Fosfoproteinfosfataser
En grupp enzymer som avskiljer serin- eller treoninbundna fosfatgrupper från ett stort antal fosfoproteiner. Till gruppen hör även ett antal enzymer som fosforylerats genom verkan av ett kinas. EC 3.1.3.16.
Fosfoproteiner
Fosfoproteiner är proteiner som innehåller kovalent bundna fosfatgrupper, ofta på serin-, treonin- eller tyrosinresidveni. Dessa fosfatgrupper kan spela en viktig roll i regleringen av proteinkunktioner, såsom enzymsaktivitet och signaltransduktion. Fosforylering och dephosphorylering av fosfoproteiner är centrala för cellulär reglering och styrs ofta av kinaser och fosfataser.
Fosforylasfosfatas
Proteinfosfatas 2
Protein Phosphatase 2 (PP2A) är ett enzym som spelar en viktig roll i cellulär signalering genom att reglera fosforylering av proteiner, det vill säga tillstånd då en fosfatgrupp fogats till ett protein. PP2A verkar som en nedreglerande mekanism genom att avlägsna fosfatgrupper från specifika serin- eller threoninresidyer på målproteiner, vilket kan påverka deras funktion, lokalisation och interaktion med andra proteiner. PP2A är involverad i en rad cellulära processer som celldelning, signaltransduktion, metabolism och apoptos.
Fosformonoesterhydrolaser
En medicinsk definition av 'Fosformonoesterhydrolas' är ett enzym som katalyserar nedbrytningen av fosfomonoestrarer till alkoholer och fosfat. Detta enzym spelar därför en viktig roll i stoffomsättningsprocesser, särskilt inom ämnesomsättningen av kolhydrater, fetter och proteiner.
Proteinfosfatas 1
Protein Phosphatase 1 (PP1) är ett enzym som spelar en viktig roll inom cellulär signalering genom att reglera fosforylering och deaktivering av proteiner, vilket påverkar deras funktion och interaktion med andra molekyler.
Okadasyra
I medicinsk kontext, kan "okadasyra" tolkas som en försämring eller ökning av ett symptom, tillstånd eller sjukdom över tid. Detta är motsatsen till "förbättringssyra", som betyder att patientens tillstånd har förbättrats. Okadasyra kan användas för att beskriva en rad olika medicinska situationer, beroende på kontexten. Till exempel kan det användas för att beskriva en ökning av smärta, inflammation, svullnad eller funktionsnedsättning.
Fosforylering
Proteinkinaser
Proteinkinaser är en grupp enzymer som katalyserar additionen av fosfatgrupper till proteiner, vilket ofta resulterar i att proteinets funktion eller lokalisation i cellen ändras. Denna process, kallad fosforylering, är en central mekanism i cellsignalering och regulerar en mängd cellulära processer, inklusive celldelning, apoptos (programmerad celldöd) och metabolism. Proteinkinaser spelar därför en viktig roll i underhåll och kontroll av cellens homeostas.
Ditioerytritol
Mangan
Metalliskt grundämne med kemiskt tecken Mn, atomnummer 25 och atomvikt 54,94. Det är anrikat i cellmitokondrier, främst i hypofysen, levern, bukspottkörteln, njurarna och skelettvävnaden. Det påverkar syntesen av mukopolysackarider, stimulerar produktionen av kolesterol och fettsyror i levern, och utgör en kofaktor för många enzymer, bl a arginas och alkalinfosfatas i levern.
Surt fosfatas
Proteintyrosinfosfataser
Natriumcholat
"Natriumcholat" er en sammensatt stoffgruppe bestående av natriumsoaps dannet ved reaksjonen mellom natrim (natrium-ioner) og fedtsyrer, også kjent som saponifiering. Disse stoffene har fløyelige egenskaper og er vanligvis uopploslige i vann, men oploslige i organiske løsninger. De brukes ofte i industrien, for eksempel som emulgatorer i fødevarer og kosmetiske produkter, på grunn av deres evne til å stabilisere blandinger av vann og olje.
Molekylvikt
Fosforylaser
Cantharidin
Kalmodulinbindande proteiner
Proteiner med förmåga att binda Kalmodulin. De finns i många vävnader och uppvisar en rad olika funktioner, inklusive F-aktinkorskoppling och blockering av cykliska nukleotidfosfodiesteraser, kalcium- och magnesium-ATPaser.
Oxazoler
"Oxazoler" är ett sammanfattande namn på en grupp av antibiotika som innehåller en oxazolidinring i sin kemiska struktur. Dessa antibiotika har bakteriedödande effekt genom att hämma proteinsyntesen i bakterier. De används främst för behandling av allvarliga infektioner orsakade av gram-positiva bakterier, som exempelvis meticillinresistenta Staphylococcus aureus (MRSA). Linazolid och tedizolid är två exempel på oxazoler.
Fosforradioisotoper
Natriumfluorid
Natriumfluorid är ett salt av natrium och fluor, med formeln NaF. Det används vanligtvis som en tillsats till tandkräm för att förebygga karies, eftersom fluoriden hjälper till att stärka tändernas emalj. Natriumfluorid kan också användas på recept i högre koncentrationer som ett desinfektionsmedel och för att behandla kronisk arsenikförgiftning.
