Proteínas de Unión al ARN
Proteínas que se unen a moléculas de ARN. Están incluidas aquí las RIBONUCLEOPROTEÍNAS y otras proteínas cuya función es unirse especificamente al ARN.
Antígenos Hu de la Encefalomielitis Paraneoplásica
Familia de proteínas de unión al ARN que son homólogas de la proteína ELAV de Drosophila. Inicialmente se identificaron en seres humanos como dianas de autoanticuerpos en pacientes con ENCEFALOMIELITIS PARANEOPLÁSICA. Se piensa que regulan la EXPRESIÓN GÉNICA a nivel postranscripcional.
Proteína FUS de Unión a ARN
Ribonucleoproteína heterogénea-nuclear multifuncional que puede desempeñar un papel en el apareamiento y recombinación de ADN homológo. La porción N-terminal de la proteína es un potente activador transcripcional, mientras que se requiere el extremo C para la unión al ARN. El nombre FUS hace referencia al hecho de que los fenómenos de recombinación genética dan lugar a proteteínas oncogénicas de fusión (PROTREÍNAS ONCOGÉNICAS) que contienen la región N-terminal de esta proteína. Se han encontrado estas proteínas de fusión en el liposarcoma mixoide (LIPOSARCOMA MIXOIDE) y en la leucemia mieloide aguda.
Regiones no Traducidas 3'
Secuencia en el extremo 3' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta región contiene secuencias reguladoras de la transcripción y de la traducción.
Estabilidad del ARN
Grado en el que una molécula de ARN retiene la integridad estructural y resiste a la degradación por ARNasas y a HIDRÓLISIS catalizada por base, bajo condiciones variables in vivo o in vitro.
Ribonucleoproteínas Nucleares Heterogéneas
Familia de ribonucleoproteínas encontradas originalmente como proteínas unidas a tránscritos de ARN nacientes en forma de partículas de ribonucleoproteínas. Aunque consideradas ribonucleoproteínas, fueron clasificadas en principio atendiendo a su componente proteico. Se hallan implicadas en una variedad de procesos tales como empaquetamiento del ARN y TRANSPORTE del ARN dentro del núcleo. Un subgrupo de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas se hallan implicadas en otras funciones, como el transporte intracitoplásmico (TRANSPORTE ACTIVO, NÚCLEO CELULAR) del ARN y la estabilidad del ARNm en el CITOPLASMA.
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Secuencia de Bases
Procesamiento Postranscripcional del ARN
Modificación biológica postranscripcional de ARNs mensajeros, de transferencia o ribosómicos o sus precursores. Incluyen la ruptura, metilación, tiolación, isopentilación, formación de pseudoridina, alteraciones conformacionales y la asociación con proteínas ribosómicas.
Secuencia de Aminoácidos
Unión Proteica
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo D
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Proteína de Factor 1 del Huésped
Factor de integración del huésped, que originariamente fue identificado como una proteína bacteriana necesaria para la integración del bacteriófago Q beta (ALOLLEVIVIRUS). Su función celular puede ser la de regular la estabilidad y procesamiento del ARNm ya que se une estrechamente al poli(A)ARN e interfiere con las uniones ribosómicas.
Proteínas de Unión a Poli(A)
Sitios de Unión
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo A-B
Clase de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas muy relacionadas, de aproximadamente 34-40 kD de tamaño. Aunque generalmente se encuentran en el nucleoplasma, también hacen de enlace entre el núcleo y el citoplasma. Se ha demostrado que los miembros de esta clase tienen una función en el transporte de ARNm, biogénesis telómera y EMPALME DEL ARN.
Proteína del Retraso Mental del Síndrome del Cromosoma X Frágil
Proteína que se une al ARN, que se encuentra fundamentalmente en el CITOPLASMA. Ayuda a regular la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS en las NEURONAS y está ausente o infraexpresado en el SÍNDROME DEL CROMOSOMA X FRÁGIL.
