Un filo de bacteria compuesto de tres clases: Bacteroides, Flavobacteria, y Sphingobacteria.
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Genoma colectivo representante de muchos organismos, principalmente microorganismos, que existe en una comunidad.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
La variedad de todos los organismos vivientes nativos y sus variadas formas de interrelación. (MeSH, 2010) Contenido vivo de la Tierra en su conjunto, todo cuanto vive en los océanos, las montañas y los bosques. La encontramos en todos los niveles, desde la molécula de ADN hasta los ecosistemas y la biosfera. Todos los sistemas y entidades biológicos están interconectados y son interdependientes. La importancia de la biodiversidad estriba en que nos facilita servicios esenciales: protege y mantiene los suelos, regula el clima y hace posible la biosíntesis, proporcionándonos así el oxígeno que respiramos y la materia básica para nuestros alimentos, vestidos, medicamentos y viviendas (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Familia de bacterias gramnegativas en el orden Cytophagales, clase Cytophagia. Se encuentra en el SUELO y AGUA DEL MAR.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Un filo de bacterias anaerobias, gramnegativas con metabolismo heterotrófico quimioorganotrófico. Son flora residente de la OROFARINGE.
Generalmente se refiere a las estructuras digestivas que se extienden desde la BOCA al ANO, pero no incluyen los órganos gandulares accesorios (HIGADO, TRACTO BILIAR, PANCREAS).
El espectro de los organismos vivos que habitan una determinada región determinada, hábitat o biotipo.
Agua salinizada de OCÉANOS Y MARES que proporciona el hábitat a los organismos marinos.
La colección completa de microbios (bacterias, hongos, virus, etc.) que, naturalmente, existe dentro de un nicho biológico particular, tal como un organismo, el suelo, un cuerpo de agua, etc.
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
Electroforesis en el que varios gradientes desnaturalizantes se utilizan para inducir los ácidos nucleicos a derretirse en las varias etapas que resultando en separación de moléculas basadas en es pequeñas diferencias en las secuencias incluyendo SNPs. Los desnaturalizantes utilizados contienen calor, formamida y urea.
Filo fisiológicamente diverso de bacterias gramnegativas acidófilas encontradas en una amplia variedad de hábitats, pero particularmente abundantes en suelos y sedimentos.
Masa de material orgánico o inorgánico sólido fragmentado, o el propio fragmento sólido, que procede de la acción del intemperismo sobre las rocas y es transportada por, suspendida en o dejado caer por el aire, agua o hielo. Se refiere también a una masa que se acumula por cualquier otro agente natural y forma capas en la superficie terrestre, tales como arena, grava, limo, lodo, relleno o marga.
Filo de bacterias gramnegativas que contienen siete grupos a nivel de clase de una gran variedad de ambientes. La mayoría de los miembros son quimioheterótrofos.
Un grupo de diferentes especies de microorganismos que actúan juntos como una comunidad.
Género de bacilos gramnegativos, anaerobios, que no forman esporas, inmóviles. Los organismos de este género originalmente se clasificaron como miembros del género BACTEROIDES pero hallazgos bioquímicos y químicos en 1990 indicaron la necesidad de separarlos de otras especies de Bacteroides, y por ello se estableció este nuevo género.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Género de bacterias gramnegativos, anaerobias, en forma de bastoncillos . Sus organismos habitan normalmente en las cavidades orales, respiratoria, intestinal y urogenital de hombres, animales e insectos. Algunas especies pueden ser patógenas.
Cantidades relativas de PURINAS y PIRIMIDINAS en un ácido nucleico.
La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.
Clase de BACTERIAS con diversas propiedades morfológicas. Algunas Actinobacterias muestran entre si una semejanza de la secuencia 16S rADN/rARN mayor al 80 por ciento asi como la presencia de distintivos de nucleótidos. (Adaptación del original: Stackebrandt E. et al, Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491).
Género de ARCHAEA grampositivos, anaeróbicos, en forma de coco a bacilos cortos, en la familia METHANOBACTERIACEAE, orden METHANOBACTERIALES. Se encuentran en el TRACTO GASTROINTESTINAL o en otros ambientes anóxicos.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
El análisis genómico de conjuntos de organismos.
