Hydroximetylglutaryl-CoA-reduktaser, NAD-beroende
Specifika hydroximetylglutaryl-CoA-reduktaser som utnyttjar kofaktor NAD. Reaktionen är: (R)-mevalonat + CoA + 2 NAD+ = 3-hydroxi-3-metylglutaryl-CoA + 2 NADH + 2 H+. Denna enzymklass spelar en katabolisk roll i mikroorganismer som t ex Pseudomonas mevalonii, där den oxidativt acetylerar mevalonsyra till att bilda 3-hydroxi-3-metylglutaryl-CoA och NADH. EC 1.1.1.88.
Hydroximetylglutaryl-CoA-reduktaser
Enzymer som katalyserar den reversibla reduktionen av alfakarboxylgruppen hos 3-hydroxi-3-metylglutarylkoenzym A till att ge mevalonsyra. EC 1.1.1.34.
Hydroximetylglutaryl-CoA-reduktashämmare
Hydroximetylglutaryl-CoA-syntas
Mevalonsyra
3,5-dihydroxi-3-metylpentansyra, ett ämne som bildas som mellansteg i biosyntesen av kolesterol.
Kolesterol
Koenzym A
Acyl-CoA
NAD
NAD (Nicotinamid Adenin Dinukleotid) är ett viktigt koenzym som deltar i flertalet biokemiska reaktioner inom kroppen, särskilt vid cellandningen där det hjälper till att konvertera energireserver i form av kolhydrater, fetter och protein till ATP (Adenosintrifosfat), som används som direkt energikälla i cellerna. NAD förekommer i två former: NAD+ (oxiderad form) och NADH (reducerad form). Vid cellandningen oxideras NADH tillbaka till NAD+, vilket genererar elektroner som driver den elektrontransportkedja som producerar ATP. Därutöver är NAD också inblandat i andra processer såsom DNA-reparation och cellulär signalering.
Acetater
Sirtuiner
Sirtuiner är en grupp av proteiner som har enzymatisk aktivitet och är involverade i cellulärt regulatoriskt system, som är kopplat till åldrande och celldöd. De är histondeacetylaser (HDAC) och kan även fungera som ADP-ribosyltransferas. Sirtuiner spelar en viktig roll i cellers förmåga att reparera DNA-skador, reglera genuttryck och styrka celldelning. Dessa proteiner är kända för sin förmåga att påverka livslängden hos diverse levande organismer genom att skydda mot stressfaktorer och skada.
Nitratreduktaser
Metylentetrahydrofolatdehydrogenas (NADP)
Ett NADP-beroende oxidoreduktas som katalyserar omvandlingen av 5,10-metylentetrahydrofolat till 5,10-metenyltetrahdyrofolat. Hos högre eukaryoter finns det ett enzym med trippelfunktion som dessutom har metenyltetrahydrofolat-cyklohydrolas- och format-tetrahydrofolatligas-aktivitet. Enzymet har stor betydelse för syntesen av 5-metyltetrahydrofolat, metylgivaren för den vitamin B12-beroende återmetyleringen av homocystein till metionin genom metioninsyntetas. EC 1.5.1.15.
Sirtuin 1
Sirtuin 1 (SIRT1) er ein klasse III histon-deacetylas, som betraktast som en viktig regulator av cellulær homeostasis og stressrespons. Denne enzymet katalyserer deacetylering av proteiner, herunder histoner og regulatoriske proteiner involvert i DNA-reparasjon, celldeling, apoptose og metabolisme. SIRT1 spiller en viktig rolle i reguleringen av cellulær aldring og er involvert i å beskytte mot aldringsrelaterte sykdommer som kreft, diabetes og neurodegenerative tilstander.
