Selencystein
Selenproteiner
RNA, Transfer, Amino Acid-Specific
Selen
Selenprotein P
Tioredoxin-disulfidreduktas
Formatdehydrogenaser
Stoppkodon
Selenradiosotoper
RNA, transfer, Ser
Glutationperoxidas
Selenprotein W
RNA, Transfer, Amino Acyl
Organoselenföreningar
Tioredoxinreduktas 1
Kodon
Lyaser
Natriumselenit
Molekylsekvensdata
Selenious Acid
Tyreoperoxidas
Nukleinsyrakonfiguration
Bassekvens
Selenföreningar
Peptidförlängningsfaktorer
3` otolkade områden
Serin-tRNA-ligas
Methionine Sulfoxide Reductases
Proteinbiosyntes
Hydrogenas
Aminosyrasekvens
Proteiner
Methanococcales
Antikodon
Selenbindande proteiner
Kolibakterie
Methanococcus
tRNA-aminoacylering
Transferaser
RNA-bindande proteiner
Selenmetionin
Kol-svavellyaser
RNA, budbärar
Svavel
Kloning, molekylär
Tioredoxinreduktas 2
Sekvenshomologi, aminosyra
Katalys
Biokatalys
Auranofin
Sekvensinpassning
Isopentenyladenosin
Glutationreduktas
Vitamin U
Selenocysteine er en sjeldent forekommende aminosyre i proteiner hos levende organismer. Det er den 21. proteinogenen aminosyren, og det inkluderes i visse proteiner som en del av deres struktur og funksjon. Selenocystein har en selenatom i stedet for en sulfuratom, som er tilfelle i den mer alminnelige aminosyren cystein. Denne selenatomen gir selenocystein unik biokjemisk aktivitet og kan være involvert i en rekke avgjørende biologiske prosesser, inkludert antioxidativt beskyttelse og redoxreaksjoner.
Det er verdt å nevne at selenocystein ikke er en standard aminosyre som inkluderes i de 20 vanlige proteinogenene aminosyrer. I stedet er det syntetisert på en speciel måte under proteinsyntesen, og det koding av genene for selenoproteiner involverer en unik mekanisme som inkluderer en særskilt tRNA-molekyl (tRNA^[Ser]Sec) og en selenocystein-specifik initiatorfaktor (IFS). Dette gjør produksjonen av selenoproteiner mer kompleks enn vanlige proteiner, men det er likevel viktig for mange biologiske prosesser hos både dyr og bakterier.
Selenoproteiner är proteiner som innehåller aminosyran selenocystein (Sec), vilket är den enda naturligt förekommande aminosyran som inkluderas i proteinsekvenser genom ett specifikt signalsystem under translationen. Selenocystein innehåller en seleenatom, och det finns 25 kända humana selenoproteiner som har en aktiv roll i vår fysiologi. Dessa proteiner är involverade i en rad cellulära processer, såsom antioxidativt försvar, skydd mot oxidativ stress, immunförsvar och skydd mot celldöd. Selenets inkorporering i dessa proteiner är viktigt för deras funktionella aktivitet och struktur.
Transfer RNA (tRNA) som är specifik för ett visst aminosyra är en typ av RNA-molekyl som transporterar en specifik aminosyra till ribosomen under processen av proteintranslering. Varje typ av tRNA har en unik sekvens av nukleotider, anticodon, som kan para ihop sig med mRNAs komplementära kodonsekvens, för att säkerställa att rätt aminosyra kopplas till rätt position i den syntetiserade peptidkedjan. Aminosyran binds till tRNA:t via en esterbindning mellan aminosyrans karboxylgrupp och tRNAs 3'-OH-grupp, vilket katalyseras av en specifik aminoacyl-tRNA-syntetas. Denna process säkerställer att informationen i DNA:t korrekt tolkas och omvandlas till en funktionell proteinsekvens under cellens proteinsyntes.
Selen är ett spårelement, vilket betyder att det förekommer i mycket låga koncentrationer i levande organismers kroppar. Det är ett viktigt beståndsdel i flera enzymer som har antioxidativa egenskaper och bidrar därmed till att skydda celler från skada. Selen ingår också i det enzym som aktiverar den viktiga hormonet sköldkörtelhormonet.
Selen förekommer naturligt i vissa livsmedel, såsom nötter (särskilt brasilianska nötter), fisk och skaldjur, ägg, gröna bladgrönsaker och svampar. Det kan också tas som närings supplement.
Det rekommenderade dagliga intaget av selen för vuxna är 55 mikrogrammar (µg) per dag enligt the National Institutes of Health i USA. Det är viktigt att inte överskrida det högsta rekommenderade dagliga intaget, som är 400 µg per dag, eftersom för höga nivåer kan vara skadliga.
