Metabolic Networks and Pathways
Metabolismo
Le reazioni chimiche che si verifichi entro le cellule, tessuti o un organismo. Questi processi includono la biosintesi (ANABOLISM) e la disaggregazione (catabolismo) di materiali organici, utilizzata dall'organismo vivente.
Biologia Dei Sistemi
Modelli Biologici
Rappresentazioni teorico che simula il comportamento o dell 'attività degli processi biologici o malattie. Le cellule come modelli per le malattie in animali viventi, malattia modella, animale e' disponibile. Modello biologico includono l ’ uso di equazioni matematiche, computer e altre apparecchiature elettroniche.
Simulazione Computerizzata
Gene Regulatory Networks
Interagire DNA-encoded sottosistemi di regolamentazione nel genoma che coordinano il contributo di attivatore ed repressiva Transcription FACTORS durante lo sviluppo, differenziazione cellulare, o in risposta a stimoli ambientali. Le reti in funzione specifica espressione di particolare serie di GENI per condizioni specifiche, orari o posti.
Biologia Computazionale
Un campo della biologia lo sviluppo delle tecniche per la raccolta e alla manipolazione di informazioni biologiche, e l ’ uso di tali dati per essere scoperte biologico o fare pronostici. Questo campo racchiuda tutti metodi computazionali e teorie per risolvere problemi biologici incluso manipolazione di modelli e serie di dati.
Metabolome
Algoritmi
Enzimi
Reti Neurali (Computer)
Un computer in architettura, implementable hardware o software biologico, modellato reti neurali. Come il sistema biologico in cui l 'elaborazione capacita' e 'il risultato dell'interconnessione dosaggi tra fasci di elaborazione non lineari dei nodi, reti neurali computerizzato, spesso chiamata perceptrons o multilayer modelli connectionist, unità neuron-like, un gruppo di unità inventa uno strato. Queste reti sono bravo nel riconoscere gli schemi. Sono in grado di adattarsi a svolgere compiti d'esempio, e sono quindi meglio per le decisioni di è lineare macchine per imparare o ammasso analisi. Non pretendono esplicito programmazione.
Biomassa
Metabolomics
L 'individuazione e quantificazione di tutti i prodotti metabolici di una cellula, tessuto, organo o organismo sotto diverse condizioni. Il METABOLOME di una cella o organismo è una dinamica collezione dei metaboliti che rappresentano la sua risposta netta con le attuali condizioni.
Metabolic Engineering
Metodi e sulle tecniche adottate modificare geneticamente... idrossimetil prodotto output e sviluppare condizioni per coltivare le cellule come bioreattori.
Autotrophic Processes
Il processo con cui usare semplici organismi quali sostanze inorganiche gassosa o diluita biossido di carbonio e azoto inorganico come nutritivo fonti. Contrasta con heterotrophic processi che fanno uso di materiali organici, come il nutritivo: Fonte di rifornimento. Può essere sia chemolithotrophs chemoautotrophs (o) e hanno Archaea e batterio, che usare anche semplice sostanze inorganiche per la loro energia metabolica reguirements photoautotrophs photolithotrophs; o (o) quali piante e i cianobatteri, che derivarne la loro energia dalla luce. Dipende da condizioni ambientali alcuni organismi possono variare tra diversi modelli nutrizionale (autotrophy; HETEROTROPHY; chemotrophy PHOTOTROPHY); o di utilizzare fonti diverse di incontrare i nutrienti e fabbisogno energetico.
Escherichia Coli
Una specie di, Facultatively anaerobi gram-negativi, forma a bastoncino batteri (anaerobi Gram-negativi Facultatively RODS) comunemente trovato nella parte inferiore dell ’ intestino di gli animali a sangue caldo. Di solito si nonpathogenic, ma alcuni ceppi sono nota per avere la diarrea e infezioni piogeno. Ceppi (patogeni virotypes) sono classificati in base al patogeno specifici meccanismi quali tossine (Enterotoxigenic Escherichia coli), ecc.
Proteoma
La proteina varieta 'di un organismo codificato con il suo genoma.
