Dioxygenaser
4-hydroxyfenylpyruvatdioxygenas
Ett enzym som katalyserar omvandlingen av 4-hydroxyfenylpyruvat och syre till homogentisinsyra och koldioxid. EC 1.13.11.27.
Oxygenaser
Katekol-2,3-dioxygenas
Katekol-2,3-dioxygenas är ett enzym som katalyserar oxidativ klövning av catecholer till muconiska syror, vilket är en viktig reaktionssteg i nedbrytningen av flera aromatiska aminer och katekoler i människan.
Protokatekuat-3,4-dioxygenas
Protocatechuate 3,4-dioxygenase är ett enzym som katalyserar oxidationen av protocatekuat till 4-karboxi-2-hydroxymukonat i två steg, med omsättning av syre. Detta enzym är vanligt förekommande hos bakterier och kan spela en viktig roll i nedbrytningen av aromatiska föreningar i naturen.
Cysteindioxygenas
Cysteine dioxygenase (CDO) is an enzyme that catalyzes the conversion of the amino acid L-cysteine to L-cysteinesulfinic acid, which is a key step in the biosynthesis of the neurotransmitters L-glutamate and L-gamma-aminobutyric acid (GABA). This enzymatic reaction also generates equimolar amounts of sulfite and water. CDO plays important roles in regulating redox homeostasis, protecting against oxidative stress, and maintaining the normal function of the central nervous system.
Katekol-1,2-dioxygenas
Tryptofanoxygenas
Tryptophan oxygenase, även känt som tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO) eller tryptophan pyrrolase, är ett enzym involverat i nedbrytningen av aminosyran tryptofan. Det katalyserar reaktionen där syre molekyler adderas till tryptofan, vilket resulterar i formationen av formylkynurenin, som är en första steg i nedbrytningen av tryptofan till niacin (vitamin B3) och andra signalsubstanser som serotonin och melatonin. Tryptofan oxygenas är huvudsakligen beläget i levern och dess aktivitet kan påverkas av olika faktorer, inklusive hormonella, immunologiska och oxidativ stressorer.
Homogentisat-1,2-dioxygenas
Homogentisat-1,2-dioxygenase är ett enzym involverat i aminosyra metabolism, specifikt i nedbrytningen av aminosyran tyrosin. Det katalyserar oxidativ klövning av homogentisat till maleylacetat som en del av fenylalanin-tyrosin-metabolismens senare steg, även kallad katekolvägsmetabolismen. Defekter i genen för detta enzym kan leda till sjukdomen alkaptonuri.
3-Hydroxyanthranilate 3,4-Dioxygenase
3-Hydroxyanthranilate 3,4-Dioxygenase är ett enzym involverat i nedbrytningen av aminosyran tryptofan i kroppen. Det katalyserar reaktionen där 3-hydroxiantraliat konverteras till 2-amino-3-carboxymukonatsemialdehyd och koldioxid som en del av kroppens pyrimidin- och niacinmetabolism.
Kynurenin
En aminosyra som är prekursor till kynurensyra och som utsöndras i små mängder i urin som metabolit av tryptofan.
Pseudomonas
Pseudomonas är ett släkte gramnegativa, aeroba stavformade bakterier, vanligtvis icke-sporbildande, som förekommer vitt spridd i naturen, särskilt i fuktiga miljöer. Några arter av släktet Pseudomonas kan orsaka infektioner hos människor och djur, framför allt Pseudomonas aeruginosa, som är känd för sin förmåga att utveckla antibiotikaresistens och orsaka livshotande sjukdomar, särskilt hos immunförsvagna individer.
Biologisk nedbrytning
Tryptofan
Tryptophan är en essentiell aminosyra, som betyder att den måste införas genom kosten eftersom kroppen inte kan syntetisera den själv. Det är en building block för proteiner och spela en viktig roll i produktionen av neurotransmittor, såsom serotonin och melatonin, som är involverade i sömnschema reglering och humör.
Rhodococcus
'Rhodococcus' är ett släkte av grampositiva, aeroba och kokusbildande bakterier som förekommer i naturen, främst i jord och vatten. Några arter av Rhodococcus kan orsaka infektioner hos människor, särskilt hos immunsupprimerade individer. Infektioner kan vara subkliniska eller ge upphov till allvarliga sjukdomar som pneumonia, sepsis och abscesser.
Pseudomonas putida
Klorbensener
En grupp industriellt viktiga kemiska föreningar, som erhålls genom klorering av bensen, och som i sin tur utgör utgångsmaterial för andra industriellt framställda produkter.
Sphingomonas
"Sphingomonas" är ett släkte av gramnegativa, aeroba bakterier som saknar yttre cellvägg och tillhör proteobacteria. De är kända för sin förmåga att metabolisera ovanliga kolväten, inklusive aromatiska kolväten, och har identifierats som en komponent i mikrobiomen på ett antal olika miljöer, inklusive vatten, jord och luft. Några arter av Sphingomonas kan orsaka infektion hos människor, särskilt hos immunförsvagna individer.
Burkholderia
Ett släkte av gramnegativa, aeroba, stavformade bakterier. De klassificerades tidigare som Pseudomonasarter, men betydande biokemiska och kemiska skillnader har lett till att de avskilts från Pseudomo nas och fått bilda ett nytt släkte.
Comamonas
Homogentisinsyra
Homogentisinsyra är en aromatisk karboxylsyra som förekommer naturligt i vissa kroppsvätskor, såsom urin, hos människor och djur. Det bildas som en biprodukt under nedbrytningen av aminosyran tyrosin genom en metabolisk process som kallas fenylalanin-tyrosin-metabolism. I normala fall bryts homogentisinsyra ner ytterligare till mindre molekyler i levern, men vid vissa genetiska störningar, såsom alkaptonuri, kan den inte brytas ned korrekt och kan leda till akumulering av homogentisinsyra i kroppen, vilket kan orsaka allvarliga hälsoeffekter som led- och giktliknande symptom samt förtärande av brosk och ledkartilagin.
