Guanylatkinas
Nukleosidfosfatkinas
Guanylatcyklas
Guanosine Monophosphate
Membranproteiner
Phosphatidylinositol 3-Kinases
Ca(2+)-kalmodulinberoende proteinkinas
MAP-kinassignalsystem
Proteinkinaser
Protein-serin-treoninkinaser
CARD Signaling Adaptor Proteins
src-domäner
Molekylsekvensdata
Intracellulära signalpeptider och -proteiner
Nervvävnadsproteiner
Adaptorproteiner, signalöverförande
Aminosyrasekvens
Proteinbindning
Cykliskt GMP
Proteinkinashämmare
Guanylatcyklasaktiverande proteiner
Post-Synaptic Density
Zonula Occludens-1 Protein
Sekvenshomologi, aminosyra
Proteinstruktur, tertiär
src-kinaser
PDZ-domäner
Proteinkinas C
Cykliskt AMP-beroende proteinkinaser
Bindningsplatser
Two-Hybrid System Techniques
p42 MAP-kinas
Neuropeptider
Mutation
Fosforylering
Kloning, molekylär
Fosfoproteiner
Bassekvens
p21-Activated Kinases
Signalomvandling
Mitogenaktiverade proteinkinaskinaser
JNK-mitogenaktiverade proteinkinaser
Rekombinanta proteiner
Tumörsuppressorproteiner
Transfektion
Mitogenaktiverat proteinkinas 3
Plant Structures
Cellinje
Receptors, Guanylate Cyclase-Coupled
Precipitintester
Rekombinanta fusionsproteiner
Zonula Occludens-2 Protein
Protein-tyrosinkinaser
Kreatinkinas
Kväveoxid
CDC2-proteinkinas
Cyklinberoende kinaser
MAP-kinaskinaskinaser
Enzymaktivering
Cykliskt GMP-beroende proteinkinaser
Oxadiazoler
Kaseinkinaser
Sekvensinpassning
DNA, komplementärt
Celler, odlade
eIF-2-kinas
Kaseinkinas II
Modeller, molekylära
Drosophilaproteiner
Metylenblått
Synapser
Cellmembran
Pyruvatkinas
Ribosomprotein-S6-kinaser
Blotting, Western
Tight Junctions
Protein-underenheter
MAP-kinaskinas 1
Receptorprotein-tyrosinkinaser
Tymidinkinas
NMDA-receptorer
Extracellulära signalstyrda MAP-kinaser
MAP-kinaskinas 4
Glutationtransferas
Isoenzymer
Aminosyramönster
1-fosfatidylinositol-4-kinas
Mitogenaktiverade proteinkinaser
CDC2-CDC28-kinaser
Nervceller
Proteintransport
I-kappa B-kinas
Råttor, Sprague-Dawley
Kväveoxiddonatorer
Glykogensyntaskinas 3
Aurora Kinases
rho-Associated Kinases
Saccharomyces cerevisiae
Receptorer, förmaksnatriuretiska
Proteinkinas C-delta
Proteinkinas c-alfa
Enzymhämmare
Natriuretiska peptider
Kolibakterie
Protonkogenproteiner
Nitroprussid
Proteinisoformer
Diacylglycerolkinas
AMP-aktiverade proteinkinaser
Jästsvampar
Kinoxaliner
Kalcium
Cykliskt AMP
Hippocampus
AMPA-receptorer
Alternativ splitsning
Protonkogenproteiner c-akt
p125FAK-protein
Hjärna
Grönfluorescerande proteiner
Cytoskelettproteiner
Myosinkinas
Substratspecificitet
Test för genetisk komplementering
Fosfotransferaser
Tyrosin
Dos-responskurva, läkemedel
Januskinas 2
Proteinkonfiguration
Natriuretisk förmaksfaktor
Focal Adhesion Protein-Tyrosine Kinases
Enzymaktivatorer
Drosophila
Ribosomprotein-S-6-kinaser, 90-kDa
Tetradekanoylforbolacetat
RNA, budbärar
Proteinkinas C-epsilon
Guanylatkinas är ett enzym som katalyserar reaktionen där ATP (Adenosintrifosfat) omvandlas till GDP (Guanosindifosfat) och pyrofosfat. Detta enzym spelar en viktig roll inom celldelning, signaltransduktion och metabolism. Guanylatkinas är också involverat i syntesen av cGMP (cykliskt GMP), ett signalsubstanser som har en rad fysiologiska funktioner, såsom reglering av blodflöde, skelettmuskulaturrelaxering och neurotransmission.
Nukleosidfosfatkinas (NPK) är ett enzym som katalyserar fosforylering av nukleosider till nukleosidmonofosfater, vilket är en viktig reaktion i syntesen av nukleotider. Nukleosider är byggstenarna i DNA och RNA, och de består av en pentos (en fem-kolsyre) sockerdel och en heterocyklisk bas. Genom att fosforylera nukleosiderna bildas nukleosidmonofosfater, som sedan kan användas för att bygga upp DNA och RNA. Det finns olika typer av NPK-enzym, som är specialiserade på att fosforylera specifika nukleosider.
Guanylatcyklaser (GC) är en grupp enzymer som katalyserar syntesen av cykliskt guanosinmonofosfat (cGMP) från guanosintrifosfat (GTP). Denna reaktion spelar en viktig roll i celldelning, signaltransduktion och reglering av blodflöde. Guanylatcyklaser aktiveras av olika signalsubstanser som gaser, hormoner och ljus, beroende på vilken typ av guanylatcyklas det är fråga om. När GC aktiveras ökar mängden cGMP i cellen, vilket leder till en kaskad av händelser som kan påverka celldifferentiering, celldelning och celldöd.
'Guanosine Monophosphate' (GMP) är en typ av nukleotid som förekommer naturligt i levande celler. Det består av en fosfatgrupp, en sockermolekyl (ribos) och en nucleobas, i detta fall guanin. GMP är en viktig building block inom DNA- och RNA-molekyler, där det spelar roll som en av de fyra huvudsakliga nukleotiderna tillsammans med adenosinmonofosfat (AMP), cytidinmonofosfat (CMP) och uridinmonofosfat (UMP).
Utöver sin roll inom DNA- och RNA-syntesen är GMP också involverat i en rad andra cellulära processer, såsom signaltransduktion, energiomsättning och neurotransmission. Dessutom kan GMP användas som ett excipient eller aktiv ingrediens inom farmaceutisk kontext.
Membranproteiner är proteiner som är integrerade i eller associerade med cellmembran, såsom plasma membran, mitokondriella membran och endoplasmatiska retikulums membran. De kan vara inkorporerade i lipidbilagan i membranet eller fäst vid ytan av membranet. Membranproteiner utför en rad viktiga funktioner, såsom transport av molekyler över membranet, signaltransduktion och cellytiska processer som celladhesion och celldelning. Enligt en uppskattning utgör membranproteiner upp till 30% av det proteomika landskapet hos eukaryota celler. Membranproteiner kan delas in i tre kategorier baserat på deras struktur och funktion: transmembrana proteiner, bitmembrana proteiner och GPI-ankrade proteiner.
Phosphatidylinositol 3-Kinases (PI3K) är en grupp enzymer som spelar en viktig roll inom cellsignalering och regulerar celldelning, celldifferentiering, apoptos (programmerad celldöd), cellcykel, cellmotilitet och cellyttuppräkning. PI3Kfamiljen kan delas upp i tre klasser baserat på struktur och funktion. Klass I PI3K är den mest studerade klassen och består av flera isoformer som katalyserar fosforylering av fosfatidylinositol (4,5)-bisfosfat (PIP2) till fosfatidylinositol (3,4,5)-trisfosfat (PIP3). PIP3 fungerar som en andra budbärare i cellsignalering och aktiverar proteiner med pleckstrinhomologidomäner, inklusive Akt/PKB. Aktiviteten hos PI3K regleras av flera olika signaleringsvägar, bland annat via receptor tyrosinkinasers aktivering och G-proteinkopplade receptorer. Dysfunktion i PI3K-signalering har visats vara involverad i många sjukdomar, inklusive cancer och diabetes.
MITOHOCHONDRIEELL MAP-KINASSYSTEM (MEVANSYREAKTIVE PROTEINKINASSYSTEM, MAPK) är ett signalsystem som överför signaler inom cellen och utgör en del av intracellulära signaltransduktionsvägar. Det består av en serie serin/treoninkinas som aktiveras i en kaskadliknande process som följer på olika yttre stimuli, såsom tillväxtfaktorer, cytokiner och stressorer.
MAP-kinasystemet består av tre huvudsakliga komponenter: MAP kinaskinas (MKKK), MAP kinaskinaser (MKK) och MAP kinaser (MPK). När en yttre stimulus binder till sin receptor aktiveras den, vilket leder till aktivering av MKKK. Aktiverade MKKK fosforylerar och aktiverar i sin tur MKK, som sedan fosforylerar och aktiverar MPK. När MPK är aktiverat kan det fosforylera och på så sätt reglera olika målproteiner, vilket leder till en cellulär respons till den ursprungliga stimulansen.
MAP-kinasystemet spelar en viktig roll i regleringen av celldelning, differentiering, apoptos och inflammation, och felaktigheter i systemet har visats vara involverade i flera sjukdomstillstånd, inklusive cancer.
Proteinkinaser är en grupp enzymer som katalyserar fosforylering av protein, vilket innebär att de adderar en fosfatgrupp till ett protein. Denna process kan aktivera eller inaktivera proteinet beroende på var på proteinmolekylen fosfatgruppen adderas. Proteinkinaserna spelar därför en viktig roll i cellens signaltransduktionsvägar och reglering av cellcykeln, apoptos och metabolism. De kan aktiveras eller inaktiveras av olika signalsubstanser och är mål för flera läkemedel inom områden som cancer och diabetes.
Protein-serin-treonin kinaser (PST-kinaser) är en grupp enzymer som har förmågan att katalysera överföringen av en fosfatgrupp från ATP till serin eller treonin aminosyror i proteiner. Denna process kallas fosforylering och den reglerar ofta proteinaktivitet, lokalisation och interaktion med andra molekyler inom cellen. PST-kinaserna spelar därför en viktig roll i cellsignalering, celldelning, apoptos och metabolism. Dereglering av dessa kinaser kan leda till olika sjukdomszustånd, exempelvis cancer.
CARD (caspase recruitment domain) signaling adaptor proteins are a group of intracellular signaling molecules that play a crucial role in the regulation of various cellular processes, including inflammation, immunity, and programmed cell death or apoptosis. These proteins contain a CARD domain, which is a protein-protein interaction module that enables them to bind to other CARD-containing proteins and form large signaling complexes.
CARD signaling adaptor proteins function as molecular scaffolds that help bring together various signaling molecules in response to different stimuli, such as pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) or damage-associated molecular patterns (DAMPs). By doing so, they facilitate the activation of downstream signaling cascades and the initiation of appropriate cellular responses.
Some examples of CARD signaling adaptor proteins include:
* Myeloid differentiation factor 88 (MyD88): This protein is involved in the signaling pathways of most Toll-like receptors (TLRs) and interleukin-1 receptor (IL-1R), leading to the activation of nuclear factor kappa B (NF-κB) and mitogen-activated protein kinases (MAPKs).
* Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1 (RIPK1): This protein is involved in various signaling pathways, including the activation of NF-κB and MAPKs, as well as programmed cell death.
* Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD (ASC): This protein plays a central role in the formation of inflammasomes, which are large signaling complexes that activate caspase-1 and lead to the production of proinflammatory cytokines.
Overall, CARD signaling adaptor proteins play a critical role in maintaining cellular homeostasis and responding to various stressors and pathogens. Dysregulation of these proteins has been implicated in various diseases, including autoimmune disorders, neurodegenerative diseases, and cancer.
'SRC-domäner' är ett begrepp inom molekylär biologi och genetik. Det står för "sökvägsrelaterade komponenter" (engelska: "signal transducing receptor") och refererar till en grupp av membranproteiner som kan ta emot signaler från utvändiga faktorer, såsom hormoner, cytokiner eller tillväxtfaktorer, och överföra denna information in i cellen.
SRC-domäner är typiskt sett transmembrana proteiner med en extracellulär domän som binder till ligander (molekyler som aktiverar receptorn), en transmembrandomän som utgör den del av proteinet som spänner över cellmembranet, och en intracellulär domän som är involverad i signaltransduktionen. När en ligand binder till den extracellulära domänen aktiveras receptorn, vilket leder till att den intracellulära domänen interagerar med andra proteiner och utlöser en kaskad av intracellulära signaleringsvägar.
Det är värt att notera att SRC-domäner inte ska förväxlas med Src-proteinet, som är ett cytoplasmiskt tyrosinkinasprotein som också spelar en roll i cellsignalering.
Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.
DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.
Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.
Intracellulära signalpeptider och proteiner är molekyler som spelar en viktig roll i cellens signalsystem och regulatoriska processer. De intracellulära signalpeptiderna och proteinerna kan aktivera eller inhibera olika cellulära funktioner, såsom genuttryck, celldelning, apoptos (programmerad celldöd) och cellcykeln. Dessa molekyler binder till specifika receptorer eller enzymer inne i cellen för att överföra signalsubstanser från cellmembranet eller cytosolen till cellkärnan. Exempel på intracellulära signalpeptider och proteiner inkluderar second messengers som cAMP (cyklisk AMP) och IP3 (inositoltrifosfat), samt proteinkinaser, kalmodulin och G-proteiner.
"Nervvävnadsproteiner" är ett mycket brett begrepp som kan omfatta alla proteiner som finns i nervvävnad, inklusive hjärna, ryggmärke och nerver. Detta kan inkludera strukturella proteiner som utgör grunden för celler och deras processer, signalproteiner som används för kommunikation mellan celler, samt enzymer och andra proteiner som har betydelse för nervvävnadens funktion och homeostas. Exempel på specifika proteiner inkluderar neurofilament, tubulin, aktin, kinas, ligander och receptorer.