Un género de bacterias gramnegativas, quimioorganotróficas en la familia CYTOPHAGACEAE. En algunas especies hay un cambio cíclico en la morfología de las células.
Residuo o excremento del tracto digestivo formado en el intestino y expulsado por recto. Las heces están compuestas por agua, residuos alimenticios, bacterias y secreciones del intestino y del hígado. (Diccionario Mosby. 5a ed. Madrid: Harcourt España, 2000, p.615).
Conjunto de organismos acuáticos diminutos PLANTAS y ANIMALES y BACTERIAS fotosintéticas, que flotan libremente o están suspendidos en el agua, con poco o ningún poder de locomoción. Están divididos en FITOPLANCTON y ZOOPLANCTON.
No puedo proporcionar una definición médica de 'Mar Mediterráneo' ya que no es un término relacionado con la medicina, la salud o las ciencias de la vida. El Mar Mediterráneo es un mar interior en el sistema de mares interconectados de la Tierra, geográficamente localizado entre Europa, Asia y África.
Una familia de bacterias en el orden Sphingobacteriales, clase Sphingobacteria. Son bacilos gramnegativos, principalmente saprofíticos en hábitats terrestres y acuáticos.
Agua que contiene cantidades no significativas de sales, como el agua de RÍOS y LAGOS.
Procesos en los que los organismos utilizan sustancias orgánicas como fuente de nutrientes. Se diferencian de los PROCESOS AUTÓTROFOS, que recurren a sustancias inorgánicas simples como fuente de aporte de nutrientes. Los heterótrofos pueden ser quimioheterótrofos (o quimioorganótrofos), que también necesitan compuestos orgánicos como la glucosa para satisfacer sus necesidades energéticas metabólicas principales, o fotoheterótrofos (o fotoorganótrofos), que satisfacen sus necesidades energéticas principales gracias a la luz. Dependiendo de las condiciones ambientales, algunos organismos pueden pasar de un modo nutricional a otro diferente (AUTOTROFIA, heterotrofia, quimiotrofia o FOTOTROFIA) para utilizar distintas fuentes con el fin de satisfacer sus necesidades de nutrientes y energía.
Grupo de protobacterias comprendidas por bacterias gramnegativas fermentadoras y facultativamente anaerobias.
Presencia de bacterias, virus y hongos en el agua. Este término no está restringido a los organismos patógenos.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Acidos orgánicos, monobásicos, derivados de hidrocarburos por el equivalente de oxidación de un grupo metilo a un alcohol, a aldehído y luego a ácido. Los ácidos grasos son saturados y no saturados (ACIDOS GRASOS NO SATURADOS).
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Líquido rechazado o desechos arrastrados por las alcantarillas.
Familia de bacterias gramnegativas que se encuentran primariamente en el tracto intestinal y en las membranas mucosas de animales de sangre caliente. Sus organismos algunas veces son patógenos.
Procedimientos para identificar tipos y cepas de bacterias. Los sistemas de tipificación más frecuentemente empleados son los de TIPIFICACION DE BACTERIOFAGOS y la SEROTIPIFICACION, así como la tipificación de bacteriocina y la biotipificación.
Un sistema funcional el cual incluye los organismos de una comunidad natural junto a su ambiente. (MeSH/NLM) Unidad ecológica básica, formada por el ambiente viviente (biotopo) y de organismos animales y vegetables que interactúan como un ente funcional único (Material II - IDNDR, 1992)
Clase del filum PROTEOBACTERIA formado generalmente por dos fenotipos principales: bacterias púrpuras no sulfúricas y bacterias que contienen bacterioclorofilo aeróbico.
Cuerpos tierra adentro apaciguados o movimientos lentos de AGUA DULCE o agua salada, más grande que un estanque, y suministrados por RÍOS y arroyos.
La zona física inmediata alrededor de las raíces de las plantas incluidas las raíces de las plantas. Es un área de intensa y compleja actividad biológica que involucra a las plantas, microorganismos, otros organismos del suelo, y al suelo.
Relación entre dos especies diferentes de organismos que son interdependientes; cada uno gana beneficios del otro o una relación entre las diferentes especies donde tanto de los organismos en cuestión se benefician de la presencia del otro.
Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.