Hydroxylaser
En stor grupp enzymer som förmedlar oxidations-reduktionsreaktioner där en atom i en syremolekyl binds till det organiska substratet. Den reducerade syreatomen binds med väte och bildar vatten. Enzymerna kallas även monooxygenaser. Dessa reaktioner fordrar två substrat som reduktanter för var och en av de båda syreatomerna. Det finns olika klasser av enzymerna beroende på vilken typ av väteavgivande kosubstrat (koenzymer) som krävs för blandfunktionsoxidationen. EC 1.4 - 1.97.
Toluen
Toluen, även känd som metylbensen, är ett aromatiskt kolväte som naturligt förekommer i petroleum och kolträsk. Det är en klar, färglös vätska med en distinkt söt doft som liknar bensin. Toluen används ofta som lösningsmedel inom industrin och kan också förekomma i små mängder i luften, vatten och mark efter utsläpp från industriella processer eller förbränning av fossila bränslen. Långvarig exponering för toluen kan orsaka skador på nervsystemet och andra hälsoproblem.
Substratspecificitet
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Hydroxybenzoates
Hydroxybenzoates are salts or esters of hydroxybenzoic acids, which are aromatic organic compounds with a carboxylic acid group and one or more hydroxyl groups attached to the benzene ring. These compounds are widely used as preservatives in pharmaceuticals, cosmetics, and food products due to their antimicrobial properties. Common examples of hydroxybenzoates include sodium benzoate, methylparaben, and propylparaben.
Molekylsekvensdata
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Burkholderiaceae
Burkholderiaceae är en familj av gramnegativa, aeroba eller facultativt anaeroba bakterier inom ordningen Betaproteobacteria. Familjen innehåller ett stort antal släkten, däribland Burkholderia, Cupriavidus och Ralstonia. Många arter inom familjen är kända för sin förmåga att bryta ned oorganiska ämnen och vissa av dem kan orsaka sjukdomar hos människor, djur och växter.
3-hydroxyantranilsyra
Gammabutyrobetaindioxygenas
Alkaptonuri
En medfödd rubbning av aminosyrametabolismen orsakad av en defekt i enzymet homogentisat-1,2-dioxygenas, vilken leder till ansamling av homogentisinsyra i urinen. Okronos (mörkfärgning) av olika vävna der och artrit är typiska för tillståndet.
Ketoglutarsyra
Polyklorerade bifenyler
"Polyklorerade bifenyler (PCB) är en grupp av klororganiska föreningar som består av 209 olika konstitutionella isomerer, alla med en bifenylstruktur där upp till tio kolatomerna är klorinerade. De var i stor skala använda under 1900-talet inom elektro- och industrisektorer på grund av deras isolerande, eldfasta och oljeframskrivande egenskaper. PCB är mycket stabila och har lång livslängd i miljön, vilket har lett till att de ackumulerats i levande organismer och människor. De är kända för sina toxiska effekter, såsom störningar av det endokrina systemet, nervsystemet och immunförsvaret, och är klassificerade som cancerogena av IARC."
Bakteriegener
Den genetiska massan hos bakterier.
Ferredoxiner
Järnhaltiga proteiner som överför elektroner, vanligtvis vid en låg potential, till flavoproteiner. Järnet uppträder inte som i hem.
Aminosyrasekvens
Brevibacterium
Sulfanilsyror
Sulfanilsyror är en grupp av organiska sulfonamider som har antibiotisk verkan och används som läkemedel för att behandla olika infektioner, särskilt urinvägsinfektioner. Den generella strukturen hos en sulfanilsyra innebär en funktionell sulfongrupp (-SO2-) som är bundad till en aromatisk ring, vanligtvis en bensenring. Exempel på vanligt använda sulfanilsyror inkluderar sulfametizol och sulfasalazin.
Alcaligenes
Järn-svavelproteiner
En grupp proteiner som har järn-svavelkomplexet som prostetisk grupp. Dessa proteiner deltar i alla viktigare elektrontransportförlopp: fotosyntes, andning, hydroxylering och bakteriell väte- och kvävefixering.
Quinolinic Acid
Quinolinic acid, also known as 2,3-pyridinedicarboxylic acid, is a compound that is produced in the body and has been identified as an important neuroactive molecule. It is a metabolite of the amino acid tryptophan and is involved in the kynurenine pathway of tryptophan metabolism. Quinolinic acid can act as a neuroexcitatory agent and has been implicated in several neurological conditions, including Huntington's disease, Alzheimer's disease, and HIV-associated dementia. It is also believed to play a role in the development of chronic pain and depression.
Kloning, molekylär
Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.
Delftia acidovorans
En allmänt utbredd, gramnegativ stavbakterie som tidigare kallades Pseudomonas acidovorans (Pseudomonas acidivorans). Den skiljer sig från övriga Comamonasarter genom sin förmåga att nyttja bensoat som kolkälla.
Järn
Ett i jordskorpan allmänt utbrett metalliskt grundämne. Kemiskt tecken är Fe, atomnummer 26 och atomvikt 55,85. Järn är en väsentlig beståndsdel i hemoglobin, cytokrom och andra komponenter i respiratoriska enzymsystem. Dess främsta funktioner är att transportera syre till vävnader (hemoglobin) och att ingå i cellulära oxidationsförlopp. Uttömning av järnförråden kan leda till järnbristanemi. Järn används för att återuppbygga blodet vid anemi.
