Nukleosiddeaminas är en typ av enzym som katalyserar reaktioner där en aminogrupp i en nukleosid substitueras med ett annat gruppering, vanligtvis en oxygen- eller svavelgrupp. Denna reaktion resulterar i konverteringen av den ursprungliga nukleosiden till en nukleosiddeamin som innehåller en ny funktionell grupp. Nukleosiddeaminaseryt spelar en viktig roll i celldelningen, DNA-reparation och immunförsvaret.
Nukleosid är en organisk komponent i nukleotider, som i sin tur är byggstenarna i nukleinsyror såsom DNA och RNA. Nukleosider bildas genom kondensation av en pentos (en fem-kolmon sugarkedja) med en heterocyklisk bas, vanligtvis adenin, guanin, cytosin, uracil eller tymin. Exempel på nukleosider är adenosin, guanosin, cytidin och uridin.
Ett enzym som katalyserar deaminering av cytidin, varvid bildas uridin. EC 3.5.4.5.
Ett enzym som katalyserar hydrolys av adenosin till inosin med eliminering av ammoniak. Enzymet uppvisar stora vävnads- och artsvariationer, och har därför använts i genetiska studier och som diagnost iskt verktyg. EC 3.5.4.4.
RNA editing refererer til den proces, hvor der foretages ændringer i det posttranskriptionelle RNA, før det oversættes til protein. Dette kan involvere indsættelse, deletyion eller substitution af nukleotider, der resulterer i en forandring af aminosyresekvensen i det endelige protein. Den mest almindelige form for RNA editing hos pattedyr er den reversible konvertering af adenosin (A) til inosin (I), katalyseret af enzymerne ADAR (Adenosine Deaminases Acting on RNA). Inosin kan derefter behandles som guanosin under oversættelsesprocessen, hvilket resulterer i en aminosyreforandring i det endelige protein.
Nukleotiddeaminasering är ett enzymkatalyserat biokemiskt förlopp där en aminogrupp (−NH2) i en nukleotid byts ut mot ett oxygenatom (=O). Detta leder till att basen i nukleotiden ändras, vilket kan ha konsekvenser för dess funktion inom DNA eller RNA. Deaminasering av DNA-nukleotider kan leda till mutationer, medan deaminasering av RNA-nukleotider kan påverka RNAs sekundärstruktur och/eller translationsprocessen.
Cytosin demethylation är ett biologiskt process där metylgrupper (–CH3) avlägsnas från cytosinbaser i DNA:t, vanligtvis vid CpG-rikedomar i genomet. Denna process spelar en viktig roll för epigenetiska regleringar av genuttryck och cellulär differensiering.
Purine nucleosides are biological compounds consisting of a purine base (adenine or guanine) linked to a pentose sugar, specifically ribose in the case of purine nucleosides.
Avlägsnande av en aminogrupp (NH2) från en kemisk förening.
Pyrimidine nucleosides are organic compounds consisting of a pyrimidine base (such as thymine, cytosine, or uracil) linked to a sugar molecule, typically ribose or deoxyribose, via a beta-N-glycosidic bond.
Nucleoside transport proteins (NTPs) are membrane-bound proteins responsible for facilitating the bidirectional movement of nucleosides and their analogs across the cell membrane. They play a crucial role in maintaining nucleoside homeostasis within cells, as well as in the uptake of nucleoside-based drugs used in chemotherapy. NTPs are essential for the survival of all organisms, from prokaryotes to humans.
En purinnukleosid med hypoxantin bundet med N9-väteatomen till kol C1 i ribos. Den utgör ett mellanleed i nedbrytningen av puriner och purinnukleosider till urinsyra samt i purinsparande reaktionsförlopp. Den finns också i antikodonet hos vissa tRNA-molekyler.
En aminohydrolase är ett enzym som bryter ned aminosyror genom att hydrolysera (splittra upp med vatten) en peptidbindning eller en sidokedja, vilket resulterar i att en aminosyra omvandlas till en annan. Denna kategori inkluderar enzymer som metionininase och asparaginasinase.
En undertyp av ekvilibrativa nukleosidtransportproteiner som lätt hämmas av 4-nitrobensyltioinosin.
'Vif gene products in Human Immunodeficiency Virus (HIV)' refers to the proteins produced by the viral infectivity factor (Vif) gene of HIV. The Vif protein is involved in the packaging and replication of the virus within host cells. It plays a crucial role in counteracting the antiviral defense mechanism of the host by targeting and degrading a cellular protein called APOBEC3G, which would otherwise restrict viral replication. By doing so, Vif ensures efficient HIV replication and contributes to the pathogenesis of HIV infection.
En pyrimidinnukleosid som består av basen cytosin, kopplad till D-ribos, ett socker med fem koldelar.
Tioinosin är ett organisk förening som består av en heterocyklisk bensendion-ring, innehållande två svavelatomer och en inosin-grupp. Det är ett nukleosid som bildas genom kondensation av svavelkvävebasen tiobase (4-thiouracil) med ribose-sötningsmedlet. Tioinosin har visats ha potential som antiviral, antibakteriell och antitumörmedel i vissa studier, men det används inte rutinmässigt inom klinisk medicin på grund av dess okända säkerhets- och effektprofil hos människor.
Purine nucleoside phosphorylase (PNP) är ett enzym som katalyserar nedbrytningen av purinbaserade nukleosider till deras respektive bas och ribosa-1-fosfat. Detta enzym spelar en viktig roll i purinn metabolism, speciellt inom immunsystemet där det hjälper till att reglera aktiviteten hos vissa typer av vita blodkroppar genom att kontrollera nivåerna av dess substrat.
En nukleosid bestående av adenin och d-ribos. Adenosin och dess derivat spelar många viktiga biologiska roller, förutom att ingå i DNA och RNA. Adenosin är en neurotransmittor.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Adenosine deaminase inhibitors are a class of medications that work by blocking the action of the enzyme adenosine deaminase, which is responsible for breaking down the molecule adenosine in the body. By inhibiting this enzyme, adenosine deaminase inhibitors increase the levels of adenosine in the body, which can have various therapeutic effects.
Ett enzym som katalyserar deaminering av guanin till att bilda xantin. EC 3.5.4.3.
Ett 23 kD-reglerprotein av betydelse för infektionsförmågan hos HIV. Proteinet återfinns i cytoplasman i HIV-infekterade celler, men är inte helt nödvändigt för viruspartikelbildning.
En purinnukleosid bestående av guanin bundet via sitt N9-kväve till C1-kolet i ribos. Guanosin ingår i RNA, och dess nukleotider har stor betydelse i ämnesomsättningen.
Nukleosiddifosfatkinas (NDK) är ett enzym som katalyserar överföringen av en fosfatgrupp från ATP till nukleosiddifosfater, vilket resulterar i produktionen av triphosphatnukleotider. Denna reaktion är viktig för energiproduktion och syntesen av nukleinsyror inom celler.
Uridin är ett nucleosid som består av en pyrimidinbas (uracil) kovalent bundet till en femtoribos (ribose) via en beta-N1-glykosidbindning. Det förekommer naturligt i RNA och har en central roll i cellers proteinsyntes som en del av transfer-RNA (tRNA).
Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.
Typarten för Lentivirus och orsaken till immunbristsyndromet AIDS. Virusets kännetecken är dess cytopatiska effekt och affinitet för T4-lymfocyter.
Nucleoside Q, också känt som "Nuc" eller "Q Nucleoside," är ett experimentellt antiviralt läkemedel som är under utveckling för behandling av HIV-infektioner. Det består av en modifierad form av nucleosid, som är en byggsten i DNA och RNA.
"Double-stranded RNA (dsRNA) is a type of Ribonucleic acid molecule where two complementary strands of RNA are aligned in an antiparallel manner, forming a double helix structure, often involved in genetic regulation and defense mechanisms against viral infections."
L-serine hydroxymethyltransferase (L-serindehydratase) är ett enzym som katalyserar omvandlingen av L-serin till glycin och en formaldehydgrupp i metabolismen av aminosyror. Detta enzym spelar därför en viktig roll i syntesen av glycin, en av de simplaste aminosyrorna som är involverad i produktionen av proteiner, neurotransmittorer och andra biologiskt aktiva ämnen i kroppen.
Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
En undertyp av ekvilibrativa nukleosidtransportproteiner som är okänsliga för 4-nitrobensyltioinosin.
Nukleosidtrifosfataser (NTPaser) är en grupp enzymer som katalyserar hydrolysen av nukleosidtrifosfater till nukleosidmonofosfater, frisättande två fosfatgrupper. Denna reaktion spelar en viktig roll i cellers energibalans och metabolism.
Ribonucleosides are organic compounds that consist of a ribose sugar molecule bonded to a nitrogenous base, specifically adenine, guanine, uracil, or cytosine in the case of RNA. They play a crucial role in various biological processes, such as encoding genetic information, catalyzing chemical reactions, and serving as cofactors for enzymes.
Nukleotider är de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA, molekyler som lagrar genetisk information och kodar för proteiner. En nukleotid består av en pentos-socker (ribosa eller deoxyribosa), en fosfatgrupp och en nitrogenbas. Nitrogenbaserna kan vara adenin, guanin, cytosin och uracil i RNA eller thymin i DNA. Nukleotider kopplas samman med varandra genom fosfatbrückor mellan sockerstrukturerna och bildar på så sätt långa polymerkedjor.
Varje påvisbar och ärftlig förändring i det genetiska materialet som medför ändrad genotyp och som överförs till dotterceller och efterföljande generationer.
Ett enzym som katalyserar deaminering av AMP till IMP. EC 3.5.4.6.
Pyrazolopyrimidinribonukleosider från Nocardia interforma. De har antitumör- och cytostatisk verkan.
Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.
Pentosyltransferases are a group of enzymes that catalyze the transfer of a pentose sugar molecule from an activated donor to a specific acceptor molecule, such as a nucleotide or a polysaccharide. These enzymes play important roles in various biochemical pathways, including the biosynthesis of nucleic acids, glycoproteins, and other complex carbohydrates.
NM23 nucleoside diphosphate kinases are a group of enzymes that play a role in regulating the intracellular concentrations of nucleoside tri- and diphosphates, which are important for various cellular processes including DNA replication, repair, and translation. The NM23 protein was originally identified as a potential metastasis suppressor gene, but its exact function in cancer biology is still not fully understood. There are several isoforms of the NM23 protein, with NM23-H1 being the most well-studied. In addition to its enzymatic activity, NM23 has been shown to have non-enzymatic functions, such as acting as a transcriptional regulator and modulating cell adhesion and motility.
En reverstranskriptasahämmare är ett antiviralt läkemedel som specifically inhibits the reverse transcriptase enzyme, thereby preventing retroviruses like HIV from converting their RNA genome into DNA and integrating it into the host cell's genome. (18 words)
En klass natrium-oberoende nukleosidtransportörer.
I medicine refererer "cellinje" til en gruppe af celler med ensartet funktion og opbygning, der samarbejder for at udføre en specifik biologisk proces eller opgave i et levende organisme. Celliner er ofte specialiserede i deres struktur og funktion for at udføre deres rolle effektivt, og de kan findes i alle levende organismer, fra encellet bakterie til komplekse flercellede dyr og planter.
Alu-sekvensfamiljen (så benämnd efter restriktionsenzymet Alu 1) är ett höggradigt konserverat och det mest upprepade spridda repetitionselementet i människan (mer än en miljon kopior). Den härrör frå n 7SL-RNA-komponenten i den signaligenkännande partikeln och innehåller en RNA-polymeras III-promotor. Transposition av detta element i genernas kodnings- eller regulatorregioner ligger bakom många är ftliga sjukdomar.
En purin- eller pyrimidinbas bunden till deoxiribos.
Experimentella eller teoretiska modeller för undersökning av molekylers form, elektroniska egenskaper eller interaktioner. Hit hör även analoga molekyler, datorframställd grafik och mekaniska strukturer.
"Virusförökning är ett biologiskt process där en infekterad värdcell tvingas producera flera kopior av det virala genomet och dess proteiner, vilket resulterar i att den cellen till slut bursts och frisätter de nya viruspartiklarna för att infektera andra oskyddade celler."
Adenosinmolekyler som kan ha ersättningar i samtliga positioner, men som saknar en hydroxylgrupp i ribosdelen.
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
RNA, eller Ribonukleinsyra, är ett biologiskt molekyll som består av en lång kedja av nukleotider. Det spelar en central roll i cellens proteinsyntes genom att transkribera DNA:t till mRNA (messenger RNA), som sedan kan översättas till protein av ribosomer. RNA förekommer också i andra funktioner, såsom reglering av genuttryck och katabolism av signalsubstanser.
En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.
En viktig purinbas. I djur- och växtceller förekommer det vanligen kondenserat med ribos eller deoxyribos i nukleosiderna adenosin och deoxyadenosin. Det är således en komponent i nukleinsyror, vissa nukleotider och många koenzymer. Det finns i bukspottkörteln och mjälten.
Kranskärlsutvidgande medel med viss antiarytmiverkan.
I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.
De reaktiva områden på en makromolekyl som är direkt envolverade i dess specifika sammankoppling med en annan molekyl.
Nukleosider som förlorat två hydroxigrupper från sockerdelen. De flesta av dessa föreningar har bredspektrumverkan mot retrovirus tack vare sin antimetabola effekt. Nukleosiderna fosforyleras intracellulärt till 5'-trifosfat och hämmar omvänd transkription hos virus genom att bilda kedjeavslutningar.
Tubercidin är ett toxin som produceras av aktinomycetbakterien Streptomyces tubercidicus och kan också hittas i vissa svampar. Det är en typ av nucleosid, vilket betyder att det består av en sockerdel (ribos) kopplad till en heterocyklisk bas. I detta fall är basen adenin, så tubercidin är strukturellt sett mycket likt den naturliga nukleosiden adenosin.
"RNA (Ribonucleic acid) är ett ensträngat nucleotidmolekylt som fungerar som genetisk budbärare i celler, transportierande genetisk information från DNA till ribosomer under protein syntesprocessen."
