Una familia de enzimas reparadoras de ADN que reconocen las bases de nucleótidos dañados y los remueven por hidrolización del vínculo N-glicosídico que los adhiere a la médula del azúcar de la molécula de ADN. El proceso llamado REPARACION DE EXCISION BASE puede ser completada por ADN-(SITIO APURINICO O APIRIMIDINICO) LIASA el cual extirpa el azúcar RIBOSA sobrante del ADN.

Clase de enzimas implicadas en la hidrólisis de los enlaces N-glicosídicos de los azúcares unidos al nitrógeno.

Una enzima reparadora de ADN que es una N-glicosil hidrolasa con especificidad para residuos de ADN-conteniendo anillo-abierto N(7)-metilguanina.

Una enzima que cataliza un clivaje endonucleolítico cerca de DIMEROS DE PIRIMIDINA para producir productos 5'-fosfato. La enzima actúa en el cable dañado del ADN desde el lado 5' del sitio dañado.

Enzima que cataliza la HIDRÓLISIS del enlace N-glicosídico entre el esqueleto de azúcares y fosfatos y el residuo URACILO durante la síntesis de ADN.

Una enzima que remueve bases de TIMINA y URACILO dispares con GUANINA a través de hidrólisis de sus enlaces N-glicosídicos. Estos nucleótidos impares generalmente ocurren a través de DESAMINACION hidrolítica de 5-METILCITOSINA a la timina.

La reconstrucción de una molécula de ADN de doble cadena continua sin defectos a partir de una molécula contenida en regiones dañadas. Los principales mecanismos de reparación son la reparación por extirpación, en la que las regiones defectuosas en una cadena son extirpadas y resintetizadas usando la información complementaria de pareamento de las bases que está en la cadena intacta.

Enzima de reparación del ADN que cataliza la escisión de los residuos de ribosa en los sitios de ADN apurínicos y apirimidínicos que pueden resultar de la acción de los ADN GLICOSILASAS. La enzima cataliza una reacción de beta-eliminación en el cual el enlace COP 3 'al sitio apurínico o apirimidínico en el ADN se rompe, dejando un azúcar insaturado 3'-terminal y un producto con un terminal 5'-fosfato. Esta enzima fue listada anteriormente bajo EC 3.1.25.2.

Compuestos basados en la imidazolindiona. Algunos derivados son ANTICONVULSIVANTES.

5-Hidroximetil-6-metil- 2,4-(1H,3H)-pirimidinodiona. Derivado del uracilo utilizado en combinación con antibióticos tóxicos para disminuir su toxicidad; también estimula la leucopoyesis y la inmunidad. Sinónimos: pentoksil; hidroximetilmetiluracil.

Un componente de ácido nucleico, específicamente una base nitrogenada pirimidínica presente en ARN pero no en ADN. (Fuente: Stedman's Medical Dictionary)

Enzima que cataliza la escisión endonucleolítica de enlaces fosfodiéster en los sitios purínicas o apirimidínicos (sitios AP) para producir como productos finales 5'-Phosphooligonucleotidos. La enzima prefiere un solo ADN inmovilizado (ssADN) y fue anteriormente clasificado como EC 3.1.4.30.

La guanina es una base nitrogenada presente en los nucleótidos de ARN y ADN, que forma un par de bases con la citosina mediante tres enlaces de hidrógeno.

Enzimas que catalizan la ruptura de un enlace carbono-oxígeno por medios ajenos a la hidrólisis o la oxidación. EC 4.2.

Grupo de enzimas que catalizan la segmentación endonucleolítica del ADN. Incluyen miembros de EC 3.1.21.-, EC 3.1.22.-, EC 3.1.23.- (ENZIMAS DE RESTRICCION DEL ADN), EC 3.1.24. (ENZIMAS DE RESTRICCION DEL ADN). y EC 3.1.25.-.

Lesiones en el ADN que introducen distorsiones de su estructura normal intacta y que puede, si no se restaura, dar lugar a una MUTACIÓN o a un bloqueo de la REPLICACIÓN DEL ADN. Estas distorsiones pueden estar causadas por agentes físicos y químicos y se producen por circunstancias introducidas, naturales o no. Estas incluyen la introducción de bases ilegítimas durante la replicación o por desaminación u otra modificación de las bases; la pérdida de una base del ADN deja un lugar abásico; roturas de filamentos únicos; roturas de filamentos dobles; intrafilamentoso (DÍMEROS DE PIRIMIDINA) o uniones cruzadas interfilamentosas. El daño con frecuencia puede ser reparado (REPARACIÓN DEL ADN). Si el daño es grande, puede inducir APOPTOSIS.

