Archaea
Uno dei tre i dominii della vita (il batterio e gli altri), un tempo chiamato Eukarya archeobatterio sotto il tassonomiche Batteri, ma ora considerati separati e distinti. Sono caratterizzato da: (1) la presenza del tRNAs e RNAS ribosomiche; (2) assenza di peptidoglicano pareti cellulari; (3) la presenza di lipidi ether-linked costruita dal branched-chain subunità; e (4) la loro incidenza di habitat. Mentre Archaea assomigliano batteri nella morfologia e organizzazione genomica, assomiglia eukarya nel loro modo di replicazione genomica. Il dominio contiene almeno quattro regni: CRENARCHAEOTA; EURYARCHAEOTA; NANOARCHAEOTA; e KORARCHAEOTA.
Rna Degli Archaea
Crenarchaeota
Un regno nel dominio Archaea composta da thermoacidophilic, sulfur-dependent organismi. I due ordini sono SULFOLOBALES e THERMOPROTEALES.
Regolazione Dell'Espressione Genica Degli Archaea
Metano
Methanococcus
Batteri
Uno dei tre i dominii della vita (e gli altri sarebbero Eukarya e Archaea), anche chiamato Eubacteria. Sono unicellulari procariote microrganismi che generalmente hanno pareti cellulari rigido, moltiplicare per la divisione cellulare, e mostrano tre principali forme: Rotonda o coccal, rodlike o Bacillary e spirale o spirochetal. I batteri possono essere classificate secondo la risposta al ossigeno: Microrganismi anaerobi Facultatively anaerobi, o per le modalità mediante le quali ottenere la loro energia: Chemotrophy (attraverso reazione chimica) o tramite luce PHOTOTROPHY (reazione); per chemotrophs dalla loro fonte di energia chimica: CHEMOLITHOTROPHY (dal composti inorganici) o da chemoorganotrophy (composti organici); e la loro fonte di CARBON; azoto, ecc. (Dal materiale organico HETEROTROPHY fonti) o (da CARBON AUTOTROPHY diossido), possono anche essere classificate secondo se mi macchiano (basata sulla struttura della parete cellulare) con la metanfetamina Violet tinta: Aerobi gram-positivi o.
Sulfolobus
Una specie di aerobica, Chemolithotrophic coccoid archaea, che gli organismi sono thermoacidophilic. Le sue cellule sono altamente di forma irregolare, spesso lobed, ma a volte sferica. Ha distribuzione mondiale da organismi isolati dal caldo acido terreni e acqua. Zolfo è usato come fonte di energia.
Methanobacteriaceae
Dati Di Sequenza Molecolare
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Euryarchaeota
Methanosarcina
Un genere di anaerobi, irregolarità spheroid-shaped METHANOSARCINALES quali organismi producono Endospores nonmotile. Non si formano. Questi Archaea ricavare energia tramite la formazione di metano dal acetato, metanolo, mono-, di- e trimethylamine e possibilmente, monossido di carbonio. Organismi vengono isolati dal acqua dolce e gli ambienti marini.
Nitrification
Un processo agevolata da batteri specifici riguardanti l'ossidazione di ammonio di nitrato di amile e.
Methanobacterium
Un genere di anaerobi, forma a bastoncino METHANOBACTERIACEAE. Il microbo nonmotile e usare l'ammoniaca come unica fonte di azoto. Questi sono presenti nei sedimenti methanogens acquatici, terreno, scarichi, e il tratto gastrointestinale di animali.
Desulfurococcaceae
Una famiglia di archaea, nell'ordine DESULFUROCOCCALES, composto da cocchi anaerobi che utilizzare amminoacidi, proteine o carboidrati Facultatively da zolfo respirazione o fermentazione. Ci sono otto generi: AEROPYRUM, Desulfurococcus, Ignicoccus, Staphylothermus, Stetteria, Sulfophoboccus, Thermodiscus e Thermosphaera. (Dal manuale di Bergey e 'a cura di), secondo il Sistema Batteriologia
Methanosarcinales
Un ordine di anaerobi methanogens nel regno EURYARCHAEOTA. Ci sono due famiglie: METHANOSARCINACEAE e Methanosaetaceae.
