentiel rolle i den centrale dogme for molekylærbiologi, idet den forbinder genetisk information fra DNA og RNA med de relevante aminosyrer under proteinsyntesen. Hvert tRNA-molekyle har et specifikt anticodon, der kan parre sig med en komplementært kodon på mRNA, hvilket sikrer at den korrekte aminosyre bliver indlemmet i det voksende peptidkæde under proteinsyntesen.
Isoleucin-tRNA-ligas
Ett enzym som aktiverar isoleucin med dess specifika tRNA. EC 6.1.1.5.
Valin-tRNA-ligas
Valin-tRNA-ligase är ett enzym som katalyserar den sista steget i syntesen av valyl-tRNA, en molekyl som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Valin-tRNA-ligas associerar aminosyran valin med sin specifika transfer-RNA (tRNA) genom att koppla ihop dem med en peptidbindning, vilket möjliggör korrekt tolkning och översättning av genetisk information till proteiner.
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Serin-tRNA-ligas
Serin-tRNA-ligase, även känt som Seryl-tRNAsynthetas, är ett enzym som katalyserar den sista steget i syntesen av serin-tRNA, vilket är en nödvändig komponent i den genetiska koden för proteintranslering. Detta enzym katalyserar kopplingen av aminosyran serin till dess specifika transfer-RNA (tRNA) via en esterbindning. Denna reaktion är viktig för att säkerställa korrekt dekodning och syntes av proteiner i cellen.
Tyrosin-tRNA ligas
Aminoacylering
Aminoacylation är en biokemisk process där en aminosyra kovalent binds till ett transfer RNA (tRNA) molekyl med hjälp av en aminoacyl-tRNA syntetas. Detta steg är viktigt för den translationella maskineriet, som är ansvarig för att tolka genetisk information och producera proteiner i cellen. Varje tRNA molekyl har en specifik anticodon-sekvens som matchar en komplementär kodon-sekvens på mRNA. När aminoacyleringen sker korrekt säkerställs att rätt aminosyra kopplas till rätt tRNA, och därmed rätt plats i det protein som byggs upp.
Tryptofan-tRNA-ligas
RNA, transfer
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl bär en specifik aminosyra, och under proteinsyntesen matchas varje tRNA med en komplementär mRNA-sekvens (ett kodon) i ribosomen för att korrekt infoga den rätta aminosyran i den nya peptidkedjan som byggs upp.
Kolibakterie
Treonin-tRNA-ligas
Treonin-tRNA-ligase (TRS) er ein enzym som katalyserer reaksjonen der treonin blir knyttet til sin specifiske transfer RNA (tRNA), deretter overføres treoninet til ribosomen under translasjonsprosessen for å syntetiserast peptidbindningene i proteiner. Dette enzymet spiller dermed en viktig rolle i den genetiske koden og proteinsyntesen hos levende organismer.
Molekylsekvensdata
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
RNA, Transfer, Amino Acyl
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Varje tRNA molekyl innehåller en specifik sekvens av nukleotider, känd som antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodonsekvens på en messenger RNA (mRNA) molekyl.
Peptidbiosyntes, nukleinsyraoberoende
"Peptidbiosyntese, nukleinsyraoberoende" refererer til en biokemisk proces hvor peptider syntetiseres uten bruk av nukleinsyrer som RNA eller DNA som skabelon. I stedet brukes en ikke-nukleinsyrebasert mekanisme, ofte involverende enzymatiske reaksjoner, for å koble aminosyrer sammen i en bestemt sekvens for å forme et peptidmolekyle. Dette er i kontrast til den mest alminnelige formen av peptidbiosyntese, som er nukleinsyra-avhengig og involverer transskripsjon og translasjon av genetisk informasjon fra DNA via mRNA for å styre peptidsyntesen.
Aminosyrasekvens
Kloning, molekylär
Substratspecificitet
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Bassekvens
RNA, transfer, Gln
Transfer RNA (tRNA) för glutamin (Gln) är ett specifikt RNA-molekyl som transporterar aminosyran glutamin till ribosomen under processen av proteintranslering. Detta sker genom att tRNAMolekylen kopplas till glutamin via en speciell bindning, känd som peptidbindning, i enlighet med den genetiska koden specificerad i mRNA (messenger RNA).
Sekvensinpassning
I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.
Antikodon
Genetisk kod
Betydelsen av bassekvensen i förhållande till hur den översätts till aminosyrasekvens. Början, slutet och ordningsföljden av aminosyrorna i ett protein bestäms av en följd av nukleotidtripletter, benämnda kodoner.
Aminosyrasubstitution
Naturligt förekommande eller experimentellt utbyte av en eller flera aminosyror i ett protein mot en eller flera andra, varvid proteinets funktioner kan bibehållas, förändras eller utebli. Experimente ll substitution används för att studera enzymaktiviteter och bindningsegenskaper.
Bindningsplatser
Modeller, molekylära
RNA, transfer, Pro
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl har en specifik sekvens av nukleotider, kallad antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodon (tre nukleotider) på en mRNA-molekyl under translationen.
Mutation
Proteinstruktur, tertiär
Tyrocidin
Tyrocidin är ett peptidantibiotikum som produceras av bakterien Bacillus brevis och består av 16 aminosyror. Det har visat sig vara verksamt mot grampositiva bakterier, men används inte kliniskt på grund av dess toxicitet och svåra farmakokinetiska egenskaper. Tyrocidin fungerar genom att förstöra bakteriens cellmembran, vilket leder till celldöd. Detta gör det effektivt mot många olika sorters grampositiva bakterier, men kan också orsaka skada på andra celler i kroppen.