Ciclo Dell'Acido Citrico
Una serie di reazioni di tipo ossidativo nella decomposizione delle unità di acetilene derivati da GLUCOSIO; VENTRESCA ACIDS ACIDS; o per mezzo di aminoacidi dell ’ acido tricarbossilico intermedi. I prodotti finali sono CARBON carbonica, acqua ed energia sotto forma di fosfato obbligazioni.
Mappatura Delle Interazioni Tra Proteine
Metodi di determinazione interazione tra proteine.
Carbonio
Grafica Computerizzata
Modelli Genetici
Ciclizzazione Del Substrato
Una serie di reazioni opposte, nonequilibrium catalizzato da diversi enzimi che agire simultaneamente, con almeno una delle reazioni guidata da ATP idrolisi. I risultati del ciclo che ATP energia è esaurita, calore, sono prodotti e senza rete substrate-to-product conversione prefissato. Esempi di substrato ciclismo sono ciclismo della gluconeogenesi e del ciclismo glicolisi le vie e dei trigliceridi e degli acidi grassi. Tassi di substrato ciclismo può essere aumentata many-fold in associazione con hypermetabolic stati derivante da ustioni gravi, freddo, o ipertiroidismo, esercizio.
Biochemical Processes
Escherichia Coli K12
Una specie di batteri gram-negativi, forma a bastoncino appartenente al gruppo K di Escherichia coli, vive come un innocuo abitante del grosso intestino umano ed e 'stata usata in campo medico e genetico.
Glicolisi
Un processo metabolico che converte GLUCOSIO in due molecole di PYRUVIC acido attraverso una serie di reazioni enzimatiche. L'energia liberata durante questo processo è conservato in due molecole di ATP. Glicolisi catabolico universale è il livello di glucosio o di glucosio, di glucosio, di scarto derivati da carboidrati complessi, come glicogeno e STARCH.
Profilo Di Espressione Genica
Studio Del Genoma
Lo studio sistematico della completa sequenze di DNA (genoma) degli organismi.
Interfaccia Utente-Computer
Saccharomyces Cerevisiae
Via Dei Pentoso-Fosfati
Un processo che converte la decarbossilazione ossidativo glucosio-6-fosfato a D-ribose-5-phosphate 6-phosphogluconate pentose attraverso il prodotto viene usato nella biosintesi of nucleic ACIDS. La generazione di energia nella forma di NADPH. Questa via di spicco nel tessuti che operano nella sintesi del VENTRESCA ACIDS e STEROIDS.
Heterotrophic Processes
Il processo con cui organismi biologici come utilizzare sostanze nutrienti fonti. Contrasta con AUTOTROPHIC PROCESSI che stanziano semplice sostanze inorganiche come nutrienti fonte. Heterotrophs possano chemoheterotrophs (o chemoorganotrophs) che richiedono sostanze quali organico anche glucosio per la loro energia metabolica primaria, o photoheterotrophs (o photoorganotrophs) che derivarne la loro energia primaria vigente dalla luce. Dipende da condizioni ambientali alcuni organismi possono variare tra diversi modelli nutrizionale (AUTOTROPHY; heterotrophy; chemotrophy PHOTOTROPHY); o di utilizzare fonti diverse di incontrare i nutrienti e fabbisogno energetico.
Trasduzione Del Segnale
Il trasferimento delle informazioni biologiche intracellulare (attivazione / inibizione) attraverso un segnale di trasduzione del segnale. In ogni sistema un'attivazione / inibizione segnale di una molecola ormone di differenziazione, biologicamente attivo (neurotrasmettitore) è mediato l'accoppiamento di un recettore / enzima per un secondo messaggero sistema o di trasduzione del segnale canale ionico. Gioca un ruolo importante nel attivando funzioni cellulari, cella differenziazione e la proliferazione cellulare. Esempi di trasduzione del segnale sistemi sono il canale ionico gamma-aminobutyric ACID-postsynaptic receptor-calcium mediato dal sistema, la via metabolica, l 'attivazione dei linfociti T e l'attivazione mediata dai recettori di membrana collegato a fosfolipasi. Quei depolarizzazione o rilascio intracellulare di calcio includono l' attivazione mediato citotossica sinaptici granulociti ed è un potenziamento dell ’ attivazione della protein-chinasi. Vie di trasduzione del segnale può essere una parte dei suoi vie di trasduzione del segnale; ad esempio, protein chinasi attivazione è parte del segnale di attivazione delle piastrine.
