Paracoccus definieras vanligtvis som ett släkte av gramnegativa, aeroba, encelliga bakterier som tillhör familjen Rhodobacteraceae inom proteobakteriesläktet. Dessa bakterier är kemoorganotrofa och kan oxidera en rad olika organiska substrat för sin växteenergi. De flesta arterna av Paracoccus är också fototrofa, vilket betyder att de kan använda ljus som energikälla genom fotosyntes. Släktet innehåller ett antal arter, varav den mest välkända är Paracoccus denitrificans, som är en modellorganism för studier av denitrifikation och cellulär respiration.
"Paracoccus denitrificans" är en gramnegativ, aerob bakterie som utför denitrifikation, en process där nitrat reduceras till gasformig kväve (N2) under syrebrist. Den kan leva på ett varierat näringsval och är vanligen belägen i vattenmiljöer, såsom mark och vattenreningssystem.
'Paracoccus pantotrophus' är en gramnegativ, aerob bakterie som förekommer i vattenmiljöer och kan orsaka infektioner hos människor, särskilt hos immunsupprimerade individer. Den är känd för sin förmåga att metabolisera en mångfald av organiska och anorganiska substrat, vilket har gett den dess namn, där 'pantotrophus' kommer från grekiskan och betyder "matare av allt".
Det sista oxidaset i andningskedjan. Det samlar ihop elektroner som överförts från reducerat cytokrom c och avger dem till molekylärt syre, som sedan reduceras till vatten. Enzymet består av cytokrom a och cytokrom b, två kopparatomer och 13 olika proteinunderenheter, av vilka kodas av mitokondrie-DNA. Ibland kallas det även komplex IV i andningskedjan. EC 1.9.3.1.
En grupp cytokromer med kovalenta tioeterbindningar mellan den ena av eller båda protohemvinylsidokedjorna och proteinet.
En nitritreduktase är ett enzym som katalyserar reduktionen av nitriter till någon form av kväve, inklusive ammoniak eller kvävgas. Dessa enzymer spelar en viktig roll i den biologiska nitrogenfixeringen och kan också vara involverade i patofysiologiska processer som hypoxia och cancer.
En nitratreduktas är ett enzym som katalyserar reduktionen av nitrat (NO3-) till nitrit (NO2-). Detta enzym förekommer hos både prokaryota och eukaryota organismer och spelar en viktig roll i olika metaboliska processer, såsom näringsupptag och avfallsbortskaffning. I vissa mikroorganismer kan nitratreduktasen även vara involverad i den anaeroba energiproduktionen genom den särskilda processen som kallas denitrifiering.
"Oxidation-reduction, or redox, refers to a type of chemical reaction where there is a transfer of electrons between two molecules, leading to a change in their oxidation state."
"Oxidoreduktaser är ett enzym som katalyserar oxidation-reduktionreaktioner, där elektroner överförs från ett molekylärt substrat, det reducerade substratet, till en acceptor, det oxiderade substratet."
Enzym som katalyserar dehydrogeneringen av sekundära aminer och ger upphov till en C=N dubbelbindning som primär reaktion. I vissa fall hydrolyseras denna senare.
Ett hemprotein som katalyserar oxidationen av ferrocytokrom c till ferricytokrom c i närvaro av väteperoxid. EC 1.11.1.5.
Electron-transferring flavoproteins (ETFs) are small, soluble proteins that play a crucial role in the electron transport chain in various organisms, including bacteria, archaea, and eukaryotes. They function as mobile carriers of electrons between different enzyme complexes within the respiratory and fermentative pathways.
En nitratreduktase är ett enzym som katalyserar reduktionen av nitrat (NO3-) till nitrit (NO2-).
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
"Nitrater" är ett samlingsnamn för salter av salpetersyra och inkluderar tre naturligt förekommande nitrater: natronitrat (NaNO3), kalciumnitrat (Ca(NO3)2) och kaliumnitrat (KNO3). Nitrater används främst som gödselmedel på grund av deras innehåll av växtnäringsämnet kväve. De kan även förekomma i vissa livsmedel, till exempel grönsaker och köttprodukter, och har då i regel bildats som en naturlig biprodukt under fermentationsprocesser. I högre koncentrationer kan nitrater vara skadliga för människor och orsaka bl.a. methemoglobinemi, ett tillstånd där syretransporterna i blodet påverkas negativt.
En teknik som är tillämpbar på en mängd olika ämnen som uppvisar paramagnetism till följd av magnetismen alstrad av opariga elektroner. Erhållna spektra kan användas för påvisande, identifiering, och bestämning av elektronstrukturer, undersökning av molekylers interaktioner, och för mätning av kärnspinn och magnetiska moment. Elektronisk dubbelresonansspektrografi (ENOR) är en variant av tekniken som ger bättre upplösning. Spinnresonansanalys kan göras in vivo, och inkluderar tillämpningar som t ex magnetresonans (MRI). Syn. ESR.
En stor grupp bakterier, omfattande dem som oxiderar ammonium eller nitrit, omsätter svavel och svavelföreningar, eller avsätter järn- eller manganoxider.
En viktig process i cellens energiomsättning. Förloppet då elektroner transporteras från ett reducerat substrat till molekylärt syre.
Det färggivande ämnet i hemoglobin. Det förekommer fritt i kroppsvävnader och som prostetisk grupp i många hemproteiner.
En färglös, brännbar vätska som används vid framställning av formaldehyd och ättiksyra, i kemiska synteser, som frostskyddsvätska och lösningsmedel. Förtäring av metanol ger förgiftning och kan orsaka blindhet.
Ett lösningsmedel som kan ha reproduktionstoxiska egenskaper.
Quinone reductases are a group of enzymes that catalyze the reduction of quinones to hydroquinones using NADH or NADPH as an electron donor. This reaction is important in the detoxification of quinones, which are produced during the metabolism of certain drugs and chemicals, as well as in normal cellular processes. High levels of quinone reductase activity have been associated with a reduced risk of cancer and other diseases, making it a potential target for therapeutic intervention.
