Guanosin 5'-difosfat-2'(3')-difosfat, en guaninnukleotid med fyra fosfatgrupper. Två fosfatgrupper är förestrade till sockerdelen i position 5' och de två övriga i position 2' eller 3'. Denna nukleotid fungerar som budbärare för avstängning av syntesen av ribosomalt RNA när det inte finns aminosyror för proteinsyntes.
Föreningar av guanosin och fosfatgrupper. De vanligaste är GMP (guanosinmonofosfat), GDP (guanosindifosfat) och GTP (guanosintrifosfat).
Guanosin 5'-trifosfat-2'(3')-difosfat, en guaninnukleotid med fem fosfatgrupper. Tre fosfatgrupper är förestrade till sockerenheten i position 5', de två övriga i postion 2' eller 3'. Nukleotiden fungerar som budbärare som stänger av syntesen av ribosomalt RNA när det inte finns aminosyra tillgänglig för proteinsyntes.
En grupp föreningar bestående av en nukleotidmolekyl, till vilken kopplats ytterligare en nukleosid genom fosfatmolekylen eller -molekylerna. Nukleotiden kan innehålla ett antal fosfater.
"Bakteriellt RNA" refererar till RNA (Ribonukleinsyra) som förekommer hos bakterier. Detta inkluderar olika typer av RNA: messenger RNA (mRNA), ribosomalt RNA (rRNA) och transfer RNA (tRNA). Dessa molekyler spelar viktiga rollar i protein syntesen hos bakterier.
En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.
Myxococcales är en ordning inom domänen Bakterier (Bacteria) som inkluderar de så kallade myxobakterierna. Dessa bakterier är kända för sin sociala beteende och deras förmåga att bilda multicellulära strukturer, såsom fruktkroppar, under speciella förhållanden. Myxobakterier lever främst i jord- och vattenmiljöer där de livnär sig på andra bakterier genom att producera antibiotiska ämnen och sedan utsöndra enzymer som bryter ner deras byten till näringsriktiga molekyler. Myxobakteriernas sociala beteende och förmåga att bilda fruktkroppar gör dem till ett intressant forskningsområde inom bland annat cellulär differentiering, signalsubstanser och kooperativt beteende hos bakterier.
En purinnukleosid bestående av guanin bundet via sitt N9-kväve till C1-kolet i ribos. Guanosin ingår i RNA, och dess nukleotider har stor betydelse i ämnesomsättningen.
Ribosomalt RNA (rRNA) är den typ av RNA som utgör en viktig komponent i ribosomer, de cellulära organeller där proteinsyntesen sker i levande celler. rRNA-molekyler fungerar som strukturella stommar och katalytiska center för ribosomen, underlättar bindningen av aminosyror och bildandet av peptidbindningar under proteinsyntesen.
Adeninnukleotider är molekyler som består av ribose (en sockerart) och adenin (en näringsrikt aromatisk bas). De två mest förekommande formerna av adeninnukleotider är adenosindifosfat (ADP) och adenosintrifosfat (ATP), som båda spelar viktiga roller i cellens energiproduktion och energiöverföring. ATP, den energirikaste formen av adeninnukleotid, fungerar som en direkt källa till energibehov i celler genom att släppa ifrån sig ett fosfatgrupp (i en reaktion katalyserad av ATPas) och omvandlas till ADP. Energin frigjord i denna process används för att driva andra celulära processer som kräver energi, såsom muskelkontraktioner, transport över cellmembran och syntes av andra molekyler. ADP kan sedan regenereras tillbaka till ATP
En grupp enzym som katalyserar hydrolys av difosfatbindningarna i sådana föreningar som nukleosiddi- och trifosfat och i sulfonylbärande anhydrider såsom adenylylsulfat. EC 3.6.
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl bär en specifik aminosyra, och under proteinsyntesen matchas varje tRNA med en komplementär mRNA-sekvens (ett kodon) i ribosomen för att korrekt infoga den rätta aminosyran i den nya peptidkedjan som byggs upp.
En grupp enzymer som katalyserar DNA-mallstyrd förlängning av 3'-änden av en RNA-sträng med en nukleotid åt gången. De kan initiera en helt ny sträng. Hos eukaryoter har tre former av enzymet kunnat särskiljas utifrån känslighet för alfa-amanitin och den typ av RNA som syntetiseras. EC 2.7.7.6.