Sirtuin 2
Sirtuin 2 (SIRT2) är ett protein som tillhör sirtuinfamiljen, en grupp av nicotinamidadenindinukleotid (NAD+)-beroende deacetylaser och ADP-ribosyltransferaser. SIRT2 är specifikt beläget i både cellkärnan och cytosolen och är involverat i en rad cellulära processer, inklusive celldelning, DNA-reparation, oxidativ stressrespons och neuroprotektion. Det är mest känd för sin roll som deacetylas av alpha-tubulin, vilket påverkar mikrotubuliens dynamik och kan ha betydelse för cellcykeln och neurodegenerativa sjukdomar.
Ribonukleotidreduktaser
En ribonukleotidreduktase (RNR) är ett enzym som katalyserar den nukleotidreduktionen som krävs för syntesen av deoxyribonukleotider, vilket är en essentiell process för DNA-replikation och -reparation. RNR konverterar ribonukleosiddifosfater till deoxyribonukleosiddifosfater genom att reducera deras hydroxylgrupp på 2'-kolatomen till en hydrogen, vilket förändrar ribos till deoxiribos. Dessa deoxyribonukleotider används sedan som byggstenar för DNA-syntesen. RNR spelar därför en central roll i cellcykeln och celldelningen, och dess reglering och aktivitet är noga kontrollerad för att säkerställa korrekt DNA-replikation och -reparation.
Alkoholoxidoreduktaser
En underklass av enzymer omfattande alla dehydrogenaser med verkan på primära och sekundära alkoholer samt hemiacetaler. Enzymerna kan klassificeras beroende på acceptor, som kan vara NAD+ eller NADP+ (underklass 1.1.1), cytokrom (1.1.2), syre (1.1.3), kinon (1.1.5) eller någon annan acceptor (1.1.99).
Oxidoreduktaser
Nitritreduktaser
NADP
NADP, eller mer formellt NADP+ (nicotinamidadenindinukleotidfosfat), är ett viktigt koenzym i celler och spelar en central roll i cellers energihushållning och metabolism. Det är ett vattenlösligt koenzym som deltar i redoxreaktioner, det vill säga reaktioner där elektroner överförs mellan molekyler. NADP+ kan acceptera två elektroner och en proton (H+), vilket resulterar i att den reduceras till NADPH.
Isocitratdehydrogenas
Ett enzym i oxidoreduktasklassen som katalyserar omvandlingen av isocitrat och NAD+ till 2-ketoglutarat, koldioxid och NADH. Det finns i cellers mitokondrier. Enzymet kräver Mg2+ och Mn2+; det aktiveras av ADP, citrat och Ca2+, och hämmas av NADH, NADPH och ATP. Reaktionen är det avgörande, hastighetsreglerande steget i citronsyracykeln. EC 1.1.1.41.
Formatdehydrogenaser
Flavoproteiner som reversibelt katalyserar reduktionen av koldioxid till format. Många föreningar kan vara mottagare (acceptorer), men den enda fysiologiskt aktiva acceptorn är NAD. Enzymerna har sin verkan vid fermentering av sockerarter och andra föreningar till koldioxid och är nyckelenzymer för energialstring när bakterier odlas på format som viktigaste kolkälla. De renframställs ur bovint blod. EC 1.2.1.2.
Sugar Alcohol Dehydrogenases
"Sugar alcohol dehydrogenases (SADHs) are a group of enzymes that catalyze the reversible oxidation and reduction reactions involving sugar alcohols, also known as polyols, to and from their corresponding aldoses or ketoses. These enzymes play a crucial role in the metabolism of sugar alcohols in various organisms, including bacteria, fungi, and plants."
Glutationreduktas
Glutamatdehydrogenas
FMN-reduktas
Flavinmononukleotid-reduktas (FMN-reduktas) är ett enzym som reducerar Flavinmononukleotid (FMN) till Flavanodihydrogen (FH2) genom att transfera två väteatomer från NADPH till FMN.
