Kalmodulin
Ett värmestabilt aktivatorprotein med låg molekylvikt i ffa hjärna och hjärta. Genom kalciumjonbindning kan proteinet kopplas till cykliska nukleotidfosfodiesteraser och adenylcyklas och således utöva sin verkan. Därmed modulerar proteinet nivåerna av cykliskt AMP och cykliskt GMP.
Trifluoperazin
Trifluoperazine är ett typiskt antipsykotiskt läkemedel som tillhör gruppen fenotiaziner. Det används primärt för behandling av psykoser, schizofreni och allvarliga agitationstillstånd. Läkemedlet fungerar genom att blockera dopaminreceptorer i hjärnan, vilket kan hjälpa att reducera symtom som hallucinationer, förvirring och aggressivt beteende.
Kalmodulinbindande proteiner
Kalcium
Grundämne som förekommer i nästan all organiserad vävnad. Det tillhör alkalimetallerna och har kemiskt tecken Ca, atomnummer 20 och atomvikt 40. Kalcium är det allra vanligaste mineralämnet i kroppen och bildar i förening med fosfor kalciumfosfat, som ingår i ben och tänder. Det spelar en essentiell roll för nerv- och muskelfunktioner, i blodkoagulationsprocessen (som faktor IV) och i många enzymp rocesser.
Kalciumbindande proteiner
Myosinkinas
Myosin kinase, ofta förkortat Myosin Kinas eller Myosinkinas, är ett enzym som finns naturligt i kroppen och spelar en viktig roll inom cellernas signaltransduktionsvägar. Det hör till en grupp av enzymer som kallas serin/treoninkinaser och är specifika för att fosforylera, det vill säga addera en fosfatgrupp till, myosinproteinet.
Calcium-Calmodulin-Dependent Protein Kinase Type 2
Calcium-Calmodulin-Dependent Protein Kinase Type 2 (CaMKII) är ett intracellulärt enzym som spelar en viktig roll i cellers signaltransduktionsprocesser. Det aktiveras av ökade intracellulära calciumnivåer och består av flera underenheter som bildar en multimerisk komplexstruktur. CaMKII reglerar en rad cellulära funktioner, inklusive neurotransmission, excitation-contraction-koppling, genelexpression och celldelning. Dess abnormala aktivitet har visats vara involverad i flera patologiska tillstånd, såsom neurodegenerativa sjukdomar, kardiovaskulära sjukdomar och cancer.
Aminosyrasekvens
Proteinbindning
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
Molekylsekvensdata
Nötkreatur
Sulfonamider
Sulfonamider är en grupp av syntetiska antibiotika som är verksamma mot olika bakterier, inklusive stafylokocker och E. coli. De fungerar genom att hämma enzymet dihydropteroatsyntas, vilket behövs för bakteriens tillväxt och reproducering. Sulfonamider används vanligen för behandling av olika infektioner, såsom urinvägsinfektioner, hudinfektioner och öroninfektioner.
Bindningsplatser
EGTA
Ca(2+)-kalmodulinberoende proteinkinas
Ett kalmodulinberoende enzym som katalyserar fosforylering av proteiner. Enzymet är ibland också kalciumberoende. Ett stort antal proteiner verkar som mottagare, däribland vimentin, synapsin, glykogen syntas, myosinets lätta kedjor och mikrotubulusassocierade proteiner.
2`,3`-cyklisk-nukleotidfosfodiesteraser
Klorpromazin
Prototypen för psykosmedel av fentiazintyp. Liksom andra läkemedel denna klass tros klorpromazinets antipsykosverkan bero på en långvarig anpassing i hjärnan till en blockering av dopaminreceptorer. Klorpromazin har flera andra verkningsmekanismer och användningsområden, bl a mot illamående och ihållande hicka.
Kalciumtransporterande ATPaser
Ett enzym som förekommer i rörmembranen i det sarkoplasmatiska retiklet. Under avslappningsfasen hos skelettmuskler och mitokondrierika muskler katalyserar detta enzym den aktiva transporten av kalciu m från sarkoplasman in i det sarkoplasmatiska retiklets rör. Det kräver mikromolkoncentrationer av Ca(2+) och utnyttjar MgATP som substrat. EC 3.6.1.38.
Enzymaktivering
Fosforylering
3´5´-cyklisk nukleotidfosfodiesteras
Neurogranin
Neurogranin är ett protein som förekommer i dendritiska spön inne i nervceller (neuron) i hjärnan, särskilt i regioner relaterade till minnes- och läringsprocesser. Proteinet spelar en viktig roll i signaltransduktionen i neuron genom att binda till kalmodulin och modulera aktiviteten av proteinkinas C, vilket är involverat i synapsk plasticitet. Förändringar i neurograninnivåer har visats korrelera med neurodegenerativa sjukdomar som Alzheimers sjukdom, vilket gör det till ett potentiellt värdefullt biomarkör för att övervaka sjukdomsprocessen och utvecklingen av terapeutiska strategier.