Kolväten, aromatiska
Sorbinsyra
Bifenylföreningar
Bensoater
Salter och estrar av bensoesyra med antibakteriella och svampdödande egenskaper. De används som konserveringsmedel i farmaceutiska preparat, kosmetika och livsmedel.
Oxidation-reduktion
Fenantrener
I en enkel medicinsk definition kan fenantrener definieras som en grupp organiska föreningar som innehåller ett fenantrenskelett, vilket består av två benzeningar fused tillsammans i en vinkel av 90 grader. Fenantrener är strukturella byggstenar i vissa typer av läkemedel och kan ha både farmakologiska och toxikologiska effekter. Det är också värt att notera att vissa fenantrener är kända för att vara cancerogena.
beta-karoten-15,15'-monooxygenas
Tyrosinemier
Tyrosinemia är ett autosomalt recessivt metabolt syndrom orsakat av en defekt i enzymet fumarylacetoacetathydrolas, som leder till påverkan på ämnesomsättningen av aminosyran tyrosin. Detta kan resultera i skada på lever, njurar och centralnervsystemet.
Ferroföreningar
Oorganiska och organiska föreningar med tvåvärt järn.
Bensoesyra
Kolibakterie
En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.
2,4-diklorfenoxiättiksyra
Ralstonia
Ralstonia är ett släkte av gramnegativa, aeroba stavformade bakterier som tillhör ordningen Burkholderiales. Ralstonia-arter är vanligen motståndskraftiga mot antibiotika och kan orsaka opportunistiska infektioner hos människor med nedsatt immunförsvar, såsom patients som får lungtransplantationer eller hemodialys. Ralstonia-infektioner kan också förekomma i andra kliniska sammanhang, såsom infusionstherapi och vattenkylsystem.
Trikloretylen
Pseudomonas pseudoalcaligenes
"Pseudomonas pseudoalcaligenes" är en grampositiv, aerob bakterie som tillhör familjen Pseudomonadaceae. Den är känd för sin förmåga att metabolisera en mångfald av organiska föreningar och kan påträffas i olika miljöer, inklusive vatten, jord och clinical sammanhang. Det är viktigt att notera att denna bakterie kan vara svår att skilja från andra grampositiva baciller, så korrekt artbestämning kan kräva användning av molekylärbiologiska tekniker som 16S rRNA-sekvensering.
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Hydroxylering
Fenol
Enzyminduktion
Enzyminduktion refererar till processen där aktiviteten hos ett enzym ökar som ett resultat av exponering för en inducerande agent. Detta sker vanligtvis genom att induceringsagenten påverkar genuttrycket och/eller syntesen av enzymet, vilket leder till en ökad mängd fungerande enzym i cellen. Enzyminduktion kan ha kliniskt relevans inom områden som farmakologi och toxicologi, eftersom den kan påverka både farmakokinetiken och toxikokinetiken av olika substanser.
Bensenderivat
"Ett bensenderivat är ett organisk ämne som har syntetiserats från bensen, en aromatisk hydrokarbonkärna bestående av sex kolatomer arrangerade i en plan ringstruktur. Bensenderivat inkluderar en mängd olika substanser med varierande egenskaper och användningsområden, från läkemedel till petrokemiska produkter."
Vanillinsyra
Vanillinsyra är en organisk syra som förekommer naturligt i naturen, bland annat i vaniljväxter och många frukter och grönsaker. Den är känd för sin behagliga, sötaktiga doft som liknar vaniljdoften. Vanillinsyra har den kemiska formeln 4-hydroxi-3-metoxibenzoesyra och är en substans som ingår i gruppen fenoler. I medicinsk kontext kan vanillinsyra användas som ett indikatorförening vid urinanalys för att påvisa närvaro av abnorma sockerarter, såsom glukos och galaktos, genom en process som kallas vanillinsyrareaktion.
Acinetobacter
Ett släkte gramnegativa bakterier tillhörande familjen Neisseriaceae som förekommer i jord och vatten och med oklar patogenitet.
Parabener
I en enkel medicinsk definition är parabener konserveringsmedel som används i vissa läkemedel, kosmetiska produkter och livsmedel för att förhindra bakterie- och svampväxt. De är esterderivat av p-hydroxibensoesyrlig acid och fungerar genom att döda mikroorganismer eller hämma deras tillväxt. Parabener anses vara sära i små mängder, men kan orsaka allergiska reaktioner hos vissa individer.
Gramnegativa aeroba bakterier
En stor grupp aeroba bakterier som färgas rosa (negativ färgning) vid gramfärgning. Detta beror på att de gramnegativa bakterierna har liten mängd peptidoglykan i cellväggen och därför låg affinitet för lila färgämnen och hög affinitet för det rosa färgämnet safranin.
Bassekvens
Burkholderia cepacia
En art av Burkholderia som anses vara en opportunistisk patogen hos människa. Den förknippas med olika nosokomiala (sjukhus-) infektioner.
Adipates
Kynurenin-3-monooxygenas
Elektronspinnresonansspektrografi
En teknik som är tillämpbar på en mängd olika ämnen som uppvisar paramagnetism till följd av magnetismen alstrad av opariga elektroner. Erhållna spektra kan användas för påvisande, identifiering, och bestämning av elektronstrukturer, undersökning av molekylers interaktioner, och för mätning av kärnspinn och magnetiska moment. Elektronisk dubbelresonansspektrografi (ENOR) är en variant av tekniken som ger bättre upplösning. Spinnresonansanalys kan göras in vivo, och inkluderar tillämpningar som t ex magnetresonans (MRI). Syn. ESR.