Architettura Del Software
E le istruzioni specifiche per il software.
Metabolismo Energetico
Le reazioni chimiche coinvolto nella produzione e utilizzo di varie forme di energia alle cellule.
Cluster Analysis
Una serie di metodi statistici utilizzati per le variabili in gruppo o osservazioni fortemente inter-related i sottogruppi. In epidemiologia, può essere usato per analizzare un strettamente raggruppati serie di eventi o di una malattia o di altri fenomeni con lo schema di distribuzione ben definiti alla salute in relazione al tempo o luogo o entrambi.
Basi Di Dati Fattuali
Esteso collezioni, dovrebbe essersi completa, di fatti e dati raccolti da materiali di uno specialista nell'area suddetta analisi e reso disponibile per la raccolta e l ’ applicazione può essere automatizzati contemporaneo vari metodi per il recupero. Il concetto devono essere differenziate da bibliografici DATABASES, vietata per collezioni di riferimenti bibliografici.
Genoma
Biological Evolution
Evoluzione Molecolare
Il processo di cambiamento a livello cumulativo del DNA, RNA e proteine, per generazioni successive.
Phototrophic Processes
Processi phototrophic organismi con cui usano la luce del sole come la loro principale fonte di energia. Contrasta con chemotrophic processi che non spetti a luce e funzione nella definizione di energia da fonti chimica esogene. Photoautotrophy (o photolithotrophy) è l ’ abilità di usare la luce del sole come energia per sistemare le sostanze nutritive inorganico usata in altri requisiti organica. Photoautotrophs includono tutte piante verde, verde alghe; cianobatteri e verde e viola, SULFUR Photoheterotrophs o photoorganotrophs richiede una scorta di nutrienti biologici organici per i loro requisiti, usano la luce del sole come la loro principale fonte di energia; esempi includono alcuni NONSULFUR viola, dipende da condizioni ambientali alcuni organismi possono variare tra diversi modelli nutrizionale (AUTOTROPHY; HETEROTROPHY; chemotrophy phototrophy); o di utilizzare fonti diverse di incontrare i nutrienti e fabbisogno energetico.
Cellule
Modelli Statistici
Le formulazioni statistica e analisi che, quando applicata a dati e trovato per i dati, e poi utilizzata per verificare le ipotesi e parametri utilizzati nell ’ analisi. Esempi di modelli statistici sono i modelli lineari, doppia modello, modello, modello polinomiale two-parameter, ecc.
Batteri
Uno dei tre i dominii della vita (e gli altri sarebbero Eukarya e Archaea), anche chiamato Eubacteria. Sono unicellulari procariote microrganismi che generalmente hanno pareti cellulari rigido, moltiplicare per la divisione cellulare, e mostrano tre principali forme: Rotonda o coccal, rodlike o Bacillary e spirale o spirochetal. I batteri possono essere classificate secondo la risposta al ossigeno: Microrganismi anaerobi Facultatively anaerobi, o per le modalità mediante le quali ottenere la loro energia: Chemotrophy (attraverso reazione chimica) o tramite luce PHOTOTROPHY (reazione); per chemotrophs dalla loro fonte di energia chimica: CHEMOLITHOTROPHY (dal composti inorganici) o da chemoorganotrophy (composti organici); e la loro fonte di CARBON; azoto, ecc. (Dal materiale organico HETEROTROPHY fonti) o (da CARBON AUTOTROPHY diossido), possono anche essere classificate secondo se mi macchiano (basata sulla struttura della parete cellulare) con la metanfetamina Violet tinta: Aerobi gram-positivi o.
Fenotipo
L'apparenza esteriore dell'individuo. E 'il risultato di interazioni tra geni e tra il genotipo e l ’ ambiente.