Enzymaktivering
Magnesium
Ett lätt, silverfärgat, metalliskt grundämne. Det har kemiskt tecken Mg, atomnummer 12 och atomvikt 24,31. Dess salter är nödvändiga i näringskedjan, då de behövs för många enzymers verkan, särskilt för sådana som deltar i oxidativ fosforylering. Magnesium ingår i såväl intra- som extracellulära vätskor och utsöndras via urin och avföring. Brist på ämnet ger upphov till nervretning, med stelkramp, kärlvidgning, kramper, darrningar, depression och psykotiska beteenden.
Molekylsekvensdata
Aminosyrasekvens
Substratspecificitet
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Dopamin och cAMP-regulerad fosfoprotein 32
Dopamin and cAMP-regulated phosphoprotein 32 (DARPP-32) is a key regulatory protein in signaling pathways that modulate neuronal excitability, synaptic plasticity, and drug addiction, by integrating signals from dopamine and glutamate receptors to regulate the activity of various enzymes and ion channels through phosphorylation.
Merkaptoetanol
Merkaptoetanol, även känt som beta-merkaptoetanol, är ett reducerande agens med den kemiska formeln HOCH2CH2SH. Det innehåller en thiolgrupp (-SH) och används ofta inom biokemi för att bryta disulfidbindningar mellan cysteiner i proteiners tresdimensionella struktur, vilket gör det lättare att behandla och studera dem.
Kaniner
Nötkreatur
Adenosintrifosfat
Adenosin-5´-(tetravätetrifosfat). En adeninnukleotid innehållande tre fosfatgrupper som förestrats till en sockerdel. Adenosintrifosfat har en betydande roll i ämnesomsättningen och som neurotransmitt or.
Kalcineurin
Ett kalcium- och kalmodulinbindande protein som finns främst i det centrala nervsystemet. Det består av två komponenter: en katalytisk enhet, kalcineurin A, och en reglerande enhet, kalcineurin B, med molekylvikter på 60 resp. 19 kD. Kalcineurin har visat sig kunna defosforylera en rad fosfoproteiner, som t ex histoner, myosinets lätta kedjor och regulatorenheten i cAMP-beroende proteinkinas. Det medverkar i styrningen av signalöverföring och utgör måltavla för en viktig grupp av immunosuppressiva läkemedel.
Fosforylaskinas
Trifluoperazin
Trifluoperazine är ett typiskt antipsykotiskt läkemedel som tillhör gruppen fenotiaziner. Det används primärt för behandling av psykoser, schizofreni och allvarliga agitationstillstånd. Läkemedlet fungerar genom att blockera dopaminreceptorer i hjärnan, vilket kan hjälpa att reducera symtom som hallucinationer, förvirring och aggressivt beteende.
Läkemedelshållbarhet
Cykliskt AMP
Cykliskt adenosinmonofosfat (adenosin-3',5'-vätefosfat). Det är en adeninnukleotid med en fosfatgrupp som förestrats mot sockerdelens 3'- och 5'-positioner. Det är en sekundär budbärare med avgörande intracellulär reglerfunktion som förmedlare av verkan av ett flertal hormoner, däribland epinefrin, glukagon och ACTH. Syn. cAMP.
Polyakrylamidgelelektrofores
Makromolekylära substanser
Glukos-6-fosfatas
Hydroximetylglutaryl-CoA-reduktaser
Cytosol
Kalmodulin
Ett värmestabilt aktivatorprotein med låg molekylvikt i ffa hjärna och hjärta. Genom kalciumjonbindning kan proteinet kopplas till cykliska nukleotidfosfodiesteraser och adenylcyklas och således utöva sin verkan. Därmed modulerar proteinet nivåerna av cykliskt AMP och cykliskt GMP.
Enzymhämmare
Enzyminhibitorer är substanser som sänker eller helt stoppar en enzymes aktivitet genom att binda till enzymet. Detta resulterar i försening eller minskning av den kemiska reaktionen som enzymet annars skulle ha katalyserat. Enzymer är proteinmolekyler som accelererar biologiska reaktioner inom celler, och deras aktivitet kan regleras genom olika mekanismer, däribland användning av enzyminhibitorer.
Histoner
Proteiner
Proteiner är komplexa biomolekyler, byggda av aminosyror som kedjas samman i en polymer. De utför viktiga funktioner inom levande organismers celler, såsom att fungera som strukturella komponenter, hormoner, enzymer och signalsubstanser. Proteinernas specifika aminosyrasekvens bestämmer deras tertiärstruktur och därmed också deras funktionella egenskaper.
Varm temperatur
Råttor, inavlade stammar
Inbred rodent strains are genetically identical populations of rats that are produced by repeatedly breeding closely related individuals over many generations, leading to a high degree of homozygosity and predictable genetic traits, which make them valuable tools in biomedical research for studying gene function, disease mechanisms, and therapeutic interventions.