Género de bacterias gram negativas deslizantes que se encuentran en el SUELO, el HUMUS, el AGUA DULCE y los hábitats marinos.
Bacteria que retiene la coloración violeta cristal cuando se trata con el método de Gram.
Propiedades y procesos fisiológicos de BACTERIA.
Herramientas o aparatos para generar productos empleando la capacidad de conversión sintética o química de un sistema biológico. Pueden ser fermentadores clásicos, sistemas de perfusión de cultivo de células, o biorreactores de enzimas. Para la producción de proteínas o enzimas, se seleccionan microorganismos recombinantes como las bacterias, células de mamífero, o células de insectos o de vegetales.
El Mar del Norte es un mar epicontinental marginal del océano Atlántico Northern, ubicado al norte de Europa, que se extiende desde Escocia hasta Noruega y Alemania.
Género de bacterias aerobias, gramnegativas en forma de bastones que están ampliamente distribuidas en el SUELO y el AGUA. Sus organismos se encuentran también en carnes crudas, LECHE y otros ALIMENTOS, en los ambientes hospitalarios y en las muestras clínicas de humanos. Algunas especies son patógenas en humanos.
El agua líquida presente bajo la superficie de la tierra.
Agua contaminada generada como producto de desecho de la actividad humana.
Filum de CHLOROBI anoxigénicos y fototróficos, incluyendo la familia Chlorobiaceae. Se encuentran en los sedimentos acuáticos, aguas sulfurosas y aguas termales y utilizan compuestos reducidos de azufre en lugar de oxígeno.
El enriquecimiento de un ECOSISTEMA terrestre o acuático, por la adición de nutrientes, especialmente nitrógeno y fósforo, que resulta en un crecimiento desbordante de plantas, ALGAS, o de otros productores primarios. Puede ser un proceso natural o resultado de la actividad humana tales como el escurrimiento de la agricultura o la contaminación de aguas residuales. En los ecosistemas acuáticos, un aumento de la población de algas se denomina una floración de algas.
El mineral no consolidada o materia orgánica en la superficie de la tierra que sirve como un medio natural para el crecimiento de las plantas terrestres.
Sección del canal alimentario que va desde el ESTÓMAGO hasta el CANAL ANAL. Incluye al INTESTINO GRUESO y el INSTESTINO DELGADO.
Grupo de sustancias similares a la VITAMINA K 1 que contiene un anillo de 2-metil-1,4-naftoquinona y una cadena lateral isoprenoide de un número variable de unidades de isopreno. En la vitamina K 2, cada unidad de isopreno contiene un doble enlace. Se producen por bacterias de la flora intestinal normal.
Cantidades mensurables de bacterias en un objeto, organismo, o compartimento de organismo.
Cualquier materia colorante normal o anormal en PLANTAS, ANIMALES o microorganismos.
Grado de contenido salino, que es en gran parte la CONCENTRACIÓN OSMOLAR de CLORURO DE SODIO más cualquiera de las otras SALES presentes. Es un factor ecológico de gran importancia, que influye en los tipos de organismos que viven en un AMBIENTE.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
El hidrocarburo saturado más simple. Es un gas inflamable, incoloro, ligeramente soluble en agua. Es uno de los principales constituyentes del gas natural y se forma en la descomposición de materia orgánica.
Clase del filum PROTEOBACTERIA, compuesta por quimioheterótrofos y quimioautótrofos, que toman sus nutrientes de la descomposición de materia orgánica.
Gruesa masa de HIELO formada en grandes regiones de tierra; RIOS; LAGOS; estanques; o AGUA DE MAR.
El océano Artico y las islas dentro de él y adyacentes a él. Incluye Point Barrow, Alaska, la mayor parte del Franklin District en Canadá, dos terceras partes de Groenlandia, Svalbard, Franz Josef Land, Lapland, Novaya Zemlya y Siberia del Norte.
Filum de esponjas, que son animales multicelulares sésiles, con alimentación en suspensión, que utilizan células flageladas llamadas coanocitos para propalar agua. La mayoria son hermafroditas. Probablemente existió una rama evolutiva que no dió lugar a ningún otro tipo de animal. Excepto para las aproximadamente 150 especies de agua dulce, las esponjas son animales marinos. Son una fuente de ALCALOIDES, ESTEROLES y otras moléculas complejas útiles en medicina e investigación biológica.
