Epigenetic Repression
"Epigenetic repression" refererer til den proces hvor genetisk aktivitet bliver reduceret eller undertrykt via epigenetiske mekanismer, som inkluderer ændringer i kromatinstrukturen og modificeringer af DNA-basepar. Disse ændringer kan være reversible og involverer tilføjelse af grupperinger såsom metylgrupper (metylering) til DNA-strengen eller modifikationer af histonproteiner, som DNA er forbundet med i kromatinstrukturen. Disse ændringer kan resultere i komprimeret kromatin, hvilket gør det vanskeligt for transskriptionsfaktorer og andre proteiner involveret i genekspression at tilgå DNA-strengen og aktivere genudtryk. Epigenetisk repression spiller en vigtig rolle i reguleringen af genaktivitet under normal udvikling, differentiering og homeostase, men kan også
Epigenes, genetisk
"Epigenetiskt genetiskt" är ett begrepp inom forskningen som refererar till de förändringar i genuttryck som inte beror på ändringar i DNA-sekvensen, utan istället på andra mekanismer som påverkar geners aktivitet. Dessa mekanismer kan inkludera metylering av DNA, modifikationer av histonproteiner och RNA-interferens. Epigenetiska förändringar kan vara reversibla och är ofta beroende av miljön och åldern, till skillnad från genetiska förändringar som är ärftliga och orsakas av mutationer i DNA-sekvensen. Epigenetiska förändringar kan spela en viktig roll i cellulär differensiering, cancerutveckling och åldrande.
DNA-metylering
Genavstängning
CpG-öar
Förtätade områden i dinukleotidsekvensen cytosin-fosfatdiester-guanin. De bildar dna-sträckor som är flera hundra till flera tusen baspar i längd. Hos människor finns det ca 45 000 CpG-öar, huvudsakligen vid genernas 5´-ändor. De är ometylerade, med undantag för dem på den inaktiva X-kromosomen och några som hör samman med präglade gener.
Polycomb Repressive Complex 2
Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) är ett proteinkomplex som spelar en viktig roll i regleringen av genuttryck, särskilt under embryonal utveckling. PRC2 katalyserar metylering av histonproteinet H3 på specifika positioner (H3K27me2/3), vilket leder till kompaktisering av kromatin och försäljning av genuttryck. Anomalier i PRC2-relaterade processer har visats korrelera med olika sjukdomar, inklusive cancer.
Histoner
Promotorregioner, genetik
I en enkel mening kan promotorregionen inom genetiken definieras som den del av ett genetiskt material (DNA) där transkriptionsfaktorer binder till att initiera transkriptionen av ett specifikt gen. Promotorregionen ligger vanligtvis uppströms (5'-ändan) av det gen som ska transkriberas och innehåller ofta cis-regulatoriska element som reglerar genuttrycket genom att påverka bindningen av RNA-polymeras II, enzymet ansvarigt för transkriptionen av protein kodande gener.
Repressorproteiner
Repressorproteiner är proteiner som binds till specifika DNA-sekvenser och hämmar transkriptionen av ett visst genetiskt material, vilket leder till nedreglering av genuttrycket för de gener som kontrolleras av dessa repressorproteiner.
Kromatinimmunprecipitation
En teknik för identifiering av specifika DNA-sekvenser, bundna, in vivo, till proteiner av intresse. Metoden omfattar formaldehydfixering av kromatin för att korslänka DNA-bindande proteiner med DNA. Sedan DNA klippts upp i små fragment isoleras specifika DNA-proteinkomplex med hjälp av immunprecipitering med proteinspecifika antikroppar.
Enzymrepression
Kromatin
Den substans som kromosomerna består av. Den utgörs av DNA, histoner och icke-histonproteiner, vilka återfinns i cellkärnan.
Tumörcellinje
En tumörcellinje refererar till en homogen grupp av cancerceller som delar gemensamma genetiska mutationer och beteenden, och som härstammar från samma ursprungscell. Denna celllinje kan behålla sin unika identitet och vårda sig lika under tumörts growth, metastas och respons på terapi. Detta är viktigt att ta hänsyn till när man utvecklar cancerbehandlingar, eftersom responsen på en viss typ av behandling kan variera mellan olika tumörcellinjer.
Reglering av genuttryck, tumörer
Transkription, genetisk
Transkriptionsfaktorer
DNA-bindande proteiner
Proteiner som binder till DNA. Till denna familj hör proteiner som binder till såväl dubbelsträngat som enkelsträngat DNA, och den omfattar även specifika DNA-bindande proteiner i serum som kan användas som markörer för tumörsjukdomar.
Catabolite Repression
Catabolite repression är ett fenomen inom mikrobiologi där produktionen av enzymer som bryter ned specifika substrat i en mikroorganism minskar när tillgången på en favoriserad energikälla, till exempel glukos, ökar. Detta sker genom att cAMP-reaktivproteinet (CAP) inte aktiveras korrekt, vilket annars skulle ha lett till induktion av genuttryck för de enzymer som bryter ned substraten. Catabolite repression är ett exempel på negativ feedback och hjälper mikroorganismerna att prioritera användningen av energirika födoämnen när de finns tillgängliga.