Factores de Transcripción con Motivo Hélice-Asa-Hélice Básico
Familia de factores de transcripción de unión al ADN que contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE de carácter básico.
Secuencias Hélice-Asa-Hélice
Estructuras supersecundarias recurrentes caracterizadas por 20 aminoácidos que se pliegan en dos alfa hélices conectadas por un segmento de "lazo" no helicoidal. Se encuentran en muchas secuencias específicas de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN y de PROTEINAS QUE SE UNEN AL CALCIO.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Proteína 1 Similar al Factor de Transcripción 7
Proteína 1 Inhibidora de la Diferenciación
Regulador negativo de los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN BÁSICOS HÉLICE-ASA-HÉLICE que bloquean la activación del INHIBIDOR P16 DE CINASA DEPENDIENTE DE LA CICLINA y se libera en diversas NEOPLASIAS.
Factores de Transcripción TCF
Familia de proteínas de unión al ADN que se expresan principalmente en los LINFOCITOS T. Estas proteínas interaccionan con la BETA CATENINA y actúan como activadores y represores transcripcionales en diversos procesos del desarrollo.
Proteína 2 Inhibidora de la Diferenciación
Regulador negativo de los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN BÁSICOS HÉLICE-GIRO-HÉLICE. Interviene en la regulación de la expresión de la INMUNOGLOBULINA E.
Factor de Transcripción de Twist
Factor de transcripción básico hélice-giro-hélice identificado originalmente en DROSOPHILA como esecial para una gastrulación apropiada y para la formación del MESODERMO. Desempeña un papel importante en el DESARROLLO EMBRIONARIO y en la DIFERENCIACIÓN CELULAR de las CÉLULAS MUSCULARES y se encuentra en una amplia variedad de organismos.
Proteínas de Unión al ADN
Proteínas Inhibidoras de la Diferenciación
Reguladores negativos de FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN BÁSICOS HÉLICE-ASA-HÉLICE; inhiben la DIFERENCIACIÓN CELULAR merced a la modulación de diversos reguladores del CICLO CELULAR.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Transcripción Genética
Proteína MioD
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Factores de Transcripción Básicos con Cremalleras de Leucinas y Motivos Hélice-Asa-Hélice
Familia de factores de transcripción que contienen regiones ricas en residuos básicos, dominios CREMALLERA DE LEUCINAS y MOTIVOS HÉLICE-GIRO-HÉLICE.
Regiones Promotoras Genéticas
Secuencia de Bases
Diferenciación Celular
Elementos E-Box
Lugares de ADN con la secuencia de consenso CANNTG. ELEMENTOS DE FACILITACIÓN pueden contener varias copias de este elemento. Las E-cajas desempeñar un papel regulador en el control de la transcripción. Se unen con espiral de hécile-asa-hélice (bHLH) de tipo FACTORES DE TRASCRIPOCIÓN. La especificidad de unión está determinada por el heterodímero bHLH específico o una combinación de homodímero y por los nucleótidos específicos en la posición 3 y 4 de la secuencia de la E-caja.
Proteínas del Tejido Nervioso
Las proteínas del tejido nervioso se refieren a las diversas proteínas específicas que desempeñan funciones cruciales en la estructura, función y regulación de las neuronas y la glía dentro del sistema nervioso central y periférico.
Regulación de la Expresión Génica
Proteínas de Homeodominio
Proteínas que se codifican por los genes "homeobox" (GENES, HOMEOBOX) que muestran similitud estructural con ciertas proteínas unidas al ADN de procariotes y eucariotes. Las proteínas del homeodominio participan en el control de la expresión genética durante la morfogénesis y el desarrollo (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN DEL GEN, DESARROLLO).
Secuencia de Aminoácidos
Hibridación in Situ
Proteínas Nucleares
Transactivadores
Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.
Miogenina
Un factor regulador miogénico que controla la miogénesis. A diferencia de otros factores miogénicos que sólo aparecen en ciertos tipos de células, la miogenina es inducida durante la diferenciación de cada línea celular muscular que ha sido investigada.
Linaje de la Célula
Historia del desarrollo de tipos de células diferenciadas específicas, desde las CÉLULAS MADRE originales del embrión.
Activación Transcripcional
Procesos que estimulan la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de un gen o conjunto de genes.
