En allmän benämning på en grupp alifatiska kolväten (Cn-H2n+2). De betecknas med ändelsen -an.

En alkan-1-monooxygenas är ett enzym som katalyserar oxidationen av alkaner till primära alkoholer med en molekyl syre och en reducerande koenzym, ofta NADPH eller NADH. Detta enzym spelar en viktig roll i biologisk oxidation av kolföreningar och finns hos både prokaryota och eukaryota organismer.

En medicinsk definition av "oxygenase" är ett enzym som katalyserar en reaktion där syre (O2) adderas till ett substrat. Detta sker ofta i oxidativ metabolism, såsom i cellandningen där oxygenasen hjälper till att bryta ned molekyler för att frigöra energi.

En stor grupp enzymer som förmedlar oxidations-reduktionsreaktioner där en atom i en syremolekyl binds till det organiska substratet. Den reducerade syreatomen binds med väte och bildar vatten. Enzymerna kallas även monooxygenaser. Dessa reaktioner fordrar två substrat som reduktanter för var och en av de båda syreatomerna. Det finns olika klasser av enzymerna beroende på vilken typ av väteavgivande kosubstrat (koenzymer) som krävs för blandfunktionsoxidationen. EC 1.4 - 1.97.

Ett NADPH-beroende flavinmonooxygenas som har avgörande betydelse i tryptofankatabolismen, genom att katalysera hydroxyleringen av L-kynurenin till 3-hydroxi-L-kynurenin och NADP. EC 1.14.13.9.

Kolväten med gemensam kemisk formel C4H10.

En familj gramnegativa, aeroba bakterier som lever av organiska enkelkolföreningar. De har påvisats i jord och vatten.

En art av Methylococcus som bildar kapslar och har förmåga till autotrof koldioxidfixering.

En stor grupp isoenzymer (hemproteiner) som utgör nyckelkomponenter i det flerfunktionsoxidassystem som dels ansvarar för biosyntesen av steroider, fettsyror och gallsyror, dels bioomvandlingen av många främmande föreningar till mutagena och cancerframkallande ämnen. De flesta däggdjur har ett flertal avlägset besläktade fenobarbitalinducerbara genunderfamiljer. De indelas efter sina sekvensöverensstämmelser snarare än efter sina funktioner i CYP-genfamiljer (>40% homologi) och underfamiljer (>59% homologi). CYP1-, CYP2- och CYP3-genfamiljerna står för större delen av läkemedelsmetabolismen. EC 1.13.-.

En kedja av processer genom vilka levande organismer bryter ned miljöföroreningar, organiskt avfall, bekämpningsmedel samt implanterade material.

Pseudomonas är ett släkte gramnegativa, aeroba stavformade bakterier, vanligtvis icke-sporbildande, som förekommer vitt spridd i naturen, särskilt i fuktiga miljöer. Några arter av släktet Pseudomonas kan orsaka infektioner hos människor och djur, framför allt Pseudomonas aeruginosa, som är känd för sin förmåga att utveckla antibiotikaresistens och orsaka livshotande sjukdomar, särskilt hos immunförsvagna individer.

Petroleum är ett samlingsnamn för naturligt förekommande, icke vattenlösliga kolväteföreningar som utvinns ur underjordiska reservoarer, ofta i form av olja och naturgas. Petroleum innehåller en rad olika kolväten, bland annat alifatiska, aromatiska och cykliska kolväten, samt små mängder svavel-, syre- och kväveföreningar. Det är en viktig råvara för produktion av energibränslen, kemikalier och andra petroleumprodukter som bensin, dieselolja, jetbränsle, asfalt och plast.

"Oxidation-reduction, or redox, refers to a type of chemical reaction where there is a transfer of electrons between two molecules, leading to a change in their oxidation state."

'Rhodococcus' är ett släkte av grampositiva, aeroba och kokusbildande bakterier som förekommer i naturen, främst i jord och vatten. Några arter av Rhodococcus kan orsaka infektioner hos människor, särskilt hos immunsupprimerade individer. Infektioner kan vara subkliniska eller ge upphov till allvarliga sjukdomar som pneumonia, sepsis och abscesser.

