Antikodon
En sats av tre nukleotider i tRNA som genom komplementär basparbildning förenar sig med en specifik triplett (kodon) i budbärar-RNA under dess translation i ribosomen.
RNA, transfer
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl bär en specifik aminosyra, och under proteinsyntesen matchas varje tRNA med en komplementär mRNA-sekvens (ett kodon) i ribosomen för att korrekt infoga den rätta aminosyran i den nya peptidkedjan som byggs upp.
RNA, Transfer, Amino Acyl
Nukleinsyrakonfiguration
I en enkel mening kan "nukleinsyrakonfiguration" referera till den specifika rymden eller position som en nukleotid eller ett baspar tar upp i en nukleinsyra, såsom DNA eller RNA. Detta inkluderar vilken sida av strängen varje nukleotid befinner sig på, och i vilket läge de är rotade. I DNA utgörs konfigurationen ofta av en dubbelhelix med antiparallella strängar, där varje baspar består av en adenin (A) som parar sig med en timin (T), och en guanin (G) som parar sig med en cytosin (C). I RNA är konfigurationen ofta en enkelsträngad helix, där uracil (U) ersätter timin (T) som basparningspartner till adenin (A).
RNA, transfer, Gly
Transfer RNA (tRNA) med koden "Gly" refererar till ett specifikt molekyltarmsband av RNA som är involverat i den genetiska kodenöversättningen vid proteintranslationsprocessen. Specifikt transporterar detta tRNA-molekyl aminosyran glycin (Gly) från aminosyra poolen till ribosomen, där proteinsyntesen sker. Denna process möjliggör byggandet av den korrekta peptidkedjan enligt mRNAs sekvens.
RNA, transfer, Phe
"RNA, transfer, Phe" refers to a specific type of RNA molecule called phenylalanine transfer RNA (tRNA-Phe). In molecular biology, tRNAs are adapter molecules that play a crucial role in protein synthesis. They translate the genetic code present in messenger RNA (mRNA) into the corresponding amino acids to build proteins.
RNA, Transfer, Amino Acid-Specific
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Varje tRNA molekyl innehåller en specifik aminosyra bunden till dess 3'-slut. Denna aminosyra är specificerad av en tresnurra, även kallad anticodon, som finns på den motsatta änden av tRNA:t (5'-slut). Anticodonen matchar komplementärt med mRNAs specifika kodon för att korrekt positionera aminosyran i den växande peptidkedjan under translationsprocessen. Sålunda är "tRNA, aminosyra-specifik" en term som refererar till den specifika aminosyran som är kopplad till varje tRNA-molekyl genom dess tresnurra.
RNA, transfer, Lys
RNA, transfer, Trp
RNA, transfer, Arg
RNA, transfer, Ile
RNA, transfer, Met
Transfer RNA (tRNA) molekyler är en typ av RNA som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl innehåller en specifik sekvens av nukleotider, kallad antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodon (en eller flera tre nucleotid långa sekvenser) på en mRNA-molekyl under processen med proteinsyntes.
RNA, transfer, Ser
Transfer RNA serine (tRNASer) är ett specifikt transfer RNA-molekyl som transporterar aminosyran serin till ribosomen during protein synthesis. Det finns två former av tRNASer, som skiljer sig åt beroende på vilken variant av serin de binder till: den ena binder till den L-formen av serin och den andra binder till den D-formen av serin. Transfer RNA är en sorts RNA-molekyl som hjälper till att översätta genetisk kod från DNA till proteiner under processen med protein syntes.
Bassekvens
Kodon
En uppsättning av tre nukleotider i en proteinkodningssekvens som anger de enskilda aminosyrorna eller en termineringssignal (terminatorkodon). De flesta kodon är universella, men vissa organismer producerar inte transfer-RNA, som utgör komplement till alla kodon. Sådana kodon kallas obestämda (nonsenskodon).