Sesterterpener
Sesterterpener är en typ av organisk förening som innehåller en funktionell grupp bestående av en fem-kolsgrupp med två dubbla bindningar och två syreringsättade syreatomer. De är relaterade till terpener, men har en extra kolatom i deras struktur. Sesterterpener förekommer naturligt i vissa växter och djur och kan ha biologisk aktivitet, inklusive potential som läkemedel.
Melitten
Cyclic Nucleotide Phosphodiesterases, Type 1
Cyclic nucleotide phosphodiesterases (PDEs) are a family of enzymes that play a crucial role in regulating intracellular levels of cyclic adenosine monophosphate (cAMP) and cyclic guanosine monophosphate (cGMP), which are important second messengers involved in various cellular processes. The type 1 subtype of PDEs (PDE1) is a calcium/calmodulin-dependent enzyme that specifically hydrolyzes cAMP and cGMP. It is composed of several isoforms, encoded by different genes, that exhibit distinct expression patterns and regulatory properties. PDE1 is involved in the regulation of smooth muscle contraction, neurotransmission, and gene expression, among other functions. Dysregulation of PDE1 activity has been implicated in various pathological conditions, including cardiovascular diseases, pulmonary hypertension, and neurological disorders.
Kalcineurin
Ett kalcium- och kalmodulinbindande protein som finns främst i det centrala nervsystemet. Det består av två komponenter: en katalytisk enhet, kalcineurin A, och en reglerande enhet, kalcineurin B, med molekylvikter på 60 resp. 19 kD. Kalcineurin har visat sig kunna defosforylera en rad fosfoproteiner, som t ex histoner, myosinets lätta kedjor och regulatorenheten i cAMP-beroende proteinkinas. Det medverkar i styrningen av signalöverföring och utgör måltavla för en viktig grupp av immunosuppressiva läkemedel.
Calcium-Calmodulin-Dependent Protein Kinase Type 1
Calcium-Calmodulin-Dependent Protein Kinase Type 1 (CAMKK1) är ett enzym som tillhör familjen serin-threonin-proteinkinaser. Det aktiveras av intracellulärt calcium och calmodulin, vilket leder till fosforylering och därmed aktivering av olika proteiner involverade i cellulära signaltransduktionsvägar. CAMKK1 spelar en viktig roll i regleringen av cellcykeln, neurosignaleringsprocesser och metabolism.
Fentiaziner
Ca(2+)-Mg(2+)-ATPas
Paramecium
Paramecium är ett släkte inom protozoerna, som är en grupp encelliga eukaryota organismen. Paramecia är fritt levande och har en asymmetrisk, klockformad kropp med cilia (hår) på ytan som används för att röra sig och för att transportera föda till munnen. De lever i sötvatten- eller bräckt vattenmiljöer och äter bakterier och andra encelliga organismen. Paramecia reproducerar sig asexuellt genom delning, men de kan också fortplanta sig sexuellt genom ett process som kallas konjugation. Det är värt att notera att Paramecium inte är en medicinsk term, utan snarare en biologisk.
Proteinstruktur, tertiär
Peptidfragment
Ett peptidfragment är en kort sekvens av aminosyror som har beeneds klippt isär från ett större peptid eller protein.
Kalciumbindande EF-hand
Prenylamin
Prenylamine är ett läkemedel som tillhör gruppen kalciumkanalblockerare och används främst för behandling av kronisk stabilt angina pectoris (smärta i bröstet orsakad av hjärtats syrebrist). Prenylamin verkar genom att relaxera de glatta musklerna runt blodkärlen, vilket leder till en ökad blodflödesvolym och sänkt blodtryck. Detta kan hjälpa till att förbättra symtomatiken hos patienter med angina pectoris.
Getinggifter
Gifter producerade av stickande insekter tillhörande getingfamiljen (Vespidae), inkl. bålgeting. Gifterna innehåller enzymer, biogena aminer, histaminutlösande faktorer, kinener, giftiga polypeptider osv. De liknar bigifter.
Proteinkonfiguration
I enkelhet kan 'proteinkonfiguration' definieras som den specifika rymdstrukturen och orienteringen hos de aminosyror som utgör ett protein. Denna konfiguration bestäms av proteinkedjans primära struktur (sekvensen av aminosyror) samt hur dessa aminosyror är hopfogade och vevda i rummet, vilket kallas för sekundär, tertiär och kvartär struktur. Proteinkonfigurationen har en direkt betydelse för proteinets funktion och stabilitet.
Hjärna
Den del av det centrala nervsystemet som befinner sig innanför kraniet och som omfattar prosencefalon (framhjärnan), mesencefalon (mitthjärnan) och rombencefalon (ruthjärnan). Den uppstår ur främre de len av embryots nervtub. Dess funktioner inkluderar muskelkontroll och koordination, mottagande och behandling av sinnesintryck, talframställning, minneslagring samt hantering av tankar och känslor.