Unión Proteica
Proteínas de Pez Cebra
Proteinas obtenidas del PEZ CEBRA. Muchas de las proteinas de estas especies han sido sujeto de estudios,implicando al desarrollo embriológico básico (EMBRIOLOGÍA).
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Proteínas de Arabidopsis
Proteínas de especies vegetales pertenecientes al género ARABIDOPSIS. Las especies de Arabidopsis más estudiadas, la Arabidopsis thaliana, se utilizan generalmente en laboratorios de experimentación.
Factores Estimuladores hacia 5'
Factores de transcripción de SECUENCIAS HÉLICE-ASA-HÉLICE de carácter básico que se expresan ubicuamente. Se unen a secuencias CANNTG en los promotores de diversos GENES implicados en el metabolismo de los cabrohidratos y de los lípidos.
Línea Celular
Arabidopsis
Género de plantas de la familia BRASSICACEAE que contienen PROTEÍNAS DE ARABIDOPSIS y PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. La especie A. thaliana se utiliza para experimentos de genética clásica en plantas así como en estudios de genética molecular en fisiología, bioquímica y desarrollo de las plantas.
Fitocromo B
Proteína fotorreguladora de las plantas que existe en dos formas, reversibles e interconvertibles por acción de la LUZ. En respuesta a la luz pasa al NÚCLEO CELULAR y regula la transcripción de genes diana. El fitocromo B tiene un importante papel en la evitación del déficit lumínico e interviene en la desetiolación por la luz roja.
Sitios de Unión
Genes Reporteros
Genes cuya expresión es fácilmente detectable y portanto se emplean para estudiar la actividad promotora en muhcas posiciones en un genoma diana. En la tecnología del ADN recombinante, estos genes pueden unirse a una región promotora de interés.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Mutación
Homología de Secuencia de Aminoácido
Regulación de la Expresión Génica de las Plantas
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Ratones Transgénicos
Elementos de Facilitación Genéticos
Secuencias de ADN de actuación cis que pueden incrementar la transcripción de los genes. Los elementos de facilitación generalmente pueden funcionar en cualquier orientación y a diversas distancias del promotor.
Ratones Noqueados
Clase de ratones en los que ciertos GENES de sus GENOMAS han sido alterados o "noqueados". Para producir noqueados, utilizando la tecnología del ADN RECOMBINANTE, se altera la secuencia normal de ADN del gen estudiado, para prevenir la sintesis de un producto génico normal. Las células en las que esta alteración del ADN tiene éxito se inyectan en el EMBRIÓN del ratón, produciendo ratones quiméricos. Estos ratones se aparean para producir una cepa en la que todas las células del ratón contienen el gen alterado. Los ratones noqueados se utilizan como MODELOS DE ANIMAL EXPERIMENTAL para enfermedades (MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD)y para clarificar las funciones de los genes.
Perilla frutescens
Factores Reguladores Miogénicos
Una familia de factores de transcripción específicos para los músculos que enlazan al ADN en regiones de control, regulando así la miogénesis. Todos los miembros de esta familia contienen una estructura hélice-aza-hélice conservada que es homólogo al de las proteínas de la familia myc. Estos factores sólo se hallan en los músculos esqueléticos. Entre los miembros se incluyen la proteína mioD (PROTEINA MIOD), la MIOGENINA, myf5, y myf6 (también llamada MF4 o herculina).
Factor 5 Regulador Miogénico
Factor de transcripción específico del MÚSCULO ESQUELÉTICO que contiene un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE de carácter básico. Desempeña un papel esencial en el DESARROLLO DEL MÚSCULO.
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Células Madre
Dimerización
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Células Cultivadas
Región Branquial
Región del periodo de desarrollo de los SOMITOS, que contiene cierto número de arcadas bilaterales con un núcleo mesodérmico revestido por endodermo y ectodermo a ambos lados. En los vertebrados acuáticos inferiores los arcos branquiales dan lugar a las BRANQUIAS. En los vertebrados superiores los arcos forman evaginaciones y se transforman en estructuras de la cabeza y el cuello. Separando los arcos están las hendiduras o surcos branquiales.