Ett antibiotikum som isolerades från Streptomyces venequelae i 1947, men som nu framställs syntetiskt. Det har förhållandevis enkel struktur och var det första bredspektrumpreparat som upptäcktes. Det har sin verkan genom att störa den bakteriella proteinsyntesen och är huvudsakligen bakteriostatiskt.
En klass enzymer som katalyserar bindning mellan två substratmolekyler, i förening med hydrolys av en pyrofosfatbindning i ATP eller liknande energigivare. EC 6.
Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.
De processer genom vilka cytoplasmatiska eller intercellulära faktorer inverkar på differentieringsstyrningen av genaktiviteten hos bakterier.
Proteiner förekommande hos någon bakterieart.
Den genetiska massan hos bakterier.
Guanosin 5'-(tetravätetrifosfat), en guaninnukleotid som innehåller tre fosfatgrupper, förestrade till sockerdelen.
Guanosin-5'-(trivätedifosfat), monoanhydrid med tiofosforsyra, är en stabil GTP-analog med en rad fysiologiska verkningar, så som stimulering av guaninnukleotidbindande proteiner, hydrolys av fosfoinositid, ackumulering av cykliskt AMP och aktivering av specifika protoonkogener.
Genetisk transkription är ett biologiskt process där DNA-sekvensen kopieras till en mRNA-sekvens (meddelande RNA) med hjälp av enzymet RNA-polymeras, vilket möjliggör syntesen av proteiner.
Varje påvisbar och ärftlig förändring i det genetiska materialet som medför ändrad genotyp och som överförs till dotterceller och efterföljande generationer.
Ett enzym som aktiverar lysin med dess specifika tRNA. EC 6.1.1.6.
Pyrophosphatases are enzymes that catalyze the hydrolysis of pyrophosphate (PPi) into two phosphate (Pi) molecules. This reaction helps to drive various biochemical processes in the cell by lowering the energy barrier and making them thermodynamically favorable. In a single definition, Pyrophosphatases can be described as:
Guanosine monophosphate (GMP) är en nukleotid som består av en fosfatgrupp, sockermolekylen ribosa och nucleobasen guanin. GMP är en viktig bestanddel i DNA och RNA, och fungerar också som en signalkemikalie inom celler. Det spelar en central roll i energitransporten inom celler genom att vara en komponent i molekylen ATP (adenosintrifosfat). GMP kan också verka som neurotransmittor och ha betydelse för blodkärlsfunktionen.
Nukleotidyltransferaser är en grupp enzymer som katalyserar överföringen av nukleotider från nucleosidtriphosphat till en acceptor, ofta en annan nukleotid eller en nukleinsyra. Detta process involverar att enzymet hydrolyserar en fosfatbindning i det donerade nukleosidtriphosphatet och etablerar en ny bindning mellan den frigjorda fosfatgruppen och acceptorn, vilket resulterar i en längre polymer. Nukleotidyltransferaser spelar därför en viktig roll i syntesen av nukleinsyror, såsom DNA och RNA.
Tryptophan-tRNA-ligase (Trp-tRNL) er ein enzym i cellene sine som katalyserer reaksjonen mellom aminosyran tryptofan og sin specifiske transfer-RNA (tRNA). Dette resulterer i dann av tryptofan-tRNAs, som er nødvendig for inkludering av tryptofan i proteinsyntesen.
Suramin är ett medically used antiparasitärt läkemedel, som primärt används för behandling av sjukdomen "Trypanosomiasis" (African sleeping sickness), som orsakas av parasiten Trypanosoma brucei. Suramin fungerar genom att störa parasitens metabolism och dess förmåga att replikera. Det bör noteras att användning av suramin är begränsad på grund av potentialen för allvarliga biverkningar, och det ska endast preskrivas och användas under en läkares övervakning.
'Purinergic P2X Receptor Antagonists' are a class of pharmaceutical compounds that block the activation of P2X receptors, which are ligand-gated ion channels found in various tissues throughout the body. These receptors are activated by purinergic signaling molecules such as ATP and ADP, and play important roles in a variety of physiological processes, including neurotransmission, inflammation, and pain perception.