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 11
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 11 (PTPN11) är ett enzym som reglerar cellytiska signaltransduktionsvägar genom att avkativa proteiner genom att tappa fosfatgrupper från tyrosinresidyer. Det är involverat i cellcykeln, celldifferentiering och celldelning. Mutationer i PTPN11 kan leda till olika genetiska sjukdomar, inklusive Noonan syndrom och leukemi.
Dual-Specificity Phosphatases
Dual-specificity phosphatases (DUSPs) are a group of protein phosphatases that are capable of removing phosphate groups from both tyrosine and serine/threonine residues on their target proteins. They play crucial roles in regulating various cellular processes, such as signal transduction, inflammation, differentiation, and apoptosis, by controlling the activity of key protein kinases involved in these pathways. Dysregulation of DUSPs has been implicated in several diseases, including cancer, diabetes, and neurodegenerative disorders.
cdc25-fosfataser
CDC25-fosfatasery är en grupp enzymer som aktiverar andra proteiner genom att avlägsna fosfatgrupper från dem, vilket är en viktig process för cellcykeln och celldelningen.
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 1
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 1 (PTPN1) är ett enzym som bidrar till att regulera cellsignalering genom att avlägsna fosfatgrupper från proteintryosiner. Detta enzym tillhör den större gruppen tyrosinfosfataser och saknar en transmembranregion, vilket skiljer det från receptortyrosinfosfataserna. PTPN1 är involverad i flera cellulära processer, inklusive celldelning, signaltransduktion och apoptos. Variationer i PTPN1-genen har associerats med olika sjukdomar, till exempel cancer och autoimmuna sjukdomar.
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 6
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 6 (PTPN6) är ett enzym som reglerar cellytiska signaltransduktionsvägar genom att avlägsna fosfatgrupper från proteintryosiner. Detta enzym tillhör den icke-receptorgruppen av tyrosinfosfataser och har visat sig spela en viktig roll i cellernas signalsystem, som exempelvis celldelning, cellytafunktioner och immunresponser. Variationer och mutationer i PTPN6-genen har associerats med olika sjukdomar, inklusive autoimmuna sjukdomar och cancer.
Myosin-Light-Chain Phosphatase
Myosin-Light-Chain Phosphatase (MLCP) är ett enzym som desfosforylerar, och därmed inaktiverar, myosinlightkedjans fosfatgrupp. Detta leder till relaxation av glatta muskler. MLCP består av tre underenheter: katalsytkomponenten (PP1cδ), en regulerande underenhet (MYPT1) och en subunit som binder till kalcium/kalmodulin (MRLC). MLCP spelar därför en viktig roll i regleringen av kontraktion och relaxation hos glatta muskler.
Hjärna
Den del av det centrala nervsystemet som befinner sig innanför kraniet och som omfattar prosencefalon (framhjärnan), mesencefalon (mitthjärnan) och rombencefalon (ruthjärnan). Den uppstår ur främre de len av embryots nervtub. Dess funktioner inkluderar muskelkontroll och koordination, mottagande och behandling av sinnesintryck, talframställning, minneslagring samt hantering av tankar och känslor.
Hjärtmuskel
Signalomvandling
I en enkel mening kan 'signalomvandling' inom medicin definieras som processen där celler konverterar inkommande signaler, ofta i form av hormoner, neurotransmittorer eller tillväxtfaktorer, till intracellulära svar genom en kaskad av biokemiska händelser. Detta kan leda till aktivering eller inhibitering av vissa cellulära funktioner och är en central mekanism i cellkommunikationen och regleringen av cellulär homeostas.
Protein Tyrosine Phosphatases, Non-Receptor
Protein Tyrosine Phosphatases, Non-Receptor (PTPN) är en grupp intracellulära enzymer som katalyserar avlägsnandet av fosfatgrupper från tyrosylresidyer på proteinmolekyler. De spelar därmed en viktig roll i regulationen av cellsignalering och homeostas. Genom att kontrollera aktiviteten hos olika proteiner kan PTPN-enzymen modulera cellulära processer som celldelning, differentiering, apoptos och metabolism. Dysfunktion i dessa enzymer har visats vara involverade i patologiska tillstånd såsom cancer, diabetes och neurologiska sjukdomar.
Cellinje
I medicine refererer "cellinje" til en gruppe af celler med ensartet funktion og opbygning, der samarbejder for at udføre en specifik biologisk proces eller opgave i et levende organisme. Celliner er ofte specialiserede i deres struktur og funktion for at udføre deres rolle effektivt, og de kan findes i alle levende organismer, fra encellet bakterie til komplekse flercellede dyr og planter.
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 2
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 2 (RPTPs, Class 2) är en undergrupp av receptorproteiner som innehåller tyrosinfosfatasverksamhet och är involverade i cellsignalering. Dessa proteiner har en extracellulär domän med flera immunoglobulin-liknande repetitiva strukturer och en transmembrandomän som innehåller tyrosinfosfatasdomäner. RPTPs, Class 2 är kända för att spela roller i reguleringen av cellulär processer såsom celldelning, cellyta-till-cellkontakt och neuronal utveckling genom att modulera signalsystem som involverar tillväxtfaktorer, cytokiner och adhesionsmolekyler. Exempel på RPTPs, Class 2 inkluderar RPTPβ/ζ, RPTPγ/δ och RPTPε.
