Totiviridae
Totivirus
Totiviridae är ett familj av små, oromboämnena (non-enveloped) RNA-virus som infekterar svampar och protozoer. Virusen innehåller en enda molekyl av dubbelsträngat RNA (dsRNA) som kodar för fyra till sex proteiner, beroende på virusart. Totivirusets genom är linjärt och cirkulärt permuterat, vilket innebär att 5'-änden av en genomsegment kopieras till 3'-änden av nästa segment under replikationen.
Totivirus har en encapsidationsstorlek på cirka 40 nm i diameter och har en symmetrisk, icosahedral kapsidstruktur med T=1 geometri. De är mycket motståndskraftiga virus som kan överleva under extremt stränga miljöförhållanden, såsom höga temperaturer och lågt pH.
Totivirusinfektioner av svampar kan orsaka sjukdom hos värden, medan infektioner hos protozoer tenderar att vara asymptomatiska eller ge upphov till milda symptom. Totivirus har potentialen att användas som biologisk kontrollmetod för svampinfektioner i jordbruk och medicinska sammanhang, men fortsatta studier behövs för att utveckla effektiva användningsmetoder.
Totivirus är ett släkte inom familjen Totiviridae, som tillhör gruppen dsRNA-virus (dubbelsträngat RNA-virus). Dessa virus har en icke-segmenterad, linjär dsRNA-genom med två gener: en kodar för den strukturella kapsidproteinet och den andra kodar för den RNA-beroende RNA-polymerasen (RdRp) som används för replikationen av viruset. Totivirus infekterar framförallt gjena av svampar, men det finns också arter som kan infektera protozoer och mögelbildande svampar. Virionerna har en diameter på cirka 40 nm och har en icosahedral kapsidstruktur. Totivirus överförs ofta vertikalt, det vill säga från föräldrageneration till avkomma, men horisontell överföring kan också förekomma genom kontakt mellan svampar eller via sporer.
Dubbelsträngat RNA (dsRNA) är en typ av RNA-molekyler som består av två komplementära RNA-strängar som sitter ihop och bildar en dubbelhelix, liknande DNA. Detta skiljer sig från det mesta av RNA som normalt sett är enkelsträngat och har en primär struktur som inte kan bilda en dubbelhelix. Dubbelsträngat RNA förekommer naturligt i vissa virus, där de utgör en del av deras genetiska material. Det kan även syntetiseras konstligen för att användas inom forskning och medicin, exempelvis som en del av RNA-interferens (RNAi) tekniker för att stänga av specifika gener.