Adaptorproteiner som är involverade i signalöverföring är proteiner som hjälper till att överföra signalsubstanser eller andra molekyler från en receptor till intracellulära signaltransduktionsvägar. Dessa proteiner har ofta modulerbara strukturer och kan binda till flera olika proteiner, vilket gör det möjligt för dem att fungera som en slags "mellanhand" i signalskeppen. På så sätt kan de hjälpa till att koordinera och integrera signalsubstansernas effekter inom cellen. Exempel på adaptorproteiner som är involverade i signalöverföring inkluderar proteiner i GRB2-familjen, SOS-proteiner och proteiner i Crk-familjen.
En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.
Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.
Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.
Proteinbindning (ibland även kallat proteininteraktion) refererar till den process där ett protein binder sig till ett annat molekylärt ämne, exempelvis en liten organisk molekyl, ett metalljon, ett DNA- eller RNA-molekyl, eller till ett annat protein. Proteinbindningar är mycket viktiga inom cellbiologi och medicinen, eftersom de ligger till grund för många olika biokemiska processer i kroppen.
Exempel på olika typer av proteinbindningar inkluderar:
* Enzym-substratbindningar, där ett enzym binder till sitt substrat för att katalysera en kemisk reaktion.
* Receptor-ligandbindningar, där en receptor binder till en ligand (exempelvis ett hormon eller en neurotransmittor) för att aktiveras och utlösa en cellsignal.
* Protein-DNA/RNA-bindningar, där proteiner binder till DNA eller RNA-molekyler för att reglera genuttrycket eller för att delta i DNA-replikation eller -reparation.
* Protein-proteinbindningar, där två eller fler proteiner interagerar med varandra för att bilda komplexa eller för att reglera varandras aktivitet.
Proteinbindningar kan styras av en mängd olika faktorer, inklusive den tresdimensionella strukturen hos de involverade molekylerna, deras elektriska laddningar och hydrofila/hydrofoba egenskaper. Många proteinbindningar kan också moduleras av läkemedel eller andra exogena ämnen, vilket gör att de är viktiga mål för farmakologisk intervention.
'Cyclic GMP' (guanosine monophosphate) refererar till en signalmolekyl inom cellen, som är involverad i en mängd olika fysiologiska processer. Cyclisk GMP syntetiseras av ett enzym kallat guanylatcyklas och bryts ned av ett annat enzym kallat fosfodiesteras. Nivåerna av cyclisk GMP kan regleras genom att kontrollera aktiviteten hos dessa två enzym.
I en medicinsk kontext kan termen 'cykliskt GMP' användas för att beskriva läkemedelsbehandlingar som påverkar nivåerna av cyclisk GMP i kroppen. Exempelvis finns det vissa läkemedel som blockerar fosfodiesterasenzenymet, vilket leder till en ökning av cyclisk GMP-nivåer och kan användas för att behandla erektil dysfunktion och pulmonell arteriell hypertension.
Samtidigt bör nämnas att termen 'cykliskt GMP' inte är en etablerad medicinsk diagnos eller sjukdom, utan snarare en benämning på en biokemisk process som kan styras med olika läkemedel för att behandla vissa medicinska tillstånd.
En proteinkinashämmare (PKI) är ett ämne som hämmar verksamheten hos en specifik proteinkinas, en typ av enzym som fosforylerar (lägger till en fosfatgrupp på) proteinmolekyler och på så sätt reglerar deras funktion. Proteinkinaserna spelar en viktig roll i cellulära signaltransduktionsvägar, och deras överaktivitet kan leda till olika sjukdomszustånd, till exempel cancer. Därför är proteinkinashämmare ett aktivt forskningsområde inom läkemedelsutveckling, där syftet är att hitta effektiva behandlingsmetoder för olika sjukdomar genom att modulera proteinkinasernas verksamhet. Proteinkinashämmare finns tillgängliga på marknaden som läkemedel mot cancer och andra sjukdomar, men deras användning är ofta kopplad till viss biverkningsrisk.
Guanylatcyklasaktiverande proteiner (GEFs) är en typ av enzymer som aktiverar guanylatcyklaser (GC), en grupp enzym som katalyserar syntesen av cyklikt GMP (cGMP) från GTP. cGMP är en signalsubstans som spelar en viktig roll i cellulära signaltransduktionsvägar och är involverad i en rad fysiologiska processer, såsom blodflödesreglering, neurotransmission och celldifferentiering.
GEFs fungerar genom att katalysera utbytet av GDP till GTP på guanylatcyklasen, vilket leder till en konformationsförändring och aktiveringen av enzymet. Detta ökar i sin tur syntesen av cGMP, som sedan kan binde till och aktivera effektormolekyler, vilket leder till ytterligare cellulära respons.
GEFs är kritiska regulatörer av guanylatcyklaser och deras aktivitet är strikt kontrollerad i cellen. Dysfunktion eller mutationer i GEF-gener kan leda till olika sjukdomstillstånd, inklusive cancer och kardiovaskulära sjukdomar.
Post-synaptic density (PSD) är ett begrepp inom neurovetenskapen och refererar till den struktur som finns på den postsynaptiska membranen i en synaps, det vill säga den sida av synapsen där impulsen normalt sett fortsätter efter att ha passerat synapsen. PSD innehåller ett stort antal proteiner som är involverade i signaltransduktion och plasticitet hos synapserna, däribland receptorer för neurotransmittor, skalförändringsproteiner och signalsubstanser. Den postsynaptiska densiteten kan variera i storlek och komplexitet beroende på olika faktorer, såsom neuronens typ, funktion och aktivitetsnivå. Ändringar i PSD har visats korrelera med olika former av synaptisk plasticitet, inlärning och minnesbildning.
Zonula Occludens-1 (ZO-1) protein är en tätt sammanlänkande (tight junction) protein som spelar en viktig roll i att reglera och upprätthålla cellers barrierfunktion i epitel- och endotelvävnader. Detta protein hör till en grupp av proteiner som kallas för "zonula occludens"-proteiner, och det är ett viktigt strukturellt och funktionellt komponent inom täta stängsel.
ZO-1 protein binder direkt till transmembrana proteiner i den tight junction, såsom klaminin, occludin och junktaderminalprotein 1 (JAM-1), för att hjälpa till att stabilisera och organisera dessa proteiner. Det fungerar också som en ankare för aktinskelettet inne i cellen, vilket bidrar till att mekaniskt stödja och förstärka barrierfunktionen.
Dessutom har ZO-1 protein visat sig ha en roll i intracellulära signaltransduktionsvägar, vilket inkluderar reglering av celldelning, celldifferentiering och cellyttans integritet. Vidare forskning pågår för att undersöka de specifika mekanismerna bakom ZO-1 proteins roll i cellulär reglering och hur dessa insikter kan användas för att utveckla terapeutiska strategier för att behandla olika sjukdomar, till exempel inflammatorisk tarmsjukdom (IBD) och cancer.
Sekvenshomologi, eller sekvenstillhörighet, inom biokemi och genetik refererar till den grad av likhet mellan två eller flera molekylära sekvenser, som kan vara DNA-sekvenser, RNA-sekvenser eller proteinsekvenser. När det gäller aminosyrasekvenser, handlar det om den ordningsföljd av specifika aminosyror som bildar en proteinmolekyl.
Aminosyrasekvenshomologi mellan två proteiner används ofta för att undersöka deras evolutionära släktskap och funktionella likheter. Hög sekvenshomologi kan indikera närbesläktade proteiner med möjligen liknande funktioner, medan låg homologi kan tyda på mindre närstående eller icke-relaterade proteinsekvenser.
Det är värt att notera att även om två proteiner har en hög sekvenshomologi kan deras struktur och funktion skilja sig ifrån varandra, eftersom aminosyrasekvenser inte alltid korrelerar perfekt med proteiners tredimensionella struktur eller biokemiska aktivitet.
Tertiär proteinstruktur refererar till den tresdimensionella formen och flexibiliteten hos ett proteinmolekyl som resulterar från de specifika interaktionerna mellan dess sekundära strukturelement, såsom alfa-helixar och beta-flakor. Den tertiära strukturen av ett protein bestäms av den sekvensordningen (primär struktur) av aminosyror som utgör proteinet och de krafter som verkar mellan dem, såsom vätebindningar, dispersion-krafter och elektrostatiska attraktioner. Den tertiära strukturen är viktig för ett proteins funktionella aktivitet och kan vara stabil eller dynamisk beroende på proteinets roll i cellen.
'SRC-kinaser' er ein type av enzymer kalt tyrosinkinaser, som spiller en viktig rolle i cellesignalering og regulering. De aktiverer andre proteiner ved å legge til en fosfatgruppe på dem, forenklet sett. SRC-kinasen er også involvert i reguleringen av cellevoksering, apoptose (programmert celledød), og cellegrovhengighet. Dess aktivitet er forstyrrt i mange typer av kreft, og det har blitt utviklet medisinske behandlinger som tar hensyn til dette.
'PDZ-domäner' är en typ av proteininteraktionsdomän som förekommer hos många olika proteiner, särskilt inom cellmembranet och i cytoskelettet. Domänen har fått namn efter de första tre proteiner där den upptäcktes: PSD-95/SAP90, DLG och ZO-1.
En PDZ-domän består av cirka 80-90 aminosyror och fungerar som en modulär enhet för proteinbindning. Den kan binda specifikt till C-terminala delar av andra proteiner, ofta med en fyra-aminosyresekvens (typvis Ser/Thr-X-Val/Ile/Leu). Genom att interagera med olika proteiner kan PDZ-domäner hjälpa till att organisera och samordna signaltransduktionsvägar, celladhesion och cytoskelettorganisation.
PDZ-domäner förekommer i en mängd olika cellulära kontekster, inklusive synapsen, där de hjälper till att reglera neuronal signalering, och i epitelceller, där de är involverade i cellytan organisation och polaritet.
Protein Kinase C (PKC) er en type enzym, mer specifikt et serin/treonin-protein kinase, som spiller en viktig rolle i signaltransduksjonen i celler. PKC-enzymene aktiveres ofte av sekundære budbringere som diacylglycerol (DAG) og calciumioner (Ca2+), som oppstår som reaksjonsprodukter etter aktivering av reseptorer for diverse hormoner, voktselvaktivatorer og andre signalmolekyler.
PKC-enzymene kan fosforylere (legg til en fosfatgruppe på) andre proteiner, som ofte fører til endringer i proteinaktiviteten og/eller lokalisasjonen. Dette er en viktig mekanisme for regulering av cellulære prosesser som cellevel, differentiering, apoptose (programmert celledød) og cellcyklus.
Der er flere isoformer av PKC-enzymene, som kan deles inn i tre klasser basert på deres aktiveringsmekanisme: konventionelle (cPKC), noveller (nPKC) og atypiske (aPKC). Disse forskjellige isoformene har forskjellige cellulære lokalisasjoner og funksjoner, noe som bidrar til deres specifike roller i cellens signaltransduksjonsnettverk.
Cyclic AMP (cAMP)-dependent protein kinases, även kända som PKA (Protein Kinase A), är en typ av enzymer som katalyserar fosforylering av serin- och/eller threoninresidyer på proteiner. Dessa kinaser aktiveras av cyklisk AMP, ett signalsubstrat som bildas inom cellen i respons till hormoner som exempelvis glukagon och adrenalin. När cAMP binder till regulatoriska underenheterna hos PKA leder detta till en konformationsförändring som frigör katalytiska underenheter, vilka kan fosforylera och på så sätt aktivera eller inaktivera målproteiner. Dessa proteinkinaser spelar därmed en viktig roll i regleringen av olika cellulära processer som exempelvis glukosmetabolism, lipidmetabolism och celldelning.
"Bindningsplatser" är ett begrepp inom strukturell biokemi och molekylärbiologi som refererar till de specifika områdena på en molekyl där den binder till en annan. Dessa bindningsplatser kan finnas på proteiner, DNA, RNA eller andra biomolekyler. De består ofta av aminosyrorsekvenser eller nukleotidsekvenser som har förmågan att känna igen och binda till specifika strukturella egenskaper hos en annan molekyl.
I proteiner kan bindningsplatser vara exponerade på proteinytan eller inbäddade i proteinets tredimensionella struktur. De kan vara specialiserade för att binde till små molekyler, joner, andra proteiner, DNA eller RNA. I DNA och RNA kan bindningsplatser bestå av komplementära baspar som möjliggör specifik bindning mellan två komplementära strängar.
Kännedom om bindningsplatser är viktigt inom forskning och medicinsk applikation, eftersom det kan användas för att utveckla läkemedel som binder till specifika proteiner eller andra molekyler i kroppen. Det kan också hjälpa till att förstå hur genuttryck regleras och hur signaleringsvägar fungerar inom celler.
A two-hybrid system technique is a genetic assay used to identify and study protein-protein interactions (PPIs) within an organism, typically in yeast cells. It is based on the modular nature of transcription factors, which consist of separate DNA-binding and activation domains. The technique involves fusing the two proteins of interest to these domains, creating hybrid proteins. One protein is fused to the DNA-binding domain (BD), while the other is fused to the activation domain (AD). When both fusion proteins interact within the cell, they bring the DNA-binding and activation domains together, leading to the transcription of a reporter gene. The activity of this reporter gene serves as an indicator of the interaction between the two proteins.
There are several variations of the two-hybrid system technique, but the most common one is the "yeast two-hybrid" (Y2H) assay. In addition to Y2H, other variants include bacterial two-hybrid systems and mammalian two-hybrid systems. These techniques have been instrumental in discovering and characterizing numerous PPIs, contributing significantly to our understanding of protein function and cellular processes.
P38 mitogen-activated protein kinaser (p38 MAPK) är ett enzym som tillhör familjen mitogen-aktiverade protein kinaser (MAPK). Det aktiveras i respons på cellulär stress, cytokiner och signalsubstanser utanför cellen. När det aktiveras får det en roll i regulering av celldelning, apoptos (programmerad celldöd), inflammation och immunresponser.
P38 MAPK är involverat i signaltransduktion för att reglera cellulär svar på diverse stressfaktorer som UV-strålning, oxidativ stress, osmotisk chock och infektion. Det aktiveras genom en kaskad av fosforyleringar av uppströms kinaser som MAP2K3/6, vilket leder till att p38 MAPK fosforylerar och aktiverar nedströms substrat såsom transkriptionsfaktorer och andra proteinkinaser.
Dess aktivitet är kopplad till en rad patologiska tillstånd, inklusive cancer, neurodegenerativa sjukdomar och inflammatoriska sjukdomar. Som ett resultat har p38 MAPK blivit en intressant måltavla för utveckling av läkemedel mot dessa sjukdomstillstånd.