Zidovudin, även känt som AZT, är ett antiviralt läkemedel som används för att behandla HIV-infektioner. Det fungerar genom att hämma enzymet reverse transcriptas, vilket HIV behöver för att replikera sin DNA och sprida sig i kroppen. Zidovudin kan inte bota HIV eller AIDS, men det kan hjälpa till att fördröja sjukdomens framskridande och förbättra livskvaliteten hos de drabbade.
Det område i ett enzym som genom verkan på sitt substrat utlöser en enzymreaktion.
Nukleosider där arabinos utgör sockerdelen.
Medel för förebyggande eller behandling av virussjukdomar. De kan ha olika verkningsmekanismer. Vissa hindrar virusreplikation genom att hämma DNA-polymeras; andra binder till specifika cellyterecepto rer och hindrar penetration eller höljeförlust; ytterligare andra hindrar viral proteinsyntes eller blockerar virussammansättningen.
Repressorproteiner är proteiner som binds till specifika DNA-sekvenser och hämmar transkriptionen av ett visst genetiskt material, vilket leder till nedreglering av genuttrycket för de gener som kontrolleras av dessa repressorproteiner.
I en enkel medicinsk definition kan puriner definieras som en grupp av organiska föreningar som inkluderar baserna adenin och guanin, vilka är viktiga beståndsdelar i nukleotider och nukleotidkvävesyror. Dessa molekyler har en central roll i cellers energimetabolism, signaltransduktion och DNA- och RNA-syntes. Puriner kan också fungera som signalsubstanser som frisätts från celler under vissa fysiologiska och patofysiologiska tillstånd, och de har potentialen att modulera immunresponsen och inflammationen.
Zink är ett essentiellt spårmineral som spelar en viktig roll i en mängd biologiska processer, såsom immunförsvar, näringsupptagning, celldelning, cellreparation och syntes av DNA. Det fungerar också som en katalysator för enzymer och hjälper till att stabilisera cellmembranen. Zink måste tas in via födan, eftersom kroppen inte kan producera det själv.
Ett enzym som reversibelt katalyserar fosforyleringen av deoxicytidin så att det bildas ett nukleosiddifosfat och deoxicytidinmonofosfat. Också cytosinarabinosid kan fungera som mottagare. Alla naturliga nukleosidtrifosfater, utom deoxicytidintrifosfat, kan vara givare. Enzymet aktiveras av vissa virusarter, i synnerhet herpes simplexviruset (Herpesvirus hominis). EC 2.7.1.74.
"Tertiär proteinstruktur refererar till den tresdimensionella formen och flexibiliteten hos ett protein, som resultat av specifika interaktioner mellan dess sekundära strukturelement, såsom alfa-helixar och beta-skikt."
Den första, kontinuerligt odlade cellinjen av humana, maligna celler, vilka kom från ett livmoderhalskarcinom hos "Henrietta Lacks". Cellerna används för virusodling och testning av cancerpreparat.
Organofosphonater är en grupp kemiska föreningar som innehåller en organisk grupp bundet till en fosfonatgrupp. De är bland annat kända för sin användning som insecticider, herbicider och nervgaser. Organofosphonater fungerar som inhibitorer av acetylkolinesteras, ett enzym som är viktigt för att reglera signalsubstanser i nervsystemet. När acetylkolinesterasen hämmas kan det leda till ökad koncentration av den signalsubstans som kallas acetylkolin, vilket kan orsaka symtom som muskelspasmer, svårigheter att andas och i värsta fall dödsfall.
I en enkel mening kan "nukleinsyrakonfiguration" referera till den specifika rymden eller position som en nukleotid eller ett baspar tar upp i en nukleinsyra, såsom DNA eller RNA. Detta inkluderar vilken sida av strängen varje nukleotid befinner sig på, och i vilket läge de är rotade. I DNA utgörs konfigurationen ofta av en dubbelhelix med antiparallella strängar, där varje baspar består av en adenin (A) som parar sig med en timin (T), och en guanin (G) som parar sig med en cytosin (C). I RNA är konfigurationen ofta en enkelsträngad helix, där uracil (U) ersätter timin (T) som basparningspartner till adenin (A).
Pyrimidine phosphorylases are a group of enzymes that play a crucial role in the metabolism of pyrimidines, which are nitrogenous bases found in nucleic acids such as DNA and RNA. These enzymes catalyze the reversible reaction of phosphorolysis, in which a pyrimidine nucleoside is broken down into a pyrimidine base and a sugar phosphate using inorganic phosphate.
Tymidin är en naturligt förekommande nukleosid som består av pyrimidinbasen tymin och den femvärda sockerarten deoxiribos. Tymidin spelar en viktig roll i DNA-syntesen och är ett av de fyra building blocken (nukleotiderna) som bygger upp DNA-molekylen.
Deoxiribonukleinsyra som utgör arvsmassan hos virus.
Det spektrum av HIV-infektioner som sträcker sig från asymtomatiska seropositiva tillstånd över AIDS-relaterade komplex (ARC) till AIDS.
Vanliga proteinstrukturer, sammansatta av enkla kombinationer av angränsande, sekundära strukturer.
Tiotionucléosidos är syntetiska nukleosidanaloger där sugergruppen i den naturliga nukleosiden ersatts med en tiosulfatgrupp (-SSO3H). Dessa substansier har visat sig vara effektiva som radiosensitizer, det vill säga de ökar verkan av joniserande strålning på cancerceller. Denna egenskap gör dem användbara i kombination med strålbehandling vid vissa typer av cancer.
En deoxiribonukleotidpolymer som utgör den grundläggande genetiska substansen i alla celler. Eukaryota och prokaryota organismer har normalt sitt DNA ordnat i dubbelsträngade strukturer, men i många viktiga biologiska processer ingår under vissa skeden enkla strängar. DNA, som består av en flersockerarts-fosfatstam med utskott av puriner (adenin och guanin) och pyrimidiner (tymin och cytosin), bildar en dubbelspiral som hålls ihop med vätebindningar mellan purinerna och pyrimidinerna (adenin mot tymin (AT) och guanin mot cytosin (GC)).
Ribonucleotider är building blocks, eller byggstenar, i RNA (Ribonukleinsyra), en viktig biomolekyl som spelar en central roll i cellens proteinsyntes och genuttryck. Varje ribonukleotid består av en ribos och en nucleotidbas – adenin, uracil, guanin eller cytosin – bundna till varandra via en fosfatgrupp.
2'-deoxiuridin. En antimetabolit som omvandlas till deoxiuridintrifosfat vid DNA-syntesen. Undertryckande av deoxiuridin används för laboratoriediagnostik av megaloblastanemier till följd av brist på vitamin B12 och folat.
Zalcitabine är ett antiviralt läkemedel som används i behandlingen av HIV-infektion. Det fungerar genom att hämta virusets förmåga att replikera sig inne i den infekterade cellen. Zalcitabin tillhör en grupp av läkemedel som kallas reverst transkriptas-hämmare (RTIs).
Uridinfosforylas är ett enzym som katalyserar nedbrytningen av uridinmonofosfat (UMP) till föreningarna uracil och fosfat genom att avlägsna en fosfatgrupp. Detta enzym spelar därför en viktig roll i nucleotidmetabolismen hos levande organismer.
Släktskapsförhållanden mellan grupper av organismer, baserade på deras genuppsättningar.
"Viralt RNA" refererer til RNA-molekyler som er en del av strukturen eller funksjonen på et virus. Virus er små infektiøse partikler som består av genetisk materiale (RNA eller DNA) emballert i et proteinhylle. Viralt RNA kan være enten en del av viruset selv, som ses i positive-sense enkelstrengede RNA-viruser og negative-sense enkelstrengede RNA-viruser, eller det kan være et mellemledd i replikasjonen av retrovirus, som har RNA-genomer. Viralt RNA kan også være involvert i syntesen av proteiner for viruset.
Preparat som används för att behandla AIDS och/eller bromsa HIV-infektionen. Hit räknas inte läkemedel mot symtom eller opportunistiska infektioner i AIDS.
En fosfodiesterashämmare som blockerar upptag och omsättning av adenosin i erytrocyter och kärlendotelceller. Dipyridamol förstärker även den klumpningsmotverkande effekten av prostacyklin.
"HIV-reversetranskriptase" är ett enzym som produceras av human immunodeficiency virus (HIV), ansvarigt för att transkribera viral RNA till DNA under infektionsprocessen, vilket möjliggör integration av viruset i värdcellens genetiska material och på så sätt reproduktion av viruset.
RNA-prekursorer är initialt transkriberade RNA-molekyler som ännu inte har blivit fullständigt processade och kan innehålla intronsekvenser som ska tas bort innan det resulterande, mognare RNA-molekylen kan användas i proteintranslering eller regulering av genuttryck.
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
Tyminnukleotider, eller tidigare kända som deoxyribothymidinmonofosfat (dTMP), är en typ av nukleotid som primärt förekommer i DNA-molekyler. Varje tyminnukleotid består av en sockermolekyl, en fosfatgrupp och en bas, i detta fall thymin. Thymin bildar specifika par med adenin genom komplementär basparning, vilket är en viktig del av DNA-replikation och transkription.
En grupp enzym som katalyserar hydrolys av difosfatbindningarna i sådana föreningar som nukleosiddi- och trifosfat och i sulfonylbärande anhydrider såsom adenylylsulfat. EC 3.6.
Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
Enkelsträngat, komplementärt DNA som syntetiseras utifrån en RNA-mall genom verkan av RNA-beroende DNA-polymeras. cDNA (dvs komplementärt, "complementary", DNA, inte cirkulärt DNA och inte heller C-DNA) används i en rad olika molekylära kloningsstudier och som specifik hydridiseringssond.
Utveckling på molekylär nivå i DNA-sekvenser och proteiner.
Adenosin-5´-(tetravätetrifosfat). En adeninnukleotid innehållande tre fosfatgrupper som förestrats till en sockerdel. Adenosintrifosfat har en betydande roll i ämnesomsättningen och som neurotransmitt or.
Dideoxynucleotides are synthetic analogs of nucleotides, which are the building blocks of DNA and RNA. Unlike normal nucleotides, dideoxynucleotides lack a hydroxyl group (-OH) in the 3' carbon position of the sugar molecule (deoxyribose). This structural difference makes it impossible for dideoxynucleotides to form phosphodiester bonds with subsequent nucleotides during DNA synthesis, which ultimately results in termination of the growing DNA chain.
Ett purin och intermediärt reaktionsämne i adenosinomsättningen och vid bildandet av nukleinsyror via räddningsprocessen.
Proteiner är komplexa biomolekyler, byggda av aminosyror som kedjas samman i en polymer. De utför viktiga funktioner inom levande organismers celler, såsom att fungera som strukturella komponenter, hormoner, enzymer och signalsubstanser. Proteinernas specifika aminosyrasekvens bestämmer deras tertiärstruktur och därmed också deras funktionella egenskaper.
Stavudin är ett antiretroviralt läkemedel som används för behandling av HIV-infektion. Det är en nukleosidanalog reverse transkriptas inhibitor (NRTI) och fungerar genom att hämma virusesens förmåga att replikera sin genetisk information.
Organisk bas, 6-oxi-2-aminopurin (C5H5N5O). Det ingår i guaninnukleotider.
Ett virion är den infectiva delen av ett virus, bestående av genetiskt material (DNA eller RNA) inneslutet i ett proteinhölje som kan skydda och hjälpa till vid infektion av en värdcell.
Förflyttning av ämnen, inkl. biokemiska substanser och läkemedel, genom cellmembran och epitellager, vanligen med passiv diffusion.
En nukleosid bestående av basen guanin och sockret deoxiribos.
Tiouridin är ett derivat av pyrimidin, som är en grundläggande byggsten i nukleotider och därmed också i nukleinsyraer som DNA och RNA. Tiouridin förekommer naturligt i vissa RNA-molekyler, där det vanligen ersätter en uracilgrupp. Det har visat sig spela en viktig roll i olika cellulära processer, såsom RNA-modifiering och proteinsyntes.
Purine nucleotides are organic compounds that consist of a purine base, a sugar molecule (ribose or deoxyribose), and one or more phosphate groups. Purines include adenine and guanine, which are important components of DNA and RNA, as well as energy-carrying molecules such as ATP (adenosine triphosphate) and GTP (guanosine triphosphate). These nucleotides play crucial roles in various cellular processes, including energy metabolism, signaling, and biosynthesis.
Membranproteiner, vars främsta uppgift är att underlätta transport av molekyler genom ett biologiskt membran. Till denna stora grupp hör proteiner som medverkar i aktiv transport, passiv transport och jonkanaler.
Den inbördes placeringen av atomer, atomgrupper eller joner i en molekyl, samt antal, typ av och plats för kovalenta bindningar.
Cytidin-5'-(tetravätetrifosfat). En cytosinnukleotid innehållande tre fosfatgrupper som förestrats till sockerdelen.
Förmåga hos virus att motstå eller utveckla tolerans för kemoterapeutiska preparat eller antivirala medel. Resistensen kan förvärvas genom genmutationer.
En ganska stor grupp enzymer, omfattande inte bara dem som omvandlar fosfat, utan även difosfat,nukeotidylrester och andra. Dessa har indelats efter acceptorgrupp. EC 2.7.
En dideoxinukleosidförening, där 3'-hydroxigruppen på sockerdelen ersatts av ett väte. Denna förändring hindrar bildandet av fosfodiesterbindningar, nödvändiga för sammansättningen av nukleinsyrakedjor. Didanosin är en kraftfull hämmare av HIV-replikation som avslutar virus-DNA-kedjor genom att binda till omvänt transkriptas. Därefter metaboliseras ddl till dideoxiadenosintrifosfat, den förmodade aktiva metaboliten.
Purinbaser besläktade med hypoxantin, en mellanstegsprodukt i urinsyrasyntesen och nedbrytningsprodukt vid adeninkatabolism.
Adeninnukleotider är molekyler som består av ribose (en sockerart) och adenin (en näringsrikt aromatisk bas). De två mest förekommande formerna av adeninnukleotider är adenosindifosfat (ADP) och adenosintrifosfat (ATP), som båda spelar viktiga roller i cellens energiproduktion och energiöverföring. ATP, den energirikaste formen av adeninnukleotid, fungerar som en direkt källa till energibehov i celler genom att släppa ifrån sig ett fosfatgrupp (i en reaktion katalyserad av ATPas) och omvandlas till ADP. Energin frigjord i denna process används för att driva andra celulära processer som kräver energi, såsom muskelkontraktioner, transport över cellmembran och syntes av andra molekyler. ADP kan sedan regenereras tillbaka till ATP