En art av Methylosinus som har förmågan att bryta ned trikloretylen och andra organiska miljögifter.

Kemiska föreningar i vilka endast kol och väte ingår (Nationalencyklopedin).

I medicinen refererer 'oktaner' til et mål for modstanden overfor forrådnelsesreaktioner, som kan føre til ustabilitet og skader i celler. Det er specielt anvendt i forbindelse med brændstof i benzin, hvor et højere oktantal betyder mindre tendens til at forrådnelsesreaktioner (knokling) opstår under kompression og antænding. Jo højere oktantal, des bedre motorperformance og -beskyttelse. I en medicinsk kontekst er begrebet 'oktaner' dog mindre relevans.

Ett monooxygenas-hemtiolat (cytokrom P-450) med kamfer bundet till den aktiva platsen. Det verkar som slutmonooxygenas i d-kamfer-monooxygenassystemet, i, och katalysen sker i närvaro av putidaredoxin, putidaredoxinreduktas och molekylärt syre. Enzymet kodas av CAMC-genen och kallas även CYP101. Under anaeroba förhållanden reducerar detta enzym de polyhalogenerade föreningar som bundits till kamferbindningsstället. Det är dessutom det enda cytokrom P-450-enzymet med känd kristallstruktur. Det har kristalliserats ur bakterier. EC 1.14.15.1.

'Rubredoxiner' refererer til en type protein som inneholder en heme-grupp, der kan undergå oxidasjon og reduksjon. De fungerer ofte som elektrontransportører i biokjemiske prosesser, slik som cellulær andning og fotosyntese. Rubredoxiner er viktige for livet på jorda og forekommer i mange levende organismer, fra bakterier til planter og dyr.

Omättade kolväten av typen Cn-H2n, betecknade med ändelsen -en.

Det enklaste, mättade kolvätet (CH4).

Koppling av en hydroxylgrupp till en förening i en position där den inte tidigare funnits.

Propan är ett gasformigt kolväte som består av tre kolatomer och åtta väteatomer (C3H8). Det används som bränsle i bland annat köksspisar, vattenburen värme och generatorer. Propangas är också en biprodukt vid raffineringen av petroleum och naturgas.

'Nitrosomonas' är ett släkte av aerobiska, fria levnadsföringssättet bakterier som oxiderar ammoniak till nitrit under den biologiska nätsprocessen, vilket kallas nittogenes. Dessa bakterier spelar en viktig roll i kvävekretsloppet i miljön. (En: 'Nitrosomonas' is a genus of aerobic, free-living bacteria that oxidize ammonia to nitrite during the biological nitrogen cycle, a process called nitrification.)

En förening av riboflavin och adenosindifosfat. Den är koenzym till olika aeroba dehydrogenaser, t ex D-aminosyraoxidas och L-aminosyraoxidas. Syn. FAD.

"Pseudomonas putida" är en gramnegativ, aerob bakterie som förekommer i naturen, särskilt i fuktiga miljöer som jord, vatten och på planter. Den är känd för sin förmåga att bryta ned en mängd olika organiska ämnen och kan orsaka infektioner hos människor, men detta är sällsynt.

Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.

Ett släkte grampositiva bakterier i familjen Gordoniaceae som isolerats ur jord och sputum från patienter med bröstsjukdomar. Bakterien används för bioomvandling av naturliga ämnen.

1-bensyl-3-(3-dimetylamino)propoxi-1H-indazolmonohydroklorid. Ett smärtstillande, febernedsättande och antiinflammatoriskt medel som används för att minska postoperativa och posttraumatiska smärtor oc h ödem och påskynda läkning. Det används också lokalt för behandling av reumatiska åkommor och inflammationer i mun och svalj.