Bassekvens
Mikrofilamentproteiner
Proteinbindning
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
Fosfatidatfosfatas
Fosfopeptider
Fosfopeptider refererar till peptider (korta proteiner) som innehåller fosfatgrupper. Dessa molekyler spelar viktiga roller inom cellulär signalering och regulering av olika fysiologiska processer, såsom celldelning, differentiering och apoptos (programmerad celldöd). Exempel på fosfopeptider inkluderar proteinkinaser och fosfataser, som är involverade i överföringen och reguleringen av signalsubstanser inom cellen.
Dual Specificity Phosphatase 1
Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1), även känt som MAP Kinase Phosphatase 1 (MKP-1), är ett enzym som tillhör familjen dual specificity phosphataser. DUSP1 har förmågan att avreglera signaltransduktionsvägar involverade i cellcykeln, celldelning, apoptos och inflammation genom att specificerat dephosphorylera både tyrosin- och tyronsinfosfater på mitogenaktiverade protein kinaser (MAPK). Detta leder till en inhibitering av MAPK-aktiviteten, vilket i sin tur reglerar cellproliferation och celldöd. DUSP1 uttrycks högt under stressreaktioner och inflammatoriska tillstånd, och har därför potential att användas som en terapeutisk måltavla för behandling av olika sjukdomar, inklusive cancer.
Fosfoserin
Fosforsyraestern av serin.
Fosfotreonin
Synapsiner
I en enkel mening kan synapsiner definieras som proteiner som deltar i regleringen av neurotransmission i centrala nervsystemet (CNS) och perifera nervsystemet (PNS). De är involverade i processen att underlätta exocytos av neurotransmittorer från presynaptiska terminaler till synapsklyftan, där de kan binde till receptorer på postsynaptiska neuroner och signalera fortsatt nervaktivitet. Synapsiner är en viktig komponent i den molekylära maskineri som styr kommunikationen mellan neuroner och är kopplad till flera neurologiska sjukdomar om de påverkas eller muteras.
Tyrosin
Tyrosine är en aromatisk essentiell aminosyra som fungerar som byggsten i proteiner och neurotransmittor i kroppen. Det syntetiseras i kroppen från den icke-essentiella aminosyran fenylalanin.
Isoenzymer
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 3
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 3 (RPTPs, Class 3) är en undergrupp av receptorproteiner som har tyrosinfosfatasverksamhet och tillhör den större familjen av protein tyrosinfosfataser (PTPs). Dessa RPTPs i klass 3 består av två gener, PTPRG och PTPRJ, vilka kodar för proteiner med en extracellulär domän som innehåller flera fibronectin III-like repetitioner och en cellmembranövergripande region, följt av en cytoplasmisk tyrosinfosfatasdomän. Dessa RPTPs i klass 3 är involverade i reguleringen av cellytorpåverkansprocesser som celladhesion, signaltransduktion och cellerorsakningar genom att modulera tyrosinfosforylering av intracellulära målproteiner.
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Intracellulära signalpeptider och -proteiner
Proteiner och peptider som deltar i signalöverföringen inuti cellen. Dessa omfattar peptider och proteiner som reglerar transkriptionsfaktorernas verksamhet och cellulära förlopp till följd av svar på signaler från cellytereceptorer. De intracellulära signalpeptiderna och -proteinerna kan utgöra en del av en enzymatisk signalkaskad, eller verka genom att binda till och modifiera verkan av andra signalfaktorer.
Kloning, molekylär
Vanadater
I en enkel mening kan vanadater definieras som joner eller föreningar som innehåller vanadium i oxidationstillståndet +5, bundet till syreatomer. Vanadater är vanligtvis färgade och förekommer naturligt i vissa mineraler, men de kan även produceras syntetiskt. De har potentialen att agera som katalysatorer och har visats ha en rad biologiska verkan, inklusive insulinliknande aktivitet, vilket gör dem intressanta inom forskning om diabetesbehandlingar.
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 4
Receptor-like protein tyrosine phosphatases (RPTPs) are a class of proteins that regulate various cellular processes through the reversible dephosphorylation of tyrosine residues on target proteins. RPTPs, Class 4, also known as RPTPμ, is a specific subfamily of RPTPs that contains a single transmembrane domain and two extracellular fibronectin type III domains.
Celler, odlade
Serin
I en enkel medicinsk definition är serin (Ser) en essentiell aminosyra som spelar en viktig roll i många kroppsliga processer, såsom proteinsyntes, cellsignaleringsvägar och neurotransmission. Serin är också en prekursor till andra biologiskt aktiva ämnen, inklusive neurotransmittorerna glycin och GABA (gamma-aminobutyriska syran). Det kan bildas i kroppen genom metabolismen av andra aminosyror, såsom glycin och metionin, men den diätära behovet täcks vanligtvis genom konsumtionen av proteinrika livsmedel.
Mitogenaktiverade proteinkinasfosfataser
En underkategori av fosfohydrolaser som är specifika för mitogenaktiverade proteinkinaser. De har en roll i inaktiveringen av MAP-kinassignalsystemet.
