Någon av de ligaser som katalyserar den ATP-förmedlade bindningen mellan en aminosyra och en tRNA och därmed aktiverar ett steg i proteinsyntesen. De enskilda enzymen är starkt specifika för en viss a minosyra och dess motsvarande tRNA.
En peptidsyntase är ett enzym som katalyserar reaktioner involverade i skapandet av peptidbindningar mellan aminosyror för att bilda peptider eller proteiner.
Ett enzym som aktiverar lysin med dess specifika tRNA. EC 6.1.1.6.
Organiska föreningar som generellt innehåller en aminogrupp (-NH2) och en karboxylgrupp (-COOH). Tjugo alfaaminosyror är de subenheter som polymeriseras till proteiner.
Ett enzym som aktiverar metionin med dess specifika tRNA. EC 6.1.1.10.
tRNA-aminoacyling, eller tRNA-syrebaseret aminosyreesterifikation, er en biokemisk reaktion, hvor en specifik aminosyre kovalent forbindes med sit tilhørende transfer RNA (tRNA) molekyle. Denne proces katalyseres af enzymer kaldet aminoacyl-tRNAsynthetaser og spiller en essentiel rolle i den centrale dogme for molekylærbiologi, idet den forbinder genetisk information fra DNA og RNA med de relevante aminosyrer under proteinsyntesen. Hvert tRNA-molekyle har et specifikt anticodon, der kan parre sig med en komplementært kodon på mRNA, hvilket sikrer at den korrekte aminosyre bliver indlemmet i det voksende peptidkæde under proteinsyntesen.
Ett enzym som aktiverar isoleucin med dess specifika tRNA. EC 6.1.1.5.
Ett enzym som aktiverar leucin med sitt specifika tRNA. EC 6.1.1.4.
Ett enzym som aktiverar glutaminsyra med sitt specifika tRNA . EC 6.1.1.17.
Valin-tRNA-ligase är ett enzym som katalyserar den sista steget i syntesen av valyl-tRNA, en molekyl som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Valin-tRNA-ligas associerar aminosyran valin med sin specifika transfer-RNA (tRNA) genom att koppla ihop dem med en peptidbindning, vilket möjliggör korrekt tolkning och översättning av genetisk information till proteiner.
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Ett enzym som aktiverar fenylalanin med specifikt tRNA. EC 6.1.1.20.
Serin-tRNA-ligase, även känt som Seryl-tRNAsynthetas, är ett enzym som katalyserar den sista steget i syntesen av serin-tRNA, vilket är en nödvändig komponent i den genetiska koden för proteintranslering. Detta enzym katalyserar kopplingen av aminosyran serin till dess specifika transfer-RNA (tRNA) via en esterbindning. Denna reaktion är viktig för att säkerställa korrekt dekodning och syntes av proteiner i cellen.
Ett enzym som aktiverar asparaginsyra med sitt specifika tRNA. EC 6.1.1.12.
Ett enzym som aktiverar arginin med sitt specifika tRNA. EC 6.1.1.19.
Tyrosyl-tRNA synthetase (Tyr-tRNA ligase) is an enzyme that catalyzes the attachment of tyrosine to its corresponding transfer RNA (tRNA) molecule during protein biosynthesis, ensuring the fidelity of the genetic code.
Enzymer som katalyserar bildandet av acyl-CoA-derivat. EC 6.2.1.
Ett enzym som aktiverar glycin med sitt specifika tRNA. EC 6.1.1.14.
Ett enzym som aktiverar histidin med dess specifika tRNA. EC 6.1.1.21.
Aminoacylation är en biokemisk process där en aminosyra kovalent binds till ett transfer RNA (tRNA) molekyl med hjälp av en aminoacyl-tRNA syntetas. Detta steg är viktigt för den translationella maskineriet, som är ansvarig för att tolka genetisk information och producera proteiner i cellen. Varje tRNA molekyl har en specifik anticodon-sekvens som matchar en komplementär kodon-sekvens på mRNA. När aminoacyleringen sker korrekt säkerställs att rätt aminosyra kopplas till rätt tRNA, och därmed rätt plats i det protein som byggs upp.
Tryptophan-tRNA-ligase (Trp-tRNL) er ein enzym i cellene sine som katalyserer reaksjonen mellom aminosyran tryptofan og sin specifiske transfer-RNA (tRNA). Dette resulterer i dann av tryptofan-tRNAs, som er nødvendig for inkludering av tryptofan i proteinsyntesen.
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl bär en specifik aminosyra, och under proteinsyntesen matchas varje tRNA med en komplementär mRNA-sekvens (ett kodon) i ribosomen för att korrekt infoga den rätta aminosyran i den nya peptidkedjan som byggs upp.
