Luciferaser från bakterier, som t ex Photobacterium, Vibrio och Photorhabdus.
"Eldflugor" refererer til medlemmer af familien Lampyridae, som er kendt for deres bioluminescens, hvor de producerer lyssignaler ved hjælp af kemiske reaktioner. Disse insekter findes primært i varme, fugtige områder verden over og er ofte aktive om natten.
Luciferaser från eldflugor, vanligtvis Photinus, som oxiderar eldflugeluciferin, varvid avges fotoner. EC 1.13.12.7.
Enzym som oxiderar vissa luminiscerande ämnen så att de avger ljus (fysisk luminiscens). Luciferaser från olika organismer har utvecklats olika under evolutionen. EC 1.13.12 (?).
En bensotiazol som oxideras av eldflugeluciferaser, varvid avges ljusstrålning (luminescens).
Vibrionaceae är en familj av gramnegativa, aeroba eller anaeroba, strikt roterande och ofta kapselbildande stavbakterier. De flesta arterna är encelliga och mobila med en eller flera polära flageller som ger dem en snabb, dartformad rörelse. Vibrionaceae-bakterier återfinns vanligtvis i vattenmiljöer, inklusive sötvatten, bräckt vatten och marina ekosystem, samt kan förekomma hos vissa djurarter som del av deras normala mikroflora. Några kända patogena arter inom familjen är Vibrio cholerae, orsak till kolera hos människor, och Vibrio vulnificus, som kan orsaka allvarliga infektioner i immunförsvagna individer.
Skalbaggar (Coleoptera) är den mest omfattande ordningen av insekter. Mer än 300 000 arter är kända. De kännetecknas av ett hårt hudskelett, med hårda täckvingar som skydd för flygvingarna.
Avgivande av synligt ljus när exciterade elektroner faller från en högre energinivå till en lägre och därvid förlorar energi i form av fotoner. Detta ljus kallas ofta kallt ljus, då det inte uppkommer till följd av upphettning, som vid incandescens. Luminiscens utnyttjas i många praktiska tillämpningar.
Luciferaser från Renilla som oxiderar vissa luminiscerande ämnen så att fotoner avges. EC 1.13.12.5.
Metoder för utnyttjande av ljus i form av fysisk luminescens avgiven av ljusalstrande proteiner och andra ljusalstrande ämnen.
Renilla är ett släkte marina bioluminiscenta organismer, vanligtvis kända som havsstjärnor eller sjöpennor, som producerar ljus genom en kemisk reaktion. Den medicinska användningen av Renilla oftast refererar till användning av ett protein från Renilla marina, kallat Renillas luciferas, i biomedicinsk forskning för att mäta proteinexpression och celleväxthastigheter. Genom att tillsätta Renillas luciferas till celler som uttrycker ett specifikt protein kan forskare mäta mängden ljus som produceras, vilket korrelerar med mängden protein som uttrycks i cellen. Detta används ofta i genetiska screeningar och för att studera celldifferentiering och signaltransduktion.
Copepoda är en ordning av små, övervägande marina kräftdjur som ofta utgör en viktig del av zooplanktonet. De flesta arterna är mikroskopiskt små och lever pelagiskt i havets övre vattenlager, men några få arter kan vara upp till ett par centimeter långa och lever i bottensediment eller på andra djurs skal. Copepoderna är vanligtvis tvådelade med en kropp som består av en främre del (cefalon) och en bakre del (thorax/abdomen). De har också ett par antenner, mandibler och maxiller för att fånga och äta små partiklar som alger eller andra encelliga djur. Copepoderna är viktiga som föda för många andra marina djur, inklusive fiskar, valar och sjöfåglar.
I en enkel mening kan "aquatic organisms" definieras som levande väsen som lever och utvecklas i vattenmiljöer. Detta inkluderar både växter (till exempel alger och sjögräs) och djur (till exempel fiskar, blötdjur, kräftdjur och groddjur). Aquatic organisms kan vara marina (levande i saltvatten, till exempel i haven) eller ferska (levande i sötvatten, till exempel i sjöar, floder och vattendrag).