Selenoprotein P, också känt som SEPP1 (Selenoprotein P plasma protein), är ett protein som innehåller flera seleniumatomer och produceras i levern. Det transporterar selenium i blodomloppet till andra delar av kroppen, där det används för att producera andra selenoproteiner med antioxidativ verkan. Selenoprotein P har också en roll i att minska oxidativ skada och skydda neuroner i hjärnan.
Tioredoxin-disulfidreduktas (TDR) är ett enzym som hjälper till att reducera, eller sänka, oxidationsgraden på proteiner i celler. Det gör detta genom att överföra elektroner från NADPH till disulfidbryggor i proteinerna, vilket bryter dem ned och reducerar proteinet. TDR är viktigt för att hålla cellens reduktiva potential i balans och för att skydda cellen mot oxidativ stress. Det spelar också en roll i celldelning, signaltransduktion och andra cellulära processer.
Formatdehydrogenaser är ett enzymkomplex som katalyserar den sista steget i biosyntesen av nukleotidbasen FAD (flavinadenindinukleotid) från dess prekursor, R5P (ribos-5-fosfat). Detta enzym hittas vanligtvis i bakterier och archaea, men saknas hos djur. Formatdehydrogenaser katalyserar den irreversibla reaktionen där R5P reduceras till FAD genom en serie av redoxreaktioner. Detta enzym är viktigt för cellens metabolism eftersom FAD är en koenzym som involveras i en mängd olika oxidoreduktaseraktioner inom cellen.
Ett stoppkodon är en sekvens av tre nukleotider (en kodon) i DNA eller mRNA-sekvens som inte kodar för en aminosyra, utan istället signalerar för att translationen ska avbrytas. Det finns tre olika stoppkodon: UAG, UAA och UGA. När dessa kodoner läses av ribosomen under proteinsyntesen kommer translationen att avbrytas och det resulterande peptidkedjan klipps loss från tRNA och ribosomen. Detta är en nödvändig process för att producera fullständiga, funktionella proteiner.
Selen-radioisotoper är radioaktiva varianter av grundämnet selen. Selen är ett spårämne som är nödvändigt för djurs och människors hälsa, men i för höga doser kan det vara skadligt.
Selen-radioisotoper används inom medicinen för att behandla vissa typer av cancer, såsom sköldkörtelcancer och prostatacancer. De kan också användas i diagnostiska procedurer för att hjälpa läkare att identifiera och undersöka sjukdomar inom kroppen.
Exempel på vanligt använda Selen-radioisotoper inkluderar Selenium-75 och Selenium-77. Dessa isotoper har olika halveringstider och emissionskärnor, vilket gör dem användbara för olika medicinska tillämpningar.
Selen-radioisotopbehandlingar ska endast utföras under kontroll av kvalificerad medicinsk personal och med godkännande från relevanta myndigheter, på grund av de potentiella riskerna som är associerade med användandet av radioaktiva substanser.
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteinsyntesen. Varje tRNA-molekyl har en speciell sekvens av nukleotider, kallad antikodon, som kan binda till motsvarande komplementära kodon på en mRNA-molekyl under proteinsyntesen.
tRNAs är också associerade med en specifik aminosyra genom en process som kallas aminosylering. Varje tRNA-molekyl har en speciell plats, kallad acceptorställe, där den kan binda till sin respektive aminosyra genom hjälp av enzymet aminosyrsyreatas.
tRNA Ser står för transfer RNA serin, och det är ett specifikt tRNA som är associerat med aminosyran serin. Det finns flera olika typer av tRNA Ser i cellen, beroende på vilken sekvens av nukleotider de har och vilka kodon de kan binda till på mRNA-molekylen.
Glutationperoxidas (GPO) er ein enzym som innehar selvetsyntetisert kobber- eller jern-basert prostgrupp, og som spiller en viktig rolle i cellens forsvar mot oxidativ stress. GPO katalyserer reaksjonen mellom reduktivt glutation (GSH) og hydrogenperoxid (H2O2), resulterende i oksidert glutation (GSSG) og vann. Dette hjelper å hindre skadelige effekter av fri radikaler som kan skape celleskade og sykdom. Det finnes noen forskjellige typer GPO, og de er spesielt viktig i bestemte celler og organer, særlig i leveren.
Selenoprotein W, också känt som selenocystein-syntetas, är ett protein som innehåller selenium i form av aminosyran selenocystein. Detta protein spelar en viktig roll i den centrala nervösa systemets homeostas och har antagits ha neuroprotektiva egenskaper. Selenoprotein W är involverat i skyddet av celler mot oxidativ stress, som kan orsaka celldöd och är associerad med flera neurologiska sjukdomar. Det är ett litet protein som består av cirka 90 aminosyror och uttrycks i höga nivåer i hjärnan och musklerna hos däggdjur.