Orden de metágenos anaerobios en el reino EURYARCHAEOTA. Tienen forma de pseudosarcina, cocoide o bastoncillos envueltos en vainas y catabolizan a grupos metilo. Las paredes celulares están compuestas de proteínas. El orden incluye una familia, METHANOCOCCACEAE.

Unión covalente de un grupo alquilo a un compuesto orgánico. Puede ocurrir por reacción de simple adición o por sustitución de otro grupo funcional.

La timina es una nucleobase pirimidínica que forma parte de los nucleótidos que constituyen el ADN, donde se empareja específicamente con la adenina mediante dos enlaces de hidrógeno.

Una base pirimidínica que es una unidad fundamental de los ácidos nucleicos.

Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).

Una purina e intermediario del metabolismo de la adenosina y en la formación de ácidos nucleicos mediante la vía de salvamento.

Base de nucleótido metilado encontrado en ADN eucariótico. En ANIMALES, la METILACIÓN DE ADN de CITOSINA para formar 5-metilcitosina se encuentra primariamente en la secuencia palindrómica CpG. En PLANTAS, la secuencia metilada es CpNpGp, en donde N puede ser cualquier base.

Presencia de una base no complementaria en el ADN de doble cadena, causada por desaminación espontánea de la citosina o la adenina. El pareo incorrecto ocurre durante la recombinación homóloga o por errores en la replicación del ADN. Múltiples errores secuenciales de apareamiento llevan a la formación de un heterodúplex de ADN (ÁCIDOS NUCLEICOS HETERODÚPLEX).

Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.

Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).

Una base púrica y unidad fundamental de los NUCLEÓTIDOS DE ADENINA.

Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.

Enzima de reparación del ADN que cataliza la síntesis de ADN durante la reparación de la excisión de bases del ADN. EC 2.7.7.7.

Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.

Grupo de desoxirribonucleótidos (hasta 12) en los que los residuos de fosfato de cada desoxirribonucleótido actúan como puentes en la formación de uniones diéster entre las moléculas de desoxirribosa.

Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.

Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.

Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.

Polímero constituido por pocos nucleótidos (de 2 a 20). En genética molecular, secuencia pequeña sintetizada para igualar a una región donde se sabe que ocurre una mutación y luego usada como detector (SONDA DE OLIGONUCLEÓTIDO). (Dorland, 28a ed)

La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.

El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.

Familia de THERMOPROTEALES constituida por bacilos rígidos de longitud variable y sin septum. Crecen quemolitoautotróficamente o por respiración sulfurosa. Los cuatro géneros son: PYROBACULUM, THERMOPROTEUS, Caldivirga y Thermocladium (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).

Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.

Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.

Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.

Productos de reacciones químicas que conllevan la adición al ADN de grupos químicos exógenos.

Compuestos con un anillo de 5 miembros de cuatro carbonos y un oxígeno. Son heterociclos aromáticos. La forma reducida es el tetrahidrofurano.

Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.

Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.

Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.

Alteración del equilibrio prooxidante-antioxidante en favor del primero, que conduce a daños potenciales. Los indicadores de estrés oxidativo incluyen bases de ADN dañadas, productos de oxidación de las proteínas, y de peroxidación de lípidos.

Adición de grupos metilo al ADN. Las metiltransferasas ADN (metilasas DNA) metilasas realizan esta reacción utilizando S-ADENOSILMETIONINA como donante del grupo metilo.

Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.

Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.

Un grupo de amidas con la fórmula general R-CONH2.

Un grupo de compuestos que consisten en una parte de dos anillos que comparten un átomo (por lo general un carbono) en común.

Imines are organic compounds containing a functional group with the general structure RR'C=NR'', where R, R' are organic residues and NR'' is an organic amino group. (Definición aproximada)

Molécula de adenosina que puede sustituirse en cualquier posición, pero que no posee un grupo hidroxilo en la parte de ribosa de la molécula.