Técnicas del Sistema de Dos Híbridos
Técnicas de cribado concebidas inicialmente en levaduras para identificar genes que codifican proteínas interactuantes. Se usan variantes para evaluar la interrelación entre las proteínas y otras moléculas. Las técnicas de dos híbridos se refieren al análisis de interacciones entre proteínas; las técnicas de un híbrido, a las interacciones entre ADN y proteína; las técnicas de tres híbridos, a las interacciones entre ARN y proteína o entre ligando y proteína. Las técnicas de n híbridos en configuración inversa se refieren al análisis de mutaciones o de moléculas pequeñas que disocian las interacciones conocidas.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Proteínas Proto-Oncogénicas
Oligodendroglía
Amplia clase de células neurogliales (macroglia) del sistema nervioso central. La oligodendroglía puede denominarse interfascicular, perivascular o perineural (no es lo mismo que CÉLULAS SATÉLITES PERINEURONALES) de acuerdo a su localización. Forman la VAINA DE LA MIELINA aislante de los axones en el sistema nervioso central.
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Fenotipo
Oxilipinas
Ácidos grasos poliinsaturados ciclopentílicos con dieciocho carbonos, derivados del ÁCIDO ALFA-LINOLEICO merced a un proceso oxidativo similar a de los EICOSANOIDES en los animales. Su biosíntesis es inhibida por los SALICILATOS. Un miembro clave de este grupo, el ácido jasmónico de las PLANTAS, juega un papel similar al del ÁCIDO ARAQUIDÓNICO en los animales.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Neuronas
Unidades celulares básicas del tejido nervioso. Cada neurona está compuesta por un cuerpo, un axón y dendritas. Su función es recibir, conducir y transmitir los impulsos en el SISTEMA NERVIOSO.
Embrión de Mamíferos
Etapa inicial del desarrollo de los MAMÍFEROS. Generalmente se define como el periodo que va desde la fase de segmentación del CIGOTO hasta el final de la diferenciación embrionaria de las estructuras básicas. En el embrión humano, representa los dos primeros meses del desarrollo intrauterino y precede a los estadios de FETO.
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Mesodermo
Operón Lac
Unidad genética formada por tres genes estructurales, un operador y un gen regulatorio. El gen regulatorio controla la síntesis de los tres genes estructurales: BETA-GALACTOSIDASA, permeasa de beta-galactósidos (involucrada con el metabolismo de la lactosa) y la beta-tiogalatósido acetiltransferasa.
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Regulación hacia Abajo
Proceso que disminuye las interacciones ligando/receptor debido a una reducción en el número de receptores disponibles. Esto puede ser resultado de la introversión del complejo ligando/receptor o de una expresión reducida del receptor. Clásicamente el concepto se refiere a los receptores de hormonas, pero el uso contemporáneo incluye otros receptores de la superficie celular.
Plantas Modificadas Genéticamente
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Ratones Consanguíneos C57BL
Inmunohistoquímica
Factor de Transcripción Sp1
Células 3T3 NIH
Una línea celular continua de alta inhibición de contacto establecida a partir de cultivos de embriones de ratón Swiss NIH. Las células son útiles para los estudios de transfección y transformación de ADN.
Pez Cebra
Modelos Genéticos
Factores de Transcripción MEF2
La activación de factores de transcripción de la familia MADS que se unen a un elemento de secuencia específica (elemento MEF2) en muchos genes específicos de músculo y están involucrados en la miogénesis esquelética y cardíaca, la diferenciación neuronal y la supervivencia / apoptosis.
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Regulación hacia Arriba
Efecto regulatorio positivo sobre procesos fisiológicos a nivel molecular, celular o sistémico. A nivel molecular, los lugares de regulación principales incluyen los receptores de membrana, genes (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA)ARNm (ARN MENSAJERO)y proteinas.
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Células Tumorales Cultivadas
Raíces de Plantas
Desarrollo de Músculos
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Proliferación de la Célula
Proteínas de Plantas
Células COS
LÍNEA CELULAR derivada de la línea celular CV-1 mediante transformación con una replicación producida por un mutante incompleto del VIRUS 40 DE LOS SIMIOS, que codifica un largo antigeno T de tipo salvaje (ANTIGENOS TRANSFORMADORES DE POLIOMAVIRUS). Son usados para transfección y clonación. (La línea celular CV-1 ha sido derivada del riñón de un mono verde africano adulto macho (ERCOPITHECUS AETHIOPS)).
Neurogénesis
Cresta Neural
Los dos engrosamientos longitudinales situados a lo largo de la LÍNEA PRIMITIVA que aparecen casi al final de la GASTRULACIÓN, durante el desarrollo del sistema nervioso (NEURULACIÓN). Las crestas están formadas por repliegues de la PLACA NEURAL. Entre las crestas está el surco neural, que va profundizándose a medida que se elevan los pliegues. Cuando los pliegues se unen en la línea media, el surco se transforma en un tubo cerrado, el TUBO NEURAL.