Archaea
Uno dei tre i dominii della vita (il batterio e gli altri), un tempo chiamato Eukarya archeobatterio sotto il tassonomiche Batteri, ma ora considerati separati e distinti. Sono caratterizzato da: (1) la presenza del tRNAs e RNAS ribosomiche; (2) assenza di peptidoglicano pareti cellulari; (3) la presenza di lipidi ether-linked costruita dal branched-chain subunità; e (4) la loro incidenza di habitat. Mentre Archaea assomigliano batteri nella morfologia e organizzazione genomica, assomiglia eukarya nel loro modo di replicazione genomica. Il dominio contiene almeno quattro regni: CRENARCHAEOTA; EURYARCHAEOTA; NANOARCHAEOTA; e KORARCHAEOTA.
Rete Neuronale
Una struttura composto meshlike interconnessi cellule nervose che sono separati alla giunzione sinaptici o unite le une alle altre dalla creatura citoplasmatica negli invertebrati, per esempio, il coraggio di rete nervose sparse su una vasta zona della rete perché sinapsi possono passare informazioni in qualsiasi direzione.
Regolazione Batterica Dell'Espressione Genica
Uno dei processi che citoplasmatica o fattori di interregolazione cellulare influenza il differenziale il controllo di Gene azione nei batteri.
Clostridium Acetobutylicum
Una specie di batteri gram-positivi in famiglia Clostridiaceae, usati per la produzione industriale di solventi.
Modelli Teorici
Internet
Gliossilati
Gliosiolati sono composti organici che contengono un gruppo funzionale glioxalico (-CHO) legato a due gruppi funzionali ammidici (-CONH2), comunemente derivanti dal metabolismo degli aminoacidi.
Methylobacterium Extorquens
Una specie di METHYLOBACTERIUM che può utilizzare acetato, etanolo o metilammina come unico risorsa di carbonio. (Dal Bergey 'Manuale delle determinanti Batteriologia, nono Ed)
Teoria Dei Sistemi
Principi, modelle, e le leggi che regolano i rapporti complessi e interdipendenze di serie di componenti collegati che formano un intero, un sistema operativo qualsiasi sistema puo 'essere composte da componenti che sono un sistema da solo (sottosistemi), come molti organi all'interno di un singolo organismo.
Gene Knockout Techniques
Photobioreactors
Dispositivi per la produzione che usano i prodotti biologici leggero come la fonte di energia. Sono utilizzati per detenzione di biomassa produzione come crescere i muschi così cianobatteri, o delle alghe.
Methanosarcina Barkeri
Una specie di microbo halophilic Archaea nonmotile. Il cui habitat includono acqua dolce e fango, animal-waste lagune marine, e la rumens di tecari ungulati.
Buchnera
Integrazione Di Sistemi
Proteomica
Molecular Sequence Annotation
Arabidopsis
Una pianta genere della famiglia BRASSICACEAE che contiene proteine e Arabidopsis MADS DOMINIO proteine. La specie A. thaliana è utilizzato per esperimenti in genetíca applícata classica così come in genetica molecolare, biochimica e fisiologia delle piante.
Regolazione Fungina Dell'Espressione Genica
Complessi Multienzima
Sistema di enzimi che funzione consecutivi in sequenza da catalizzatore reazioni legate da comune intermedi metaboliche possono coinvolgere semplicemente un trasferimento di molecole d'acqua o atomi di idrogeno e può essere associata a grandi strutture supramolecular come mitocondri o ribosomi.
Delezione Genica
Un riarrangiamento tramite perdita di segmenti di DNA o RNA sequenze, che normalmente sono separati in prossimita '. Questa delezione può essere individuata mediante tecniche citogenetica e può anche essere dedotte da il fenotipo, indicando una cancellazione a uno specifico locus.
Reti Di Comunicazione Di Computer
Proteine Dell'Escherichia Coli
Proteine ottenuti da Escherichia coli.
Glucosio
Una fonte d'energia fondamentale per gli organismi viventi. E 'naturale' frutta e altre parti di piante nel proprio Stato libero terapeuticamente è utilizzato in un fluido e nutriente sostituto.
Carbon Cycle
Thermoanaerobacterium
Una specie di batteri anaerobi gram-positivi, in famiglia Thermoanaerobacteriaceae. Sono di idrolase e saccharolytic.