Tyrosin 3-monooxygenas, även känt som tyrosin hydroxylas, är ett enzym involverat i katekolaminernas syntes i kroppen. Det katalyserar den första steget i syntesen av katekolaminer, såsom dopamin, noradrenalin och adrenalin, genom att konvertera aminosyran tyrosin till L-DOPA (3,4-dihydroxifenylalanin) med hjälp av syre och NADPH som kofaktorer.

Squalen monooxygenase är ett enzym som katalyserar en reaktion där syre adderas till squalen, vilket är en föregångare till kolesterol i kroppen. Denna reaktion är en viktig del av kolesterolsyntesvägen och resulterar i bildandet av ett mellanprodukt kallat 2,3-oxidosqualen.

"Oxidoreduktaser är ett enzym som katalyserar oxidation-reduktionreaktioner, där elektroner överförs från ett molekylärt substrat, det reducerade substratet, till en acceptor, det oxiderade substratet."

Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.

Flavinmononukleotid-reduktas (FMN-reduktas) är ett enzym som reducerar Flavinmononukleotid (FMN) till Flavanodihydrogen (FH2) genom att transfera två väteatomer från NADPH till FMN.

NADPH-ferrihemoproteinreduktase, även känt som NADPH-oxidoreduktas eller NOX, är ett enzym som överför elektroner från NADPH till ferrihemoproteiner och kan reducera dem till ferrohemoproteiner. Detta enzym spelar en viktig roll i cellers förmåga att generera reaktiva syremolekyler, såsom superoxidradikaler, som är involverade i olika fysiologiska processer, inklusive immunförsvar och signaltransduktion.

Dessa enzym katalyserar elimineringen av ammoniak från amidiner, med bildande av en dubbelbindning. EC 4.3.2.

System av enzym som verkar i följd genom att katalysera på varandra följande reaktioner sammankopplade med gemensamma metabola intermediärer. De kan medverka i en enkel omsättning av vattenmolekyler eller väteatomer, eller vara förknippade med stora supramolekylära strukturer som mitokondrier eller ribosomer.

Flaviner är en grupp organiska föreningar som fungerar som prostetiska grupper inom flavoproteiner, vilka är involverade i biologiska oxidations-reduktionsprocesser. Flavinmononukleotid (FMN) och flavinadensindinukleotid (FAD) är två exempel på flaviner som spelar en viktig roll inom cellers metabolism, såsom i andningen och i nedbrytningen av fettsyror, kolhydrater och aminosyror.

En stor grupp aeroba bakterier som färgas rosa (negativ färgning) vid gramfärgning. Detta beror på att de gramnegativa bakterierna har liten mängd peptidoglykan i cellväggen och därför låg affinitet för lila färgämnen och hög affinitet för det rosa färgämnet safranin.

Alcanivoraceae är en familj av gramnegativa, aeroba och encelliga bakterier som tillhör klassen Gammaproteobacteria. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att metabolisera och bryta ned alifatiska kolväten, såsom oljor och hydrokarboner, vilket gör dem viktiga i naturens eget reningssystem av kontaminerade miljöer.

Ett antiseptiskt och desinficerande medel. Det är verksamt mot ett stort antal mikroorganismer, inklusive vissa svampar och virus, men har trög verkan mot sporer. Det har använts som huddesinfektionsmedel och för att lindra klåda.

En färglös och luktfri gas med kemisk formel C2H6.

Trikloretylen är ett organisk halogenkomposto och ett klorerat kolväte, som används som ett allmänt anestetikum inom medicinen för att underhålla och inducerar medvetslöshet under kirurgiska ingrepp.

Toluen, även känd som metylbensen, är ett aromatiskt kolväte som naturligt förekommer i petroleum och kolträsk. Det är en klar, färglös vätska med en distinkt söt doft som liknar bensin. Toluen används ofta som lösningsmedel inom industrin och kan också förekomma i små mängder i luften, vatten och mark efter utsläpp från industriella processer eller förbränning av fossila bränslen. Långvarig exponering för toluen kan orsaka skador på nervsystemet och andra hälsoproblem.

