Acetiltransferasas
Histona Acetiltransferasas
Enzimas que catalizan la transferencia del grupo acilo desde el ACETIL-CoA a las HISTONAS formando CoA y acetil-histonas.
Factores de Transcripción p300-CBP
Familia de histona-acetiltransferasas que se relaciona estructuralmente con la PROTEÍNA DE UNIÓN A CREB y con la PROTEÍNA P300 ASOCIADA A E1A. Funcionan como coactivadores transcripcionales formando puentes entre los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN de unión al ADN y la maquinaria de transcripción basal. Modifican también los factores de transcripción y la CROMATINA a través de la ACETILACIÓN.
Acetiltransferasas N-Terminal
Enzimas que catalizan la transferencia de un grupo de acetilo, por lo general de la ACETILCOENZIMA A, a la N-terminal de una cadena de péptidos.
Carnitina O-Acetiltransferasa
Proteína de Unión a CREB
Miembro de la familia de los factores de transcripción p300-C8P que fue identificado inicialmente como molécula de unión de la PROTEÍNA DE UNIÓN A LOS ELEMENTOS DE RESPUESTA AL AMPc. Las mutaciones en la proteína de unión a CREB se asocian al SÍNDROME DE RUBINSTEIN-TAYBI.
Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Proteína p300 Asociada a E1A
Miembro de los factores de transcripción p300-CBP que fue identificado originalmente como molécula de unión de las PROTEÍNAS E1A DE ADENOVIRUS.
Acetiltransferasa E N-Terminal
Subtipo de acetiltransferasa N-terminal que consiste en la subunidad catalítica Naa50p y las subunidades catalíticas Naa10p y Naa15p. Tiene especificidad por la METIONINA N-terminal de péptidos en donde el siguiente aminoácido en la cadena es hidrófobo.
Histona Desacetilasas
Deacetilasas que separan grupos N-acetil de las cadenas aminósidas de los aminoácidos de HISTONAS. La familia de enzimas pueden dividirse en al menos tres subclases estructuralmente definidas. La clase I y la clase II de desacetilasas utilizan un mecanismo dependiente de zinc. Las sirtuinas son histona deacetilasas que pertenecen a la clase III y son enzimas dependientes de NAD.
Acetilcoenzima A
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Acetiltransferasa A N-Terminal
Subtipo de acetiltransferasa N-terminal que consiste en la subunidad catalítica Naa10p y en la subunidad auxiliar Naa15p. La estructura de esta enzima es conservada entre eucariotas inferiores y superiores. Tiene especificidad por la SERINA N-terminal; ALANINA; TREONINA; GLICINA; VALINA y residuos de CISTINA y actúa sobre las cadenas de péptido nacientes después de la eliminación de la METIONINA iniciadora mediante las METIONIL AMINOPEPTIDASAS.
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Ácidos Anacárdicos
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Transactivadores
Arilamina N-Acetiltransferasa
Enzima que cataliza la transferencia de grupos acetil desde el ACETIL COENZIMA A a las arilaminas. También puede catalizar la transferencia de acetil entre arilaminas sin COENZIMA A y tiene una gran especificidad por las aminas aromáticas, incluida la SEROTONINA. Sin embargo, la arilamina N-acetiltransferasa no debería confundirse con la enzima N-ACETILTRANSFERASA DE ARILALQUILAMINA, también conocida como SEROTONINA ACETILTRANSFERASA.
Inhibidores de Histona Desacetilasas
Compuestos que inhiben la HISTONA DESACETILASAS. Esta clase de fármacos puede influir en la expresión génica al aumentar el nivel de histonas acetiladas en dominios específicos de la CROMATINA.
Secuencia de Aminoácidos
Proteínas Nucleares
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Especificidad por Sustrato
Transcripción Genética
Proteínas de Ciclo Celular
Proteínas que controlan el CICLO DE DIVISIÓN CELULAR. Esta familia de proteínas incluye una gran variedad de clases, entre las que se encuentran las CINASAS DEPENDIENTES DE LA CICLINA, cinasas activadas por mitógenos, CICLINAS y FOSFOPROTEÍNA FOSFATASAS, así como sus presuntos sustratos, como las proteínas asociadas a la cromatina, las PROTEÍNAS DEL CITOESQUELETO y los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN.
Activación Transcripcional
Procesos que estimulan la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de un gen o conjunto de genes.
N-Acetiltransferasa de Aminoácidos
Procesamiento Proteico-Postraduccional
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Unión Proteica
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
Saccharomyces cerevisiae
Histona Desacetilasa 1
Un subtipo de histona desacetilasa que está a lo largo de la HISTONA DESACETILASA 2; PROTEÍNA 4 DE UNIÓN A RETINOBLASTOMA; y PROTEÍNA 7 DE UNIÓN A RETINOBLASTOMA como componentes centrales de los complejos de histona desacetilasa.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Regiones Promotoras Genéticas
Homología de Secuencia de Aminoácido
Alcanos
Nucleosomas
Chaperonas de Histonas
Histona Desacetilasa 2
Un subtipo de la histona desacetilasa que se encuentra junto con las HISTONAS DESACETILASAS 1; RETINOBLASTOMA PORTADOR DE PROTEÍNA 4 ; y RETINOBLASTOMA PORTADOR DE PROTEÍNA 7 como componentes núcleos de los complejos histona desacetilasa.
Mutación
Ensamble y Desensamble de Cromatina
Los mecanismos que efectúan el establecimiento, mantención y modificación de la conformación física específica de la CROMATINA determinando la accesibilidad o inaccesibilidad transcripcional del ADN.