Virusproteiner
"Virusproteiner" refererer til proteiner som produceres af et virus for å fullføre sin infeksjonsprosess og reproducerer seg i værtsorganismen. Disse proteinet kan ha ulike funksjoner, såsom å binde til værtscellene for å fremme infeksjonen, å beskytte virusgenomet under overføringen mellom værter eller å hjelpe med replikasjonen av viruset.
Statmin
"Statin" är ett samlingsnamn för en grupp av kolesterolavsaknande läkemedel som används för att sänka blodkolesterolnivåer, specifikt LDL-kolesterol (dåligt kolesterol), och minska risken för hjärt-kärlsjukdomar som hjärtinfarkt och stroke. Statiner fungerar genom att hindra enzymet HMG-CoA-reduktas, som är involverat i kroppens eget produktion av kolesterol, varvid kolesterolnivåerna sänks.
Mutation
Bindningsplatser
Rekombinanta fusionsproteiner
Rekombinanta fusionsproteiner är proteiner som skapats genom att kombinera genetiska sekvenser från två eller fler olika proteinmolekyler, vilket resulterar i en hybridprotein med unika funktionella egenskaper. Genetisk manipulation används för att fusionera generna på ett sådant sätt att de uttrycks som ett enda proteinskapsel i värdenorganismen. Dessa tekniker används ofta inom biomedicinsk forskning för att undersöka proteininteraktioner, skapa nya diagnostiska verktyg och utveckla terapeutiska läkemedel.
Protein-serin-treoninkinaser
Protein-serin-treonin kinases are a type of enzyme that plays a crucial role in various cellular processes by adding phosphate groups to serine and threonine residues on target proteins. This post-translational modification can activate or inhibit the function of these proteins, thereby regulating signal transduction pathways involved in cell growth, differentiation, metabolism, and survival. Dysregulation of protein-serin-treonin kinases has been implicated in numerous diseases, including cancer, diabetes, and neurodegenerative disorders.
SH2 Domain-Containing Protein Tyrosine Phosphatases
SH2 Domain-Containing Protein Tyrosine Phosphatases (PTPs) are a group of enzymes that regulate various cellular processes by removing phosphate groups from tyrosine residues on proteins. They play crucial roles in signal transduction pathways and are involved in the regulation of many cell functions, such as cell growth, differentiation, migration, and survival. Dysregulation of these enzymes has been implicated in various diseases, including cancer and diabetes. The SH2 domain in these proteins is responsible for recognizing and binding to specific phosphotyrosine-containing motifs on target proteins, allowing the PTPs to selectively dephosphorylate and regulate their activity.
Fosfotyrosin
En aminosyra som förekommer i endogena proteiner. Fosforylering och defosforylering av tyrosin har betydelse för cellulär signalöverföring och möjligen för kontroll av celltillväxt och tumöruppkomst.
Rekombinanta proteiner
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
Peptidkartläggning
Peptidkartläggning, även kallat peptidmappning, är en biokemisk metod som används för att bestämma aminosyrasequensen hos ett okänt peptidmolekyul genom att successivt bryta ned det i kortare fragment med hjälp av proteaser och sedan bestämma sekvensen av varje fragment genom till exempel Edman degradering eller masspektrometri.
Dual Specificity Phosphatase 6
Dual Specificity Phosphatase 6 (DUSP6), även känt som MAP Kinase Phosphatase 3 (MKP3), är ett enzym som tillhör familjen dual specificity phosphataser, vilka är kända för deras förmåga att avlägsna fosfatgrupper från både tyrosin- och tyrusin/serin/treoninrestudier på sina målmolekyler. DUSP6 är specifikt inriktad på att regulerera mitogenaktiverade protein kinaser (MAPK) genom att avlägsna fosfatgrupper från deras aktiveringsställen, vilket leder till en nedreglering av MAPK-signalslingan. DUSP6 har visat sig spela en viktig roll i cellcykeln, celldifferentiering och apoptos.
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 2
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 2 (PTPN2) är ett enzym som bidrar till att reglera cellsignalering i kroppen genom att avlägsna fosfatgrupper från protein. Specifikt är PTPN2 en tyrosinfosfatas som tar bort fosfatgrupper från tyrosinresidyer på proteiner, vilket kan påverka deras funktion och aktivitet. Detta enzym spelar en viktig roll i regleringen av immunsystemet och cellernas livscykel, inklusive celldelning och apoptos (programmerad celldöd). Genetiska mutationer i PTPN2 kan vara associerade med olika sjukdomar, till exempel autoimmuna sjukdomar och cancer.
Precipitintester
I en enkel medicinsk definition kan man säga att en "Precipitintest" är ett laboratorietest som används för att undersöka om en given substans, till exempel ett läkemedel eller en biologisk vätska som urin, kan orsaka en kemisk reaktion i form av en så kallad precipitatsbildning när den blandas med en specifik testvätska. Precipitatet är ett fast, oftast olösligt ämne som bildas när två lösningar blandas och deras komponenter reagerar tillsammans.
