Fenaziner
"Fenaziner" är ett samlingsnamn för en grupp syntetiska föreningar med en speciell kemisk struktur, bestående av två benzenringar som är fästade vid varandra genom en nitrogenatom. Fenaziner har potentialen att agera som elektrontransportörer och har därför studerats inom områdena medicin och biologi för möjliga användningsområden, till exempel som läkemedel mot infektioner orsakade av mikroorganismer respektive som antioxidanter. Det bör dock poängteras att fenaziner ännu inte har blivit etablerade som kliniskt använda substanser inom medicinen.
Metylfenazonmetosulfat
Pyocyanin
Pyocyanin är ett blågrönt pigment som produceras av vissa stafylokocker, särskilt Pseudomonas aeruginosa. Det är ett sekundärt metabolit och orsakar den blågröna färgen i kolonier av P. aeruginosa på laboratorieodlingar. Pyocyanin har också visat sig ha toxicologiska effekter på celler och kan bidra till skadan hos personer med cystisk fibros eller andra lungsjukdomar som är associerade med P. aeruginosa-infektioner.
Pseudomonas
Pseudomonas är ett släkte gramnegativa, aeroba stavformade bakterier, vanligtvis icke-sporbildande, som förekommer vitt spridd i naturen, särskilt i fuktiga miljöer. Några arter av släktet Pseudomonas kan orsaka infektioner hos människor och djur, framför allt Pseudomonas aeruginosa, som är känd för sin förmåga att utveckla antibiotikaresistens och orsaka livshotande sjukdomar, särskilt hos immunförsvagna individer.
Prenylering
I en enskild mening kan 'prenylering' definieras som en biokemisk process där ett protein modifieras genom att fogas till ett lipofilt grupp, vanligtvis en farnesyl- eller geranylgeranylgrupp. Denna modifikation hjälper till att reglera proteinets funktion och dess subcellulära lokalisation. Prenylering är en viktig posttranslationell modifikation som påverkar många olika cellulära processer, inklusive signaltransduktion, celldelning och trafficking av proteiner.
Exopeptidaser
En underunderklass av peptidhydrolaser som endast verkar på polypeptidkedjors yttersta delar. Exopeptidaserna är underindelade i aminopeptidaser (EC 3.4.11), dipeptidaser (EC 3.4.13), dipeptidyl- och tripeptidylpeptidaser (EC 3.4.14), peptidyldipeptidaser (EC 3.4.15), karboxipeptidaser (EC 3.4.16-18) och omegapeptidaser (EC 3.4.19). EC 3.4.-.
Biosyntetiska banor
Klofazimin
En fettlöslig riminofenazinfärg som används för behandling av spetälska. Det har prövats i kombination med andra antimykobakteriella preparat mot Mycobacterium aviuminfektioner hos AIDS-patienter. Klofazimin har även en märkbar antiinflammatorisk effekt och ges för att kontrollera reaktionen erythema nodosum leprosum vid spetälska.
Pseudomonas aeruginosa
Dimetylallyltranstransferas
Ett enzym som under kolesterolbiosyntesen katalyserar kondenseringen av isopentenylpyrofosfat och dimetylallylpyrofosfat till pyrofosfat och geranylpyrofosfat. Därefter katalyserar enzymet kondenseringen av sistnämnda förening med ytterligare isopentenylpyrofosfat till pyrofosfat och farnesylpyrofosfat. EC 2.5.1.1.
Microbial Interactions
"Microbial interactions" refer to the various ways in which different microorganisms, such as bacteria, fungi, and viruses, influence each other's growth, survival, and behavior when they are present in the same environment. These interactions can be either positive (mutualistic or symbiotic), negative (competitive or antagonistic), or neutral, and can occur through a variety of mechanisms, including the production of metabolites, enzymes, and signaling molecules, as well as direct physical contact between cells. Understanding microbial interactions is crucial for understanding the dynamics of microbial communities in various ecosystems, including the human body, and has important implications for fields such as medicine, agriculture, and environmental science.
Färgämnen
Oxidation-reduktion
4-butyrolakton
Dihydro-2(3H)-furanon. En endogen substans, framställd ur gamma-aminobutyrat och prekursor till gamma-hydroxybutyrat, som även används farmakologiskt. Den verkar uppenbarligen som modulator vid bindni ngsstället för pikrotoxin på GABA-A-receptorer och kan också ha verkan på GABA-B-receptorer. Används huvudsakligen experimentellt. Bland andra systemiska effekter orsakar den en ökning av dopamin i hj ärnan genom att hämma frisläppandet från nervändarna. Har också bruk som industrellt lösningsmedel och prekursor.
Quorum Sensing
Quorum sensing är ett biokommunikationssystem hos bakterier som tillåter dem att detektera och reagera på populationens densitet genom att producera, upptäcka och svara på signalmolekyler, kallade autoinducerer. När bakteriepopulationen når en viss tröskelvärde (quorum) av celltäthet, kommer koncentrationen av autoinducerer att vara tillräckligt hög för att utlösa ett gemensamt beteende eller svar, vilket kan inkludera bioluminescens, antibiotikaproduktion, sporbildning eller biofilmformering.
Pseudomonas fluorescens
"Pseudomonas fluorescens" är en grampositiv, aerob bakterie som naturligt förekommer i vatten och jordmån. Den är känd för sin förmåga att producera ett blått-grönt fluorescerande pigment under optimala tillväxtförhållanden, men detta är inte alltid synligt. Bakterien kan orsaka infektioner hos människor, framförallt hos immunosupprimierade individer, men den ses sällan som en patogen i kliniska sammanhang. Den kan också vara en förorenare inom livsmedelsindustrin och orsaka fördärv av produkter.
Fusarsyra
Ett pikolinsyraderivat som erhålls från olika arter av Fusarium. Det har varit på förslag för användning i en rad behandlingssituationer, men används främst inom forskning. Verkningsmekanismerna är inte väl kända. Förmodligen blockerar ämnet dopamin-betahydroxilas, ett enzym som omvandlar dopamin till norepinefrin. Det kan även ha andra effekter, som t ex att hämma cellutveckling och DNA-syntes.
Elektrontransport
Shikimisyra
Streptomyces
Streptomyces är ett släkte av grampositiva, strikt aeroba bakterier som tillhör ordningen Actinomycetales. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att producera en rad olika antibiotika och andra bioaktiva metaboliter, vilket gör dem viktiga inom biomedicinsk forskning. Streptomyces-arterna har en komplex livscykel som inkluderar sporbildande hyfer och vegetativa mycel. De förekommer naturligt i en rad olika miljöer, till exempel jord, vatten och på levande växter.