Nukleosiddeaminas är en typ av enzym som katalyserar reaktioner där en aminogrupp i en nukleosidmolekyl ersätts av ett hydroxylgrupp. Detta resulterar i att nukleosiden konverteras till en nukleosiddeamin, som sedan kan konvertingas till en nukleotiddeamin via en process som kallas nukleotiddeaminering.

Nukleosiddeaminaseryreaktioner spelar en viktig roll i cellens normala funktion och metabolism, men de kan också vara involverade i patologiska processer, såsom cancer och virusinfektioner. Ett exempel på ett nukleosiddeaminas som är känt för att spela en roll i cancerutveckling är AID (aktiverad immundefektförmedlad idiopatisk inflammatorisk vesikelbildning), som aktiveras under B-cellernas differentiering och kan orsaka mutationer i DNA som leder till onkogenesis.

Andra exempel på nukleosiddeaminaser inkluderar enzymer som katalyserar konverteringen av cytidin till uridin i RNA (t.ex. CAD) och enzymer som är involverade i antivirala svar, såsom APOBEC3G, som kan orsaka mutationer i retrovirus-DNA genom att konvertera cytidin till uracil.

Nukleosider är en organisk komponent i nukleotider, som är byggstenarna i nukleinsyror såsom DNA och RNA. En nukleosid bildas genom kondensation av en pentos (en fem carbonsugar) med en heterocyklisk bas, vanligtvis adenin, guanin, cytosin, uracil eller tymin. Nukleosider spelar därför en central roll i lagring och överföring av genetisk information inom celler.

Cytidine deaminase (CDA) er ein enzym som fungerer i kroppens prosess for å bryte ned (metabolisere) bestemt type av nukleosider, specifikt cytidin og deoxicitidin. Nukleosider er byggesteiner i DNA og RNA. Cytidine deaminasen fjerner en aminosgruppe fra cytidin eller deoxicitidin, som resulterer i omsetning til uridin eller deoxyuridin. Dette kan ha betydning for behandling med visse typer av kreftmedisin, fordi det påvirkar hvor lange tid cytostatika (kreftmedisiner) som er basert på nukleosider forblir aktive i kroppen.

Det finnes to typer av cytidine deaminaser:

1. Cytidine deaminase 1 (CDA1): Denne enzymet forekommer naturligvis i leveren og andre organer, og er involvert i normal metabolisme av nukleosider.
2. Cytidine deaminase 2 (CDA2): Dette er en variant av cytidine deaminasen som forekommer i hvit blodceller (leukocytter) og kan være involvert i immunforsvaret.

Det finnes også en tredje type, APOBEC3A, som er en cytidine deaminase som spesielt er involvert i antivirale immunforsvar mot retrovirus og andre virus.

Adenosine deaminase (ADA) är ett enzym som bryter ner adenosin till inosin genom att avlägsna aminogruppen. Detta enzym finns naturligt i kroppens alla celler och är viktigt för immunsystemets funktion, särskilt för T-cellers utveckling och överlevnad.

Defekter eller mutationer i ADA-genen kan leda till ett sjukdomstillstånd som kallas adenosindeaminasdefekt (ADA-deficiens), vilket orsakar en nedsatt funktion hos detta enzym. Denna sjukdom leder till en påverkan på immunförsvaret och kan leda till svårartad kombinerad immunbrist, som kan vara livshotande om den inte behandlas. Behandlingen för ADA-deficiens innefattar ofta enzymersättningstherapi med regelbundna injektioner av fungerande ADA-enzym.

RNA editing refererer til den proces, hvor der foretages ændringer i det originale RNA-sekvens, som er blevet transkriberet fra et DNA-template. Disse ændringer kan inkludere indsættelse, udskiftning eller fjernelse af nukleotider, der resulterer i en forandret proteinsyntese. RNA-editing er særligt almindelig hos visse arter, herunder planter og insekter, men findes også hos pattedyr. Det spiller en vigtig rolle ved reguleringen af genudtryk og proteinsyntese, samt tilpasning til forskellige cellulære behov og respons på ændringer i miljøet.

Nukleotiddeaminasering är ett biokemiskt förfarande där en aminogrupp (−NH2) i en nukleotid byts ut mot ett annat funktionellt grupp, vanligtvis en hydroxylgrupp (−OH). Denna reaktion katalyseras av en specifik typ av enzymer som kallas nukleotiddeaminaser.

Det finns två huvudsakliga typer av nukleotiddeaminaser:

1. Purinnukleotiddeaminaser: Dessa enzymer katalyserar deamineringen av puriner i nukleotider, till exempel när adenin (A) deamineras till hypoxantin (Hx).
2. Pyrimidinnukleotiddeaminaser: Dessa enzymer katalyserar deamineringen av pyrimidiner i nukleotider, till exempel när cytosin (C) deamineras till uracil (U).

Det är värt att notera att nukleotiddeaminaser även kan verka på fria nukleotider och oligonukleotider utanför cellen, vilket har betydelse för vissa biologiska processer och patologiska tillstånd.

Cytosine deaminase (CDA) är ett enzym som katalyserar den spontana reaktionen där cytosin konverteras till uracil. Detta enzym förekommer naturligt i bakterier, svampar och vissa djurceller, men saknas i människor. I cancerbehandling har cytosine deaminas använts som ett enzym i immunterapi, där det konverterar det kemoterapeutiska läkemedlet 5-fluorocytosin till 5-flurouracil, vilket är en aktiv cytotoxisk metabolit.

Purine nucleosides är en typ av kemiska föreningar som består av en purinbas (antingen adenin eller guanin) förbunden till en sockerdel, ribos eller deoxyribos. De två huvudsakliga purinnukleosiderna är adenosin (med adenin som bas och ribos som socker) och guanosin (med guanin som bas och ribos som socker). Dessa föreningar spelar en viktig roll i cellers energimetabolism och som byggstenar i DNA och RNA.

In biochemistry, deamination is the removal of an amino group (-NH2) from a molecule. In the case of amino acids, this process results in the conversion of an amino acid to a keto acid. Deamination of DNA or RNA bases refers to the removal of an amine group from these molecules. This can occur as a result of natural processes, such as programmed cell death (apoptosis), or due to environmental factors like radiation and chemicals. Deamination can lead to mutations in the genetic code, which may contribute to the development of diseases, including cancer.

Pyrimidinnukleosider är en typ av nukleosid som består av en pyrimidinring kopplad till en sockergrupp, vanligtvis ribos eller deoxyribos. Exempel på naturligt förekommande pyrimidinnukleosider inkluderar cytidin och timidin. Dessa molekyler spelar en viktig roll i DNA- och RNA-syntesen, och störningar i deras metabolism kan leda till olika sjukdomstillstånd.

Nukleosidtransportproteiner (NTT) är en typ av proteiner som transporterar nukleosider, vilket är byggstenarna i DNA och RNA, genom cellytan. Dessa proteiner hjälper till att reglera nivåerna av intracellulära nukleosider och deras derivat, inklusive nukleotider, som är de föregångare som behövs för syntesen av DNA och RNA. NTT finns i alla levande celler och är viktiga för celldelning, tillväxt och utveckling. Dysfunktion eller mutationer i NTT kan leda till olika sjukdomar, inklusive neurodegenerativa störningar och cancer.

Inosin, också känt som inosin monofosfat (IMP), är ett naturligt förekommande nukleotid som hittas i alla levande celler. Det bildas i cellskelettet och är en viktig del av purinmetabolismen, som är involverad i energiproduktion och DNA-syntesen. Inosin har också visat sig ha potential som läkemedel för att behandla olika medicinska tillstånd, såsom muskelvärk och neurodegenerativa sjukdomar.

"Aminohydrolase" er en generell betegnelse for en gruppe enzymer som katalyserer hydrolyse (splitting med vann) av amider og peptidbindinger, der frigør en aminogruppe. De inkluderer enzymer som trypsin, chymotrypsin, pepsin, karboxypeptidaser og aminopeptidaser. Disse enzymer spiller en viktig rolle i fordøyelsen av proteiner og er også involvert i mange andre biokjemiske prosesser i kroppen.

Equilibrative Nucleoside Transporter 1 (ENT1) är en typ av proteiner som hjälper till att reglera transporten av nucleosider, som är byggstenarna i DNA och RNA, in och ut ur celler. ENT1 är specifikt ett protein som transporterar nucleosider genom celldelningen med hjälp av diffusion. Det gör det möjligt för celler att ta upp de nukleosider de behöver från omgivningen, samtidigt som de avlägsnar överflödiga nukleosider. ENT1 är viktig för celldelning och tillväxt, och störningar i dess funktion kan leda till cellulär dysfunktion och sjukdom.

'Vif' står för 'Viral Infectivity Factor' och är ett protein kodat av humant immunodeficiensvirus (HIV). Proteinet hjälper HIV att infektera CD4+ T-celler, en typ av vita blodkroppar som är viktiga för immunförsvaret.

Vif gör detta genom att neutralisera ett annat protein i cellen, känt som APOBEC3G, som normalt skulle hindra HIV från att infektera celler korrekt. Genom att neutralisera APOBEC3G kan HIV:s genetisk information (RNA) konverteras till DNA och integreras i värdcellens genombrott, vilket leder till produktion av fler viruspartiklar och fortsatt spridning av infektionen.

I medicinsk kontext är Vif ett viktigt mål för HIV-behandlingar eftersom blockering av dess funktion kan hämma virusets förmåga att sprida sig och orsaka skada på immunförsvaret.

Cytidin är en nucleosid som består av cytosin (en nukleotidbas) kopplad till en ribose (sönderfallsprodukt från RNA). Det bildas när cytosin kombineras med ribos via en glykosidasbindning. Cytidin spelar en viktig roll i cellers DNA- och RNA-syntes, och är också en del av koenzymet PT (tiaminpyrofosfat), som är involverad i flera metaboliska processer, särskilt kolvätets metabolism.

Tioinosin är ett läkemedel som tillhör gruppen reverser transkriptas inhibitorer. Det används främst för behandling av HIV-infektion, tillsammans med andra antivirala mediciner. Tioinosin fungerar genom att hämma enzymet reverser transkriptas, vilket är nödvändigt för HIV-viruset att reproducera sig inne i den infekterade cellen. På så sätt kan koncentrationen av virus i kroppen minska och symtomen på HIV-infektionen förbättras.

Läkemedlet ges vanligen som tablett eller intravenös injektion, beroende på formuleringen. Tioinosin kan ha vissa biverkningar, såsom illamående, diarré, trötthet och muskelvärk. Dessa biverkningar tenderar att vara milda till måttliga och försvinner ofta efter några dagar eller veckor av behandling. I sällsynta fall kan allvarligare biverkningar uppstå, såsom leverfunktionsnedsättning eller blodproppar. Därför är det viktigt att regelbundet besöka läkaren under behandlingen för att övervaka eventuella biverkningar och justera dosen om det behövs.

Purinnukleosidfosforylas är ett enzym som katalyserar nedbrytningen av puriner i celler. Puriner är en typ av nukleotider, som är byggstenarna i DNA och RNA. När celler bryts ner behövs dessa nukleotider återvinnas, och detta görs med hjälp av olika enzymer, däribland purinnukleosidfosforylas.

Specifikt katalyserar purinnukleosidfosforylas nedbrytningen av purinnukleosider till deras respektive baser och ribosa (eller deoxyribosa) socker. Detta är ett viktigt steg i cellens nukleotidåtervinning, eftersom dessa byggstenar kan användas för att syntetisera nya nukleotider när cellen behöver reparera eller skapa ny DNA eller RNA.

Det finns också en speciell form av purinnukleosidfosforylas som kallas hypoxantin-guanin-fosforibosyltransferas (HGPRT). Detta enzym katalyserar en reaktion där hypoxantin eller guanin fosforyleras till deras respektive nukleotider, inklusive inosinmonofosfat (IMP) och guanosinmonofosfat (GMP). Detta är ett viktigt steg i cellens purinnukleotidåtervinning, eftersom det möjliggör för cellen att återanvända dessa baser istället för att behöva syntetisera dem från grunden.

Adenosin är ett endogent nukleosid som består av en nucleotidbase (adenin) som är kovalent bundet till en pentos (ribose) via en β-N1-glykosidbindning. Adenosin har en central roll inom celldelenas energihushållning, då det fungerar som prekursor till adenosintrifosfat (ATP) och adenosindifosfat (ADP).

Utöver sin roll i energimetabolismen är adenosin också en viktig neurotransmittor och modulerande signalsubstans inom det centrala nervsystemet. Det fungerar som en inhibitorisk neurotransmittor och har en dämpande effekt på exciterade neuroner. Adenosinreceptorerna är måltavlor för flera läkemedel, till exempel vid behandling av arytmier (hjärtrytmrubbningar) och smärta.

I kroppen kan adenosin bildas genom nedbrytning av ATP eller genom direkt syntes från inosinmonofosfat (IMP). Nivåerna av adenosin i blodet är höga vid fysisk aktivitet och stress, då energiförbrukningen ökar. Vid sänkta nivåer av syre tillgänglighet, som under hypoxi eller ischemisk skada, kan adenosin bildas i större utsträckning genom en process som kallas för hypoxantisk nedbrytning.