Ambiente
Isotopi Di Carbonio
Piante
Eucariotiche pluricellulare, forme di vita di regno Plantae (sensu), il lato VIRIDIPLANTAE; RHODOPHYTA; e GLAUCOPHYTA; tutti cloroplasti acquisita direttamente endosymbiosis dei cianobatteri. Sono principalmente fotosintetici, caratterizzata da un meccanismo di alimentazione. La crescita illimitata a localizzato regioni di divisioni cellulari; cellulosa (meristems) all ’ interno delle cellule di organi rigidità; assenza di locomozione; assenza di nervoso e sistema sensoriale, e un'alternanza di auxotrofi e diploidi generazioni.
Fermentazione
Anaerobi degradazione di GLUCOSIO o altri nutrienti biologici per ottenere energia sotto forma di ATP. Prodotti finali variare a seconda dei substrati e gli organismi enzimatici. Comune fermentazione prodotti comprendono etanolo e LACTIC acido.
Termodinamica
Un rigoroso analisi matematica di energia relazioni (aumento della temperatura, il lavoro, temperatura corporea), and equilibrium. Descrive i sistemi il cui Stati sono determinate dai parametri termici, quali febbre, oltre ai meccanici e parametri elettromagnetica. (Dal Hawley Condensed Chemical Dictionary, dodicesimo Ed)
Corynebacterium Glutamicum
Una specie di gram-positivi, bastoncelli Irregolari, non-pathogenic, batteri del terreno che produce l acido.
Reti Civiche
Adattamento Biologico
Riproducibilità Dei Risultati
Riproducibilità Dei misure statistiche (spesso in un contesto clinico), incluso il controllo di strumenti e tecniche per ottenere risultati riproducibile. Il concetto include riproducibilità Dei misurazioni fisiologiche, che può essere utilizzato per valutare la probabilità di sviluppare regole o prognosi, o dalla risposta agli stimoli; riproducibilità Dei verificarsi di una condizione; e risultati sperimentali riproducibilità Dei.
Ingegneria Genetica
Frammentografia Di Massa
Compressione Di Dati
Informazioni applicazione basata su una varietà di metodi di codifica per minimizzare la quantità di dati devono essere conservati recuperata o trasmesse. Compressione di dati possono essere applicati in varie forme di dati, come immagini e dei segnali. E 'utilizzato per ridurre i costi e l' efficienza nel mantenimento della ingenti volumi di dati.
Genoma Delle Piante
Complemento del DNA di una pianta (piante) rappresentata nel suo DNA.
Vitamina K3
Modelli Chimici
Regolazione Dell'Espressione Genica
Analisi Per Componenti Principali
Proteine Del Saccharomyces Cerevisiae
Proteine ottenute dalla specie Saccharomyces cerevisiae. La funzione di proteine specifiche da questo organismo sono oggetto di intensa interesse scientifico e sono stati usati per ricavare comprensione del funzionamento proteine simili eukaryotes più alte.
Analisi Di Sequenze Attraverso Un Pannello Di Oligonucleotidi
Nadp
Nicotinamide adenina dinucleotide fosfato, un composto di coenzima ribosylnicotinamide 5 '-Fosfato NMN) (attacchi di Pirofosfato con il 5' -Fosfato adenosina 2 ', 5' -bisphosphate. È un elettrone portaerei in un certo numero di reazioni, essere in alternativa ossidato (NADP +) e ridotta (NADPH) (Dorland, 27 Ed)
Adattamento Fisiologico
I cambiamenti biologici non genetico di un organismo in risposta a sfide nel suo ambiente.
Rete Di Trans-Golgi
Una rete di membrana situati ai compartimenti citoplasmatica parte del Golgi APPARATUS, dove proteine e lipidi sono ordinati per il trasporto a varie localita 'in cella o membrana cellulare.
Aminoacidi
I composti organici che generalmente contiene una amino (-NH2) e un carbossile (-COOH). 20 alpha-amino acidi sono i subunità che sono polymerized per formare delle proteine.
Chimica Organica
Lo studio della struttura, preparazione, proprietà e reazioni di composti di carbonio. (McGraw-Hill Dictionary of Voglia scientifico e tecnico, sesto Ed)
Cellule Procariotiche
Proteine Batteriche
Proteine trovate in una specie di batteri.