Slutna blåsor av fragmenterat endoplasmatiskt nätverk som bildas när leverceller eller -vävnad säras genom homogenisering. De kan vara släta eller ojämna.

Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.

En familj gramnegativa, metanotrofa bakterier i ordningen Rhizobiales, avlägset besläktade med kvävefixerande och fototrofa bakterier.

Påskyndande av en kemisk reaktion genom medverkan av en särskild reaktorsubstans, katalysator.

Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.

Organiska föreningar av kol och väte, där en eller flera väteatomer ersatts av klor.

I en enskild mening kan "vaxa" i medicinsk kontext definieras som att aktivt introducera ett vaccin i en individ, normalt genom injektion, för att stimulera immunförsvaret att utveckla skydd mot specifika sjukdomar. Vaccinering är en preventiv medicinsk procedur som har räddat miljontals liv och eliminerat eller kontrollerat många dödliga infektionssjukdomar världen över.

Beijerinckiaceae is a family of nitrogen-fixing bacteria within the order Rhizobiales. These bacteria are gram-negative, motile rods that can exist as free-living organisms in soil or as symbionts in root nodules of leguminous plants. They play a crucial role in the global nitrogen cycle by converting atmospheric nitrogen into ammonia, which is a form of nitrogen that plants can use for growth. Some notable genera within this family include Azorhizobium, Beijerinckia, and Methylocella.

Alkylföreningar med en hydroxylgrupp. De klassificeras efter kolatomens förhållande: primära alkoholer (R-CH2OH), sekundära (R2-CHOH), tertiära (R3-COH).

Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.

NADP, eller mer formellt NADP+ (nicotinamidadenindinukleotidfosfat), är ett viktigt koenzym i celler och spelar en central roll i cellers energihushållning och metabolism. Det är ett vattenlösligt koenzym som deltar i redoxreaktioner, det vill säga reaktioner där elektroner överförs mellan molekyler. NADP+ kan acceptera två elektroner och en proton (H+), vilket resulterar i att den reduceras till NADPH.

'Oxidoreduktaser, O-demetylering' refererar till en grupp enzymer som katalyserar oxidationen och reduktionen av molekyler, samt den process där en metylgrupp (-CH3) avlägsnas från en substans genom oxidativ demetylering.

Ett läkemedelsmetaboliserande enzym i lever-, livmoder- och tarmmikrosomer som omsätter 7-alkoxykumarin till 7-hydroxykumarin. Enzymet är beroende av cytokrom P450. EC 1.14.13.- .

"Pseudomonas mendocina" är en gramnegativ, aerob bakterie som normalt förekommer i vatten och jord. Den är en opportunistisk patogen hos människor och kan orsaka infektioner, särskilt hos immunsupprimerade individer.

Fenoler med en eller flera kloratomer i någon position.

Ett släkte gramnegativa bakterier tillhörande familjen Neisseriaceae som förekommer i jord och vatten och med oklar patogenitet.

Kemisk förändring av en exogen substans i ett biologiskt system. Förändringen kan innebära en inaktivering av ämnet eller produktion av en aktiv metabolit från en inaktiv ursprungsförening. Omvandling en kan vara icke-syntetisk (oxidation-reduktion, hydrolys) eller syntetisk (glukuronidbildning, sulfatkonjugation, acetylering, metylering). Metabolisk detoxikation och eliminering räknas också hit.

Den genetiska massan hos bakterier.

Proteiner förekommande hos någon bakterieart.

Föreningar som uteslutande används för acetylering, oxidation och dehydrering, samt för modifiering av proteiner och enzymer.

En flerstegsprocess som omfattar DNA-kloning, mappning, subkloning, sekvensering och analys av data.

Giftiga, klorerade och omättade kolväten, omfattande både 1,1- och 1,2-diklorisomererna. Båda isomerer är giftiga, men 1,1-dikloretylen har kraftigare toxisk verkan på CNS och lever.