Tioredoxin-disulfidreduktas
Tioredoxin-disulfidreduktas är ett enzym som hjälper till att reducera, eller sänka, nivåerna av oxiderad tioredoxin i celler. Tioredoxin spelar en viktig roll i celldefenssystemet genom att hjälpa till att reglera cellers oxidativa status och underlätta neutraliseringen av skadliga fria radikaler. Tioredoxin-disulfidreduktas är ett väsentligt enzym för att hålla tioredoxinsystemet i balans, och störningar i dess funktion har visats vara relaterade till olika sjukdomstillstånd, inklusive cancer och neurodegenerativa sjukdomar.
NADPH-ferrihemoproteinreduktas
NADPH-ferrihemoproteinreduktase, även känt som NADPH-oxidoreduktas eller NOX, är ett enzym som överför elektroner från NADPH till ferrihemoproteiner och kan reducera dem till ferrohemoproteiner. Detta enzym spelar en viktig roll i cellers förmåga att generera reaktiva syremolekyler, såsom superoxidradikaler, som är involverade i olika fysiologiska processer, inklusive immunförsvar och signaltransduktion.
Ferredoxin-NADP-reduktas
Ett enzym som katalyserar oxidationen eller reduktionen av ferredoxin eller adrenodoxin i närvaro av NADP. EC 1.18.1.2.
Cytokromreduktaser
Cytokromreduktasen är ett enzymkomplex involverat i celldygnets (circadian rytm) reglering inom mitokondrierna hos eukaryota celler. Det katalyserar elektrontransportreaktioner och tillhandahåller energibearbetning genom att överföra elektroner från reducerade nicotinamidadenindinukleotid (NADH) till oxidationsmedel som syre, vilket leder till bildandet av vatten. Cytokromreduktasen spelar också en viktig roll i homeostasen hos celler genom att reglera apoptos eller programmerad celldöd.
Molekylsekvensdata
Aminohydrolaser
Aminosyrasekvens
O-acetyl-ADP-ribos
O-acetyl-ADP-ribosylation refererar till en posttranslatorisk modifikation av proteiner, där en O-acetyl-ADP-ribosrest kovalent adderas till en proteinaminosyrares syreatom. Denna process katalyseras av en grupp enzymer som kallas O-acetyltransferaser och involverar ADP-ribosylderivat av acetylkoenzym A (acetyl-CoA) som substrat. Det exakta funktionella betydelsen och konsekvenserna av denna modifikation är fortfarande under aktiv forskning, men det antas att den kan spela en roll i regleringen av cellytiska processer som cellcykeln, DNA-reparation och signaltransduktion.
Oxidation-reduktion
Thermoproteaceae
Thermoproteaceae is a family of archaea within the order Thermoproteales and the phylum Crenarchaeota. These extremophilic organisms are typically found in hot environments such as volcanic vents and hot springs, with optimum growth temperatures ranging from 75 to 105°C. They are characterized by their rod-shaped or filamentous morphology and the presence of a unique type of flagella called archaellum, which they use for movement. Thermoproteaceae species obtain energy through either chemolithotrophic or organotrophic metabolism, with some being sulfur-dependent. They play important roles in global carbon and sulfur cycling in extreme environments.
Sirtuin 3
Sirtuin 3 (SIRT3) är ett protein som tillhör sirtuinfamiljen, en grupp av proteiner som har deacylase- och ADP-ribosyltransferasaktivitet och är involverade i cellulär reglering av åldrande, metabolism och stressrespons. SIRT3 är beläget i mitokondrierna och spelar en viktig roll i reguleringen av mitokondriell funktion genom dess förmåga att modifiera andra proteiner i mitokondrien, inklusive aktyvierung av enzymer som katalyserar oxidativ fosforylering och reducerar oxidativ stress. SIRT3 har också visat sig ha potentialen att vara neuroskyddande och anti-aging.
Tetrahydrofolatdehydrogenas
Tetrahydrofolate dehydrogenase (EC 1.5.1.20) er ein emne i biokjemisken som katalyserer den oxidative desaminationen av tetrahydrofolat til dihydrofolat med NAD+ som elektronakseptor. Denne reaksjonen er viktig for folsyra-metabolismen og kan ha en betydning i behandlinga av kreft og andre sykdomar.