I medicinsk kontext kan adenosin användas som ett läkemedel vid diagnostisering och behandling av olika hjärtsjukdomar, till exempel för att inducerara atrioventrikulär blockad eller för att behandla paroxysmal supraventrikulär tachykardi (PSVT). Adenosin ges ofta som en snabb intravenös bolus injektion och verkar genom att bromsa sinusknuten och atrioventrikulära noden, vilket kan korrigera oregelbundna hjärtrytmer eller sänka frekvensen vid tachykardi.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

Adenosine deaminase inhibitors are a class of medications that work by blocking the action of the enzyme adenosine deaminase. This enzyme is responsible for breaking down the molecule adenosine in the body. By inhibiting this enzyme, adenosine deaminase inhibitors increase the levels of adenosine in the body, which can have various effects depending on the specific medication and its intended use.

For example, one adenosine deaminase inhibitor called pentostatin is used to treat hairy cell leukemia, a type of cancer that affects white blood cells. By increasing the levels of adenosine in the body, pentostatin can help to slow the growth of cancer cells and improve symptoms.

Another adenosine deaminase inhibitor called pegylated interferon alpha-2a is used to treat chronic hepatitis C, a viral infection that affects the liver. In this case, increasing the levels of adenosine in the body can help to stimulate the immune system and enhance its ability to fight off the virus.

Like all medications, adenosine deaminase inhibitors can have side effects and may interact with other drugs or medical conditions. It is important for patients to discuss the potential risks and benefits of these medications with their healthcare provider before starting treatment.

Guanidinoaminaser (guanidine aminotransferases) är en grupp enzymer som katalyserar överföringen av guanidinogrupper mellan olika substanser i kroppen. Dessa enzymer spelar en viktig roll i metabolismen av flera biologiskt aktiva ämnen, till exempel kreatin och arginin.

Ett exempel på ett specifikt guanidinoaminas är creatin guanidinoaminas, som katalyserar överföringen av en guanidinogrupp från creatin till ornitin för att producera kreatinin och arginin.

Det är värt att notera att medicinska definitioner kan variera beroende på kontext och källa, så det kan finnas andra specifika aspekter eller betydelser av "guanidinoaminas" som inte omfattas i denna allmänna definition.

"Genprodukter" refererer til de molekyler som blir produsert i levende celler etter at gener har blitt transskribert og translert. Disse inkluderer proteiner, som er kanskje det mest velkjente eksemplet, men også andre typer av molekyler kan være genprodukter, for eksempel RNA-molekyler som rRNA og tRNA.

"Vif" står for "virion infectivity factor" og er et protein som produseres av HIV (Human Immunodeficiency Virus). Vif-proteinet spiller en viktig rolle i infeksjonsprosessen hos HIV, ved å hjelpe viruset til å overvinne cellens forsvarsmekanismer. Vif-proteinet er derfor ein del av HIV's strategi for å formidle seg mellom cellene og etterlate infeksjonen i vårt immunforsvar.

'Guanosin' är ett av de fyra nucleotidbaserna som finns i DNA och RNA. Guanosin består av en pentos sugar (ribos) som är kovalent bundet till en nucleobase, guanin. Dessa nucleotider bildar par med varandra och hålls samman av vätebindningar, där guanin alltid parar sig med cytosin. Guanosin har också en viktig roll som energibärare i cellen i form av GTP (guanosintrifosfat).

Nukleosid difosfat kinaser (NDK) är ett enzym som katalyserar överföringen av en fosfatgrupp från en nukleosid difosfat till en annan molekyl, ofta en annan nukleosid difosfat. Denna reaktion resulterar i bildandet av två nukleosid trifosfater (NTP:er). NDK spelar därför en viktig roll i regleringen av cellens energibalans och näringsmetabolism, samt i syntesen av DNA och RNA. Det finns flera olika isoformer av NDK hos människor, var och en med sina egna specifika funktioner och subcellulära lokaliseringsställen.

Uridin är ett nucleosid som består av en pyrimidinbas (uracil) kopplad till en ribosemolekyul. Det förekommer naturligt i RNA och har en viktig roll i cellers proteinsyntes och andra biokemiska processer. Uridin kan också ingå i vissa koenzymer och andra biomolekyler.

"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.

En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.

Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.

HIV-1 (Human Immunodeficiency Virus type 1) är ett retrovirus som orsakar den akuta och kroniska infektionen hos människan, vilken kan leda till sjukdomen AIDS om den inte behandlas. HIV-1 attackerar och förstör CD4+ T-celler (en typ av vita blodkroppar), som är viktiga för att koordinera immunförsvaret i kroppen. När CD4+ T-cellerna minskar i antal, blir individen alltmer immunbristig och ökar risken för opportunistiska infektioner och cancer. HIV-1 smittar vanligtvis via sexuell kontakt, blodöverföring eller från en smittad mor till ett foster eller barn under fostertiden eller amning.

I'm sorry for any confusion, but "Nucleoside Q" is not a widely recognized or established medical term or concept in nucleoside research or medicine. Nucleosides are biological compounds that consist of a pentose sugar (ribose or deoxyribose) linked to a nitrogenous base (such as adenine, guanine, cytosine, thymine, or uracil). The term "Q" does not typically denote any specific nucleoside or modification thereof.

If you have more context or information about the source of this term, I'd be happy to help you further interpret it or provide additional information.

Dubbelsträngat RNA (dsRNA) är en typ av RNA-molekyler som består av två komplementära RNA-strängar som sitter ihop och bildar en dubbelhelix, liknande DNA. Detta skiljer sig från det mesta av RNA som normalt sett är enkelsträngat och har en primär struktur som inte kan bilda en dubbelhelix. Dubbelsträngat RNA förekommer naturligt i vissa virus, där de utgör en del av deras genetiska material. Det kan även syntetiseras konstligen för att användas inom forskning och medicin, exempelvis som en del av RNA-interferens (RNAi) tekniker för att stänga av specifika gener.

L-serine är en essentiell aminosyra som spelar en viktig roll i cellers växande och delning. L-serindehydratas är ett enzym som katalyserar nedbrytningen av L-serin till pyruvat och ammoniak. Detta enzym finns naturligt i bakterier och kan användas inom bioteknik för att producera pyruvat, ett viktigt mellanprodukt inom cellens stofskifte.

En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.

Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.

Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.

Substratspecificitet betegner i farmakologi og enzyms biokemi, hvilken type af substrat (den molekyle, der binder til enzymet) et specifikt enzym er i stand til at binde sig til og katalyse en reaktion med. Enzymer er biologiske katalysatorer, der accelererer kemiske reaktioner inden for levende organismer, og hver enzym har typisk en specifik substratspecificitet, der bestemmer, hvilken type af molekyler, den kan arbejde på.

Substratspecificiteten for et enzym kan være meget snæver, så det kun kan binde sig til én specifik molekyletype, eller den kan være bredere, så det kan binde sig til flere relaterede molekyler. Substratspecificiteten af et enzym kan blive fastlagt ved at undersøge, hvilke substrater det kan binde sig til og katalysere en reaktion med under specifikke betingelser.

Det er vigtigt at notere, at substratspecificiteten for et enzym ikke altid er absolut. I nogle tilfælde kan et enzym have en vis grad af fleksibilitet og være i stand til at binde sig til og katalysere reaktioner med substrater, der ikke er helt identiske med dets normale substrat. Dette kaldes undertiden for "promiskuitet" eller "krydsreaktivitet".

Equilibrative Nucleoside Transporter 2 (ENT2) är en protein som fungerar som en transportör för överföringen av nucleosider (kvävebaser kopplade till en ribose eller deoxyribose sockel) in och ut av celler. ENT2 är specifikt ett exempel på en equilibrativ transporter, vilket innebär att den medierar diffusionen av substanser över cellmembranet i en gradient-beroende modell, där transporten sker från högre koncentration till lägre koncentration.

ENT2 är belägen i cellmembranet och transporterar både naturligt förekommande nucleosider, som adenosin och guanosin, samt läkemedel som används för att behandla sjukdomar såsom cancer och virusinfektioner. Genom att kontrollera cellulärt inflöde av dessa substanser kan ENT2 spela en viktig roll i regleringen av celldifferentiering, celldödlighet och cellyttuppförsel.

Det är värt att notera att ENT2 har visat sig ha en speciell affinitet till puriner (kvävebaser som innehåller en ring med två kväveatomer), såsom adenosin och guanosin, jämfört med pyrimidiner (kvävebaser med en enda kväveatom). Dessutom har ENT2 visat sig ha potential som ett terapeutiskt mål för att behandla olika sjukdomar, inklusive cancer och neurodegenerativa tillstånd.

Nukleosidtrifosfatas (NTPas) är ett enzym som bryter ned nukleosidtrifosfater till nukleosidmonofosfater. Nukleosidtrifosfater är molekyler som består av en nucleotid och tre fosfatgrupper, medan nukleosidmonofosfater består av en nucleotid och en fosfatgrupp.

Denna reaktion är viktig för att reglera cellens energibalans och för att producera de molekyler som behövs för celldelning och tillväxt. NTPas finns i alla levande celler och har en central roll i cellens metabolism.

Det existerar olika typer av NTPaser, beroende på vilken typ av nukleosidtrifosfat de katalyserar. Till exempel finns det ATPaser som bryter ner adenosintrifosfat (ATP), GTPaser som bryter ner guanosintrifosfat (GTP) och dylika enzymer för andra nukleosidtrifosfater.

Ribonukleosider är en typ av organiska komponenter som förekommer i vissa biomolekyler, såsom RNA (ribonukleinsyra). De består av en ribofuranos-sockermolekyl (en pentos-sockertyp) som är kovalent bundet till en heterocyklisk bas. Ribonukleosider bildas när en bas kondenseras med en sockermolekyl under en process som kallas glykosylering.

I ribonukleosider är sockerdelen alltid ribosa, och den heterocykliska basen kan vara antingen en purinbas (adenin eller guanin) eller en pyrimidinbas (uracil, cytosin eller tiamin). När en eller flera fosfatgrupper adderas till ribonukleosiden bildar det ett ribonukleotid. Ribonukleotider är de grundläggande byggstenarna i RNA-molekyler, och de spelar en viktig roll i cellulär metabolism, signaltransduktion och genuttryck.

Nukleotider är de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA, som är de två typerna av nucleic acids som förekommer naturligt. En nukleotid består av en pentos-socker (en femkolossig sockerart), en fosfatgrupp och en nitrogenbas. De vanligaste nukleotiderna i DNA innehåller de fyra olika nitrogenbaserna adenin, timin, guanin och cytosin, medan RNA innehåller adenin, uracil, guanin och cytosin.

Nukleotider kan även fungera som en energibärare i celler, genom att innehålla en hög koncentration av kemisk energi som kan frigöras genom hydrolys. Exempel på sådana nukleotider är adenosintrifosfat (ATP) och guanosintrifosfat (GTP).

En mutation är ett tillfälligt eller permanet genetiskt förändring i DNA-sekvensen som kan resultera i en förändring i strukturen eller funktionen hos ett protein eller en genprodukt. Mutationer kan uppstå spontant under celldelning, eller orsakas av externa faktorer såsom strålning, kemikalier eller virus. Mutationer kan vara skadliga, neutrala eller till och med fördelaktiga beroende på vilken del av genomet de påverkar och hur de påverkar genens funktion.

AMP-deaminase, eller adenosinmonofosfat-deaminas, är ett enzym som bryter ner och omvandlar den energirika molekylen AMP (adenosinmonofosfat) till IMP (inosinmonofosfat) i kroppen. Detta enzym finns naturligt i många olika levande organismer, inklusive människor, och spelar en viktig roll i cellers energihushållning och nukleotidmetabolism.

Det medicinska intresset för AMP-deaminas har ökat på senare år, eftersom det har visat sig vara involverat i flera olika sjukdomar och tillstånd. Till exempel har mutationer i genen som kodar för AMP-deaminas setts i samband med muskelsjukdomar, neurodegenerativa sjukdomar och metaboliska störningar. Dessutom kan vissa läkemedel och miljögifter påverka AMP-deaminaseaktiviteten, vilket kan leda till negativa hälsoeffekter.

Forskningen kring AMP-deaminas och dess roll i olika sjukdomar och tillstånd är fortfarande en aktiv och snabb utvecklande område inom medicinsk forskning.

Formyciner är en grupp av svampmediciner som används för att behandla olika typer av svampinfektioner, till exempel orals thrush (svulst i munnen) och vaginals candidiasis (svulst i slidan). De aktiva ingredienserna i formyciner är vanligtvis imidazoler eller triazoler, som fungerar genom att döda svampen eller hämma dess tillväxt. Exempel på formyciner inkluderar clotrimazol, miconazol och fluconazol.

I medicinen refererer kinetik specifikt till läkemedelskinetik, som är studiet av de matematiska modellerna som beskriver hur ett läkemedel distribueras, metaboliseras och utsöndras i en levande organism. Det finns fyra huvudsakliga faser av läkemedelskinetik:

1. Absorption (absorption): Hur snabbt och effektivt absorberas läkemedlet från gastrointestinal tract till blodomloppet.
2. Distribution (distribution): Hur snabbt och i vilken utsträckning fördelar sig läkemedlet i olika kroppsvävnader och vätskor.
3. Metabolism (metabolism): Hur snabbt och hur påverkar läkemedlets kemiska struktur i kroppen, ofta genom enzymer i levern.
4. Elimination (elimination): Hur snabbt och effektivt utsöndras läkemedlet från kroppen, vanligtvis via urin eller avföring.

Läkemedelskinetiken kan påverkas av många faktorer, inklusive patientens ålder, kön, genetiska variationer, lever- och njurfunktion samt andra läkemedel som patienten tar.

'Pentosyltransferases' är ett samlingsnamn för en grupp enzymer som katalyserar överföringen av en pentos (en fem-kolgrupp socker) till en acceptor, vilket kan vara en molekyl som ska modifieras. Dessa enzymer spelar en viktig roll i olika biologiska processer, såsom glykosylering av proteiner och syntesen av glykosider och andra kolhydratderivat.