*Alcaligenes faecalis* är en gramnegativ, aerob bakterie som förekommer naturligt i miljöer såsom vatten, jord och djurspillning. Den är en opportunistisk patogen hos människor, vilket betyder att den kan orsaka infektioner, särskilt hos immunsupprimerade individer. Infektioner som orsakas av *A. faecalis* innefattar urinvägsinfektioner, blodförgiftning och hud- och webbinfektioner. Den kan vara svår att behandla på grund av dess resistens mot flera antibiotika.
Metylaminers är en grupp signalsubstanser i hjärnan som är involverade i regleringen av kognitiva funktioner, emotioner och homeostatiska processer. De är excitatoriska neurotransmittorer som verkar genom att påverka jonkanaler i postsynaptiska neuron. Metylaminerna inkluderar dopamin, norepinefrin (noradrenalin) och serotonin, vilka alla har unika effekter beroende på var de aktiveras i centrala nervsystemet.
Denitrification är ett biologiskt process som sker under anoxiska (syrefria) förhållanden, där vissa bakterier omvandlar kväveoxider (t.ex. nitrat och nitrit) till gasformig kväve (N2), som sedan frisläpps till atmosfären. Detta är en viktig del av naturliga näringsämnescykler, men kan även bidra till föroreningar i mark och vatten om det sker i överdriven grad, exempelvis vid felaktig användning av konstgödsel eller avlopp.
Elektrontransportkomplex III, även känt som cytochrom b-c1 komplex eller ubihydrokinas, är ett enzymkomplex inblandat i den mitokondriella elektrontransportkedjan, där det katalyserar överföringen av elektroner från ubichinol till cytochrom c. Detta steg genererar energi i form av protonmotivkraft, vilket används för att producera ATP, den huvudsakliga energikällan i celler.
Deoxiribonukleinsyra (arvsmassa) hos bakterier.
16S RNA er en typ av ribosomalt RNA (rRNA) som finnes i prokaryote ribosomer og har en viktig rolle i translasjonen av genetisk informasjon til proteinsyntese. 16S rRNA-molekylen er en del av den lille ribosomale subuniten og inneholder konserverte sekvensregioner som kan brukes til identifisering og klassifisering av forskjellige arter av bakterier og archaea.
Ett bakteriellt protein från Pseudomonas, Bordetella eller Alcaligenes som fungerar som elektronöverföringsenhet tillsammans med cytokromkedjan. Molekylvikten är ca 16 000, och det innehåller en enda kopparatom, har intensivt blå färg och fluorescerar vid 308 nm.
Sulfitdehydrogenasa är ett enzym som katalyserar reaktionen där svaveldioxid (SO2) reduceras till sulfithaltiga föreningar, såsom svavelsulfat (SO3²-) eller svavelväte (H2S), med simultant oxidation av en elektrondonor, ofta en organisk sulfid. Denna process är viktig inom cellers reduktiva metabolism och detoxifiering av skadliga svavelkomponeter.
I en enkel medicinsk definition är nitriter kemiska föreningar som innehåller en nitrogrupp bundet till en eller två väteatomer och en kolgruppering. De används vanligtvis inom medicinen som läkemedel, särskilt under namnet glycerintrinitrat, för att behandla angina pectoris (svår bröstsmärta orsakad av hjärtklafforsmak) eftersom de verkar vidga blodkärlen och förbättra blodflödet till hjärtat.
Betasulfoalanin. En aminosyra med en sulfonsyragrupp vid C-änden som isolerats från hår hos människa, oxiderat med permanganat. Den finns normalt i fårpälsens ytterskikt, där ullen är utsatt för ljus och väder.
Proteiner som har en eller fler hårt bundna metalljoner i sin struktur.
I medicinen refererer protoner til positivt ladede partikler, som normalt findes i atomkerner sammen med neutroner og neutroner. Protoner spiller en vigtig rolle i kemiske reaktioner, herunder også i cellers energiproduktion, hvor de frigives under nedbrydningen af glukose via cellemembranens protonpumpe og dermed producerer ATP, cellsensenergi.
Svavel (S) är ett icke-metalliskt grundämne som förekommer naturligt i naturen och är en essentiell näringsämne för levande organismer. Det är ett giftigt, illaluktande, gulaktigt gas vid rumstemperatur och omvandlas till en fast, vit substans under lägre temperaturer. Svavel förekommer i proteiner och som svavelkväveföreningar i levande växter och djur. Det används också inom industrin för att producera svavelsyra, kemikalier, gummi, pesticider och som desinfektionsmedel.
Ett membranbundet mitokondrieprotein av c-typ, med molekylvikt 30 kD, som fungerar som elektrongivare till cytokrom c i andningskedjan i mitokondrier och bakterier.
Proteiner förekommande hos någon bakterieart.
"Tiosulfater" är ett samlingsnamn för salter av tiosulfatjonen, S2O3 2-, som är en svagt reducerande agent och används inom medicinen som ett antidot vid till exempel cyanidförgiftning. Den reagerar med cyanid i kroppen och omvandlar det till den mindre giftiga thiocyanatjonen.
En livsmiljö utan syrgas.
Spektrofotometri är en teknik för att mäta absorptionen av ljus av olika våglängder, vilket används inom medicinen för att exempelvis bestämma koncentrationen av olika substanser i ett prov, såsom blodprov.
Flavoproteiner är proteiner som binder flavinmononukleotid (FMN) eller flavinadensindinukleotid (FAD), två former av vitamin B2. Dessa koenzymers fungerar som elektrontransportörer i en rad biologiska reaktioner, inklusive oxidation-reduktionreaktioner. Flavoproteiner deltar i ett brett spektra av cellulära processer, såsom aerobisk and respiration, fotosyntes och metabolismen av aminosyror, fettsyror och karbohydrater.
"Avloppsvatten" är ett samlingsbegrepp inom medicinen för vatten som innehåller bakterier, virus eller andra mikroorganismer som kan vara skadliga för människors hälsa. Detta vatten kommer oftast från toaletter, badrum, kök och industriella processer. Avloppsvatten kan innehålla patogener som orsakar sjukdomar såsom diarré, mag-tarmloppstillstånd, hudinfektioner och andningsvägsinfektioner. Riskerna med avloppsvatten är speciellt höga i områden med bristfällig sanitet och hygien.
En flerstegsprocess som omfattar DNA-kloning, mappning, subkloning, sekvensering och analys av data.