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
Morfogénesis
Desarrollo de las estructuras anatómicas para crear la forma de un organismo uni o multicelular. La morfogénesis proporciona cambios de forma de una o varias partes o de todo el organismo.
Subunidad alfa del Factor 1 Inducible por Hipoxia
La subunidad alfa del factor 1 inducible por hipoxia es un factor de transcripción hélice-giro-hélice alcalino que está regulado por la disponibilidad de OXÍGENO y que es objetivo de la degradación por parte de la PROTEÍNA SUPRESORA DE TUMORES DEL SÍNDROME DE VON HIPPEL-LINDAU.
Factores de Transcripción con Cremalleras de Leucina de Carácter Básico
Gran superfamilia de factores de transcripción que contienen una región rica en residuos de AMINOÁCIDOS BÁSICOS seguida por un dominio CREMALLERA DE LEUCINAS.
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Células HeLa
Mapeo Cromosómico
Translocador Nuclear del Receptor de Aril Hidrocarburo
Translocador nuclear del receptor de aril hidrocarburo es una proteína que contiene SECUENCIAS HÉLICE-ASA-HÉLICE alcalinas que forma un complejo con RECEPTORES DE DIOXINAS. El complejo fija elementos reguladores xenobióticos y activa la transcripción de diversos genes, entre ellos la UDP GLUCURONOSILTRANSFERASA. El traslocador nuclear AhR es también una subunidad del FACTOR 1 INDUCIBLE POR HIPOXIA.
Evolución Molecular
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Proteínas Fluorescentes Verdes
Analógos y derivados proteicos de la proteína fluorescente Aequorea victoria verde que emite luz (FLUORESCENCIA) cuando se estimula con RAYOS ULTRAVIOLETAS. Se usan en GENES REPORTEROS al hacer TÉCNICAS GENETICAS. Se han hecho numerosos mutantes para emitir otros colores o ser sensibles a pH.
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
ARN Interferente Pequeño
Pequeños ARN bicatenarios no codificadores de proteínas, de 21 A 31 nucleótidos, implicados en mecanismos de SILENCIAMIENTO GÉNICO, especialmente en la INTERFERENCIA POR ARN o RIBOINTERFERENCIA (RNAi). Los RNA interferentes pequeños (siRNA) se forman endógenamente a partir de dsRNA (ARN BICATENARIOS) por acción de una misma ribonucleasa, Dícer, que genera miRNA (MICROARN). El apareamiento perfecto de la hebra antiparalela de siRNA con ARN complementarios es un paso intermedio en la RNAi, que permite la escisión de los RNA guiada por el siRNA. Los siRNA se clasifican en: siRNA que actúan en trans (tasiRNA), RNA asociados a repeticiones (rasiRNA), RNA small-scan (scnRNA) y RNA de interacción con proteínas Piwi (RNApi), y desempeñan diversas funciones específicas de silenciamiento génico.
Sistema Nervioso
Todo el aparato nervioso, formado por una parte central, el cerebro y la médula espinal, y una parte periférica, los nervios craneales y espinales, ganglios autónomos y plexos. (Stedman, 25a ed)
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Leucina Zippers
Motivos que se unen al ADN formados por dos alfa hélices que se entrelazan durante 8 giros en una espiral enrollada y luego se bifurcan para formar unas estructuras en forma de Y. Las leucinas que ocurren en repeticiones heptádicas terminan en los mismos lados de las hélices y son adyacentes unas a otras en el tronco de la Y (la región "zipper"). Los residuos que se unen al ADN se encuentran en la región bifurcada de la Y.
Factores de Tiempo
Factor de Transcripción AP-1
Factor multiproteico compuesto por los productos de los proto-oncogenes c-jun y c-fos. Estas proteínas deben formar dímeros para unirse al sitio de reconocimiento AP-1, conocido también como el elemento de respuesta TPA (TRE). El AP-1 controla tanto la transcripción basal como la inducible de varios genes.
Factor de Transcripción 3
Factor básico de transcripción hélice-asa-hélice que juega un rol en la determinación del destino celular durante la embriogénesis. Forma un heterodímero con el FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DE TWIST y el COMPLEJO GÉNICO ACHAETE-SCUTE-relacionado a los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN.