Substratspecificitet
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Aldehydoxidoreduktaser
Aldehydoxidoreduktaser är ett enzym som katalyserar reduktionen av aldehyder till primära alkoholer med NAD(P)+ som elektronacceptor under aeroba förhållanden.
Metylentetrahydrofolatreduktas (NADPH2)
Xylitol
Xylitol är ett sötningsmedel som är naturligt förekommande i vissa frukter och grönsaker, men som vanligtvis framställs kommersiellt genom att behandla xylan, en typ av kolhydrat som finns i trä och andra vegetabiliska material. Xylitol har ungefär lika mycket sötma som socker, men har cirka 40% färre kcal per gram. Det är ett populärt alternativ till socker för diabetiker och för dem som vill minska sin intag av kolhydrater och kalorier. Xylitol används också i vissa tandvårdsprodukter, eftersom det har visat sig kunna reducera tooth decay genom att hämma bakteriers förmåga att metabolisera socker och producera syra som skadar tänderna.
Ribitol
Ribitol är ett reducerat socker (en pentitol) som är relaterat till ribos, ett socker som finns naturligt i levande organismer och är en del av riboflavin (vitamin B2)-kofaktorn. Ribitol används inom biokemi och molekylärbiologi som en del av kromatidstabiliseringskomplexet i PCR-baserade metoder för att stabilisera dubbelsträngsbindningen under termocyklingen.
Metenyltetrahydrofolatcyklohydrolas
Ett aminohydrolas som katalyserar hydrolys av 5,10-metenyltetrahydrofolat till 10-formyltetrahydrofolat. Hos de flesta högrestående eukaryoterna uppvisar enzymet även metylentetrahydrofolatdehydrogenas (NADP)- och formattetrahydrofolatligas-aktiviteter. EC 3.5.4.9
Gluconobacter
Laktatdehydrogenaser
Malatdehydrogenas
Methionine Sulfoxide Reductases
Ribonukleosiddifosfatreduktas
A Ribonucleotide Reductase (RNR) is a crucial enzyme in DNA synthesis and repair, responsible for catalyzing the conversion of ribonucleotides to deoxyribonucleotides by reducing the 2'-hydroxyl group of the ribose sugar to a hydrogen, creating the building blocks necessary for DNA replication and repair.
Kolibakterie
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Quinone Reductases
Quinone reductases are a group of enzymes that catalyze the reduction of quinones to hydroquinones using NADH or NADPH as an electron donor. This reaction is important in the detoxification of quinones, which are produced during the metabolism of certain drugs and chemicals, as well as in normal cellular processes. High levels of quinone reductase activity have been associated with a reduced risk of cancer and other diseases, making it a potential target for therapeutic intervention.
Kloning, molekylär
Bassekvens
Koenzymer
En koenzym är ett organisk molekyl som hjälper till att aktivera enzym, en protein som accelererar kemiska reaktioner inom celler. Koenzymer binder till enzym vid en viss aktivt site och hjälper till att omvandla substrat, den ursprungliga molekylen som enzymet agerar på, till produkt, den slutgiltiga molekylen som bildas efter reaktionen. Koenzymer deltar ofta i oxidation-reduktionreaktioner och kan hjälpa till att överföra elektroner eller protoner mellan substrat. Ett exempel på en koenzym är NAD+ (nikotinamidadenindinukleotid), som hjälper till att överföra elektroner i cellandningen.