'Paracoccus' är ett släkte av gramnegativa, aeroba bakterier som tillhör familjen Rhodobacteraceae. Dessa bakterier är kemoorganotrofa och kan oxidera en rad olika organiska ämnen som kolkälla. De flesta arterna i släktet Paracoccus är också fototrofa, vilket betyder att de kan använda solljus som energikälla genom fotosyntes.

Paracoccus-bakterier förekommer vanligtvis i vattenmiljöer och kan hittas i sötvatten, bräckt vatten och marina miljöer. De kan också påträffas i jord och i association med växter och djur.

Ett välkänt exempel på en art inom släktet Paracoccus är P. denitrificans, som är känd för sin förmåga att reducera kväve till gasformigt kväve (N2) under syrebrist, ett process som kallas denitrifiering. Denna bakterie används kommersiellt inom avloppsbehandling och i andra industriella processer där det behövs avlägsnas överflödigt kväve.

'Paracoccus denitrificans' är en gramnegativ, aerob bakterie som normalt förekommer i vattenmiljöer. Den har förmågan att utföra denitrifikation, ett biologiskt process där kväveoxider reduceras till gasformig kväv till följd av brist på syre (O2). Detta gör att bakterien kan leva i miljöer med lågt syrehalt och är användbar inom avloppsbehandling och bioremediering. 'Paracoccus denitrificans' kan också oxidera en rad kolväteföreningar som en del av sin ämnesomsättning, vilket gör att den kan användas inom biobränsleproduktion.

'Paracoccus pantotrophus' är en gramnegativ, aerob bakterie som tillhör släktet Paracoccus. Den är känd för sin förmåga att metabolisera en mångfald av olika organiska och icke-organiska substrat som kolkälla, inklusive en- och flerkarbonater, alkaner, aromatiska kolväten och aminosyror. Detta gör den till en mycket anpassningsbar art, och den har påträffats i en rad olika miljöer som exempelvis jord, vatten, luft och petroleumprodukter.

'Paracoccus pantotrophus' är även kapabel till den så kallade "dENDRA-processen", vilket innebär att den kan använda väte som elektrondonator under sin ämnesomsättning, vilket gör den till en potentialt intressant art för bioteknologiska tillämpningar inom exempelvis vätgasproduktion och bioremediering.

Elektrontransportkomplex IV, också känd som cytochrom c oxidase, är ett enzym i mitokondriernas inre membran i celler. Det är den sista komponenten i den elektrontransportkedja som genererar ATP (adenosintrifosfat) genom cellegensis. Elektrontransportkomplex IV katalyserar oxidationen av reducerad cytochrom c och reduktionen av syre till vatten. Detta steg är kritiskt för den cellulära andningen eftersom det är här där de sista elektronerna överförs till syre, vilket leder till bildandet av vatten istället för farliga och reaktiva syrgasradikaler.

Cytokrom c är ett proteinskt enzymsystem som deltar i cellandningen, eller celldygnaden, i mitochondrier. Det består av en hemgrupp och två proteinkedjor och har en viktig roll i den elektrontransportkedjan där det hjälper till att generera energi i form av ATP (Adenosintrifosfat). Cytokrom c kan även vara involverat i apoptos, eller programmerad celldöd. Det är lokaliserat i mitochondriernas intermembranrum och har en molekylvikt på cirka 12 kDa.