Interferon Type II
Interferon typ II, även känt som IFN-γ (Interferon gamma), är ett cytokin som produceras främst av naturliga killer-celler (NK-celler) och T-hjälpenda celler (Th1) i samband med immunförsvarets respons mot infektioner orsakade av intracellulära patogener, såsom virus och bakterier. IFN-γ har en central roll i cellmedierad immunitet och påverkar aktivt både innate (ospecificerad) och adaptiva (specifik) immunsvar. Det fungerar som en signalmolekyl mellan olika celltyper inom det immunförsvaret och har antivirala, antibakteriella och immunreglerande egenskaper. IFN-γ inducerar även uppeggning av major histokompatibilitetskomplexet (MHC) klass II-molekyler på olika celltyper, vilket underlättar presentationen av antigener till T-
Icke-hemjärnproteiner
Icke-hemjärnproteiner, också kända som icke-heme-proteiner eller non-heme proteins, är proteiner som binder till metallioner utanför ett hem-gruppcentrum, i kontrast till hemproteiner som innehåller en prostetisk grupp av porfyrin med en järn(II)-ion.
Syrgasisotoper
Naftalener
I en enkel medicinsk kontext kan 'naftalener' referera till en grupp organiska föreningar som innehåller naftalen, ett polycykliskt aromatiskt kolväte (PAH) bestående av två benzening rings som är kondenserade med varandra. Naftalener har historiskt använts inom medicinen, men deras användning är numera begränsad på grund av toxicitet och cancerrisk. I vissa fall kan naftalener fortfarande användas externt i dermatologiska preparat, men interna användningsområden är idag mycket sällsynta.
Multienzymkomplex
System av enzym som verkar i följd genom att katalysera på varandra följande reaktioner sammankopplade med gemensamma metabola intermediärer. De kan medverka i en enkel omsättning av vattenmolekyler eller väteatomer, eller vara förknippade med stora supramolekylära strukturer som mitokondrier eller ribosomer.
Syrgas
"Syrgas" er en sammentrekning av ordene "syre" og "luft", og refererer til den atmosfæriske luften som vi normalt inhalerer, som består av omkring 21% syre (O2), 78% kv nitrogen (N2) og små mengder av andre gasser som argon, kultilkristaller og spor av kullilkristaller. I denne enkelte meningen kan syrgas definieres som den atmosfæriske luft som inneholder 21% syre (O2) som er livsviktig for mennesker og andre levende vesen for å oksidere (forbranne) næringsstoffer for å produsere energi i cellene.
Gramnegativa aeroba stavar och kocker
En grupp gramnegativa bakterier, bestående av stav- och klotformade celler. De är både aeroba (växer i närvaro av luft) och mikroaerofila (växer bättre vid låga syrehalter) under kvävefixerande förhållanden, men vid tillgång till bundet kväve växer de som aerober.
Spektrofotometri
DNA-sekvensanalys
Rekombinanta proteiner
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
Hydrolaser
ortho-Aminobenzoates
Ortho-aminobenzoates are a group of chemical compounds that contain an ortho-substituted amino benzoate functional group, which consists of a benzene ring with a carboxylate group (–COO−) and an amino group (–NH2) attached to adjacent carbon atoms on the benzene ring. This group is often abbreviated as "o-ABA" or "OABA". These compounds have various applications, including use as pharmaceuticals, dyes, and plastic additives.
Comamonadaceae
Comamonadaceae är en familj av proteobakterier inom den taxonomiska klassen Betaproteobacteria. Bakterier inom denna familj är vanligen stavformade och aeroba (andas syre), även om några anaeroba arter också finns beskrivna. Comamonadaceae-medlemmar kan förekomma i en mängd olika miljöer, inklusive vatten, jord och förnedrada utsläpp. Några kända släkten inom familjen är Comamonas, Hydrogenophaga och Acidovorax, som kan orsaka infektioner hos människor och djur, men vanligtvis är de inte patogena ( sjukdomsframkallande).
Multigenfamilj
En uppsättning gener som genom mångfaldigande och variation härstammar från någon ursprunglig gen. Sådana gener kan sitta tillsammans på samma kromosom eller vara utspridda på olika kromosomer. Exempel på multigenfamiljer är de som kodar för hemoglobiner, immunglobuliner, histokompatibilitetsantigener, aktiner, tubuliner, keratiner, kollagener, stressproteiner, salivproteiner, korioproteiner, membranproteiner, ägguleproteiner och faseoliner, och även histoner, ribosom-RNA och tRNA-gener. De tre senare utgör exempel på upprepningsgener, av vilka det finns hundratals identiska i tandemformationer.
Taurin
Taurin är ett sulfonerat β-aminosyra som finns naturligt i kroppen och kan hittas i höga koncentrationer i vissa delar av centrala nervsystemet och muskulaturen. Det utövar flera fysiologiska funktioner, till exempel reglering av elektrolytbalans, neurotransmission och antioxidativ stressrespons. Taurin kan också tas in som dietary supplement för att möjligen stödja vissa hälsorelaterade funktioner, såsom ökad utökningskapacitet och celldefens under stressförhållanden.
Oxidoreduktaser
Polycykliska kolväten, aromatiska
"Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are a group of organic compounds consisting of two or more fused benzene rings in linear, angular, or cluster arrangements, which are typically found in coal tar and produced by incomplete combustion of fossil fuels and other organic materials, known to have potential carcinogenic and mutagenic effects on humans."
Katalys
Okronos
Prokollagenprolindioxygenas
Intramolekylära lyaser
Xylener
Xylene är ett organisk compound som består av tre isomerer: *o*-xylen, *m*-xylen och *p*-xylen. Det är en klar, flytande vätska med en karakteristisk lukts sensation som påminner om bensin. Xylen används primärt som lösningsmedel inom industrin och förekommer naturligt i kol- och petroleumprodukter.