'Photobacterium' är ett släkte av gramnegativa, fakultativt anaeroba bakterier som tillhör familjen Vibrionaceae. De flesta arterna av Photobacterium är bioluminescenta och förekommer naturligt i marina miljöer, där de lever symbiotiskt med djur som lever på havsbottnen. Exempel på kända arter inom släktet Photobacterium är P. leiognathi, P. mandapamensis och P. phosphoreum. Dessa bakterier producerar ljus genom en biokemisk reaktion som involverar ett enzym som kallas luciferas och ett substrat som kallas luciferin. Photobacterium-bakterier kan också orsaka sjukdomar hos människor, framför allt hos immunosupprimerade individer, och kan leda till infektioner såsom sepsis, meningit och endokardit.
'Luminiscenerande medel' refererar till ämnen eller preparat som är kapabla till att ge ifrån sig ljus, ofta genom excitering av en yttre källa som elektromagnetisk strålning. Detta fenomen kallas luminiscens och kan inträffa på grund av olika mekanismer såsom fluorescens, fosforescenс eller chemiluminiscens. Luminiscenerande medel används inom en rad olika områden, till exempel inom medicinen för diagnostiska och terapeutiska syften, liksom i forskning och industriella tillämpningar.
Photorhabdus är ett genus av gramnegativa, aeroba, sporsäcksbildande och bioluminescerande bakterier som lever symbiotiskt inne i entomopatogena nematoder (insektsinfekterande rundmaskar) av familjen Heterorhabditidae. När värddjuret infekteras av nematoden frigörs bakterierna och producerar toxiner som dödar insekten, vilket skapar ett miljö för både nematodens och bakteriens reproduktion. Senare bildar bakterierna sporer som kan överleva i marken tills de infekterar en ny värd. Photorhabdus-stammar kan vara patogena även för andra organism än insekter, inklusive ryggradsdjur. Dessa bakterier är därför ett intressant forskningsområde för att utveckla nya biologiska kontrollmetoder mot skadeinsekter och för att studera deras unika symbiotiska livscy
Protein renaturation refererar till processen där ett protein som har blivit denaturerat, det vill säga förlorat sin naturliga tertiär- och sekundärstruktur, återfår sin ursprungliga konformation och funktion. Denna process kan ske spontant under specifika fysikaliska och kemiska betingelser, såsom temperatur, pH och saltkoncentration. Proteinrenaturation kan också uppnås genom kontrollerade in vitro-förfaranden, där proteinet gradvis exponeras för mildare miljöförhållanden för att successivt återfå sin ursprungliga struktur och funktion.
I medicine refererar "färg" vanligtvis till det visuella aspekten av vävnader, kroppsfluider eller huden som kan variera som ett resultat av normal fysiologisk process, patologiska tillstånd eller påverkan av yttre faktorer. Exempelvis kan gul färg i huden och ögonvitor (icterus) indikera en störning i leverfunktionen.
Ett enzyms förmåga att bibehålla sin strukturform eller sin verkan när det utsätts för lagring, isolering, rening eller annan fysikalisk eller kemisk manipulering, inklusive proteolytiska enzymer och värme.
'Vibrio' är ett släkte av gramnegativa, spiralformade eller stavformade bakterier som naturligt förekommer i vattenmiljöer, särskilt i kustnära och estuarina ekosystem med brackvatten. Många arter av Vibrio är kända för att orsaka sjukdomar hos människor, framför allt Vibrio vulnificus och Vibrio cholerae, som kan leda till allvarliga infektioner som till exempel matförgiftning eller sårinfektioner. Vibrio-bakterier är ofta förenade med vattenlevande djur, såsom skaldjur och fiskar, och smitta hos människor kan inträffa genom att äta rå eller underkokt skaldjurs kött eller genom öppna sår som utsätts för infekterad vatten.
Proteiner som är delaktiga i ljusalstringsfenomen hos livsformer, vari ingår bl a enzymatiska och icke-enzymatiska system, med eller utan närvaro av syre eller kofaktorer.
Gener som uttrycker sig på ett lätt påvisbart sätt och därför används för att studera promotoraktivitet på många platser i ett målgenom. Inom rekombinant DNA-teknik kan dessa gener kopplas till ett promotorområde av intresse.
Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.
Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
De reaktiva områden på en makromolekyl som är direkt envolverade i dess specifika sammankoppling med en annan molekyl.