Citoplasma
Homología de Secuencia de Aminoácido
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Células HeLa
Empalme Alternativo
Proceso en el cual muchas transcripciones de ARN se generan a partir de un solo gen. El empalme alternativo implica el empalme conjunto de otros conjuntos posibles de EXONAS durante el procesamiento de algunas, aunque no todas, las transcripciones del gen. Por tanto, una exona particular puede estar conectada a cualquiera de las diversas exonas alternativas para formar un ARN maduro. Las formas alternativas maduras de ARN MENSAJERO producen ISOFORMAS DE PROTEÍNAS en las que una parte de las isoformas es común, mientras que las otras partes son diferentes.
ARN Bicatenario
ARN constituido por dos cadenas, en oposición al ARN de una sóla cadena que tiene mayor prevalencia. La mayoría de los segmentos bicatenarios se forman por la transcripción del ADN, por pareamiento intramolecular de las bases se secuencias complementarias invertidas por un asa de una sola cadena. Algunos segmentos bicatenarios de ARN son normales en todos los organismos.
Tristetraprolina
MOTIVO DEDO DE ZINC que contiene un factor de transcripción originalmente identificado como una de las PROTEÍNAS INMEDIATAS TEMPRANAS. Conecta el CITOPLASMA con el NÚCLEO CELULAR y está involucrado en la desestabilización de ARNm por el FACTOR DE NECROSIS TUMORAL ALFA.
Regulación de la Expresión Génica
Proteínas del Factor Nuclear 90
Familia de proteínas de unión al ARN bicatenario que se relacionan con los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN NFATC. Además de unirse al ARN, las proteínas del factor nuclear 90 forman complejos heterodiméricos que regulan la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y pueden desempeñar una función en la activación de los LINFOCITOS T.
Antígenos de Superficie
Precursores del ARN
Transcripciones de ARN del ADN que se encuentran en alguna etapa inconclusa de procesamiento post-transcripcional ( PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN ) necesarios para la función. Precursores de ARN pueden someterse a varias etapas del EMPALME DEL ARN durante el cual los enlaces fosfodiesterasas en los límites exón-intrón se escinden y se extraen los intrones. En consecuencia se forma un nuevo enlace entre los extremos de los exones. Resultantes de ARN maduros se pueden utilizar, por ejemplo, ARNm maduro (ARN MENSAJERO) se usa como una plantilla para la producción de proteínas.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Secuencias Reguladoras de Ácido Ribonucleico
Secuencias dentro del ARN que regulan el procesamiento, la estabilidad (ESTABILIDAD DEL ARN) o la traducción de ARN (vea BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS).
Transporte de ARN
El proceso de pasar moléculas específicas de ARN de un compartimento celular o región a otra por diversas operaciones de selección y mecanismos de transporte.
Proteína de Unión de Tracto de Polipirimidina
Proteína de unión al ARN que se une a regiones ricas en polipirimidina en los INTRONES de los ARN mensajeros. La proteína de unión al tracto de polipirimidina puede estar implicada en la regulación del AYUSTE ALTERNATIVO de los ARNm, ya que su presencia en una región de ARN intrónica secuencia arriba de un EXÓN inhibe el ayuste del exón en el producto ARNm final.
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo C
Grupo heterogéneo de ribonucleoproteinas nucleares muy relacionadas, de aproximadamente 41-43 kD de tamaño, que se encuentran en el núcleo celular. Se ha implicado a los miembros de esta clase en distintos procesos, incluyendo el emplame, poliadenilación y retención nuclear de ARN.
Factores de Transcripción de Octámeros
Mutación
Ratones Quaking
Proteínas Nucleares
Polirribosomas
Estructura multirribosómica que representa una secuencia lineal de RIBOSOMAS los cuales se mantienen unidos por el ARN MENSAJERO. Estos polirribosomas constituyen los complejos activos en la síntesis proteica celular y son capaces de incorporar los aminoácidos a los polipéptidos tanto in vivo como in vitro. (From Rieger, et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
Conformación de Ácido Nucleico
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Secuencias de Aminoácidos
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
Interferencia de ARN
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
Proteínas Reguladoras del Hierro
Poli G
Transcripción Genética
Proteínas de Unión al ADN
Proteínas Recombinantes de Fusión
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo K
Ribonucleoproteína heterogénea nuclear que se encuentra en el NÚCLEO CELULAR y CITOPLASMA. La ribonucleoproteína heterogénea-nuclear grupo K está involucrada cercanamente en la regulación de la expresión génica en casi todos los niveles: TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA, procesamiento de ARNm (PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN), el transporte del ARNm, estabilidad del ARNm y traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS). La proteína hnRNP tiene una fuerte afinidad por ARN rico de polipirimidina-rico y por el ADN de una solo filamento de polipirimidina-enriquecida. Existen debido al empalme alternativo múltiples isoformas de proteínas hnRNP K y exhiben diferentes propiedades de unión al ácido nucleico.