Fosvitin
Fosvitin är ett glukoprotein som förekommer naturligt i äggvita och utgör en viktig del av äggets näringsriktiga innehåll. Det kännetecknas av sina höga nivåer av fosfoser och karboxylgrupp-terminaler, vilket gör det till ett effektivt chelator av mineraler såsom järn, zink och kalcium. Fosvitin har visat sig ha potential som en hälsofrämjande komponent i näringsmässiga tillämpningar på grund av dess förmåga att underlätta mineralabsorptionen och stödja immunförsvaret.
Membranproteiner
Proteiner i biologiska membran, som t ex cellmembran och intracellulära membran. De utgörs av två typer, yttre (perifera) och inre, integrerade, proteiner. De omfattar de flesta membranbundna enzymer, antigena proteiner, transportproteiner, och receptorer för läkemedel, hormoner och lektiner.
Tvådimensionell gelelektrofores
Proteinstruktur, tertiär
Protein-tyrosinkinaser
Protein-tyrosinkinases (PTKs) are a type of enzyme that plays a crucial role in signal transduction within cells. They catalyze the transfer of a phosphate group from adenosine triphosphate (ATP) to specific tyrosine residues on target proteins, a process known as tyrosine phosphorylation. This post-translational modification can alter the activity, stability, or localization of the target protein and is involved in various cellular processes such as growth, differentiation, and apoptosis. Dysregulation of PTKs has been implicated in several diseases, including cancer, making them important drug targets for therapeutic intervention.
Blotting, Western
Blot-metod för identifiering av proteiner eller peptider som separerats med elektrofores och överförts till nitrocellulosastrimlor och sedan påvisas med hjälp av radioistopmärkta antikroppar.
Mikrocystiner
Tartrater
I medicinen refererer "tartrater" til et salt af tartarsyre, som er en organisk syre der findes naturligt i visse levnedsmidler som f.eks. vin. Tartrater kan også dannes i kroppen, især i led og blodårer, når der opstår forstyrrelser i kroppens syre-base-hævning. I den medicinske kontekst refererer "tartrater" ofte til et laboratorietest, hvor man måler mængden af tartarsyres salt i blodet for at evaluere patientens syre-base-status.
Osteopontin
Osteopontin (OPN) är ett protein som uttrycks inom flera olika fysiologiska och patologiska tillstånd, såsom ben- och tandbildning, fibros, immunförsvar och cancer. Det är känt för sin roll i celladhesion, migration, proliferation och överlevnad, samt även som en cytokinmodulator. OPN binder till integriner och CD44-receptorer på cellmembranet, vilket leder till aktivering av intracellulära signaltransduktionsvägar. Detta bidrar till reguleringen av osteoklastaktivitet, inflammation och fibros, men även till cancerrelaterade processer som tumörinvasion och metastasbildning.
Kalcium
Grundämne som förekommer i nästan all organiserad vävnad. Det tillhör alkalimetallerna och har kemiskt tecken Ca, atomnummer 20 och atomvikt 40. Kalcium är det allra vanligaste mineralämnet i kroppen och bildar i förening med fosfor kalciumfosfat, som ingår i ben och tänder. Det spelar en essentiell roll för nerv- och muskelfunktioner, i blodkoagulationsprocessen (som faktor IV) och i många enzymp rocesser.
RNA, budbärar
Cellkärneproteiner
Cellkärneproteiner är proteiner som lokaliseras till cellkärnan och utövar strukturella, regulatoriska eller katabola/anabola funktioner inom cellkärnans olika kompartment, såsom kromosomer, karyolymfa och kärnmembran.
Nervvävnadsproteiner
"Nervvävnadsproteiner" refererar till de proteiner som utgör strukturella och funktionella komponenter hos nervceller (neuron) och deras stödjande celler (glialceller) i nervsystemet. Dessa proteiner är involverade i en rad olika processer, inklusive signaltransduktion, cellytiska processer, neurotransmission och homeostas. Exempel på nervvävnadsproteiner är neurofilament, tubulin, aktin, laminer, GFAP (glial fibrillär acidisk protein) och diverse receptorer och kanaler.
Transfektion
Transfektion är en process där DNA, RNA eller andra molekyler överförs till eukaryota celler, ofta med syfte att introducera en specifik gen så att cellen kan producera ett protein som kodas av den genen. Detta kan göras för forskningsändamål, till exempel för att studera proteinet och dess funktion, eller för medicinska ändamål, till exempel för att ersätta en defekt gen hos en patient med ärftlig sjukdom. Transfektion kan ske med olika metoder, såsom elektroporering, kemisk transfektion eller viralvektorbaserad transfektion.
Cellkärna
Celladhesionsmolekyler
PTEN-fosfohydrolas
'PTEN-fosfohydrolas' (eller PTEN) är ett enzym som binder och dephosphorylerar fosfatgrupper från specifika proteiner, lipider och andra molekyler inom cellen. Det fungerar som en tumörsuppressor, eftersom det hjälper till att reglera celldelning och apoptos (programmerad celldöd). PTEN-fosfohydrolas är känt för sin roll i negativ regulering av PI3K/AKT-signalvägen, vilket är involverat i cellcykeln, celldelning, överlevnad och apoptos. Mutationer eller nedsatt funktion hos PTEN kan leda till onkogenes och cancerutveckling.