Transfer RNA (tRNA) är ett slags RNA-molekyler som spelar en central roll i den genetiska koden och proteintranslationsprocessen. Varje tRNA-molekyl innehåller en specifik sekvens av nukleotider, kallad anticodon, som kan binda till motsvarande kodon (en sekvens av tre nukleotider) på en mRNA-molekyl under translationen.
Aminoacyl-tRNA är ett komplex bestående av en tRNA-molekyl och en specifik aminosyra som är kovalent bundet till denna tRNA via en reaktion kallad aminoacylering. Denna reaktion katalyseras av enzymer kallade aminoacyl-tRNAsynthaser, där varje enzym är specifikt för att koppla en viss aminosyra till sin tRNA. När detta komplex binder till den rätta mRNA-kodonsekvensen under translationen, kan aminosyran transporteras in i den växande peptidkedjan och därmed bygga upp ett protein enligt den genetiska koden.
Organoselenföreningar är kemiska föreningar som innehåller kol (organo-) och selen (seleno-). Selen är ett spårämne som är nödvändigt för vissa enzymer i kroppen, men vid högre koncentrationer kan det vara skadligt. Organoselenföreningar har studerats för sin potentiala att fungera som antioxidanter och möjligen skydda mot cancer, men forskningen på området är fortfarande preliminärt.
Tioridoxinreduktas 1 (TrxR1) är ett enzym som ingår i cellens antioxidativa system. Det är ansvarigt för att regenerera det antioxidativa proteinen tioridoxin (Trx), genom att reducera dess disulfidbrygga till två thiolgrupper. TrxR1 är ett flavoprotein som innehåller en FAD-grupp och en molekylärt syreberoende aktivt centrum med två selenocysteiner. Det reducerar Trx genom att överföra elektroner från NADPH till disulfidbryggan i Trx, vilket leder till att den blir reducerad och kan återuppta sin antioxidativa funktion. TrxR1 har också visat sig ha en viktig roll i celldelning, signaltransduktion och DNA-syntes.
Enligt medicinskt lexicon är ett kodon ett trentals sekvens av nukleotider i DNA eller RNA som koder för en viss aminosyra under processen av proteintranslering. I mRNA består varje kodon av tre baser, och det finns 64 möjliga kodonkombinationer. Av dessa kodar 61 för specifika aminosyror, medan de resterande tre (UAA, UAG och UGA) är stoppkodon som signalerar slutet på proteinkedjan.
I en medicinsk kontext är en lyas ett enzym som bryter ned (hydrolyserar) en substratmolekyl genom att eliminera en grupp, ofta vatten, och bildar två produktmolekyler. Lyaserer katalyserar reaktioner där en dubbelbindning brutits upp, till exempel mellan kolatomerna i ett kolhydrat eller en fettsyra. Det finns olika typer av lyaser beroende på vilken typ av bindning som hydrolyseras. Exempel på lyaser inkluderar dezymiperoxidas, kinas och proteas.
Natriumselenit är ett salt av det essentiella spårelementet selen. Det används inom medicinen som en dietary supplement och har potentiala positiva effekter på vissa hälsoproblem, såsom kardiovaskulära sjukdomar, cancer och sköldkörtelrelaterade störningar. Natriumselenit fungerar som ett antioxidativt medel genom att hjälpa till att skydda celler från skada orsakad av fria radikaler. Det kan också bidra till en förbättrad immunfunktion och förhindra oxidativ stress. Natriumselenit intas vanligtvis per oral, men kan också ges intravenöst under vissa omständigheter.
Cysteine är en svagt luktande sulfhydrylgrupp (SH)-bärande proteinogen aminosyra. Den har den kemiska formeln HO2CCH(NH2)CH2SH. Cystein kan bilda disulfidbindningar (-S-S-) med andra cysteiner, vilket är viktigt för tredimensionell struktur hos vissa proteiner. I enzymer spelar cystein ofta en roll som nukleofil i katalytiska reaktioner.
Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.
DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.
Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.
Selenious acid, även känt som selenium dioxide eller selenium(IV) oxid, är ett surt, vitaktigt ämne med formeln SeO2. Det är en oorganisk oxosyra av selen. Selenious acid används inom organisk syntes för att introducera selenatomer i organiska molekyler och som en källa till selen i glasyrer och smälta.
Det är värt att notera att selenious acid inte är något vanligt förekommande ämne inom medicinen, men selen är ett essentiellt spårämne för människor och djur och ingår i flera enzymer. Selen kan ha potentiala hälsoeffekter vid optimal dosering, men högre doser kan vara skadliga. Det rekommenderade dagliga intaget av selen för vuxna är 55 mcg enligt the National Institutes of Health (NIH).
