Ligasi Ubiquitina-Proteina
Una classe di enzimi che interagiscono con UBIQUITIN-CONJUGATING enzimi e proteine ubiquitination-specific substrati. Ogni membro di questo enzima gruppo ha un suo distinto specificità per un substrato ed ubiquitin-conjugating enzima. Ubiquitin-protein Ligasi esistono come due proteine Monomeriche multiprotein complessi.
Ligasi
Una classe di enzimi in grado di catalizzare la formazione di un legame fra due substrato molecole, insieme con l ’ idrolisi di una Pirofosfato titoli ATP o un'energia similare donatore. (28 Dorland, Ed, del trattato CE 6.
Endosomal Sorting Complexes Required for Transport
Una serie di proteine subcomplexes coinvolto PROTEIN Ubiquitinated USO di proteine nelle vescicole intraluminale di MULTIVESICULAR corpi e nella membrana benzisossazolica durante la formazione di vescicole intraluminale, durante la fase finale di CYTOKINESIS e durante la nascente di virus con capside lipidico. La ESCRT macchinari comprende la proteina prodotti di classe E proteina vacuolar di geni.
Enzimi Coniuganti L'Ubiquitina
Complessi Di Ligasi Ubiquitina-Proteina
Complessi di enzimi in grado di catalizzare la legame covalente con altre proteine della UBIQUITIN formando un legame peptidico tra la glicina di C-terminale alpha-amino UBIQUITIN e i gruppi di lisina residui nelle proteine. I complessi giocano un ruolo importante nel mediare l selective-degradation di breve durata e proteine anormali. Il complesso di enzimi può essere suddiviso in tre componenti che coinvolgono l 'attivazione di UBIQUITIN-ACTIVATING ubiquitin (enzimi), la coniugazione di ubiquitin al ligasi UBIQUITIN-CONJUGATING complesso (enzimi) e di legatura ubiquitin al substrato proteina (UBIQUITIN-PROTEIN Ligasi).
Ubiquitine
Una famiglia di proteine che vengono structurally-related a Ubiquitina. Ubiquitine e ubiquitin-like proteine partecipare in diverse funzioni cellulari, quali proteine degrado e Heat-Shock risposta, da coniugazione con altre proteine.
Ubiquitina
Un peptide conservato 76-amino acido universalmente trovato in eukaryotic cells che funziona come un indicatore per PROTEIN TRASPORTARE intracellulare e degrado. Ubiquitina viene attivato tramite una serie di complicazioni passi e forma un legame con la lisina isopeptide residui di specifiche proteine all'interno della cellula. Questi "Ubiquitinated" proteine possono riconosciuto e degradato dalla proteosomes o essere trasportato in compartimenti specifici all'interno della cellula.
Sequenza Aminoacidica
L'ordine di aminoacidi che si verifichi in una catena polipeptidica. Questo viene definito la struttura primaria di proteine, è molto importante nel determinare PROTEIN la conferma.
Dati Di Sequenza Molecolare
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Omologia Di Sequenza Di Amino Acido
Il grado di somiglianza tra sequenze di aminoacidi. Queste informazioni sono utili per la relazione genetica analisi di proteine e specie.
Dna Ligasi
Poli (deossiribonucleotide): Poli (deossiribonucleotide) Ligasi. Enzimi in grado di catalizzare l'unione di preformed deoxyribonucleotides in collegamento durante phosphodiester processi genetici durante la riparazione di una pausa spaiati in duplex DNA. Il corso include sia CE 6.5.1.1 (Atp) e CE 6.5.1.2 (NAD).
Skp Cullin F-Box Protein Ligases
Culline
Enzimi Attivanti L'Ubiquitina
Una classe di enzimi che catalizza la formazione di un i thioester legame tra sé e UBIQUITIN. E poi trasferisce il attivato ubiquitin a uno dei UBIQUITIN-PROTEIN Ligasi.
Ubiquitination
L'atto di legare con le proteine per formare UBIQUITINS ubiquitin-protein ligasi complessi di etichettare le proteine per trasporto per il proteosoma Endopeptidasi complesso dove proteolisi.
Complesso Proteasoma Endopeptidasi
Un grande complesso multisubunit che gioca un ruolo importante nel della degradazione delle proteine e nucleare citoplasmatica in eukaryotic cells. Contiene un 700-kDa sub-complex catalitica 700-kDa sub-complexes regolamentare e due. Il complesso digerisce Ubiquitinated proteine e proteine attivata tramite l ’ ornitin- decarbossilasi antizyme.