En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.
Treonin-tRNA-ligase (TRS) er ein enzym som katalyserer reaksjonen der treonin blir knyttet til sin specifiske transfer RNA (tRNA), deretter overføres treoninet til ribosomen under translasjonsprosessen for å syntetiserast peptidbindningene i proteiner. Dette enzymet spiller dermed en viktig rolle i den genetiske koden og proteinsyntesen hos levende organismer.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Varje tRNA molekyl innehåller en specifik sekvens av nukleotider, känd som antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodonsekvens på en messenger RNA (mRNA) molekyl.
"Peptidbiosyntese, nukleinsyraoberoende" refererer til en biokemisk proces hvor peptider syntetiseres uten bruk av nukleinsyrer som RNA eller DNA som skabelon. I stedet brukes en ikke-nukleinsyrebasert mekanisme, ofte involverende enzymatiske reaksjoner, for å koble aminosyrer sammen i en bestemt sekvens for å forme et peptidmolekyle. Dette er i kontrast til den mest alminnelige formen av peptidbiosyntese, som er nukleinsyra-avhengig og involverer transskripsjon og translasjon av genetisk informasjon fra DNA via mRNA for å styre peptidsyntesen.
Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.
Ett enzym som aktiverar alanin med sitt specifika tRNA. EC 6.1.1.7.
Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.
Transfer RNA (tRNA) för glutamin (Gln) är ett specifikt RNA-molekyl som transporterar aminosyran glutamin till ribosomen under processen av proteintranslering. Detta sker genom att tRNAMolekylen kopplas till glutamin via en speciell bindning, känd som peptidbindning, i enlighet med den genetiska koden specificerad i mRNA (messenger RNA).
I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.
En sats av tre nukleotider i tRNA som genom komplementär basparbildning förenar sig med en specifik triplett (kodon) i budbärar-RNA under dess translation i ribosomen.
Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.
Betydelsen av bassekvensen i förhållande till hur den översätts till aminosyrasekvens. Början, slutet och ordningsföljden av aminosyrorna i ett protein bestäms av en följd av nukleotidtripletter, benämnda kodoner.
Naturligt förekommande eller experimentellt utbyte av en eller flera aminosyror i ett protein mot en eller flera andra, varvid proteinets funktioner kan bibehållas, förändras eller utebli. Experimente ll substitution används för att studera enzymaktiviteter och bindningsegenskaper.
De reaktiva områden på en makromolekyl som är direkt envolverade i dess specifika sammankoppling med en annan molekyl.
Experimentella eller teoretiska modeller för undersökning av molekylers form, elektroniska egenskaper eller interaktioner. Hit hör även analoga molekyler, datorframställd grafik och mekaniska strukturer.
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl har en specifik sekvens av nukleotider, kallad antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodon (tre nukleotider) på en mRNA-molekyl under translationen.
Varje påvisbar och ärftlig förändring i det genetiska materialet som medför ändrad genotyp och som överförs till dotterceller och efterföljande generationer.
Infogande av en syraradikal i molekylen till en kemisk förening.
"Tertiär proteinstruktur refererar till den tresdimensionella formen och flexibiliteten hos ett protein, som resultat av specifika interaktioner mellan dess sekundära strukturelement, såsom alfa-helixar och beta-skikt."
Tyrocidin är ett peptidantibiotikum som produceras av bakterien Bacillus brevis och består av 16 aminosyror. Det har visat sig vara verksamt mot grampositiva bakterier, men används inte kliniskt på grund av dess toxicitet och svåra farmakokinetiska egenskaper. Tyrocidin fungerar genom att förstöra bakteriens cellmembran, vilket leder till celldöd. Detta gör det effektivt mot många olika sorters grampositiva bakterier, men kan också orsaka skada på andra celler i kroppen.
En essentiell, förgrenad, alifatisk aminosyra som finns i många proteiner. Den är en isomer av leucin, och viktig för hemoglobinsyntesen och regleringen av blodets socker- och energinivåer.
Transfer RNA (tRNA) med koden "Glu" är ett specifikt RNA-molekyl som transporterar aminosyran glutaminsyra till ribosomen during protein synthesis. Tillsammans med mRNA och rRNA, utgör tRNA en väsentlig komponent i den genetiska koden och proteinkapslningens processer.
Proteiner förekommande hos någon bakterieart.
Ett enzym som katalyserar bildandet av CoA-derivat ur ATP, acetat och CoA, varvid fås AMP, pyrofosfat och acetyl-CoA. Det har också verkan på propionat och akrylat. EC 6.2.1.1.