Luciferase är ett enzym som produceras av vissa arter av luminescerande (ljusbärande) bakterier, till exempel *Vibrio harveyi* och *Photobacterium phosphoreum*. Detta enzym katalyserar en reaktion där luciferin (ett förening som fluorescerar när det utsätts för ljus) oxideras till oxyluciferin, under simultan produktion av blått-grönt ljus. Reaktionen kräver syre och energikälla i form av ATP (adenosintrifosfat).

Bakteriell luciferas används ofta inom biomedicinsk forskning som ett reportergen, vilket betyder att den kopplas till ett genuttryck som ska studeras. När detta gen uttrycks så produceras luciferasen och ger ifrån sig ljus, vilket kan ses och mätts för att avgöra om genen är aktiv under olika förhållanden eller i olika celltyper.

'Eldflugor' er en norsk betegnelse for en art som i engelsk litteratur ofte kallas 'fireflies' eller 'lightning bugs'. På svensk kan de også kallas 'ljusstötar'. Det vetenskaplige navnet på denne insektsgruppen er Lampyridae.

Eldflugor er en type coleoptera, eller biller, og de fleste arter har en karakteristisk evne til å produserer kjemisk lys i deres kropp, ofte i bakkroppen. Dette lysprosessen kaller vi bioluminisens. Denne funksjonen brukes vanligvis som en del av paringsritualet hos eldflugene.

Det er viktig å merke seg at betegnelsen 'eldflue' ofte kun refererer til de arter som kan produser kjemisk lys, men det finnes også andre arter av Lampyridae som ikke har denne evnen.

Luciferase är ett enzym som katalyserar bioluminescensreaktionen hos vissa levande organismer, såsom certaina arter av eldflugor (Lampyridae). Reaktionen involverar en substratmolekyl, vanligtvis luciferin, som oxideras till ett exciterat tillstånd och sedan sönderfaller, vilket resulterar i ljusemission. Luciferasreaktionen är en ATP-beroende process och producerar ljus utan att generera värme, till skillnad från vanlig termisk strålning eller elektrisk belysning.

Det finns olika typer av luciferaser som förekommer hos olika arter, men de flesta har en hög specificitet för sitt respektive substrat. Luciferasreaktionen är ett exempel på en biokemisk process där energi frigörs i form av ljus istället för värme. Denna unika egenskap gör luciferasen och andra relaterade enzymkomplex till användbara verktyg inom biomedicinsk forskning, diagnostik och bioingenjering.

Luciferase är ett enzym som katalyserar bioluminescens, det vill säga ljusproduktion, i vissa levande organismer. Det mest kända exemplet är den blå-gröna lysglansen hos eldflugor och djuphavsdjur som till exempel Kalanmarctis planktonica.

Luciferasreaktionen involverar en substratmolekyl, vanligtvis benämnd luciferin, som oxideras av luciferas i ett tvåstegsprocess där ATP och syre också är nödvändiga reaktanter. Det resulterande ljuskvantumet har en våglängd på omkring 470-560 nanometer, beroende på vilken typ av luciferas som används.

I medicinsk kontext kan luciferas användas som ett reportergen i molekylärbiologiska studier för att mäta och visualisera biologisk aktivitet, till exempel celldelning eller genuttryck, genom att koppla en luciferase-genererande sekvens till en promotor av intresse. När denna promotor aktiveras kommer luciferas att produceras och kan detekteras som ljus med hjälp av ett luminometer eller en CCD-kamera.

Luciferin och eldflugor är två separata begrepp inom biologi och medicin. Luciferin är ett organisk molekyl som förekommer hos vissa djur och bakterier, och som kan oxideras till en exciterad syrgasmolekyl som sedan avges som ljus. Detta fenomen kallas bioluminiscens.