Proteínas de Xenopus
Proteínas obtenidas a partir de diversas especies de Xenopus. Aquí se incluyen las proteínas de la rana de uñas Africana (Xenopus laevis). Muchas de estas proteínas han sido objeto de investigaciones científicas en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Clonación Molecular
Factores de Escisión y Poliadenilación de ARNm
Factores que están implicados en la dirección de la escisión y la POLIADENILACIÓN del ARN MENSAJERO cerca del sitio de SEÑALES DE POLIADENILACIÓN DEL ARN 3´.
Proteínas y Péptidos de Choque por Frío
Proteínas celulares y péptidos que son inducidos en respuesta a el estrés frío. Se encuentran en una amplia variedad de organismos procarióticos y eucarióticos.
ARN Nuclear Heterogéneo
ARN nuclear no ribosómico con más de 1000 nucleótidos, cuya masa se sintetiza rápidamente y se degrada dentro del núcleo celular. Algunos ARN nucleares heterogéneos pueden ser precursores del ARNm. Sin embargo, la gran mayoría del ARNnh total forma un híbrido con el ADN nuclear en lugar de con el ARNm.
Empalme del ARN
Exlusión final de secuencias sin sentido o secuencias interventoras (intrones) antes de que la última transcripción de ARN sea enviada al citoplasma.
Proteína EWS de Unión a ARN
Proteína hnRNP ubicua, encontrada en el NÚCLEO CELULAR y el CITOPLASMA. Las translocaciones que se producen en la formación de las proteínas de fusión que contienen partes de la proteína EWS de unión a ARN puede jugar un rol en los procesos neoplásicos, como el SARCOMA DE EWING.
Línea Celular
Poli C
Proteínas de Transporte Nucleocitoplasmático
Proteínas involucradas en el proceso de transporte de moléculas dentro y fuera del núcleo celular. Entre ellas se incluyen: las PROTEÍNAS DE COMPLEJO PORO NUCLEAR, que son proteínas de membrana que forman el PORO NUCLEAR, las CARIOFERINAS, que transportan moléculas a través del complejo de poros nuclear y las proteínas que juegan un papel directo en el transporte de complejos de carioferinas a través del complejo de poros nuclear.
MicroARNs
ARN bicatenarios pequeños, no codificadores de proteínas, con una longitud de 21-25 nucleótidos, que son formados a partir de transcritos génicos de microARN de simple hélice por la misma RIBONUCLEASA III, Dícer, que produce ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS. Pasan a formar parte del COMPLEJO DEL SILENCIAMIENTO INDUCIDO POR ARN y reprimen la traducción (TRADUCCIÓN GENÉTICA) de determinados ARN mediante la unión a la región 3'UTR homóloga como apareamiento imperfecto. Los ARN pequeños temporales (ARNst), let-7 y lin-4, de C. elegans, son los 2 primeros ARNmi descubiertos y pertenecen a la clase de ARNmi implicados en la cronología del desarrollo.
Proteínas del Tejido Nervioso
Las proteínas del tejido nervioso se refieren a las diversas proteínas específicas que desempeñan funciones cruciales en la estructura, función y regulación de las neuronas y la glía dentro del sistema nervioso central y periférico.
Proteína 1 Reguladora de Hierro
proteína multifuncional de hierro-azufre que es a la vez proteína reguladora del hierro y forma citoplásmica de la aconitato hidratasa. Se une a los elementos reguladores del hierro en los ARNm implicados en el metabolismo del hierro y regula su traducción. Su capacidad para unirse al ARN y su actividad aconitato hidrolasa dependen de la disponibilidad de HIERRO.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
ARN del Cloroplasto
Técnicas del Sistema de Dos Híbridos
Técnicas de cribado concebidas inicialmente en levaduras para identificar genes que codifican proteínas interactuantes. Se usan variantes para evaluar la interrelación entre las proteínas y otras moléculas. Las técnicas de dos híbridos se refieren al análisis de interacciones entre proteínas; las técnicas de un híbrido, a las interacciones entre ADN y proteína; las técnicas de tres híbridos, a las interacciones entre ARN y proteína o entre ligando y proteína. Las técnicas de n híbridos en configuración inversa se refieren al análisis de mutaciones o de moléculas pequeñas que disocian las interacciones conocidas.