Jordmikrobiologi
Närvaron av bakterier, virus och svampar i jord. Termen är inte begränsad till att gälla sjukdomsalstrande organismer.
Oxidoreduktaser, O-demetylering
Karotenoider
Starkt gulröda, fettlösliga färgämnen som strukturellt liknar karoten. De utgörs av alifatiska kolväten med en polyisoprenbas och förekommer i växter, djur och mikroorganismer och omfattar t ex betakaroten och de olika xantofyllerna. Av de mer än 600 kända karotenoiderna återfinns ca 10 % i växtriket.
Stereoisomerism
Stereoisomerism är en form av isomeri, där två eller fler molekyler har samma kemiska formel och struktur, men differar i rumslig orientering av deras atomgrupper. Detta innebär att de har samma typ och antal atomer, men skiljer sig åt genom att vara speglar av varandra, liknande vänster- och högerhanden, vilket kallas att vara en form av "enantiomerer". Stereoisomeri är viktigt inom farmakologi eftersom olika stereoismoriska former av samma molekyl kan ha olika biologiska aktivitet och effekter på levande organismer.
Planococcus Bacteria
'Planococcus bacteria' are a group of Gram-positive, catalase-positive, and oxidase-negative cocci that typically appear in pairs or tetrads. They are non-motile, facultatively anaerobic organisms that can grow in a wide range of temperatures and NaCl concentrations. Some species are found in various environments such as soil, water, and food, while others are associated with clinical settings and can cause infections in humans and animals. Proper identification and antimicrobial susceptibility testing are essential for appropriate treatment.
Ftalsyror
Nitroparaffiner
I en enkel medicinsk kontext kan 'nitroparaffiner' definieras som en grupp organiska föreningar som innehåller en eller flera kolkedjor (paraffiner) med tillhörande kväveatom(ater) i form av nitrogruppen (-NO2). Dessa ämnen är vanligen artificiellt framställda och används inte som läkemedel, men kan förekomma som kontaminanter eller biprodukter i vissa industriella processer eller produkter. Nitroparaffiner kan vara skadliga för levande vävnader och ha potential att orsaka cancer, beroende på deras specifika kemiska struktur och koncentration.
Bakterie-DNA
Deoxiribonukleinsyra (arvsmassa) hos bakterier.
Gallussyra
Bensofuraner
Bensofuraner är en organisk kemisk klass av föreningar som innehåller ett bensenring system som är kondensat med en furan ring genom en kol-kol-bindning. Det vill säga, två aromatiska ringstrukturer är sammanbundna med varandra och bildar en sex-ledad ring med fem kolatomer och en syreatom. Bensofuraner kan förekomma naturligt i vissa växter och djur, men de flesta föreningarna inom denna klass är syntetiska och har använts inom farmaceutisk forskning för att utveckla läkemedel. Vissa bensofuraner kan dock vara skadliga eller cancerogena.
Cupriavidus necator
"Cupriavidus necator" är en gramnegativ, aerob bakterie som förekommer i naturen, bland annat i jord och vatten. Den har förmåga att bryta ned vissa organiska ämnen och kan användas inom bioteknik för produktion av kemikalier såsom polyhydroxialkanoater (PHA), som är en typ av bioplast. Den kan också reducera kväve till ammoniak och har därför potentialt att användas för behandling av avloppsvatten.
Biotransformering
Kemisk förändring av en exogen substans i ett biologiskt system. Förändringen kan innebära en inaktivering av ämnet eller produktion av en aktiv metabolit från en inaktiv ursprungsförening. Omvandling en kan vara icke-syntetisk (oxidation-reduktion, hydrolys) eller syntetisk (glukuronidbildning, sulfatkonjugation, acetylering, metylering). Metabolisk detoxikation och eliminering räknas också hit.
Reglering av genuttryck, enzymer
Jordförorenande ämnen
'Jordförorenande ämnen' är en samlingsbeteckning för kemiska substance som på grund av mänsklig aktivitet har släppts fritt i marken och orsakar negativa effekter på dess fysikaliska, kemiska och biologiska egenskaper, hotar den ekologiska balansen och kan ha skadliga konsekvenser för djurs, växters och människors hälsa.
Bensen
Ferredoxin-NADP-reduktas
Krokus
Modeller, molekylära
Maleater
I medicinen refererer "maleater" til at knuse eller opløse en medicinpille eller andet solidt medicinalformulering til en flydende form, f.eks. for at gøre det lettere at tage den gennem en slange eller for at give den patienten via en enteral sonde. Dette skal altid udføres under oplysning og vejledning fra en autoriseret sundhedsperson, da visse mediciner ikke bør maleates på grund af ændringer i deres farmakologiske egenskaber eller potentiale til at skade patienten.
Salicylater
Salicylater är en grupp av läkemedel som har svagt smärtstillande, febernedsättande och inflammationsdämpande effekter. De verkar genom att hämma en specifik enzymaktivitet i kroppen (cyclooxygenas-1 och -2), vilket leder till minskad syntes av prostaglandiner, som är signalmolekyler involverade i smärta, feber och inflammation. Salicylater förekommer naturligt i vissa växter, exempelvis i barken från salixarter (vilket gett upphov till namnet), men de används också syntetiskt inom farmaci. Ett vanligt exempel på ett salicylatpreparat är acetylsalicylsyra, som marknadsförs under varumärken som Aspirin och diversa generiska produkter.
Plasmider
En plasmid är en liten, cirkulär dubbelsträngad DNA-molekyl som kan replikera självständigt och förekommer hos bakterier och andra encelliga organismer. Plasmider kan överföras mellan celler och innehåller ofta gener som ger resistens mot antibiotika eller kodar för toxiner. De används också i molekylärbiologi som vektorer för kloning av gener.