Tyreoperoxidase (TPO) er ein enzym som fungerer som ein katalysator i produksjonen av skjoldbruskkjeretshormonet. Det er lokalisert i folikelcellene i skjoldbruskkjerten og er viktig for konverteringen av jodid til jod, som er en grunnleggende prosess i syntesen av skjoldbruskkjeretshormoner. Tyreoperoxidas kan også spille en rolle i immunforsvaret og ha bakteriedrapsfunksjon. Dypere medisinske definisjoner vil typisk inneholde mer detaljert informasjon om strukturen, funksjonen, reguleringen og klinisk signifikans av tyreoperoxidas.
Nukleinsyrakonfiguration refererar till den tresdimensionella strukturen hos nukleinsyra, som kan vara antingen DNA (deoxiribonucleic acid) eller RNA (ribonucleic acid). Det finns två huvudsakliga konfigurationer av dubbelsträngat DNA: A-DNA och B-DNA.
A-DNA är en kompaktare form av DNA som förekommer under torra förhållanden eller när DNA binds till proteiner. Den har en större diameter och en rakare, mer stram struktur än B-DNA.
B-DNA är den mest vanliga formen av dubbelsträngat DNA i levande celler. Den har en mindre diameter och en svagt skruvad struktur med ungefär 10 baspar per hel vridning.
RNA har också en specifik konfiguration, som kallas A-form. RNA är en singelsträngad nukleinsyra som bildar en svagt skruvad struktur med ungefär 11 baser per hel vridning.
I allmänhet avgörs nukleinsyrakonfigurationen av den specifika sekvensen av nukleotider, samt de miljöfaktorer som påverkar dess struktur, såsom saltkoncentration och fuktighet.
"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.
En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.
Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.
Selenium compound (Selenium-containing compound) är en kemisk förening som innehåller grundämnet selen. Selen är ett spårämne hos människor och djur, vilket betyder att det endast behövs i mycket små mängder för att uppfylla viktiga funktioner i kroppen.
Selen förekommer ofta som en del av enzymkomplex, där det utgör en viktig del i deras aktivitet. Exempel på sådana enzymer är glutationperoxidas och thioredoxinreduktas, vilka båda har antioxidativ verkan och hjälper till att skydda celler från oxidativ skada.
Selenföreningar kan förekomma i olika former, bland annat som seleniter (Se+4), selenater (Se+6) eller organiska selenföreningar (till exempel selenoaminosyror). Födoämnen som är rika på selen inkluderar spannmål, nötter och fisk.
Det är viktigt att notera att både för lite och för mycket selen kan vara skadligt. För höga doser av selen kan leda till toxicitet och symtom som hudförändringar, irritation i svalget, illamående och kräkningar.
Excuse me, I believe you are asking for a medical definition of "peptide-extending factors." In the field of molecular biology and genetics, peptide-extending factors, also known as elongation factors, are crucial components in the process of protein synthesis. Specifically, peptide-extending factors assist in the addition of amino acids to a growing polypeptide chain during translation.
In prokaryotic cells, there are two main types of elongation factors: EF-Tu and EF-G. EF-Tu plays a role in delivering the appropriate aminoacyl-tRNA (transfer RNA) to the ribosome, ensuring that the correct amino acid is added to the polypeptide chain. EF-G, on the other hand, facilitates the translocation of the mRNA and tRNAs within the ribosome after peptide bond formation, allowing for the next codon to be exposed and ready for the next aminoacyl-tRNA to bind.
In eukaryotic cells, there are analogous elongation factors, such as EF1A (the equivalent of prokaryotic EF-Tu) and EEF2 (the equivalent of prokaryotic EF-G). These factors perform similar functions in the protein synthesis process.
It is important to note that while peptide-extending factors are essential for life, they can also be targeted by certain antibiotics to inhibit bacterial growth. For example, erythromycin and its derivatives bind to EF-Tu in prokaryotic cells, preventing the formation of the ternary complex (EF-Tu-GTP-aminoacyl-tRNA) and thus halting protein synthesis.
'Serin-tRNA-ligase' (SERS-tRNAsyntetase) er enzym som katalyserer den siste steget i syntesen av serin-tRNA, et essensielt molekyle for translasjonen av genetisk informasjon til aminosyrer i proteinsyntese.
Specifikt katalyserer Serin-tRNA-ligase esterbindingen av aminosyran serin til sit specifikke transfer RNA (tRNA) molekyle, som koding for serin-kodonet i mRNA-sekvensen. Dette gjør at serin kan identifiseres og brukes korrekt under proteinsyntesen.
Det finnes to typer Serin-tRNA-ligaser i mennesker, som er spesifikke for de to former for tRNA-molekyler som koder for serin: en for alfa-serin og en for beta-serin. Disse enzymer er viktige for korrekt proteinsyntese og feilfunksjon kan føre til ulike sykdommer og skader på cellene.
Methionine sulfoxide reductases (MSRs) are a group of enzymes that catalyze the reduction of methionine sulfoxides back to methionine. Methionine is an essential amino acid, meaning it cannot be synthesized by the human body and must be obtained through the diet.