Halobacteriales
Un ordine di estremamente halophilic archaea, nel regno EURYARCHAEOTA ubiquitously. Ciò avviene in natura dove il contenuto di sale, sono chemoorganotrophic, usando aminoacidi o carboidrati come risorsa di carbonio.
Haloferax
Una specie di HALOBACTERIACEAE che sono estremamente halophilic chemoheterotropic e strettamente Aerobico. Si trovano nei salina neutrale ambienti come sale laghi (in particolare il Mar Morto) e dei salterns.
Pyrococcus
Una specie di strettamente ultrathermophilic anaerobi archaea, in famiglia THERMOCOCCACEAE, verificatisi in riscaldata seawaters. Mostrano heterotrophic crescita a una temperatura ideale di 100 gradi.
Sulfolobus Acidocaldarius
Una specie di aerobica, Chemolithotrophic Archaea composto di zolfo coccoid le cellule che utilizzare come fonte di energia. La temperatura ideale per la crescita è 70-75 gradi C. Loro vengono isolati dal campo acido.
Rna Ribosomiale 16S
Methanosarcinaceae
Una famiglia di anaerobi METHANOSARCINALES le cui cellule sono mesophilic o di idrolase e forma irregolare sferoide con corpi o infoderato. Questi methanogens si trovano in ogni ambiente anaerobico incluso sedimenti, acquatici e gastrointestinale liquame anaerobi digesters terriere. Ci sono quattro generi: METHANOSARCINA, Methanolobus, Methanothrix e Methanococcoides.
Pyrococcus Abyssi
Cromosomi Degli Archaea
Sulfolobus Solfataricus
Una specie di thermoacidophilic Archaea in famiglia Sulfolobaceae, trovato nelle regioni vulcaniche dove la temperatura è di circa 80 gradi centigradi e SULFUR è presente.
Sedimenti Geologici
Una massa di materiale organico né inorganico solido frammentato, o il frammento di solido, e che viene dall'erosione di roccia e viene trasportata dai o sospeso nell'aria, acqua passata, o ghiaccio. Essa si riferisce anche a una massa che si accumula con qualsiasi altro agente e naturale che si raccoglie in strati sulla superficie terrestre, come la sabbia, sabbia, fango, fango, riempire o loess. (McGraw-Hill scientifico e tecnico Dictionary of Voglia, 4th Ed, p1689)
Methanococcales
Un ordine di anaerobi methanogens nel regno EURYARCHAEOTA. Sono pseudosarcina, coccoid o infoderato forma a bastoncino e nei gruppi metilici. Le pareti cellulari è costituito da proteine. L'ordine include una famiglia, METHANOCOCCACEAE. (Dal Bergey 'Manual of Systemic Batteriologia, 1989
Archaeoglobus Fulgidus
Una specie di estremamente di idrolase, l'auto riduzione dei Archaea. Cresce la temperatura massima di 35 gradi C. in aree geotermiche o marine degli abissi.
Pyrococcus Furiosus
Una specie di strettamente anaerobi hyperthermophilic archaea, che vive nei sedimenti marini. Geothermally-heated dimostra di possedere heterotropic crescita per fermentazione o zolfo respirazione.
Evoluzione Molecolare
Thermococcus
Cellule Eucariotiche
Methanosarcina Barkeri
Halobacteriaceae
Una famiglia di estremamente halophilic Archaea trovato in ambienti ad alta concentrazione di sale, come sale laghi, evaporato brines o pesce salato, Halobacteriaceae sono terminatore o anaerobi gram-negativi facoltativa e sono suddivisi in almeno 26 generi che comprende: HALOARCULA; HALOBACTERIUM; HALOCOCCUS; HALOFERAX; HALORUBRUM; NATRONOBACTERIUM; e NATRONOCOCCUS.