En nitritreduktase är ett enzym som katalyserar reduktionen av nitriter till någon form av kväve, inklusive ammoniak, kvävgas eller oxiderade kväveföreningar. Det finns två huvudsakliga typer av nitritreduktaser: assimilativa och dissimilativa. Assimilativa nitritreduktaser förekommer hos växter och många mikroorganismer, där de reducerar nitrit till ammoniak som en del av processen att använda kväve i biosyntesen av aminosyror. Dismilativa nitritreduktaser förekommer hos vissa anaeroba bakterier och arkéer, där de reducerar nitrit till kvävgas som en del av den processen att oxidera organiska ämnen för energiutvinning. Det finns också en tredje typ av nitritreduktas, kallas cytochrom c-nitritreduktas, som förekommer hos vissa proteobakterier och reducerar nitrit till niter eller kvävoxider.

En nitratreduktas är ett enzym som katalyserar reduktionen av nitrat (NO3-) till nitrit (NO2-). Det finns två typer av nitratreduktaser: assimilatoriska och dissimilatoriska. Assimilatoriska nitratreduktaser förekommer hos växter, alger och vissa bakterier och används för att konvertera kväve till en form som kan användas för att bygga upp aminosyror och andra organiska molekyler. Dismimilatoriska nitratreduktaser förekommer hos vissa bakterier och används för att oxidera organiska ämnen under syrefria förhållanden, vilket resulterar i produktionen av kvävegas som en slutprodukt.

Oxidation-reduction, också känt som redoxreaktioner, är en process där elektroner överförs från ett molekyl eller jon till ett annat. Det består av två delprocesser: oxidation och reduction.

Oxidation definieras som förlusten av elektroner eller ökning av oxidationstallet hos ett atom eller molekyler. Reduction är motsatsen, där det finns en vinst av elektroner eller minskning av oxidationstalet hos ett atom eller molekyler.

I allmänhet är oxidationen kopplad till en ökning i oxidationsgraden och reductionen med en minskning i oxidationsgraden. Detta kan illustreras genom följande exempel:

2Na (s) + Cl2 (g) -> 2NaCl (s)

I denna reaktion är natrium (Na) oxiderat, eftersom det förlorar en elektron och bildar Na+. Chlor (Cl2) är reducerat, eftersom det vinner elektroner och bildar Cl-. Detta visar hur oxidation och reduction sker samtidigt i samma reaktion, vilket kallas en redoxreaktion.

Oxidoreduktaser är ett samlingsnamn för en grupp enzymer som katalyserar o oxidations-reduktionsreaktioner, där elektroner överförs från ett ämne (donator) till ett annat (acceptor). I dessa reaktioner ändras donatorns oxidationstal medan acceptorns oxidationstal minskar. Oxidoreduktaser delas in i olika klasser baserat på de aktiva centra där elektronöverföringen sker, till exempel:

1. Oxidas (EC 1) - använder molekylär syre som acceptor
2. Dehydrogenaser (EC 1.1) - överför väteatomer mellan substrat och NAD+/NADP+ eller FAD
3. Reduktaoser (EC 1.2) - använder kemiska reduktanter som acceptorer
4. Oxidoreduktaser som överför elektroner till metalljoner (EC 1.16-1.19)

Oxidoreduktaserna är viktiga för cellens energiproduktion, metabolism och homeostas.

'Oxidoreductases acting on CH-NH group donors' är en kategori inom klassificeringssystemet EC-nummer (Enzyme Commission number) för enzymer. Detta betyder att de specifika enzymer som faller under denna kategori katalyserar reaktioner där en donator av en CH-NH grupp reduceras, medan en acceptor oxideras.

Exempel på enzymer inom denna kategori är:

* EC 1.5.1: L-lysin-5,6-aminomutase
* EC 1.9.3.1: Formamidase
* EC 1.9.7.1: Dimetylsulfoniopropionat degradering

Det är värt att notera att det finns många andra kategorier av oxidoreduktaser som agerar på olika typer av donatorer och acceptorer, såsom EC 1.1 (oxidoreductaser som agerar på CH-OH grupper), EC 1.3 (aktiverande enzymer för karboxylgrupps oxidering) och EC 1.10 (hydroxylaser).

Cytochrom c-peroxidase är ett enzym som förekommer hos vissa bakterier och archaea. Det innehåller hemgrupp, liksom cytochrom c hos eukaryoter, men dess funktion är något annorlunda. Cytochrom c-peroxidaser katalyserar reduktionen av peroxider till vatten med hjälp av reducerad cytochrom c som elektrondonator. Reaktionen kan skrivas som följer:

ROOR + 2cyt c(red) + 2H+ → ROH + H2O + 2cyt c(ox)

där R kan vara en organisk substans eller väte. Detta enzym är intressant eftersom det kan katalysera reduktionen av väteperoxid till vatten utan att bilda radikaler som kan skada cellen.

Electron-transferring flavoproteins (ETFs) are small protein complexes that play a crucial role in the electron transport chain in various organisms, including bacteria, archaea, and eukaryotes. They are named after their ability to transfer electrons via a covalently bound flavin adenine dinucleotide (FAD) cofactor.

ETFs function as mobile electron carriers between different enzyme complexes in the respiratory chain or during fatty acid oxidation. They can accept and donate electrons to various redox partners, facilitating the transfer of reducing equivalents across the cell membrane. This versatile electron transfer ability makes ETFs essential for the overall energy metabolism in many organisms.

In summary, electron-transferring flavoproteins are protein complexes involved in electron transport chains that facilitate the movement of electrons via a covalently bound FAD cofactor between different redox partners in various cellular processes, such as respiration and fatty acid oxidation.