Det finns flera olika typer av pentosyltransferaser som katalyserar överföringen av specifika pentoser, såsom arabinos, xylos, eller ribos. Dessa enzymer kan variera i sin substratspecificitet och deras funktioner kan variera beroende på vilket system de är involverade i.

Exempel på pentosyltransferaser inkluderar xylosyltransferaser, som överför xyloser till proteiner eller andra sockermolekyler, och ribosyltransferaser, som överför riboser till olika acceptorer.

NM23 (Non-Metastatic Cells 23) Nucleoside Diphosphate Kinases are a group of evolutionarily conserved proteins that play a crucial role in regulating the intracellular concentrations of nucleoside tri- and diphosphates. These enzymes catalyze the reversible transfer of the terminal phosphate group between nucleoside diphosphates and triphosphates, maintaining a balanced pool of these nucleotides required for various cellular processes such as DNA replication, repair, transcription, and energy metabolism.

There are ten isoforms of NM23 proteins identified in humans (NM23-H1 to NM23-H10), among which NM23-H1 and NM23-H2 are the most extensively studied. These two isoforms share approximately 75% sequence identity and exhibit nucleoside diphosphate kinase activity, although their primary function appears to be unrelated to this enzymatic activity. Instead, they have been implicated in several cellular processes, including cell growth, differentiation, and motility.

NM23-H1 is also known as NDKA (Nucleoside Diphosphate Kinase A) or HSN2 (Human Submandibular Gland Protein 2), while NM23-H2 is referred to as NDBA (Nucleoside Diphosphate Kinase B) or HSN1.

Interestingly, reduced expression of NM23-H1 has been associated with increased metastatic potential in various types of cancer, which led to the initial naming of this protein as a "non-metastatic" factor. However, subsequent research revealed that both NM23-H1 and NM23-H2 could have dual roles in tumor progression, acting as either metastasis suppressors or promoters depending on the context and cellular environment.

En reverstranskriptas inhibitor, eller reverstranskriptashämmare, är ett läkemedel som hämmar verksamheten hos ett enzym som kallas revers transcriptas. Revers transcriptas är ett enzym som gör det möjligt för vissa virus, till exempel HIV och hepatit B-virus, att konvertera sitt RNA till DNA.

Dessa läkemedel används ofta i kombination med andra antivirala läkemedel för att behandla HIV-infektioner och hepatit B-infektioner. Genom att hindra virusets förmåga att konvertera sitt RNA till DNA kan revers transcriptas-hämmare minska virusets förmåga att replikera sig, vilket i sin tur kan hjälpa till att kontrollera infektionen och förhindra dess spridning.

Det är värt att notera att revers transcriptas-hämmare inte bör användas som enbart behandling mot cancer, eftersom de också kan påverka normala celler i kroppen som använder sig av samma typ av enzym.

Ekvilibristiska nukleosidtransportproteiner, också kända som ENT-proteiner (Equilibrative Nucleoside Transporters), är en typ av proteiner som transporterar nukleosider (basen kopplad till en socker) över cellmembranet. De hjälper till att upprätthålla balansen (ekvilibrium) mellan koncentrationerna av olika nukleosider inne och ute i cellen.

Det finns två huvudtyper av nukleosidtransportproteiner: ekvilibristiska (ENT-proteiner) och koncentrationsgradientdrivna (CNT-proteiner). Ekvilibristiska proteiner transporterar nukleosider i båda riktningarna över cellmembranet, oberoende av koncentrationsskillnader. Detta innebär att de kan ta upp nukleosider från det extracellulära utrymmet och släppa ut dem från det intracellulära utrymmet, eller tvärt om, beroende på vilken sida av membranet som har högre koncentration.

ENT-proteiner spelar en viktig roll i cellers metabolism och homeostas, eftersom de hjälper till att förse cellen med nukleosider som behövs för syntes av DNA och RNA. Dysfunktion eller mutationer i dessa proteiner kan leda till olika sjukdomar, inklusive neurologiska störningar och cancer.

"Cell line" er en betegnelse for en population av levende celler som deler seg selvstandig og ubestemt i laboratoriet. Disse cellene har typisk samme karyotype (sammensetningen av deres kromosomer) og genetiske egenskaper, og de kan replikeres over en lang periode av tid. De kan brukes i forskning for å studere cellebiologi, molekylær biologi, farmakologi, virologi og andre områder innen biovitenskapen. Eksempler på velkjente cellinjer inkluderer HeLa-cellinjen (som er tatt fra en livstrukturløs kvinne i 1951) og Vero-cellinjen (som er vanlig å bruke i studier av virusinfeksjoner).

"Alu-elements" refer to a family of mobile genetic elements found in the human genome. They are named "Alu" because they contain a characteristic RNA sequence that is complementary to a restriction enzyme called AluI. These elements are about 300 base pairs long and are composed of two similar but not identical monomers, each containing a internal promoter for RNA polymerase III.

Alu-elements do not encode any proteins themselves, but they can move around the genome by using a mechanism called "retrotransposition." This process involves the transcription of the Alu-element into RNA, which is then reverse transcribed back into DNA by an enzyme called reverse transcriptase. The new copy of the Alu-element can then insert itself into a new location in the genome.

It is estimated that there are approximately one million Alu-elements in the human genome, making up about 10% of our genetic material. While many Alu-elements are no longer active and have accumulated mutations over time, some still retain their ability to retrotranspose and can contribute to genetic variation and disease.

Deoxyribonucleosides are the building blocks of DNA, one of the two main types of nucleic acids in cells. A deoxyribonucleoside is made up of a deoxyribose sugar, which is a type of sugar that lacks one oxygen atom compared to ribose (the sugar found in RNA), and a nitrogenous base, which can be either a purine or a pyrimidine.

The nitrogenous bases that can be found in deoxyribonucleosides include adenine, guanine, thymine, and cytosine. Adenine pairs with thymine, and guanine pairs with cytosine, through hydrogen bonds to form base pairs that are the foundation of DNA's double helix structure.

Deoxyribonucleosides are important in genetics because they make up the DNA molecule, which contains the genetic instructions for the development and function of all living organisms. They play a crucial role in processes such as replication, transcription, and repair of DNA.

Molekylära modeller är matematiska och grafiska representationer av molekyler och deras interaktioner på en molekylär nivå. Dessa modeller används inom flera områden inom naturvetenskapen, till exempel inom biologi, kemi och fysik, för att förutsäga hur olika molekyler beter sig och interagerar med varandra.

En molekylär modell kan bestå av en tredimensionell struktur av en molekyl, som visar var varje atom finns placerad och hur de är bundna till varandra. Den kan också inkludera information om elektronmolntopologi, laddning och andra fysikaliska egenskaper hos molekylen.

Molekylära modeller kan användas för att simulera kemiska reaktioner, studera proteiners struktur och funktion, utveckla läkemedel och förstå komplexa biologiska system på en molekylär nivå. Genom att visualisera och analysera molekylära modeller kan forskare få en bättre förståelse för de grundläggande principerna som styr molekyler och deras interaktioner, vilket kan leda till nya insikter och innovationer inom många olika områden.

Medicinskt sett definieras virusförökning som processen där en värdkälla, till exempel en cell, infekteras av ett virus och tvingas producera fler virioner (viruspartiklar). Detta sker genom att virusets genetiskt material integreras eller replikeras inom värddjuret och tvingar den till att producera nya viruspartiklar som sedan friges och kan infektera andra celler.

Virusförökningen är en central del i viruspatogenes, det vill säga sjukdomsprocessen orsakad av ett virus. Förståelsen av denna process har varit viktig för utvecklingen av antivirala läkemedel och vacciner som används för att behandla och förebygga virussjukdomar.

Deoxyadenosine är en nukleosid som består av den sugarsubstansen deoxyribose och basen adenin. Det saknar en oxygenatom jämfört med den vanligare nukleosiden adenosin, där ribosen istället förekommer. Deoxyadenosin är en viktig building block inom DNA-syntesen.

Sekvenshomologi, eller sekvenstillhörighet, inom biokemi och genetik refererar till den grad av likhet mellan två eller flera molekylära sekvenser, som kan vara DNA-sekvenser, RNA-sekvenser eller proteinsekvenser. När det gäller aminosyrasekvenser, handlar det om den ordningsföljd av specifika aminosyror som bildar en proteinmolekyl.

Aminosyrasekvenshomologi mellan två proteiner används ofta för att undersöka deras evolutionära släktskap och funktionella likheter. Hög sekvenshomologi kan indikera närbesläktade proteiner med möjligen liknande funktioner, medan låg homologi kan tyda på mindre närstående eller icke-relaterade proteinsekvenser.

Det är värt att notera att även om två proteiner har en hög sekvenshomologi kan deras struktur och funktion skilja sig ifrån varandra, eftersom aminosyrasekvenser inte alltid korrelerar perfekt med proteiners tredimensionella struktur eller biokemiska aktivitet.

RNA, eller Ribonukleinsyre, er et biomolekyle som spiller en viktig rolle i livsprosessene i levende organismer. Det er relatert til DNA (DNA), men har en slik struktur og funksjon som gjør det unikt.

RNA består av en lineær kjenke av nukleotider, som inneholder fire forskjellige baser: adenin (A), uracil (U), guanin (G) og cytosin (C). Disse basene parrer seg med hverandre ved hydrogenbindinger, slik at A parer med U og G parer med C.

Det finnes tre hovedtyper av RNA:

1. Messenger RNA (mRNA): Denne typen RNA transporterer genetisk informasjon fra DNA til ribosomene, hvor proteinsyntesen skjer.
2. Transfer RNA (tRNA): Dette er et lite RNA-molekyle som transporterer aminosyrer til ribosomen under proteinsyntesen. Hver tRNA har en specifik antall-basparring som passer med en specifik aminosyre.
3. Ribosomalt RNA (rRNA): Dette er en del av ribosomet, som er et kompleks molekyle der proteinsyntesen skjer. rRNA utgjør en viktig del av ribosomets struktur og hjelper til å katalysere reaksjonene som skaper peptidbindinger mellom aminosyrer under proteinsyntesen.

I tillegg til disse tre hovedtyper finnes det også andre typer RNA, som for eksempel small nuclear RNA (snRNA) og microRNA (miRNA), som spiller en viktig rolle i reguleringen av genuttrykk og andre cellulære prosesser.

En kolibakterie (officiellt kallas Escherichia coli, ofta förkortat till E. coli) är en typ av gramnegativ bakterie som normalt förekommer i tarmarna hos varma blodcirkulerande djur, inklusive människor. Det finns många olika stammar av kolibakterier, och de flesta är ofarliga eller till och med nyttiga för värden. Några stammar kan dock orsaka allvarliga infektioner i mag-tarmkanalen, blodet eller andra kroppsdelar. En välkänd patogen kolibakteriestam är E. coli O157:H7, som kan orsaka livshotande komplikationer som hemolytisk uremisk syndrom (HUS) och tack följd av förtäring kontaminert mat eller vatten.

Adenine is a nucleobase, which is a type of molecule that is a key component of nucleic acids, which are the building blocks of DNA and RNA. Adenine is one of the four nitrogenous bases found in DNA, where it pairs with thymine via two hydrogen bonds. In RNA, adenine pairs with uracil via two hydrogen bonds.

Adenine has a purine ring structure, which consists of a six-membered imidazole ring fused to a five-membered pyrimidine ring. It is an important component of many biomolecules and plays a critical role in various cellular processes, including energy transfer and signaling.

In addition to its role as a nucleobase, adenine also functions as a neurotransmitter and neuromodulator in some organisms, where it is involved in the regulation of various physiological processes such as learning, memory, and behavior.

Dilazep är ett läkemedel som tillhör gruppen kalciumkanalblockerare. Det används främst för att behandla angina pectoris, det vill säga smärta i bröstet orsakad av hjärtats syrebrist. Dilazep verkar genom att relaxera de glatta musklerna runt blodkärlen och på så sätt öka blodflödet till hjärtat, vilket underlättar för att minska smärtan.

Läkemedlet ges vanligtvis som tabletter och bör tas enligt den rekommenderade dosen av din läkare eller apotekstekniker. Det är viktigt att inte öka eller minska dosen utan att först diskutera det med din läkare, eftersom för höga doser kan orsaka biverkningar som yrsel, huvudvärk och lågt blodtryck.

Precis som med alla andra läkemedel kan Dilazep också ha vissa biverkningar och interagera med andra mediciner. Se alltid din läkares eller apoteksteknikers råd innan du börjar använda något nytt läkemedel, inklusive Dilazep.

'Sequencing' är ett begrepp inom genetiken som refererar till metoder för bestämandet av raka rader (sekvenser) av nukleotider, de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA. 'Sequencing' används ofta för att undersöka gener och andra delar av DNA för att få information om deras struktur, funktion och evolutionära utveckling.

'Sekvensinpassning' (engelska: sequence alignment) är en metod inom bioinformatiken som används för att jämföra två eller flera DNA- eller proteinsekvenser för att hitta likheter och skillnader mellan dem. Genom att jämföra sekvenser kan forskare identifiera konserverade regioner, mutationer, evolutionära relationer och möjliga funktionella roller.

Sekvensinpassning kan användas för att undersöka olika aspekter av DNA- eller proteinsekvenser, till exempel struktur, funktion, evolutionärt ursprung och släktskap. Det är en viktig metod inom komparativ genetik, molekylär evolution och strukturell biologi.

I sekvensinpassning jämförs två eller flera sekvenser med varandra genom att lägga till luckor (gaps) i sekvenserna för att matcha upp dem så bra som möjligt. Det finns två huvudtyper av sekvensinpassning: global och lokal. Global inpassning jämför hela sekvenserna med varandra, medan lokal inpassning endast jämför delar av sekvenserna där likheter finns.