Abskisinsyra
Indigo Carmine
Sekvensinpassning
I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.
Hydrokinoner
Hydroquinone är ett organisk ämne som används inom dermatologin som en ljussvagent för att behandla hyperpigmentering, såsom solskador, leverfläckar och åldersfläckar. Det fungerar genom att hämta igång en process som stoppar produktionen av melanin, det pigment i huden som orsakar fläckar och mörkningar. Hydroquinone kan användas topisk (på ytan) i form av cream eller gel, men det finns också tillgängligt i tablettform för behandling av inre orsaker till hyperpigmentering.
Kinolinsyror
Kinolinsyror är en grupp organiska föreningar som innehåller ett kinolinringsystem, vilket består av två benzening rings kopplade via en pyrrolring. De är vanligen syntetiska och har visat sig ha antibiotiska egenskaper. Exempel på kinolinsyror inkluderar ciprofloxacin och norfloxacin, som används för behandling av olika infektionssjukdomar.
Ultraviolettspektrofotometri
Ultraviolettspektrofotometri (UV-spektrofotometri) är en laboratorieteknik som används för att bestämma koncentrationen av ett ämne i en lösning genom att mäta absorptionen av ultraviolett ljus. Detta görs genom att lysa upp lösningen med UV-ljus och mäta den absorbierade strålningen vid specifika våglängder. Resultaten presenteras i form av ett spektrum, som visar absorptionen som en funktion av våglängden. Metoden är vanlig inom områden som kemi, biokemi och miljöanalys för att bestämma koncentrationer av olika organiska och oorganiska ämnen, till exempel aminosyror, vitaminer, pigment och vissa typer av föroreningar.
Reglering av genuttryck, bakterier
De processer genom vilka cytoplasmatiska eller intercellulära faktorer inverkar på differentieringsstyrningen av genaktiviteten hos bakterier.
Högtrycksvätskekromatografi
Pyrrolnitrin
Masskromatografi-Masspektrometri
Dendritiska celler
Immunkompetenta celler i lymfsystemet och det blodbildande (hemopoietiska) systemet och i huden. De kallas även interdigiterande, retikulära eller beslöjade. Deras morfologiska och fenotypiska funktion består i att bearbeta antigen eller presentera dem för T-celler, och därmed stimulera den cellulära immuniteten.
Bindningsplatser
Immuntolerans
Specifik avsaknad av immunreaktion mot ett visst antigen hos en individ med iövrigt normalt immunförsvar. Bristen kan bero på tidig kontakt med antigenet hos en immunologiskt omogen individ (foster eller nyfödd) eller hos en vuxen som utsatts för extremt stora doser eller ytterst små mängder av antigenet, eller genom exponering för strålning, antimetaboliter, antilymfocytserum osv.
Enzymreaktivatorer
Enzymreaktivatorer är substance som ökar aktiviteten hos enzymer genom att hjälpa till att stabilisera den tredimensionella strukturen eller konformationen hos enzymet, vilket i sin tur underlättar substratbindningen och katalysen av en biokemisk reaktion. De kan vara organiska eller oorganiska molekyler, inklusive joner, metallkomplex och proteinproteiner som kallas cofaktorer eller koenzym.
Metabola nätverk och banor
Molekylstruktur
Pseudomonas stutzeri
Molekylvikt
Modeller, kemiska
Toluidiner
I en enskild mening kan 'Toluidiner' definieras som en grupp organiska föreningar som innehåller en bensenring med två substituerade aminogrupper (-NH2), där minst en av dem är en toluidin-grupp. En toluidin-grupp är en metylgrupp (-CH3) som är bundet till en aminogrupp (-NH2), vilket ger upphov till strukturen C6H7N2. Toluidiner är relaterade till aniliner, där båda aminogrupperna inte är substituerade med en metylgrupp.
Nitrobensoater
I en enkel medicinsk definition, är nitroglycerin (även känt som nitrobenzolat eller nitroglycerin) ett läkemedel som vid användning ger muskler i kärlen i hjärtat och hjärnan en relaxerande effekt. Detta leder till att blodkärl expanderar och blodflödet ökar, vilket kan vara användbart för att behandla angina (svårigheter att andas eller smärtor i bröstet på grund av otillräcklig blodförsörjning till hjärtat) och andra hjärt-kärlsjukdomar. Nitroglycerin kan användas som spray under tungan, tabletter som placeras under tungan eller som en cream eller plaster som appliceras på huden. Det bör dock inte användas av personer som nyttjar vissa andra läkemedel, till exempel Viagra, och ska hanteras med omsorg på grund av möjliga biverkning
Restriktionskartläggning
Dinitrobensener
Betalainer
Betalainer är ett samlingsnamn för vattenlösliga, röd- till gulaktigt färgade pigment som huvudsakligen förekommer hos växter från Caryophyllales ordningen, såsom betsmarker och amarantväxter. De utgör en del av växternas naturliga försvar mot skadedjur och har också visat sig ha potential som antioxidativt och antiinflammatoriskt hälsomineral. Betalainer bör inte förväxlas med anthocyaniner, som är ett annat slags växtfärgämne men som tillhör en annan kemisk grupp.
Hem
1,2-Dihydroxybenzene-3,5-Disulfonic Acid Disodium Salt
1,2-Dihydroxybenzene-3,5-disulfonic acid disodium salt, även känt som pyrocatechol violett eller piceol sulfonic acid disodium salt, är ett organisk förening med formeln C6H4Na2O6S2. Det är den disodiumsaltformen av 1,2-dihydroxybenzen-3,5-disulfonsyra och används ofta som en indikator i kemiska reaktioner på grund av dess färgförändringar under olika pH-värden. Det har en intensivt lila färg i lösning.