Katalys
NADH, NADPH-oxidoreduktaser
NAD(P)H-oxidoreduktaser är ett samlingsnamn för en grupp enzymer som katalyserar oxidationen av NADH (reducerad nicotinamidadenindinukleotid) eller NADPH (reducerad nicotinamidadenindinukleotidfosfat) till NAD+ (oxiderad nicotinamidadenindinukleotid) eller NADP+ (oxiderad nicotinamidadenindinukleotidfosfat), samtidigt som de reducerar ett elektronacceptor. Denna katalytiska process är central för cellens metabolism och energiproduktion, särskilt inom cellandning (oxidativ fosforylering) där NADH och NADPH fungerar som elektrondonatorer i den elektrontransportkedja som genererar ATP (adenosintrifosfat). NAD(P)H-oxidoreduktaserna kan också spela en viktig roll i det redoxbalansen
Oxidoreductases Acting on CH-CH Group Donors
'Oxidoreductases Acting on CH-CH Group Donors' är ett samlingsnamn inom nomenklatur för en grupp enzymer som katalyserar oxidation-reduktionsreaktioner där kol-kol-bindningar (CH-CH) i organiska substance är donatorer av elektroner. Detta innebär att de hjälper till att överföra elektroner från en kolatom till en annan, vilket ofta leder till bildandet eller brytandet av kol-kol-bindningar. Exempel på enzymer som faller under denna kategori är dekarboxylaser och oxidaser.
Silent Information Regulator Proteins, Saccharomyces cerevisiae
Silent Information Regulators (Sir) proteins in Saccharomyces cerevisiae refer to a group of four protein factors (Sir2, Sir3, Sir4, and Sir5) that are involved in the establishment and maintenance of heterochromatin structure and function in yeast. Specifically, they play a crucial role in the silencing of gene expression at specific loci such as telomeres, mating-type loci, and ribosomal DNA (rDNA) repeats. The Sir proteins are recruited to these regions through interactions with histone modifications and other chromatin-associated factors, leading to the formation of repressive chromatin structures that prevent transcription. Sir2 is a NAD+-dependent histone deacetylase that specifically targets lysine 16 on histone H4 (H4K16), while Sir3 and Sir4 help to stabilize the silencing complex and promote spreading of the repressive chromatin structure along the DNA.
Dihydropteridinreduktas
Sockeralkoholer
Sockeralkoholer, även kända som sugeralkoholer eller polyoler, är en grupp sockerartade substanser som används som sötningsmedel och texturbildare inom livsmedelsindustrin. De är strukturellt relaterade till sockret (sackaros), men har en annorlunda kemisk struktur som ger upphov till lägre kaloriinnehåll och långsammare sötningskurva än sockret.
Ketoglutarsyra
Oxalobacteraceae
Oxalobacteraceae är en familj av gramnegativa, aeroba eller anaeroba, stavformade bakterier som huvudsakligen förekommer i miljöer med höga nivåer av oxaler syra, såsom i vissa växter och däggdjurs urin. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att metabolisera oxalat, en organisk syra som kan vara skadlig för människor i högre koncentrationer. Bakterier inom Oxalobacteraceae anses ha potential att användas terapeutiskt för att hjälpa till att reglera oxalatnivåer i kroppen och möjligen behandla sjukdomar som är associerade med höga nivåer av oxalat, såsom njursten.
Sorbitol
Sorbitol är ett sötningsmedel och kolhydrat som används i vissa livsmedel, läkemedel och hälsoprodukter. Det är en sakaridalcohol som kan tas upp i kroppen utan insulin och används därför som ett sötningsmedel i produkter marknadsförda till diabetiker. Sorbitol fungerar också som fuktbindemedel och kan hjälpa att förlänga produkternas hållbarhet.
Tioredoxinreduktas 1
Tioredoxinreduktas 1 (TrxR1) är ett intracellulärt enzym som reducerar tioredoxin till dess aktiva, reducerade form, vilket är involverat i cellers reduktiva stresshantering och antioxidativ försvar. Det spelar också en viktig roll i celldifferentiering, apoptos och signaltransduktion. TrxR1 innehåller en flavinmononukleotid-grupp (FMN) och ett dinukleotidfosfat (NADPH) som kofaktorer för den reduktiva reaktionen.
Histondeacetylaser
Deacetylaser som avlägsnar N-acetylgrupper från sidokedjorna till aminosyror i histoner. Några av dessa tillhör proteinfamiljen sirtuiner.