Treonin
Treonin är en essentiell aminosyra, vilket betyder att det måste införas genom kosten eftersom kroppen inte kan syntetisera den själv i tillräckliga mängder. Det är en av de 20 standardaminosyrorna som är byggstenar i proteiner och har beteckningen Thr eller T i treställiga kodonsekvensen TTT, TTC, TCT och TCC. Treonin har en hydroxylgrupp (–OH) som kan fosforyleras, vilket är viktigt för cellsignalering och reglering av proteinkinaser.
Glykogensyntas-D-fosfatas
Proteinmodifiering, posttranslationell
Posttranslational protein modification (PTPM) refers to the covalent alteration of a protein's structure after its translation from mRNA to polypeptide chain but before it becomes fully functional. These modifications play crucial roles in regulating protein function, localization, stability, and interaction with other molecules within the cell. Examples of PTPMs include phosphorylation, glycosylation, ubiquitination, methylation, acetylation, and sumoylation, among others.
Subcellulära fraktioner
Subcellular fractions refer to the distinct components or particles that are isolated from a cell by various fractionation techniques, each containing different types of cellular structures and molecules. These fractions can include organelles such as the nucleus, mitochondria, endoplasmic reticulum, Golgi apparatus, lysosomes, peroxisomes, and plasma membrane, as well as cytoskeletal elements, ribosomes, and soluble proteins. The isolation of these subcellular fractions allows for the independent study of their unique functions, compositions, and interactions in cellular processes and diseases.
Cellmembran
Cykliskt AMP-beroende proteinkinaser
En grupp enzymer som är beroende av cykliskt AMP (cAMP) och som katalyserar fosforyleringen av serin- och treoninrester på proteiner. EC 2.7.10.-.
Sialoglykoproteiner
Sialoglykoproteiner är proteiner som är modifierade med sialiska sockergrupper, vilket är en typ av sackarider. Dessa sockergrupper sitter vanligtvis längst ut på proteinmolekylen och kan ha betydelse för proteinets funktion, till exempel genom att påverka dess interaktion med andra molekyler eller dess struktur. Sialoglykoproteiner förekommer i många olika typer av celler och vävnader i kroppen och har en rad olika funktioner, till exempel kan de vara involverade i cell-till-cell-kontakter, signaltransduktion och immunförsvar.
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 5
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases, Class 5 (RPTPσ/ψ) are a subfamily of protein tyrosine phosphatases that are characterized by their structure and function as receptors. These proteins have an extracellular domain, a transmembrane region, and an intracellular domain with tyrosine phosphatase activity. They play crucial roles in various cellular processes, including cell-cell adhesion, neuronal development, and synaptic plasticity. RPTPσ/ψ have been identified as key regulators of axon growth and guidance, and their dysfunction has been implicated in several neurological disorders.
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 12
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 12 (PTPN12) är ett enzym som reglerar cellyttor och signaltransduktion genom att avlägsna fosfatgrupper från tyrosiner på proteiner. Det är involverat i cellcykeln, celldelning, celldifferentiering och apoptos (programmerad celldöd). Genmutationer eller abnorma nivåer av PTPN12 har visats påverka cellsignalering negativt och kan vara associerade med olika sjukdomar, inklusive cancer.
DNA, komplementärt
Dual Specificity Phosphatase 3
Dual Specificity Phosphatase 3 (DUSP3), även känt som MAP Kinase Phosphatase 1 (MKP1), är ett enzym som tillhör familjen dual specificity phosphataser. Dessa enzymer har förmågan att avlägsna fosfatgrupper från både tyrosin- och tyrusin/serin/treoninrestider på sina målproteiner, ofta signalproteiner som är involverade i cellsignalering.
COS-celler
Cellinje från den afrikanska grönapan som används för transfektion och kloning.
Tumörceller, odlade
Kaseinkinas II
Ett allmänt utbrett kaseinkinas (CKII) med två distinkta katalytiska enheter och en dimerisk reglerenhet. CKII har visat sig fosforylera ett stort antal ämnen, av vilka många är proteiner som ingår i regleringen av det genetiska uttrycket. EC 2.7.1.37.
Adaptorproteiner, signalöverförande
Adaptorproteiner i signalöverföringen är strukturella proteiner som hjälper till att koppla receptorer till intracellulära signalsystem genom att verka som mellansteg och organisera signalkomplex, vilket leder till specificerad cellulär respons under homeostatiska och patologiska tillstånd.
Proteinkinas C
Protein Kinase C (PKC) är ett enzym som spelar en viktig roll inom cellsignalering och regulerar en rad cellulära processer, såsom celldelning, differentiering, apoptos och cellytiska respons på till exempel växt hormoner och tillväxthormon. PKC aktiveras av diacylglycerol (DAG) och calciumjoner (Ca2+) och får därigenom förmågan att fosforylera, det vill säga överföra en fosfatgrupp till, specifika serin- eller treoninresidyer på målproteiner. Detta leder till en förändring av proteinet som kan leda till aktivering eller inaktivering av dess funktion. PKC finns i flera olika isoformer som varierar mellan olika celltyper och har olika substratspecifitet, reguleringsmekanismer och subcellulära lokaliseringsställen.