RNA, transfer, Tyr
Nukleosid Q
RNA, transfer, Asp
Transfer RNA (tRNA) Asp refers to a specific type of transfer RNA molecule that is involved in the process of protein synthesis and carries the amino acid aspartic acid (Asp). Transfer RNA molecules are responsible for translating the genetic code contained within messenger RNA (mRNA) into the corresponding amino acids, which are then linked together to form proteins. Each type of tRNA has a unique anticodon sequence that allows it to recognize and bind to a specific codon on the mRNA, and it also has a binding site for its corresponding amino acid. In the case of tRNA Asp, its anticodon recognizes and binds to one or more of the mRNA codons that specify aspartic acid (GAC, GAT), and it carries an aspartic acid molecule in its binding site.
RNA, transfer, Glu
Pseudouridin
Pseudouridin (Ψ) är en modifierad nukleosid som förekommer naturligt i RNA. Det bildas genom en isomerisering av uridin, där den cykliska sockermolekylen omvandlas från en furanosform till en pyranform. Denna modifikation påverkar RNAs stabilitet, struktur och funktion, och förekommer i alla livsformer.
Aminoacyl-tRNA-syntetaser
RNA, transfer, Pro
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl har en specifik sekvens av nukleotider, kallad antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodon (tre nukleotider) på en mRNA-molekyl under translationen.
RNA, transfer, Cys
RNA, transfer, Leu
Transfer RNA leucine (tRNA-Leu) är ett specifikt ämne inom biokemi och molekylärbiologi som är en del av den genetiska koden och proteinsyntesen i celler. Transfer RNA (tRNA) är en typ av RNA-molekyler som transporterar aminosyror till ribosomen under processen att bygga upp proteiner enligt den genetiska koden specificerad i mRNA (messenger RNA).
Kolibakterie
Suppression, genetisk
"Genetic suppression refers to the process by which the expression of a specific gene is reduced or prevented, often through various molecular mechanisms such as epigenetic modifications, RNA interference, or mutations in regulatory elements. This can be used as a strategy to study gene function, or to counteract the effects of deleterious mutations in genetic disorders."
RNA, transfer, Thr
Transfer RNA (tRNA) Thr refererar till en specifik typ av tRNA-molekyl som transporterar en aminosyra, den specifika är threonin, till ribosomen under proteinsyntesen i cellen. Tillsammans med mRNA och rRNA utgör tRNA de viktigaste komponenterna av det molekylära maskineriet som bygger proteiner enligt genetisk information kodad i DNA:t. Varje typ av tRNA har en unik sekvens av nukleotider, en anticodon-sekvens, som matchar en specifik kodonsekvens på mRNA, och en aminosyra som den binder till via en esterbindning. På det sättet hjälper tRNAThr till att översätta genetisk information från DNA till en proteinsekvens med aminosyror under processen som kallas translation.
RNA, transfer, Gln
Transfer RNA (tRNA) för glutamin (Gln) är ett specifikt RNA-molekyl som transporterar aminosyran glutamin till ribosomen under processen av proteintranslering. Detta sker genom att tRNAMolekylen kopplas till glutamin via en speciell bindning, känd som peptidbindning, i enlighet med den genetiska koden specificerad i mRNA (messenger RNA).
tRNA-aminoacylering
tRNA-aminoacyling, eller tRNA-syrebaseret aminosyreesterifikation, er en biokemisk reaktion, hvor en specifik aminosyre kovalent forbindes med sit tilhørende transfer RNA (tRNA) molekyle. Denne proces katalyseres af enzymer kaldet aminoacyl-tRNAsynthetaser og spiller en essentiel rolle i den centrale dogme for molekylærbiologi, idet den forbinder genetisk information fra DNA og RNA med de relevante aminosyrer under proteinsyntesen. Hvert tRNA-molekyle har et specifikt anticodon, der kan parre sig med en komplementært kodon på mRNA, hvilket sikrer at den korrekte aminosyre bliver indlemmet i det voksende peptidkæde under proteinsyntesen.
RNA, transfer, Ala
RNA, transfer, Val
Transfer RNA (tRNA) med valin som sin specifika aminosyra är ett små molekyler av RNA som transporterar specifika aminosyror till ribosomer under processen av proteintranslering. Varje typ av tRNA har en unik tre nukleotider lång sekvens, känd som anticodon, som komplementärt parar sig med mRNAs komplementära codon för att korrekt införa valinaminosyran i den syntetiserade peptidkedjan.