Inmunoprecipitación
Regiones no Traducidas 5'
Secuencia en el extremo 5' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta secuencia contiene el sitio de unión del ribosoma y otras secuencias que regulan la transcripción y la traducción.
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
ARN Helicasas DEAD-box
Gran familia de ARN helicasas que comparten un motivo proteico común con la secuencia de aminoácidos de una única letra D-E-A-D (Asp-Glu-Ala-Asp). Además de la actividad ARN helicasa, los miembros de la familia DEAD-box participan en otros aspectos del metabolismo del ARN y en la regulación de la función del ARN.
Células Germinativas
Sondas ARN
ARN preparado usualmente por transcripción a partir de ADN clonado, el cual es complementario de un ARNm específico o ADN y que se usa generalmente para estudiar genes de virus, distribución de ARN específico en tejidos y células, integración de ADN viral a los genomas, transcripción, etc. En tanto es preferible usar las SONDAS ADN a nivel macroscópico para detectar la presencia de ADN/ARN de especies o subespecies específicas, las sondas ARN se prefieren para estudios genéticos. El marcaje convencional para las sondas ARN incluyen los radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina. Las sondas ARN pueden dividirse por categorías en sondas ARN de sentido +, sondas ARN de sentido -, o sondas ARN antisentido.
ARN de Hongos
Síndrome del Cromosoma X Frágil
Afección que se caracteriza genotípicamente por una mutación del extremo distal del brazo largo del cromosoma X (en el locus del gen FRAXA o FRAXE) y fenotípicamente por trastornos cognitivos, hiperactividad, CONVULSIONES, retraso en el lenguaje, y crecimiento de las orejas, cabeza y testículos. La DISCAPACIDAD INTELECTUAL ocurre en casi todos los varones y aproximadamente en el 50 por ciento de las mujeres con mutación completa de FRAXA. (Traducción libre del original: Menkes, Textbook of Child Neurology, 5th ed, p226)
Proteína 2 Reguladora de Hierro
Proteína multifuncional de hierro-azufre que es a la vez proteína reguladora del hierro y forma citoplásmica de anocitato hidratasa. Se une a los elementos reguladores del hierro que se encuentran en los ARNm implicados en el metabolismo del hierro y regula su traducción. Su velocidad de degradación aumenta en presencia de HIERRO.
Drosophila
Ribonucleasa III
Una endorribonucleasa que es específica para ARN bicatenario. Juega un rol en el PROCESAMIENTO DEL ARN POSTRANSCRIPCIONAL del pre-ARN RIBOSOMICO y una variedad de otras estructuras del ARNA que contienen regiones bicatenarias.
Distrofia Miotónica
Trastorno neuromuscular caracterizado por la ATROFIA MUSCULAR ESPINAL; MIOTONÍA, y varias atrofias multisistémicas. También se puede producir DISCAPACIDAD INTELECTUAL leve. Una EXPANSIÓN DE REPETICIÓN DE TRINUCLEÓTIDO anormal en las REGIONES NO TRADUCIDAS 3' del gen de la PROTEÍNA QUINASA DE DISTROFIA MIOTÓNICA se asocia con distrofia miotónica 1. La EXPANSIÓN DE LAS REPETICIONES DE ADN del intrón del gen de proteínas-9 en dedo de zinc se asocia con distrofia miotónica 2.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Proteínas Asociadas a Matriz Nuclear
Una amplia categoría de proteínas nucleares que son componentes de la MATRIZ NUCLEAR o participan de su formación.
Poliadenilación
Adición de una parte de ácido poliadenílico (POLI A)a la terminal 3' del ARNm (ARN MENSAJERO). La poliadenilación implica el reconocimiento de la señal de lugar de procesamiento (AAUAAA)y división del ARNm para crear un terminal 3' OH al que la polimerasa poli A (POLINUCLEÓTIDO ADENILILTRANSFERASA)adiciona 60-200 residuos de adenilato. La terminal 3' procesada por algunos ARNs mensajeros, como la histona ARNm histona es llevado a cabo por un proceso diferente que no incluye la adición de poli A como se describe aqui.