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Proteínas E1A de Adenovirus
Coactivador 2 del Receptor Nuclear
Factor de transcripción que se asocia a un ligando unido a RECEPTORES DE GLUCOCORTICOIDES y RECEPTORES DE ESTRÓGENOS para estimular la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA. Tiene un papel importante en la FECUNDIDAD así como en el METABOLISMO de los LÍPIDOS.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Regulación Enzimológica de la Expresión Génica
Proteínas de Unión al ADN
Línea Celular
Células HeLa
Proteínas Cromosómicas no Histona
Nucleoproteínas, que en contraste con las HISTONAS, son insolubles en ácido. Participan en las funciones cromosómicas; por ejemplo, se unen selectivamente al ADN, estimulan la transcripción que produce la síntesis de ARN específico de los tejidos y sufre cambios específicos en respuesta a distintas hormonas o fitomitógenos.
Dominio Catalítico
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Inhibidores Enzimáticos
Secuencia de Bases
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Pruebas de Precipitina
Sitios de Unión
Biocatálisis
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Epigénesis Genética
El proceso genético por el cual el organismo adulto es formado por incrementos graduales en complejidad de estructuras como opuesto a un simple incremento en el tamaño de estructuras preexistentes. Incluye esos mecanismos que causan represión o de-represión selectiva del gen que restringen los posibles destinos de las células y eventualmente llevan a su estado de diferenciación.
Regulación de la Expresión Génica
Proteína-Arginina N-Metiltransferasas
Enzima que cataliza la metilación de residuos de arginina de las proteínas, para formar N-mono- y N,N-dimetilarginina. Esta enzima se encuentra en muchos órganos, principalmente en el cerebro y el bazo.
Modelos Moleculares
Productos del Gen tat
Factores de transcripción que actúan en trans y son producidos por retrovirus, como el VIH. Son proteínas nucleares cuya expresión es necesaria para que la replicación vírica. La proteína tat estimula la síntesis de ARN guidada por la REPETICIÓN TERMINAL LARGA de proteínas víricas reguladoras y estructurales. Tat es la abreviatura de trans-activación de la transcripción.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Aminoglicósidos
Metilación
Adición de grupos metilo. En histoquímica, la metilación se usa para esterificar grupos sulfato tratando cortes de tejido con metanol caliente en presencia de ácido clorhídrico. (Stedman, 25a ed)
Proteínas Quinasas
ARN Polimerasa II
Silenciador del Gen
Productos del Gen tat del Virus de la Inmunodeficiencia Humana
Western Blotting
Identificación de proteínas o péptidos que se han separado por electroforesis por blotting y luego se han transferido a tiras de papel de nitrocelulosa . Los blots se detectan entonces con el uso de anticuerpos radiomarcados.
Catálisis
Isoenzimas
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Clonación Molecular
Péptidos
Miembros de la clase de compuestos formados por AMINOÁCIDOS unidos por enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes en estructuras lineales, ramificadas o cíclicas. Los OLIGOPÉPTIDOS están compuestos por aproximadamente 2-12 aminoácidos. Los polipéptidos están compuestos por aproximadamente 13 o mas aminoácidos. Las PROTEINAS son polipéptidos lineales que normalmente son sintetizadas en los RIBOSOMAS.
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Plásmidos
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Genes Reporteros
Transfección
Células 3T3
Líneas celulares cuyo procedimiento original de crecimiento consistia en seren transferidas (T) a cada 3 días e placadas a 300.000 células por placa (cápsula o disco de Petri). Las líneas se desarrollaron utilizando varias cepas diferentes de ratones. Los tejidos son generalmente fibroblastos derivados de embriones de ratones pero otros tipos y fuentes también ya fueron desarrollados. Las líneas 3T3 son sistemas de hospederos in vitro valiosos para los estudios de transformación de virus oncogénicos ya que las células 3T3 poseen una elevada sensibilidad a la INIBICION DE CONTACTO.
Células COS
LÍNEA CELULAR derivada de la línea celular CV-1 mediante transformación con una replicación producida por un mutante incompleto del VIRUS 40 DE LOS SIMIOS, que codifica un largo antigeno T de tipo salvaje (ANTIGENOS TRANSFORMADORES DE POLIOMAVIRUS). Son usados para transfección y clonación. (La línea celular CV-1 ha sido derivada del riñón de un mono verde africano adulto macho (ERCOPITHECUS AETHIOPS)).
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Inmunoprecipitación
Interferencia de ARN
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
Daño del ADN
Lesiones en el ADN que introducen distorsiones de su estructura normal intacta y que puede, si no se restaura, dar lugar a una MUTACIÓN o a un bloqueo de la REPLICACIÓN DEL ADN. Estas distorsiones pueden estar causadas por agentes físicos y químicos y se producen por circunstancias introducidas, naturales o no. Estas incluyen la introducción de bases ilegítimas durante la replicación o por desaminación u otra modificación de las bases; la pérdida de una base del ADN deja un lugar abásico; roturas de filamentos únicos; roturas de filamentos dobles; intrafilamentoso (DÍMEROS DE PIRIMIDINA) o uniones cruzadas interfilamentosas. El daño con frecuencia puede ser reparado (REPARACIÓN DEL ADN). Si el daño es grande, puede inducir APOPTOSIS.
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Espectrometría de Masas
Fenotipo
Eliminación de Secuencia
Relación Estructura-Actividad
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Cristalografía por Rayos X
Subunidades de Proteína
Sustancias Macromoleculares
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.