Proteine Protooncogene C-Cbl
Poliubiquitina
Oligomer si Ł costituito da un collega della telopeptide glicina di una molecola isopeptide UBIQUITIN attraverso un legame con la lisina residui su un secondo ubiquitin molecola. È strutturalmente molto diverso dal UBIQUITIN C, che è una proteina tandemly abbigliata ubiquitin contenente un peptide sequenza.
Legame Di Proteine
Proteine Del Saccharomyces Cerevisiae
Proteine ottenute dalla specie Saccharomyces cerevisiae. La funzione di proteine specifiche da questo organismo sono oggetto di intensa interesse scientifico e sono stati usati per ricavare comprensione del funzionamento proteine simili eukaryotes più alte.
Struttura Terziaria Della Proteina
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.
Endopeptidasi Della Cisteina
Sindrome Di Angelman
Una sindrome caratterizzata da collezionare anomalie multiple, un ritardo, e disturbi del movimento, regalo di solito sono cranio e altre anomalie (infantile, frequenti spasmi muscolari e infantile); facilmente provocabile e prolungata parossismi di risate (quindi "felice"); essiccata puppetlike movimenti (quindi "pupazzo"); lingua continua sporgenza; ritardo motoria, atassia, ipotonia, un muscolo strano facies. Questo è associato eliminazioni materna del cromosoma 15q11-13 e altre anomalie genetiche. (Dal Am J Med Genet 1998 dic. 4; 80 (4): 385-90; Hum Mol Genet 1999 Jan; 8 129-35) (1):
Polinucleotide Ligasi
Reticolociti
Immaturo eritrociti. Nell ’ uomo, queste sono cellule ematiche che hanno subito Extrusion del nucleo cellulare, che contengono ancora organelli diminuiscono gradualmente al numero che le cellule maturo. Ribosomi sono gli ultimi a sparire. Alcune macchie tecniche causare i ribosomi agevolare in genere caratteristici “Reticulum" (diverso) ENDOPLASMIC Reticulum, da cui deriva il nome reticolociti.
Motivi Strutturali Degli Aminoacidi
Comunemente osservati elementi portanti di proteine, formato da combinazioni di strutture secondaria adiacente. Un comunemente osservati struttura é composto da una sequenza di CONSERVED che possono essere rappresentate da un consenso sequenza.
Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome
Un sottocapo ubiquitin ligasi principalmente coinvolto nella regolamentazione della metaphase-to-anaphase transizione durante la mitosi attraverso ubiquitination di specifiche proteine CELLULARE CICLO dell 'attività degli enzimi strettamente regolato attraverso subunità e cofattori, che ne modulano l' attivazione, dell ’ inibizione, e substrato specificità. La Anaphase-Promoting complesso, o APC-C, è anche coinvolta nei tessuti differenziazione nella PLACENTA LENS cristallina, e muscolo scheletrico, e in regolamentazione delle postmitotic l'eccitabilità plasticità e neuronale.
Mutazione
Complessi Multienzima
Saccharomyces Cerevisiae
Ubiquitina Tiolesterasi
RING Finger Domains
Un dominio zinc-binding definita dalla sequenza Cysteine-X2-Cysteine-X (9-39) -Cysteine-X (-His-X a L3) (2 – 3) (-Cysteine-X2-Cysteine -X 4-48) -Cysteine-X2-Cysteine, dove x e 'un aminoacido. L'anello dito Motif si lega due atomi di zinco, zinco con ogni atomo legato tetrahedrally da cysteines o tre o quattro cysteines e istidina. Il tema anche in una struttura unitario cross-brace regione centrale e si trova in molte proteine che hanno coinvolto in interazioni protein-protein. L'acronimo anello rappresenta davvero interessante New Gene.
Specificità Del Substrato
Apc3 Subunit, Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome
Subunità altamente evolutivamente conservato del Anaphase-Promoting complesso (APC-C) contenente 34-amino-acid multiple tetratricopeptide si ripete. Questi settori, trovano anche nei APC subunità 6, 7 e 8, hanno mostrato di mediare protein-protein interazioni, suggerendo che Apc3 può essere di aiuto nel coordinare il contrasto fra la subunità riconoscimento e substrato catalitica modulo rispetto a co-activators e APC-C inibitori.