"Syrgas" er en sammentrekning av ordene "syre" og "luft", og refererer til den atmosfæriske luften som vi normalt inhalerer, som består av omkring 21% syre (O2), 78% kv nitrogen (N2) og små mengder av andre gasser som argon, kultilkristaller og spor av kullilkristaller. I denne enkelte meningen kan syrgas definieres som den atmosfæriske luft som inneholder 21% syre (O2) som er livsviktig for mennesker og andre levende vesen for å oksidere (forbranne) næringsstoffer for å produsere energi i cellene.

Organiska föreningar av kol och väte med omättad och vanligen hexagonal ringstruktur. Molekylerna kan bestå av en enkel ring, dubbelring, trippelring eller flera sammanfogade ringar.

Organiska föreningar av kol och väte, där en eller flera väteatomer ersatts med halogenatomer.

Färglös gas som framställs genom reaktion mellan vatten och kalciumkarbid. Gasen är brännbar, explosiv och vattenlöslig och används som svetsgas.

En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.

Släktskapsförhållanden mellan grupper av organismer, baserade på deras genuppsättningar.

En uppsättning gener som genom mångfaldigande och variation härstammar från någon ursprunglig gen. Sådana gener kan sitta tillsammans på samma kromosom eller vara utspridda på olika kromosomer. Exempel på multigenfamiljer är de som kodar för hemoglobiner, immunglobuliner, histokompatibilitetsantigener, aktiner, tubuliner, keratiner, kollagener, stressproteiner, salivproteiner, korioproteiner, membranproteiner, ägguleproteiner och faseoliner, och även histoner, ribosom-RNA och tRNA-gener. De tre senare utgör exempel på upprepningsgener, av vilka det finns hundratals identiska i tandemformationer.

"Pseudomonas stutzeri" är en gramnegativ, aerob bakterie som normalt förekommer i vatten- och jordmiljöer. Den är en opportunistisk patogen hos människor och kan orsaka infektioner, särskilt hos immunsupprimierade individer, till exempel lunginflammation, blodförgiftning och hudinfektioner.

Ketoner är en klass organiska ämnen som typiskt består av en karbonylgrupp och två kolvätegrupper. Vid reduktion bildas alkoholer.

En färglös, alkalisk gas. Den bildas i kroppen vid nedbrytning av organiskt material i samband med ett stort antal metaboliskt viktiga reaktioner.

Mikroblåsor som bildas av det endoplasmatiska nätverket när celler brister. De kan isoleras genom differentialcentrifugering och utgörs av tre strukturtyper: ojämna vesiklar, släta vesiklar och ribosomer. Ett flertal enzymatiska processer är förknippade med mikrosomfraktioneringen.

"Pseudomonas fluorescens" är en grampositiv, aerob bakterie som naturligt förekommer i vatten och jordmån. Den är känd för sin förmåga att producera ett blått-grönt fluorescerande pigment under optimala tillväxtförhållanden, men detta är inte alltid synligt. Bakterien kan orsaka infektioner hos människor, framförallt hos immunosupprimierade individer, men den ses sällan som en patogen i kliniska sammanhang. Den kan också vara en förorenare inom livsmedelsindustrin och orsaka fördärv av produkter.

Deoxiribonukleinsyra (arvsmassa) hos bakterier.

En brandfarlig, färglös, flyktig vätska med behaglig eterisk doft. Den är ett allmänt använt lösningsmedel och används som sådant inom farmacin; vid koncentrationer över 80% används den som antiseptis kt medel. Aceton är ett av de ketonämnen som bildas vid ketoacidos, som i diabetes eller vid svält.

Metalliskt grundämne, och tillika spårämne, med kemiskt tecken Cu, atomnummer 29 och atomvikt 63,55. Koppar ingår i hemocyanin, som är syrebärare hos de flesta leddjur.

Enzyminduktion refererar till processen där aktiviteten hos ett enzym ökar som ett resultat av exponering för en inducerande agent. Detta sker vanligtvis genom att induceringsagenten påverkar genuttrycket och/eller syntesen av enzymet, vilket leder till en ökad mängd fungerande enzym i cellen. Enzyminduktion kan ha kliniskt relevans inom områden som farmakologi och toxicologi, eftersom den kan påverka både farmakokinetiken och toxikokinetiken av olika substanser.