En nitratreduktase är ett enzym som katalyserar reduktionen av nitrat (NO3-) till nitrit (NO2-). Detta enzym förekommer naturligt i vissa bakterier, växter och djur, inklusive människan. I människokroppen är nitratreduktaser involverade i metabolismen av vissa läkemedel och kemikalier.

Det finns två huvudtyper av nitratreduktaser:

1. Den första typen, assimilatoriska nitratreduktas, hittas hos växter och bakterier som använder sig av denna process för att tillgodogöra sig kväve från miljön. Detta enzym finns i kloroplasten hos växter och reducerar nitrat till nitrit, vilket sedan kan konverteras till ammoniak och införlivas i aminosyror.

2. Den andra typen, dissimilatoriska nitratreduktas, återfinns hos vissa bakterier som använder nitrat som ett elektronacceptor under anaeroba förhållanden. Detta enzym är involverat i den process som kallas denitrifikation, där kväveoxider reduceras till gasformig kväve (N2).

Det är värt att notera att överexponering för nitratreduktaser kan vara skadligt eftersom höga nivåer av nitrit kan orsaka metemoglobinemi, en sjukdom där blodets förmåga att transportera syre minskar.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

'Nitrater' är ett samlingsnamn för salter av salpetersyra och inkluderar ämnen som natronitratsalt (sodium nitrat) och kaliumnitrat (kalciumnitrat). I medicinsk kontext används ofta natronitratsalt som ett läkemedel, som vasodilatator, för att behandla angina pectoris (svårigheter att andas orsakade av bröstsmärta) och hjärtbesvär. Nitrater fungerar genom att öka blodflödet till hjärtat och minska på det totala behovet av syre i kroppen, vilket kan hjälpa att förhindra anginal symptom.

Electron Spin Resonance Spectroscopy (ESR or EPR) er en teknisk metode i fysikken og kjemien som brukes for å studere et materiales elektronspinn. Denne teknikken er spesiell nyttig for å identifisere radikaler, defekter i faststoffer, metallioner med ufullt fylt d-skal, og andre systemer med en uendreidig antall elektroner.

I ESR spektroskopi, et magnetisk felt appliceres til et prøvemateriale plassert i en resonanskavitet. Dette fører til at elektronspinnene i materialet oppdelt seg i to separate tilstander med forskjellige energi. Elektromagnetisk stråling, vanligvis i form av mikrobølger, sendes inn i kaviteten og får noen av elektronspinnene til å endre tilstand. Denne overgangen kan detekteres og måles for å produsere et ESR-spekterum som inneholder informasjon om materialets egenskaper, inkludert størrelsen og typen av elektronspinnsystemet, samt andre parametre som avstanden mellom spinne og andre defekter i faststoffet.

ESR spektroskopi er en viktig teknisk metode innenfor flere områder av fysikk og kjemi, blant annet materialvitenskap, kjemisk syntese, biofag, geofag og astronomi.

Ett sätt att definiera begreppet "gramnegativa kemolitotrofa bakterier" är följande:

Gramnegativa bakterier är en grupp av bakterier som inte tar upp violett färg when de färgas med Gram-färgning, till skillnad från grampositiva bakterier som behåller färgen. Istället färgar sig gramnegativa bakteriers cellmembran rött eller rosa.

Kemolitotrofa bakterier är en grupp av bakterier som kan använda kemiska föreningar som sin enda energikälla, istället för att behöva ljus som grönlundsväxter och andra fotosyntetiserande organismer. De oxiderar ofta svavelväte (H2S) eller ammoniak (NH3) till svavelicor (SO4^2-) eller nitrat (NO3-), respektive, och använder den frigjorda energin för att bygga upp sina celler.

Då således är gramnegativa kemolitotrofa bakterier en grupp av bakterier som inte tar upp violett färg med Gram-färgning, har ett rött eller rosa färgat cellmembran, och kan använda kemiska föreningar som sin enda energikälla.

Ett exempel på en gramnegativ kemolitotrof bakterie är *Thiobacillus denitrificans*, som lever i vatten och jord och kan oxidera svavelväte till svavelicor för att producera energi.

Elektrontransport är en biokemisk process som sker inne i celler och är en viktig del av cellandningen, eller celldygnets process. Det är en serie av redoxreaktioner där elektroner passerar mellan olika molekyler, vilket genererar energi i form av ATP (adenosintrifosfat).

I mitokondrierna, de subcellulära organellerna som är ansvariga för cellandningen, sker elektrontransporten i den så kallade elektrontransportkedjan. Denna kedja består av en serie komplexa proteiner och koenzym som sitter inbäddade i mitokondriens inre membran. Elektroner från reducerade coenzym, till exempel NADH och FADH2, passerar genom denna kedja och överförs till syre, vilket är det slutliga elektronacceptorn. Under transporten frigörs energi, som används för att pumpa protoner (H+) över mitokondriens inre membran, vilket skapar ett koncentrationsgradient. ATP-syntas, ett enzymkomplex beläget i mitokondriens inre membran, använder sedan denna gradient för att syntetisera ATP från ADP och fosfat.

I alltså är elektrontransporten en viktig process som genererar energi i celler genom en serie av redoxreaktioner där elektroner passerar mellan olika molekyler, vilket leder till skapandet av ATP.