Naftoler
I en enkel medicinsk definition kan 'naftoler' definieras som kemiska föreningar som innehåller naftalen som grundstruktur och har minst en hydroxylgrupp (-OH) kopplad till naftalenvätegruppen. Dessa föreningar är kända för att ha potentialen att fungera som antiinflammatoriska, antioxidativa och analgetiska agenter.
Biokatalys
En biokatalys, även känd som ett enzym, är ett protein som accelererar en biokemisk reaktion genom att sänka aktiveringsenergibehovet för reaktionen. Denna minskning av energi krav gör det möjligt för reaktionen att fortgå under mildare betingelser, såsom fysiologiska temperaturer och pH-värden, jämfört med obehindrade reaktioner. Biokatalysörer är specifika för de reaktioner de katalyserar och ökar ofta reaktionshastigheten av många magnituder. De spelar en avgörande roll i alla levande system genom att underlätta metabolismen och andra biokemiska processer.
Bakterier
Stenkolstjära
Propan
3-merkaptopropionsyra
Pseudomonas fluorescens
"Pseudomonas fluorescens" är en grampositiv, aerob bakterie som naturligt förekommer i vatten och jordmån. Den är känd för sin förmåga att producera ett blått-grönt fluorescerande pigment under optimala tillväxtförhållanden, men detta är inte alltid synligt. Bakterien kan orsaka infektioner hos människor, framförallt hos immunosupprimierade individer, men den ses sällan som en patogen i kliniska sammanhang. Den kan också vara en förorenare inom livsmedelsindustrin och orsaka fördärv av produkter.
Actinomycetales
En ordning av grampositiva, primärt aeroba bakterier med förgrenade filament.
Open Reading Frames
I en mening kan "Open Reading Frames" (ORF) definieras som en sekvens av DNA eller RNA som har potentialen att koda för ett protein. ORF börjar med en startkodon, vanligtvis AUG, och fortsätter till nästa stoppkodon (UAG, UAA eller UGA). Den resulterande aminosyrasekvensen kan potentiellt vara kapabel till att bilda ett protein om den översätts korrekt. Det är värt att notera att inte alla ORF:er leder nödvändigtvis till produktionen av ett funktionellt protein, eftersom det kan finnas flera skäl till varför translationen kan misslyckas eller ge upphov till en icke-funktionell peptid.
Emericella
Emericella är ett släkte av svampar inom ascomyceterna och är nära relaterat till släktet Aspergillus. Dessa svampar förekommer vanligtvis i naturen, framförallt i marken och på förrotten vegetation. Några arter av Emericella kan producera sekundära metaboliter med medicinsk relevans, till exempel emericellamider som har visat sig ha potential som antibiotika och antitumörmedel. Det är dock värt att notera att Emericella-svampar i allmänhet inte anses vara patogena för människor, men kan orsaka infektioner hos immunosvaga individer.
Mutation
Cysteamin
2,4,5-triklorfenoxiättiksyra
Pentanoner
I en enkel medicinsk definition är pentanol (eller pentanonol) ett alkoholhaltigt, klart och färglöst vätskeämne med kemisk formel C5H11OH. Det är en sekundär alkohol som förekommer naturligt i vissa frukter och vin, men kan också produceras syntetiskt. Pentanol används inom medicinen som ett lokalbedövningsmedel vid små kirurgiska ingrepp eller injektioner, då det har en narkotisk effekt på nervändarändarna.
Karboxilyaser
Pyrogallol
Pyrogallol är ett organisk ämne som används inom laboratoriemedicin och forskning. Det är ett phenol med tre hydroxylgrupper (-OH) som är kemiskt reaktivt och används som reducerande agent i vissa typer av analytiska metoder, såsom oxdation-reduktionstester. Pyrogallol är även känt för att ha potentialen att vara irritant och senstizer för hud och slemhinnor.
Fenylpyrodruvsyror
Aminosyror
Proteinkonfiguration
I enkelhet kan 'proteinkonfiguration' definieras som den specifika rymdstrukturen och orienteringen hos de aminosyror som utgör ett protein. Denna konfiguration bestäms av proteinkedjans primära struktur (sekvensen av aminosyror) samt hur dessa aminosyror är hopfogade och vevda i rummet, vilket kallas för sekundär, tertiär och kvartär struktur. Proteinkonfigurationen har en direkt betydelse för proteinets funktion och stabilitet.
Flaviner
Flaviner är en grupp organiska föreningar som fungerar som prostetiska grupper inom flavoproteiner, vilka är involverade i biologiska oxidations-reduktionsprocesser. Flavinmononukleotid (FMN) och flavinadensindinukleotid (FAD) är två exempel på flaviner som spelar en viktig roll inom cellers metabolism, såsom i andningen och i nedbrytningen av fettsyror, kolhydrater och aminosyror.
Herbicidresistens
Herbicidresistens är ett fenomen där växter, oftast ogräs, utvecklar tolerance eller resistens mot specifika herbicider som tidigare var effektiva för att kontrollera eller döda dem. Detta sker på grund av genetiska mutationer eller selektiv press som orsakas av upprepad exponering för samma herbicide. Som ett resultat kan dessa växter överleva och fortplanta sig, vilket kan leda till en ökad population av resistenta ogräs som är svåra att kontrollera med de vanliga metoderna.