P42 MAP-kinas, også kjent som Mitogen-aktiveret protein kinase 1 (MAPK1), er en type serin/treonin-spetsifikk kinase som spiller en viktig rolle i intracellulære signalveier. Denne kinasen er involvert i reguleringen av cellers vekst, differentiering, apoptose og respons på stressorer. P42 MAP-kinas aktiveres ved phosphorylering av en rekke upstream kinaser, som p44 MAP-kinas (MAPK3), og er involvert i en kaskade av signaltransduksjon som resulterer i endelig aktivering av transskripsjonsfaktorer og andre effektorproteiner. Dette bidrar til reguleringen av diverse cellulære funksjoner, inkludert cellecyklus, cytoskeletal dynamikk, metabolisme og inflammatorisk respons.
Neuropeptider är signalmolekyler som består av korta aminosyrekedjor och fungerar som neurotransmittorer eller neuromodulatorer i det centrala nervsystemet (CNS) och det perifera nervsystemet (PNS). De produceras inne i neuron och är involverade i en rad olika fysiologiska processer, såsom smärtperception, aptitreglering, minnesbildning och emotionella respons.
Neuropeptider binder till specifika receptorer på cellmembranet hos målcellerna och utlöser en kaskad av intracellulära signaltransduktionsprocesser som leder till en biologisk respons. Exempel på välkända neuropeptider inkluderar substance P, endorfiner, oxytocin och vasopressin.
I medicinska sammanhang kan förändringar i neuropeptidernas uttryck och funktion vara associerade med olika sjukdomszustånd, såsom smärtsyndrom, neuropsykiatriska störningar och neurologiska skador.
En mutation är ett tillfälligt eller permanet genetiskt förändring i DNA-sekvensen som kan resultera i en förändring i strukturen eller funktionen hos ett protein eller en genprodukt. Mutationer kan uppstå spontant under celldelning, eller orsakas av externa faktorer såsom strålning, kemikalier eller virus. Mutationer kan vara skadliga, neutrala eller till och med fördelaktiga beroende på vilken del av genomet de påverkar och hur de påverkar genens funktion.
I medicinen refererer kinetik specifikt till läkemedelskinetik, som är studiet av de matematiska modellerna som beskriver hur ett läkemedel distribueras, metaboliseras och utsöndras i en levande organism. Det finns fyra huvudsakliga faser av läkemedelskinetik:
1. Absorption (absorption): Hur snabbt och effektivt absorberas läkemedlet från gastrointestinal tract till blodomloppet.
2. Distribution (distribution): Hur snabbt och i vilken utsträckning fördelar sig läkemedlet i olika kroppsvävnader och vätskor.
3. Metabolism (metabolism): Hur snabbt och hur påverkar läkemedlets kemiska struktur i kroppen, ofta genom enzymer i levern.
4. Elimination (elimination): Hur snabbt och effektivt utsöndras läkemedlet från kroppen, vanligtvis via urin eller avföring.
Läkemedelskinetiken kan påverkas av många faktorer, inklusive patientens ålder, kön, genetiska variationer, lever- och njurfunktion samt andra läkemedel som patienten tar.
'Fosforylering' er en biokjemisk prosess hvor et fosfatgruppe (PO4-) blir lagt til ein molekyll, ofte ein protein eller en enzym. Dette skjer når ATP (Adenosintrifosfat) deler seg i ADP (Adenosindifosfat) og frigir ein energirik fosfatgruppe som kan bli lagt til et anna molekyll for å endre dets egenskaper eller aktivere det. Fosforylering er en viktig reguleringsmekanisme innenfor cellegjenforening og signalveiledning i levande organismer.
Molekylär kloning är en biologisk teknik där man skapar exakta kopior av specifika gener eller andra stycken av DNA. Detta görs genom att skapa en rekombinant DNA-molekyl, vilken består av DNA från två olika källor. Denna rekombinanta DNA-molekyl innehåller oftast en önskad gen som är flankerad av kontrollsekvenser, så kallade promotor- och terminatorkärnor, som styr när och hur mycket av genen ska exprimera sig.
Den rekombinanta DNA-molekylen införs sedan i en värdcell, ofta en bakteriecell eller en eukaryot cell, där den kan replikera sig tillsammans med cellens egna gener. På det viset produceras stora mängder av den önskade genen eller DNA-sekvensen.
Molekylär kloning används inom forskning för att studera geners funktion och interaktion, för att producera proteiner i stor skala för medicinska tillämpningar och för att skapa genetiskt modifierade organismer som används inom jordbruk och bioteknik.
Fosfoproteiner är proteiner som innehåller kovalent bundna fosfatgrupper. Den vanligaste typen av fosfatbinding sker på serin, treonin och tyrosinresidyer i proteinmolekylen, men även histidin kan under vissa förhållanden fosforyleras. Fosfatgruppen tillförs proteinet av en specifik enzymklass som kallas kinaser, medan de avlägsnas av en annan grupp enzymer som kallas fosfataser.
Fosforylering av proteiner är en mycket vanlig posttranslatorisk modifiering och spelar en central roll i cellulär signalering och reglering av olika cellulära processer, såsom celldelning, differentiering, apoptos och metabolism. Fosforyleringen kan leda till konformationsförändringar hos proteinet, vilket kan påverka dess funktion, samt skapa nya bindningsställen för andra proteiner som kan ingå i signaltransduktionskedjor. Dessutom kan fosfatgruppen fungera som en negativ laddning och på så sätt påverka proteinets elektrostatiska egenskaper, vilket kan ha konsekvenser för dess interaktion med andra molekyler.
"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.
En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.
Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.
P21-activated kinases (PAKs) är en familj av serin-/treonin-kinaser som spela en viktig roll i cellsignalering och regulering av celldelning, cellmigration och cytoskelettremodelering. De aktiveras av små GTPaser av Rho-familjen, till exempel Cdc42 och Rac1, som binder till deras p21-bindande domäner (PBD). Aktiverade PAKs kan fosforylera och därmed reglera en mängd olika substrat, inklusive proteiner involverade i cytoskelettremodelering, transkriptionsfaktorer och andra signalproteiner. Dysregleringar av PAK-aktivitet har visats vara involverade i patologiska tillstånd som cancer och neurodegenerativa sjukdomar.
I medicinen kan "signalomvandling" definieras som den process där celler eller molekyler omvandlar inkommande signaler till en biologisk respons. Detta sker ofta genom en kaskad av reaktioner, där en initial signal aktiverar en receptor, som sedan aktiverar andra molekyler i en signalkedja. Den slutliga responsen kan vara en genetisk aktivering eller enzymatisk aktivitet, beroende på vilken typ av cell och signal som är inblandad. Signalomvandling är en central mekanism för cellkommunikation och koordinering av cellulära processer som tillväxt, differentiering och apoptos (programmerad celldöd).
Mitogen-activated protein kinase (MAPK) is a type of protein kinase that is involved in the regulation of various cellular processes such as proliferation, differentiation, and apoptosis. MAPKs are activated by a variety of extracellular signals, including growth factors, hormones, and stressors. Once activated, they phosphorylate and activate other proteins, which then go on to regulate specific cellular responses.
MAPKs are organized into a three-tiered kinase module that includes MAPK kinase kinases (MAPKKKs), MAPK kinases (MAPKKs), and MAPKs. Each tier activates the next by phosphorylation, resulting in a signaling cascade that amplifies the signal and allows for specificity in the cellular response.
There are several different subfamilies of MAPKs, including ERK (extracellular signal-regulated kinase), JNK (c-Jun N-terminal kinase), and p38 MAPK, each with distinct functions and substrates. Dysregulation of MAPK signaling has been implicated in a variety of diseases, including cancer, inflammation, and cardiovascular disease.
JNK (c-Jun N-terminal kinase) är en typ av mitogenaktiverad protein kinas (MAPK) som spelar en viktig roll i signaltransduktionen och regleringen av cellers proliferation, differentiering, apoptos och överlevnad. JNK-mitogenaktiverade proteinkinaser är en grupp enzymer som aktiveras av olika stressfaktorer och signalsubstanser, vilket leder till fosforylering av flera transkriptionsfaktorer och andra proteiner. Denna fosforylering påverkar proteinernas funktion och aktivitet, vilket i sin tur kan leda till olika cellulära responsar som exempelvis inflammation, immunresponser och apoptos (programmerad celldöd). JNK-mitogenaktiverade proteinkinaser är involverade i en rad fysiologiska processer såväl som i patofysiologiska tillstånd, inklusive cancer, neurodegenerativa sjukdomar och diabetes.
Rekombinanta proteiner är proteiner som har skapats genom tekniker för genetisk rekombination, där man kombinerar DNA-sekvenser från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskvärda egenskaper. Denna teknik möjliggör produktionen av stora mängder specifika proteiner med konstant och predikterbar struktur och funktion. Rekombinanta proteiner används inom flera områden, till exempel inom medicinen för framställning av läkemedel som insulin, vaccin och enzymer.
Tumörsuppressorproteiner är proteiner som hjälper till att reglera celldelningen och förhindra oregelbunden celldelning eller överdriven cellexpansion, vilket kan leda till cancersjukdomar. Dessa proteiner fungerar genom att hämma cellcykeln, reparera DNA-skador eller initiera programmerad celldöd (apoptos) när celldelningen är skadad eller cancergenetisk information upptäcks. När tumörsuppressorproteinerna är defekta eller fungerar fel kan det leda till oregelbunden celldelning och cancersjukdomar. Exempel på välkända tumörsuppressorgener är TP53, RB1 och BRCA1/2.
Transfektion är en process där DNA, RNA eller andra molekyler överförs till celler i syfte att förändra deras genetiska makeup. Detta kan uppnås genom olika metoder, såsom elektroporering, kemisk transfektion eller viraltransduktion. Transfektion används ofta inom forskning för att studera geneffekter och proteinexpression, men den kan även användas i terapeutiska syften för att behandla genetiska sjukdomar.
Mitogen-activated protein kinase 3 (MAPK3) är ett enzym som tillhör familjen mitogen-aktiverade protein kinaser (MAPK). Detta enzym spelar en viktig roll i cellers signalsystem och är involverat i reguleringen av celldelning, differentiering, apoptos (programmerad celldöd) och cellcykeln. MAPK3 aktiveras som svar på olika signalsubstanser, så kallade mitogener, som binder till receptorer på cellens yta och utlöser en kaskad av reaktioner inne i cellen. Aktiveringen av MAPK3 leder till att specifika proteiner fosforyleras (får en fosfatgrupp tillagd), vilket kan leda till att de ändrar sin funktion och/eller aktivitet.
'Plant structures' refer to the different parts or components that make up a plant, each with specific functions that enable the plant to grow, reproduce, and respond to its environment. Here are some common plant structures and their functions:
1. Roots: The roots absorb water and nutrients from the soil, provide stability to the plant, and store carbohydrates.
2. Stems: The stems support the leaves and transport water, nutrients, and sugars between the roots and leaves. They also contain buds that can grow into new branches or flowers.
3. Leaves: The leaves are the primary site of photosynthesis, where plants convert light energy into chemical energy to fuel their growth. They contain chlorophyll, which gives them their green color, and have a large surface area to absorb sunlight.
4. Flowers: Flowers are the reproductive structures of plants, where male and female gametes (sex cells) are produced. They contain brightly colored petals that attract pollinators, such as bees and butterflies, which help to transfer pollen from one flower to another.
5. Fruits: Fruits are the mature ovary of a flower, containing seeds that can germinate and grow into new plants. They protect the seeds and help to disperse them, often through animal consumption.
6. Seeds: Seeds contain the embryo of a new plant, along with stored nutrients that enable it to germinate and grow. They are often protected by a hard coat that helps to prevent desiccation (drying out) and damage.
These structures work together to enable plants to survive and reproduce in their environment. Understanding the functions of different plant structures can help us to appreciate the complexity and beauty of the natural world, as well as to develop more sustainable and efficient agricultural practices.
"Cell line" er en betegnelse for en population av levende celler som deler seg selvstandig og ubestemt i laboratoriet. Disse cellene har typisk samme karyotype (sammensetningen av deres kromosomer) og genetiske egenskaper, og de kan replikeres over en lang periode av tid. De kan brukes i forskning for å studere cellebiologi, molekylær biologi, farmakologi, virologi og andre områder innen biovitenskapen. Eksempler på velkjente cellinjer inkluderer HeLa-cellinjen (som er tatt fra en livstrukturløs kvinne i 1951) og Vero-cellinjen (som er vanlig å bruke i studier av virusinfeksjoner).
Guanylate cyclase-coupled receptors är en typ av transmembrana receptorproteiner som innehåller en intracellulär guanylylcyclas-domän. När de aktiveras genom att binda specifika ligander orsakar detta en konformationsförändring som leder till att deras guanylylcyclas-domän katalyserar bildandet av cykliskt GMP (cGMP) från GTP. cGMP fungerar sedan som en intracellulär signalmolekyl och aktiverar proteinkinas eller andra effektorproteiner, vilket leder till en biologisk respons i cellen.
Exempel på guanylylcyclase-kopplade receptorer inkluderar atrieller natriuretisk peptidreceptor (NPR-A) och C-typ natriuretisk peptidreceptor (NPR-B), som binder till natriuretiska peptider, samt receptorerna för gasc oxygen (solubilt guanylylcyclas, sGC) och koldioxid (membranbundet guanylylcyclas E, MGCE). Dessa receptorer är involverade i en rad fysiologiska processer som blodtryckreglering, diures och vasodilatation.
I'm happy to help! However, I believe there may be a typo in your question and you are asking for a medical definition of "precipitin test."
A precipitin test is a type of immunological assay used to detect the presence of specific antibodies or antigens in a sample. It works by mixing a patient's serum (or other bodily fluid) with a known antigen or antibody, and then observing whether a visible precipitate forms.
In this test, if the patient's serum contains the specific antibody that recognizes the added antigen, the two will bind together to form an insoluble complex, which is visible as a precipitate. Similarly, if the patient's serum contains the specific antigen that recognizes the added antibody, the two will also bind together to form a precipitate.