'Hem' er ein term i medisin som refererer til det komplekse molekylet som inneholder jernet i hemoglobin, et protein i røde blodceller som transporterer ilt i kroppen. Hemet består av en organisk ringstruktur som kaller porfyrin, og jernet er faset inn i denne strukturen. Jernet i hemet kan reversibelt binde seg til ilt, og dette er viktig for ilts transport i blodet. Hem er også en del av andre enzymer som er involvert i cellulær respirasjon og oxidativ stressreaksjoner.

'Träsprit' är ett informellt och dialektalt uttryck för den metylalkohol (metanol) som kan framställas genom torrdestillation av trä. I medicinsk kontext används istället termen 'metanol' eller 'metylalkohol'. Metanol är en farlig substans som kan orsaka allvarliga skador på nervsystemet och ögonen, samt i värsta fall leda till dödsfall om det intas eller andas in.

Dimetylformamid (DMF) er en organisk forbindelse som vanligvis forekommer som en klar, flegmast væske. Det har den kemiske formel (CH3)2NCHO. DMF er en polær aprotisk solvent, det vil si at det kan opløse både hydrofile og hydrofobe stoffer, men ikke deltager i protonoverførsel. Dette gjør det til en viktig løsingsmiddel innenom kjemisk syntese, især for reaksjoner som involverer fosfiner og andre svært polære eller ioniske reaktanter.

DMF er ikke direkte giftig i små mengder, men eksposisjon over lengre tid kan føre til skader på leveren og nervesystemet. Det kan også være ødeleggende for huden og øyene ved kontakt. Derfor er det viktig å bruke personlig skyddsutstyr (PSU) når man arbeider med DMF.

Quinone reduktaser (QR) är en grupp enzymer som katalyserar reductionen av kvävebaserade eller svavelbaserade kvioner till deras respektive hydrokinoler. Det finns två huvudtyper av quinone reduktaser: NAD(P)H-avhängiga quinone reduktaser (EC 1.6.99.2) och FAD-avhängiga quinone reduktaser (EC 1.3.5.1).

NAD(P)H-avhängiga quinone reduktaser är enzymer som katalyserar reductionen av kvävebaserade kvioner till hydrokinoler med hjälp av NADH eller NADPH som elektrondonator. Dessa enzymer har en viktig roll i cellers skydd mot oxidativ stress, genom att reducera potential-skadliga kvävebaserade kvioner till deras mindre reaktiva hydrokinoler.

FAD-avhängiga quinone reduktaser är enzymer som katalyserar reductionen av både kvävebaserade och svavelbaserade kvioner till sina respektive hydrokinoler med hjälp av FAD som elektrondonator. Dessa enzymer deltar i cellers elektrontransportkedjor, där de hjälper till att transportera elektroner från reducerade koenzymer till terminala elektronacceptorer.

Quinone reduktaser har också visat sig ha potential som mål för cancerterapi, eftersom vissa typer av quinone reduktaser är överförda i cancerceller jämfört med normala celler.

'Alcaligenes faecalis' är en gramnegativ, aerob bakterie som tillhör familjen Alcaligenaceae. Den förekommer naturligt i miljöer som jord, vatten och djurfäkalier. Bakterien är kännetecknad av sin förmåga att oxidera en rad olika kolhydrater och organiska syror som energikälla. 'Alcaligenes faecalis' kan i sällsynta fall orsaka infektioner hos människor, ofta relaterade till immunförsvagning eller komplikationer efter kirurgiska ingrepp.

'Metylamin' er en organisk forbindelse som består av en kolhydridgruppe (–NH–) bundet til en metylgruppe (–CH3). I biologi og medisin refererer 'metylaminer' ofte til en gruppe neurotransmittere som inkluderer dopamin, noradrenalin (eller norepinefrin), og adrenalin (eller epinefrin). Disse er kjent som catekolaminer og spiller en viktig rolle i reguleringen av en rekke fysiologiske funksjoner, inkludert søvn/våkenhet, opmerksomhet, hukommelse, humør, blodtrykk, puls, og respirasjon.

Metylamin-gruppen kan binde seg til andre molekyler i kroppen og på denne måten endre deres egenskaper og funksjoner. For eksempel er metylering av enzymet histon et viktig mekanisme for regulering av genernes aktivitet. Anomalier i metylamin-metabolismen kan være involvert i ulike sykdommer, inkludert psykiatriske lidelser og kreft.

Denitrification is a process in microbiology where certain bacteria convert nitrates (NO3-) into nitrogen gas (N2) and other gaseous forms of nitrogen, such as nitrous oxide (N2O) and dinitrogen oxide (N2O4). This process occurs under anaerobic conditions, meaning in the absence of oxygen. The bacteria responsible for denitrification are known as denitrifiers, and they use nitrate as an alternative electron acceptor during respiration when oxygen is not available. This process plays a significant role in the nitrogen cycle, helping to regulate the amount of fixed nitrogen in the environment.

Elektrontransportkomplex III, även känd som cytochrom b-c1 komplex eller ubihydrokinas, är ett enzymkomplex inblandat i den mitokondriella elektrontransportkedjan. Det är beläget i inner membranen av mitokondrier och mikrosomer hos eukaryota celler och cellmembranet hos prokaryoter.