Bensocykloheptener
Spektralanalys, Raman
Raman-spektroskopi är en typ av vibrationsspektroskopi som ger information om vibrations- och roteringsenerginivåer hos molekyler i ett material. Tekniken bygger på Ramaneffekten, där en ljuskälla med en viss frekvens inkompagerar ett material och en mindre andel av den infallande ljusströmmen ändrar frekvens (skiftar) till lägre eller högre värden. Detta skift i frekvens, kallat Ramanskiftet, är specifikt för varje kemisk bindning och ger en unik fingeravtryckslik spektralanalys för det aktuella materialet. På så sätt kan Raman-spektroskopi användas för att identifiera och undersöka olika substanser, inklusive kemiska bindningar, struktur, faser, komposition och interaktioner mellan molekyler.
Acinetobacter calcoaceticus
En art gramnegativa, aeroba bakterier som finns i jord och vatten. Normalt icke-patogena, men kan orsaka sjukhusinfektioner, framförallt hos försvagade personer.
Oxidoreductases Acting on CH-CH Group Donors
'Oxidoreductases Acting on CH-CH Group Donors' är ett samlingsnamn inom nomenklatur för en grupp enzymer som katalyserar oxidation-reduktionsreaktioner där kol-kol-bindningar (CH-CH) i organiska substance är donatorer av elektroner. Detta innebär att de hjälper till att överföra elektroner från en kolatom till en annan, vilket ofta leder till bildandet eller brytandet av kol-kol-bindningar. Exempel på enzymer som faller under denna kategori är dekarboxylaser och oxidaser.
Flavin-adenindinukleotid
Naftalensulfonater
Naphthalene sulfonates are a class of chemical compounds characterized by the addition of one or more sulfonic acid groups (-SO3H) to naphthalene, a polycyclic aromatic hydrocarbon consisting of two benzene rings fused together. These compounds are commonly used as detergents, dyes, and industrial chemicals. A well-known example is sodium naphthalene sulfonate, which is an anionic surfactant.
NAD
NAD (Nicotinamid Adenin Dinukleotid) är ett viktigt koenzym som deltar i flertalet biokemiska reaktioner inom kroppen, särskilt vid cellandningen där det hjälper till att konvertera energireserver i form av kolhydrater, fetter och protein till ATP (Adenosintrifosfat), som används som direkt energikälla i cellerna. NAD förekommer i två former: NAD+ (oxiderad form) och NADH (reducerad form). Vid cellandningen oxideras NADH tillbaka till NAD+, vilket genererar elektroner som driver den elektrontransportkedja som producerar ATP. Därutöver är NAD också inblandat i andra processer såsom DNA-reparation och cellulär signalering.
Fenoler
Enzymstabilitet
Omflyttningsbara DNA-segment
Enskilda segment av DNA som kan falla ut och återinlämmas på annan plats i genomet. De flesta är inaktiva, dvs att de inte påträffats i annat än sitt integrerade tillstånd. Till de omflyttningsbara DNA-segmenten hör IS("insertion sequence")- och Tn-enheterna hos bakterier, Ac- och Ds-sekvenserna hos majs, P-, gypsy- och pogosekvenserna hos Drosophila, Tiggersekvenserna hos människa samt Tc- och marinersekvenserna, vilka förekommer i hela djurriket.
Metylenblått
Comamonas testosteroni
En art gramnegativa, aeroba stavbakterier, som tidigare kallades Pseudomonas testosteroni. Den skiljer sig från andra Comamonasarter genom sin förmåga att assimilera (ta upp) testosteron och att nyttja fenylacetat eller maleat som kolkällor.
Streptomyces
Streptomyces är ett släkte av grampositiva, strikt aeroba bakterier som tillhör ordningen Actinomycetales. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att producera en rad olika antibiotika och andra bioaktiva metaboliter, vilket gör dem viktiga inom biomedicinsk forskning. Streptomyces-arterna har en komplex livscykel som inkluderar sporbildande hyfer och vegetativa mycel. De förekommer naturligt i en rad olika miljöer, till exempel jord, vatten och på levande växter.
Nitrobensener
En medicinsk definition av "nitrobenzen" är en kemisk substans som består av en benzenring (en cyklisk, aromatisk kolväte) med en nitrogrupp (-NO2) kovalent bunden till en kolatom. Nitrobenzen används inte primärt inom medicinen, men kan förekomma som en intermediär komponent i syntesen av vissa läkemedel. Den är även välkänt för sin explosiva natur under vissa förhållanden.
Svavelaminosyror
Sulfonamider, eller sulfa-preparat, är en grupp antibiotika som verkar genom att hibita bakteriens förmåga att syntetisera en essentiell aminosyra, dihydrofolsyra. De gör detta genom att tävla ut med paraminobenzoat (PABA) om platsen i enzymkomplexet för syntesen av folsyra. Sulfonamiderna har varit väl använda sedan 1930-talet och är effektiva mot många bakterier, inklusive stafylokocker, streptokocker och E. coli. De kan ges oralt eller parenteralt och används ofta i kombination med andra antibiotika för att behandla olika infektioner, såsom urinvägsinfektioner, hud- och webbinfektioner samt ögoninfektioner.
Rhodocyclaceae
Rhodocyclaceae är en familj av proteobakterier inom fylumet Pseudomonadota. Bakterier inom denna familj är vanligen gramnegativa, aeroba eller anaeroba och har ofta en cirkulär eller spiralformad morfologi. De flesta arterna är kända för sin förmåga att oxidera ammoniak till nitrit och kan spela en viktig roll i den biogeochemiska kvävecykeln.
Växtproteiner
Masspektrometri
Galium
Brevibacterium flavum
Neopterin
Moraxella
Ett släkte gramnegativa, aeroba bakterier som är i antingen stavform (undersläktet Moraxella) eller klotform (undersläktet Branhamella). Bakterierna parasiterar på slemhinnor hos människor och andra varmblodiga djur.