Drosophila
Médula Espinal
Estructura larga casi cilíndrica, alojada en el conducto vertebral y que se extiende desde el agujero magno en la base del cráneo hasta la parte superior de la región lumbar. Componente del sistema nervioso central, la médula del adulto tiene un diámetro aproximado de 1 cm y una longitud media de 42 a 45 cm. La médula conduce impulsos desde y hacia el encéfalo, y controla numerosos reflejos. Tiene un núcleo central de sustancia gris formado principalmente por células nerviosas, y está rodeada por tres membranas meníngeas protectoras: duramadre, aracnoides y piamadre. La médula es una prolongación del bulbo raquídeo y termina cerca de la tercera vértebra lumbar. (Diccionario Mosby. 5a ed. Madrid: Harcourt España, 2000, p.795)
Músculo Esquelético
Apoptosis
Uno de los mecanismos mediante los que tiene lugar la MUERTE CELULAR (distinguir de NECROSIS y AUTOFAGOCITOSIS). La apoptosis es el mecanismo responsable de la eliminación fisiológica de las células y parece estar intrínsicamente programada. Se caracteriza por cambios morfológicos evidentes en el núcleo y el citoplasma, fraccionamiento de la cromatina en sitios regularmente espaciados y fraccionamiento endonucleolítico del ADN genómico (FRAGMENTACION DE ADN) en sitios entre los nucleosomas. Esta forma de muerte celular sirve como equilibrio de la mitosis para regular el tamaño de los tejidos animales y mediar en los procesos patológicos asociados al crecimiento tumoral.
Northern Blotting
Células Madre Hematopoyéticas
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Factores de Transcripción Forkhead
Subclase de proteínas winged helix de unión al ADN, homólogas de su predecesor, la proteína "fork head" de Drosophila.
Animales Recién Nacidos
Factor de Transcripción Asociado a Microftalmía
Un factor de transcripción cremallera de leucina básica de hélice-bucle-hélice que regula la DIFERENCIACIÓN CELULAR y el desarrollo de una variedad de tipos de células que incluyen MELANOCITOS; OSTEOCLASTOS; y EPITELIO PIGMENTADO DE LA RETINA. Las mutaciones en la proteína MITF se han asociado con la OSTEOPETROSIS y SÍNDROME DE WAARDENBURG.
Movimiento Celular
Proteínas de Xenopus
Proteínas obtenidas a partir de diversas especies de Xenopus. Aquí se incluyen las proteínas de la rana de uñas Africana (Xenopus laevis). Muchas de estas proteínas han sido objeto de investigaciones científicas en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Embrión no Mamífero
Desarrollo de un huevo fecundado (CIGOTO) en especies animales distintas de los MAMÍFEROS. Para pollos, use EMBRIÓN DE POLLO.
Receptores de Hidrocarburo de Aril
Proteínas citoplasmáticas que unen ciertos aril hidrocarburos, los translocan hasta el núcleo, y activan la transcripción de segmentos particulares del ADN. Los receptores AH se identifican por su alta afinidad de unión a varios productos químicos ambientales que son carcinogénicos y teratogénicos entre los que se incluyen hidrocarburos aromáticos policíclicos que se encuentran en el humo del cigarro y en el smog, aminas heterocíclicas que se encuentran en los alimentos cocinados, e hidrocarburos halogenados entre los que se incluyen dioxinas y bifenilos policlorados. No se han identificado ligandos endógenos, pero se sospecha la existencia de un mensajero natural desconocido que desempeña un papel en la diferenciación y desarrollo celular.
Western Blotting
Encéfalo
Parte del SISTEMA NERVIOSO CENTRAL contenida dentro del CRÁNEO. Procedente del TUBO NEURAL, el encéfalo embrionario consta de tres partes principales: PROSENCÉFALO (cerebro anterior), MESENCÉFALO (cerebro medio) y ROMBENCÉFALO (cerebro posterior). El encéfalo desarrollado consta de CEREBRO, CEREBELO y otras estructuras del TRONCO ENCEFÁLICO.
Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
Ensayo de Cambio de Movilidad Electroforética
Técnica electroforética para identificación de ligaciones de un compuesto al otro. Márcase un compuesto para seguir su movilidad durante la electrofóresis. Si el compuesto marcado presentarse unido a un otro compuesto, entonces la movilidad del compuesto marcado por el medio electroforético será retardada.