Proteínas de Caenorhabditis elegans
Proteínas de las especies de nematodos CAENORHABDITIS ELEGANS. Las proteínas de estas especies han despertado interés científico en el campo de la MORFOGÉNESIS de los organismos multicelulares.
Edición de ARN
Proceso que cambia la secuencia de nucleótidos del ARNm a partir de aquella del molde de ADN que lo codifica. Algunas de las clases principales de edición de ARN son las siguientes: 1) conversión de la citosina a uracil en el ARNm, 2) adición de un número variable de guaninas en sitios predeterminados y 3) la adición y deleción de uracilos, modelados por ARNs guías (ARN GUIA).
Saccharomyces cerevisiae
Motivos de Nucleótidos
Comúnmente observados SECUENCIA DE BASES o nucleótidos componentes estructurales que pueden ser representados por una SECUENCIA DE CONSENSO o una SECUENCIA LOGO.
Ensayo de Cambio de Movilidad Electroforética
Técnica electroforética para identificación de ligaciones de un compuesto al otro. Márcase un compuesto para seguir su movilidad durante la electrofóresis. Si el compuesto marcado presentarse unido a un otro compuesto, entonces la movilidad del compuesto marcado por el medio electroforético será retardada.
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo F-H
Grupo heterogéneo de ribonucleoproteínas nucleares estrechamente relacionadas implicadas en el ayuste del ARNm.
Ribonucleoproteínas Nucleares Pequeñas
Complejos nucleares ARN-proteína altamente conservados que funcionan en el procesamiento del ARN en el núcleo, se incluye la escisión del pre-ARNm y el procesamiento del extremo pre-ARNm 3' en el nucleoplasia, y el procesamiento de pre-ARNr en el nucleolo (ver RIBONUCLEOPROTEÍNAS, NUCLEOLAR PEQUEÑA).
Proteínas Portadoras
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas
Módulos proteicos con superficies de unión a ligandos conservadas que intervienen en funciones de interacción específicas en las VIAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL y los SITIOS DE UNIÓN específicos de sus LIGANDOS proteicos afines.
Caenorhabditis elegans
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Poli U
Proteínas Argonauta
Familia de proteínas de unión a ARN que tienen especificidad por las MICROARNS y moléculas del ARN INTERFERENTE PEQUEÑO. Las proteínas participan del procesamiento del ARN como componentes básicos del complejo silenciador inducido por ARN.
Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Testículo
Gónada masculina con dos partes funcionales: los TÚBULOS SEMINÍFEROS, que intervienen en la producción y transporte de las células germinales masculinas (ESPERMATOGÉNESIS) y el compartimento intersticial que que comprende las CÉLULAS DE LEYDIG, productoras de ANDRÓGENOS.
Pruebas de Precipitina
Ribonucleoproteína Nuclear Pequeña U1
Complejo nuclear de ARN-proteína que desempeña un rol en el procesamiento del ARN. En el nucleoplasia, el U1 RNPnp junto con otras ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (U2, U4-U6, y U5) se unen para formar ESPLICEOSOMAS que eliminan por escisión intrones a partir del pre-ARNm. La U1 RNPnp forma pares de bases que conservan los motivos de secuencias en el sitio de separación 5' y que reconoce los sitios de separación 5'- y 3'- , ellas pueden tener un papel fundamental en la alineación de los dos sitios para la reacción de separación.
ARN Interferente Pequeño
Pequeños ARN bicatenarios no codificadores de proteínas, de 21 A 31 nucleótidos, implicados en mecanismos de SILENCIAMIENTO GÉNICO, especialmente en la INTERFERENCIA POR ARN o RIBOINTERFERENCIA (RNAi). Los RNA interferentes pequeños (siRNA) se forman endógenamente a partir de dsRNA (ARN BICATENARIOS) por acción de una misma ribonucleasa, Dícer, que genera miRNA (MICROARN). El apareamiento perfecto de la hebra antiparalela de siRNA con ARN complementarios es un paso intermedio en la RNAi, que permite la escisión de los RNA guiada por el siRNA. Los siRNA se clasifican en: siRNA que actúan en trans (tasiRNA), RNA asociados a repeticiones (rasiRNA), RNA small-scan (scnRNA) y RNA de interacción con proteínas Piwi (RNApi), y desempeñan diversas funciones específicas de silenciamiento génico.