Precipitin tests are commonly used in diagnostic medicine to identify various infectious diseases, autoimmune disorders, and allergies. They can help doctors determine the presence or absence of certain antibodies or antigens in a patient's body, which can aid in making an accurate diagnosis and developing an appropriate treatment plan.
Rekombinanta fusionsproteiner är proteiner som skapats genom molekylärbiologiska metoder, där genetisk information från två eller fler olika protein kodande gener kombineras till en enda gen. Den resulterande fusionerade genen ger upphov till ett protein som innehåller delar av de ursprungliga proteinenheterna, vilka är sammanfogade i en enda peptidkedja.
Denna teknik möjliggör skapandet av proteiner med nya och unika funktionella egenskaper som inte finns hos de ursprungliga proteinerna. Rekombinanta fusionsproteiner används inom forskning, diagnostik och terapi, exempelvis vid tillverkning av monoklonala antikroppar för behandling av cancer och autoimmuna sjukdomar.
Zonula Occludens-2 (ZO-2) protein är en typ av tjockt bandprotein som spelar en viktig roll i att hålla tillsammans de celler som bildar ett epitel. Detta proteinet hittas ofta i de "täta fogarna" (zonula occludens) mellan cellerna, där det hjälper till att reglera permeabiliteten och förhindra oönskad diffusion av molekyler genom cellmembranet. ZO-2 protein interagerar med flera andra proteiner i de täta fogarna, inklusive aktinfilament i cellens cytoskelett, för att hålla cellerna tillsammans och upprätthålla epitelbarriärens integritet.
Protein-tyrosinkinaser (PTK) er ein type av kinase, som kan overføre en fosfatgruppe fra ATP til tyrosylresid i ein protein. Dette resulterer i at proteinet endrer sin funksjon eller konfigurasjon. PTKs spiller en viktig rolle i intrasellular signalveger, og feilregulering av PTK-aktivitet kan føre til ulike sykdomar, inkludert kreft.
I medisinsk sammenheng kan PTK-inhibitorer være verksomme i behandlinga av kreft, fordi de kan redusere aktiviteten hos onkogena PTK-enheimer som driver kreftvoksten.
Kreatinkinas (CK) är ett enzym som finns naturligt i kroppen och spelar en viktig roll vid energiproduktionen inom celler, särskilt i muskel- och hjärtceller. Det förekommer också i lever, hjärna och andra vävnader i mindre utsträckning.
CK delas upp i tre huvudtyper beroende på var de främst finns:
1. CK-MM (muskeltyp): Denna typ är vanligast och återfinns i skelettmuskulatur, hjärta och andra muskler.
2. CK-MB (hjärtmuskeltyp): Denna typ återfinns främst i hjärtmusklerna. Nivåerna av CK-MB kan öka vid skador på hjärtat, till exempel vid en hjärtattack.
3. CK-BB (hjärn- och nervtyp): Denna typ återfinns främst i hjärnan och nerver. Nivåerna av CK-BB kan öka vid skador på hjärnan, till exempel vid stroke eller en allvarlig skalltrauma.
En ökning av totalt CK eller specifika typer av CK kan vara ett tecken på olika medicinska tillstånd och sjukdomar, inklusive muskelskador, hjärtsjukdomar och neurologiska störningar.
Nitrogen oxide (NO) är en samlingsbeteckning för en grupp gasformiga ämnen som innehåller kväve och syre. Det kan bildas naturligt i atmosfären genom åska och vulkanutbrott, men den största källan till nitrogen oxid är mänsklig aktivitet, särskilt förbränning av fossila bränslen som bensin och dieselolja. Nitrogen oxid kan också bildas i vissa industriella processer.
Nitrogen oxid är en luftförorening som kan ha negativa effekter på människors hälsa, särskilt andningsorganen. Det kan också bidra till att forma smog och acidregn. Långvarig exponering för höga nivåer av nitrogen oxid kan orsaka andningsbesvär, hosta, irritation i ögon, näsa och hals samt ökad risk för lunginfektioner. Barn, äldre och personer med redan existerande andningsproblem är särskilt känsliga för effekterna av nitrogen oxid.
CDC2-proteinkinase, även känt som CDK1 (Cyclin-dependent kinase 1), är ett enzym som spelar en central roll i regleringen av cellcykeln hos eukaryota celler. Det aktiveras av cyklin B och tillsammans bildar de komplexet M-CDK, vilket är nödvändigt för inträdet i mitosen (cellens delningsfas).
M-CDK reglerar flera processer under mitosen, såsom kromosombundning, spindelapparatusbildning och cytokines, genom fosforylering av olika substrat. Aktiviteten hos M-CDK är strikt kontrollerad både vid aktivering och inaktivering, vilket säkerställer en korrekt celldelning.
Felet i regleringen av CDC2-proteinkinas kan leda till abnorma cellcykler och cancerutveckling.
Cyclin-dependent kinases (CDKs) are a family of serine/threonine protein kinases that play crucial roles in regulating the cell cycle, transcription, and other cellular processes. The activity of CDKs is dependent on their association with cyclin proteins, which act as regulatory subunits.
The cell cycle is a tightly regulated process that involves several stages, including G1 phase, S phase (DNA replication), G2 phase, and M phase (mitosis). CDKs are key regulators of the transitions between these phases. For example, CDK4 and CDK6 form complexes with D-type cyclins during G1 phase and help to promote progression into S phase by phosphorylating and inactivating the retinoblastoma protein (pRb). This allows the transcription factor E2F to be released and activate genes required for DNA replication.
CDKs are also involved in other cellular processes, such as transcription, where they can regulate the activity of transcription factors by phosphorylating them. CDK7, for example, is a component of the general transcription factor IIH (TFIIH) complex and plays a role in initiating transcription by phosphorylating the carboxy-terminal domain of RNA polymerase II.
CDKs are tightly regulated through various mechanisms, including activation by cyclin binding, inhibition by CDK inhibitors, and regulation by phosphorylation. Dysregulation of CDK activity has been implicated in several diseases, including cancer, where aberrant CDK activity can lead to uncontrolled cell cycle progression and tumor growth. As a result, CDKs have become important targets for the development of anti-cancer therapies.
MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE (MAPK) PATHWAYS er en serie relaterede enzymer i cellen som er involvert i overføringen av signaler fra receptorer på cellemembranen til DNA i kjernen. Disse stiene er involvert i reguleringen av en rekke cellulære prosesser, inkludert cellecyklus, apoptose (programmert celledød), inflammasjon og differentiering.
MAPK-stiene består av tre hovedkomponenter: MAP kinase kinase kinase (MAP3K), MAP kinase kinase (MAP2K) og MAP kinase (MAPK). Signalet overføres fra receptorer til MAP3K, som aktiverer MAP2K, som deretter aktiverer MAPK. Aktiverte MAPK kan så føre til endelige responser ved å fosforylere andre proteiner i cellen.
Det finnes flere forskjellige typer av MAPK-stier, inkludert ERK (ekstracellulær signalregulerte kinase), JNK (c-Jun N-terminal kinase) og p38 MAPK. Disse stiene kan aktiveres av ulike stimuli, som f.eks. vækstfaktorer, cytokiner, stressorer og infeksjoner.
Enzymaktivering refererar till processen där ett enzym aktiveras för att kunna börja katalysera en biokemisk reaktion. Detta kan ske på olika sätt, beroende på typen av enzym. I allmänhet kan enzymaktivering involvera att en molekyl, kallad en aktivator, binds till enzymet och orsakar en konformationsändring som gör att enzyms aktiva plats blir tillgänglig för substratet. I andra fall kan enzymaktivering ske genom att en inhibitor tas bort från enzyms aktiva plats, eller genom att enzymet modifieras genom en kemisk reaktion.
Exempel på mekanismer för enzymaktivering inkluderar allosterisk regulering, där bindningen av en molekyl till en allostersk plats på enzymet orsakar en konformationsändring som påverkar aktiva platsen, och covalent modifiering, där en grupp kovalent binder till enzyms aktiva plats och förändrar dess egenskaper.
I medicinsk kontext kan enzymaktivering ha betydelse när det gäller att behandla sjukdomar genom att påverka enzymaktiviteten i kroppen. Exempelvis kan enzymaktiverande läkemedel användas för att behandla vissa typer av cancer, där aktivering av specifika enzymer hjälper till att bromsa celltillväxten eller inducerar apoptos (programmerad celldöd).
"Cyclic GMP (guanosine monophosphate)-dependent protein kinases" are a type of enzyme that play a crucial role in various cellular signaling pathways. These enzymes are also known as "protein kinase G" or PKG for short. They add phosphate groups to specific target proteins, which can alter the activity or function of those proteins.
The "cyclic GMP-dependent" part of the name refers to the fact that these enzymes are activated by binding to cyclic GMP, a molecule that acts as a second messenger in cells. Cyclic GMP is produced by another enzyme called guanylyl cyclase, which is often activated in response to hormones or other signaling molecules.
Once cyclic GMP binds to and activates PKG, the kinase can then phosphorylate its target proteins, leading to a variety of cellular responses. For example, PKG has been shown to play a role in regulating smooth muscle contraction, cardiovascular function, and neurotransmission, among other processes.
There are several different isoforms of PKG that have been identified, each with slightly different properties and functions. However, they all share the common feature of being activated by cyclic GMP.
'COS-celler' är en typ av genetiskt modifierade celler som används inom molekylärbiologi och biomedicinsk forskning. COS-celler är en speciell linje av simia (apa) fibroblaster som har transformerats med ett virus, bestående av adenoviruskapselförpackat DNA från svin-svampsvulstvirus (SV40).
Denna modifiering gör att COS-cellerna uttrycker T-antigen, ett protein som binder till och aktiverar origo på plasmid-DNA, vilket underlättar effektivare och säkrare kloning av exogena DNA. Detta gör COS-celler till en populär val för att producera stora mängder fritt protein in vitro från klonade gener.
Det finns två huvudtyper av COS-celler: COS-1 och COS-7. COS-1 är diploid, medan COS-7 är en subklon av COS-1 som har ökad stabilitet och effektivitet vid proteinproduktion.
Oxadiazoler är en typ av heterocykliska organiska föreningar som innehåller en fem-ledd ring med två kolatomer, en syreatom och två kväveatomer, varav två är direkt bundna till varandra. Det finns tre olika isomerer av oxadiazoler beroende på vilka kolatomerna befinner sig i relation till syreatomen: 1,2-oxadiazol, 1,3-oxadiazol och 1,4-oxadiazol. Dessa föreningar har visat sig ha potential inom områden som läkemedelsutveckling och materialvetenskap på grund av deras elektroniska egenskaper och stabilitet.
Kaseinkinaser er en type enzym som bryter ned kasein, et protein som forekommer naturlig i mælk. Der findes forskellige typer kaseinkinaser, men de fleste arter af mennesker har to primære typer, kaseinkinaser 1 og 2. Disse enzymer spiller en vigtig rolle i fordøjelsen af mælk og andre mælkeproteiner.
Mutationer i generne, der koder for kaseinkinaser, kan føre til forstyrrelser i kaseinfordøjelsen og forskellige sygdomstilstande, herunder kaseinfødeallergi og primært skummeltarm. Disse tilstande kan medføre symptomer som opkast, diaré, bughindepine og vægt tab.
'Sequencing' är ett begrepp inom genetiken som refererar till metoder för bestämandet av raka rader (sekvenser) av nukleotider, de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA. 'Sequencing' används ofta för att undersöka gener och andra delar av DNA för att få information om deras struktur, funktion och evolutionära utveckling.
'Sekvensinpassning' (engelska: sequence alignment) är en metod inom bioinformatiken som används för att jämföra två eller flera DNA- eller proteinsekvenser för att hitta likheter och skillnader mellan dem. Genom att jämföra sekvenser kan forskare identifiera konserverade regioner, mutationer, evolutionära relationer och möjliga funktionella roller.
Sekvensinpassning kan användas för att undersöka olika aspekter av DNA- eller proteinsekvenser, till exempel struktur, funktion, evolutionärt ursprung och släktskap. Det är en viktig metod inom komparativ genetik, molekylär evolution och strukturell biologi.
I sekvensinpassning jämförs två eller flera sekvenser med varandra genom att lägga till luckor (gaps) i sekvenserna för att matcha upp dem så bra som möjligt. Det finns två huvudtyper av sekvensinpassning: global och lokal. Global inpassning jämför hela sekvenserna med varandra, medan lokal inpassning endast jämför delar av sekvenserna där likheter finns.
Sekvensinpassning kan användas för att hitta homologa sekvenser (sekvenser som har gemensam evolutionärt ursprung), identifiera mutationer och andra variationer, och studera evolutionära relationer mellan olika arter eller populationer. Det kan även användas för att förutsäga struktur och funktion hos okända sekvenser genom att jämföra dem med kända sekvenser med liknande egenskaper.
"Complementary DNA" (cDNA) är en syntetisk enkelsträngad DNA-molekyl som skapas genom att transkribera en messenger RNA (mRNA)-molekyl med hjälp av en revers transkriptas. cDNA används ofta i molekylärbiologiska experiment, till exempel för att klona specifika gener eller studera genuttryck.
Den komplementära naturen av cDNA och den ursprungliga mRNA-molekylen gör det möjligt att använda cDNA som en representation av den ursprungliga genen, eftersom basparningen mellan DNA och RNA följer komplementära regler (A parar sig med T respektive G parar sig med C). Detta gör cDNA till ett värdefullt verktyg inom molekylärbiologi, eftersom det ofta är lättare att arbeta med DNA än RNA.
"Cell culturing" or "cell cultivation" is the process of growing and maintaining cells in a controlled environment outside of a living organism. This is typically done in a laboratory setting using specialized equipment and media to provide nutrients and other factors necessary for cell growth and survival. The cells can be derived from a variety of sources, including human or animal tissues, and can be used for a range of research and therapeutic purposes, such as studying cell behavior, developing new drugs, and generating cells or tissues for transplantation.
eIF-2-kinase er en type kinase, enzym som fosforylerer (leger på med en fosfatgruppe) andre proteiner. Specifikt refererer "eIF-2-kinase" til en gruppe enzymer som fosforylerer et specifikt protein kalt eukaryot initiation factor 2 (eIF-2).
eIF-2 spiller en viktig rolle i prosessen med å starte proteinsyntese, eller translasjon, i eukaryote celler. Når eIF-2 er fosforylert av eIF-2-kinase, blir dette en inhibitor for prosessen med å starte translasjon. Dette betyr at eIF-2-kinase kan regulere proteinsyntesen i cellen ved å kontrollere hvor aktivt eIF-2 er.