Guanosin 5'-(trivätedifosfat). En guaninnukleotid med två fosfatgrupper som förestrats till sockerdelen. Synonymer är GRPP och guanosinpyrofosfat.
P2-receptorer är en typ av receptorer som binder adenosintrifosfat (ATP) och andra nukleotider. De är G-proteinkopplade receptorer och delas in i två undergrupper, P2Y-receptorer och P2X-receptorer. P2Y-receptorerna är metaboliskt sensitiva och aktiveras av nukleotider som ATP, ADP, UTP och UDP, medan P2X-receptorerna är jonkanaler som aktiveras av ATP. P2-receptorer spelar en viktig roll i regleringen av flera fysiologiska processer, såsom smärta, inflammation, blodtryck och excitation-kontraktionskoppling i hjärtat och skelettmusklerna.
Purinergic P2X receptors are a type of ligand-gated ion channel that are activated by the binding of extracellular ATP (adenosine triphosphate) and other purinerglic agonists. These receptors play important roles in various physiological processes, including neurotransmission, pain perception, and immune response. Upon activation, P2X receptors allow for the flow of cations such as calcium, sodium, and potassium across the cell membrane, which can lead to changes in membrane potential and downstream signaling events. There are seven subtypes of P2X receptors (P2X1-7) that differ in their pharmacological properties, distribution, and functions.
'Purinergic P2Y Receptor Agonists' are substances that bind and activate purinergic P2Y receptors, which are a type of G-protein coupled receptors found on the cell membrane. These receptors are activated by endogenous nucleotides such as ATP (Adenosine triphosphate), ADP (Adenosine diphosphate), UTP (Uridine triphosphate) and UDP (Uridine diphosphate). Activation of P2Y receptors plays a role in various physiological processes, including platelet aggregation, smooth muscle contraction, neurotransmission, and inflammation. Synthetic P2Y receptor agonists are used in research and therapeutics to understand the function of these receptors and to develop potential treatments for various diseases.
"Uracilnukleotider" är en typ av nukleotider som innehåller den nucleobasen uracil. De förekommer naturligt i RNA, men inte i DNA där thymin används istället. Uracilnukleotider bygger upp strukturen hos enskilda nukleotider i en RNA-molekyl, tillsammans med en pentos (ribos) sockerstruktur och en fosfatgrupp.
RNA Cap Analogs are synthetic molecules that mimic the structure of the 5' cap found on eukaryotic messenger RNAs (mRNAs). The 5' cap is a modified guanine nucleotide that is linked to the first nucleotide of the mRNA through a triphosphate bridge. This structure plays a crucial role in various aspects of mRNA metabolism, including protection from exonucleolytic degradation, promotion of splicing, and initiation of translation. RNA Cap Analogs are used in research to study these processes and as components of therapeutic agents, such as gene therapy vectors and vaccines.
'Purinergic P2 receptor agonists' are substances that bind and activate purinergic P2 receptors, which are a type of cell surface receptor that respond to extracellular nucleotides such as ATP and ADP. These agents are used in medical research and therapy to stimulate various physiological responses, including smooth muscle contraction, platelet aggregation, and neurotransmission, depending on the specific P2 receptor subtype they target.
Adenosin-5´-(tetravätetrifosfat). En adeninnukleotid innehållande tre fosfatgrupper som förestrats till en sockerdel. Adenosintrifosfat har en betydande roll i ämnesomsättningen och som neurotransmitt or.
I en enkel medicinsk kontext, kan polyfosfater definieras som långa kedjor av fosfatgrupper som förekommer naturligt inom levande organismer, däribland bakterier och svampar. De har visats kunna spela en roll i biologiska processer såsom cellväxt, celldelning och stresthantering. I vissa medicinska tillämpningar kan polyfosfater användas för att påverka dessa processer, exempelvis inom forskning kring bakteriell infektion och cellförökning.
Ett enzym som aktiverar fenylalanin med specifikt tRNA. EC 6.1.1.20.
En fosfodiesteras är ett enzym som bryter ned specifika fosfatesterbindningar, vanligtvis i molekyler såsom nucleotider och nukleotidföreningar, vilket resulterar i frisättning av fosfatgrupper.
Spjälkning av ett kemiskt ämne genom tillägg av en vattenmolekyl.