Espermatogénesis
Proceso de desarrollo de las células germinales masculinas a partir de las células germinales primordiales, a través de los ESPERMATOGONIOS, ESPERMATOCITOS y ESPERMÁTIDES hasta el ESPERMATOZOIDES haploide maduro.
Drosophila melanogaster
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
ARN Nuclear
Moléculas de ARN que se encuentran en el núcleo, asociadas con cromosomas o en el nucleoplasma.
ARN Bacteriano
Transfección
ARN Protozoario
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Oogénesis
Modelos Moleculares
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Variación de la técnica PCR en la que el cADN se hace del ARN mediante transcripción inversa. El cADN resultante se amplifica usando los protocolos PCR estándares.
Nucléolo Celular
Región diferente, no delimitada por una membrana, que se encuentra dentro del NÚCLEO CELULAR de la mayoría de las células eucariotas, en el mismo se sintetizan algunas especies de ARNr (ARN RIBOSÓMICO) y se ensamblan con unidades de ribonucleoproteínas del ribosoma. En el nucléolo el ARNr se transcribe a partir de un organizador nucleolar, es decir, un grupo de genes cromosomales en línea que codifican al ARNr y que son transcriptos por la ARN polimerasa I.
Proteína-Arginina N-Metiltransferasas
Enzima que cataliza la metilación de residuos de arginina de las proteínas, para formar N-mono- y N,N-dimetilarginina. Esta enzima se encuentra en muchos órganos, principalmente en el cerebro y el bazo.
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo U
Isoformas de Proteínas
Proteína I de Unión a Poli(A)
Proteína de unión poli(A) que tiene distintas funciones, como la estabilización del ARNm y la protección del ARN de la actividad nucleasa. Aunque la proteína I de unión poli(A) se considera una proteína de unión al ARN citoplasmático principal, también se encuentra en el NÚCLEO CELULAR y puede estar implicado en el transporte de las partículas RNPm.
Transporte Activo de Núcleo Celular
Mecanismos de transporte de compuerta por los cuales proteínas o ARN son movidos a través de la MEMBRANA NUCLEAR.
Northern Blotting
Detección del ARN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa u otro tipo de papel o membrana de nylon.
ARN de Planta
Arabidopsis
Género de plantas de la familia BRASSICACEAE que contienen PROTEÍNAS DE ARABIDOPSIS y PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. La especie A. thaliana se utiliza para experimentos de genética clásica en plantas así como en estudios de genética molecular en fisiología, bioquímica y desarrollo de las plantas.
Proteínas de Arabidopsis
Proteínas de especies vegetales pertenecientes al género ARABIDOPSIS. Las especies de Arabidopsis más estudiadas, la Arabidopsis thaliana, se utilizan generalmente en laboratorios de experimentación.
Silenciador del Gen
Poli A
Técnicas de Silenciamiento del Gen
La inducción artificial del SILENCIADOR DEL GEN por el uso de la INTERFERENCIA DE ARN para reducir la expresión de un gen específico. Se incluye el uso de ARN BICATENARIO, tales como los ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS y ARN que contenga SECUENCIA DE LA HORQUILLA EN BUCLE, y OLIGONUCLEÓTIDOS ANTISENTIDO.
Genes Reporteros
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo L
Exones
Las partes de una transcripción de un GEN que queda después que los INTRONES se remueven. Son ensambles que se convierten en un ARN MENSAJERO u otro ARN funcional.
Transporte de Proteína
Factores Eucarióticos de Iniciación
Animales Modificados Genéticamente
Animales, o hijos de dichos animales, en los cuales se ha transferido experimentalmente material genético clonado utilizando una microinyección, bien directamente o dentro del embrión, de ADN extraño, o de tipos de células diferenciadas. Se han producido variedades transgénicas de conejos, ratas, peces, Xenopus, ovejas, cerdos y pollos utilizando genes de erizos de mar, Cándida, Drosophila, y ratas.