Sekvensinpassning kan användas för att hitta homologa sekvenser (sekvenser som har gemensam evolutionärt ursprung), identifiera mutationer och andra variationer, och studera evolutionära relationer mellan olika arter eller populationer. Det kan även användas för att förutsäga struktur och funktion hos okända sekvenser genom att jämföra dem med kända sekvenser med liknande egenskaper.

"Bindningsplatser" är ett begrepp inom strukturell biokemi och molekylärbiologi som refererar till de specifika områdena på en molekyl där den binder till en annan. Dessa bindningsplatser kan finnas på proteiner, DNA, RNA eller andra biomolekyler. De består ofta av aminosyrorsekvenser eller nukleotidsekvenser som har förmågan att känna igen och binda till specifika strukturella egenskaper hos en annan molekyl.

I proteiner kan bindningsplatser vara exponerade på proteinytan eller inbäddade i proteinets tredimensionella struktur. De kan vara specialiserade för att binde till små molekyler, joner, andra proteiner, DNA eller RNA. I DNA och RNA kan bindningsplatser bestå av komplementära baspar som möjliggör specifik bindning mellan två komplementära strängar.

Kännedom om bindningsplatser är viktigt inom forskning och medicinsk applikation, eftersom det kan användas för att utveckla läkemedel som binder till specifika proteiner eller andra molekyler i kroppen. Det kan också hjälpa till att förstå hur genuttryck regleras och hur signaleringsvägar fungerar inom celler.

Dideoxinukleosider är en typ av nukleosider där den hydroxylgrupp (-OH) som normalt finns på 2'-positionen i den pentos sugaren har ersatts med en hydrogenatom (-H). Detta gör att de inte längre kan agera som substrat för en fortsatt fosforylering till nukleotider, och därmed saknar förmågan att ingå i DNA-syntesen.

Dideoxinukleosider används som building blocks vid syntesen av antivirala läkemedel, framförallt mot HIV (humant immunodeficiency virus). Exempel på sådana läkemedel är AZT (zidovudin), d4T (stavudin) och 3TC (lamivudin). När viruset integrerar sig i värdcellens DNA kan dess revers transcriptas enzym ersätta en naturlig nukleosid med en dideoxinukleosid, vilket leder till att syntesen av virusets DNA avbryts och därmed förhindras reproduktionen av viruset.

Tubercidin är ett toxin som produceras av en typ av svamp, Streptomyces tubercidicus. Det är en typ av nukleosid, vilket betyder att det består av en sockerdel (ribos) och en nukleobas. I tubercidins fall är nukleobasen adenin.

Tubercidin har förmågan att ingå i DNA och RNA:s uppbyggnad, istället för den vanliga nukleosiden adenosin. Detta kan störa celldelningen och proteinproduktionen, vilket kan leda till cellens död. Tubercidin har visat sig ha antibiotisk verkan mot vissa bakterier och svampar, men på grund av dess toxicitet har det inte använts som läkemedel.

RNA (Ribonucleic acid) är ett samlingsnamn för en grupp molekyler som spelar en central roll i cellens proteinsyntes och genuttryck. Det finns olika typer av RNA, men en specifik typ kallas just budbärarrNA (mRNA, messenger RNA). BudbärarrNA har till uppgift att transportera genetisk information från cellkärnan till ribosomen i cytoplasman, där den används för att bygga upp proteiner enligt instruktionerna i genomet. På så sätt fungerar budbärarrNA som ett slags "budbärare" av genetisk information mellan cellkärnan och ribosomen.

Zidovudin, också känt som AZT eller ZDV, är ett antivirusmedel som används för att behandla HIV-infektioner. Det är en nukleosidanalog reverse transkriptas inhibitor (NRTI) och fungerar genom att hämma viruses reproduktion i kroppen. Zidovudin ges vanligen som tablett, men det finns också injekterbar form av läkemedlet. Det används ofta i kombination med andra HIV-mediciner för att få bäst möjliga behandlingsresultat och fördröja utvecklingen av AIDS.

I en biokemisk kontext refererar "katalytisk domän" till den del av ett enzym (eller ett annat kataltiskt protein) som innehåller de aktiva sidorna och är ansvarig för den kemiska reaktionen som sker. Den katalytiska domänen består ofta av sekundär-, teritiär- och/eller kvartärstruktur, vilket ger den en specifik form och laddning som möjliggör bindning och omvandling av substratet till produkt. Det är värt att notera att enzym ofta kan innehålla flera olika katalytiska domäner, var och en ansvarig för en specifik reaktion eller steg i en mer komplex biokemisk process.

Arabinonukleosider är en typ av kemisk förening som består av en pentos, arabinos, som är kovalent bundet till en nucleosid. Arabinos är en monosackarid med fem kolatomer och kan förekomma i olika former beroende på hur den är konfigurerad runt kolatom 1, alpha eller beta. I arabinonukleosider är arabinosen vanligtvis bundet till en nucleosid genom en glykosidbindning vid kolatom 1' i den ribos eller deoxyribos som ingår i nucleosiden.

Exempel på arabinonukleosider inkluderar arabinofuranosylcytidin (AraC) och arabinofuranosyladenosin (AraA), som båda har antivirala och cytostatiska egenskaper. Dessa substanser används i behandlingen av vissa typer av cancer och virusinfektioner, såsom leukemi och herpes simplex.

Antivirala medel är en typ av läkemedel som används för att behandla eller föventionellt förhindra infektioner orsakade av virus. De fungerar genom att hindra viruses reproduktion och spridning inne i kroppen. Exempel på antivirala medel inkluderar läkemedel som används för att behandla HIV/AIDS, herpes, influensa (vanlig hosta och mag-tarmlopp), hepatit B och C samt vissa former av cancer. Det är viktigt att notera att antivirala medel inte bör användas för att behandla infektioner orsakade av bakterier, svamp eller parasiter, eftersom de inte kommer att vara effektiva mot dessa typer av patogener.

Repressorproteiner är proteiner som binds till specifika DNA-sekvenser och på så sätt förhindrar transkriptionen av angränsande gener. De fungerar som del av regulatoriska system i celler, där de kan stänga av genuttrycket när det inte behövs. Repressorproteinens aktivitet kan moduleras av olika signalmolekyler, till exempel sekundära meddelandeämnen (secoeder), för att möjliggöra precisely kontrollerad genuttryck. I prokaryota celler är repressorprotein ofta en del av operonregulatoriska system, medan de i eukaryota celler oftare är involverade i regleringen av enskilda gener.

'Puriner' är ett samlingsbegrepp för en grupp organiska föreningar som innehåller en purinring, vilket är en sex-ledad heterocyklisk aromatisk kolvätemolekyl. Puriner innefattar bland annat de två nukleotidbaserna adenin och guanin, som förekommer i DNA och RNA. Andra exempel på puriner är ATP (adenosintrifosfat), ADP (adenosindifosfat) och AMP (adenosinmonofosfat), vilka är viktiga kemiska komponenter inom cellens energimetabolism. Puriner har också en betydande roll som signalsubstanser i cellkommunikationen, bland annat genom att fungera som neurotransmittorer och modulerare av immunresponsen.

'Zink' er ein elemtar metallisk stoff som er nødvendig for menneskelig helse. Det forekommer naturlig i mange matvarer, særlig i kjøtt, fisk, mølje, nøtter og visse grønnsaker som bønner og spinnaker. Zink er en viktig del av mange enzymer og proteiner i kroppen og bidrar til å styrke immunsystemet, repariere DNA-skade, og hjelpe med sårhealing. Det er også viktig for vår sans for smak og luktestørrelse.

Mennesker trenger vanligvis mellom 8 og 11 milligram zink om dagen, men denne behovet kan variere alt etter alder, kjønn, graviditet og amning, samt andre faktorar som stress og sykdom. Et defisitt av zink kan føre til en rekke helseproblemer, inkludert større risiko for infeksjoner, langsomme vekst hos barn, svingende smak- og luktestørrelse, og sårhealing.

Deoxycytidine kinase (dCK) er enzym som spesielt deltar i aktivering av nukleosidanaloger, som er et type antikreftmedisin. Dette enzymet fosforylerer deoxycytidin og deoxycytidineanaloger til deres monofosfatformer, som er nødvendig for deres inn incorporering i DNA-stoffet og deres effektivitet som antikreftmedisin. dCK er aktivert under cellestress og proliferasjon, noe som gjør at det er viktig for å kontrollere cellecykler og beskytte mot skade på DNA-stoffet. Mutasjoner i dCK-genen kan føre til resistens mot nukleosidanaloger og redusert behandlingseffektivitet hos kreftpasienter.

Tertiär proteinstruktur refererar till den tresdimensionella formen och flexibiliteten hos ett proteinmolekyl som resulterar från de specifika interaktionerna mellan dess sekundära strukturelement, såsom alfa-helixar och beta-flakor. Den tertiära strukturen av ett protein bestäms av den sekvensordningen (primär struktur) av aminosyror som utgör proteinet och de krafter som verkar mellan dem, såsom vätebindningar, dispersion-krafter och elektrostatiska attraktioner. Den tertiära strukturen är viktig för ett proteins funktionella aktivitet och kan vara stabil eller dynamisk beroende på proteinets roll i cellen.

Hela-celler, även kända som HeLa-celler, är en immortaliserad celllinje som isolerades från ett cancerpatient som led av cervixcancer. Patienten hette Henrietta Lacks och hennes celler togs utan hennes vetskap eller samtycke under en operation 1951.

HeLa-cellerna är speciella eftersom de är "immortala", vilket betyder att de kan dela sig oändligt i laboratoriemiljö och fortsätta växa och reproduceras under lång tid. Detta gör dem till en mycket användbar resurs inom biomedicinsk forskning, eftersom de kan användas för att studera cellbiologi, genetik, cancer, virusinfektioner och andra sjukdomar.

HeLa-cellerna var den första mänskliga celllinjen som lyckades kultivera i laboratoriet och har sedan dess använts i tusentals forskningsstudier världen över. De har bidragit till ett stort antal vetenskapliga framsteg, inklusive utvecklingen av poliovaccinet, upptäckten av telomeraser och studiet av cellcykeln.

Emellertid har användningen av HeLa-celler också varit kontroversiell på grund av etiska frågor kring patientens samtycke och efterlevande familjs rättigheter till hennes genetiska information.

Organofosfonater är en grupp kemiska föreningar som innehåller en organisk grupp bundet till en fosfonatgrupp. De flesta organofosfonater är starkt giftiga för levande väsen, eftersom de inhibiterar enzymet acetylkolinesteras, vilket leder till en accumulering av neurotransmittorn acetylkolin i synapser och därmed oönskade effekter på nervsystemet. Några exempel på organofosfonater är sönderfallsprodukterna av nervegasen sarin och insekticiden paration.

Nukleinsyrakonfiguration refererar till den tresdimensionella strukturen hos nukleinsyra, som kan vara antingen DNA (deoxiribonucleic acid) eller RNA (ribonucleic acid). Det finns två huvudsakliga konfigurationer av dubbelsträngat DNA: A-DNA och B-DNA.

A-DNA är en kompaktare form av DNA som förekommer under torra förhållanden eller när DNA binds till proteiner. Den har en större diameter och en rakare, mer stram struktur än B-DNA.

B-DNA är den mest vanliga formen av dubbelsträngat DNA i levande celler. Den har en mindre diameter och en svagt skruvad struktur med ungefär 10 baspar per hel vridning.

RNA har också en specifik konfiguration, som kallas A-form. RNA är en singelsträngad nukleinsyra som bildar en svagt skruvad struktur med ungefär 11 baser per hel vridning.

I allmänhet avgörs nukleinsyrakonfigurationen av den specifika sekvensen av nukleotider, samt de miljöfaktorer som påverkar dess struktur, såsom saltkoncentration och fuktighet.

Pyrimidine phosphorylases are a group of enzymes that play a crucial role in the metabolism of pyrimidines, which are nitrogenous bases found in nucleic acids such as DNA and RNA. These enzymes catalyze the reversible phosphorolytic cleavage of pyrimidine nucleosides into ribose-1-phosphate and a free base.

There are two major classes of pyrimidine phosphorylases: cytosine phosphorylase (CP) and thymidine phosphorylase (TP). CP is responsible for the conversion of cytidine or deoxycytidine to uridine or deoxyuridine, respectively, while TP catalyzes the reaction of thymidine or deoxythymidine to thymine or deoxythymine.

These enzymes are important in nucleotide salvage pathways, where they help recycle pyrimidines and generate precursors for DNA and RNA synthesis. Additionally, TP has been implicated in angiogenesis and cancer progression, making it a potential target for anti-cancer therapies.

Tymidin är ett av de fyra nucleosiderna i DNA. Det består av en pyrimidinring, som är en aromatisk heterocyklisk förening, och en sockermolekyl (deoxyribosa). Tymidin kännetecknas av att det innehåller en speciell bas, thymin, som sitter i pyrimidinringen. Thymin är en av de två puriner som förekommer i DNA, den andra är cytosin. Tymidin spelar därför en viktig roll i lagring och överföring av genetisk information inom celler.

'Virus-DNA' refererer til det genetiske materiale i form av DNA (deoxyribonucleic acid) som findes i visse typer virus. Virus er små infektiøse partikler som ikke kan reproducere seg selv, men har brug for en værtscell for å formere seg.

Virus-DNA kan være enten enkeltstreget eller dobbeltstreget, og den kan være lineær eller cirkulær. Nogle viruser har DNA som det primære genetiske materialet, mens andre har RNA (ribonucleic acid).

DNA-viruses inneholder ofte en begranset mengde genetisk informasjon og er avhengige av værttens cellulære mekanismer for å syntetisere proteiner og replikere seg. Eksempler på DNA-viruses inkluder herpesvirus, papillomavirus og adenovirus.

En HIV-infektion är en infektionssjukdom som orsakas av human immunodeficiency virus (HIV). Viruset attackerar och förstör CD4-celler, en typ av vita blodkroppar som är viktiga för att hålla kroppen frisk. När CD4-cellerna minskar i antal kan kroppen inte längre effektivt bekämpa infektioner och sjukdomar.