Eldflugor är en grupp insekter som tillhör ordningen tvåvingar (Diptera) och familjen myggor (Culicidae). De flesta arter av eldflugor är inte lysande, men det finns ett fåtal undantag. Det mest kända exemplet är släktet *Photuris*, som inkluderar den nordamerikanska eldflugan (*P. versicolora*). Dessa arter kan producera bioluminiscens genom att oxidera en speciell typ av luciferin med hjälp av ett enzym som kallas luciferase.

Sålunda är "Luciferin, eldfluga" ingen medicinsk term, men det finns vissa arter av eldflugor som kan producera bioluminiscens med hjälp av luciferin.

'Vibrionaceae' är en familj av gramnegativa, aeroba och anaeroba, encelliga eller stavformade bakterier. Många arter inom denna familj är kända för att vara fakultativt anaeroba, vilket betyder att de kan växa i både syrgasrikt och syrefattigt miljöer.

De flesta arterna av Vibrionaceae lever som fria levande organismer i vattenmiljöer, men några arter är kommensaler eller patogener hos djur, inklusive människor. Till exempel orsakar *Vibrio cholerae* kolera, en allvarlig och livshotande infektionssjukdom som kan leda till svår diarré och uttorkning. Andra arter av Vibrionaceae kan orsaka hudinfektioner eller sjukdomar i mag-tarmsystemet hos människor.

Vibrionaceae-bakterier har ofta en flagell, ett slags "svans" som de använder för att röra sig. De kan också producera enzymer och toxiner som hjälper dem att bryta ner och ta i sig näring från sin omgivning.

'Skalbaggar' är ett samlingsnamn för en stor grupp insekter som tillhör ordningen Coleoptera. Ordet "coleoptera" kommer från grekiskans "koleos" (skal) och "ptera" (vingar), vilket refererar till deras hårda, skyddande framtalsvinge som de kan dra in under en sköldformad bakre del av kroppen när de inte använder sig av sina vingar.

Skalbaggar utgör den största gruppen av alla levande djurarter, med över 350 000 beskrivna arter och troligen många fler som fortfarande är okända för vetenskapen. De finns i nästan alla habitat på jorden, från skogar och gräsmarker till vatten och stadsområden.

Många skalbaggar har en betydande ekonomisk roll som skadedjur eller nyttodjur. Några exempel på skadedjursarter är barkborrar, som kan orsaka stor skada på träd, och livsmedelsdådjur som kornskalbaggar och torkdjur. Andra skalbaggar, såsom mjukbaggar och syrsor, är värdefulla nedbrytare av organisk materia i ekosystemen.

Det bör nämnas att termen "skalbagge" inte används inom medicinen eller biomedicinska sammanhang. Den är istället en benämning som främst används inom entomologi, zoologi och ekologi för att beskriva denna specifika grupp insekter.

Luminiscens är ett fysikaliskt fenomen där ett material utsätts för en exciterande händelse, till exempel elektromagnetisk strålning eller mekanisk påverkan, vilket resulterar i att materialet emitterar ljus. Detta sker när elektroner i materialet exciteras till ett högre energitillstånd och sedan sakta återvänder till sitt grundtillstånd, under vilken process de avger energi i form av ljuskvant (fotoner).

I medicinsk kontext kan luminiscens användas inom diagnostiska tekniker som exempelvis positronemissionstomografi (PET) och singel-positronemissionskomputertomografi (SPECT), där radioaktiva isotoper injiceras i patienten och exciteras av kroppens naturliga processer, vilket resulterar i emissionen av positroner som sedan interagerar med materialet i skannern för att producera en bild.

Luciferase är ett enzym som produceras naturligt av vissa arter av djur, såsom eldflugor och bläckfiskar. Det används kommersiellt inom forskning för att producera ljus när det kombineras med ett substrat kallat luciferin. När luciferin binder till luciferasen undergår en kemisk reaktion som resulterar i att ljuskällan lyser upp.

Renilla-luciferas är ett annat slags luciferas som produceras av en sorts sjöpung, Renilla reniformis. Det fungerar på samma sätt som luciferasen från eldflugor, men använder ett substrat kallat coelenterazin istället för luciferin. När coelenterazinet binder till Renilla-luciferas undergår en kemisk reaktion som också resulterar i att ljuskällan lyser upp.