Det finnes fire forskjellige typer av eIF-2-kinaser, og de blir aktivert under forskjellige stresssituasjoner som f.eks. hypoxi (lavt syretilstand), ER-stress (endoplasmic reticulum stress) og infeksjoner med visse typer av virus. Dette betyr at eIF-2-kinaser spiller en viktig rolle i cellens svar på forskjellige stressfaktorer og kan hjelpe til å beskytte cellen ved å redusere proteinsyntesen under disse situasjonene.
Casein kinase II (CK2) är ett serin- och threonin-specifikt protein kinas som fosforylerar flera olika substrat i cellen. Det är involverat i en rad cellde funktioner, inklusive celldelning, signaltransduktion, apoptos och DNA-reparation. CK2 finns i alla eukaryota celler och består av två katalaytiska underenheter (α och α') och två regulatoriska underenheter (β). Dess aktivitet är konstitutivt aktiverad och regleras delvis genom interaktion med andra proteiner.
Molekylära modeller är matematiska och grafiska representationer av molekyler och deras interaktioner på en molekylär nivå. Dessa modeller används inom flera områden inom naturvetenskapen, till exempel inom biologi, kemi och fysik, för att förutsäga hur olika molekyler beter sig och interagerar med varandra.
En molekylär modell kan bestå av en tredimensionell struktur av en molekyl, som visar var varje atom finns placerad och hur de är bundna till varandra. Den kan också inkludera information om elektronmolntopologi, laddning och andra fysikaliska egenskaper hos molekylen.
Molekylära modeller kan användas för att simulera kemiska reaktioner, studera proteiners struktur och funktion, utveckla läkemedel och förstå komplexa biologiska system på en molekylär nivå. Genom att visualisera och analysera molekylära modeller kan forskare få en bättre förståelse för de grundläggande principerna som styr molekyler och deras interaktioner, vilket kan leda till nya insikter och innovationer inom många olika områden.
"Drosophila proteins" refer to the proteins that are expressed by the genes found in the genome of Drosophila melanogaster, also known as the fruit fly. Drosophila is a widely used model organism in various fields of biological research, including genetics, developmental biology, and neurobiology. The study of Drosophila proteins has contributed significantly to our understanding of fundamental biological processes, such as gene regulation, cell signaling, and protein function.
Drosophila proteins are encoded by genes that are transcribed into messenger RNA (mRNA) molecules, which are then translated into proteins through a process called translation. The Drosophila genome contains approximately 15,000 genes, many of which encode for proteins with diverse functions. These proteins range in size from small peptides to large complex structures and play critical roles in various cellular processes, such as enzyme catalysis, DNA replication and repair, signal transduction, and cytoskeleton organization.
The study of Drosophila proteins has led to the discovery of many important biological concepts, including the mechanisms of gene regulation, the role of microRNAs in post-transcriptional gene silencing, and the function of protein domains in mediating protein-protein interactions. Additionally, Drosophila proteins have been used as models to study human diseases, such as cancer, neurodegenerative disorders, and developmental abnormalities. The insights gained from studying Drosophila proteins have provided valuable information for understanding the molecular basis of these diseases and developing new therapeutic strategies.
"Bärarproteiner", eller "transportproteiner", är proteiner som binder till och transporterar specifika molekyler, såsom hormoner, vitaminer, lipider och joner, genom cellmembranet eller inom cellen. De hjälper till att reglera cellytans homeostas och kommunikation mellan olika celler. Exempel på bärarproteiner inkluderar hemoglobin, som transporterar syre i blodet, och LDL-cholesterol, som transporterar kolesterol i blodet.
Metylenblått, också känt som metylthionin chlorid, är ett syntetiskt azofärgämne med blå färg. Det används inom medicinen som ett diagnostikum för att undersöka leverfunktion och sällsynt som läkemedel för behandling av metemoglobinemi, en självrådande störning i ämnesomsättningen där den syreburna hemoglobinen i blodet omvandlas till metemoglobin, vilket gör att den inte kan transportera syre effektivt. Metylenblått fungerar genom att konvertera metemoglobin tillbaka till hemoglobin och återställa syretransporten. Det bör dock användas med försiktighet eftersom det kan ha biverkningar som illamående, kräkningar, huvudvärk och andningssvårigheter.
En synaps är en struktur i nervsystemet där nervceller (neuron) kan kommunicera med varandra och utbyta elektriska eller kemiska signaler. En synaps består vanligtvis av en presynaptisk neuron, en synaptisk spalt och en postsynaptisk neuron.
En definition av 'synapser' är:
"Den strukturella och funktionella kontakten mellan två nervceller eller mellan en nervcell och ett effektororgan, där neurotransmittor molekyler frisätts från den presynaptiska neuronen och diffunderar över synaptisk spalt för att binda till receptorer på den postsynaptiska neuronen eller effektororganet, vilket leder till en elektrisk eller kemisk signal som påverkar cellens funktion."
"Cell membrane," også kjent som plasma membran, er en flexible, semipermeable barriere som omgir alle levende celler. Det består hovedsakelig av lipider og proteiner og har til oppgave å kontrollere pasasjen av molekyler, ions og andre stoffer inn i og ut av cellen. Lipidbilagen i cellmembranen er organiert som en dobbeltlayet med hydrofobe halvballer mot hverandre og hydrofille halvballer vendt ut og inne i cellen. Proteinmolekyler inneholdt i membranen kan fungere som transportproteiner, reseptorer, enzymers eller mekaniske koblinger til cytoskelettet. Cellmembranen er viktig for å opretholde cellens homeostasisme og integritet.
Pyruvatkinas är ett enzym som katalyserar en glykolytisk reaktion där fosfatgruppen från fosfoenolpyruvat (PEP) överförs till adenosindifosfat (ADP), vilket resulterar i bildandet av pyruvat och adenosintrifosfat (ATP). Denna reaktion är en viktig del av cellens energiproduktion, särskilt under anaeroba förhållanden. Pyruvatkinas finns i två isoformer, L-pyruvatkinas och M2-pyruvatkinas, som uttrycks i olika vävnader och under olika fysiologiska tillstånd. Dess aktivitet kan reguleras av flera faktorer, inklusive glukos, fruktose-1,6-bisfosfat, alanin och fosfatas.
Ribosomprotein-S6-kinas är ett enzym som aktiverar proteintranslationsprocessen inom celler. Det fosforylerar, det vill säga tillfogar en fosfatgrupp till, ribosomproteinet S6 i den lilla 40S-subenheten av ribosomen. Denna fosforylering leder till att ribosomen ökar sin kapacitet att syntetisera proteiner, vilket kan leda till ökad cellymnghälsa och celltillväxt. Ribosomprotein-S6-kinas aktiveras av olika signalsubstanser som exempelvis insulin och tillväxthormon, och dess aktivitet är kopplad till celldifferentiering, celldelning och celldöd.
"Western blotting" är en laboratorieteknik som används för att detektera och identifiera specifika proteiner i en biologisk prov. Denna metod kombinerar elektrofores, immunoblotting och immunokemi.
I korthet innebär tekniken följande steg:
1. Elektrofores: Proteiner i ett extrakt av en cell eller vävnad separeras beroende på deras molekylära vikt genom elektrisk potentialskillnad i en gel.
2. Transfer: De separerade proteinkomplexen överförs sedan från gelen till en membran (vanligtvis nitrocellulosa eller PVDF) där de fastnar i ett ordnat mönster.
3. Blockering: Membranet blockeras med ett protein som inte binder till den primära antikroppen, för att undvika nonspecifika bindningar.
4. Immunoblotting: Membranet exponeras för en specifik primär antikropp som binder till det sökta proteinets epitop.
5. Avläsning: Andra sekundära antikroppar, konjugerade med ett enzym eller fluorescenta markörer, införs för att binda till primärantikroppen och avslöja positionen och mängden av det sökta proteinet.
Denna teknik används ofta inom forskning och klinisk diagnostik för att upptäcka specifika proteiner som är associerade med sjukdomar, funktionella störningar eller förändringar i cellulär aktivitet.
Tight junctions, også kjent som zonula occludens, er en type av kontaktoppløsninger mellom epitellsier og endotellsier i levende væv. De fungerer som barriere som forhindrer passasje av molekyler mellom de sammenkoblede cellene. Tight junctions er komplekse strukturer bestående av transmembrane proteiner, slik som occludin og claudins, som interagerer med hverandre og med cytoplasmatiske proteiner for å stabilisere kontaktoppløsningen. Disse strukturene er viktige for reguleringen av permeabiliteten i epitellsiale barrierer, inkludert tarmsystemet, lungene og hjernen.
Protein undersyrer, også kjent som proteindefisiens, refererer til et tilstand hvor individet ikke får nok proteiner for å oppfylle sine kroppsbehov. Protein er en viktig byggestoff for kroppen og er involvert i mange funksjoner som muskelforming, immunforsvar, hormonproduksjon og andre essensielle biokjemiske prosesser.
En proteinundersyre kan føre til en rekke negative helsekonsekvenser, herunder vansakhet, svakt muskeltonus, økt risiko for infeksjoner, langsom vekst hos barn og unge, og i alvorlige tilfeller kan det føre til komplikasjoner som lever- og hjertesvikt. Proteinundersyre kan være akutt eller kronisk og kan skyldes en rekke forskjellige faktorer, inkludert mangel på proteinrik mat, økt behov for proteiner pga sykdom eller skade, eller forstyrrelser i absorpsjonen eller bruken av proteiner i kroppen.
MITOHOCHONDRIEELL MAP-KINAS 1 (Mitochondrial MAPK1) er enzym som er aktivert ved fosforylasjon av tyrosin og serin residiver i proteinet. MAPK1, også kjent som extracellulær signal-regulerte kinase 2 (ERK2), er en del av MAP kinase signalveien og er involvert i reguleringen av cellers vekst, differentiering, apoptose og respons på stress. I mitokondriene, kan MAPK1 være involvert i reguleringen av cellegrensesenergiomsatting og -homøostasisme.
Receptorprotein-tyrosinkinaser (RTK) är en typ av receptorer som finns i cellmembranet hos djurceller. De aktiveras när specifika ligander binder till deras extracellulära domän, vilket leder till att tyrosinkinasdomänen i receptorn blir aktiv och fosforylerar (lägger till en fosfatgrupp på) specifika tyrosiner i proteiner inne i cellen. Detta skapar signaltransduktionskaskader som reglerar viktiga cellulära processer såsom celldelning, cellcykel, differentiering och apoptos (programmerad celldöd).
RTK:er är involverade i många olika sjukdomar, inklusive cancer. Mutationer i RTK-gener kan leda till onkogen aktivering av RTK:erna och överaktivitet av deras signaltransduktionsvägar, vilket kan bidra till cancerexpansion och progression. Därför är RTK:er ett viktigt mål för cancerterapi, där man försöker blockera deras aktivitet med specifika läkemedel som kallas tyrosinkinashämmare.
Tymidinkinase (TPK eller TK) er ein enzym som spiller en viktig rolle i cellens vekst og deling. Det konverterer nukleotiden tymidinmonofosfat (dTMP) til deoxynukleotiden tymidindifosfat (dTDP), som er ein building block i DNA-molekylet. Tymidinkinas er derfor viktig for produksjonen av ny DNA under cellcyklen.
Det finnes to typer tymidinkinaser, typisk betegnet som tymidinkinase 1 (TK1) og tymidinkinase 2 (TK2). TK1 er hovedsakelig aktiv i S-fasen av cellcyklen og er derfor sterkt forbunden med cellevis reparasjon og vekst. TK2 er tilgjengelig i alle stadier av cellcykelen og er viktig for normal cellefunksjon i alle typer celler, men spesielt i muskel- og nervesystemet.
Aktiviteten til tymidinkinas kan måles i blodprøver og er ein indikator på cellevis aktivitet. Forhøyd aktivitet av TK1 kan være forbundet med forskjellige typer av krankheter, som kreft, infeksjoner og autoimmune sykdommer.
NMDA-receptorer, eller N-methyl-D-aspartat-receptorer, är en typ av jonkanaler som finns i hjärnan och ryggmärgen. De är glutamatreceptorer, vilket betyder att de aktiveras av den signalsubstans (glutamat) som används för excitering av nervceller. NMDA-receptorerna har en särskild roll i långtidspotentiering, ett fenomen där synapser stärks och blir mer effektiva efter frekvent stimuli. Dessa receptorer är också involverade i lära- och minnesprocesser samt i flera patologiska tillstånd som skada hjärnan, såsom stroke, neurodegenerativa sjukdomar och smärta.
'Extracellular signal-regulated mitogen-activated protein kinases' (Extracellulära signalsyringsreglerade Mitogen-aktiverade proteinkinaser) är en grupp enzymer som spelar en viktig roll i cellens signaltransduktionsvägar. Dessa enzymer är involverade i överföringen och amplifieringen av signalsubstanser från cellens yta till dess kärna, där de påverkar genuttryck och cellytors funktioner.
MAP-kinaserna aktiveras av olika extracellulära signalsubstanser som exempelvis tillväxtfaktorer, cytokiner och stressorer. När en signalsubstans binder till sin receptor på cellens yta initieras en kaskad av fosforyleringsreaktioner där MAP-kinaserna aktiveras genom att få tillförts fosfatgrupper. Aktiverade MAP-kinaser kan sedan fosforylera och på så sätt aktivera andra proteiner, vilket leder till en kedja av reaktioner som slutligen resulterar i den önskade cellresponsen.
MAP-kinaserna delas vanligtvis in i tre undergrupper: extracellulära signalreglerade kinaser (ERK), c-Jun N-terminala kinaser (JNK) och p38 mitogen-aktiverade protein kinaser (p38 MAPK). Varje undergrupp är involverad i olika cellulära processer, såsom celldelning, differentiering, apoptos och inflammation.
MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 4 (MAP2K4) er en del av signaltransduksjonsveien som regulerer cellers vokst, differentiering, apoptose og inflammasjon. MAP2K4 er en serin/treonin-proteinkinase som aktiveres ved stimulering av diverse reseptorer, inkludert reseptorer for faktorer som styrer cellers vekst og differentiering. Aktiviert MAP2K4 fosforylerer og aktiverer i sin tur MAP-kinasen ERK (extracellular signal-regulated kinase), som er involvert i regulering av en rekke cellegrene funksjoner.
MAP2K4 spiller også en viktig rolle i regulering av immunsystemet og inflammasjonen ved å aktivere transskripsjonsfaktorer som kontrollerer ekspressjonen av gener involvert i immunrespons og inflammatoriske prosesser. Dysregulering av MAP2K4-aktiviteten har vært forbundet med ulike sykdommer, inkludert kraftig endret cellvokst og kreft.
Glutathion-S-transfereaser (GST) er en type enzym, som hjælper med at afbrydegiftene i kroppen. De gør dette ved at forbinde giftstofferne med et tripeptid kaldet glutation, der er dannet af aminosyrerne cystein, glutaminsyre og glycin. Dette dannes en mindre toksisk forbindelse, som kan fjernes fra kroppen mere let. GSTs findes i mange forskellige arter, herunder mennesker, og de er især koncentreret i leveren, lungerne og nyrerne. Der findes flere forskellige typer af GSTs, hver med en specifik rolle i at neutralisere bestemte slags gifte.
Isoenzym (eller isoform) är ett samlingsnamn för olika enzymer som har samma funktion men kan skilja sig något i deras aminosyresekvens och/eller kinetiska egenskaper. De uppstår genom genetisk variation, där varje isoenzym kodas av en separat gen. Isoenzymen kan ha olika reguleringsmekanismer, subcelulär lokaliseringsgrad och stabilitet, vilket gör att de kan anpassa sig till specifika cellulära behov och miljöer. Detta är en naturlig strategi hos levande organismer för att öka deras flexibilitet och adaptabilitet. I klinisk kontext kan isoenzymnivåer i blodet användas som markörer för olika sjukdomstillstånd, eftersom specifika isoenzymbrister kan vara associerade med vissa patologiska tillstånd.
Aminosyramönster, eller aminoacyl-tRNA-mönstret, refererar till den specifika kombinationen av aminosyror och transfer-RNA (tRNA) som finns i en ribosom under processen att bygga upp ett protein enligt informationen i ett messenger-RNA (mRNA). Varje tRNA har en specifik anticodon-sekvens som matchar en komplementär kodon-sekvens på mRNA, och bär därmed en specifik aminosyra. När ribosomen läser av mRNA:t och bygger upp proteinet, binds aminosyran till den växande peptidkedjan genom en reaktion katalyserad av peptidyltransferas-enzymet i ribosomen. På så sätt skapas ett specifikt aminosyramönster som korrelerar med genetisk informationen i mRNA:t.
1-Fosfatidylinositol-4-kinas (PI4K) är ett enzym som katalyserar fosforylering av position 4 på fosfatidylinositol (PI), vilket resulterar i bildandet av fosfatidylinositol 4-fosfat (PI4P). PI4P är en viktig membranföbundet signalsubstrat som deltar i regleringen av olika cellulära processer, inklusive trafficking av vesiklar, cellsignalering och celldelning. Det finns flera isoformer av PI4K hos djur, varav två är cytoplasmatiska (PI4KIIα och PI4KIIβ) och två är membranbundna (PI4KIIIα och PI4KIIIβ). Dysfunktion i PI4K-relaterade signaltransduktionsvägar har visats korrelera med flera sjukdomstillstånd, inklusive cancer, neurodegenerativa sjukdomar och mikrobiella infektioner.
Mitogen-activated protein kinases (MAPK) är en familj av serin/treonin-proteinkinaser som spela en viktig roll i signaltransduktionen av cellyta och celldelning. De aktiveras av mitogener, till exempel tillväxtfaktorer och cytokiner, och är involverade i en rad cellulära processer som differentiering, apoptos och stressrespons. MAPK-systemet består av tre huvudkomponenter: MAP kinase kinase kinase (MAP3K), MAP kinase kinase (MAP2K) och MAPK. Varje komponent aktiverar den nästa i kedjan genom fosforylering, vilket resulterar i aktivering av MAPK. Aktiverade MAPK kan fosphorylera och på så sätt reglera olika transkriptionsfaktorer och andra proteiner som är involverade i cellcykeln och cellytans respons på stimuli.
CDC2 och CDC28 är två namn på samma encym, en serin-treonin kinase som spelar en viktig roll i cellcykeln hos eukaryota celler. Denna kinase reglerar ingången till mitosen, den fas av cellcykeln då cellen delar sig. CDC2/CDC28 aktiveras genom att binda till cykliska komplex av regulatoriska subenheter, och tillsammans med dessa komplex bildar de en aktiverad kinasheter. Dessa komplex kallas också M-CDK (mitotiska cyklin-dependent kinaser).
I medicinska sammanhang refererar begreppet "CDC2-CDC28-kinaser" ofta till denna grupp av kinaser och deras roll i cellcykelregleringen. Avvikelser i CDC2/CDC28-aktiviteten har visats vara associerade med olika sjukdomstillstånd, inklusive cancer, då onormal cellcykelreglering kan leda till oregelbunden celldelning och tumörbildning.
'Nervceller', eller neuroner, är de specialiserade cellerna i nervsystemet som skickar och tar emot signaler, så kallade impulser, från varandra via sina utskott, axon och dendriter. Dessa signaler kan vara kemiska eller elektriska och används för att kommunicera information inom och mellan olika delar av nervsystemet. Nervcellerna är mycket viktiga för alla aspekter av kroppens funktion, inklusive sinnesintryck, rörelse, minne och känslor. De är också specialiserade till att överleva länge och har en hög grad av återbildning efter skada jämfört med andra celltyper i kroppen.
Proteintransport refererer til den proces, hvor proteiner transporteres fra sted til sted i eller mellem celler. Proteinerne kan transporteres gennem membraner via specielle transportkanaler eller ved hjælp af transportproteiner, også kaldet kvasi-transportproteiner eller receptorer. Disse proteiner har evnen til at genkende og binde sig til bestemte typer proteiner og transportere dem gennem membranen.
Proteintransport er en nødvendig proces for cellernes overlevelse, da proteinerne skal være placeret korrekt i cellen for at udføre deres funktioner korrekt. Der findes to hovedtyper af proteintransport: intracellulær transport (indinside cellen) og extracellulær transport (udenfor cellen).
Intracellulært transporteres proteinerne fra det sted, hvor de syntetiseres i cytoplasmaet til deres endelige destination, som kan være i organeller eller membraner. Extracellulært transport involverer frigivelse af proteiner ud af cellen og transportering af dem gennem extracellulært miljø til deres destination, f.eks. andre celler eller organer.
Proteintransport kan reguleres af mange forskellige faktorer, herunder pH, temperatur, membrankomposition og andre proteiner. Dysfunktion i proteintransport kan resultere i en række sygdomme, herunder neurologiske forstyrrelser, immunologiske lidelser og kancer.
I-kappa B (IkB) kinase er ein omfattende betegnelse for en familie av kinaser (en typ av enzym) som spiller en viktig rolle i reguleringen av immunsystemet. IkB-kinasene aktiverer en prosess kalt signaltransdusering, der deimennesagefaktorene (NF-kB) frigjores fra IkB-proteinet sine og overføres til cellekjernen for å påvirke uttrykkingsnivået av bestemte gener. Dette resulterer i en reaksjon som inkluderer inflammasjon, immunforsvar og cellesignalering. IkB-kinasene kan bli aktivert av ulike stimuli, for eksempel bakterielle og virale infeksjoner, stresstilstande og toksiner. Aktiviteten til IkB-kinasene må holdes under kontroll for å unngå uønsket aktivering av NF-kB og eventuelle skadelige virkninger på cellehelse og -funksjon.
Sprague-Dawley råtta är en specifik strain av laboratorieråtta som vanligtvis används inom forskning. Denna strain utvecklades under 1920-talet av två forskare, Sprague och Dawley, i USA.
Sprague-Dawley råttor är kända för sin jämna genetiska bakgrund, god hälsa och lätta hantering, vilket gör dem till en populär val för forskning inom områden som farmakologi, toxicologi, beteendevetenskap och cancerforskning. De är också vanliga som subjekt i prekliniska studier av nya läkemedel och andra terapeutiska behandlingar.
Dessa råttor har en genomsnittlig livslängd på två till tre år och väger ungefär 250-500 gram som vuxna. De är också kända för sin fertilitet och stor förmåga att producera avkomma, vilket gör dem lättillgängliga och relativt billiga att använda i forskningssyfte.
Kväveoxiddonatorer är en typ av enzym som främjar eller katalyserar bildandet av kväveoxid (NO) och relaterade molekyler. Dessa enzymer spelar en viktig roll i regleringen av vissa fysiologiska processer, såsom blodflöde, signaltransduktion och neurotransmission. Exempel på kväveoxiddonatorer inkluderar nitrogenmonoxids syntas (NOS) och xantinoxidas.
Glycogen synthase kinase 3 (GSK3) er ein enzym som fungerer som kinase, det betyr at det kan fosforylere andre proteiner for å regulere deres aktivitet. GSK3 spiller en viktig rolle i mange cellulære prosesser, blant annet signalering og metabolisme.
Glykogensyntaskinas 3 (GSK3) er en av de to homologene isoformene av GSK3-enzymet, og det andre er GSK3β. Både GSK3α og GSK3β deler om lag 90% identisk aminosyresekvens, men de har ulik regulering og subcellulære lokasjoner.
GSK3α er involvert i reguleringen av glykogenstoffskifte, en metabolisk prosess der glukosen lagres som glykogen i leveren og musklene. GSK3α fosforylerer og inaktiverer glykogensyntasen, et enzym som katalyserer den siste steget i glykogenstoffskiftet. Når GSK3α er inaktivert ved fosforylasjon av andre kinaser, aktiveres glykogensyntasen og glykogen lagring øker.
I tillegg til sin rolle i glykogenstoffskiftet, er GSK3α involvert i reguleringen av en rekke andre cellulære prosesser, blant annet cellecyklus, apoptose og inflammasjon.
Aurora kinases are a family of serine/threonine protein kinases that play important roles in regulating various cellular processes during mitosis, the process by which a eukaryotic cell separates its chromosomes and cytoplasm to form two new cells. In humans, there are three members of the Aurora kinase family: Aurora A, Aurora B, and Aurora C.
Aurora A is primarily localized to the spindle poles during mitosis and plays a critical role in centrosome maturation, bipolar spindle formation, and chromosome segregation. It also regulates the G2/M transition of the cell cycle.
Aurora B, on the other hand, is localized to the kinetochores, the protein structures that connect each sister chromatid to the mitotic spindle. Aurora B plays a crucial role in kinetochore-microtubule attachment, chromosome alignment, and the spindle assembly checkpoint, which ensures that all chromosomes are properly attached to the spindle before anaphase begins.
Aurora C is most similar to Aurora B and is primarily expressed in testicular tissue, where it plays a role in spermatogenesis.
Dysregulation of Aurora kinases has been implicated in various human diseases, including cancer. Overexpression or amplification of Aurora A and Aurora B have been observed in many types of cancer, and inhibitors of these kinases are being investigated as potential cancer therapeutics.
Rho-associated kinases (ROCKs) är en typ av serin/treoninproteinkinasör som aktiveras av Rho GTPaser. De är involverade i cellulär processer såsom cellstammens reglering, cytoskelettets omorganisering och celldelning. ROCKs finns i två isoformer hos människor: ROCK1 och ROCK2. Dessa kinaser fyller liknande funktioner men har också unika egenskaper. De aktiveras av Rho GTPaser, som binder till deras Rho-bindande domäner, vilket leder till en konformationsförändring och aktivering av kinaseaktiviteten. ROCKs fosforylerar flera substrat, inklusive myosinlightkedjan, LIM-kinasen och MLC-phosphataset, vilket resulterar i kontraktion av aktin-myosinfilamenten och cellstammens reglering. Dysreglering av ROCK-aktivitet har visats vara involverad i flera patologiska tillstånd, inklusive cancer, neurodegenerativa sjukdomar och kardiovaskulära sjukdomar.
'Saccharomyces cerevisiae' er en art av enkle celler organismer kjent som gjær. Den er en av de mest velstuderte arter av gjær og har vært brukt i både vitenskapelige studier og industrielle prosesser i tusenvis av år.
'Saccharomyces cerevisiae' er en fakultativt anaerob livsform, det vil si at den kan overleve ved å bruke ilkje for å oksidere sukker til kolsiringsprodukter som koldioxid og alkohol. Denne fermenteringsevnen er viktig i bakeri- og drikkevareindustrien, hvor den blir brukt til å lage brød, øl og vin.
I tillegg til sine praktiske anvendelser, er 'Saccharomyces cerevisiae' også en viktig modellorganisme i biologi og genetikk. Den har en liten, veldefinerte genom med om lag 6000 gener, og denne enkelhet gjør den til et ideelt system for å studere grunnleggende cellulære prosesser som celldeling, DNA-reparasjon og regulering av genuttrykk.
"Förmaksnatriuretiska receptorer" refererar till specifika proteiner på cellytan som binder till hormonet natriuretisk peptid (ANP) och kan orsaka en ökning av salt- och vattenut ur kroppen, vilket sänker blodtrycket. Dessa receptorer finns huvudsakligen i hjärtat (i specifikt förmaken) men även i njurarna och andra vävnader. När ANP binder till dessa receptorer aktiveras en signaltransduktionsväg som leder till ökad utsöndring av cGMP, vilket i sin tur orsakar relaxation av glatt muskulatur, minskat sympatiska nervsystemet aktivitet och ökad diuresis (urinproduktion). Detta hjälper till att reglera vatten- och elektrolytbalansen i kroppen och underlättar kontrollen av blodtrycket.
Protein Kinase C-δ (PKC-δ) er en type av proteinkinase, som er en klasse av intracellulære enzymer som kan fosforylere andre proteiner. Proteinkinaser spiller en viktig rolle i signaltransduksjon og regulerer mange cellulære prosesser, såsom celldeling, apoptose (programmatisk celldød) og metabolisme.