Ammoniaca
Un gas incolore fosfatasi. Si è formato nel corpo durante la decomposizione di materiali organici, durante un gran numero di reazioni metabolicamente importante notare che la forma di ammoniaca acquosa come AMMONIUM idrossido.
Sequenza Aminoacidica
Eteri Glicerilici
Eukaryota
Uno dei tre i dominii della vita (il batterio e gli altri), anche chiamato Archaea Eukarya. Questi sono organismi le cui cellule sono racchiusi in membrane, possedere un nucleo e comprendono quasi tutti pluricellulare e molti organismi unicellulari e di solito sono divisi in gruppi (detta regni) inclusi gli animali e piante; funghi: Una delle alghe e altre taxa che prima erano parte del vecchio regno Protista.
Thermoplasma
Una specie di heterotrophic Facultatively anaerobi archaea, nell'ordine, isolate dal THERMOPLASMALES self-heating carbone rifiuto pile e acido sorgenti calde. Sono di idrolase e possono crescere con o senza zolfo.
Allineamento Di Sequenze
L'accordo di due o più sequenze di base aminoacido o un organismo o organismi in modo tale da allineare le aree di condividere le sequenze proprietà comuni. Il grado di relazione o omologia tra le sequenze prevista computationally o statisticamente basato su pesi attribuiti agli elementi allineati tra le sequenze. A sua volta questo puo 'servire da indicatore genetica potenziale relazione tra gli organismi.
Analisi Di Sequenze Di Dna
Dna Ribosomiale
Omologia Di Sequenza Di Amino Acido
Autotrophic Processes
Il processo con cui usare semplici organismi quali sostanze inorganiche gassosa o diluita biossido di carbonio e azoto inorganico come nutritivo fonti. Contrasta con heterotrophic processi che fanno uso di materiali organici, come il nutritivo: Fonte di rifornimento. Può essere sia chemolithotrophs chemoautotrophs (o) e hanno Archaea e batterio, che usare anche semplice sostanze inorganiche per la loro energia metabolica reguirements photoautotrophs photolithotrophs; o (o) quali piante e i cianobatteri, che derivarne la loro energia dalla luce. Dipende da condizioni ambientali alcuni organismi possono variare tra diversi modelli nutrizionale (autotrophy; HETEROTROPHY; chemotrophy PHOTOTROPHY); o di utilizzare fonti diverse di incontrare i nutrienti e fabbisogno energetico.
Haloferax Mediterranei
Cellule Procariotiche
Thermoproteaceae
Una famiglia di THERMOPROTEALES di lunghezza variabile rigido barre senza septa. Crescono o chemolithoautotrophically o da zolfo respirazione. I quattro generi sono: PYROBACULUM; THERMOPROTEUS; Caldivirga; e Thermocladium. (Dal manuale di Bergey e 'a cura di), secondo il Sistema Batteriologia
Halobacterium Salinarum
Sequenza Base
Thermoplasmales
Un ordine di aerobica, di idrolase archaea, nel regno EURYARCHAEOTA, caratterizzate dall'assenza di un muro della cella. Sono stati descritti due generi: THERMOPLASMA e Picrophilus.
Trasporto Genico Orizzontale
Naturalmente la trasmissione di informazioni genetiche tra organismi, collegate e non orizzontale, evitando parent-to-offspring trasmissione. Trasferimento gene causa una varietà di processi naturali come genetico coniugazione; genetico TRANSFECTION FKPB 12; e potrebbe determinare una modifica del destinatario organismo è composizione genetica (trasformazione, genetico).
Methanobrevibacter
Una specie di anaerobi gram-positivi, cocchi, di forma a bastoncino archaea, in famiglia METHANOBACTERIACEAE, ordine METHANOBACTERIALES. Si trovano nei TRACT gastrointestinale o altre anoxic ambienti.
Proteine Batteriche
Proteine trovate in una specie di batteri.
Haloarcula Marismortui
Geni Del Rna Ribosomiale
Sulfolobales
Un ordine di CRENARCHAEOTA composto da aerobico o Facultatively aerobico, cocchi Chemolithotrophic che sono thermoacidophiles estremo, non hanno peptidoglicano nei loro pareti cellulari.