"Bakterie-DNA" refererer til det genetiske materiale i form av DNA (desoxyribonukleinsyre) som findes i bakterier. DNA består av to stränge av nukleotider som er forbundet til hverandre med basepar som er komplementære, dvs. A-T og G-C. Disse basepara koder for genene som styrer bakteriens funksjoner og egenskaper. Bakterie-DNA kan variere mye mellom forskjellige arter av bakterier og er ein viktig del av molekylærbiologien og -genetikken.

RNA (Ribonucleic acid) er ein type nucleinsyre som er nøysomt involvert i overføringen av genetisk informasjon fra DNA til ribosomer, der proteiner syntesises. RNA er en lineær polymér av nukleotider med en pentos sugar, ribose, som er knyttet til tre baser: adenin, guanin og uracil.

Ribosomen er organell i ei celle som syntiserer proteiner ved å lese og overføre informasjon fra RNA-molekyler. De består av to deler, en større subunit og en mindre subunit, som tilsammen utgjør en maskin som sammenkobler aminosyrer i den rekke de skal ha for å forme ein protein.

16S rRNA (ribosomalt RNA) er en type RNA-molekylt som finns i ribosomer og er involvert i translasjonen av genetisk informasjon til proteiner. 16S rRNA er ein del av den mindre subuniten i prokaryote ribosomer (bakterier og arkeer). Den har en viktig rolle i identifisering og klassifisering av forskjellige bakterieslag, fordi den inneholder konservierte sekvensregioner som er unike for hvert slag. Disse regionene brukes i metoden kallaet 16S rRNA-sekvensanalyse for å identifisere og klasifisere ukjente bakterier basert på deres genetiske sekvenser.

"Azurin" er en type protein som inneholder kobber (copper) og har blå farge. Det dannes naturlig i visse bakterier, og det antas at azurin spiller en viktig rolle i bakteriens elektrontransportkjede. Azurin har også vist seg å ha potentiale som en effektiv behandling for kreft, fordi det kan hjelpe til å generere frie radikaler som ødelegger kreftceller.

Sulfitdehydrogenas er ein enzym som deltar i bortføringen av sulfiter i kroppen. Det konverterer sulfiten til svovel (IV) sulfat, som kan fjernes fra kroppen. Dette enzymet finnes naturligvis i mange levande vesen, inkludert mennesker. Det er viktig for å holde balanse i kroppens svovelforhold og å beskytte mot skadelige effekter av for høye nivåer av sulfiter.

Nitriter är en typ av kemisk förening som innehåller en nitrogrupp (NO2) bundet till en väteatom. I medicinsk kontext refererar "nitriter" ofta till kemiska föreningar som används som läkemedel, särskilt som lättlösliga salter av nitritsyra. De används primärt som vasodilatatorer, det vill säga de orsakar utvidgning av blodkärlen, vilket kan vara användbart för att behandla akuta situationer såsom kärlkramp och lungemboli.

Dessutom bör nämnas att nitriter också förekommer naturligt i vissa livsmedel, som till exempel grönsaker, och kan även bildas som en biprodukt under nedbrytningen av proteiner i kroppen. Emellertid är det viktigt att vara medveten om att höga nivåer av nitriter kan vara skadliga, eftersom de kan reagera med sekundära aminerna i mag-tarmkanalen och bilda cancerogena ämnen som kallas nitrosaminer.

Cysteinyl acid, eller cysteinsyra, är en biologiskt betydelsefull aminosyra som innehåller en thiolgrupp (-SH), även känd som en svavelhaltig funktionell grupp. Den är en av de 20 standardaminosyrorna som används för att bygga proteiner, och den kan hittas i många olika proteiner i kroppen.

Cysteinyl acid spelar också en viktig roll i antioxidativt försvar genom att hjälpa till att producera glutation, ett tripeptid som hjälper till att skydda celler från skada orsakad av fria radikaler. Dessutom kan två cysteinyl acid-residyer bindas samman för att bilda en disulfidbrygga, vilket ger proteiner deras tertiära struktur och hjälper till att stabilisera proteinernas konformation.

Metalloproteiner är proteiner som innehåller en eller flera metallioner, vilka ofta är viktiga för proteinets funktion. Metallionen kan vara bundet till proteinets aktiva sida och delta i kemiska reaktioner, eller den kan ha en strukturell roll och bidra till att stabilisera proteinet. Exempel på metallproteiner inkluderar hemoglobin (järn), katalas (koppar) och superoxiddismutas (koppargrupp).

'Proton' är ett begrepp inom atomfysiken och betecknar en subatomär partikel som finns i atomkärnan. Protonen har en positiv elektrisk laddning och tillsammans med neutronerna utgör de atomkärnans kärnmassa. Protonens laddning anges vanligtvis som +1, vilket är den grundläggande enheten för elektrisk laddning inom fysiken. Protonens massa är ungefär lika med 1,67 x 10^-27 kg och är något större än neutronens massa. Protoner spelar en viktig roll inom kemi och fysik, bland annat i samband med kemiska reaktioner och radioaktivt sönderfall.

Själva grundämnet svavel (symbol: S) är inte direkt relaterat till medicin, men vissa svavelhaltiga kemiska föreningar kan ha medicinska användningsområden. Här följer en definition av en sådan svavelhaltig substans som kan användas inom medicinen:

Sulfasalazin: En läkemedelssubstans som används huvudsakligen för behandling av kronisk inflammatorisk tarmsjukdom (IBD), till exempel Crohns sjukdom och ulcerös kolit. Sulfasalazin är en kombination av två andra substanser, 5-aminosalicylsyra (5-ASA) och sulfapyridin, som tillsammans har antiinflammatoriska egenskaper. När sulfasalazin tas upp i kroppen splittras den upp till 5-ASA och sulfapyridin, där 5-ASA verkar direkt på tarmslemhinnan för att minska inflammationen.