Methionine can be oxidized to form two different stereoisomers of methionine sulfoxide: methionine-S-sulfoxide and methionine-R-sulfoxide. MSRs are responsible for reducing both forms back to methionine, with different MSR enzymes specific to each stereoisomer.
MSRs play important roles in protecting proteins from oxidative damage, as well as in regulating various cellular processes such as signal transduction and gene expression. Dysregulation of MSR activity has been implicated in several diseases, including neurodegenerative disorders and cancer. Therefore, understanding the function and regulation of MSRs is an active area of research with potential therapeutic implications.
Proteinbiosyntese er den biokjemiske proces, hvor levende celler syntetiserer proteiner baseret på informationen i DNA-molekylet. Denne proces foregår i to hovedtrin: transkription og translation.
I det første trin, transkriptionen, læses informationen fra DNA-strengen ud og overføres til en RNA-streng (mRNA). Dette sker med hjælp fra et enzym kaldet RNA-polymerase, som samler nukleotiderne sammen til en mRNA-streng ifølge DNA-sekvensen.
I det andet trin, translationen, læses informationen fra den syntetiserede mRNA-streng af og overføres til en protein. Dette sker i ribosomerne, som er komplekse maskinerier bestående af RNA og proteiner. Her oversættes den genetiske kode i form af en sekvens af tre nukleotider (kodon) på mRNA-strengen til en aminosyresekvens, der danner grundlag for et protein. Aminosyrerne transporteres til ribosomet af transfer RNA-molekyler (tRNA), som har specifikke anticodoner, der matcher de respektive kodoner på mRNA-strengen.
Translationen fortsætter, indtil hele mRNA-strengen er oversat til et protein. Proteinet foldes herefter korrekt og klippes evt. af for at blive funktionelt.
Hydrogenase är ett enzym som katalyserar omvandlingen av väte (H2) till protoner och elektroner eller vice versa. Det finns två typer av hydrogenaser: vanliga ([Fe-Fe]-hydrogenas) och adliga ([Ni-Fe]-hydrogenas). Dessa enzymer förekommer hos bakterier, arkéer och vissa eukaryota celler, som exempelvis grönalger. Hydrogenaser är viktiga i mikroorganismernas energibalans och kan användas för produktion av vätegas som en förnybar energikälla.
En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.
Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.
Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.
Amebicides are a type of medication used to treat infections caused by Entamoeba histolytica, a species of amoeba that can cause dysentery and other gastrointestinal symptoms. Amebicides work by killing or inhibiting the growth of the amoebae, thereby eliminating the infection.
Examples of amebicides include:
* Metronidazole (Flagyl)
* Tinidazole (Tindamax)
* Chloroquine (Aralen)
* Paromomycin (Humatin)
* Iodoquinol (Yodoxin)
* Diloxanide furoate (Furamide)
These medications are usually given in pill or liquid form, and the dosage and duration of treatment may vary depending on the severity of the infection and the individual patient's medical history. It is important to follow the instructions of a healthcare provider when taking amebicides to ensure that the infection is properly treated and to minimize the risk of side effects.
It is also important to note that some of these medications can have serious side effects, especially if taken in large doses or for extended periods of time. Therefore, it is essential to use amebicides only under the supervision of a healthcare provider.
Proteiner (eller proteinmolekyler) är stora, komplexa molekyler som består av aminosyror som kedjas samman i en specifik sekvens. Proteiner bygger upp och utgör en väsentlig del av alla levande cellers struktur och funktion. De utför viktiga funktioner såsom att underlätta kroppens tillväxt och reparation, reglera processer i cellen, skydda organismen från främmande ämnen som t.ex. virus och bakterier samt hjälpa till vid transport av andra molekyler inom kroppen. Proteiner kan ha en mycket varierad struktur och form beroende på deras funktion, och de kan indelas i olika klasser baserat på deras specifika egenskaper och roller inom cellen.
Methanococcales är en ordning inom domänen archaea, som tillhör klassen Methanococci. Denna grupp archaea kännetecknas av att de är metanogena, vilket betyder att de producerar metan som ett slutprodukt i sin ämnesomsättning. Methanococcales innehåller arter som lever under anaeroba förhållanden och som förekommer främst i marina miljöer, men kan även påträffas i sötvatten och termala källor. Exempel på släkten inom Methanococcales är Methanococcus, Methanothermococcus och Methanopyrus.
"Anticodon" är en term inom genetiken och molekylärbiologin. Det refererar till de tre nukleotidbaserna (en bassekvens) i en tRNA-molekyl (transfer-RNA) som komplementärt parar sig med den mRNA-komplmentära kodonsekvensen (tripletten av nukleotider) på en specifik aminosyre under processen av proteintranslering. Anticodonen hjälper till att säkerställa att rätt aminosyra kopplas till rätt position i ett proteins molekylärt seqvens.