Både luciferas och Renilla-luciferas används ofta inom molekylärbiologi för att mäta aktiviteten hos specifika gener eller proteiner i levande celler. Genom att koppla en reportergen till ett genuttryck eller proteininteraktion av intresse kan forskare studera hur dessa processer påverkar aktiviteten hos luciferasen eller Renilla-luciferasen, och därmed dra slutsatser om vad som händer med genuttrycket eller proteininteraktionen.

Luminiscens är ett fenomen där ett material utsätts för en exciterande händelse, till exempel elektromagnetisk strålning eller kemisk reaktion, vilket resulterar i att elektroner i materialet exciteras till ett högre energitillstånd. När dessa exciterade elektroner sedan relaxerar tillbaka till sitt grundtillstånd avges det ljus, och detta kallas just luminiscens.

Mätning av luminiscens är en teknik som används för att mäta denna ljusemission. Det kan ske på olika sätt beroende på vilket slags luminiscens som ska mätas och under vilka betingelser. I allmänhet innebär det dock att man exponerar ett luminiscensaktivt material för en exciterande strålning under en viss tidsperiod, varefter man mäter den intensitet av ljus som avges.

Den exciterande strålningen kan vara ultraviolett (UV) eller visuell (blått/violett) ljus, beroende på vilket slags luminiscens man vill studera. Exempel på olika typer av luminiscens som kan mätas innefattar fluorescens och fosforescens.

Fluorescens är en form av luminiscens där materialet snabbt (inom nanosekunder) relaxerar tillbaka till sitt grundtillstånd efter att ha exciterats, medan fosforescens är en form av luminiscens där relaxationen sker mycket långsammare (sekunder, minuter eller till och med timmar).

Mätning av luminiscens används inom många olika områden, till exempel inom kemi för att studera kemiska reaktioner, inom fysik för att undersöka materialegenskaper och inom biologi för att studera cellulära processer.

"Renilla" är ett samlingsnamn för marina organismer som tillhör klassen Hydrozoa och ordningen Anthoathecata. De flesta Renilla-arter är små, transparanta polypformer som lever i kolonier i marina miljöer.

Men det finns också en speciell art av Renilla som kallas för "Renilla reniformis", även känd som "den blå lysande sjöstjärnan". Denna art producerar ett protein som kallas för "Renilla luciferin" och ett enzym kallat "Renilla reniformis luciferase". När dessa två substanser interagerar i närvaro av syre och joner av metallen calcium, skapas en biokemisk reaktion som leder till att Renilla-arten lyser blått.

Denna bioluminiscens hos Renilla reniformis har använts inom forskning för att studera olika aspekter av cellulär och molekylär biologi, såsom interaktioner mellan proteiner och cellytiska processer.

Copepoda är en ordning av små, pelagiska kräftdjur som tillhör klassen Maxillopoda. De flesta arterna är planktoniska och förekommer i alla typer av vattenmiljöer, från sötvatten till marina habitat. Copepoderna utgör en viktig del i nästan alla ekosystem som innehåller vatten, eftersom de är en viktig källa till föda för många andra djur, bland annat fiskar och valar.

Copepoderna har ett kompakt kroppsformat med två taggar bakom huvudet och fem par extremiteter som används för simning och födosök. De flesta arterna är hermafroditer, men det finns också arter där hanar och honor skiljer sig åt. Copepoderna livnär sig främst på plankton, men vissa arter kan även vara rovdjur som tar andra små kräftdjur eller ägg.

Copepoderna är också viktiga för det globala koldioxidcykeln, eftersom de tillsammans med andra zooplankton deltar i att transportera kol från ytan ner till djuphavet genom att sänka sig ner när de dör eller blir uppätna av andra djur. Detta hjälper till att minska mängden koldioxid i atmosfären och ökar mängden syre i vattnet.

'Aquatic organisms' are species that live in water environments, such as oceans, seas, lakes, rivers, and ponds. This category includes a wide variety of living beings, ranging from bacteria and other microscopic organisms to large marine mammals like whales and dolphins.