Apc10 Subunit, Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome
Non è necessario Apc10 coactivator-dependent substrato riconosciuta dalla Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome. Si lega alla subunità Apc2, che costituisce una parte del nucleo catalitica e interagisce con Coactivators CDH1 o Cdc20 per reclutare substrati al complesso.
Epithelial Sodium Channels
I canali del sodio salt-reabsorbing ematiche epiteliale trovato su quella linea la distale NEPHRON; la parte distale del colon; DUCTS ghiandole salivari; sudore, e il polmone artificiale. Sono AMILORIDE-sensitive e giocare un ruolo importante nel controllo di equilibrio, il volume, e pressione del sangue.
Tecniche Del Sistema Del Doppio Ibrido
Proiezione tecniche sviluppate prima nei lieviti per identificare geni che codificano interagire proteine. Variazioni sono utilizzati per valutare interazione tra proteine e altre molecole. Two-hybrid tecniche di analisi per protein-protein interazioni, one-hybrid per DNA-protein interazioni, three-hybrid interazioni per RNA-protein interazioni o interazioni n-hybrid ligand-based. Tecniche di analisi per mutazioni o di altre piccole molecole che dissociarsi interazioni note.
Proteine Di Trasporto
Proteine Di Trasporto Dei Nucleotidi
Rna Ligasi (Atp)
Proteine Leganti Il Calcio
Proteine quali gli ioni di calcio sono legati, possono agire da regolatore proteine, proteine di trasporto, o di proteine. Solitamente contengono EF mano muoventi.
Proteine Di Fusione Ricombinanti
Proteine ricombinanti prodotta dalla fusione di segmenti traduzione piu genetico geni formato dalla combinazione di acido nucleico REGULATORY SEQUENCES di uno o più geni con le proteine codifica sequenze di uno o più geni.
Cellule Hela
Proteine Del Ciclo Cellulare
Proteine che controllano la divisione cellulare CICLO. Questa famiglia di proteine include un'ampia varieta 'di corsi, incluso CYCLIN-DEPENDENT chinasi, chinasi mitogen-activated cicline e Phosphoprotein Phosphatases nonché il loro presunta substrati come CYTOSKELETAL chromatin-associated proteine, proteine, e Transcription FACTORS.
Proteine Nucleari
Proteine trovate nel nucleo di una cella. Non confondere con NUCLEOPROTEINS che sono proteine coniugato con acidi nucleici, che non sono necessariamente presente nel nucleo.
Inibitore Dell'Apoptosi Legato Al Cromosoma X
Peptido Idrolasi
Nello specifico Fosforico staccare le obbligazioni peptidica in proteine e peptidi. Esempi di sub-subclasses per questo gruppo includono EXOPEPTIDASES e Endopeptidases.
Siti Di Legame
F-Box Proteins
Una famiglia di proteine che condividere la F-Box e Motif protein-protein sia coinvolto in interazioni, giocano un ruolo importante nel processo di proteine ubiquition, per esempio se frequenta una varietà di substrati e poi associare nel quadro di riferimento UBIQUITIN Ligasi complessi. Esse siano depositate in ubiquitin-ligase complessa attraverso il legame alle proteine DOMINIO SKP.
Modificazioni Post-Traduzionali Delle Proteine
Nessuno dei vari con metodi enzimatici catalizzato modificazioni post-traduzionali peptidi o di proteine nella cella d'origine. Queste modifiche includono carboxylation; idrossilazione; acetilazione; fosforilazione; metilazione; glicosilazione; ubiquitination; ossidazione; proteolisi; e crosslinking e determinare variazioni di peso molecolare o Electrophoretic motilità.
Proteine
Che sono sintetizzati glicosilati di lineare su ribosomi e può essere ulteriormente modificato, crosslinked, tagliato o assemblata in le proteine complesse con diversi subunità. La specifica sequenza di amminoacidi del polipeptide ACIDS determina la forma, durante PROTEIN SCATOLA, e la funzione della proteina.
Trasfezione
Glutatione Transferasi
Endopeptidasi
Una tipologia di peptide Fosforico in grado di catalizzare i peptidi o di proteine.
Allineamento Di Sequenze
L'accordo di due o più sequenze di base aminoacido o un organismo o organismi in modo tale da allineare le aree di condividere le sequenze proprietà comuni. Il grado di relazione o omologia tra le sequenze prevista computationally o statisticamente basato su pesi attribuiti agli elementi allineati tra le sequenze. A sua volta questo puo 'servire da indicatore genetica potenziale relazione tra gli organismi.