Selenbindande proteiner, även kända som selenoproteiner, är proteiner som innehåller den organiska selelementet selen i form av aminosyran selenocystein (Sec). Selenocystein är en icke-standardaminosyra som skiljer sig från de 20 standardaminosyrorna och kodas för av ett stoppkodon i mRNA, ofta TGA.
Selenocystein har en seleenatom i sin sidokedja, vilket gör att det kan delta i redoxreaktioner och fungera som en effektiv antioxidant. Därför har selenbindande proteiner viktiga funktioner i cellers skydd mot oxidativ skada och i regleringen av celldifferentiering, tillväxt och apoptos (programmerad celldöd).
Exempel på selenbindande proteiner inkluderar glutationperoxidas, thioredoxinreduktas och selensyntas. Dessa proteiner är involverade i viktiga cellulära processer som metabolism av peroxider, reduktion av disulfidbryggor och syntes av selenhalten i kroppen.
En kolibakterie (officiellt kallas Escherichia coli, ofta förkortat till E. coli) är en typ av gramnegativ bakterie som normalt förekommer i tarmarna hos varma blodcirkulerande djur, inklusive människor. Det finns många olika stammar av kolibakterier, och de flesta är ofarliga eller till och med nyttiga för värden. Några stammar kan dock orsaka allvarliga infektioner i mag-tarmkanalen, blodet eller andra kroppsdelar. En välkänd patogen kolibakteriestam är E. coli O157:H7, som kan orsaka livshotande komplikationer som hemolytisk uremisk syndrom (HUS) och tack följd av förtäring kontaminert mat eller vatten.
'Methanococcus' är ett släkte av encelliga archaeer, som lever i anaeroba (syrefria) miljöer och producerar metan som en del av deras näringsintag. Dessa mikroorganismer förekommer naturligt i marina och sötvattenmiljöer, samt i djurmagar och tarmar. De är kända för sin förmåga att metabolisera enbart enkla kolväten som till exempel kolmonoxid och väte till metan (biogas).
tRNA-aminoacylering är ett biokemiskt process där specifika aminosyror kopplas till sina respektive transfer RNA (tRNA) molekyler. Detta är en nödvändig steg i den genetiska koden för att syntetisera proteiner korrekt, eftersom varje tRNA bär en specifik anticodon-sekvens som matchar en komplementär codon-sekvens på mRNA. Genom att koppla rätt aminosyra till rätt tRNA kan den genetiska informationen i mRNA tolkas korrekt och användas för att bygga upp en peptidkedja under processen av proteintranslering. Aminoacyleringsprocessen katalyseras av en grupp enzymer som kallas aminoacyl-tRNAsyntetaser, var och en specifik för en viss aminosyra.
Enligt IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) är en transferas ett enzym som katalyserar överföringen av en funktionell grupp (-X), till exempel en sockergrupp, från ett donormolekyl till ett acceptormolekyl i en kemisk reaktion. Transferaser kan delas in i olika klasser beroende på vilken typ av funktionell grupp som överförs. Exempel på transferaser är glycosyltransferaser (som överför sockergrupper), acetyltransferaser (som överför acetylgrupper) och metyltransferaser (som överför metylgrupper). Transferasers kodas ofta av gener som finns i kluster på kromosomen.
RNA-bindande proteiner (RBPs) är proteiner som binder till RNA-molekyler och spelar en viktig roll i regleringen av RNA-processering, transport, lokalisation och traduction. Dessa proteiner har olika strukturella domäner som möjliggör deras bindning till specifika sekvenser eller strukturer hos RNA. Genom att interagera med RNA kan RBPs påverka dess stabilitet, sönderdelning, och dess förmåga att interagera med andra proteiner och ribonukleoproteinpartikel (RNP) komplex. RBPs är involverade i en rad cellulära processer såsom splicing, transport, lokalisation, stabilitet och översättning av mRNA, samt i regleringen av miRNA-funktioner.
Selenometionin är en organisk förening som består av svavel (sulfydrylgrupp) och selen (selenocysteingrupp). Det är en aminosyra som innehåller selen, vilket gör den till en näringsämne. Selenmetionin är en av de två formerna av selen som finns naturligt i livsmedel och är väl assimilerad av kroppen. Det är en viktig del av flera enzymer och hjälper till att skydda celler från skada.
'Kol-svavellyaser' er en samlebetegnelse for organiske forbindelser som inneholder både kol (carbon) og svovl (sulfur). Disse forbindelsene har ofte en keten- eller tiorganstruktur, der vil si at de består av en kjede med kolatomer som er bundet til hverandre via svovlatomer. Kol-svavellyasere kan være naturlige forekomster, som i fallet med garleis (diallyldisulfid), men de fleste er syntetiske og brukes blant annet som industrikjemittel eller i medisinen. I medisinen kan kol-svavellyasere for eksempel brukes som antibakterielle midler, antioxidanter eller i kirurgiske applikasjoner.