PKC-δ er specifikt involvert i reguleringen av apoptose og cellecyklus. Det aktiveres som svar på forskjellige intracellulære signaler, herunder calcium- og diacylglycerol (DAG)-signaler. Når aktivert, fosforylerer PKC-δ andre proteiner, noe som kan føre til endringer i deres funksjon og aktivitet.
Anotering: Denne svaret er basert på medisinsk og biologisk kunnskap og kan være for simplifisert for å oppfylle dine behov.
Protein Kinase C-alpha (PKC-α) er en type enzym, mer specifikt et serin/treonin kinase, som spiller en viktig rolle i cellers signalering og regulering. PKC-α er lokaliseret i celleplasmasmembranen og aktiveres ved hjelp av sekundære meldinger som diacylglycerol (DAG) og calciumjoner (Ca2+). Når aktivert, fosforylerer PKC-α andre proteiner, som kan påvirke deres funksjon og aktivitet. Dette kan føre til endringer i cellens vekst, differentiering, apoptose og sekretorisk aktivitet. PKC-α er involvert i en rekke fysiologiske prosesser som immunrespons, inflammasjon, cellecyklusregulering og neurotransmission. Dessutert kan abnorme nivåer eller aktivitet av PKC-α være forbundet med ulike patofisiologiske tilstander, inkludert kreft, diabetes, kardiovaskulære sykdommer og neurodegenerative lidelser.
Enzyminhibitorer, också kända som enzymhämmare, är molekyler som binder till enzym och minskar dess aktivitet. Denna bindning kan vara reversibel eller irreversibel och påverkar ofta den katalytiska funktionen hos enzymet genom att förhindra substratets bindning till aktivt centrum eller att störa den kemiska reaktionen som sker inne i enzymet. Enzyminhibitorer kan vara naturligt förekommande, till exempel i vissa giftiga substanser, eller syntetiskt framställda, och används ofta inom medicinen för att behandla olika sjukdomar.
'Natriuretiska peptider' är hormoner som produceras huvudsakligen i hjärtan och har en kraftig effekt på natriumexkreTION, diures och vasodilatation. Dessa hormoner inkluderar atriellt natriuretisk peptid (ANP), B-type natriuretisk peptid (BNP) och C-type natriuretisk peptid (CNP). De hjälper till att reglera blodtrycket, volymen av vätska i kroppen och homeostasen av elektrolyter. ANP och BNP frisätts huvudsakligen från hjärtats förmakar (atrium) som svar på ökat tryck eller volym, medan CNP frisätts från endotelceller i blodkärlen.
En kolibakterie (officiellt kallas Escherichia coli, ofta förkortat till E. coli) är en typ av gramnegativ bakterie som normalt förekommer i tarmarna hos varma blodcirkulerande djur, inklusive människor. Det finns många olika stammar av kolibakterier, och de flesta är ofarliga eller till och med nyttiga för värden. Några stammar kan dock orsaka allvarliga infektioner i mag-tarmkanalen, blodet eller andra kroppsdelar. En välkänd patogen kolibakteriestam är E. coli O157:H7, som kan orsaka livshotande komplikationer som hemolytisk uremisk syndrom (HUS) och tack följd av förtäring kontaminert mat eller vatten.
Protonpumpproteiner, också kända som protonkogenproteiner, är proteiner som aktivt transporterar protoner (H+) över cellyttmembranet. Denna transport process skapar ett koncentrationsgradient för H+ joner och genererar en protonsjö i specifika kompartment inom cellen, vilket är en viktig del av cellens energiproduktion.
Ett exempel på ett protonpumpprotein är ATPas, som hittas i mitokondriernas inner membran och i cellytan hos epitelceller i mag-tarmkanalen. I mag-tarmkanalen är detta viktigt för att möjliggöra en kontrollerad frisättning av H+ joner till magsäcken, vilket skapar den låga pH som krävs för att bryta ned matspillror. I mitokondrien är ATPas-proteinet en viktig del av oxidativ fosforylering och produktionen av ATP, det viktigaste energibärande molekylen i cellen.
Protonpumpproteiner kan också hittas i andra kompartment inom cellen, såsom i endosomer och golgiapparaten, där de hjälper till att underhålla ett specifikt pH-värde som krävs för korrekt proteintransport och -förädling.
Nitroprusside är ett snabbtverkande intravenöst blodtrycksmedel som används för att behandla akut högt blodtryck och hjärtödem. Det är en organisk sockerförening som innehåller kväve, syre, kol, väte och järn. Nitroprussid verkar genom att relaxera glatt muskulatur i artärväggarna, vilket orsakar vasodilatation (dilatering av blodkärlen) och minskar efterlasten på hjärtat.
Det är viktigt att notera att nitroprussid bör endast användas under kontinuerlig blodtrycksmonitorering och under övervakning av en läkare, eftersom det kan leda till en snabb och kraftig minskning av blodtrycket om det ges i för hög dos eller om det används för lång tid. Dessutom kan nitroprussid orsaka metabolitbildning som kan vara skadlig för nervsystemet vid långvarig användning.
Protein isolerare är en grupp enzymer som bryter ned proteiner till mindre peptider eller enskilda aminosyror. De gör detta genom att klyva specifika bindningar mellan aminosyrorna i proteinmolekylen, vilket orsakar dess nedbrytning. Proteinisoformer är viktiga för cellulärt proteinhomeostasibalans och proteinkatabolism, men de kan också vara skadliga om de överaktiveras eller missregleras, särskilt under sjukdomstillstånd som neurodegenerativa sjukdomar.
Diacylglycerol kinase (DGK) er en familie av intracellulære enzymkomplekser som fosforylerer diacylglycerol (DAG) til phosphatidic acid (PA). DGK-enzymerne spiller dermed en vigtig rolle i reguleringen af intracellulær signaltransduktion, især inden for cellers proliferation, apoptose og migration.
Specifikt fosforylerer DGK diacylglycerol til phosphatidic acid, hvilket er en vigtig proces i intra-cellulære signalveje som involverer proteinkinase C (PKC) og mTOR. Der findes flere forskellige isoformer af DGK, der kan udtrykkes i forskellige celler og under forskellige fysiologiske tilstande, hvilket gør at de har potentiale til at regulere en række forskellige cellulære processer.
AMP-aktiverade protein kinaser (AMPK) är ett enzymkomplex som spelar en central roll i regleringen av cellens energibalans. Det aktiveras under förhållanden när cellens energiförsörjning är hotad, till exempel vid lägre nivåer av ATP (den primära energibäraren inom cellen) och högre nivåer av AMP (en biprodukt som bildas när ATP omvandlas till ADP).
AMPK är involverat i flera cellulära processer, såsom regleringen av celldelning, celldöd, cellytning, metabolism och autofagi. När AMPK aktiveras får det en inhibitorisk effekt på anabola processer (som exempelvis lipid- och kolhydratsyntes) och stimulerar katalytiska processer som genererar ATP, såsom celldygnad, oxidativ metabolism och glukosuppmekanismer.
Dess aktivering har visat sig ha potentiala terapeutiska fördelar inom områden som diabetes, fetma, cancer och neurodegenerativa sjukdomar.
Jästsvampar, också kända som säcksvampar (på latin: Saccharomycetes), är en grupp encelliga eller myceliella svampar som tillhör riket Fungi. De flesta jästsvamparna har en diameter på 3-10 mikrometer och lever i alla möjliga miljöer, inklusive luft, vatten, jord och på levande och döda växter och djur.
Jästsvampar är kända för sin förmåga att fermentera socker till kolhydrater som alkohol och Koolsl gas (KOLA), vilket gör dem användbara inom bageri- och dryckesindustrin. De har också en viktig roll i naturen, där de bryter ned organiska material och hjälper till att recirkulera näringsämnen.
Jästsvampar kan vara antingen fria levande eller parasiter på andra organismer. De har en enkel cellstruktur med en cellyta som skyddas av ett cellvägg, som innehåller glukan och mannan. Deras DNA innesluts i en kärna, och de flesta jästsvampar har också mitokondrier.
Jästsvamparna är en mycket artrik grupp med över 1500 beskrivna arter, varav många har medicinska tillämpningar. Exempelvis används vissa jästsvampar som probiotika för att främja tarmhälsa, medan andra kan orsaka sjukdom hos människor och djur.
Kinoxaliner är en grupp kemiska föreningar som innehåller en kinoxalin-struktur, vilket är en heterocyklisk aromatisk komponent bestående av två bensenringar som är kopplade till varandra via två kolatomer och en kväveatom.
I medicinsk kontext kan kinoxaliner användas som läkemedel eller i forskning. Till exempel har vissa kinoxalinderivat visat sig ha antibakteriella, antifungala och antivirala egenskaper. Dessa föreningar kan vara verksamma mot en rad olika mikroorganismer, inklusive bakterier som orsakar sjukdomar som tuberkulos och stafylokocker.
Även om kinoxaliner har visat lovande resultat inom vissa medicinska tillämpningar, används de inte allmänt som läkemedel på grund av möjliga toxicitet och biverkningar. Fler studier behövs för att fullt ut förstå deras potential och säkerhet innan de kan användas i klinisk praktik.
Kalcium (Ca) er ein essensiell mineral som spiller en viktig rolle i menneskelige kroppa. Det er det mest abundaante mineralet i den menneskelige kroppen og utgjør om lag 1,5-2% av kroppens totale vekt. Kalcium finst foremost i tannene og benene, men det også fungerer som en viktig elektrolytt i kroppa og er involvert i mange viktige fysiologiske prosesser, så som:
1. Muskelkontraksjon: Kalcium hjelper med å aktivere muskelkontraksjoner, slik at vi kan bevege oss.
2. Nervesignalering: Kalcium er involvert i nervesystemet og hjeler med å overføre nervesignaler mellom nervecellene.
3. Blodkoagulasjon: Kalcium spiller en viktig rolle i blodkoagulasjonen ved hjelp av å aktivere bestemte proteiner som er involvert i denne prosessen.
4. Hormonproduksjon: Kalcium er også involvert i produksjonen og reguleringen av visse hormoner, for eksempel parathyroideahormonet og kalcitoninet.
5. Cellsignaleringsprosesser: Kalcium hjelper med å regulere cellsignaleringsprosesser i kroppen, som for eksempel cellevekst og celldeling.
For å sikre at kroppa får nok kalcium, er det viktig å ha en balanseert kost med tilstrekkelige mengder av denne næringsstoffen. God kilder på kalcium inkluderer mælkprodukter, grønnsaker som brokkoli og bladgrønnsaker, bønner, nøtter og fisk som sardiner og laks.
Cyclic AMP, eller cAMP (cyclisk adenosinmonofosfat), är ett second messenger-molekyl som spelar en viktig roll i cellsignalering inom organismen. Det bildas inifrån cellen när en hormonreceptor på cellmembranet aktiveras av ett hormon, till exempel glukagon eller adrenalin. Aktiveringen av receptorn leder till att en G-proteinkomplex kopplad till receptorn aktiveras, vilket i sin tur aktiverar en enzymkomplex kallad adenylatcyklas. Adenylatcyklasen konverterar ATP till cAMP, som sedan fungerar som en signalsubstans inom cellen och aktiverar olika proteinkinas-enzymkomplex. Dessa komplex kan leda till olika fysiologiska respons, beroende på vilket hormon som initialt aktiverade receptorn. När signalsubstanserna cAMP har utfört sin funktion bryts de ned av fosfodiesteras-enzymkomplex, varpå signalsystemet återgår till det ursprungliga tillståndet.
Den hippocampus är en del av limbiska systemet i hjärnan som spelar en viktig roll i minnes- och läringsprocesser. Det är ett par strukturer, en i varje hemisfär, som liknar en hästsko i formen och ligger djupt inne i tinningloben. Hippocampus består av flera regioner, inklusive cornu ammonis, dentatgyrus och subiculum, som tillsammans bildar en komplex neural nätverksarkitektur.
Hippocampus är speciellt känslig för skador orsakade av syrebrist, neuroinflammation och neurodegenerativa sjukdomar, såsom Alzheimers sjukdom. Forskning har visat att förlust av volym och funktion i hippocampus korrelerar med minnesförlust och kognitiva nedsättningar hos äldre vuxna och personer med demenssjukdomar.
AMPA-receptorer, eller α-aminosuberat receptorer, är en typ av jonotropa receptor som tillhör glutamatreceptorfamiljen. De aktiveras av den excitatoriska aminosyran glutamat och dess analog, AMPA (α-aminosuberat), och leder till ökad permeabilitet för natrium- och kaliumjoner över cellmembranet, vilket orsakar depolarisering av postsynaptiska neuron. Dessa receptorer spelar en viktig roll i snabb neurotransmission och långsiktig potentiering i centrala nervsystemet.
"Alternativ splitsning" (alternative splicing) är ett biologiskt fenomen där flera olika proteiner kan produceras från en och samma gen genom att olika delar av den genetiska informationen i RNA-molekylen exciseras och de kvarvarande delarna (exonerna) sedan sammanfogas på olika sätt. Detta medför att ett stort antal olika proteiner kan produceras från en enda gen, vilket ökar den genetiska variationsmöjligheten och komplexiteten hos levande organismer.
ACOG (Amerikanska Collegiet för Obstetrik och Gynekologi) definierar 'protonkogenproteiner c-akt' som ett protein som är involverat i celldelning, cellcykeln, cellmotilitet, metabolism, apoptos och överlevnad. Det aktiveras av signalsubstanser utanför cellen och är också en nedvärmare för flera andra proteiner som påverkar celldelningen. c-Akt är ett medlem i AGC-kinasfamiljen, vilket innebär att det är en serin/treoninkinas. Dess aktivering är kopplad till flera olika cancertyper, såsom bröstcancer, livmoderhalscancer och prostatacancer.
P125FAK, också känt som Focal Adhesion Kinase (FAK), är ett cytoplasmiskt protein som spelar en viktig roll i cellsignalering och regulerar celldelning, migration, adhesion och överlevnad. Det aktiveras av extracellulära signalsubstanser som ger upphov till en kaskad av intracellulära signaltransduktion via tyrosinkinaser och adapterproteiner. P125FAK är involverat i cellulär processer som är viktiga för cancerutveckling, såsom angiogenes, celldelning och metastasbildning.