Factores de Transcripción Paired Box
Familia de factores de transcripción que controlan el DESARROLLO EMBRIONARIO de diversas estirpes celulares. Se caracterizan por poseer un dominio de unión al ADN emparejado altamente conservado que se identificó por vez primera en genes de segmentación de DROSOPHILA.
beta-Galactosidasa
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Factor de Transcripción AP-2
Familia de proteínas de unión al ADN que regulan la expresión de diversos GENES durante la DIFERENCIACIÓN CELULAR y la APOPTOSIS. Los miembros de esta familia contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE básico carboxiterminal altamente conservado, involucrado en la dimerización y la secuencia específica de unión del ADN.
Dedos de Zinc
Motivos de las proteínas que se unen al ADN y al ARN cuyos aminoácidos se pliegan en una sola unidad estructural alrededor de un átomo de zinc. En el dedo de zinc clásico, un átomo de zinc se encuentra unido a dos cisteínas y dos histidinas. Entre las cisteínas y las histidinas hay 12 residuos que forman una yema de dedo que se une al ADN. Por variaciones en la composición de las secuencias de la yema de dedo y el número y espaciado de las repeticiones en tándem del motivo, los dedos de zinc pueden formar un gran número de sitios específicos de unión con diferente secuencia.
Factores de Transcripción de Tipo Kruppel
Familia de factores de transcripción dedos de zinc que son homólogos de la proteína Kruppel de Drosophila. Entre los MOTIVOS DEDOS DE ZINC contienen una secuencia espaciadora de siete aminoácidos muy conservada.
Embrión de Pollo
Es la entidad en desarrollo del huevo de gallina fecundado (CIGOTO). El proceso del desarrollo comienza 24 horas antes de la puesta, en el que el huevo está en estadio de BLASTODISCO, una pequea mácula blanca en la superficie de la YEMA DEL HUEVO. Tras 21 días de incubación, el embrión está totalmente desarrollado antes de la eclosión.
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Factores de Transcripción TFII
Los llamados factores generales de transcripción que se unen a la ARN POLIMERASA II y que son necesarios para iniciar la transcripción. Ellos incluyen a TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFII-I, y TFIIJ. Aparentemente, in vivo se unen en un proceso de pasos múltiples y ordenados y/o pueden formar un gran complejo de preiniciación llamado holoenzima ARN polimerasa II.
División Celular
Fisión de las CÉLULAS. Incluye la CITOCINESIS, cuando se divide el CITOPLASMA de una célula y la DIVISIÓN CELULAR DEL NÚCLEO.
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Supervivencia Celular
Factor de Transcripción GATA2
Factor de transcripción GATA esencial, que se expresa principalmente en las CÉLULAS MADRE HEMATOPOYÉTICAS.
Factor de Transcripción YY1
Factor de Transcripción STAT3
Xenopus
Factor de Transcripción GATA4
Factor de transcripción GATA que se expresa en el MIOCARDIO del corazón en desarrollo y que se ha relacionado con el proceso de diferenciación de los MIOCITOS CARDÍACOS. El factor GATA4 se activa mediante FOSFORILACIÓN y regula la transcripción de genes cardioespecíficos.
Factor de Transcripción TFIID
Principal componente de unión al ADN de secuencia específica involucrado en la activación de transcripción de ARN POLIMERASA II. En un principio se describió como un complejo de PROTEÍNA DE UNIÓN A TATA-BOX y a FACTORES ASOCIADOS CON LA PROTEÍNA DE UNIÓN TATA. Actualmente se sabe que las PROTEÍNAS SIMILARES A LA PROTEÍNA DE UNIÓN TATA-BOX puede realizar la función de la proteína de unión TATA-box en el complejo.
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Factor de Transcripción Activador 3
Factores de Transcripción NFATC
Familia de factores de transcripción que se caracterizan por la presencia de y calcineurina-dominios altamente conservadas de unión al ADN. Proteínas NFAT se activan en el CITOPLASMA de la fosfatasa CALCINEURINA dependiente de calcio. Ellos transducen señales de calcio al núcleo donde pueden interactuar con FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN AP-1 o FN-KAPPA B e iniciar la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de genes implicados en la DIFERENCIACIÓN CELULAR y desarrollo. Proteínas NFAT estimulan la activación del LINFOCITO T a través de la inducción de GENES INMEDIATOS PRECOCES como la INTERLEUCINA-2.