RNA (Ribonucleic acid) är ett samlingsnamn för en grupp molekyler som spelar en central roll i cellens proteinsyntes och genuttryck. Det finns olika typer av RNA, men en specifik typ kallas just budbärarrNA (mRNA, messenger RNA). BudbärarrNA har till uppgift att transportera genetisk information från cellkärnan till ribosomen i cytoplasman, där den används för att bygga upp proteiner enligt instruktionerna i genomet. På så sätt fungerar budbärarrNA som ett slags "budbärare" av genetisk information mellan cellkärnan och ribosomen.
Själva grundämnet svavel (symbol: S) är inte direkt relaterat till medicin, men vissa svavelhaltiga kemiska föreningar kan ha medicinska användningsområden. Här följer en definition av en sådan svavelhaltig substans som kan användas inom medicinen:
Sulfasalazin: En läkemedelssubstans som används huvudsakligen för behandling av kronisk inflammatorisk tarmsjukdom (IBD), till exempel Crohns sjukdom och ulcerös kolit. Sulfasalazin är en kombination av två andra substanser, 5-aminosalicylsyra (5-ASA) och sulfapyridin, som tillsammans har antiinflammatoriska egenskaper. När sulfasalazin tas upp i kroppen splittras den upp till 5-ASA och sulfapyridin, där 5-ASA verkar direkt på tarmslemhinnan för att minska inflammationen.
Molekylär kloning är en biologisk teknik där man skapar exakta kopior av specifika gener eller andra stycken av DNA. Detta görs genom att skapa en rekombinant DNA-molekyl, vilken består av DNA från två olika källor. Denna rekombinanta DNA-molekyl innehåller oftast en önskad gen som är flankerad av kontrollsekvenser, så kallade promotor- och terminatorkärnor, som styr när och hur mycket av genen ska exprimera sig.
Den rekombinanta DNA-molekylen införs sedan i en värdcell, ofta en bakteriecell eller en eukaryot cell, där den kan replikera sig tillsammans med cellens egna gener. På det viset produceras stora mängder av den önskade genen eller DNA-sekvensen.
Molekylär kloning används inom forskning för att studera geners funktion och interaktion, för att producera proteiner i stor skala för medicinska tillämpningar och för att skapa genetiskt modifierade organismer som används inom jordbruk och bioteknik.
Tioredoxinreduktas 2 (TrxR2) är ett enzym som tillhör den katalytiska familjen oxidoreduktaser. Det är involverat i cellens reduktion-oxidation (redox) reglering och skyddar cellen från oxidativ skada. TrxR2 är specifikt beläget i mitokondrien och spelar en viktig roll i att underhålla den reducerade miljön inne i mitokondrien, genom att regenerera det antioxidativa proteinet tioredoxin (Trx). TrxR2 är också känt för att vara involverat i celldifferentiering och apoptos (programmerad celldöd). Defekter i TrxR2 har associerats med flera sjukdomar, inklusive neurodegenerativa sjukdomar och cancer.
Sekvenshomologi, eller sekvenstillhörighet, inom biokemi och genetik refererar till den grad av likhet mellan två eller flera molekylära sekvenser, som kan vara DNA-sekvenser, RNA-sekvenser eller proteinsekvenser. När det gäller aminosyrasekvenser, handlar det om den ordningsföljd av specifika aminosyror som bildar en proteinmolekyl.
Aminosyrasekvenshomologi mellan två proteiner används ofta för att undersöka deras evolutionära släktskap och funktionella likheter. Hög sekvenshomologi kan indikera närbesläktade proteiner med möjligen liknande funktioner, medan låg homologi kan tyda på mindre närstående eller icke-relaterade proteinsekvenser.
Det är värt att notera att även om två proteiner har en hög sekvenshomologi kan deras struktur och funktion skilja sig ifrån varandra, eftersom aminosyrasekvenser inte alltid korrelerar perfekt med proteiners tredimensionella struktur eller biokemiska aktivitet.
En katalys är ett molekyul eller jon som ökar hastigheten på en kemisk reaktion genom att sänka energibarriären för reaktionen, men själv inte förändras i antal eller typ under processen. Katalytiska reagens deltar alltså inte i reaktionen och produceras inte som ett produkt av den heller. Istället fungerar de genom att sänka den aktiveringsenergi som behövs för att starta reaktionen, vilket gör att fler molekyler kan reagera under givena förhållanden. Katalysatorer är mycket viktiga inom biologin och industrin eftersom de gör det möjligt att effektivt producera en mängd olika kemikalier och material.