Ossidoriduttasi
La classe di enzimi principale che catalizza oxidoreduction reazioni. Il substrato che viene ossidato è considerata come un donatore, il nome sistematica idrogeno si basa su donatore: Acceptor oxidoreductase. Il nome sarà deidrogenasi, ovunque sia possibile, in alternativa, può essere usato. Ossidasi reduttasi deve essere usato solo nei casi in cui l'ossigeno e 'il acceptor. (Enzima nomenclatura, 1992, p9)
Modelli Molecolari
Microbiologia Dell'Acqua
La presenza di batteri, virus e funghi in acqua. Tale termine non sia limitato a organismi patogeni.
Methanomicrobiaceae
Una famiglia di anaerobi METHANOMICROBIALES le cui cellule sono coccoid subito o leggermente curvo barre. Ci sono sei varieta '.
Ecosistema
Archaeoglobus
Anaerobiosi
Rna Transfer
Il piccolo RNA molecole, 73-80 nucleotidi tanto che la traduzione piu,) (traduzione genetico per allineare amino ACIDS al ribosomi in una sequenza determinato dall 'RNA messaggero mRNA (). Ci sono circa 30 diverse trasferimento RNAS. Ogni riconosce uno specifico codone sulla mRNA attraverso le proprie ANTICODON e come aminoacyl tRNAs (RNA, trasferimento, l' acil) ogni porta un aminoacido a ribosoma da aggiungere alla catene di allungamento dei peptidi.
Sequenza Conservata
Salinity
Escherichia Coli
Una specie di, Facultatively anaerobi gram-negativi, forma a bastoncino batteri (anaerobi Gram-negativi Facultatively RODS) comunemente trovato nella parte inferiore dell ’ intestino di gli animali a sangue caldo. Di solito si nonpathogenic, ma alcuni ceppi sono nota per avere la diarrea e infezioni piogeno. Ceppi (patogeni virotypes) sono classificati in base al patogeno specifici meccanismi quali tossine (Enterotoxigenic Escherichia coli), ecc.
Microbiologia Del Suolo
La presenza di batteri, virus e funghi nel terreno. Tale termine non sia limitato a organismi patogeni.
Plancton
Ossido-Riduzione
Una reazione chimica nel quale un elettrone e 'trasferito da una molecola a un altro, questo e' la molecola electron-donating reductant; la riduzione o electron-accepting molecola è l'agente ossidante o ossidante. Ridurre e agenti ossidante funzionare come coppia o coniugato reductant-oxidant redox paia (Lehninger, i Principi di Biochimica, 1982, p471).
Rna Batterico
Acido Ribonucleic nei batteri avendo regolamentare e ruoli catalitica nonché coinvolgimento nella sintesi proteica.
Ribosome Subunits, Large, Archaeal
Sulfolobaceae
Una famiglia di SULFOLOBALES composto da aerobico o anaerobico Facultatively cocchi Chemolithotrophic, di solito si verificano da sole. Crescono meglio con un pH di circa 2.
Bioreattori
Attrezzi per fornire prodotti o dispositivi sintetico o conversione chimica utilizzo della capacità di un sistema biologico, possono essere fermentors classica perfusione, sistemi di colture cellulari, o enzima bioreattori. Per la produzione di proteine, enzimi, da microorganismi come batteri, le cellule di mammifero, o insetto o pianta cellule di solito sono scelti.
Hot Temperature
Presenza di calore, di calore, una temperatura notevolmente superiori di un abituato Norm.
Hydrothermal Vents
Le sorgenti calde sul fondo dell'oceano. Sono comunemente trovato vicino volcanically principio posti come mid-oceanic Ridges.
Struttura Terziaria Della Proteina
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.
Proteobacteria
Un tipo di batteri consistenti nei batteri viola e i loro parenti che formano un ramo dell'albero eubacterial. Questo gruppo di prevalentemente batteri gram-negativi è classificata in base alla sequenza dei nucleotidi omologia equivalente 16S o mediante ibridazione di RNA ribosomiale RNA ribosomiale 16S o DNA e RNA ribosomiale 23S.