Proteína 2 Similar al Factor de Transcripción 7
Factor de transcripción que participa en la vía de señalización WNT. La actividad de la proteína es regulada mediante la interacción con la BETA CATENINA. El factor de transcripción 7 similar a proteína 2 juega un importante rol en la embriogénesis del PÁNCREAS y de los ISLOTES PANCREÁTICOS.
Factor de Transcripción Sp3
Sitio de Iniciación de la Transcripción
FN-kappa B
Activador transcripcional nuclear, ubicuo, inducible, que se une a los elementos activadores en muchos tipos celulares diferentes y se activa por estímulos patógenos. El complejo FN-kappa B es un heterodímero compuesto por dos subunidades que se unen al ADN: FN-kappa B1 y relA.
Saccharomyces cerevisiae
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Oligodesoxirribonucleótidos
Fibroblastos
Fosforilación
Páncreas
Órgano nodular en el ABDOMEN que contiene una mezcla de GLÁNDULAS ENDOCRINAS y GLÁNDULAS EXOCRINAS.La pequeña parte endocrina está constituida por los ISLOTES DE LANGERHANS,secretoras de distintas hormonas en la corriente sanguínea. La amplia parte exocrina (PÁNCREAS EXOCRINO) es una glándula acinar compleja que segrega distintas enzimas digestivas en el sistema ductal pancreático que desemboca en el DUODENO.
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Factor de Transcripción Activador 2
Factor de transcripción activador que regula la expresión de diversos GENES, como los GENES C-JUN, CICLINA A, CICLINA D1 y el FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN ACTIVADOR 3.
Factor de Transcripción TFIIB
Factor de transcripción específico de la ARN POLIMERASA II. Tiene una función en la reunión del complejo de preiniciación transcripcional pol II y ha sido implicado como objetivo de los activadores transcripcionales específicos de genes.
Factor de Transcripción GATA1
Factor de transcripción GATA que se expresa específicamente en los linajes hematopoyéticos y desempeña una función importante en la DIFERENCIACIÓN CELULAR de las CÉLULAS ERITROIDES y los MEGACARIOCITOS.
Factor de Transcripción E2F1
Factor de transcripción E2F que interactúa directamente con la PROTEÍNA DEL RETINOBLASTOMA y la CICLINA A, y activa la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA necesaria para la entrada en el CICLO CELULAR y la síntesis de ADN. El factor E2F1 está relacionado con la reparación del ADN y con la APOPTOSIS.
ARN Polimerasa II
Eliminación de Secuencia
Proteínas Proto-Oncogénicas c-myc
Proteínas celulares que se unen al ADN y que son codificadas por el gen c-myc. Ellas normalmente participan en el metabolismo de los ácidos nucleicos y median la respuesta celular a los factores de crecimiento. La expresión elevada y no regulada (constitutiva) de las proteínas c-myc pueden causar tumorigénesis.
Mutagénesis Sitio-Dirigida
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Factor de Transcripción GATA3
Factor de transcripción GATA que se encuentra principalmente en los precursores de las CÉLULAS LINFOIDES y que se ha relacionado con el proceso de DIFERENCIACIÓN CELULAR de los LINFOCITOS T COOPERADORES. La haploinsuficiencia de GATA3 se asocia a HIPOPARATIROIDISMO, HIPOACUSIA NEUROSENSORIAL y síndrome de anomalías renales.
Células 3T3
Líneas celulares cuyo procedimiento original de crecimiento consistia en seren transferidas (T) a cada 3 días e placadas a 300.000 células por placa (cápsula o disco de Petri). Las líneas se desarrollaron utilizando varias cepas diferentes de ratones. Los tejidos son generalmente fibroblastos derivados de embriones de ratones pero otros tipos y fuentes también ya fueron desarrollados. Las líneas 3T3 son sistemas de hospederos in vitro valiosos para los estudios de transformación de virus oncogénicos ya que las células 3T3 poseen una elevada sensibilidad a la INIBICION DE CONTACTO.
Proteínas de Neoplasias
Proteínas que en las expresiones anormales (ganancia o pérdida)se asocian al desarrollo, crecimiento o progresión de las NEOPLASIAS. Algunas proteínas de neoplasias son ANTÍGENOS DE NEOPLASIAS, es decir, inducen una reacción inmune en su tumor. Muchas proteínas de neoplasias han sido caracterizadas y se utilizan como marcadores tumorales (MARCADORES BIOLÓGICOS DE TUMOR), cuando son detectables en células y líquidos corporales en el control de la presencia o crecimiento de tumores. La expresión anormal de PROTEÍNAS ONCOGÉNICAS está implicada en la transformación neoplásica, mientras que la pérdida de la expresión de las PROTEÍNAS SUPRESORAS DE TUMOR están relacionadas con la pérdida del control y progresión del crecimiento de la neoplasia.