Hjärnan är det centrala nervösa systemets kontroll- och koordineringsorgan. Den består av hjärnbarken (cerebrum), liljan (cerebellum) och förlängda märgen (medulla oblongata), samt flera inre strukturer så som thalamus, hypothalamus och hippocampus. Hjärnan är ansvarig för högre kognitiva funktioner såsom tankeprocesser, minne, språk och medvetandet, samt kontrollerar också kroppens autonoma funktioner som andning, hjärtrytm och kroppstemperatur. Hjärnan är indelad i två hemisfärer och innehåller miljarder nervceller (neuron) som kommunicerar med varandra via nervimpulser för att skapa tankar, känslor, minnen och handlingar.
"Grön fluorescerande protein" (GFP) er ein biologisk fluorescerende proteinet som oprinnelig kommer fra den lysende havhøne, Aequorea victoria. GFP-molekylet inneholder et hromofor som absorberer blått lys med en bølgelengde på om lag 480 nm og emitterer grønt lys med en bølgelengde på om lag 510 nm.
GFP-proteinet kan brukes i biomedisinsk forskning som et markør for ei spesifikk molekyltype, for eksempel ein gen, en proteinkompleks eller en celle. Dette gjør det mulig å studere hvordan disse molekyler oppfører seg under forskjellige fysiologiske tilstande og under forskjellige eksperimentelle vilkår. GFP-proteinet har vært en sentral komponent i mange grunnleggande biologiske forskningsprosjekter, og det har bidratt til en rekke betydelige gjenomfinninger innen molekylærbiologi og cellebiologi.
Cytoskelettproteiner är proteiner som utgör cytoskelettet, det inre schelet, i celler. Cytoskelettet ger cellen form och struktur samt möjliggör cellens rörelse och transportprocesser. Det består av tre huvudsakliga komponenter: aktinfilament, intermediär filament och mikrotubuli. Var och en av dessa komponenter har sin egen uppsättning unika proteiner som ger dem deras specifika egenskaper och funktioner. Aktinfilamentet är flexibelt och starkt, och spelar en viktig roll i cellens form och rörelse. Intermediär filament är starka och stabila, och hjälper till att ge cellen struktur och integritet. Mikrotubuli är hårdare än aktinfilament och intermediär filament, och är viktiga för celldelning, intracellulär transport och cellytorers rörelse.
Myosin kinase, ofta förkortat Myosinkinas, är ett enzym som finns i muskelceller och är involverat i muskelkontraktioner. Det fosforylerar, det vill säga adderar en fosfatgrupp till, myosin, ett annat protein som är viktigt för muskelkontraktioner. Genom att fosforylera myosin påverkar myosinkinas muskelfunktionen och hjälper till att reglera kontraktionshastigheten i musklerna. Myosinkinas aktiveras av kalciumjoner, som frisläpps från sarkoplasmisk retikulum (ett organell inne i muskelcellen) under en muskelkontraktion.
Substratspecificitet betegner i farmakologi og enzyms biokemi, hvilken type af substrat (den molekyle, der binder til enzymet) et specifikt enzym er i stand til at binde sig til og katalyse en reaktion med. Enzymer er biologiske katalysatorer, der accelererer kemiske reaktioner inden for levende organismer, og hver enzym har typisk en specifik substratspecificitet, der bestemmer, hvilken type af molekyler, den kan arbejde på.
Substratspecificiteten for et enzym kan være meget snæver, så det kun kan binde sig til én specifik molekyletype, eller den kan være bredere, så det kan binde sig til flere relaterede molekyler. Substratspecificiteten af et enzym kan blive fastlagt ved at undersøge, hvilke substrater det kan binde sig til og katalysere en reaktion med under specifikke betingelser.
Det er vigtigt at notere, at substratspecificiteten for et enzym ikke altid er absolut. I nogle tilfælde kan et enzym have en vis grad af fleksibilitet og være i stand til at binde sig til og katalysere reaktioner med substrater, der ikke er helt identiske med dets normale substrat. Dette kaldes undertiden for "promiskuitet" eller "krydsreaktivitet".
'Test för genetisk komplementering' är ett laboratoriemässigt test som används för att undersöka om en fungerande kopia av en viss gen kan komplettera eller kompensera för den defekta genen hos en individ med en genetisk sjukdom. Testet innebär att man inför en normalt fungerande genkopia i celler som saknar en fungerande kopia av samma gen, och sedan ser på om detta leder till en korrekt produktion av det protein som genen kodar för.
Genetisk komplementering används ofta inom forskning för att undersöka samband mellan specifika gener och sjukdomar, men kan även användas i kliniska sammanhang för att fastställa om en viss genförändring orsakar en specifik sjukdom. Testet kan också användas för att undersöka effekterna av genterapi, där man ersätter en defekt gen med en fungerande kopia.
Fosfotransferaser är ett samlingsnamn för en grupp enzymer som katalyserar överföringen av en fosfatgrupp från en donatormolekyl till en acceptormolekyl. Denna reaktion kallas för fosforylering och är en central mekanism i cellens energihushållning, signaltransduktion och näringsmetabolism.
Det finns olika typer av fosfotransferaser beroende på vilken donator- och acceptormolekyl som är inblandad i reaktionen. Exempel på fosfotransferaser inkluderar:
1. Kinaser: överför fosfatgruppen från ATP till en protein- eller kolhydratmolekyl.
2. Fosfatas: avlägsnar en fosfatgrupp från en molekyl, ofta för att aktivera eller inaktivera en biologisk funktion.
3. Fosfotransferaser som överför fosfatgrupper mellan kolhydrater, lipider och nukleotider.
Fosfotransferasreaktioner är viktiga för cellens homeostas och reglering av olika cellulära processer som celldelning, signaltransduktion, ämnesomsättning och energiproduktion.
Tyrosine är en aromatisk essentiell aminosyra, som betyder att den inte kan syntetiseras i kroppen och måste tas in via kosten. Den utgör grunden för tillverkning av neurotransmittorer (dopamin, noradrenalin och adrenalin) samt melanin, ett pigment som ger huden, håret och ögat färg. Tyrosin kan också fungera som en prekursor till signalsubstanser i centrala nervsystemet. Födoämnen som innehåller tyrosin är bland annat kött, ägg, fisk, bönor, nötter och spannmål.
En dos-respons kurva är en grafisk representation av hur effekten av ett läkemedel varierar beroende på dosen. Kurvan visar den önskvärda effekten som ökar med ökande dos, tills en toppnivå nås där ytterligare ökning av dosen inte ger någon extra effekt. Vid högre doser kan läkemedlet bli skadligt och orsaka biverkningar, vilket resulterar i att kurvan börjar dalande.
Den optimala dosen av ett läkemedel är ofta den lägsta effektiva dosen som ger önskad terapeutisk effekt med minsta möjliga risk för biverkningar. Dos-respons kurvor används ofta vid utformning och planering av kliniska prövningar för att fastställa läkemedels säkerhet, effektivitet och optimal dosering.
Januskinas 2 (JAK2) är ett intracellulärt enzym som tillhör tyrosinkinasfamiljen. Det spelar en viktig roll i signaltransduktionen av cytokiner och tillväxtfaktorer genom att fosforylera och aktivera signalkaskader som Stat-proteiner. JAK2 är involverat i reguleringen av celltillväxt, differentiering, apoptos och immunresponser.
Mutationer i JAK2-genen har associerats med flera sjukdomar, framför allt myeloproliferativa neoplasm (MPN) såsom polycytemia vera, essentiell trombocytopeni och myelofibros. Den mest kända JAK2-mutationen är V617F, som orsakar en konstitutiv aktivering av JAK2-enzymet och en ökad cellproliferation.
Proteinkonfiguration refererar till den unika sekvensen av aminosyror som bildar ett proteinmolekyls tredimensionella struktur. Denna konfiguration bestäms av proteinkodande gener och påverkas av posttranslationella modifikationer. Proteinkonfigurationen är viktig för proteinets funktion, stabilitet och interaktion med andra molekyler inom cellen.
En natriuretisk förmaksfaktor är ett peptidhormon som bildas i hjärtat, mer specifikt i förmaken (atrium). Det kallas ofta atrial natriuretisk peptid (ANP) på engelska. Natriuretiska förmaksfaktorer har en diuretisk och vasodilaterande effekt, vilket innebär att de ökar urinproduktionen och vidgar blodkärlen. Dessa hormoner frisätts som svar på ökat intravaskulärt tryck eller volym i hjärtat och hjälper därmed till att reglera vätskebalansen och blodtrycket i kroppen. Natriuretiska förmaksfaktorer verkar genom att hindra återupptagningen av natrium (natriures) i njurarna, vilket leder till ökad utsöndring av natrium och vatten i urinen.
Fokal adhesionsprotein-tyrosinkinaser (FTK) är en grupp enzymer som spelar en viktig roll i cellens signaltransduktion och regulering av cellens cytoskelett. De aktiveras genom att fosforylera tyrosiner i proteiner, vilket orsakar en kaskad av händelser som leder till cellulär signalering. FTK finns ofta lokaliserade till fokal adhesionskomplex, strukturer där cellen är fäst vid extracellulär matrix via integrinreceptorer. Dessa proteinkinasers aktivitet är kopplad till cellens rörelse, form och tillväxt, och felaktig regulering av FTK har visats vara involverat i flera olika sjukdomar, inklusive cancer.
Enzymaktivatorer, också kända som cofaktorer eller koenzymmer, är molekyler som binder till enzymer och sänker den aktiveringsenergi som krävs för att enzymet ska kunna utföra sin katalytiska funktion. De kan vara organiska (som koenzym A) eller icke-organiska (som joner av metall) och de hjälper ofta till att stabilisera substratet i en reaktion, vilket gör det lättare för enzymet att utföra sin katalytiska funktion.
I vissa fall kan en aktivator vara ett annat molekylärt substrat som binder till enzymet och orsakar en konformationsförändring i enzymet, vilket ökar dess aktivitet. Exempel på sådana aktivatorer inkluderar ATP och ADP.
Det är viktigt att notera att enzymaktivatorer inte ska förväxlas med enzyminhibitorer, som istället minskar enzymets aktivitet genom att binda till det och hindra det från att fungera korrekt.
Immunohistochemistry (IHC) är en teknik inom patologi och histologi som kombinerar immunologiska metoder med mikroskopisk observation för att visualisera specifika proteiner eller antigener i celler eller vävnader. Denna teknik använder sig av specifika antikroppar som är markerade med en fluorescerande markör eller en enzymatisk reaktion, vilket gör det möjligt att lokalisera och identifiera olika typer av celler och strukturer inuti ett vävnadsprov. IHC används ofta som en diagnosmetod inom klinisk medicin för att ställa diagnoser på olika slags cancersjukdomar och andra sjukdomar som är relaterade till specifika proteiner eller antigener.
'Drosophila' är ett släkte inom flugordningen, och det mest kända arten inom släktet är bananflugan (*Drosophila melanogaster*). Denna art är en vanlig modellorganism inom genetisk forskning på grund av sin enkla uppbyggnad, kort livscykel och lätta odling. Genomet hos bananflugan är väl studerat och den har blivit ett viktigt verktyg för att förstå grundläggande principer inom genetik och developmental biology.
Ribosomal Protein S6 Kinase, 90 kDa (RSK90) är ett enzym som tillhör serin/treonin-proteinkinasfamiljen. Det fosforylerar, det vill säga adderar en fosfatgrupp till, flera olika proteiner och reglerar därmed olika cellulära processer såsom celldelning, celldifferentiering och celldöd. RSK90 är specifikt inblandat i signaltransduktionsvägar som aktiveras av tillväxtfaktorer och andra signalsubstanser utanför cellen.
RSK90 består av två domäner: en N-terminal kinasedomän och en C-terminal kinasedomän. Den N-terminala kinasedomen är aktiv när den fosforyleras, medan den C-terminala kinasedomen har en regulatorisk funktion och aktiverar den N-terminala kinasedomen genom att fosforyleras.
RSK90 är ett viktigt mål för forskning inom områden som cancer, neurodegenerativa sjukdomar och inflammation, eftersom det har visat sig vara överaktiverat i olika patologiska tillstånd.
Tetradekanoylforbolacetat, ofta förkortat till PMA (Phorbol Myristate Acetat), är ett kemiskt förening som används inom forskning som en aktivator av protein kinas C (PKC). Det är en syntetisk derivat av forbol, som finns naturligt i crotonolja. PMA binder till och aktiverar PKC-enzymet, vilket leder till en mängd cellulära respons, inklusive celldelning, differentiering och apoptos (programmerad celldöd).
På grund av dess starka biologiska verkan används PMA ofta som ett verktyg inom forskning för att studera PKC-relaterade signaltransduktionsvägar. Det kan också användas som en positiv kontroll i cellresponsassayer. Emellertid bör det hanteras med försiktighet på grund av sina potentiala onkogena effekter och skall endast användas under kontrollerade laboratorieförhållanden.
RNA (Ribonucleic acid) är ett samlingsnamn för en grupp molekyler som spelar en central roll i cellens proteinsyntes och genuttryck. Det finns olika typer av RNA, men en specifik typ kallas just budbärarrNA (mRNA, messenger RNA). BudbärarrNA har till uppgift att transportera genetisk information från cellkärnan till ribosomen i cytoplasman, där den används för att bygga upp proteiner enligt instruktionerna i genomet. På så sätt fungerar budbärarrNA som ett slags "budbärare" av genetisk information mellan cellkärnan och ribosomen.
Protein Kinase C-ε (PKC-ε) är ett enzym som tillhör familjen Protein Kinase C, som är involverade i cellsignalering och regulerar en mängd cellulära processer, inklusive celldelning, differentiering, apoptos och cellcykeln. PKC-ε aktiveras av diacylglycerol (DAG) och calciumjoner och fyller en viktig roll i cellernas svar på tillväxtfaktorer, hormoner och signalsubstanser som är involverade i inflammation och smärta.
PKC-ε har också visat sig spela en viktig roll i cancerutveckling genom att reglera celldelning, överlevnad och apoptos hos cancerceller. Dessutom har forskning visat att PKC-ε kan vara involverat i resistens mot vissa cancerbehandlingar, såsom kemoterapi och strålbehandling.