Dna Batterico
Acido deossiribonucleico su materiale genetico di batteri.
Oceano Pacifico
Proteobacteria Delta
Un gruppo di Proteobacteria rappresentati da morfologicamente diversi sulfidogens anaerobica. Alcuni membri del gruppo sono considerate batteriche predatori, avendo bacteriolytic proprieta '.
Biota
Zolfo
Haloarcula
Una specie di HALOBACTERIACEAE distingue dagli altri generi di famiglia dalla presenza di specifiche derivati di lipidi. Polare TGD-2 Haloarcula sono illustrati nella salina neutrale ambienti come sale laghi, marine salterns, e fisiologica del terreno.
Microbial Consortia
Sorgenti Calde
Habitat di acqua calda naturalmente riscaldate da processi geologica sottostanti, le terme sono state usate per BALNEOLOGY. Delle sorgenti calde sott'acqua sono chiamati sorgenti idrotermali.
Batteri Riduttori Di Zolfo
Temperatura
La proprieta 'di oggetti che determina la direzione del flusso caldo quando si sono collocate in diretto contatto termica. La temperatura è l'energia di microscopiche mozioni (vibrazione translational) e delle particelle di atomi.
Clonaggio Molecolare
Estuaries
Parzialmente accluso un corso d'acqua, e nella parte circostante l'habitat costiero, dove l'acqua salata dall'oceano si mescola con acqua fresca dai fiumi o ruscelli. Il miscuglio risultante di acqua di mare e l'acqua dolce è chiamato acqua salmastra e la salinita 'puo' andare da 0,5 a 35 ppt. (Accesso http: / / oceanservice.noaa.gov / istruzione / kit / estuari / estuaries01 _ whatis.html)
Pyrococcus Horikoshii
Methanomicrobiales
Un ordine di anaerobi, methanogens altamente specializzata, nel regno EURYARCHAEOTA. Nonmotile o gli organismi sono pericolosa, con le cellule occurring as coccoid corpi, pseudosarcina o barre. Famiglie comprendono METHANOMICROBIACEAE, Methanocorpusculaceae e Methanospirillaceae.
Pyrobaculum
Una specie di forma a bastoncino, quasi rettangolare archaea, in famiglia THERMOPROTEACEAE. Gli organismi sono strettamente Facultatively aerobico o anaerobico si sviluppano su vari substrati organico, e sono illustrati nella solfataras continentale.
Lakes
Cristallografia A Raggi X
Thermoproteus
Una specie di obligately anaerobi THERMOPROTEACEAE archaea, in famiglia. Si trovano nei termale e acido pozze d'acqua.
Aeropyrum
Un genere di anaerobi, chemolithotropic coccoid archaea, in famiglia DESULFUROCOCCACEAE. Vivono in ambienti marini.
Specificità Delle Specie
La restrizione una caratteristica comportamento, struttura anatomica o sistema fisico, come risposta immunitaria; risposta metabolico, o Gene o del gene variante ai membri di una specie. Si riferisce a quella proprieta 'che distingue una specie di un'altra ma è anche utilizzato per phylogenetic livelli maggiori o minori di quanto la specie.
Conformazione Dell'Acido Nucleico
Heterotrophic Processes
Il processo con cui organismi biologici come utilizzare sostanze nutrienti fonti. Contrasta con AUTOTROPHIC PROCESSI che stanziano semplice sostanze inorganiche come nutrienti fonte. Heterotrophs possano chemoheterotrophs (o chemoorganotrophs) che richiedono sostanze quali organico anche glucosio per la loro energia metabolica primaria, o photoheterotrophs (o photoorganotrophs) che derivarne la loro energia primaria vigente dalla luce. Dipende da condizioni ambientali alcuni organismi possono variare tra diversi modelli nutrizionale (AUTOTROPHY; heterotrophy; chemotrophy PHOTOTROPHY); o di utilizzare fonti diverse di incontrare i nutrienti e fabbisogno energetico.