Proteinkinaser
Proteinkinaser är en grupp enzymer som katalyserar additionen av fosfatgrupper till proteiner, vilket ofta resulterar i att proteinets funktion eller lokalisation i cellen ändras. Denna process, kallad fosforylering, är en central mekanism i cellsignalering och regulerar en mängd cellulära processer, inklusive celldelning, apoptos (programmerad celldöd) och metabolism. Proteinkinaser spelar därför en viktig roll i underhåll och kontroll av cellens homeostas.
Kaniner
Fosforylaskinas
Kycklingar
Kalciumsignalering
Signalöverföringsmekanismer med mobilisering av kalcium (utifrån eller från intracellulära depåer) i cytoplasman till följd av yttre stimulans. Calciumsignalerna fortplantar sig som vågor, svängningar , spikar eller små stötar. Kalcium fungerar som intracellulär budbärare genom att aktivera kalciummottagliga proteiner.
Fosfordiesterhydrolaser
Muskelmage, fågel
Troponin
Troponin är ett protein som förekommer i muskelceller, inklusive hjärtmuskulaturen. Det finns tre typer av troponiner: Troponin C, Troponin T och Troponin I. Nivåerna av Troponin T och I i blodet kan användas som markörer för skada på hjärtmuskeln, till exempel vid hjärtinfarkt.
Polyakrylamidgelelektrofores
Affinitetskromatografi
Bensylaminer
Flufenazin
Ett fenotiazinpreparat för behandling av psykoser. Det har ungefär samma verkan och användningsområden som klorpromazin.
Molekylvikt
Troponin C
Troponin C är ett protein som ingår i troponinkomplexet på tunntarmstraffarnas (actinfilamentens) yta inne i hjärtmuskulaturen, och har en viktig roll i muskelkontraktionen genom att reglera calciumbindningen till aktinfilamentet. Troponin C är ett av tre proteiner som tillsammans med troponin I och troponin T bildar det regulatoriska komplexet troponin, som sitter på tunntarmstraffarnas yta och kontrollerar muskelkontraktionen genom att reglera kalciumjonernas bindning till aktinfilamentet. Troponin C har en hög affinitet till calciumjoner och kan därför fungera som en sensor för intracellulärt calciumnivå i muskelcellen, vilket är av stor betydelse för muskelkontraktionens initiering och styrning.
Myosiner
Myosin är ett protein som spelar en viktig roll inom muskelkontraktioner. Det är en huvudbestanddel av thick filamenten i sarcomeren, den grundläggande kontraktila enheten i striata muskler. Myosiner har en motor-liknande funktion och kan binda till aktinfilamentet och röra sig längs det genom att hydrolysera ATP, vilket resulterar i muskelkontraktion. I en mening kan man säga att myosin är "ett protein involverat i muskelkontraktioner genom att generera kraftfulla rörelser längs aktinfilamentet med hjälp av ATP-hydrolys."
Peptider
Rekombinanta proteiner
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
Myosin typ I
Myosin typ I, även känt som myosinin heavy chain 7 (MYH7) eller kardial myosin, är en specifik typ av myosin som huvudsakligen finns i de slags muskelceller som bildar hjärtmuskulaturen. Det är ett viktigt protein som spelar en central roll i kontraktionen och relaxationen av hjärtmuskeln genom att interagera med aktinfibriller och producera kraft för muskelfiberkontraktion. Myosin typ I har också visat sig vara involverat i patofysiologiska processer som relaterar till vissa typer av hjärtsjukdomar, såsom hypertrofisk kardiomyopati och dilaterad kardiomyopati.
Fosfoproteinfosfataser
Adenylatcyklas
Ett enzym i lyasklassen som katalyserar omvandlingen av ATP till 3´,5´-cykliskt AMP och pyrofosfat. Enzymet finns i plasmacellmembran och aktiveras av vissa hormoner (epinefrin, vasopressin, glukagon och kortikotropin). Reaktionsprodukten, cykliskt AMP, har en viktig regleringsfunktion i ämnesomsättningen. EC 4.6.1.1.
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Bigifter
Erytrocytmembran
Aktiner
Trådliknande proteiner som utgör huvuddelen av muskelfibrernas tunna trådar. Trådarna (också benämnda filamentöst - eller F-aktin) kan sönderdelas i globulära underenheter (G-aktin) bestående av en e nda polypeptid, 375 aminosyror lång. I samverkan med myosin ansvarar aktin för musklernas sammandragning och avslappning.
Proteinkinas C
Protein Kinase C (PKC) är ett enzym som spelar en viktig roll inom cellsignalering och regulerar en rad cellulära processer, såsom celldelning, differentiering, apoptos och cellytiska respons på till exempel växt hormoner och tillväxthormon. PKC aktiveras av diacylglycerol (DAG) och calciumjoner (Ca2+) och får därigenom förmågan att fosforylera, det vill säga överföra en fosfatgrupp till, specifika serin- eller treoninresidyer på målproteiner. Detta leder till en förändring av proteinet som kan leda till aktivering eller inaktivering av dess funktion. PKC finns i flera olika isoformer som varierar mellan olika celltyper och har olika substratspecifitet, reguleringsmekanismer och subcellulära lokaliseringsställen.