En biokatalys är ett enzym som accelererar en biokemisk reaktion genom att sänka aktiveringsenergiprocessen. Enzymer är proteiner med en specifik struktur som tillåter dem att binda substrat (reaktanterna) och katalysera en specifik kemisk reaktion. De flesta biologiska reaktioner i levande organismer sker med hjälp av biokatalysatorer, eftersom de gör det möjligt för cellerna att utnyttja den kemiska energin effektivt och snabbt. Biokatalysatorernas verkan regleras ofta av olika faktorer som pH, temperatur och koncentrationer av substrat och produkter.
Auranofin är ett läkemedel som används för behandling av reumatoid artrit. Det är en gul kapsel som innehåller en kemisk förening av guld, som verkar genom att modifiera immunsystemet och minska inflammationen i lederna. Auranofin ges vanligen som en tablett som tas oralt, två gånger per dag.
Läkemedlet bör endast användas under övervakning av en läkare på grund av möjliga biverkningar och kontraindikationer. Det kan till exempel orsaka mag- och tarmbesvär, hudirritationer, förändringar i smaken och sällsynta men allvarliga biverkningar som lever- eller njurskada.
Det är viktigt att inte använda auranofin utan recept och att följa läkarens instruktioner noga under behandlingen.
'Sequencing' är ett begrepp inom genetiken som refererar till metoder för bestämandet av raka rader (sekvenser) av nukleotider, de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA. 'Sequencing' används ofta för att undersöka gener och andra delar av DNA för att få information om deras struktur, funktion och evolutionära utveckling.
'Sekvensinpassning' (engelska: sequence alignment) är en metod inom bioinformatiken som används för att jämföra två eller flera DNA- eller proteinsekvenser för att hitta likheter och skillnader mellan dem. Genom att jämföra sekvenser kan forskare identifiera konserverade regioner, mutationer, evolutionära relationer och möjliga funktionella roller.
Sekvensinpassning kan användas för att undersöka olika aspekter av DNA- eller proteinsekvenser, till exempel struktur, funktion, evolutionärt ursprung och släktskap. Det är en viktig metod inom komparativ genetik, molekylär evolution och strukturell biologi.
I sekvensinpassning jämförs två eller flera sekvenser med varandra genom att lägga till luckor (gaps) i sekvenserna för att matcha upp dem så bra som möjligt. Det finns två huvudtyper av sekvensinpassning: global och lokal. Global inpassning jämför hela sekvenserna med varandra, medan lokal inpassning endast jämför delar av sekvenserna där likheter finns.
Sekvensinpassning kan användas för att hitta homologa sekvenser (sekvenser som har gemensam evolutionärt ursprung), identifiera mutationer och andra variationer, och studera evolutionära relationer mellan olika arter eller populationer. Det kan även användas för att förutsäga struktur och funktion hos okända sekvenser genom att jämföra dem med kända sekvenser med liknande egenskaper.
Isopentenyladenosin (IPA) är ett derivat av adenosin som innehåller en isoprenylgrupp. Det är en förorening som kan förekomma i läkemedelspreparat, särskilt i preparat baserade på adenosin eller nukleotider. IPA har också visat sig ha potential som ett immunsuppressivt medel och som en möjlig behandling för vissa former av cancer. Dock är ytterligare forskning behövlig innan dessa användningsområden kan bli kliniskt etablerade.
Glutationreduktas (GR) är ett enzym som finns naturligt i levande celler och har en viktig roll i att hjälpa till att skydda cellerna mot skada. Det gör detta genom att hjälpa till att reglera nivåerna av glutation (GSH), ett antioxidativt ämne som hjälper till att neutralisera fria radikaler och andra skadliga molekyler i cellen.
Specifikt är GR ansvarigt för att reducera oxiderad glutation (GSSG) tillbaka till sin reducerade form (GSH), så att GSH kan fortsätta att agera som en effektiv antioxidant i cellen. GR använder NADPH som en kofaktor för att driva denna reaktion, och det är därför viktigt att ha tillgång till tillräckligt med NADPH för att säkerställa att GR fungerar optimalt.
GR har också visat sig spela en roll i andra cellulära processer, såsom regleringen av apoptos (programmerad celldöd) och immunresponsen. Dessutom kan nivåerna av GR vara förändrade vid vissa sjukdomstillstånd, såsom cancer, neurodegenerativa sjukdomar och åldrande.
'Vitamin U' är ett äldre, icke officiellt erkänt begrepp som ibland har använts för att beskriva en substans som kallas S-metylmetionin. Denna substans finns naturligt i vissa livsmedel, till exempel kål och andra grönsaker.
Det finns dock inget vetenskapligt stöd för att S-metylmetionin uppfyller kriterierna för att betraktas som ett vitamin, dvs. en näringsämne som är nödvändigt för att underhålla liv och hälsa och som måste tas in med kosten eftersom kroppen inte kan syntetisera tillräckliga mängder av det själv.
Idag används termen 'Vitamin U' därför sällan, om alls, inom medicinsk och vetenskaplig kontext.