Cytochrom c1 är ett protein som ingår i det elektrontransportkedjan i mitokondriernas inre membran. Det är en del av komplex III, även känt som cytochrom bc1-komplexet. Cytochrom c1 innehåller en hemgrupp och fungerar som en elektrontransportör mellan andra proteiner i komplexet. Cytochrom c1 är viktigt för cellens energiproduktion, genom att hjälpa till att generera ett proton gradient över mitokondriens inre membran, vilket sedan kan omvandlas till ATP, det primära energibäraren i cellen.

Bacterial proteins are simply proteins that are produced and present in bacteria. These proteins play a variety of roles in the bacterial cell, including structural support, enzymatic functions, regulation of metabolic processes, and as part of bacterial toxins or other virulence factors. Bacterial proteins can be the target of diagnostic tests, vaccines, and therapies used to detect or treat bacterial infections.

It's worth noting that while 'bacterieproteiner' is not a standard term in English medical terminology, I assume you are asking for information about proteins that are found in bacteria.

Tiosulfater är ett salt eller ester av tiosulfatjonen, S2O3 2-, som består av två svavelatomar och en syreatom. I medicinsk kontext används natriumtiosulfat ofta som ett reducerande medel för att behandla cyanidförgiftning. Det fungerar genom att reagera med cyanid till mindre giftiga produkter, vilket gör att det kan neutralisera cyanidens effekter på kroppen. Natriumtiosulfat används också som ett behandlingsmedel för gulsot hos nyfödda, eftersom det kan hjälpa till att eliminera bilirubin från kroppen.

'Anaerobic' er en medisinsk betegnelse for noen organismer, celler eller prosesser som ikke trenger ilt for å overleve eller foregå. Det kan også referere til miljøer uten ilt. I biologisk sammenhenging, innebærer 'anaerobios' vanligvis bakterielle vækster i en iltfattig omgivelse, som resulterer i fermentering av organiske stoffer for å produsere energi i form av ATP (Adenosintrifosfat).

Der er to typer anaerobe prosesser: obligate anaerobe prosesser og fakultativt anaerobe prosesser. Obligate anaerobe organismer kan ikke overleve i iltrikende miljø, mens fakultativt anaerobe organismer kan tolerere ilt og kan vokse både i iltfattige og iltrende miljø.

Specifikalt within medical field, spektrofotometri er en laboratoriemetode for å måle absorpsjonen av lys av ulike bølgelengder som passerer gjennom et prøvemateriale. Metoden brukes ofte i biokjemisk analyse til å bestemme konkentrasjonen av en substans, som f.eks. et kjemisk eller biologisk stoff, i en prøve ved å måle absorpsjonen av lys av en spesiell bølgelengde som er karakteristisk for dette stoffet.

I simplifisert termer, spektrofotometri innebærer at man sender en stråle med ulike bølgelengder av lys gjennom et prøvemateriale og måler hvor mye lys som absorberes ved hver bølgelengde. Dette gir en spektral signatur eller kurve som kan sammenlignes med referansespektre for å identifisere og kvalitativt eller kvantitativt bestemme eksisterende stoffer i prøven.

Denne teknikken er viktig innen områder som f.eks. klinisk biokjemisk analyse, farmakologi, mikrobiologi og miljøanalyse.

Flavoproteiner är proteiner som innehåller en eller flera flavinkoenzymgrupper, vanligtvis i form av FAD (flavinadenindinukleotid) eller FMN (flavinmononukleotid). Dessa koenzymgrupper deltar som elektronmottagare och -donatorer i en rad olika biokemiska reaktioner, inklusive oxidation-reduktionreaktioner. Flavoproteiner är involverade i ett brett spektra av cellulära processer, såsom celldygningsprocesser, metabolismen av aminosyror, fettsyror och karboxylsyror, samt i det elektrontransportsystemet. Exempel på flavoproteiner är dekonsyderaser, xantinoxidas och sarcosinoxidas.

Avloppsvatten är enligt medicinsk terminologi en benämning på vatten som innehåller föroreningar från mänsklig aktivitet, exempelvis från toaletter, kök och industri. Avloppsvattnet kan vara orena med bakterier, virus, parasiter, kemikalier och andra föroreningar som kan utgöra en risk för människors hälsa och miljön om det inte behandlas korrekt.

Ordet 'Avloppsvatten' används ofta i medicinska sammanhang när man diskuterar smittspridning och förebyggande hälsomått, särskilt i samband med vattenborne sjukdomar som drabbar människor via kontaminert vatten.

DNA-sekvensanalys är en metod inom genetiken och bioinformatiken som används för att bestämma den exakta ordningsföljden (sekvensen) av nukleotider (baser) i en DNA-molekyl. Genom att undersöka och jämföra dessa sekvenser kan man få information om individens genetiska make-up, evolutionära härstamning och samband med olika arvsbundna sjukdomar eller andra genetiska egenskaper. DNA-sekvensanalys används också för att identifiera mikroorganismer såsom bakterier och virus genom att jämföra deras genetiska sekvenser med kända exemplar i databaser.