Oocitos
ARN de Helminto
Dedos de Zinc
Motivos de las proteínas que se unen al ADN y al ARN cuyos aminoácidos se pliegan en una sola unidad estructural alrededor de un átomo de zinc. En el dedo de zinc clásico, un átomo de zinc se encuentra unido a dos cisteínas y dos histidinas. Entre las cisteínas y las histidinas hay 12 residuos que forman una yema de dedo que se une al ADN. Por variaciones en la composición de las secuencias de la yema de dedo y el número y espaciado de las repeticiones en tándem del motivo, los dedos de zinc pueden formar un gran número de sitios específicos de unión con diferente secuencia.
Neuronas
Western Blotting
Rayos Ultravioleta
La parte del espectro electromagnético que está inmediatamente debajo del rango visible y se extiende hasta las frecuencias de rayos x. Las longitudes de ondas más largas (rayos cercanos a UV, o bióticos, o vitales) son necesarias para la síntesis endógena de la vitamina D y también son conocidos como rayos antirraquíticos; las longitudes de onda más cortas, ionizantes, (rayos lejanos de UV, o abióticos, o extravitales) son viricidas, bactericidas, mutagénicos y carcinogénicos y se emplean como desinfectantes.
Elementos Ricos en Adenilato y Uridilato
Secuencias de ARN compuesta de NUCLEÓTIDOS DE ADENINA y NUCLEÓTIDOS DE URACILO, que se encuentran en las REGIONES NO TRADUCIDAS 3' de moléculas de ARN MENSAJERO que son rápidamente degradadas. También son conocidos como AREs [AU Rich Elements].
Reactivos de Enlaces Cruzados
Reactivos con dos grupos reactivos, usualmente en extremos opuestos de la molécula, que son capaces de reaccionar y así formar puentes entre las cadenas laterales de los aminoácidos de las proteínas; las locaciones de las áreas naturalmente reactivas dentro de las proteínas pueden identificarse de esta forma; también pueden utilizarse para otras macromoléculas, como las glicoproteínas, ácidos nucleicos, u otros.
Xenopus
Aconitato Hidratasa
ARN Helicasas
Familia de proteínas que promueven la anulación de ARN durante el empalme y la traducción.
Células HEK293
Allolevivirus
Eliminación de Secuencia
Intrones
Secuencias no codificadoras e interventoras de ADN que son transcriptas, pero que son removidas en la transcripción génica primaria y degradadas rápidamente durante la maduración del ARN mensajero. La mayoría de los genes en los núcleos de eucariotes contienen intronas, al igual que los genes mitocondriales y del cloroplasto.
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Autoantígenos
Regiones no Traducidas
Partes de la secuencia del ARN mensajero que no codifica para productos, es decir, REGIONES 5' NO TRADUCIDAS y REGIONES 3' NO TRADUCIDAS.
ARN no Traducido
ARN que no codifica para proteína pero que tiene alguna función enzimática, estructural o regulatoria. Aunque el ARN ribosómico (ARN RIBOSÓOMICO) y ARN de transferencia;(ARN DE TRANSFERENCIA) son también ARNs no traducidos, ellos no están incluidos en este alcance.
Xenopus laevis
Especie mayor y más común de "rana" con garras (Xenopus) de África. Esta especie se utiliza extensamente en investigaciones. Hay una importante población en California descendiente de animales de laboratorio que han escapado.
Proteínas de Plantas
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Degeneración Lobar Frontotemporal
Grupo heterogéneo de trastornos neurodegenerativos caracterizados por atrofia del lóbulo temporal y frontal asociada a pérdida neuronal, gliosis, y demencia. Los pacientes exhiben cambios progresivos en su vida social, comportamiento y / o en las funciones del lenguaje. Muchos subtipos o formas se reconocen en base a la presencia o ausencia de inclusiones de la PROTEÍNA TAU. Las FTLD incluyen tres síndromes clínicos: DEMENCIA FRONTOTEMPORAL, demencia semántica y AFASIA NO FLUENTE PROGRESIVA PRIMARIA.
eIF-2 Quinasa
Proteína serina/treonina quinasa activada por dsARN e independiente del AMP cíclico, que es inducida por interferón. En presencia de dsARN y ATP, la quinasa se autofosforila en varios residuos de serina y treonina. La enzima fosforilada cataliza la fosforilación de la subunidad alfa del FACTOR 2 EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN, conduciendo a la inhibición de la síntesis proteica.