HIV-infektionen går genom tre olika stadier: akut HIV-infektion, asymptomatisk HIV-infektion och symptomatisk HIV-infektion eller AIDS. AIDS står för acquired immunodeficiency syndrome och är den allvarligaste fasen av HIV-infektionen då individen blir särskilt känslig för allvarliga infektioner och cancer.

Det finns inget botemedel mot HIV, men det går att behandla HIV med antiretroviral terapi (ART) som kan hjälpa till att kontrollera virusets replikation och sakta ner sjukdomens framskridande. Med rätt behandling och regelbunden follow-up kan många HIV-positiva personer leva ett nästan normalt liv.

Aminosyramönster, eller aminoacyl-tRNA-mönstret, refererar till den specifika kombinationen av aminosyror och transfer-RNA (tRNA) som finns i en ribosom under processen att bygga upp ett protein enligt informationen i ett messenger-RNA (mRNA). Varje tRNA har en specifik anticodon-sekvens som matchar en komplementär kodon-sekvens på mRNA, och bär därmed en specifik aminosyra. När ribosomen läser av mRNA:t och bygger upp proteinet, binds aminosyran till den växande peptidkedjan genom en reaktion katalyserad av peptidyltransferas-enzymet i ribosomen. På så sätt skapas ett specifikt aminosyramönster som korrelerar med genetisk informationen i mRNA:t.

Tionukleosider är en typ av organisk förening som består av en sockerdel (ribos eller deoxyribos) kopplad till en heterocyklisk aromatisk bas genom en N-glykosidbindning. De aromatiska baserna kan vara antingen puriner, som inkluderar adenin och guanin, eller pyrimidiner, som inkluderar tymin, cytosin och uracil. Tionukleosider spelar en viktig roll i molekylär biologi, eftersom de utgör byggstenarna i nukleinsyror, såsom DNA och RNA. De är också viktiga intermediater i cellens energiproduktion och signaltransduktion.

DNA, eller deoxyribonucleic acid, är ett molekyärt ämne som innehåller de genetiska instruktionerna för utveckling och funktion hos alla levande organismers celler. DNA består av två långa, dubbelhelixstrukturer som är byggda upp av en serie nukleotider som inkluderar socker (deoxyribose), fosfatgrupper och fyra olika baser: adenin (A), timin (T), guanin (G) och cytosin (C). Adenin parar sig alltid med timin, och guanin parar sig alltid med cytosin. Denna specifika basparning är viktig för att korrekt koda genetisk information.

DNA-molekylen lagrar den genetiska informationen i en kod som består av sekvenser av dessa fyra baser, och varje organisms unika DNA-sekvens ger instruktioner för hur proteiner ska byggas upp. Proteiner är viktiga byggstenar i alla levande organismer och utför en rad olika funktioner som hjälper till att reglera cellens struktur, metabolism och andra viktiga processer.

Ribonukleotider är building blocks, eller byggstenar, inom DNA (Dioxyribonucleic acid) och RNA (Ribonucleic acid). De består av en ribos (en pentos-socker, en fem-kolsvågsring), en fosfatgrupp samt en av fyra nukleobaser: adenin, guanin, uracil eller cytosin. Ribonukleotider kallas även för nucleosidmonofosfater. När flera ribonukleotider binds samman via fosfatbronterna bildar de en lång kedja och tillsammans med proteiner utgör de den genetiska informationen i levande celler.

Deoxyuridine (tidigare även kallat deoxythymidine) är en nukleosid som består av denolkan basen uracil och sockret deoxyribose. Det förekommer naturligt i DNA under normala förhållanden, men spelar ingen roll i genetisk information eller proteinsyntes. I celler som delar sig kan dock nivåerna av deoxyuridin öka, vilket kan vara ett tecken på celldelning eller celldöd.

I medicinsk kontext används syntetiska derivat av deoxyuridin som cytostatika, läkemedel som hämmar celldelningen och därmed kan användas i behandlingen av cancer. Ett exempel på ett sådant läkemedel är fluorouracil (5-FU), som används för att behandla flera olika typer av cancer, bland annat coloncancer och bröstcancer.

Det är värt att notera att deoxyuridin inte skall förväxlas med den närbesläktade nukleosiden thymidin, som även den består av en deoxyribos och en bas, men i detta fall är basen thymin istället för uracil. Thymidin spelar en viktig roll i DNA-replikationen och är därför ett viktigt ämne inom cellbiologi och genetik.

Zalcitabine är ett antiviralt läkemedel som används för behandling av HIV-infektion. Det är en nukleosidanalog reverse transkriptas inhibitor (NRTI) och fungerar genom att hämma virusets förmåga att replikera sin DNA. Zalcitabin marknadsförs under varunamnet HIVID och används vanligtvis i kombination med andra antiretrovirala läkemedel för att kontrollera HIV-infektionen och fördröja framskridandet av AIDS. Läkemedlet ges vanligen som tablettor som tas peroral, ofta i kombination med andra HIV-mediciner. Som alla läkemedel kan zalcitabin ha biverkningar och kontraindikationer, och det bör endast användas under ledning av en läkare.

Uridinfosforylas (EC 3.6.1.98) är ett enzym som katalyserar nedbrytningen av uridinmonofosfat (UMP) till fosfat och uridin. Detta enzym spelar därför en viktig roll i nukleotidmetabolismen. Reaktionen kan skrivas enligt nedan:

(dUMP + H2O → uracil + difosfat)

Det är värt att notera att detta enzym också kan katalysera nedbrytningen av andra nukleotider, såsom cytidinmonofosfat (CMP) och timidinmonofosfat (TMP).

"Fylogenetik" (förekommande stavning inom biologi på engelska: 'phylogenetics') är ett område inom biologin som handlar om att studera evolutionära relationer mellan olika arter eller andra taxonomiska grupper. Genom att jämföra morfologiska, genetiska och/eller fossila data kan forskare konstruera ett fylogenetiskt träd som visar hur olika arter tros ha utvecklats från gemensamma förfäder över tid.

Termen "fylogen" (på engelska: 'phylogeny') refererar till den evolutionära historien och relationerna mellan olika taxa, det vill säga en grupp organismer som är relaterade genom gemensam härstamning. En fylogeni kan representeras av ett diagramatiskt träd där varje gren representerar en klad, det vill säga en monofyletisk grupp med alla dess ättlingar inkluderat och utan inslag av äldre gemensamma förfäder.

I medicinsk kontext kan fylogenetiska analyser användas för att studera evolutionära relationer mellan patogena mikroorganismer, vilket kan vara viktigt för att förstå hur sjukdomar sprids och utvecklas, och hur vacciner och andra behandlingsmetoder kan utformas.

'RNA viralt' refererer til et virus som har sin genetisk informasjon lagret i RNA (ribonukleinsyre) istedenfor DNA (deoxyribonukleinsyre) som er vanligere for levende organismer. Disse typer av viruser bruker RNA-polymerase enzym for å transkribere og replikere sin genetisk informasjon. Mange infektiøse og smittebærende virusser, som f.eks. HIV, influenza, SARS-CoV-2 (som forårsaker COVID-19), er RNA-virusser.

"Anti-HIV-medicin" refererar till läkemedel som används för att behandla HIV (Human Immunodeficiency Virus) infektion. Dessa mediciner kallas även för antiretrovirala läkemedel (ARV) eftersom de påverkar virusets förmåga att replikera sig genom att blockera olika steg i dess livscykel.

Det vanligaste behandlingsschemat för HIV-infektion kallas HAART (Highly Active Antiretroviral Therapy), som ofta består av en kombination av tre eller fler olika ARV-preparat. Genom att använda flera läkemedel samtidigt kan man minska risken för resistensutveckling och öka effektiviteten i behandlingen.

ARV-mediciner kan delas in i olika klasser beroende på vilket steg i HIV-livscykeln de blockerar:

1. Reverse transkriptas-hämmare (NRTIs, NNRTIs och INSTIs): De hämmer virusets förmåga att konvertera RNA till DNA, en nödvändig steg för att viruset ska kunna införlivas i värdcellen.
2. Proteashämmare: De blockerar virushöljetas proteas, ett enzym som klipper proteiner så de kan monteras till nya viruspartiklar.
3. Integrashämmare (INSTIs): De förhindrar att HIV-DNA integreras i värdcellens DNA.
4. Fusionshämmare: De blockerar infusionen av viruset in i värdcellen genom att hindra sammansmältningen mellan virusets och cellmembranet.

Genom att använda en kombination av läkemedel från olika klasser kan man effektivt hämma HIV-replikationen, sänka virallasterna i blodet och förbättra immunförsvaret.

Dipyridamole är ett kärlvasodilatatoriskt läkemedel som används för att behandla och förebygga blodproppar (tromboser). Det fungerar genom att öka blodflödet i kärlen och förhindra aggregation av blodplättar, vilket kan hjälpa att minska risken för att utveckla blodproppar. Dipyridamole kan användas ensamt eller tillsammans med andra läkemedel som aspirin efter stroke orsakad av en blodpropp.

Läkemedlet ges vanligen peroralt (via munnen) och börjar verka inom en timme efter intagandet. Vanliga biverkningar inkluderar huvudvärk, yrsel, magont, diarré och hudutslag. I sällsynta fall kan dipyridamole orsaka allvarligare biverkningar som andningssvårigheter, lågt blodtryck eller överdosering, vilket kan kräva akut medicinsk behandling.

Det är viktigt att använda dipyridamole enligt receptläkarens instruktioner och att inte öka dosen eller avbryta behandlingen utan första att konsultera läkaren.

HIV-reverstranskriptas (HIV-RT) er ein viktig del av human immunodeficiency virus (HIV), som orsaker HIV/AIDS. Det er ein enzym som HIV brukar for å reverse-transkribera viral RNA til DNA, sånn at det kan integreres i värtscellens genoma og produse flere viruspartikler. HIV-reverstranskriptas er et viktig mål for HIV-behandling, fordi inhibisjon av dette enzymet hindrer virusets evne til å repliseres og spredes i kroppen.

RNA-prekursorer, eller RNA-precursor molekyler, refererar till initiala transkriptionsprodukter som består av en längre sekvens än den mognaste, funktionella RNA-molekylen. Dessa prekursorer innehåller ofta intronsekvenser som behöver tas bort genom ett process som kallas splicing innan den funktionella RNA-molekylen kan bildas. RNA-prekursorer kan vara antingen protein kodande, såsom pre-mRNA (prekursor-messenger RNA), eller icke-proteinkodande, som inkluderar pre-rRNA (prekursor-ribosomalt RNA) och pre-tRNA (prekursor-transfer RNA).

Proteinbindning (ibland även kallat proteininteraktion) refererar till den process där ett protein binder sig till ett annat molekylärt ämne, exempelvis en liten organisk molekyl, ett metalljon, ett DNA- eller RNA-molekyl, eller till ett annat protein. Proteinbindningar är mycket viktiga inom cellbiologi och medicinen, eftersom de ligger till grund för många olika biokemiska processer i kroppen.

Exempel på olika typer av proteinbindningar inkluderar:

* Enzym-substratbindningar, där ett enzym binder till sitt substrat för att katalysera en kemisk reaktion.
* Receptor-ligandbindningar, där en receptor binder till en ligand (exempelvis ett hormon eller en neurotransmittor) för att aktiveras och utlösa en cellsignal.
* Protein-DNA/RNA-bindningar, där proteiner binder till DNA eller RNA-molekyler för att reglera genuttrycket eller för att delta i DNA-replikation eller -reparation.
* Protein-proteinbindningar, där två eller fler proteiner interagerar med varandra för att bilda komplexa eller för att reglera varandras aktivitet.

Proteinbindningar kan styras av en mängd olika faktorer, inklusive den tresdimensionella strukturen hos de involverade molekylerna, deras elektriska laddningar och hydrofila/hydrofoba egenskaper. Många proteinbindningar kan också moduleras av läkemedel eller andra exogena ämnen, vilket gör att de är viktiga mål för farmakologisk intervention.

Tyminnukleotider, även kända som T-nukleotider eller thymidiner, är en typ av nukleotider som innehåller den sockerkärnan deoxyribosa och den nucleobasen tymin. Deyminner är en viktig delkomponent i DNA (DNA) molekyler och spelar därför en central roll i arvsförhållandena och cellreplikationen hos levande organismer.

I DNA-molekylen bildar tyminnukleotider specifika parningar med adenin nukleotider, vilket bidrar till den dubbelstrukturen hos DNA. Denna speciella komplementära basparning är viktig för stabiliteten och funktionen av DNA-molekylen.

Sura anhydrider, även känt som sura estrar, är kemiska föreningar som bildas när en karboxylsyra reagerar med en alkohol i närvaro av ett dehydreringsmedel, vilket resulterar i att vattenmolekylen elimineras. Sura anhydrider är reaktiva och hydrolyseras lätt tillbaka till sina ursprungliga karboxylsyror och alkoholer i närvaro av vatten.

En sura anhydridhydrolaser är en medicinsk term som refererar till ett enzym som katalyserar hydrolysen av sura anhydrider. Det specifika enzymer som har denna funktion är acetylkolinesteras (AChE) och butyrylkolinesteras (BChE). Dessa enzymer bryter ned neurotransmittorerna acetylkolin och butyrylkolin till deras respektive karboxylsyror och alkoholer. AChE är specifikt involverat i nervimpulstransmissionen i centrala och perifera nervsystemet, medan BChE har en mer bred substratspecificitet och kan bryta ned fler olika typer av esterbindningar.

Molekylär kloning är en biologisk teknik där man skapar exakta kopior av specifika gener eller andra stycken av DNA. Detta görs genom att skapa en rekombinant DNA-molekyl, vilken består av DNA från två olika källor. Denna rekombinanta DNA-molekyl innehåller oftast en önskad gen som är flankerad av kontrollsekvenser, så kallade promotor- och terminatorkärnor, som styr när och hur mycket av genen ska exprimera sig.