Isopentenyladenosin
Molekylsekvensdata
Genetisk kod
Tiouridin
Tiouridin är ett derivat av pyrimidin, som är en grundläggande byggsten i nukleotider och därmed också i nukleinsyraer som DNA och RNA. Tiouridin förekommer naturligt i vissa RNA-molekyler, där det vanligen ersätter en uracilgrupp. Det har visat sig spela en viktig roll i olika cellulära processer, såsom RNA-modifiering och proteinsyntes.
RNA, bakteriellt
Uridin
RNA, transfer, His
Transfer RNA (tRNA) med specifikt aminosyraresel ("His" står för histidin) är en typ av RNA-molekyler som spelar en central roll i processen som kallas proteintranslering. Varje tRNA-molekyl har en specifik sekvens av nukleotider, kallad anticodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodon (tre nukleotider) på mRNA (messenger RNA). När tRNA-molekylen binder till mRNA via detta komplementära parning av baser, transporteras en specifik aminosyra till ribosomen där proteinsyntesen sker. I fallet med tRNA His transporterar den aminosyran histidin till ribosomen för att ingå i den pågående proteinbildningen.
Oligoribonukleotider
Oligoribonukleotider (ORNs) är korta en- eller flerfaldigt polymeriserade molekyler av ribonukleotider, som utgör byggstenarna i RNA. ORNs kan variera i längd från några få upp till hundratals nukleotider och har en rad olika funktioner inom cellen, till exempel som delar i regleringen av genuttryck och proteinsyntes. De kan även ha en roll i celldefens och sjukdomsprocesser, såsom virusinfektioner och neurologiska störningar.
Aminoacylering
Aminoacylation är en biokemisk process där en aminosyra kovalent binds till ett transfer RNA (tRNA) molekyl med hjälp av en aminoacyl-tRNA syntetas. Detta steg är viktigt för den translationella maskineriet, som är ansvarig för att tolka genetisk information och producera proteiner i cellen. Varje tRNA molekyl har en specifik anticodon-sekvens som matchar en komplementär kodon-sekvens på mRNA. När aminoacyleringen sker korrekt säkerställs att rätt aminosyra kopplas till rätt tRNA, och därmed rätt plats i det protein som byggs upp.
tRNA-metyltransferaser
Ribosomer
Ett ribosom är en komplex struktur i cellen som syntetiserar proteiner genom att translatera information från RNA till aminosyror, vilket resulterar i bildandet av en peptidkedja. Ribosomen består av två subenheter, en större och en mindre, som innehåller ribosomalt RNA (rRNA) och proteiner. De två subenheterna interagerar med varandra samt med mRNA (budbärar-RNA) och tRNA (transfer-RNA), för att bygga upp en proteinmolekyl korrekt enligt genetisk information. Ribosomer finns i både cytoplasma och mitokondrier, och spelar därför en central roll i cellens proteinsyntes.
Basparsbildning
Proteinbiosyntes
Proteinbiosyntese refererer til den proces, hvor celler syntetiserer proteiner baseret på informationen i DNA-molekylet. Denne proces foregår i to etaper: transkription og translation. Under transkriptionen konverteres DNA-sekvensen til en komplementær mRNA-sekvens, der derefter transporteres ud af cellkernen. I den efterfølgende translation skaber ribosomerne forbindelsen mellem aminosyrerne i overensstemmelse med sekvensen af nukleotider i mRNA-molekylet, hvilket resulterer i dannelse af et protein. Proteinbiosyntesen er en essentiel livsfunktion for alle levende organismer.
RNA, svamp
RNA (Ribonucleic acid) är ett nukleinsyremedel som spelar en central roll i den genetiska informationens flöde och proteinsyntes inom celler hos levande organismer, inklusive svampar. RNA består av en lång kedja av nukleotider som innehåller fyra olika baser: adenin (A), uracil (U), cytosin (C) och guanin (G). I svampar, liksom i andra eukaryota organismer, finns det tre huvudsakliga typer av RNA: messenger RNA (mRNA), ribosomalt RNA (rRNA) och transfer RNA (tRNA). Dessa olika RNA-typer har specifika funktioner i cellen, exempelvis att transportera genetisk information från DNA till ribosomen där proteinsyntesen sker eller att utgöra en del av ribosomerna där proteiner syntetiseras.