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases
Receptor-Like Protein Tyrosine Phosphatases (RPTPs) are a class of proteins that play a crucial role in regulating cell signaling pathways by removing phosphate groups from tyrosine residues on other proteins. They are called "receptor-like" because they contain an extracellular domain that allows them to bind to specific ligands, similar to receptor tyrosine kinases (RTKs).
Transkription, genetisk
Genetisk transkription är ett biologiskt process där DNA-sekvensen kopieras till en mRNA-sekvens (meddelande RNA) med hjälp av enzymet RNA-polymeras, vilket möjliggör syntesen av proteiner.
src-domäner
I medicinsk kontext, refererar "source domains" (eller "src-domäner") till specifika områden i hjärnan som är aktiverade under en given mentala upplevelse eller kognitiv process och bidrar till att informera andra relaterade hjärnregioner. Dessa domäner kan vara involverade i inmatning, tolkning och integrering av sensoryperception, emotionella tillstånd, minnen eller andra kognitiva funktioner som är relevanta för upplevelsen. Detta koncept används ofta inom forskningsområden som neurovetenskap, psykiatri och kognitionsvetenskap för att undersöka neurala nätverk och deras roll i hjärnfunktioner och beteende.
Mitos
Saccharomyces cerevisiae
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 13
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 13 (PTPN13) er ein fosfatase-enzym som spesialiserer seg på å avkvelle fosfatgrupper fra tyrosiner i proteiner. Dette regulerer ofte signalvei og aktiviteten til mange intracellulære proteiner. PTPN13, også kjent som FAP-1 (Fas-associated phosphatase 1), er lokalizert i cellemembranen og inneholder flere domener som interagerer med andre proteiner for å regulere cellulær signalering, adherens junction-funksjon og cellemoviment. Variasjonser i PTPN13-genet har vore knyttet til sluttsynstørrelse og kreft.
Sekvensinpassning
I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.
Ben och benvävnad
'Ben och benvävnad' refererar till den strukturella och funktionella enheten hos ryggradsdjur, inklusive människor, som består av benmärg, benvävnad (som omfattar kompakt ben, spongiosa ben och brosk), ledbrosk, ledkapsel, ligament och senor, vilka alla tillsammans ger form, stöd och rörelseförmåga till kroppen.
Tidsfaktorer
"Tidsfaktorer" refererar inom medicinen till de aspekter av tiden som kan spela in på en persons hälsa, sjukdomsutveckling eller svar på behandling. Detta kan omfatta sådant som tidpunkt för exponering för en skada eller en infektion, tid som har gått sedan symtom uppstod, eller den tid det tar för en behandling att verka. Tidsfaktorer kan vara av avgörande betydelse för att ställa diagnoser, planera behandlingar och förutse prognoser.
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 3
Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 3 (PTPN3) är ett enzym som bidrar till regulationen av cellsignalering genom att avlägsna fosfatgrupper från proteintryosiner. Detta enzym tillhör den större gruppen tyrosinfosfataser och saknar en transmembranregion, vilket innebär att det inte är kopplat till cellmembranet som receptorproteiner. PTPN3 har visat sig spela roller i flera cellulära processer, inklusive celldelning, signaltransduktion och cellytaresresponser.
Nukleoproteiner
Nukleoproteiner är proteiner som har en nära association med nukleinsyra, det vill säga DNA eller RNA. Denna association kan vara permanent eller tillfällig och kan involvera icke-kovalenta bindningar mellan proteinets aminosyrarestser och fosfatgrupperna i nukleinsyran. Nukleoproteiner har ofta en strukturell roll, där de hjälper till att ge stabilitet och form åt nukleinsyrorna, men de kan också ha en funktionell roll i cellulära processer som replikation, transkription och translation. Ett exempel på ett nukleoprotein är kapsidproteinet hos en virus, som omger och skyddar virala genomet.
Reglering av genuttryck, enzymer
Cytoplasma
DNA-primrar
Kolibakterie
Modeller, biologiska
Mutagenes, riktad
Cellcykelproteiner
Proteiner som kontrollerar celldelningscykeln. Denna proteinfamilj omfattar ett stort antal klasser, inklusive cyklinberoende kinaser, mitogenaktiverade kinaser, cykliner och fosfoproteinfosfataser, s amt deras förmodade substrat, så som kromatinassocierade proteiner, cytoskelettproteiner och transkriptionsfaktorer.
Peptidfragment
Ett peptidfragment är en kort sekvens av aminosyror som har beeneds klippt isär från ett större peptid eller protein.
Jonbytarkromatografi
Cercopithecus aethiops
En art av Cercopithecus med tre underarter: C. tantalus, C. pygerythrus och C. sabeus. De lever i skogs- och savannområden i Afrika. Den afrikanska grönapan, C. pygerythrus, är den naturliga värden fö r SIV och används i AIDS-forskningen.
4-nitrofenylfosfatas
Ett enzym som katalyserar hydrolys av nitrofenylfosfater till nitrofenoler. Vid surt pH är det sannolikt surt fosfatas (EC 3.1.3.2); vid alkaliskt pH är det förmodligen alkalint fosfatas (EC 3.1.3.1). EC 3.1.3.41.