Movimiento o capacidad de moverse de un lugar a otro. Se puede referir a humanos, animales vertebrados o invertebrados y microorganismos.
Filo de bacterias verdes no sulfúricas incluyendo la familia Chloroflexaceae, entre otras.
Transmisión de información genética entre organismos, emparentados o sin parentesco, burlando la transmisión de padres a hijos, que se da de forma natural. Puede darse mediante procesos naturales como la CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA y la TRANSFECCIÓN. Puede dar lugar a un cambio de la composición genética del organismo recipiente (TRANSFORMACIÓN GENÉTICA).
Material inútil, dañado, defectuoso, superfluos o efluentes de operaciones industriales.
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Gran orden de insectos caracterizados por tener parte de la boca adaptada para perforar o chupar. Está constituido por cuatro subórdenes: HETEROPTERA, Auchenorrhyncha, Sternorrhyncha, y Coleorrhyncha.
Organismos diminutos que flotan libremente en el agua y que son fotosintéticos. El término no es taxonómico y se refiere a una forma de vida (utilización de la energía y motilidad) mas que a un determinado tipo de organismo. La mayoría, pero no todos, son algas unicelulares. Grupos importantes incluyen DIATOMEAS, DINOFLAGELADOS, CIANOBACTERIAS, CHLOROPHYTA, HAPTOPHYTA, CRIPTÓFITAS y silicoflagelados.
Bacterias anaerobias son microorganismos unicelulares que no requieren oxígeno para sobrevivir y crecer, y a menudo producen toxinas que pueden causar infecciones graves en humanos y animales.
Se aplica a soluciones adoptadas para la eliminación de aguas residuales excepto las indicadas por descriptores más específicos.
Tipo de HIBRIDACION IN SITU en que las secuencias dianas se tiñen con colorante fluorescente de manera que se pueda determinar su localización y tamaño mediante el empleo de microscopía fluorescente. Esta coloración es lo suficientemente distintiva como para que la señal de hibridización pueda ser vista tanto en las difusiones de la metafase como en los núcleos de la interfase.
Reacciones vitales o metabólicas que ocurren en un ambiente que contiene oxígeno.
Procesos celulares de la biosíntesis (anabolismo) y degradación (catabolismo) de los CARBOHIDRATOS.
Género de bacterias en forma de bastoncillos, gram positivas, no resistentes a ácidos, que no forman esporas, son inmóviles y pertenecen a la familia Bifidobacteriaceae, orden Bifidobacteriales, clase ACTINOBACTERIA. Habita en los intestinos y heces de humanos así como en la vagina humana.
Primer estómago de los rumiantes. Descansa en el lado izquierdo del cuerpo, ocupa todo el lado izquierdo del abdomen y se alarga a través de todo el plano medio del cuerpo hacia el lado derecho. Tiene gran capacidad, se divide en un saco superior y uno inferior, cada uno de los cuales posee un saco ciego en su extremidad posterior. El rumen está cubierto por una membrana mucosa que no contiene glándulas digestivas, pero que contiene gran cantidad de glándulas que segregan moco. Alimento poco procesado y parcialmente masticado se almacena y agita en el rumen hasta que el animal encuentra que hay circunstancias convenientes para rumiarlo. Cuando esto ocurre, pequeñas bolas de alimentos se regurgitan a través del esófago hacia la boca, y se someten a una segunda masticación más cuidadosa, se traga, y pasa hacia otras partes del estómago compuesto.
Ausencia total, o (aproximadamente) la escasez, de oxígeno elemental disuelto o gaseoso en un lugar o ambiente determinado.
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Un género de bacterias aeróbicas gramnegativas en la familia FLAVOBACTERIACEAE. Muchas de estas especies fueron antiguamente del género FLAVOBACTERIUM.
Gran colección de fragmentos de ADN clonados (CLONACIÓN MOLECULAR)de un determinado organismo, tejido, órgano o tipo celular. Puede contener secuencias genómicas completas (BIBLIOTECA GENÓMICA) o secuencias complementarias de ADN, éstas formadas a partir de ARN mensajero y sin secuencias intrónicas.