Aquatic organisms can be further classified into several groups based on their specific characteristics and adaptations to their environment. Some examples include:

* Plankton: small organisms that float in the water column, including both plants (phytoplankton) and animals (zooplankton).
* Nekton: actively swimming aquatic animals, such as fish, squid, and marine mammals.
* Benthos: organisms that live on or near the bottom of a body of water, including both plants (like seaweed) and animals (like crabs, mussels, and starfish).
* Neuston: organisms that live at the air-water interface, such as certain types of insects and small fish.

Aquatic organisms play a critical role in maintaining the health and balance of aquatic ecosystems, providing food and habitat for other species and contributing to important processes like nutrient cycling and carbon sequestration. They also have significant cultural, recreational, and economic value for humans, serving as sources of food, medicine, and inspiration for art and literature.

'Photobacterium' är ett släkte av gramnegativa, aeroba eller fakultativt anaeroba, stavformade bakterier som tillhör familjen Vibrionaceae. Dessa bakterier är vanligen bioluminescenta och förekommer naturligt i marina miljöer, där de lever symbiotiskt med djur som lever på havsbottnen. Exempel på kända arter inom släktet 'Photobacterium' är 'Photobacterium phosphoreum' och 'Photobacterium leiognathi'. Dessa bakterier kan orsaka infektioner hos människor, ofta associerade med vattenburna aktiviteter som simning eller fiske.

'Luminisceraende medel' är ett medicinskt begrepp som refererar till substanser eller preparat som kan avge ljus när de exponeras för vissa stimuli, vanligtvis mekanisk påverkan eller elektromagnetisk strålning. Detta fenomen kallas luminiscens.

I en medicinsk kontext används luminisceraende medel ofta i diagnostiska procedurer för att undersöka olika strukturer och funktioner i kroppen. Exempel på sådana preparat inkluderar:

1. Fluorescein: Detta är ett grönt fluorescerande ämne som används vid fluoresceinangiografi för att undersöka blodflödet i ögats retina och kärl. När fluoresceinet exponeras för blått ljus avger det ett grönt ljus, vilket gör att blodkärlen kan ses tydligare under mikroskopi.
2. Radioaktivt luminisceraende medel: Dessa preparat innehåller radioaktiva isotoper som avger gammastrålning när de bryts ned. När de injiceras i kroppen kan de följas med en gammakamera för att undersöka olika organ och vävnader, till exempel vid skelettscanningar eller hjärtstudier.
3. Kautschukluminiscens: Detta är ett ämne som används i vissa latexhandske tillverkare för att underlätta identifiering av mikroskopiska hål och skador på handskenorna. När handskeexponeras för ultraviolett ljus (UV-ljus) avger det ett blått ljus, vilket gör att eventuella skador kan upptäckas lättare.

Det är viktigt att notera att användningen av luminisceraende medel måste ske under kontrollerade förhållanden och under övervakning av kvalificerad personal, eftersom de kan innehålla radioaktiva ämnen eller andra skadliga substanser.

Photorhabdus är ett släkte av gramnegativa, fakultativt anaeroba bakterier som tillhör familjen Enterobacteriaceae. Dessa bakterier lever i symbios med entomopatogena (insektsdödande) nematoder av släktet Heterorhabditis. När ett insekt infekteras av nematoden, frigörs Photorhabdus-bakterierna och producerar toxiner som dödar insekten. Därefter bryts kroppen ner av bakterierna och näringsupptaget används för att föda upp ytterligare nematoder.

Photorhabdus-bakterier är intressanta på grund av deras unika livscykel och deras potential som biologiska kontrollmedel mot skadeinsekter. Dessutom har de visat sig producera en rad bioaktiva molekyler med möjligheter inom medicinsk forskning, till exempel antibiotika och antitumörmedel.