Cytidin
Treonin-tRNA-ligas
Treonin-tRNA-ligase (TRS) er ein enzym som katalyserer reaksjonen der treonin blir knyttet til sin specifiske transfer RNA (tRNA), deretter overføres treoninet til ribosomen under translasjonsprosessen for å syntetiserast peptidbindningene i proteiner. Dette enzymet spiller dermed en viktig rolle i den genetiske koden og proteinsyntesen hos levende organismer.
Saccharomyces cerevisiae
Ribonukleaser
En ribonukleas (RNas) är ett enzym som bryter ned RNA-molekyler i mindre segment genom att hydrolysavspjälka fosfodiesterbindningarna mellan dess nucleotider. Det finns olika typer av ribonukleaser, inklusive RNas A, RNas B och RNas C, som är specifika för att klyva specifika sekvenser i RNA-molekyler. Dessa enzymer spelar viktiga roller i cellulär regulering, såsom proteinsyntes, RNA-modifiering och immunförsvar.
Läsramsskifte, ribosomalt
En riktad ändring i läsramarna för translationen som medger produktion av ett enda protein från två eller fler överlappande gener. Förloppet styrs av MRNA:s nukleotidsekvens, och påverkas ibland även av den sekundära eller tertiära mRNA-strukturen. Processen ses främst hos virus (särskilt retrovirus), retrotransposoner och bakteriella insertionskroppar, men även i cellulära gener.
Mutation
Guanosin
En purinnukleosid bestående av guanin bundet via sitt N9-kväve till C1-kolet i ribos. Guanosin ingår i RNA, och dess nukleotider har stor betydelse i ämnesomsättningen.
Ribonukleas T1
Tryptofan-tRNA-ligas
Stoppkodon
Ett kodon som signalerar avslut på genetisk translation (genetisk translation). Peptidtermineringsfaktorer binder till stoppkodonet och utlöser hydrolys av aminoacylbindningen mellan den färdiga polypeptiden och tRNA. Stoppkodon specificerar inte aminosyror.
RNA Processing, Post-Transcriptional
Post-transcriptional RNA processing refers to the modifications and regulations that occur to RNA molecules after they have been transcribed from DNA. These processes include capping, splicing, and tailing, which are essential for stabilizing and enabling the mature RNA to perform its functions in protein synthesis or gene regulation. Additionally, post-transcriptional RNA processing can also involve various forms of editing, such as base modifications and insertion/deletion of nucleotides, that further diversify and refine the information encoded in the RNA.
Valin-tRNA-ligas
Valin-tRNA-ligase är ett enzym som katalyserar den sista steget i syntesen av valyl-tRNA, en molekyl som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Valin-tRNA-ligas associerar aminosyran valin med sin specifika transfer-RNA (tRNA) genom att koppla ihop dem med en peptidbindning, vilket möjliggör korrekt tolkning och översättning av genetisk information till proteiner.
Modeller, molekylära
Tyrosin-tRNA ligas
RNA, transfer, Asn
Transfer RNA (tRNA) för asparagin (Asn) är ett specifikt RNA-molekyl som transporterar aminosyran asparagin till ribosomen under processen av proteintranslering. Tillsammans med andra tRNA-molekyler och ribosomerna hjälper asparagins tRNA till att bygga upp en peptidkedja genom att koppla asparagin till rätt sekvens av baser i mRNA, vilket är den molekyl som leder proteinet som ska syntetiseras.
Serin-tRNA-ligas
Serin-tRNA-ligase, även känt som Seryl-tRNAsynthetas, är ett enzym som katalyserar den sista steget i syntesen av serin-tRNA, vilket är en nödvändig komponent i den genetiska koden för proteintranslering. Detta enzym katalyserar kopplingen av aminosyran serin till dess specifika transfer-RNA (tRNA) via en esterbindning. Denna reaktion är viktig för att säkerställa korrekt dekodning och syntes av proteiner i cellen.