Den rekombinanta DNA-molekylen införs sedan i en värdcell, ofta en bakteriecell eller en eukaryot cell, där den kan replikera sig tillsammans med cellens egna gener. På det viset produceras stora mängder av den önskade genen eller DNA-sekvensen.

Molekylär kloning används inom forskning för att studera geners funktion och interaktion, för att producera proteiner i stor skala för medicinska tillämpningar och för att skapa genetiskt modifierade organismer som används inom jordbruk och bioteknik.

Rekombinanta proteiner är proteiner som har skapats genom tekniker för genetisk rekombination, där man kombinerar DNA-sekvenser från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskvärda egenskaper. Denna teknik möjliggör produktionen av stora mängder specifika proteiner med konstant och predikterbar struktur och funktion. Rekombinanta proteiner används inom flera områden, till exempel inom medicinen för framställning av läkemedel som insulin, vaccin och enzymer.

"Complementary DNA" (cDNA) är en syntetisk enkelsträngad DNA-molekyl som skapas genom att transkribera en messenger RNA (mRNA)-molekyl med hjälp av en revers transkriptas. cDNA används ofta i molekylärbiologiska experiment, till exempel för att klona specifika gener eller studera genuttryck.

Den komplementära naturen av cDNA och den ursprungliga mRNA-molekylen gör det möjligt att använda cDNA som en representation av den ursprungliga genen, eftersom basparningen mellan DNA och RNA följer komplementära regler (A parar sig med T respektive G parar sig med C). Detta gör cDNA till ett värdefullt verktyg inom molekylärbiologi, eftersom det ofta är lättare att arbeta med DNA än RNA.

Molekylær evolution refererer til studiet af de molekylære mekanismer og processer som driver ændringer i DNA-sequencer over tid, hvilket resulterer i den biologiske evolution. Dette inkluderer studiet af mutationer, genetisk drift, genflow og naturlig selektion på molekylær niveau. Molekylær evolution anvender ofte sekvensdata fra DNA, RNA eller protein for at konstruere filogenetiske træer, der viser de evolutionære forhold mellem organismer.

Adenosintriphosphat (ATP) är ett molekylärt komplex som utgör en energirik förening i levande celler. Det består av en nukleotid, adenosin, som är kovalent bundet till tre fosfatgrupper. ATP fungerar som den huvudsakliga energibäraren inom celler och används för att driva en mängd olika cellulära processer, såsom muskelkontraktioner, nerverna transmissionsprocesser och syntesen av proteiner och andra biologiska molekyler. När ATP hydrolyseras (bryts ned) frigörs energi som kan användas för att utföra arbete inom cellen.

Dideoxynucleotides are analogs of nucleotides, which are the building blocks of DNA and RNA. In a dideoxynucleotide, two of the hydroxyl (-OH) groups that are normally present in the sugar molecule of a nucleotide are replaced with hydrogen atoms (H). Specifically, these are the 2'-hydroxyl group and the 3'-hydroxyl group.

The absence of the 3'-hydroxyl group makes it impossible for dideoxynucleotides to form a phosphodiester bond with the next nucleotide in a growing DNA chain, which effectively terminates the elongation of the chain. This property is exploited in the Sanger method of DNA sequencing, where dideoxynucleotides are used as terminators in a reaction that produces a set of DNA fragments of different lengths, each ending with a specific dideoxynucleotide. By separating and analyzing these fragments, the sequence of nucleotides in the original DNA molecule can be determined.

Dideoxynucleotides are also used as antiviral drugs, particularly against HIV, by inhibiting the reverse transcriptase enzyme that the virus uses to make a DNA copy of its RNA genome during infection. The absence of the 3'-hydroxyl group in dideoxynucleotides prevents the formation of a new strand of DNA, which stops the replication of the virus.

Hypoxanthine är ett derivat av purin, som är en typ av nukleotid. Det bildas i kroppen som en del av normal metabolism och brytningen ner av nukleotider. Hypoxantin kan också konverteras till xantin och sedan till uric acid, som är slutprodukten i purinmetabolismen hos människor.

I medicinskt hänseende kan höga nivåer av hypoxanthine i blodet vara ett tecken på en genetisk störning som kallas Lesch-Nyhan syndrom, eller på cellskador orsakade av ischemisk skada eller hypoxi.

Proteiner (eller proteinmolekyler) är stora, komplexa molekyler som består av aminosyror som kedjas samman i en specifik sekvens. Proteiner bygger upp och utgör en väsentlig del av alla levande cellers struktur och funktion. De utför viktiga funktioner såsom att underlätta kroppens tillväxt och reparation, reglera processer i cellen, skydda organismen från främmande ämnen som t.ex. virus och bakterier samt hjälpa till vid transport av andra molekyler inom kroppen. Proteiner kan ha en mycket varierad struktur och form beroende på deras funktion, och de kan indelas i olika klasser baserat på deras specifika egenskaper och roller inom cellen.

Stavudin är ett antiviralt läkemedel som används för att behandla HIV-infektion. Det är en nukleosidanalog reverse transkriptas inhibitor (NRTI) och fungerar genom att hämma enzymet reverst transkriptas, vilket stoppar virusets förmåga att replikera sin DNA. Stavudin marknadsförs under varunamnet Zerit och används ofta i kombination med andra antiretrovirala läkemedel för att kontrollera HIV-infektionen och förhindra dess progression till AIDS.

Guanin är ett av de fyra nucleotidbaserna som förekommer i DNA och RNA. Guanin bildar par med cytosin via tres bonded hydrogen bonds, vilket är en viktig del av DNA-replikationen och transkriptionen. Guanin har också en roll i cellsignalering och reglering av celldelning genom att ingå i signalsubstanser som cGMP (cyclisk guanosinmonofosfat).

'Virion' är ett begrepp inom virologi och refererar till ett fullt samlat, infektionsberett viruspartikel utanför ett värddjurs cell. Det inkluderar alltså viruskapsid (proteinhölje) och eventuellt också virushylster (lipidhaltigt membran). Ibland kan viruset även innehålla en del av värdcellens membran som en del av sitt yttre skal, beroende på hur viruset sprider sig från den infekterade cellen. Virionen innehåller dessutom genetiskt material i form av RNA eller DNA.

"Biological transport" refererar till de mekanismer och processer som är involverade i förflyttningen av substanser, såsom näringsämnen, hormoner, syre, koldioxid och avfallsprodukter, inom och mellan levande organismers celler, vävnader och system. Det kan ske genom olika mekanismer som diffusion, osmos, aktiv transport, exocyos/endocytos och cirkulation i blod- eller lymfkärl. Biologisk transport är nödvändig för att underhålla homeostas, cellernas överlevnad och funktion, samt kommunikation mellan celler och organ.

Deoxyguanosine är en nukleosid som består av den pentosa sockerarten deoxyribose och guanin, en av baserna i DNA. Det saknar ett syreatom jämfört med guanosin, som istället har en ribosgrupp. Deoxyguanosin bildar två vätebindningar med cytidin när DNA parar sig.

Tiouridin är ett derivat av pyrimidin, som är en grundläggande byggsten i nukleotider (en typ av building block för DNA och RNA). Tiouridin innehåller svavelatomen istället för den vanliga syreatomen i den vanliga pyrimidingruppen. Det förekommer naturligt i vissa RNA-molekyler, där det kan spela rollar i stabilisering av strukturen eller funktionen hos RNA.

Purinnukleotider är en typ av kemiska föreningar som spelar en viktig roll inom cellernas ämnesomsättning, särskilt beträffande energiförvaring och överföring. De består av en purinbas (antingen adenin eller guanin), en sockerdel (ribos eller deoxyribos) och en fosfatgrupp. Exempel på purinnukleotider är ATP (adenosintrifosfat), ADP (adenosindifosfat), AMP (adenosinmonofosfat), GTP (guanosintrifosfat) och GDP (guanosindifosfat). Purinnukleotiderna är viktiga som energibärare, signalsubstanser och byggstenar inom celldelningen.

Membrantransportproteiner är proteiner som spänner över cellytans membran och aktivt transporterar molekyler, joner eller vattenmolekyler genom membranet. Dessa proteiner kan vara specifika för en viss substans och kan verka som aktiva transportörer (där energibeslutas används för att pumpa substansen upp- eller nedför ett koncentrationsgradient) eller passiva transportörer (där substansen transporteras med gradienten). Membrantransportproteiner är väsentliga för cellens homeostas och kommunikation med sin omgivning.

Molekyler är de minsta beståndsdelarna av ett rensat, rent ämne och består vanligtvis av två eller flera atomer som är kemiskt bundna tillsammans. Molekylstruktur refererar till den specifika positionen och orienteringen av varje atom i en molekyl, inklusive de kemiska bindningarna mellan dem. Denna struktur kan ha stor betydelse för molekylets egenskaper och funktion, eftersom små förändringar i molekylstrukturen kan leda till stora skillnader i dess fysikaliska och kemiska karaktär.

Exempel: Vatten (H2O) är en enkel molekyl med en molekylstruktur som består av två väteatomer (H) bundna till en syreatom (O) genom kovalenta bindningar. Denna specifika molekylstruktur ger vattnet unika egenskaper, såsom dess höga brytningsindex och dess förmåga att agera som ett polärt lösningsmedel för många olika ämnen.

Cytidintriphosphat (CTP) är en nukleotid som spelar en viktig roll i cellens metabolism, särskilt inom syntesen av RNA. Det består av en cytosinbas, en fosfatgrupp och två additionella fosfatgrupper som sitter bundna till varandra i en lineär kedja. CTP är ett viktigt byggsteget vid produktionen av RNA, eftersom det hjälper till att bygga upp den alternerande strukturen av ribos och deoxyribos i RNA-kedjan. Det är också involverat i syntesen av andra nukleotider och energitransfer inom cellen.

Viral medicines resistance, eller läkemedelsresistens hos virus, är ett tillstånd där ett virus har utvecklat mekanismer som gör det mindre känsligt för eller immuno mot vissa specifika antivirala läkemedel. Detta kan inträffa genom mutationer i viruset som förändrar dess struktur och funktion, vilket gör att läkemedlet inte längre kan binda till sitt mål på viruspartikeln eller hindra den från att replikera sig korrekt.

Viral medicines resistance kan vara en naturlig förekomst hos vissa virus, men kan också utvecklas under behandling med antivirala läkemedel. Det är därför viktigt att använda läkemedel korrekt och som avråda från oförskrivet bruk av dessa läkemedel, för att minska risken för resistensutveckling hos virus.

Exempel på virus som kan utveckla resistens mot antivirala läkemedel inkluderar HIV, influensavirus och herpesvirus.

Fosfotransferaser är ett samlingsnamn för en grupp enzymer som katalyserar överföringen av en fosfatgrupp från en donatormolekyl till en acceptormolekyl. Denna reaktion kallas för fosforylering och är en central mekanism i cellens energihushållning, signaltransduktion och näringsmetabolism.

Det finns olika typer av fosfotransferaser beroende på vilken donator- och acceptormolekyl som är inblandad i reaktionen. Exempel på fosfotransferaser inkluderar:

1. Kinaser: överför fosfatgruppen från ATP till en protein- eller kolhydratmolekyl.
2. Fosfatas: avlägsnar en fosfatgrupp från en molekyl, ofta för att aktivera eller inaktivera en biologisk funktion.
3. Fosfotransferaser som överför fosfatgrupper mellan kolhydrater, lipider och nukleotider.

Fosfotransferasreaktioner är viktiga för cellens homeostas och reglering av olika cellulära processer som celldelning, signaltransduktion, ämnesomsättning och energiproduktion.

Didanosine är ett antivirusmedel som används för att behandla HIV-infektion. Det tillhör en grupp läkemedel som kallas reverstranskriptas inhibitorer (NRTIs). Didanosin fungerar genom att hämta en speciell typ av enzym, revers transkriptas, som HIV behöver för att replikera sig. På så sätt kan didanosin hjälpa till att förhindra spridningen av HIV i kroppen och sänka risken för komplikationer relaterade till HIV-infektionen, såsom AIDS.

Det är viktigt att notera att didanosin inte bör användas som en enda behandling för HIV-infektion, utan bör kombineras med andra antivirusmedel för att maximera dess effektivitet och fördröja utvecklingen av resistens mot läkemedlet.

Läkemedlets vanliga biverkningar inkluderar illamående, diarré, huvudvärk, yrsel, muskel- och ledsmärta, trötthet och förändringar i smaksinnet. Mer allvarliga biverkningar kan också uppstå, såsom njur- eller leverproblem, neuropati (nervskada), ögonsjukdomar och försämrad immunförsvar.

Didanosin bör endast användas under en läkares övervakning och efter att dennes potentiala fördelar och risker har vägt upp mot varandra.

Hypoxanthine är ett derivat av purin och förekommer naturligt i kroppen. Det bildas bland annat när adenosintrifosfat (ATP) bryts ned under cellandning, särskilt under situationer med syrebrist eller ischemi. Hypoxanthinet omvandlas sedan till xantin och sedan slutligen till urinsyra, som är ett slutprodukt i purinnklyvningen.

I en medicinsk kontext kan höga nivåer av hypoxanthin i blodet vara ett tecken på olika sjukdomstillstånd, såsom cellskada, tumörer eller genetiska störningar som beror på bristande aktivitet hos enzym som kallas hypoxantin-guanindin fosforybosyltransferas (HGPRT). Sådana tillstånd kan leda till ökad risk för gikt, neurologiska symtom och andra komplikationer.

Adenine nucleotider är en typ av kemiska föreningar som spelar en viktig roll inom cellens energimetabolism. De består av en purinbas, adenin, som är kovalent bundet till en sockerstruktur, ribos eller deoxyribos, och en eller flera fosfatgrupper. De mest kända adeninnukleotiderna är ATP (adenosintrifosfat), ADP (adenosindifosfat) och AMP (adenosinmonofosfat). Dessa molekyler fungerar som energibärare i cellen, där ATP är den viktigaste. När ATP bryts ner till ADP + Pi friges energi som kan användas för att driva cellens olika processer.