Fenotipo
Complejo Silenciador Inducido por ARN
Complejo ribonucleoproteico con múltiples componentes conformado por una de la familia de las PROTEÍNAS ARGONAUTAS y el "hilo guía" de uno de los 20 a 30 nucleótidos ARNs pequeños. RISC separa ARNs específicas, que se destinan a la degradación por homología con estos pequeños ARNs. Funciones en la regulación de la expresión genética son determinadas por las proteínas argonautas específicas y ARN pequeño incluyendo ARNsi (ARN INTERFERENTE PEQUEÑO), ARNmi (MICROARN), o ARNpi (ARN DE INTERACCIÓN PIWI).
Endorribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación endonucléolítica del ARN. Incluye EC 3.1.26.-, EC 3.1.27.-, EC 3.1.30.- y EC 3.1.31.-.
Sistemas de Lectura Abierta
ARN Citoplasmático Pequeño
ARNs pequeños que se encuentran en el citoplasma y que usualmente forman complejos con las proteínas en RNPCPs (RIBONUCLEOPROTEÍNAS CITOPLASMÁTICAS PEQUEÑAS).
Esclerosis Amiotrófica Lateral
Trastorno degenerativo que afecta las NEURONAS MOTORAS superiores en el cerebro y las neuronas motoras inferiores en el tronco cerebral y la MÉDULA ESPINAL. El comienzo de la enfermedad es usualmente después de los 50 años de edad y el proceso usualmente es fatal en 3 a 6 años. Las manifestaciones clínicas incluyen debilidad progresiva, atrofia, FASCICULACIÓN, hiperreflexia, DISARTRIA, disfagia, y parálisis eventual de la función respiratoria. Las características patológicas incluyen el reemplazo de las neuronas motoras con ASTROCITOS fibrosos y atrofia de las RAÍCES DE LOS NERVIOS ESPINALES anteriores y de los tractos corticoespinales.
Plásmidos
Diferenciación Celular
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Trypanosoma brucei brucei
Espermatocitos
Células germinales masculinas que se derivan de los ESPERMATOGONIOS. Los espermatocitos euploides primarios sufren la MEIOSIS, dando lugar a los espermatozitos haploides secundarios, que a su vez dan lugar a las ESPERMÁTIDES.
Proteínas Fluorescentes Verdes
Analógos y derivados proteicos de la proteína fluorescente Aequorea victoria verde que emite luz (FLUORESCENCIA) cuando se estimula con RAYOS ULTRAVIOLETAS. Se usan en GENES REPORTEROS al hacer TÉCNICAS GENETICAS. Se han hecho numerosos mutantes para emitir otros colores o ser sensibles a pH.
Hibridación in Situ
Análisis de Secuencia de ARN
Modelos Genéticos
Cromatografía de Afinidad
Células Cultivadas
Proteínas de Cloroplastos
Liposarcoma Mixoide
Exorribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación exonucleolítica del ARN. Incluye EC 3.1.13.-, EC 3.1.14.-, EC 3.1.15.-, y EC 3.1.16.-. EC 3.1.-
Proteína del Factor Nuclear 45
ARN Mensajero Almacenado
ARN mensajero que es almacenado en un estado enmascarado para translación en un tiempo posterior. Distinguir de ARN NO TRADUCIDO que refiérese a ARN no mensajero, o sea, ARN que no codifica para proteína.
Proteínas Ribosómicas
Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.
ARN Nuclear Pequeño
Cadenas cortas de ARN (100-300 nucleótidos de largo) abundantes en el núcleo y que usualmente forman complejos con las proteínas en las ARNnps (RIBONUCLEOPROTEÍNAS, NUCLEARES PEQUEÑAS). Muchas funcionan en el procesamiento de los precursores del ARN mensajero. Otros, los ARNnops (ARN, NUCLEOLAR PEQUEÑO), participan en el procesamiento de los precursores del ARN ribosómico.
Fosforilación
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Estructuras Citoplasmáticas
Componentes del citoplasma excluyendo el CITOSOL.