Protein renaturation refererar till processen där ett protein som har blivit denaturerat (dvs fått sin naturliga tredimensionella struktur förlorad orsakat av exempelvis höga temperaturer, förändrade pH-värden eller kemiska ämnen) återfår sin ursprungliga konformation och funktion. Denna process kan ske spontant under specifika villkor, till exempel genom att gradvis sänka temperaturen och/eller återställa den ursprungliga pH-balansen. Proteinrenaturation är en viktig aspekt inom biokemi och molekylärbiologi, eftersom proteiner måste ha rätt konformation för att kunna utföra sina funktioner korrekt.

I medicinsk kontext, refererar "färg" ofta till olika färger av kroppsvävnader, kroppsfluider eller hudmönster som kan vara antingen fysiologiska (normala) eller patologiska (abnorma). Exempel på detta inkluderar:

1. Livmoderfärg: Den normala färgen på livmoderslemhinnan är röd, men under menstruationen kan den bli brunaktig. Abnorma livmoderfärger kan vara tecken på patologiska tillstånd som exempelvis endometrit eller cancer.

2. Hudadgångar: Vissa hudförändringar kan vara antingen röda, vita, bruna eller svarta beroende på deras orsak. Exempelvis kan rödaktiga hudadgångar vara tecken på inflammation eller infektion, medan vitaktiga hudadgångar kan indikera vitiligo eller pigmentförlust.

3. Ögonfärger: Även om ögonfärgen inte är direkt kopplad till en specifik medicinsk diagnos, kan vissa ögonfärger vara associerade med specifika genetiska förutsättningar eller sjukdomar. Exempelvis kan albinism orsaka ljusgrå ögonfärg.

4. Urinfärg: Den normala urinfärgen är gulaktig, men vissa abnorma urinfärger kan indikera specifika sjukdomar eller tillstånd. Exempelvis kan blod i urinen orsaka en rödaktig eller rosa färg, medan protein i urinen kan ge en skummig konsistens och en brunfärgad nyans.

I allmänhet är observationen av olika färger viktiga för att ställa diagnoser, övervaka behandlingar och bedöma prognoser inom medicinen.

'Enzymstabilitet' refererer til den grad av motstand enzymet har mod den inaktivering eller denaturering som kan ske under forskjellige vilkår, så som temperatur, pH, saltkoncentrasjon og påvirkning fra håndterings- eller lagringsforhold. Jo mer stabil et enzym er, desto bedre beholder det sin aktivitet under lengre tid, når det utsatt for varierende vilkår. Enzymers stabilitet kan ha betydning for deres effektivitet i biokjemiske prosesser og industrielle anvendelser.

'Vibrio' är ett släkte av gramnegativa, spiral- eller rakformade, fakultativt anaeroba bakterier som normalt förekommer i vattenmiljöer, särskilt i kustnära och marina ekosystem. Många arter av Vibrio är kända för att orsaka sjukdomar hos människor och djur, framför allt Vibrio cholerae, som orsakar koleran, en akut diarréisk sjukdom. Andra patogena arter inkluderar Vibrio vulnificus och Vibrio parahaemolyticus, vilka kan orsaka allvarliga infektioner i mag-tarmkanalen och huden, särskilt hos personer med nedsatt immunförsvar eller vid öppna sår.

Luminiscenerande proteiner är proteiner som kan producera ljus genom ett biokemiskt process. Det mest välkända exemplet på ett luminiscenerande protein är gröna fluorescerande protein (GFP) som originallyt hittades i en marin svampart, Aequorea victoria. När GFP exponeras för blått eller ultraviolett ljus kommer det att emittera grön ljus. Luminiscenerande proteiner används ofta som markörer inom biologisk forskning för att studera olika cellulära processer och interaktioner.

Rapportörgener (engelska: *reporting genes*) är inom genetiken benämning på gener som kodar för proteiner eller RNA-molekyler som har en funktion att rapportera information från cellen till omgivningen. Detta kan ske genom att de aktiverar olika signaltransduktionsvägar, exkretion av signalsubstanser eller andra mekanismer. Exempel på sådana gener inkluderar generna för cytokiner, interferoner och neuropeptider. Rapportörgener spelar en viktig roll i cellkommunikationen och koordineringen av olika fysiologiska processer i kroppen.

En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.

Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.

Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.

