Retortamonadidae är en familj inom protozoerna som tillhör ordningen Retortamonadida och innehåller små, äggformade parasiter som lever i tarmen hos däggdjur och amfibier. Dessa organismers cellkroppar saknar mitokondrier och har två korta, baktillböjda flageller som används för att röra sig framåt. Retortamonadidae innefattar bland annat släktena Retortamonas och Spironucleus, vilka kan orsaka diarré och andra tarmrelaterade sjukdomar hos värddjuren.