Fotosintesi
La sintesi di composti chimici organici da organismi, specialmente carboidrati, da anidride carbonica ottenuti usando l'energia dalla luce piuttosto che dal ’ ossidazione di composti chimici. Fotosintesi si compone di due processi separati la luce e oscurita '. Reazioni reazioni nei maggiori piante; alga verde, e i cianobatteri; NADPH e ATP formato dalla luce al buio reazioni guidare reazioni che determinano l'ossessione di anidride carbonica. (Da Oxford Dictionary of Biochimica e biologia, 2001)
Basi Di Dati Di Proteine
Database contenente informazioni di proteine quali amino acido sequenza; PROTEIN la conferma, e altre proprieta '.
Intelligenza Artificiale
Mutazione
Logica Fuzzy
Ragionamento quantitativo approssimativi, che è preoccupato dell'ambiguità linguistici che esiste in linguaggio naturale o sintetica in fondo sono variables such as buono, cattivo, e giovane nonché avverbi come piu ', meno e molto. I termini ordinari rappresentano Fuzzy sets in un particolare problema. Logica sfumata svolge un ruolo fondamentale in molti medici sistemi esperti.
Convalida Del Software
L'atto di testando il software per la conformità con il cambio manuale.
Lactobacillus Plantarum
Una specie di forma a bastoncino, LACTIC acido foraggio probiotici e batteri usato nella produzione.
Biotecnologia
Corpo di conoscenze correlati all ’ uso di organismi, cellule o Cell-Derived elettori nello sviluppo prodotti che possono essere tecnicamente scientificamente e clinicamente utile. Alterazione della funzione biologica a livello molecolare (ossia, genetico ENGINEERING) è un tema centrale; laboratorio dei metodi utilizzati includono TRANSFECTION e sulla clonazione tecnologie, sequenza e la struttura algoritmi di analisi, computer banche dati e analisi Gene e struttura proteica funzionalità e previsione.
Trascrizione Genetica
Memorizzazione E Reperimento Dell'Informazione
Teorema Di Bayes
Un teorema nella teoria delle probabilità di nome di Thomas Bayes (1702-1761). In epidemiologia è usato per ottenere la probabilità di malattia in un gruppo di persone con una caratteristica sulla base del tasso complessivo della malattia e dei rischi di tale caratteristica in individui sani e malato. La più preparata nel corso dell 'analisi decisione dove è utilizzato per stimare le probabilità di un particolare diagnosi data la comparsa di sintomi o risultati degli esami.
Protein Interaction Maps
Microbiologia Industriale
Regolazione Dell'Espressione Genica Delle Piante
Uno dei processi che nucleare, citoplasmatica o fattori di interregolazione cellulare influenza il differenziale il controllo di Gene azione nelle piante.
Specificità Delle Specie
La restrizione una caratteristica comportamento, struttura anatomica o sistema fisico, come risposta immunitaria; risposta metabolico, o Gene o del gene variante ai membri di una specie. Si riferisce a quella proprieta 'che distingue una specie di un'altra ma è anche utilizzato per phylogenetic livelli maggiori o minori di quanto la specie.
Terreni Di Coltura
Qualsiasi liquido o solido preparazione fatto appositamente per la crescita, custodia o trasporto di microrganismi o altri tipi di cellule, la varietà di media che esistono allow for the culturing di specifici tipi di cellule microrganismi e, come la media, selettivo, dei media test media e definito media, solida media consistere di liquido media che sono stati solidificato con un agente come Agar o gelatina.
Proteine
Che sono sintetizzati glicosilati di lineare su ribosomi e può essere ulteriormente modificato, crosslinked, tagliato o assemblata in le proteine complesse con diversi subunità. La specifica sequenza di amminoacidi del polipeptide ACIDS determina la forma, durante PROTEIN SCATOLA, e la funzione della proteina.
Fattori Di Trascrizione
Di solito endogena attivi, proteine, che siano efficaci nel trattamento dell 'inizio del trattamento, stimolazione, o la cessazione dell' trascrizione genetica.