I medicinen refererer kinetik specifikt till läkemedelskinetik, som är studiet av de matematiska modellerna som beskriver hur ett läkemedel distribueras, metaboliseras och utsöndras i en levande organism. Det finns fyra huvudsakliga faser av läkemedelskinetik:

1. Absorption (absorption): Hur snabbt och effektivt absorberas läkemedlet från gastrointestinal tract till blodomloppet.
2. Distribution (distribution): Hur snabbt och i vilken utsträckning fördelar sig läkemedlet i olika kroppsvävnader och vätskor.
3. Metabolism (metabolism): Hur snabbt och hur påverkar läkemedlets kemiska struktur i kroppen, ofta genom enzymer i levern.
4. Elimination (elimination): Hur snabbt och effektivt utsöndras läkemedlet från kroppen, vanligtvis via urin eller avföring.

Läkemedelskinetiken kan påverkas av många faktorer, inklusive patientens ålder, kön, genetiska variationer, lever- och njurfunktion samt andra läkemedel som patienten tar.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

'Sequencing' är ett begrepp inom genetiken som refererar till metoder för bestämandet av raka rader (sekvenser) av nukleotider, de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA. 'Sequencing' används ofta för att undersöka gener och andra delar av DNA för att få information om deras struktur, funktion och evolutionära utveckling.

'Sekvensinpassning' (engelska: sequence alignment) är en metod inom bioinformatiken som används för att jämföra två eller flera DNA- eller proteinsekvenser för att hitta likheter och skillnader mellan dem. Genom att jämföra sekvenser kan forskare identifiera konserverade regioner, mutationer, evolutionära relationer och möjliga funktionella roller.

Sekvensinpassning kan användas för att undersöka olika aspekter av DNA- eller proteinsekvenser, till exempel struktur, funktion, evolutionärt ursprung och släktskap. Det är en viktig metod inom komparativ genetik, molekylär evolution och strukturell biologi.

I sekvensinpassning jämförs två eller flera sekvenser med varandra genom att lägga till luckor (gaps) i sekvenserna för att matcha upp dem så bra som möjligt. Det finns två huvudtyper av sekvensinpassning: global och lokal. Global inpassning jämför hela sekvenserna med varandra, medan lokal inpassning endast jämför delar av sekvenserna där likheter finns.

Sekvensinpassning kan användas för att hitta homologa sekvenser (sekvenser som har gemensam evolutionärt ursprung), identifiera mutationer och andra variationer, och studera evolutionära relationer mellan olika arter eller populationer. Det kan även användas för att förutsäga struktur och funktion hos okända sekvenser genom att jämföra dem med kända sekvenser med liknande egenskaper.

Rekombinanta proteiner är proteiner som har skapats genom tekniker för genetisk rekombination, där man kombinerar DNA-sekvenser från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskvärda egenskaper. Denna teknik möjliggör produktionen av stora mängder specifika proteiner med konstant och predikterbar struktur och funktion. Rekombinanta proteiner används inom flera områden, till exempel inom medicinen för framställning av läkemedel som insulin, vaccin och enzymer.

"Bindningsplatser" är ett begrepp inom strukturell biokemi och molekylärbiologi som refererar till de specifika områdena på en molekyl där den binder till en annan. Dessa bindningsplatser kan finnas på proteiner, DNA, RNA eller andra biomolekyler. De består ofta av aminosyrorsekvenser eller nukleotidsekvenser som har förmågan att känna igen och binda till specifika strukturella egenskaper hos en annan molekyl.

I proteiner kan bindningsplatser vara exponerade på proteinytan eller inbäddade i proteinets tredimensionella struktur. De kan vara specialiserade för att binde till små molekyler, joner, andra proteiner, DNA eller RNA. I DNA och RNA kan bindningsplatser bestå av komplementära baspar som möjliggör specifik bindning mellan två komplementära strängar.

Kännedom om bindningsplatser är viktigt inom forskning och medicinsk applikation, eftersom det kan användas för att utveckla läkemedel som binder till specifika proteiner eller andra molekyler i kroppen. Det kan också hjälpa till att förstå hur genuttryck regleras och hur signaleringsvägar fungerar inom celler.