8-hydroxikinolinoler, vars nr 5 och/eller 7-kolatomer klorinerats. De har antibakteriell, antiprotozo- och antidiarréverkan, särskilt vid amöbainfektion; även mot seborré har de använts. Preparaten används huvudsakligen lokalt, men också som tillsats i djurfoder. De kan orsaka syn- och andra nervstörningar och ges oftast i kombination med andra medel.

Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.

Fraktionering av ett förgasat prov genom avskiljning mellan en rörlig gasfas och en fast fas i kolonn. Det finns två typer: gas-fastfaskromatografi och gas-vätskekromatografi.

Tryptophanhydroxylase är ett enzym involverat i serotoninsyntesen i kroppen. Det katalyserar den första och rate-limitierande reaktionen, nämligen omvandlingen av aminosyran tryptofan till 5-hydroxytryptofan (5-HTP). Serotonin är en signalsubstans som har betydelse för bland annat sömnbeteende, aptit och stämningsreglering.

I en enkel medicinsk kontext kan 'Agrocybe' definieras som ett släkte av svampar som inkluderar arter som kan producera toxiner som är skadliga för människor och djur om de konsumeras. Ett exempel på en sådan art är Agrocybe aegerita, även känd som poplar mushroom eller black poplar mushroom, som innehåller neurotoxiner som kan orsaka mag-tarmsymtom och neurologiska effekter om den konsumeras i stora mängder. Det är viktigt att notera att inte alla Agrocybe-arter är skadliga för människor, men det finns inga etablerade medicinska användningsområden för dessa svampar.

En grupp polymerer framställda genom polymerisation av någon monomer med oxirangrupp(er).

Den inbördes placeringen av atomer, atomgrupper eller joner i en molekyl, samt antal, typ av och plats för kovalenta bindningar.

Ett i jordskorpan allmänt utbrett metalliskt grundämne. Kemiskt tecken är Fe, atomnummer 26 och atomvikt 55,85. Järn är en väsentlig beståndsdel i hemoglobin, cytokrom och andra komponenter i respiratoriska enzymsystem. Dess främsta funktioner är att transportera syre till vävnader (hemoglobin) och att ingå i cellulära oxidationsförlopp. Uttömning av järnförråden kan leda till järnbristanemi. Järn används för att återuppbygga blodet vid anemi.

Föreningar där en eller fler hydroxylgrupper av glycerol har eterbindning med en mättad eller omättad alifatisk alkohol. En eller två av glycerolhydroxylgrupperna kan vara förestrade. Dessa ämnen har påträffats i olika typer av djurvävnad.

Ett koenzym till ett flertal oxidationsenzymer, inklusive NADH-dehydrogenas. Det utgör den huvudsakliga förekomstformen av riboflavin i celler och vävnader.

Ett flavoprotein som katalyserar syntesen av protokatekusyra (3,4-dihydroxybensoesyra) från 4-hydroxybenzoat i närvaro av molekylärt syre. EC 1.14.13.2.

Teoretiska framställningar som efterliknar kemiska processer eller fenomen. Simuleringarna inkluderar bruk av matematiska beräkningar, datorer och annan elektronisk utrustning.

I den medicinska kontexten refererar "Rhodium" vanligtvis till ett sällsynt ädelmetall som används inom medicinen, specifikt inom den interventionskardiologiska behandlingen av hjärtkranskärlssjukdom. Rhodium-belagda stents är en typ av koronarstent (ett rörliknande stöd) som placeras inuti ett kärl för att hålla det öppet och återställa blodflödet.

Bensoaat-4-monooxygenas är ett enzym som katalyserar oxidationen av bensoaat (parakresol) till 4-hydroxibensoaat, vilket är en metabolit med potentialt giftverkan. Detta enzym finns naturligt i levern hos däggdjur och spelar därför en viktig roll i det metaboliska clearance av bensoaat från kroppen.