Receptores Notch
Familia de receptores de la superficie celular que contienen repeticiones del FACTOR DE CRECIMIENTO EPIDÉRMICO en su dominio extracelular y repeticiones de ANKIRINA en sus dominios citoplásmicos. El dominio citoplásmico de los receptores notch se libera en la unión al ligando y se transloca al NÚCLEO CELULAR, donde actúa como factor de transcripción.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-ets
Familia de factores de transcripción que comparten un único dominio de unión del ADN. Debe su nombre a la proteína oncogénica v-ets del VIRUS DE LA ERITROBLASTOSIS AVIAR.
Factores de Transcripción GATA
Familia de factores de transcripción que contienen dos MOTIVOS DEDO DE ZINC y se unen a la secuencia (A/T)GATA(A/G) del ADN.
Proteínas Potenciadoras de Unión a CCAAT
Una clase de proteínas que fueron originariamente identificadas por su habilidad de ligarse a la secuencia de CCAAT del ADN. La proteína potenciadora de unión a CCAAT típica forma dímeros y consiste de un dominio de activación, una región básica de unión a ADN, y un dominio de dimerización rico en leucina (LEUCINA ZIPPERS). FACTOR DE ENLACE A CCAAT es estructuralmente un tipo distinto de proteína potenciadora de unión a CCAAT que consiste de un trímero de tres diferentes subunidades.
Elementos de Respuesta
Secuencias de nucleótidos, generalmente al inicio de la cadena, que son reconocidas por factores de transcripción reguladores específicos, provocando la respuesta del gen a los distintos agentes reguladores. Estos elementos pueden encontrarse tanto en regiones promotoras como intensificadoras.
Drosophila melanogaster
Factores de Transcripción Activadores
Los factores de transcripción activadores se identificaron originalmente en PROTEÍNAS FIJADORAS DE ADN que interactúan con los PROMOTORES TEMPRANOS de ADENOVIRUS. Son una familia de factores de transcripción de cremalleras de leucinas de naturaleza básica que se unen al sitio de consenso de TGACGTCA del elemento de respuesta del AMP cíclico y se hallan estrechamente relacionados con la PROTEÍNA FIJADORA DE ADN QUE RESPONDE AL AMP CÍCLICO.
Factor de Transcripción STAT1
Transductor de señales y activador de la transcripción que interviene en las respuestas celulares a los INTERFERONES. Stat 1 interactúa con la PROTEÍNA SUPRESORA DE TUMORES P53 y regula la expresión de los GENES implicados en el control del crecimiento y en la APOPTOSIS.
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Factores de Transcripción ARNTL
Proteínas del tipo de dominio básico de la hélice-lazo-hélice (bHLH) que desempeñan un papel importante en la regulación del RITMO CIRCADIANO. Se combinan con las proteínas del reloj para formar los factores de transcripción heterodimérica que son específicos para el E-elementos del cuadro y estimular la transcripción de los genes de varios e-cuadro que intervienen en la regulación del ciclo.
Cloranfenicol O-Acetiltransferasa
Enzima que cataliza la acetilación del cloranfenicol para formar cloranfenicol 3-acetato. Como el cloranfenicol 3-acetato no se enlaza con los ribosomas bacterianos y no es un inhibidor de peptidiltransferasa, la enzima es la responsable de la resistencia natural al cloranfenicol en las bacterias. La enzima, de la cual se conocen variantes, está presente en bacterias tanto gramnegativas como granpositivas. EC 2.3.1.28.
Factor de Transcripción ReIA
Factores de Transcripción E2F
Familia de factores básicos de transcripción hélice-bucle-hélice que controlan la expresión de una variedad de GENES implicados en la regulación del CICLO CELULAR. Factores de transcripción E2F típicamente forman complejos heterodiméricos con FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DP1 o factor de transcripción DP2, y tienen dominios de dimerización de unión a ADN y N-terminal. Factores de transcripción E2F pueden actuar como mediadores de la represión de la transcripción o la activación transcripcional.